長鏈非編碼RNA在2種乳腺癌耐藥性細胞中的表達分析和功能預測*

張秀磊，王志宇，朱　濤，汪香婷△(中國科學技術大學生命科學學院，安徽合肥3007;河北大學附屬醫(yī)院腫瘤內(nèi)科，河北保定0700)

長鏈非編碼RNA在2種乳腺癌耐藥性細胞中的表達分析和功能預測*

張秀磊1，王志宇2，朱濤1，汪香婷1△
(1中國科學技術大學生命科學學院，安徽合肥230027;2河北大學附屬醫(yī)院腫瘤內(nèi)科，河北保定071002)

目的:發(fā)掘在乳腺癌耐藥性細胞中表達錯調的長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA，lncRNA)。方法:對敏感和耐藥性乳腺癌細胞中的lncRNA表達分別進行芯片檢測。檢測后結果經(jīng)生物信息統(tǒng)計學分析對lncRNA進行歸類和功能網(wǎng)絡預測。結果:與敏感細胞相比，他莫昔芬和曲妥珠單抗耐藥細胞中表達上調和下調的lncRNA分別為2 107、611、1 154和2 141種，其中在2種耐藥細胞株中共同表達錯調的有93種。對共同表達上調的69種lncRNA的功能預測發(fā)現(xiàn)2種與在乳腺癌耐藥性中發(fā)揮作用的蛋白編碼基因或microRNA相關，2種參與有絲分裂節(jié)點或DNA損傷引發(fā)的細胞死亡。結論:本研究發(fā)現(xiàn)大量在他莫昔芬與曲妥珠單抗耐藥細胞中異常表達的lncRNAs，但同時在2種細胞中異常表達的數(shù)量極少，提示lncRNAs在腫瘤藥物耐藥性中具有較強特異性。本研究還通過生物信息學分析，建立了一種新型的基于功能預測的靶基因篩選方法。

國家自然科學基金資助項目(No.31471226; No.91440108) ;中國科學院基金資助項目(No.KJ2070000031)

△E-mail: wangxt11@ustc.edu.cn