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    數(shù)據(jù)挖掘及其在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用

    2014-12-31 00:00:00夏朦
    電子世界 2014年10期

    【摘要】簡要介紹數(shù)據(jù)挖掘的基本概念和功能。針對醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)的隱私性、不完整性、復(fù)雜性,闡述數(shù)據(jù)挖掘在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用,主要包括:作為HIS系統(tǒng)的補充,對醫(yī)療質(zhì)量、手術(shù)室感染進行管理;輔助科研統(tǒng)計,降低藥物開發(fā)成本;輔助醫(yī)學(xué)診斷,預(yù)測疾病趨勢。最后,對數(shù)據(jù)挖掘的發(fā)展前景作出預(yù)測提出期望。

    【關(guān)鍵詞】數(shù)據(jù)挖掘;醫(yī)學(xué)應(yīng)用

    1.數(shù)據(jù)挖掘的基本概念

    數(shù)據(jù)挖掘(Data Mining)就是從大量的、不完全的、有噪聲的、模糊的、隨機的實際應(yīng)用數(shù)據(jù)中,提取隱含在其中的、人們事先不知道的、但又是潛在有用的信息和知識,并表現(xiàn)為概念、規(guī)則、規(guī)律、模式等形式的過程[1]。

    這個定義包括好4層含義:數(shù)據(jù)挖掘的數(shù)據(jù)源是真實的、大量的、含噪聲的[2];挖掘發(fā)現(xiàn)的是用戶感興趣的知識;所發(fā)現(xiàn)的知識是可接受、可理解、可運用的,同時盡可能將它們用自然語言的形式被表達出來;這些被提取的知識不是絕對的,而是在某個特定條件和領(lǐng)域里面才成立。

    2.數(shù)據(jù)挖掘的功能

    2.1 自動預(yù)測趨勢和行為

    數(shù)據(jù)挖掘自動在大型數(shù)據(jù)庫中尋找預(yù)測性信息,以往需要進行大量手工分析的問題如今可以迅速直接由數(shù)據(jù)本身得出結(jié)論。例如:數(shù)據(jù)挖掘使用過去有關(guān)促銷的數(shù)據(jù)來尋找未來投資中回報最大的用戶,其它可預(yù)測的問題包括預(yù)報破產(chǎn)以及認(rèn)定對指定事件最可能作出反應(yīng)的群體。

    2.2 關(guān)聯(lián)分析

    數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)是數(shù)據(jù)庫中存在的一類重要的可被發(fā)現(xiàn)的知識。若兩個或多個變量的取值之間存在某種規(guī)律性,就稱為關(guān)聯(lián)。關(guān)聯(lián)可分為簡單關(guān)聯(lián)、時序關(guān)聯(lián)、因果關(guān)聯(lián)。關(guān)聯(lián)分析的目的是找出數(shù)據(jù)庫中隱藏的關(guān)聯(lián)網(wǎng)。有時并不知道數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)函數(shù),即使知道也是不確定的,因此關(guān)聯(lián)分析生成的規(guī)則帶有可信度。

    2.3 聚類

    數(shù)據(jù)庫中的記錄可被化分為一系列有意義的子集,即聚類。聚類增強了人們對客觀現(xiàn)實的認(rèn)識,是概念描述和偏差分析的先決條件。主要包括傳統(tǒng)的模式識別方法和數(shù)學(xué)分類學(xué)。

    2.4 概念描述

    概念描述就是對某類對象的內(nèi)涵進行描述,并概括這類對象的有關(guān)特征。概念描述分為特征性描述和區(qū)別性描述。

    2.5 偏差檢測

    數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)常有一些異常記錄,從數(shù)據(jù)庫中檢測這些偏差很有意義。偏差包括很多潛在的知識,如分類中的反常實例、不滿足規(guī)則的特例、觀測結(jié)果與模型預(yù)測值的偏差、量值隨時間的變化等。偏差檢測的基本方法是,尋找觀測結(jié)果與參照值之間有意義的差別[3]。

    3.醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘的特點

    隱私性;不完整性;復(fù)雜性。

    4.數(shù)據(jù)挖掘在醫(yī)學(xué)中的具體應(yīng)用

    4.1 醫(yī)院管理

    4.1.1 HIS系統(tǒng)的補充和升級

    國內(nèi)不少醫(yī)院已經(jīng)引入醫(yī)院信息系統(tǒng)(Hos-pital Information System,簡稱HIS[4])。HIS系統(tǒng)作為醫(yī)學(xué)信息學(xué)的一個分支,分為管理信息系統(tǒng)和臨床信息系統(tǒng)前者主要處理醫(yī)院內(nèi)部管理方面的信息如人事、財務(wù)和設(shè)備管理等,而后者是以處理患者為中心的信息系統(tǒng),如患者人院、住院、治療、檢查、出院等一系列與患者有關(guān)的信息。但是HIS停留在了基于數(shù)據(jù)庫技術(shù)支持的操作型事務(wù)處理的水平上,僅僅可以實現(xiàn)數(shù)據(jù)的錄入、修改、查詢等簡單功能,諸如利潤預(yù)測、發(fā)病率統(tǒng)計等等問題就要靠構(gòu)建數(shù)據(jù)挖掘模型來解決。

    4.1.2 醫(yī)療質(zhì)量管理

    醫(yī)改大潮下,緊張的醫(yī)患關(guān)系、醫(yī)療資源的嚴(yán)重不足等等諸多問題擺在眼前。這就需要院方對本院的醫(yī)療質(zhì)量進行管理和檢測。利用DM技術(shù)中的環(huán)基比和定基比可以分析一眼門診量、住院量、收入等的增長速度,反映醫(yī)院的工作量和發(fā)展趨勢。利用DM的灰色關(guān)聯(lián)分析方法還可以對醫(yī)院收治患者人數(shù)的影響因素進行分析,得到住院患者手術(shù)人次、病床周轉(zhuǎn)次數(shù)、年平均醫(yī)生數(shù)等因素的關(guān)聯(lián)度,幫助發(fā)現(xiàn)提高臨床服務(wù)效率和質(zhì)量的方法[5]。

    4.1.3 手術(shù)室感染管理

    對手術(shù)室感染的管理,DM的技術(shù)重點放在手術(shù)室消毒滅菌工作與消毒效果和監(jiān)測結(jié)果產(chǎn)生規(guī)律搭配上,使手術(shù)室感染管理的常規(guī)工作有據(jù)可查。對手術(shù)室環(huán)境、無菌用品、消毒液的生物監(jiān)測工作;手術(shù)室的無菌操作、消毒隔離技術(shù)規(guī)范;消毒液的效果與質(zhì)量、無菌物品及一次性用品的保存;醫(yī)院感染的監(jiān)控和報告;手術(shù)室人員進行的消毒滅菌和院內(nèi)感染崗位培訓(xùn)直至醫(yī)用廢棄物的科學(xué)分類和無害化處理等進行一系列的質(zhì)量跟蹤分析[6]。

    4.2 科研和藥物開發(fā)

    數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)已經(jīng)被應(yīng)用到醫(yī)療衛(wèi)生的各個領(lǐng)域,在基因研究和藥物開發(fā)等科研中都獲得了豐碩的成果,在數(shù)據(jù)分析的效率上與傳統(tǒng)的統(tǒng)計分析方法相比更加高效。

    4.2.1 科研統(tǒng)計

    隨著人類基因組計劃的進行,目前己獲得數(shù)十億的核背酸和上百萬的氨基酸的數(shù)據(jù),如何從這大量的1)NA數(shù)據(jù)中找到具有統(tǒng)計特異性的序列(組)就成為最迫切需要解決的問題。很多研究者[7-10]嘗試采用數(shù)據(jù)挖掘工具對基因組測序數(shù)據(jù)進行分析,結(jié)果表明數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)較傳統(tǒng)的統(tǒng)計分析方法更為有效。

    4.2.2 新藥開發(fā)

    在新藥開發(fā)的過程中,需要通過數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)來完成開發(fā)新藥物的系統(tǒng)設(shè)計,挖掘出新藥構(gòu)成的化學(xué)物質(zhì),減少新藥開發(fā)研究的成本和時間。因此,數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)對于藥物的毒理學(xué)研究以及新的副作用研究有重要意義

    4.3 輔助醫(yī)學(xué)診斷、分析、預(yù)測

    4.3.1 疾病診斷

    正確的診斷對于病人的用藥、手術(shù)、復(fù)健等都尤為重要。數(shù)據(jù)挖掘?qū)?shù)據(jù)源進行清洗和分類,模糊聚類壓縮處理醫(yī)學(xué)影像,灰度分析對疾病相關(guān)因素的關(guān)聯(lián)性分析等等都對醫(yī)生的診斷提供了幫助。數(shù)據(jù)挖掘輔助診斷的實例在國內(nèi)外都不少。國內(nèi),有研究者利用Fayyad輔助中醫(yī)診脈,將粗糙集理論應(yīng)用與中醫(yī)類風(fēng)濕診斷[11],大大提高了診斷準(zhǔn)確率。

    4.3.2 疾病趨勢分析

    根據(jù)病人的病史,身體狀況,結(jié)合對某類疾病的規(guī)律、誘因等的分析,預(yù)測疾病發(fā)展趨勢,有針對性地進行預(yù)防。

    5.結(jié)語

    數(shù)據(jù)挖掘作為近幾年來迅速發(fā)展的新興研究領(lǐng)域,在商業(yè)、公共管理、醫(yī)學(xué)等方面都有著廣泛的應(yīng)用前景。尤其在醫(yī)學(xué)方面,隨著醫(yī)改的不斷深入,醫(yī)院信息化逐步進入醫(yī)院管理層乃至普通百姓的視線,雖然數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用剛剛起步,尚處于摸索階段,隨著數(shù)據(jù)庫、人工智能等技術(shù)的發(fā)展,數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)會日臻完善,必將為醫(yī)學(xué)管理決策、科學(xué)研究帶來極大的方便和可觀的效益;在現(xiàn)有的HIS、PACS的基礎(chǔ)上,數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)必將成為醫(yī)療信息化發(fā)展的最大助力。

    參考文獻

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    [3]韓煌.數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在醫(yī)院信息系統(tǒng)中的應(yīng)用[J].醫(yī)學(xué)信息學(xué)雜志,2010,31(10):25-31.

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    [5]Wolf Stuglinger et al. Intelligent Data Mining for Medical Quality Management [OL].http://www.ifs.tuwien.ac.at/~silvia/i-damap-2000

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    [9]King RD,Karwath A,Clare A, et al.Accurate prediction of protein functional class from sequence in the Mycobacterium tuberculosis and Escherichia coli genomes using data mining[J].Yeast,2000,17(4):283-293.

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    [11]秦中廣,等.粗糙集在中醫(yī)類風(fēng)濕征候診斷中的應(yīng)用[J].中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)報,2001,20(4):357-363.

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