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      循環(huán)腫瘤DNA在惡性腫瘤診療中的應(yīng)用

      2015-03-20 17:02:06楊全勝
      感染、炎癥、修復(fù) 2015年1期
      關(guān)鍵詞:測(cè)序基因腫瘤

      趙 曉 杜 楠 楊全勝

      (解放軍總醫(yī)院第一附屬醫(yī)院, 北京 100048)

      ·綜 述·

      循環(huán)腫瘤DNA在惡性腫瘤診療中的應(yīng)用

      趙 曉 杜 楠 楊全勝

      (解放軍總醫(yī)院第一附屬醫(yī)院, 北京 100048)

      惡性腫瘤危害巨大,絕大多數(shù)患者明確診斷時(shí)已經(jīng)是中晚期,預(yù)后差[1-2]。因此,建立一種方便、微創(chuàng)、靈敏、特異的診斷和監(jiān)測(cè)手段勢(shì)在必行。研究人員發(fā)現(xiàn)腫瘤是一種最常見的基因疾病,不同癌癥有不同的誘因和癥狀,但都可以通過基因突變得到解釋。循環(huán)腫瘤DNA是存在于血液中的細(xì)胞外游離DNA,具有無創(chuàng)、實(shí)時(shí)、可重復(fù)和操作簡(jiǎn)便等特點(diǎn),通過對(duì)腫瘤患者循環(huán)腫瘤 DNA的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè),可能為患者的早期診斷、用藥選擇、病情監(jiān)測(cè)提供全面的實(shí)時(shí)信息。本文對(duì)近年來國內(nèi)外有關(guān)循環(huán)腫瘤DNA及其在惡性腫瘤診療中應(yīng)用的研究綜述如下。

      1 循環(huán)腫瘤 DNA

      循環(huán)DNA是一種存在于血漿或血清、腦脊液及滑膜液等體液中的細(xì)胞外 DNA。腫瘤患者外周血中存在的循環(huán)DNA,含量明顯高于健康人,并且這些循環(huán) DNA具有腫瘤特征性,稱為循環(huán)腫瘤DNA[3]。循環(huán)腫瘤DNA極易獲得,在惡性腫瘤發(fā)生的早期其含量和基因的異常改變就可以被檢測(cè)到。而且它攜帶有腫瘤患者的基因信息,定量或定性分析這些循環(huán) DNA對(duì)腫瘤的早期診斷、治療、病情監(jiān)測(cè)及預(yù)后的評(píng)價(jià)都具有重要意義。更重要的是能夠?yàn)槟[瘤個(gè)體化治療提供較全面的分子學(xué)特性,是一種理想的腫瘤標(biāo)志物[4]。

      1.1 循環(huán)腫瘤 DNA的來源 研究發(fā)現(xiàn),在原發(fā)腫瘤形成和生長(zhǎng)的各個(gè)階段都會(huì)出現(xiàn)腫瘤細(xì)胞的壞死和凋亡, 無論腫瘤細(xì)胞是原位死亡或是進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng),它們的DNA都會(huì)釋放入血液[5]。關(guān)于循環(huán)腫瘤 DNA 具體的釋放機(jī)制仍存在爭(zhēng)論,通過近年的研究,人們推測(cè)其主要可能來源于以下一些途徑:①循環(huán)血或微轉(zhuǎn)移灶中腫瘤細(xì)胞溶解;②腫瘤細(xì)胞的壞死或凋亡;③腫瘤細(xì)胞不斷釋放DNA進(jìn)入血液循環(huán);④腫瘤侵襲致周圍細(xì)胞、組織變性而釋放DNA入血;⑤腫瘤分泌的小囊泡——exosome中存在的DNA,即exDNA,其意義尚不清楚。但是,無論循環(huán)腫瘤DNA如何產(chǎn)生,目前研究都認(rèn)為,它與原發(fā)腫瘤的基因組 DNA具有相同的遺傳變異,其變異特征和表達(dá)量都與原發(fā)腫瘤組織呈正相關(guān),并能反映腫瘤的特征性改變。對(duì)這種腫瘤DNA的替代物的回收和檢測(cè),為腫瘤的診斷和預(yù)測(cè)開辟了新領(lǐng)域。

      1.2 循環(huán)腫瘤 DNA的特點(diǎn) 惡性腫瘤患者循環(huán)腫瘤 DNA含量較正常人群增高,完整性較好,并且一個(gè)癌細(xì)胞克隆群落中的每一個(gè)突變共同組成了獨(dú)一無二的突變信息“條形碼”,對(duì)腫瘤患者循環(huán)DNA的分析被認(rèn)為是實(shí)時(shí)的“液相活檢”。通過提取患者血漿中循環(huán)腫瘤 DNA獲取腫瘤的全部片段,而不是對(duì)腫瘤的某一特殊部位進(jìn)行組織活檢,可以體現(xiàn)出患者疾病的大致輪廓,從而評(píng)估患者當(dāng)前腫瘤的所有突變和克隆情況[6]。同時(shí),相對(duì)于傳統(tǒng)組織活檢創(chuàng)傷大、標(biāo)本量小等局限性,循環(huán)DNA具有取樣簡(jiǎn)便易行,患者痛苦小等優(yōu)勢(shì),是一種十分理想的檢測(cè)標(biāo)本。借助現(xiàn)代分子生物學(xué)手段對(duì)循環(huán)游離DNA進(jìn)行提取,并對(duì)其遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)的異常改變進(jìn)行分析,可能為腫瘤的早期診斷、療效評(píng)估、復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)及預(yù)后判斷提供重要的信息,這種基于血液樣本分析的研究方法正在成為腫瘤領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。

      2 循環(huán)腫瘤DNA的檢測(cè)

      對(duì)循環(huán)腫瘤DNA的檢測(cè)可分為定性和定量?jī)煞N:前者主要檢測(cè)血清和血漿中腫瘤特異性基因的改變,后者則檢測(cè)血清和血漿的DNA總量。早期研究方法有4類:RNA-DNA 雜交法、二苯胺法、溴化乙錠法和對(duì)流免疫電泳法,它們技術(shù)方法不同,但都有一定的缺陷,特別是在判定檢測(cè)方法的金標(biāo)準(zhǔn)上,表現(xiàn)欠佳,敏感度和特異度均不十分理想。近年來,以分子生物學(xué)的迅速發(fā)展為起點(diǎn),又有一批新的研究方法產(chǎn)生,在臨床上得到了廣泛的應(yīng)用,如單核苷酸多態(tài)性分析、放射免疫法、分光光度測(cè)量法、實(shí)時(shí)定量PCR法、熒光定量法等,大大提高對(duì)循環(huán)腫瘤 DNA 檢測(cè)的靈敏度[7]。近年來出現(xiàn)的新一代測(cè)序法,具有成本低、速度快、通量高的特點(diǎn),在腫瘤臨床領(lǐng)域顯現(xiàn)出很高的應(yīng)用價(jià)值。

      2.1 定量檢測(cè) 既往對(duì)于循環(huán)腫瘤 DNA的定量檢測(cè)缺乏統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),曾經(jīng)通過顯色反應(yīng)結(jié)果,根據(jù)顏色與濃度的對(duì)應(yīng)關(guān)系檢測(cè)其濃度,但其靈敏度和特異度不高,未能在臨床上大規(guī)模開展。之后又陸續(xù)出現(xiàn)了血清凝集素抑制法、補(bǔ)體結(jié)合法等一些新的檢測(cè)方法,但靈敏度仍較低。近年來,隨著放射免疫分析和對(duì)流免疫電泳技術(shù)的發(fā)展,DNA檢測(cè)靈敏度有了較大的提高,可以檢測(cè)納克級(jí)(ng)的DNA[8],而實(shí)時(shí)定量 PCR技術(shù)出現(xiàn)之后,更是可以檢測(cè)皮克(pg)級(jí)的 DNA。除此之外,還有一些改進(jìn)技術(shù)或聯(lián)合應(yīng)用技術(shù)可以更加精確地測(cè)定循環(huán)DNA的含量。近年,多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),在治療過程中,檢測(cè)到的循環(huán)腫瘤DNA數(shù)量跟腫瘤容積有關(guān)聯(lián),

      而治療后,確認(rèn)的患者與殘留病體相符合,并且相比放射治療手段,該方法的檢測(cè)反應(yīng)更佳。

      2.2 定性分析 循環(huán)腫瘤DNA 的定性分析是指對(duì)腫瘤特異性基因改變的檢測(cè)。理論上,任何腫瘤相關(guān)的遺傳學(xué)和表遺傳學(xué)改變均可以用來進(jìn)行檢測(cè)。而目前臨床上,主要開展的檢測(cè)包括基因突變、甲基化異常、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)和雜合性缺失(LOH)等,如對(duì)K-ras 和p53 基因突變的檢測(cè)。實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)精度較高,曾經(jīng)是定性分析循環(huán)腫瘤 DNA的主流技術(shù)。

      2.3 新一代測(cè)序 循環(huán)腫瘤DNA的快速發(fā)展離不開測(cè)序技術(shù)的不斷進(jìn)步,近幾年來,基因測(cè)序領(lǐng)域技術(shù)發(fā)展迅速,通過對(duì)DNA直接測(cè)序就可以鑒別循環(huán)DNA的突變信息,大大縮短了檢測(cè)的時(shí)間和經(jīng)濟(jì)成本,利用血液樣本替代組織進(jìn)行基因突變檢測(cè)成為現(xiàn)實(shí)[9]。其中新一代測(cè)序是二者發(fā)展史上的里程碑,在這里進(jìn)行簡(jiǎn)單介紹[10]。 新一代測(cè)序(NGS)又稱二代測(cè)序、高通量測(cè)序或大規(guī)模平行測(cè)序(MPSS),是相對(duì)于第一代測(cè)序即桑格測(cè)序(Sanger sequencing) 而言的。

      2005年羅氏公司推出了第一臺(tái)高通量測(cè)序儀,其后羅氏公司和Illumina 公司相繼推出了Solexa 基因組分析儀,ABI 公司推出了SOLiD 測(cè)序儀,3類測(cè)序平臺(tái)雖然各有特點(diǎn),但都以高輸出量與高解析度為特性,在原理上也有許多共同之處:三者都是將目標(biāo)DNA剪切為小片段,然后將單個(gè)小片段DNA分子結(jié)合到固相表面,對(duì)單分子獨(dú)立擴(kuò)增,而且每次只復(fù)制一個(gè)堿基(A、C、T、G)并檢測(cè)信號(hào),最后通過高分辨率的成像系統(tǒng)獲取測(cè)序結(jié)果。NGS僅用了短短的10年時(shí)間就成功地從科學(xué)研究轉(zhuǎn)化為臨床應(yīng)用,目前在無創(chuàng)產(chǎn)前診斷、單基因遺傳病診斷、器官移植排斥篩查以及腫瘤相關(guān)基因的檢測(cè)方面發(fā)揮出巨大的應(yīng)用價(jià)值。

      NGS較第一代測(cè)序在腫瘤診斷方面表現(xiàn)出超高的敏感性和特異性,原因主要有兩個(gè)。首先,多基因組合大大提高了對(duì)腫瘤診斷的敏感性和特異性:傳統(tǒng)的第一代測(cè)序只能一個(gè)基因、一個(gè)基因地進(jìn)行檢測(cè),而NGS技術(shù)能對(duì)多個(gè)基因同時(shí)進(jìn)行檢測(cè)。其次,NGS技術(shù)本身檢測(cè)基因突變的靈敏度就高于第一代測(cè)序。目前公認(rèn)的第一代測(cè)序檢測(cè)突變的靈敏度大約在20%,而NGS技術(shù)由于引入了測(cè)序深度(sequencing depth) 這一概念,使其可以檢測(cè)到低于0.5%的突變。測(cè)序深度是指測(cè)序得到的堿基總量(bp) 與目的基因組大小的比值,是評(píng)價(jià)測(cè)序量的指標(biāo)之一。測(cè)序深度越深,對(duì)突變檢測(cè)的靈敏度也越高。另外,NGS 還能檢測(cè)血漿中循環(huán)腫瘤DNA的甲基化狀態(tài)和拷貝數(shù)變異等。

      NGS技術(shù)中剛剛興起的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)也在腫瘤診斷中顯示出廣闊的前景。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是將分離的單個(gè)細(xì)胞中微量的全基因組DNA 進(jìn)行無選擇性地?cái)U(kuò)增,獲得高覆蓋率的完整的基因組之后再通過NGS 技術(shù)對(duì)其進(jìn)行測(cè)序,從而揭示細(xì)胞個(gè)體間差異。值得一提的是,2012 年,華大基因同樣利用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)分析了單個(gè)腎癌細(xì)胞的單核苷酸突變特征,從而在更高的分辨能力上為評(píng)價(jià)基因改變的復(fù)雜性提供了更為優(yōu)化的方法[8]。2014 年,他們又用該方法在結(jié)腸癌中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的癌基因SLC12A5[9]。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)還能與循環(huán)腫瘤細(xì)胞(circulating tumor cells,CTCs) 篩選技術(shù)相結(jié)合,檢測(cè)外周血CTCs 單核苷酸變異(single-nucleotide variations,SNV)、基因拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNV)或外顯子組插入/缺失突變,為腫瘤診斷及個(gè)體化治療提供一種非侵入性檢測(cè)手段。

      NGS的發(fā)展極大促進(jìn)了循環(huán)腫瘤DNA在腫瘤診斷中的應(yīng)用,但是在臨床應(yīng)用中仍有很多問題需要解決,如數(shù)據(jù)在臨床診斷上的作用、測(cè)序數(shù)據(jù)的儲(chǔ)存和分析、數(shù)據(jù)的安全和信息隱私等。

      3 循環(huán)腫瘤DNA 的臨床應(yīng)用

      人類早在1947年就發(fā)現(xiàn)了循環(huán)核酸,并在30 年后開始對(duì)腫瘤患者血液循環(huán)中的循環(huán)DNA進(jìn)行研究。近幾年,隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,通過對(duì)循環(huán)腫瘤DNA檢測(cè)可以在較短時(shí)間內(nèi)獲得多個(gè)基因的表達(dá)水平、突變信息等情況,使得循環(huán)腫瘤DNA在腫瘤的診斷和治療監(jiān)測(cè)中的應(yīng)用有了新的突破,利用血液樣本替代傳統(tǒng)組織進(jìn)行基因檢測(cè)有望成為現(xiàn)實(shí)。

      3.1 早期診斷 循環(huán)腫瘤DNA 水平變化與惡性腫瘤的臨床篩查方面的研究開展較早,早期研究聚焦于惡性腫瘤患者循環(huán)腫瘤DNA含量與正常人之間的差異。1997年關(guān)于癌癥患者血清中存在的游離 DNA 含量約為健康人的 10 倍的報(bào)道,引發(fā)了研究人員對(duì)血循環(huán)中游離 DNA 與惡性腫瘤相關(guān)研究的普遍關(guān)注。后續(xù)多項(xiàng)研究相繼證實(shí),在結(jié)腸癌、肺癌、乳腺癌等惡性腫瘤患者外周血中的循環(huán)腫瘤DNA含量與正常人存在明顯差異。在惡性腫瘤血行轉(zhuǎn)移方面,有研究發(fā)現(xiàn):伴有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的患者循環(huán)腫瘤DNA水平明顯高于無遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的患者,提示循環(huán)腫瘤DNA可能作為血行轉(zhuǎn)移重要的預(yù)測(cè)指標(biāo)。另有報(bào)道腫瘤循環(huán)DNA水平與臨床分期、轉(zhuǎn)移情況及腫瘤大小具有相關(guān)性,可以作為乳腺癌的診斷、分期指標(biāo)[11]。近年來越來越多的研究關(guān)注循環(huán)腫瘤DNA 中的基因突變,如檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌患者EGFR基因突變,進(jìn)一步對(duì)不同惡性腫瘤患者從基因水平上進(jìn)行個(gè)體化診斷分析[12]。這些研究視野的拓展和新發(fā)現(xiàn),為腫瘤的早發(fā)現(xiàn)、早診斷提供了新的思路和方法。

      3.2 療效預(yù)測(cè) 近年來,有關(guān)循環(huán)腫瘤DNA水平變化與抗腫瘤(包括手術(shù)、放療、新輔助化療、姑息性化療等)療效預(yù)測(cè)方面的研究陸續(xù)出現(xiàn)。在循環(huán)腫瘤DNA 水平變化與手術(shù)治療療效預(yù)測(cè)方面,Sozzi等[13]在對(duì)術(shù)后肺癌患者的隨訪中發(fā)現(xiàn),無復(fù)發(fā)患者循環(huán)腫瘤DNA水平逐漸恢復(fù)正常,而復(fù)發(fā)患者出現(xiàn)2~20 倍的增加;Banki等[14]在對(duì)食管癌術(shù)后患者進(jìn)行隨訪研究發(fā)現(xiàn),術(shù)后循環(huán)腫瘤DNA 水平降至正常患者,中位生存期12 個(gè)月時(shí)復(fù)查病情穩(wěn)定,無明顯復(fù)發(fā)、 轉(zhuǎn)移征象,而循環(huán)腫瘤DNA水平上升患者出現(xiàn)了疾病的復(fù)發(fā)和進(jìn)展。國內(nèi)也有系統(tǒng)性研究發(fā)現(xiàn),肺癌、結(jié)腸癌等發(fā)生復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移時(shí)外周血循環(huán)DNA 的含量明顯增高[15]。上述的研究主要從循環(huán)腫瘤DNA整體水平變化進(jìn)行探討,近年來隨著分子生物學(xué)研究的深入,針對(duì)與疾病關(guān)系明確的DNA 片段進(jìn)行定性分析成為新的研究主體。其中,基因突變檢測(cè)中應(yīng)用較為廣泛的如K-ras 基因,可以為結(jié)、直腸癌患者化療是否聯(lián)合西妥昔單抗提供療效預(yù)測(cè)標(biāo)志;EGFR基因外顯子 19 和 21 的突變情況開始進(jìn)入臨床為非小細(xì)胞肺癌分子靶向治療療效預(yù)測(cè)提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。ERCC1、TYMS、UGT等基因多態(tài)性分析也正在研究階段,預(yù)計(jì)將為腫瘤個(gè)體化治療提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

      3.3 個(gè)體化治療 過去10年,對(duì)于惡性腫瘤發(fā)生、維持和進(jìn)展的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)分子方面的研究取得了重大進(jìn)展,這些新發(fā)現(xiàn)促成了新型治療策略的突破[16]。腫瘤患者的臨床處理正在從基于患者臨床特征選擇治療方案的傳統(tǒng)治療模式,轉(zhuǎn)變?yōu)榛诨颊吣[瘤分子表達(dá)譜選擇治療方法的個(gè)體化治療模式。這種全新的醫(yī)療模式以個(gè)人基因組信息為基礎(chǔ),結(jié)合蛋白質(zhì)組、代謝組等相關(guān)內(nèi)環(huán)境信息,為患者量身設(shè)計(jì)出最佳治療方案,選擇合適的藥物及正確的劑量,預(yù)測(cè)藥物的療效,在癌癥治療中已經(jīng)初見成效,正在世界范圍內(nèi)逐步取代現(xiàn)在的腫瘤治療模式[17]。這種治療模式的推廣,對(duì)于腫瘤監(jiān)測(cè)提出了新的要求,促使臨床工作者尋找更為高效、準(zhǔn)確的腫瘤監(jiān)測(cè)手段來判斷患者病情發(fā)展變化及對(duì)治療的反應(yīng)。近幾年來,基因檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展和完善提高了其檢測(cè)結(jié)果的可信度,檢測(cè)設(shè)備和檢測(cè)成本的下降為這一技術(shù)的廣泛應(yīng)用提供了可行性。這些發(fā)展都為我們開展以基因檢測(cè)為基礎(chǔ)的腫瘤監(jiān)測(cè)提供了可能性。

      有最新研究報(bào)道,循環(huán)腫瘤 DNA在腫瘤個(gè)體化治療中的作用已經(jīng)在一些轉(zhuǎn)移性乳腺癌,轉(zhuǎn)移性結(jié)、直腸癌和轉(zhuǎn)移性黑色素瘤的研究中得到證實(shí)[18-19]。研究發(fā)現(xiàn),通過連續(xù)監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者循環(huán)腫瘤DNA的 10個(gè)伴隨突變,針對(duì)不同亞克隆腫瘤灶給予不同的化療方案,患者治療效果顯示出明確差異。對(duì)轉(zhuǎn)移性結(jié)、直腸癌患者經(jīng)KRAS等位基因突變檢查診斷后給予抗EGFR抗體藥物治療,經(jīng)影像學(xué)檢查證實(shí)為疾病進(jìn)展的平均時(shí)間為21周,最長(zhǎng)可達(dá)10個(gè)月[20]。德國的研究者們對(duì)復(fù)發(fā)性胃腸道間質(zhì)瘤患者血漿標(biāo)本的循環(huán)腫瘤DNA的突變情況與患者的臨床狀態(tài)進(jìn)行了匹配,發(fā)現(xiàn)兩者具有較好的相關(guān)性[21]。先前研究表明,肺癌患者循環(huán)腫瘤DNA水平比對(duì)照組人群的水平更高,循環(huán)腫瘤DNA可作為接受化學(xué)治療患者疾病進(jìn)展的顯著預(yù)測(cè)標(biāo)志物[22]。此外,另一些研究報(bào)道了循環(huán)腫瘤DNA水平和患者預(yù)后之間的相關(guān)性。雖然僅是初步研究,但這些結(jié)果仍然顯示通過監(jiān)測(cè)循環(huán)腫瘤DNA,有助于我們?cè)谟跋駥W(xué)證據(jù)出現(xiàn)以前,針對(duì)新生轉(zhuǎn)移性腫瘤灶進(jìn)行早期干預(yù)。這些發(fā)現(xiàn)表明:在不久的將來,循環(huán)腫瘤DNA可能被用于高風(fēng)險(xiǎn)人群的篩查、患者的預(yù)后評(píng)估和療效評(píng)價(jià),其廣泛的應(yīng)用性和潛在的重要性將對(duì)臨床工作產(chǎn)生更大的影響。

      4 小結(jié)與展望

      循環(huán)腫瘤 DNA 可以直接從患者的外周血中獲取,有望發(fā)展成為一種新型的腫瘤學(xué)監(jiān)測(cè)指標(biāo)。作為一種靈敏、特異、無創(chuàng)的分子生物學(xué)檢測(cè)手段,檢測(cè)循環(huán)腫瘤DNA可以便捷地對(duì)腫瘤做出早期診斷、進(jìn)行療效監(jiān)測(cè)及對(duì)惡性腫瘤做出預(yù)后評(píng)價(jià),可應(yīng)用于腫瘤的預(yù)防以及個(gè)體化治療的開展。

      但是目前,各中心對(duì)于循環(huán)腫瘤DNA的研究方法和研究結(jié)果不盡相同。循環(huán)腫瘤DNA檢測(cè)如何作為一種標(biāo)準(zhǔn)化的方法應(yīng)用于臨床?這就亟需建立一套國內(nèi)外統(tǒng)一的循環(huán)腫瘤DNA定量檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)以及各類型腫瘤定性分析的譜式,為將來開展大規(guī)模的流行病學(xué)監(jiān)控、系統(tǒng)地收集癌癥患者外周血標(biāo)本、規(guī)范循環(huán)腫瘤DNA的臨床應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。另外,現(xiàn)代DNA測(cè)序技術(shù)尤其是二代測(cè)序技術(shù)敏感性極高,這也增加了檢測(cè)的非特異性,即假陽性。這類技術(shù)在腫瘤臨床中的應(yīng)用,除了需要完備的質(zhì)量控制和系統(tǒng)的臨床樣本對(duì)比外,還需重新審視現(xiàn)有臨床意義明確的基因的臨床指導(dǎo)價(jià)值。因此,循環(huán)腫瘤DNA在臨床中的廣泛應(yīng)用還需要大規(guī)模臨床試驗(yàn)的驗(yàn)證。

      [1] Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW, Jr., Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage [J]. Nature medicine, 2014, 20(5): 548-554.[2] Fujiwara K, Fujimoto N, Tabata M, Nishii K, Matsuo K, Hotta K, Kozuki T, Aoe M, Kiura K, Ueoka H, Tanimoto M. Identification of epigenetic aberrant promoter methylation in serum DNA is useful for early detection of lung cancer [J]. Clin Cancer Res, 2005, 11(3): 1219-1225.

      [3] Rosell R, Molina MA, Serrano MJ. EGFR mutations in circulating tumour DNA[J]. Lancet Oncol, 2012, 13(10): 971-973.

      [4] Bryzgunova O, Bondar A, Morozkin E, Mileyko V, Vlassov V, Laktionov P. A reliable method to concentrate circulating DNA [J]. Analytical Biochem, 2011, 408(2): 354-356.

      [5] Alix-Panabieres C, Schwarzenbach H, Pantel K. Circulating tumor cells and circulating tumor DNA [J]. Annual Rev Med, 2012, 63(2):199-215.

      [6] Leary RJ, Sausen M, Kinde I, Papadopoulos N, Carpten JD, Craig D, O’shaughnessy J, Kinzler KW, Parmigiani G, Vogelstein B, Diaz LA, Jr., Velculescu VE. Detection of chromosomal alterations in the circulation of cancer patients with whole-genome sequencing [J]. Sci Translational Med, 2012, 4(1): 152-154.[7] Hong B, Zu Y. Detecting circulating tumor cells: current challenges and new trends[J]. Theranostics, 2013, 3(6): 377-394.

      [8] Azvolinsky A. Beyond counting: new way to use circulating tumor cells [J]. J National Cancer Institute, 2014, 106(10):1005-1008.

      [9] Auer M, Heitzer E, Ulz P, Geigl JB, Speicher MR. Single circulating tumor cell sequencing for monitoring [J]. Oncotarget, 2013, 4(6): 812-813.

      [10] Cooke S, Campbell P. Circulating DNA and next-generation sequencing [J]. Recent Results Cancer Res,2012, 195:143-149.

      [11] Madhavan D, Wallwiener M, Bents K, Zucknick M, Nees J, Schott S, Cuk K, Riethdorf S, Trumpp A, Pantel K, Sohn C, Schneeweiss A, Surowy H, Burwinkel B. Plasma DNA integrity as a biomarker for primary and metastatic breast cancer and potential marker for early diagnosis [J]. Breast Cancer Res Treatment, 2014, 146(1): 163-174.

      [12] Douillard JY, Ostoros G, Cobo M, Ciuleanu T, Cole R, Mcwalter G, Walker J, Dearden S, Webster A, Milenkova T, Mccormack R. Gefitinib treatment in EGFR mutated caucasian NSCLC: circulating-free tumor DNA as a surrogate for determination of EGFR status [J]. J Thoracic Oncol, 2014, 9(9): 1345-1353.

      [13] Sozzi G, Conte D, Mariani L, Lo Vullo S, Roz L, Lombardo C, Pierotti MA, Tavecchio L. Analysis of circulating tumor DNA in plasma at diagnosis and during follow-up of lung cancer patients [J].Cancer Res, 2001, 61(12): 4675-4678.

      [14] Banki F, Mason RJ, Oh D, Hagen JA, Demeester SR, Lipham JC, Tanaka K, Danenberg KD, Yacoub WN, Danenberg PV, Demeester TR. Plasma DNA as a molecular marker for completeness of resection and recurrent disease in patients with esophageal cancer [J]. Arch Surg, 2007, 142(6): 533-538; discussion 538-539.

      [15] 閆巍,張能維,徐智,阿民布和,朱斌,宮軻,尹剛,孫志鵬. 結(jié)直腸癌患者手術(shù)前后循環(huán)DNA 水平的變化及其意義 [J]. 中國普通外科雜志, 2013, 22(12): 1627-1630.

      [16] Dobbelstein M, Moll U. Targeting tumour-supportive cellular machineries in anticancer drug development [J]. Nature Rev Drug Discovery, 2014, 13(3): 179-196.

      [17] Aparicio S, Caldas C. The implications of clonal genome evolution for cancer medicine [J]. New Engl J Med, 2013, 368(9): 842-851.

      [18] Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW, Jr., Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage [J]. Nature Med, 2014, 20(5):548-554.[19] Bidard FC, Madic J, Mariani P, Piperno-Neumann S, Rampanou A, Servois V, Cassoux N, Desjardins L, Milder M, Vaucher I, Pierga JY, Lebofsky R, Stern MH, Lantz O. Detection rate and prognostic value of circulating tumor cells and circulating tumor DNA in metastatic uveal melanoma [J]. Intern J Cancer, 2014, 134(5): 1207-1213.

      [20] Mcbride DJ, Orpana AK, Sotiriou C, Joensuu H, Stephens PJ, Mudie LJ, Hamalainen E, Stebbings LA, Andersson LC, Flanagan AM, Durbecq V, Ignatiadis M, Kallioniemi O, Heckman CA, Alitalo K, Edgren H, Futreal PA, Stratton MR, Campbell PJ. Use of cancer-specific genomic rearrangements to quantify disease burden in plasma from patients with solid tumors [J]. Genes Chromosomes Cancer, 2010, 49(11): 1062-1069.[21] Maier J, Lange T, Kerle I, Specht K, Bruegel M, Wickenhauser C, Jost P, Niederwieser D, Peschel C, Duyster J, Von Bubnoff N. Detection of mutant free circulating tumor DNA in the plasma of patients with gastrointestinal stromal tumor harboring activating mutations of CKIT or PDGFRA [J].Clin Cancer Res,2013, 19(17): 4854-4867.

      [22] Catarino R, Coelho A, Araujo A, Gomes M, Nogueira A, Lopes C, Medeiros R. Circulating DNA: diagnostic tool and predictive marker for overall survival of NSCLC patients [J]. PloS One, 2012, 7(6): e38559.

      10.3969/j.issn.1672-8521.2015.01.016

      解放軍總醫(yī)院臨床科研扶持基金(304專項(xiàng))資助(2014FC-CXYY-1004)

      2014-12-08)

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