方增冰, 戴新宇, 鄒 秀, 郭曉鴿, 徐善良, 王丹麗, 趙云龍
(1. 寧波大學(xué)海洋學(xué)院, 寧波 315211; 2. 華東師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,上海 200062)
蚤狀溞(Daphniapulex) Chk1基因的克隆與表達(dá)分析
方增冰1, 戴新宇1, 鄒 秀1, 郭曉鴿1, 徐善良1, 王丹麗1, 趙云龍2
(1. 寧波大學(xué)海洋學(xué)院, 寧波 315211; 2. 華東師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,上海 200062)
用RACE技術(shù)從蚤狀溞(Daphniapulex)中克隆到Chk1基因cDNA全長(zhǎng)為1767 bp,開放閱讀框?yàn)?497 bp,編碼了498個(gè)氨基酸,其結(jié)構(gòu)中存在3個(gè)保守的Ser-Gln (SQ)和Thr-Gln (TQ) 序列。同源性比對(duì)結(jié)果顯示,蚤狀溞Chk1基因與麗色扇頭蜱、切葉蜂、轉(zhuǎn)基因捕食螨、豌豆長(zhǎng)管蚜和黑腹果蠅等的同源性均為51%~55%。進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),蚤狀溞Chk1基因與豌豆長(zhǎng)管蚜、切葉蜂、黑腹果蠅、麗色扇頭蜱和轉(zhuǎn)基因捕食螨等節(jié)肢動(dòng)物親緣關(guān)系最近。Real Time PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,Chk1 mRNA在兩性溞的表達(dá)量顯著高于孤雌溞(P<0.05),且在休眠卵中表達(dá)量最低。推測(cè)Chk1基因可能在蚤狀溞的生殖轉(zhuǎn)化調(diào)控中發(fā)揮重要作用。
蚤狀溞;Chk1;Real time-PCR;生殖轉(zhuǎn)化
蚤狀溞(Daphniapulex)為枝角亞目(Cladocera)一種常見的小型枝角類,該溞分布廣、易繁殖、適應(yīng)性強(qiáng),易于觀察,個(gè)體發(fā)育迅速,發(fā)育階段明顯,是實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)研究和教學(xué)的好材料。枝角類具兩種生殖模式:春、夏季節(jié),當(dāng)外界水溫合適、食物充足時(shí),蚤狀溞行孤雌生殖,雌性產(chǎn)不受精卵,發(fā)育成雌體。當(dāng)氣溫降低,光照變短,生活環(huán)境變得惡劣時(shí),雌溞產(chǎn)生卵鞍,行有性生殖。蚤狀溞兩種生殖方式的交替,通過有性生殖產(chǎn)生的卵鞍來適應(yīng)、抵御不良環(huán)境,對(duì)于種的延續(xù)有重大的生物學(xué)意義。
Chk1是一種絲氨酸/蘇氨酸蛋白質(zhì)激酶(checkpoint kinase 1),其在生物進(jìn)化中具有較強(qiáng)的保守性,調(diào)控S期、G2/M檢測(cè)點(diǎn)細(xì)胞周期的進(jìn)程[1]。細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1(Chk1)最早由Walwrot[2]在裂殖酵母中發(fā)現(xiàn),當(dāng)DNA受損時(shí),ATM/ATR基因立即激活,并磷酸化Chk1的第317位絲氨酸(S317)和第345位絲氨酸(S345)而使激酶激活,激活后的Chk1又可進(jìn)一步作用于它的下游蛋白Cdc25A/B/C,從而引起S期或G2期阻滯,為修復(fù)損傷的DNA爭(zhēng)取時(shí)間[3-4]。目前對(duì)Chk1的研究主要集中在細(xì)胞周期調(diào)控方面,檢測(cè)DNA是否損傷[5-6]及抗腫瘤方面[7-9]。尚未見Chk1調(diào)控動(dòng)物生殖轉(zhuǎn)化方面的報(bào)道。但近年來,本課題組通過構(gòu)建枝角類孤雌溞和兩性溞cDNA文庫及對(duì)EST序列進(jìn)行基因的特異表達(dá)分析,篩選得到了在表達(dá)上差異極為顯著的與生殖轉(zhuǎn)化相關(guān)的功能基因,發(fā)現(xiàn)其中Chk1單一序列在表達(dá)上有顯著性差異,即在兩性溞中Chk1基因表達(dá)量高于孤雌溞,其有可能參與調(diào)控卵母細(xì)胞不同的成熟方式,推測(cè)有可能參與了枝角類的生殖轉(zhuǎn)化調(diào)控[10]。本研究以蚤狀溞為研究對(duì)象,通過PCR進(jìn)行cDNA末端快速克隆的技術(shù)(rapid-amplification of cDNA ends, 簡(jiǎn)稱RACE PCR) 和同源序列法,克隆了蚤狀溞Chk1的cDNA全長(zhǎng),采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析Chk1 mRNA在蚤狀溞各生殖狀態(tài)下的表達(dá)水平,通過以上方法來探索枝角類生殖轉(zhuǎn)化的規(guī)律和分子機(jī)理。
1.1 實(shí)驗(yàn)溞來源及馴化
本實(shí)驗(yàn)用蚤狀溞為單克隆培養(yǎng)獲得, 溞體大小(3.1±0.6)mm。 選擇健康活潑的成溞培養(yǎng)在盛有 3g兔子糞+4 g 干稻草+20 g 土壤+1900 mL自來水的“Banta 糞土培養(yǎng)液” 玻璃缸內(nèi), 每天投喂2次小球藻。水溫控制在24~26℃;pH值7~8;約培養(yǎng)2周后, 溞密度即可達(dá)到3000 只/L 以上, 高密度種群條件下,缸內(nèi)溞逐漸轉(zhuǎn)為有性生殖, 數(shù)天后出現(xiàn)兩性溞。蚤狀溞不同生殖狀態(tài)下的形態(tài)結(jié)構(gòu)如圖1所示。
1.2 引物設(shè)計(jì)
從GenBank獲得了轉(zhuǎn)基因捕食螨(Metaseiulusoccidentalis) Chk1基因(XM_003745270.1),歐洲熊蜂(Bombusterrestris) Chk1基因(XM_003401009.1),切葉蜂(Megachilerotundata)Chk1基因(XM_003705944.1)和豌豆長(zhǎng)管蚜(Acyrthosiphonpisum)Chk1基因(XM_001944700.2)。根據(jù)此序列, 運(yùn)用Vector NTI 11.0軟件,設(shè)計(jì)1對(duì)簡(jiǎn)并引物Chk1-F/R,此對(duì)引物擴(kuò)增Chk1基因cDNA部分片段;由該片段再設(shè)計(jì)5′ RACE和3′ RACE的特異性引物Chk1-5′R 和Chk1-3′F,擴(kuò)增出蚤狀溞DpChk1cDNA全長(zhǎng)序列;實(shí)時(shí)熒光定量PCR引物為DpChk1-F和DpChk1-R。根據(jù)蚤狀溞18S(AF014011.1)cDNA序列設(shè)計(jì)18S-F和18S-R內(nèi)參基因序列,用1對(duì)特異性引物DpChk1-F和DpChk1-R 和1對(duì)內(nèi)參基因引物18S-F和18S-R來檢測(cè)在不同生殖狀態(tài)下蚤狀溞Chk1 mRNA的表達(dá)(引物見表1)。
表1 試驗(yàn)中用到的引物名稱及序列
M—A or C; K—G or T; R—A or G。
1.3 總RNA 的提取及cDNA第一鏈的合成
孤雌溞、兩性溞和休眠卵的總RNA采用RNA提取試劑盒(RNA Extraction Kit,Axygen)提取,反轉(zhuǎn)錄cDNA則用試劑盒 (PrimeScript RT Master Mix Perfect Real Time Kit)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄(37℃反轉(zhuǎn)錄15min,85℃5s滅活反轉(zhuǎn)錄酶),合成的cDNA產(chǎn)物保存在-20℃或直接用于PCR。
1.4 Chk1基因cDNA片段的克隆
用上述獲得的兩性溞cDNA為模板,通過簡(jiǎn)并引物Chk1-F/R進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系為50 μL,擴(kuò)增條件優(yōu)化:94℃預(yù)變性3 min;94℃下變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,連續(xù)30~35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min后4℃保存。經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,送上海桑尼生物公司進(jìn)行測(cè)序。
1.5 RACE擴(kuò)增Chk1基因的全長(zhǎng)序列
在NCBI數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)中對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行BlastX比對(duì),分析實(shí)驗(yàn)所得的Chk1序列與其它物種Chk1的同源性,若有部分同源,則根據(jù)測(cè)得序列再設(shè)計(jì)正向(Chk1-5′R)、反向(Chk1-3′F)引物用于RACE擴(kuò)增。進(jìn)一步采用SMARTTM RACE cDNA試劑盒(Clontech)對(duì)5′和3′ 端進(jìn)行RACE,從而獲得cDNA全長(zhǎng)。
1.6 生物信息學(xué)分析
蛋白理化特性用Protparam軟件(http://au.expasy.org/tools/protparam.htm1)進(jìn)行預(yù)測(cè),核酸和蛋白序列相似性比較用BlastX工具(http://www.ncbi.nlm.nih.gov);氨基酸序列通過NCBI的ORF Finder進(jìn)行開放閱讀框分析預(yù)測(cè);用ExPASy-PROSITE(8Hhttp://prosite.expasy.org/)預(yù)測(cè)氨基酸功能域;信號(hào)肽分析用SignalP程序;Smart軟件預(yù)測(cè)功能域;多序列比對(duì)分析采用Clustal W軟件進(jìn)行。用MEGA5.1 軟件構(gòu)建進(jìn)化樹。用自展法進(jìn)行1000 次重復(fù)檢驗(yàn)。
1.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析
為獲得最佳模板濃度,將各類模板稀釋成10、10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6和10-7μM 8個(gè)濃度梯度,用引物分別進(jìn)行擴(kuò)增。并對(duì)引物退火溫度也進(jìn)行優(yōu)化:95℃預(yù)變性30 s;95℃變性5 s,57℃退火30 s,72℃30 s,40個(gè)循環(huán)。反應(yīng)結(jié)束后確定Real-time PCR的擴(kuò)增曲線和溶解曲線,數(shù)據(jù)采集和處理在ABI StepOnePlusTMInstrument上進(jìn)行。每種生殖狀態(tài)的樣品設(shè)3個(gè)重復(fù)。
用平均值(Mean, M)±標(biāo)準(zhǔn)差(Stdeva, SD)表示以上處理得到的數(shù)據(jù),測(cè)得數(shù)據(jù)經(jīng)過以下處理:使用SPSS 14.0軟件來進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析,顯著性檢驗(yàn)采用單因素方差分析法進(jìn)行,并用鄧肯檢驗(yàn)法進(jìn)行多重比較。本實(shí)驗(yàn)PCR產(chǎn)物特異性根據(jù)Livak[11]的方法進(jìn)行引物的效率檢測(cè)。qRT-PCR結(jié)果采用2-△△Ct法分析處理,內(nèi)標(biāo)18S Ct 值與目的基因(DpChk1)Ct 值的差值定義為ΔCt 。
圖1 蚤狀溞不同生殖形態(tài)圖
依次為孤雌溞(未帶卵)(40×);孤雌溞(帶夏卵)(100×);孤雌溞(背面觀)(40×);兩性溞(帶冬卵)(40×);休眠卵(100×)。
2.1 蚤狀溞細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1 DpChk1全長(zhǎng)cDNA的克隆
以蚤狀溞兩性溞的cDNA為模板,用簡(jiǎn)并引物Chk1-F/R進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到約700 bp的片段,經(jīng)BlastX分析與已登錄的歐洲熊蜂Bombusterrestris(XP_003401057.1)、轉(zhuǎn)基因捕食螨Metaseiulusoccidentalis(XP_003745318.1)、長(zhǎng)牡蠣Crassostreagigas(EKC39820.1)、囊舌蟲Saccoglossuskowalevskii(XP_002741282.1)和紫海膽Strongylocentrotuspurpuratus(NP_001091925.1)Chk1基因具有較高的同源性。以這段700 bp序列繼續(xù)設(shè)計(jì)5′和3′ RACE引物,分別進(jìn)行5′和3′RACE,通過測(cè)序得到序列并比對(duì)拼接獲得一條1767 bp的全長(zhǎng)序列(GenBank登錄號(hào):KC713933)。為進(jìn)一步驗(yàn)證序列的可靠性,重新設(shè)計(jì)Chk1-S/V克隆Chk1全長(zhǎng)序列,結(jié)果與上述全長(zhǎng)序列一致,證明蚤狀溞Chk1cDNA克隆有效。
2.2 蚤狀溞細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1 DpChk1序列特征分析
蚤狀溞 Chk1全長(zhǎng)核苷酸序列和推導(dǎo)出的氨基酸序列如圖2,全長(zhǎng)為1767 bp的蚤狀溞Chk1 cDNA序列包含了一個(gè)186 bp的5′-UTR區(qū)域和84 bp的3′-UTR(非編碼區(qū))區(qū)域,兩端各含有一個(gè)終止密碼子(TAA)和 polyA尾。1497 bp的開放閱讀框(ORF)編碼了498個(gè)氨基酸,包含有多個(gè)磷酸化位點(diǎn)(phosphorylation site)。蚤狀溞Chk1的理論等電點(diǎn)(pI)為8.40,計(jì)算分子質(zhì)量56.16 ku。
圖2 蚤狀溞Chk1的cDNA全長(zhǎng)及推斷的氨基酸
陰影部分aga為起始密碼子; taa為終止密碼子。
2.3 蚤狀溞細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1 DpChk1結(jié)構(gòu)分析
圖3 蚤狀溞細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1與其它甲殼類同源序列的多序列比對(duì)Fig 3 Multiple alignment of D. Pulex Chk1 with the other crustacean Chk1灰色陰影顯示的是GxGxxG域;方框顯示3個(gè)SQ/TQ域。
蚤狀溞 DpChk1N端含有3個(gè)串聯(lián)的Chk1功能域,分別為PKc結(jié)構(gòu)域(殘基27~273位)、PKc-like superfamily結(jié)構(gòu)域(殘基27~273位)、S-TKc結(jié)構(gòu)域(殘基21~275位)。C端是調(diào)節(jié)域,含有調(diào)控必需的SQ/TQ域,該結(jié)構(gòu)域中含有3個(gè)保守的Ser-Gln (SQ)和Thr-Gln (TQ) 序列,其中的Ser或Thr能被ATR或ATM磷酸化,激活Chk1蛋白的N端功能域。3個(gè)保守的Ser-Gln (SQ)和Thr-Gln (TQ) 序列在蛋白中的位置分別為:321~322、357~358、369~370(圖3)。
2.4 蚤狀溞細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1DpChk1氨基酸序列同源性分析
利用ClustalW 對(duì)蚤狀溞 DpChk1和其它7種節(jié)肢動(dòng)物Chk1的多序列比對(duì)見圖3。蚤狀溞DpChk1與轉(zhuǎn)基因捕食螨(Metaseiulusoccidentalis)、切葉蜂(Megachilerotundata)、頂切葉蟻(Acromyrmexechinatior)、黑腹果蠅(Drosophilamelanogaster)、歐洲熊蜂(Bombusterrestris)、麗色扇頭蜱(Rhipicephaluspulchellus)、豌豆長(zhǎng)管蚜(Acyrthosiphonpisum)的同源性都較高,同源性均為51%~55%。
利用MEGA4.0軟件對(duì)19個(gè)不同物種的Chk1序列進(jìn)行了分子系統(tǒng)學(xué)分析,在構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹的基礎(chǔ)上研究了蚤狀溞和其它種類Chk1之間的進(jìn)化關(guān)系(見圖4)。從系統(tǒng)進(jìn)化樹上可以看到Chk1基因在上述動(dòng)物中主要被分為3個(gè)亞群:蚤狀溞與豌豆長(zhǎng)管蚜、黑腹果蠅、頂切葉蟻、切葉蜂、轉(zhuǎn)基因捕食螨、麗色扇頭蜱等節(jié)肢動(dòng)物分為第1亞群;吉富羅非魚(Oreochromisniloticus)、黃牛(Bostaurus)、人(Homosapiens)、家馬(Equuscaballus)等脊椎動(dòng)物聚為第2亞群;紫海膽Strongylocentrotuspurpuratus、囊舌蟲 (Saccoglossuskowalevskii)等棘皮半索動(dòng)物為第3亞群。蚤狀溞與豌豆長(zhǎng)管蚜、切葉蜂和黑腹果蠅等首先聚類,之后與轉(zhuǎn)基因捕食螨、麗色扇頭蜱等節(jié)肢動(dòng)物聚為一支,再與棘皮半索動(dòng)物聚在一起,最后與脊椎動(dòng)物聚類。蚤狀溞Chk1與脊椎動(dòng)物在分子進(jìn)化上距離相對(duì)較遠(yuǎn)。
圖4 根據(jù)N-J法繪制的Chk1基因進(jìn)化樹
2.5 DpChk1 mRNA在蚤狀溞各生殖狀態(tài)下的表達(dá)差異
以篩選后最為理想的18S作為本實(shí)驗(yàn)熒光定量的內(nèi)參基因。Chk1基因在孤雌溞、兩性溞、休眠卵中的表達(dá)差異如圖5所示。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:DpChk1在兩性溞中表達(dá)最高,在休眠卵中的表達(dá)量最低。Chk1 mRNA在兩性溞的表達(dá)量顯著高于孤雌溞(P<0.05),推測(cè)Chk1基因與蚤狀溞的生殖轉(zhuǎn)化可能有相關(guān)性。
圖5 Chk1 mRNA 在不同生殖狀態(tài)下的表達(dá)水平
已有許多學(xué)者證實(shí)了枝角類雌體生殖細(xì)胞發(fā)生過程中,都是在夏卵和冬卵出現(xiàn)以后,出現(xiàn)兩次成熟分裂[12-14]。 蔣燮治等[15]研究發(fā)現(xiàn),孤雌溞卵子的成熟只伴隨一次均等分裂,孤雌溞為二倍體;但是兩性溞的卵子成熟時(shí)和正常減數(shù)分裂一樣,染色體均等裂,每個(gè)卵子都為單倍體。但是Bacci[16]等認(rèn)為孤雌溞不止經(jīng)歷一次分裂,且細(xì)胞未分裂,故產(chǎn)生的卵子為二倍體。因此,枝角類的生殖細(xì)胞的兩次成熟分裂,對(duì)其兩種生殖方式有很大影響。卵母細(xì)胞成熟的調(diào)控不是一個(gè)單因子的作用,它的調(diào)控過程很復(fù)雜,由多個(gè)因子共同參與[17],需要特定的基因在特定的時(shí)期準(zhǔn)確地表達(dá)。
細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1(Chk1)的主要功能是調(diào)控細(xì)胞周期,當(dāng)DNA受損時(shí),Chk1基因能使細(xì)胞周期阻滯在S期,為DNA修復(fù)損傷爭(zhēng)取時(shí)間[18]。近些年的研究發(fā)現(xiàn)Chk1基因還可能與枝角類的生殖轉(zhuǎn)化相關(guān)[14,17]。本實(shí)驗(yàn)中蚤狀溞兩種生殖狀態(tài)下Chk1 mRNA的表達(dá)水平顯示:其兩性溞的表達(dá)量最高,是孤雌溞的1.6倍,在休眠卵中的表達(dá)量最低。Chk1基因的表達(dá)在兩性生殖和孤雌生殖中有顯著性差異(P<0.05),推測(cè)其有可能是參與調(diào)控卵母細(xì)胞不同的成熟方式;另一方面由于受到環(huán)境因素脅迫,溞體DNA的損傷程度增大,導(dǎo)致了與修復(fù)損傷DNA有關(guān)的Chk1基因的表達(dá)量上升,從而提高或維持兩性溞的種群密度。同時(shí)我們也注意到,兩性溞在兩性生殖時(shí)所產(chǎn)生的休眠卵隨卵鞍排到體外發(fā)育至囊胚期即停止發(fā)育,在外界經(jīng)過滯育期,待環(huán)境適宜后才繼續(xù)發(fā)育[14]。Chk1基因在休眠卵中表達(dá)量明顯低于兩性溞和孤雌溞,是否這個(gè)細(xì)胞周期調(diào)節(jié)因子也作用于休眠卵,使其終止分裂,停止發(fā)育。目前我們對(duì)Chk1基因在生殖轉(zhuǎn)化中的作用,都是推測(cè)性的,還有待于今后通過原位雜交和RNA干擾等技術(shù)進(jìn)一步研究確定。
本研究克隆得到了蚤狀溞Chk1基因的cDNA全長(zhǎng)序列,其中包括一個(gè)編碼了498個(gè)氨基酸的全長(zhǎng)為1497 bp的開放閱讀框(ORF)。與NCBI公布的蚤狀溞全基因組(2011年)中的假設(shè)蛋白序列(GenBank登錄號(hào):EFX87696.1)相比有97%的相似度,后者ORF編碼了489個(gè)氨基酸。從ORF包含的氨基酸序列中我們可以看到有多個(gè)磷酸化位點(diǎn)和1個(gè)N-糖基化位點(diǎn),其生理功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)就是通過蛋白質(zhì)的磷酸化、糖基化來完成。蚤狀溞DpChk1的ORF有多個(gè)位點(diǎn)有可能發(fā)生磷酸化修飾和糖基化修飾,這些存在的位點(diǎn)可能就是DpChk1被轉(zhuǎn)運(yùn)到某個(gè)特定的細(xì)胞器后的加工位點(diǎn),通過此翻譯后加工來實(shí)現(xiàn)其生理功能。至于這些可能與生殖細(xì)胞分裂相關(guān)的位點(diǎn)以及DpChk1確切的翻譯后加工機(jī)制還需要進(jìn)一步的深入研究。蚤狀溞Chk1基因由1個(gè)265殘基的N-末端激酶功能域和1個(gè)233殘基的C-末端調(diào)節(jié)域組成。激酶功能域中含有一個(gè)“GxGxxG”域,是ATP結(jié)合部位[1],調(diào)節(jié)域中含有6個(gè)Ser-Gln (SQ)和Thr-Gln (TQ) 序列,是蛋白激酶的激活部位(見圖3)。Zhao等[19]的研究指出人Chk1蛋白由一個(gè)257殘基的N-末端激酶功能域和1個(gè)211殘基的C-末端調(diào)節(jié)域構(gòu)成,調(diào)節(jié)域中有5個(gè)SQ/TQ位點(diǎn),其中Ser-317和Ser-345被磷酸化后,才能激活激酶功能域。Shiromizu等[20]發(fā)現(xiàn)HeLa細(xì)胞中Chk1蛋白的激活依賴于其Ser-286和Ser-301的磷酸化。本實(shí)驗(yàn)中,蚤狀溞Chk1蛋白調(diào)節(jié)域中有3個(gè)保守的SQ/TQ序列(321~322、357~358、369~370),但是具體是哪幾個(gè)Ser(Thr)被磷酸化也有待進(jìn)一步的研究。
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Clonning and expression analysis of Chk1 gene inDaphniapulex
FANG Zeng-bing1, DAI Xin-yu1, ZOU Xiu1, GUO Xiao-ge1,XU Shan-liang1, WANG Dan-li1, ZHAO Yun-long2
(1. College of Marine Science, Ningbo University, Ningbo 315211;2. College of Life Science, East China Normal University, Shanghai 200062, China)
The full-length cDNA of a Chk1 (DpChk1) was cloned from cladoceranDaphniapulexusing rapid amplification of complementary DNA ends (RACE) method. The DpChk1 cDNA is 1767 bp in length; and it has a 1497-bp open reading frame that encodes a 498-amino-acid polypeptide containing three conserved Ser-Gln (SQ), and Thr-Gln (TQ) sequence. In addition, DpChk1 shared homology of 51%-55% with gene inRhipicephaluspulchellus,Megachilerotundata,Metaseiulusoccidentalis,AcyrthosiphonpisumandDrosophilamelanogaster. Phylogenetic analysis revealed that DpChk1 protein has a close genetic relationship withPhylumarthropodasuch asAcyrthosiphonpisum,Megachilerotundata,Drosophilamelanogaster,Rhipicephaluspulchellus,Metaseiulusoccidentalisand so on. qPCR results (real-time quantitative PCR) showed that the DpChk1 expression was significantly higher (P<0.05) in ephippial female than in parthenogenetic female and was the lowest in the resting egg. Therefore, Chk1 was closely related to the reproduction conversion ofDaphniapulex.
Daphniapulex; Chk1; Real time-PCR; reproductive conversion
2014-09-28,
2014-11-07
國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31172043); 浙江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(LY12C19003); 上海市科技創(chuàng)新行動(dòng)計(jì)劃項(xiàng)目(12391900700); 寧波市創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(2011B81003); 寧波大學(xué)胡嵐優(yōu)秀博士基金
方增冰,碩士研究生,研究方向?yàn)轸~類資源及養(yǎng)殖,E-mail: ice19870906@163.com;
王丹麗, 教授,研究方向?yàn)閺氖滤鷦?dòng)物學(xué)研究,E-mail: wangdanli@nbu.edu.cn; 趙云龍, 教授,研究方向?yàn)閺氖录讱?dòng)物學(xué)研究,E-mail: ylzhao@bio.ecnu.edu.cn。
S917.4;Q78
A
2095-1736(2015)02-0012-05
doi∶10.3969/j.issn.2095-1736.2015.02.012