牛曉輝 李遠(yuǎn) 徐海榮
. 專論 Special article .
20 年磨一劍——記北京積水潭醫(yī)院骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫的建立
牛曉輝 李遠(yuǎn) 徐海榮
骨腫瘤;軟組織腫瘤;數(shù)據(jù)庫
骨與軟組織腫瘤屬于腫瘤學(xué)的范疇。當(dāng)前針對腫瘤的研究,不管是基礎(chǔ)還是臨床,都強(qiáng)調(diào)循證醫(yī)學(xué)的重要性,循證醫(yī)學(xué)的根本是完整可靠的數(shù)據(jù)記錄,而數(shù)據(jù)記錄的集合就是數(shù)據(jù)庫。就臨床而言,腫瘤學(xué)數(shù)據(jù)庫可分為兩種:一種是以流行病學(xué)研究為主要目的腫瘤登記數(shù)據(jù)庫,另一種以臨床、科研為目的,研究疾病本身特點(diǎn)及治療療效的專業(yè)單 ( 或 ) 多病種數(shù)據(jù)庫。目前各醫(yī)院盡管都有自己的病歷管理系統(tǒng),但當(dāng)前的醫(yī)院病歷系統(tǒng)很難涵蓋臨床和科研需要的全部參數(shù),另外也不能隨時(shí)更新以滿足多中心臨床研究為目的的參數(shù)。這種專業(yè)單 ( 或 ) 多病種數(shù)據(jù)庫,針對的是某一 ( 類 ) 特定疾病,涉及患者的一般資料、診斷治療、隨訪記錄和預(yù)后情況等,涵蓋疾病的發(fā)病、治療、轉(zhuǎn)歸等過程。骨與軟組織腫瘤相對是少見疾病,但在北京積水潭醫(yī)院這樣的??漆t(yī)院,擁有全國乃至世界上最大的病例數(shù)量,其病例的廣度和深度是綜合醫(yī)院難以比擬的,所以建立一個(gè)這樣的數(shù)據(jù)庫是極為迫切的。筆者以北京積水潭醫(yī)院骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫的建立為契機(jī),闡述國內(nèi)外骨與軟組織腫瘤的發(fā)展?fàn)顩r和方向。
( 一 ) 國外腫瘤數(shù)據(jù)庫情況
為了便于醫(yī)學(xué)科學(xué)數(shù)據(jù)資源的檢索、交換、共享,國外以腫瘤登記制度為基礎(chǔ),已經(jīng)建立了許多大型數(shù)據(jù)庫,并且已經(jīng)收集了大量的病歷資料,這些數(shù)據(jù)庫中有些包括骨與軟組織腫瘤患者信息。通過定期發(fā)布腫瘤報(bào)告或者在線查詢方式公布數(shù)據(jù)。
1. 監(jiān)測、流行病學(xué)和最終結(jié)果數(shù)據(jù)庫 ( surveillance,epidemiology and end results,SEER ):美國癌癥研究所 ( National cancer institute,NCI ) 下屬的 SEER 項(xiàng)目是全球最具代表性的大型腫瘤登記注冊數(shù)據(jù)庫。登記數(shù)據(jù)包括患者基本情況、原發(fā)病灶部位、腫瘤形態(tài)、分期、第一療程治療情況、隨訪狀況、死亡原因等。目前覆蓋 28% 的全美人口。通過網(wǎng)頁瀏覽方式提供不含個(gè)人信息的腫瘤病例數(shù)據(jù)資料 ( http://seer.cancer.gov )。SEER 是目前腫瘤臨床研究領(lǐng)域最重要的資源之一,如果使用其數(shù)據(jù)庫進(jìn)行骨與軟組織腫瘤研究就會(huì)發(fā)現(xiàn),其中沒有關(guān)于家族史、既往史、并發(fā)癥、手術(shù)切緣、病理學(xué)資料信息;其記錄的治療方式包括手術(shù)、放療,而不包括輔助治療、內(nèi)分泌治療、化療、生物治療等,并且缺少第一療程后的后續(xù)治療;在臨床資料部分也不包括血紅蛋白、乳酸脫氫酶等化驗(yàn)檢查值及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移數(shù)目等指標(biāo)。
2. 美國國家癌癥數(shù)據(jù)庫 ( National cancer data base,NCDB ):美國外科醫(yī)師學(xué)會(huì) ( American college of surgeons,ACoS ) 和美國癌癥協(xié)會(huì) ( American cancer society,ACS ) 下屬的癌癥委員會(huì) ( commission on cancer,CoC ) 建立了美國國家癌癥數(shù)據(jù)庫。美國 70% 新診斷的癌癥病例登記到 ( national cancer database,NCDB )。從 1989 年開始,NCDB 已經(jīng)收集到大約 2900 萬條病歷資料。與 SEER 內(nèi)容相似,數(shù)據(jù)庫包括患者的基本信息、腫瘤分期、腫瘤的組織學(xué)特征、第一療程治療方式和預(yù)后等信息。
3. WHO 死亡率數(shù)據(jù)庫 ( WHO Mortality Database ):世界衛(wèi)生組織的死亡率數(shù)據(jù)是由各會(huì)員國從其民事登記系統(tǒng)中報(bào)告的年齡、性別和死亡原因匯編的數(shù)據(jù)。公眾可以通過瀏覽器訪問在線數(shù)據(jù)庫,查詢不同國家、不同年份、不同性別、不同死亡原因的死亡人數(shù)和年齡標(biāo)準(zhǔn)化死亡率。還可以根據(jù)用戶的需要,進(jìn)行詳細(xì)的死亡原因匯總。
4. 五大洲腫瘤發(fā)病資料 ( cancer incidence in five continents,CI5 ):五大洲癌癥發(fā)病率是國際癌癥研究所 ( international agency for research on cancer,IARC ) 和國際癌癥登記協(xié)會(huì) ( international association of cancer registries,IACR ) 的合作項(xiàng)目,每 5 年出版一系列的專著,成為國際癌癥發(fā)病率數(shù)據(jù)的參考來源。也可以通過網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫進(jìn)行查詢 http://ci5.iarc.fr。全球各地的腫瘤登記處向 CI5 提交登記資料,最新資料中包括中國14 個(gè)登記處報(bào)告資料。資料包括:患者基本信息、腫瘤信息、醫(yī)院信息、隨訪信息 4 部分,約 40 項(xiàng)。主要記錄流行病學(xué)方面信息,不包括患者詳細(xì)治療信息。
5. GLOBOCAN 數(shù)據(jù)庫:這也是國際癌癥研究所下屬項(xiàng)目。該項(xiàng)目的目的是在國家級(jí)提供主要癌癥類型的發(fā)病率和死亡率的估計(jì)值。目前為 GLOBOCAN 2012。
針對城鎮(zhèn)化進(jìn)程給農(nóng)村教育信息化帶來的沖擊和問題,以及對農(nóng)村信息化教育現(xiàn)狀的了解和分析,筆者提出如下幾點(diǎn)策略,以期為城鎮(zhèn)化進(jìn)程中的農(nóng)村教育信息化發(fā)展提供借鑒。
6. 意大利 Rizzoli 骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫:意大利博洛尼亞 Rizzoli 骨科學(xué)院的骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫,在網(wǎng)站上公開的資料,可用其查到某個(gè)特定腫瘤的性別分布、年齡分布、部位分布等流行病學(xué)特點(diǎn)。
7. 其它未在互聯(lián)網(wǎng)上發(fā)布的數(shù)據(jù)庫:除了 Rizzoli 骨科學(xué)院外,很多骨與軟組織腫瘤治療中心都建立了自己的病歷數(shù)據(jù)庫。這些專業(yè)骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫,詳細(xì)記錄了患者的臨床病理影像隨訪資料。但僅供本單位醫(yī)務(wù)工作者使用。
( 二 ) 國內(nèi)腫瘤數(shù)據(jù)庫情況
1. 中國腫瘤防治數(shù)據(jù)庫:我國腫瘤數(shù)據(jù)庫最初是 1963 年在上海城區(qū)建立腫瘤登記數(shù)據(jù)庫,之后江蘇省啟東、北京等地相繼建立了腫瘤登記處。到 2013 年全國腫瘤登記中心收集了 219 個(gè)登記處惡性腫瘤的登記資料。將數(shù)據(jù)按城鄉(xiāng)、地區(qū)、性別分層,計(jì)算各層年齡別腫瘤別發(fā)病率和死亡率,然后根據(jù)全國實(shí)際人口,估計(jì)全國主要惡性腫瘤以及合計(jì)的發(fā)病、死亡相關(guān)數(shù)據(jù),并對其情況進(jìn)行描述。雖然每年發(fā)布腫瘤發(fā)病率情況報(bào)告,但網(wǎng)站長期沒有更新,無法查詢實(shí)時(shí)信息。
2. 北京積水潭醫(yī)院骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫 ( 后面介紹,此處略 )。
3. 其它未在互聯(lián)網(wǎng)上發(fā)布的數(shù)據(jù)庫:醫(yī)學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫在國內(nèi)發(fā)展相對緩慢,不同地區(qū)不同醫(yī)院發(fā)展極不平衡。患者數(shù)量多、經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá)、醫(yī)院重視程度高的醫(yī)院往往更重視醫(yī)療數(shù)據(jù)的積累,愿意投入資金,進(jìn)行專業(yè)數(shù)據(jù)庫建設(shè)。筆者在工作交流中可知,只有為數(shù)不多的骨與軟組織腫瘤治療中心,以醫(yī)院科室為單位建立自己的數(shù)據(jù)庫,管理患者資料,可以實(shí)現(xiàn)簡單查詢,但是難以表現(xiàn)患者復(fù)雜的診療過程。就筆者所知,目前除北京積水潭醫(yī)院骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫外,目前,國內(nèi)還沒有在互聯(lián)網(wǎng)上可以查詢的骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫。
為了提高醫(yī)院管理水平,各地醫(yī)院都紛紛建立了以醫(yī)院為單位的醫(yī)療信息化系統(tǒng)。醫(yī)院信息系統(tǒng)( hospital information system,HIS ) 是一個(gè)龐大而復(fù)雜的現(xiàn)代化信息管理系統(tǒng),它包含財(cái)務(wù)、人事、住院、門診、掛號(hào)、醫(yī)技、收費(fèi)、分診、藥品管理等多個(gè)子系統(tǒng)。隨著醫(yī)院內(nèi)部業(yè)務(wù)流程的不斷梳理和整合,HIS系統(tǒng)被賦予更多的功能,HIS 與實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng) ( laboratory information management system,LIS ),醫(yī)學(xué)影像存檔與通訊系統(tǒng) ( picture archiving and communication systems,PACS ),放射信息管理系統(tǒng) ( radioiogy information system,RIS ),電子病歷 ( electronic medical record,EMR ) 等外圍模塊不斷融合。HIS 系統(tǒng)正是管理患者信息的利器,曾被認(rèn)為最終將代替專業(yè)數(shù)據(jù)庫。但在實(shí)際工作中筆者見到的是現(xiàn)實(shí)與理想的巨大差距。HIS 系統(tǒng)的特點(diǎn)如下:( 1 ) HIS 系統(tǒng)主要用于醫(yī)院管理,專業(yè)數(shù)據(jù)庫著重與疾病的臨床治療及科研;( 2 ) HIS 系統(tǒng)針對整個(gè)醫(yī)院設(shè)計(jì),沒有為某一種 ( 類 ) 疾病進(jìn)行定制,無法規(guī)范此類疾病診療信息所需參數(shù)。難以檢索查詢;( 3 ) 各個(gè)醫(yī)院 HIS 系統(tǒng)不同,數(shù)據(jù)格式不同,數(shù)據(jù)難以交換共享;( 4 ) 在現(xiàn)行法律法規(guī)規(guī)范下,為了保證患者資料的安全性,所有醫(yī)院 HIS 系統(tǒng)中的病歷資料無法進(jìn)行隨意檢索,導(dǎo)出;( 5 ) 各地醫(yī)院 HIS系統(tǒng)大多建立于 2000 年后,歷史資料少;( 6 ) 無法通過互聯(lián)網(wǎng)共享數(shù)據(jù)。因此,HIS 系統(tǒng)目前仍然只能作為專業(yè)數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)來源,而且在多數(shù)醫(yī)院專業(yè)數(shù)據(jù)庫無法直接聯(lián)入 HIS 系統(tǒng)取得數(shù)據(jù),只能單獨(dú)輸入數(shù)據(jù)。
( 一 ) 北京積水潭醫(yī)院骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫發(fā)展歷史
20 世紀(jì) 90 年代前期,筆者借鑒國內(nèi)外發(fā)表文章中的數(shù)據(jù),結(jié)合在臨床工作中,總結(jié)提煉骨與軟組織腫瘤相關(guān)參數(shù)約 70 個(gè),制作了表格式手寫病歷,并填寫紙質(zhì)表格進(jìn)行登記、存檔。期間登記約 2000 例患者信息。但是由于無法進(jìn)行編目、索引,無法進(jìn)行有效查詢,這些只是一些“死”數(shù)據(jù)。
20 世紀(jì) 90 年代中后期,隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)發(fā)展,醫(yī)院中出現(xiàn) 386 計(jì)算機(jī)及微軟 DOS 操作系統(tǒng)。為了讓積累的數(shù)據(jù)“活”起來,選擇當(dāng)時(shí)流行的 dBase 數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),建立第一代單機(jī)版骨與軟組織數(shù)據(jù)庫。dBASE 是第一個(gè)在微型計(jì)算機(jī)上被廣泛使用的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng),但當(dāng)時(shí)程序設(shè)計(jì)人員水平普遍不高,在設(shè)計(jì)中根本沒有使用其關(guān)系型數(shù)據(jù)庫特點(diǎn),實(shí)際建立的是二維數(shù)據(jù)表。對于同一患者多次入院治療,同一患者多種疾病,同一疾病多部位,同一患者多次手術(shù)等如何體現(xiàn)無法解決。在數(shù)據(jù)輸入過程中,大量字段需要手工輸入,容易出現(xiàn)錯(cuò)誤。也沒有良好的數(shù)據(jù)檢索程序支持。在此階段將約 3000 例病例數(shù)字化。
進(jìn)入 21 世紀(jì),DOS 操作系統(tǒng)逐漸消亡,Windows XP 系統(tǒng)成為主流。dBASE 沒能成功轉(zhuǎn)換到 Microsoft Windows 平臺(tái)并逐漸被 Paradox、Clipper、 FoxPro 等替代。從 2002 年,我科重新開發(fā)骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫。此時(shí)互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)剛剛興起,網(wǎng)絡(luò)人口普及率 < 2.5%,因此數(shù)據(jù)庫仍定位為單機(jī)版。為延續(xù)原 dBase 數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),采用 Visual FoxPro6.0 數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),此系統(tǒng)仍然是關(guān)系型數(shù)據(jù)庫,兼容 dBase 數(shù)據(jù)庫,可進(jìn)行圖形界面的可視化編程。此次開發(fā)人員為非專業(yè)人員,由本科室內(nèi)熟悉數(shù)據(jù)庫開發(fā)的醫(yī)生擔(dān)任。開發(fā)過程中將每一患者記錄的參數(shù)增加到 150 余個(gè),豐富了數(shù)據(jù)庫內(nèi)容。輸入模式進(jìn)行改變,減少數(shù)據(jù)輸入過程中直接填寫內(nèi)容,將大部分內(nèi)容改為通過下拉菜單選擇輸入,減少人為錯(cuò)誤。將所有參數(shù)分為 7 個(gè)數(shù)據(jù)表,建立簡單邏輯關(guān)系,分別輸入,部分解決了同一患者多次入院治療問題,但由于程序設(shè)計(jì)水平問題,難以實(shí)現(xiàn)多表間復(fù)雜邏輯關(guān)系,同一患者多種疾病,同一疾病多部位,同一患者多次手術(shù)等問題仍無法解決。而軟件中查詢功能也較薄弱。2003 年完成開發(fā)后,進(jìn)行病歷數(shù)字化。至 2009 年,紙質(zhì)登記表內(nèi)容錄入數(shù)據(jù)庫,完成約 6000 例。
2010 年互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)迅速發(fā)展,互聯(lián)網(wǎng)人口普及率達(dá)到 28.9%。為使數(shù)據(jù)可以實(shí)時(shí)更新,隨時(shí)隨地輸入查詢。將數(shù)據(jù)庫上網(wǎng),開發(fā) WEB 模式數(shù)據(jù)庫。此次開發(fā)由專業(yè)互聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)庫服務(wù)商單獨(dú)承擔(dān),服務(wù)器端采用MySQL 關(guān)系型數(shù)據(jù)庫及 Java Server Pages ( JSP ) 動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁技術(shù)。開發(fā)過程基本延續(xù)原有數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu),字段進(jìn)一步增加到 200 項(xiàng),進(jìn)一步優(yōu)化了輸入方式,豐富了查詢手段,實(shí)現(xiàn)了多表間交叉查詢,使用不同權(quán)限的登錄密碼完成對數(shù)據(jù)庫管理。但是由于開發(fā)的專業(yè)人員對疾病診療過程完全不了解及設(shè)計(jì)經(jīng)費(fèi)不足等原因,依然沒有實(shí)現(xiàn)多數(shù)據(jù)表之間復(fù)雜邏輯關(guān)系,同一患者多種疾病,同一疾病多部位,同一患者多次手術(shù)的存儲(chǔ)問題仍無法解決。此版數(shù)據(jù)庫可通過互聯(lián)網(wǎng),需要密碼登錄后才可以使用,沒有提供公眾訪問的頁面。使用此數(shù)據(jù)庫,到 2012 年,完成 14 500 余例病歷數(shù)字化。
2012 年為向公眾提供真實(shí)、免費(fèi)的骨與軟組織腫瘤流行病學(xué)信息,北京積水潭醫(yī)院骨腫瘤科建立了一個(gè)免費(fèi)的在線原發(fā)骨腫瘤數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站 ( http://www.sarcoma-jst.org ),此網(wǎng)站構(gòu)建于 Word Press 的門戶網(wǎng)站,使用 Php 語言和 MySQL 數(shù)據(jù)庫。由于后臺(tái)使用不同數(shù)據(jù)服務(wù)器,需要定期將數(shù)據(jù)庫內(nèi)數(shù)據(jù)導(dǎo)出,再導(dǎo)入 Word Press 數(shù)據(jù)庫,不能達(dá)到實(shí)時(shí)更新效果。
2013 年開始,針對以往數(shù)據(jù)庫開發(fā)中遇得到困難,再次升級(jí)數(shù)據(jù)庫。此次由熟悉程序設(shè)計(jì)的本科室醫(yī)生與專業(yè)互聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)庫服務(wù)商共同開發(fā),服務(wù)器端采用 Microsoft SQL Server 2008 R2 數(shù)據(jù)庫服務(wù)器及 ASP.NET技術(shù)。本次開發(fā)調(diào)整了數(shù)據(jù)表結(jié)構(gòu),重新制定了各個(gè)數(shù)據(jù)表之間的邏輯關(guān)系,完全解決了同一患者多種疾病,同一疾病多部位,同一患者多次手術(shù)的記錄問題。在設(shè)計(jì)過程中采用模塊化方式,便于后期數(shù)據(jù)庫修改維護(hù)。這一版數(shù)據(jù)庫完成同時(shí),除提供科室內(nèi)人員登錄使用,還開通了針對公眾的免費(fèi)網(wǎng)站 ( http://www.sarcoma-jst. net ),提供不包括患者信息的流行病學(xué)資料查詢。至 2015 年,共完成 17 000 余病歷的數(shù)字化工作。
( 二 ) 北京積水潭醫(yī)院骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫特點(diǎn)
1. 安全可靠性:數(shù)據(jù)庫位于云主機(jī)上,每個(gè)主機(jī)數(shù)據(jù)保留 4 份,實(shí)時(shí)存儲(chǔ)于集群中的若干臺(tái)服務(wù)器上,即使同時(shí)損壞 3 份數(shù)據(jù),也不影響主機(jī)的正常使用,系統(tǒng)可靠性達(dá) 99.95% 以上。為保證數(shù)據(jù)安全,還定時(shí)進(jìn)行了人工數(shù)據(jù)備份。數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)采用底層數(shù)據(jù)庫、網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用服務(wù)器、用戶客戶端三層結(jié)構(gòu),杜絕用戶直接訪問底層數(shù)據(jù)服務(wù)器。用戶分為不同級(jí)別,通過密碼登錄,只能完成本級(jí)別功能。
2. 穩(wěn)定性:采用瀏覽器和服務(wù)器結(jié)構(gòu) ( B / S )。用戶表示層、業(yè)務(wù)邏輯層、數(shù)據(jù)訪問層分離,當(dāng)改變其中某一層次時(shí),不會(huì)影響其它兩層的工作。
3. 可擴(kuò)展性:本系統(tǒng)采用模塊化原則,分為數(shù)據(jù)庫輸入、查詢、維護(hù)模塊。信息存儲(chǔ)也按照模塊方式進(jìn)行,分為:醫(yī)療機(jī)構(gòu)、科室、患者信息三級(jí)模塊;患者信息內(nèi)又包括:住院信息、診斷信息、疾病部位、手術(shù)信息、化療信息、隨訪信息等模塊。最終到每一個(gè)字段都成為單獨(dú)模塊。通過不同模塊組合完成業(yè)務(wù)邏輯。在必要條件下也可由單獨(dú)模塊完成業(yè)務(wù)邏輯。
4. 易維護(hù)性:系統(tǒng)功能模塊相互獨(dú)立,修改單一模塊不會(huì)影響其它部分功能。需要根據(jù)用戶需求改變的復(fù)雜的數(shù)據(jù)處理位于中間業(yè)務(wù)邏輯層,對其修改不會(huì)影響底層數(shù)據(jù)訪問層及表現(xiàn)層。降低了維護(hù)成本和維護(hù)時(shí)間。
5. 先進(jìn)性:參數(shù)字段選擇,采用業(yè)界成熟的瀏覽器和服務(wù)器結(jié)構(gòu) ( B / S ),三層體系結(jié)構(gòu),面向?qū)ο蟮脑O(shè)計(jì)方法。采用 Microsoft SQL Server 2008 R2 關(guān)系型數(shù)據(jù)庫,實(shí)現(xiàn)多表之間復(fù)雜邏輯關(guān)系,完美解決了對于同一患者多次入院治療,同一患者多種疾病,同一疾病多部位,同一患者多次手術(shù)信息存儲(chǔ)問題。采用結(jié)構(gòu)化查詢語言 ( structured query language,SQL ) 進(jìn)行存取數(shù)據(jù)以及查詢、更新和管理關(guān)系數(shù)據(jù)庫。字段內(nèi)容容量及查詢方法多樣都優(yōu)于國外同類數(shù)據(jù)庫。
6. 標(biāo)準(zhǔn)化:數(shù)據(jù)以標(biāo)準(zhǔn)化字段形式體現(xiàn),目前每位患者包括約 200 個(gè)字段。字段內(nèi)容 90% 以上為標(biāo)準(zhǔn)化,通過單 ( 多 ) 項(xiàng)選擇進(jìn)行輸入,保證數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、正確。字段設(shè)計(jì)參考 SEER 等標(biāo)準(zhǔn)腫瘤數(shù)據(jù)庫,其中診斷項(xiàng)目參照 WHO2013 最新骨與軟組織腫瘤分類和 icd10 分別編碼,以保證將來與國外相關(guān)數(shù)據(jù)庫交流的可行性。從患者入院、化療、手術(shù)、出院、隨訪等各個(gè)環(huán)節(jié),建立了完整標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)收集機(jī)制,保證數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)更新及數(shù)據(jù)完整性。
7. 易用:檢索方式多樣,界面清晰。輸入界面交互性好,以選擇為主,減少手工輸入內(nèi)容,操作方便,可以被大部分中等以上文化程度的人理解和使用。
8. 實(shí)時(shí)查詢:采用瀏覽器和服務(wù)器結(jié)構(gòu) ( B / S ),數(shù)據(jù)庫中內(nèi)容輸入或修改后可以實(shí)時(shí)查詢。
9. 獨(dú)立 / 共享:此系統(tǒng)雖然是單中心開發(fā),但在研發(fā)起始就規(guī)劃為可以提供多中心使用。其數(shù)據(jù)存儲(chǔ)及檢索應(yīng)用都可以滿足多中心同時(shí)獨(dú)立使用或數(shù)據(jù)共享使用。
( 三 ) 發(fā)展方向
北京積水潭醫(yī)院骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫的建立是一個(gè)起點(diǎn),它標(biāo)準(zhǔn)化了數(shù)據(jù)庫模型、規(guī)范了數(shù)據(jù)收集流程、促進(jìn)了數(shù)據(jù)管理,實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)共享、發(fā)布了共享信息。“一花獨(dú)放不是春,百花齊放春滿園”,在使用數(shù)據(jù)庫、享受數(shù)據(jù)庫提供的便利同時(shí),筆者向全國骨與軟組織腫瘤專業(yè)醫(yī)生推廣,免費(fèi)使用此數(shù)據(jù)庫,使每一名醫(yī)生挖掘到數(shù)據(jù)的財(cái)富。把骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫發(fā)展成為大數(shù)據(jù)應(yīng)用平臺(tái),提供真實(shí)的、專業(yè)的、權(quán)威的、先進(jìn)的、可靠的、實(shí)用的、有指導(dǎo)意義的數(shù)據(jù)。將來的發(fā)展方向,還需要從以下幾個(gè)方面開展:
1. 建立良好運(yùn)行機(jī)制:數(shù)據(jù)庫建設(shè)是一項(xiàng)有序的、動(dòng)態(tài)的、可持續(xù)發(fā)展的系統(tǒng)工程,必須建立良好的運(yùn)行機(jī)制,以促進(jìn)建設(shè)過程中各個(gè)環(huán)節(jié)的正規(guī)有序,實(shí)現(xiàn)統(tǒng)合。它包括數(shù)據(jù)庫的管理、研發(fā)、運(yùn)營、維護(hù)、使用等各個(gè)方面,是數(shù)據(jù)庫的頂層設(shè)計(jì)。需要協(xié)調(diào)互聯(lián)網(wǎng)服務(wù)提供商、數(shù)據(jù)庫運(yùn)營商、提供數(shù)據(jù)的醫(yī)療單位、使用數(shù)據(jù)的用戶等之間的責(zé)任、權(quán)利、義務(wù)等關(guān)系。特別是發(fā)展為多用戶系統(tǒng)后,多個(gè)用戶之間數(shù)據(jù)的獨(dú)立使用和數(shù)據(jù)共享之間關(guān)系需要協(xié)調(diào)。
2. 規(guī)范建設(shè)標(biāo)準(zhǔn):沒有標(biāo)準(zhǔn)就沒有系統(tǒng)。建立覆蓋整個(gè)骨與軟組織腫瘤領(lǐng)域、不斷動(dòng)態(tài)更新的數(shù)據(jù)建設(shè)標(biāo)準(zhǔn),為實(shí)現(xiàn)各級(jí)各類信息系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)互連、信息互通、資源共享奠定基礎(chǔ)。
3. 搭建數(shù)據(jù)共享平臺(tái):數(shù)據(jù)只有不斷流動(dòng)和充分共享,才有生命力。在以往的數(shù)據(jù)庫研發(fā)及運(yùn)行過程中,投入了大量的人力及資金,這也是曾經(jīng)限制眾多醫(yī)院建立數(shù)據(jù)庫的難題。但隨著互聯(lián)網(wǎng)企業(yè)商業(yè)模式的轉(zhuǎn)變,與互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)提供商協(xié)作機(jī)制也發(fā)生變化,在技術(shù)研發(fā)及維持?jǐn)?shù)據(jù)庫運(yùn)行方面的費(fèi)用直線下降,甚至可以給用戶提供免費(fèi)數(shù)據(jù)共享平臺(tái)。已有單中心數(shù)據(jù)庫的單位可以通過數(shù)據(jù)集成,實(shí)現(xiàn)各級(jí)各類信息系統(tǒng)的數(shù)據(jù)交換和數(shù)據(jù)共享。使單中心數(shù)據(jù)庫向多中心數(shù)據(jù)庫發(fā)展,并進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)向大數(shù)據(jù)平臺(tái)的轉(zhuǎn)變。
4. 開發(fā)一系列數(shù)據(jù)應(yīng)用:數(shù)據(jù)的應(yīng)用主要是指對歷史數(shù)據(jù)的利用。包括對數(shù)據(jù)的一般性檢索和統(tǒng)計(jì)分析、BI 數(shù)據(jù)挖掘。更重要的是為臨床及科研工作提供途徑、工具、手段和方法來利用這些數(shù)據(jù),這才能體現(xiàn)大數(shù)據(jù)的價(jià)值。
5. 數(shù)據(jù)收集方式的進(jìn)步:數(shù)據(jù)收集是大數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)。目前只有大醫(yī)生或大醫(yī)院才關(guān)注數(shù)據(jù)庫建設(shè),而臨床工作的繁重讓絕大多數(shù)一線醫(yī)生無暇顧及數(shù)據(jù)的收集。他們需要的是高效率、簡單易行的臨床輔助工具,而不是在原有工作上再增加額外的負(fù)擔(dān)。因此,如何讓作為醫(yī)療服務(wù)主體的醫(yī)生接受數(shù)據(jù)庫、建設(shè)數(shù)據(jù)庫、使用數(shù)據(jù)庫才是數(shù)據(jù)庫發(fā)展的前提。數(shù)據(jù)的收集需要解決數(shù)據(jù)錄入和訪問的快捷問題,才能得到作為使用者的醫(yī)生的擁護(hù)。聯(lián)通各個(gè)醫(yī)院封閉的 HIS 系統(tǒng),建立兼容性數(shù)據(jù)接口是努力方向。
6. 人才培養(yǎng):大數(shù)據(jù)時(shí)代需要三個(gè)方面人才,一是技術(shù)相關(guān)人才,包括 IT、系統(tǒng)、硬件和軟件;二是數(shù)據(jù)相關(guān)人才,包括統(tǒng)計(jì)、數(shù)學(xué)、建模、算法;三是業(yè)務(wù),就是要有一定的專業(yè)醫(yī)學(xué)知識(shí)。建立大數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)本身就需要技術(shù)能力,但是怎么通過數(shù)據(jù)去做分析?這就需要數(shù)據(jù)能力。怎么確定建模或者分析的方向,這就需要業(yè)務(wù)能力。在數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)開發(fā)過程中,需要的技術(shù)人員就不只是 IT 方面的技術(shù)人員,還要有專業(yè)醫(yī)生密切參與才能夠把這個(gè)系統(tǒng)建好,否則根本無法掌握一個(gè)系統(tǒng)發(fā)展方向。
骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫的建立,需要建立者對疾病的整個(gè)診治和隨訪過程有詳細(xì)深入的認(rèn)識(shí)。因此,數(shù)據(jù)庫的設(shè)計(jì)需要包羅臨床所需要的幾乎全部參數(shù)。在使用過程中,需要對患者的數(shù)據(jù)記錄記載詳實(shí)。另外,復(fù)查系統(tǒng)的完善,不僅提示患者應(yīng)按時(shí)間來定期復(fù)查,也使得醫(yī)生對于患者的整個(gè)診治過程有更全面的理解。以上三點(diǎn)均從側(cè)面促進(jìn)了疾病診治水平的提高?,F(xiàn)在的數(shù)據(jù)庫已不是孤立的數(shù)據(jù)庫,由基礎(chǔ)數(shù)據(jù)生成的流行病學(xué)數(shù)據(jù)可以供專業(yè)的和非專業(yè)的人士免費(fèi)查詢,其數(shù)據(jù)還可以與影像學(xué)數(shù)據(jù)和組織庫數(shù)據(jù)進(jìn)行連接,以保證更深層次的需求。完善的數(shù)據(jù)庫對于醫(yī)學(xué)科學(xué)研究的發(fā)展有著重要的意義,面對數(shù)據(jù)庫,在科研選題和立項(xiàng)上不僅為研究者提供了更多想法,而且為科學(xué)研究直接提供數(shù)據(jù)支持,這些數(shù)據(jù)可以直接為第三方檢驗(yàn)提供支持,杜絕醫(yī)學(xué)造假。筆者相信:骨與軟組織腫瘤數(shù)據(jù)庫的建立,最終會(huì)從臨床和科研兩個(gè)方面促進(jìn)本專業(yè)的健康發(fā)展,最終體現(xiàn)自身良好的社會(huì)效益和經(jīng)濟(jì)效益。筆者呼吁,所有有志于骨與軟組織腫瘤事業(yè)的醫(yī)療人員和科研人員加入到專業(yè)數(shù)據(jù)庫的建設(shè)中來,為我國骨與軟組織腫瘤事業(yè)的進(jìn)一步發(fā)展而努力。
( 本文編輯:李貴存 )
Establishment process of bone and soft tissue database of Beijing Jishuitan Hospital: nearly 20 years experience
NIU Xiao-hui, LI Yuan, XU Hai-rong.
Department of Orthopedic Oncology Surgery, Beijing Jishuitan Hospital, 100035, PRC
Cancer database is dedicated to understand the cancer incidence, the treatment and the prognosis. Eventually, the data are to develop and improve cancer prevention and control strategies for the government. Due to the low incidence of bone and soft tissue tumors, the diagnosis and treatment have always been difficult. To establish a database of bone tumor is much more difficult than to establish a general cancer database, such as lung cancer, breast cancer database. Department of orthopedic oncology surgery ( Beijing Jishuitan Hospital ) is one of the earliest professional centers in China exclusively treating bone and soft tissue tumors. The setup of this database generally reflects the establishment of the basic profile of the bone and soft tissue tumor database of China. Current papers describe the basic development of database of tumors at home and abroad, and introduce the currently widely used hospital information system. And its main features are illustrated as well. The database of Beijing Jishuitan Hospital can be traced back to 1977. It has gone through the paper registration, stand-alone and network version of the development process. The basic characteristics can be summarized as follows: secure, stable, scalable, easy to maintain, advanced, standardized, easy to use, real-time inquiry, independent / share. Lastly, prospect of its development is introduced including the establishment of well-functioning mechanisms that regulate construction standards, setting up of datasharing platform for the development progress of a series of data applications, data collection methods, and personnel training aspects. It is worth noting that we are inviting all national experts focusing on bone and soft tissue tumors to use this database for free.
Bone tumors; Soft tissue tumors; Database
10.3969/j.issn.2095-252X.2015.09.002
R738.1
100035 北京積水潭醫(yī)院骨腫瘤科
2015-08-14 )