孫 鳴,馬智勇,黃朝陽(yáng),胡 斌△,沈關(guān)心(1.廈門(mén)大學(xué)附屬第一醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)科,福建
廈門(mén) 361003;2.華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)系,湖北武漢 430030;3.廈門(mén)大學(xué)附屬第一醫(yī)院檢驗(yàn)科,福建廈門(mén) 361003)
乙型肝炎病毒(HBV)是一種嗜肝DNA病毒,是導(dǎo)致人類(lèi)急性和慢性乙型肝炎的主要原因。目前在乙型肝炎治療方面,基于RNA干擾的基因治療成為HBV感染者新的治療策略[1-5]。但是,如何將siRNA或siRNA表達(dá)盒靶向?qū)?HBV感染的肝細(xì)胞是目前應(yīng)用RNA干擾治療HBV感染的主要難題之一[6]。乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)表達(dá)于HBV感染的肝細(xì)胞表面,而未感染的肝細(xì)胞不表達(dá)此抗原,是HBV基因治療的良好靶分子[4]。噬菌體展示技術(shù)是將外源的重組肽、蛋白質(zhì)包括抗體片段融合到噬菌體衣殼蛋白上的一項(xiàng)基因技術(shù),是篩選特定分子、細(xì)胞甚至組織特異性小分子多肽的有利工具。本研究以HBsAg作為靶物質(zhì),應(yīng)用噬菌體展示肽庫(kù)技術(shù)篩選可以與HBsAg特異性結(jié)合的短肽序列,期望以此短肽為橋梁介導(dǎo)siRNA分子結(jié)合HBV感染的肝細(xì)胞,為乙型肝炎的靶向基因治療研究奠定基礎(chǔ)。
1.1 材料來(lái)源 Ph.D.-12TM 噬菌體隨機(jī)肽庫(kù)購(gòu)自 New England Biolabs公司(E8111L),庫(kù)濃度為1.0×1013pfu/mL,宿主 菌 為 E.coli2738,-96gⅢ 自 動(dòng) 測(cè) 序 引 物 (5′-CCC TCA TAG TTA GCG TAA CG-3′)由上海生物工程技術(shù)有限公司合成。試劑:HRP標(biāo)記的抗 M13蛋白Ⅷ單克隆抗體(#27-9421-01,anti-M13phageⅧ,1∶5 000稀釋工作濃度)購(gòu)自 GE healthcare公司。酵母表達(dá)的HBsAg由武漢生物制品研究所饋贈(zèng)。
1.2 方法
1.2.1 噬菌體隨機(jī)肽庫(kù)篩選結(jié)合HBsAg的特異性多肽 將酵母表達(dá)的 HBsAg抗原用0.1mol/L碳酸氫鈉(NaHCO3,pH 8.6)包被緩沖液稀釋成70μg/mL,每孔100μL包被96微孔板,4℃孵育過(guò)夜。倒掉包被液,每孔加滿封阻液[0.1mol/L NaHCO3,5mg/mL牛血清清蛋白(BSA),0.02%的 NaN3],4℃封阻2h。用 TBST(50mmol/L Tris-HCl,150mmol/L NaCl,0.1%Tween-20)快速洗板6次,每孔加入1.0×1011pfu的噬菌體,室溫輕搖震蕩60min,棄去未結(jié)合的噬菌體液,用TBST洗板10次,每孔加入非特異性鹽酸甘氨酸洗脫液(0.2 mol/L Glycine-HCl,pH 2.2,1mg/mL BSA)100μL,室溫輕搖10min,洗脫特異性結(jié)合的噬菌體,收集洗脫液于微量離心管,加入中和緩沖液15μL(1mol/L Tris-HCl,pH 9.1),留取5μL用于滴度測(cè)定,剩余洗脫物感染宿主菌ER2738進(jìn)行擴(kuò)增,回收后測(cè)滴度用于下一輪篩選。以上述方法進(jìn)行后面3輪篩選,使結(jié)合HBsAg的噬菌體克隆得到富集。
1.2.2 特異性結(jié)合HBsAg的噬菌體克隆測(cè)序 經(jīng)4輪篩選后,隨機(jī)挑取15個(gè)噬菌體克隆,提取DNA送公司測(cè)序。具體操作如下:將單個(gè)噬菌體克隆加入1mL ER2738培養(yǎng)物中進(jìn)行小量擴(kuò)增,取擴(kuò)增液500μL,加入200μL PEG/NaCl,混勻,室溫放置10min;10 000r/min,離心10min,棄上清液,加100 μL碘化物緩沖液(10mmol/L Tris-HCl,pH 8.0,1mmol/L EDTA,4mol/L NaI)和250μL無(wú)水乙醇懸浮沉淀,室溫溫育10min;10 000r/min,離心10min,棄上清液,用70%乙醇500 μL洗沉淀,再離心去上清液并晾干沉淀,滅菌超純水30μL懸浮即得高質(zhì)量的噬菌體克隆DNA。瓊脂糖凝膠電泳鑒定后,用肽庫(kù)-96gⅢ自動(dòng)測(cè)序引物送上海生物工程技術(shù)有限公司測(cè)序。
1.2.3 ELISA鑒定特異性結(jié)合HBsAg多肽的親和力 用包被緩沖液將HBsAg稀釋成20μg/mL,以每孔100μL包被微孔板,密封濕盒中4℃過(guò)夜。棄包被液,每孔加滿封阻液,4℃封阻2h。0.5%TBST洗板6次,然后按所測(cè)定的噬菌體滴度每孔加人5.0×1010pfu的噬菌體,室溫作用2h,0.5%Tween-20TBST洗板6次,再加入 HRP標(biāo)記的anti-M13phageⅧ(1∶5 000)抗體,作用1h,0.5%Tween-20TBST洗板6次,加入TMB顯色液和終止液。以酶標(biāo)儀讀取A450值。同時(shí)以20μg/mL BSA 100μL包被微孔板作無(wú)關(guān)蛋白對(duì)照。
1.2.4 劑量依賴結(jié)合實(shí)驗(yàn)鑒定特異性結(jié)合HBsAg多肽的特異性 將HBsAg和無(wú)關(guān)蛋白m1ECD(小鼠肝臟去唾液酸糖蛋白受體大亞基胞外段)以不同濃度(1、2.5、10、40、70μg/mL)每孔100μL包被微孔板,4℃孵育過(guò)夜,并用封阻液4℃封閉2h,0.5%TBST 洗板6次。每孔加入5.0×1010pfu的 No.3號(hào)噬菌體和原庫(kù),室溫作用2h,0.5%Tween-20TBST洗板6次,再加入 HRP標(biāo)記的anti-M13phageⅧ(1∶5 000)抗體,作用1h,0.5%Tween-20TBST洗板6次,加入 TMB顯色液和終止液。以酶標(biāo)儀讀取A450值。
1.2.5 競(jìng)爭(zhēng)抑制實(shí)驗(yàn)鑒定特異性結(jié)合HBsAg多肽的特異性 按上述方法用20μg/mL HBsAg每孔100μL包被微孔板。將不同濃度140、70、40、20、10μg/mL 的 HBsAg取100 μL與1.0×1010pfu No.3號(hào)噬菌體上清液混勻,室溫作用2h?;靹蛭锛尤際BsAg包被微孔板內(nèi),室溫震蕩2h,0.5%TBST洗板6次,加入HRP標(biāo)記的anti-M13phageⅧ(1∶5 000)抗體孵育1h,再用0.5%TBST洗板6次,加入TMB顯色液和終止液。以酶標(biāo)儀讀取A450值。
1.3 儀器與試劑 TMB ELISA顯色液和終止液購(gòu)自上??迫A生物技術(shù)有限公司。其他試劑均為本室配置。主要儀器:高速離心機(jī)(Beckman JA-25.50)、低溫離心機(jī)(Sigma 3-16K)、酶標(biāo)儀(Thermo multiskan MK3)等。
2.1 特異性結(jié)合HBsAg多肽的篩選 以酵母表達(dá)的HBsAg作為靶分子,對(duì)噬菌體十二肽庫(kù)進(jìn)行了4輪篩選,第4輪回收率(回收/投入)比第1輪增加了20倍(表1)。又進(jìn)行了輪次ELISA鑒定,用ELISA鑒定每輪洗脫物擴(kuò)增后對(duì)HBsAg親和力的增加,與HBsAg結(jié)合的噬菌體得到了有效的富集,見(jiàn)圖1。
表1 從噬菌體十二肽庫(kù)篩選HBsAg結(jié)合肽
圖1 各輪洗脫物擴(kuò)增后對(duì)HBsAg的結(jié)合
2.2 特異性結(jié)合HBsAg的噬菌體克隆測(cè)序 第4輪篩選完成后,從洗脫物測(cè)滴度平板隨機(jī)挑取15個(gè)克隆,提取噬菌體DNA并送測(cè)序。結(jié)果顯示存在9種多肽序列No.1~No.9,其中No.1~No.3為優(yōu)勢(shì)序列。見(jiàn)表2。
表2 噬菌體克隆展示肽測(cè)序結(jié)果
2.3 ELISA鑒定特異性結(jié)合HBsAg多肽的親和力 擴(kuò)增No.1~No.9噬菌體,以噬菌體ELISA實(shí)驗(yàn)檢測(cè)它們與HB-sAg的結(jié)合情況,優(yōu)勢(shì)克隆No.3與HBsAg結(jié)合最強(qiáng)。結(jié)果見(jiàn)圖2。
圖2 No.1~No.9噬菌體的ELISA鑒定
2.4 劑量依賴結(jié)合實(shí)驗(yàn)鑒定特異性結(jié)合HBsAg多肽的特異性 No.3號(hào)噬菌體與HBsAg的結(jié)合,隨著HBsAg包被濃度的增加而增加,而與無(wú)關(guān)蛋白m1ECD的結(jié)合沒(méi)有這種劑量依賴性。見(jiàn)圖3。
圖3 No.3號(hào)噬菌體與HBsAg的劑量依賴性結(jié)合
2.5 競(jìng)爭(zhēng)抑制實(shí)驗(yàn)鑒定特異性結(jié)合HBsAg多肽的特異性游離HBsAg與No.3號(hào)噬菌體預(yù)先結(jié)合后,能夠抑制噬菌體與包被HBsAg的結(jié)合,且游離HBsAg濃度越高,抑制作用越強(qiáng)。此外無(wú)關(guān)蛋白m1ECD對(duì)No.3號(hào)噬菌體與包被的HB-sAg結(jié)合沒(méi)有抑制作用。見(jiàn)圖4。
圖4 游離HBsAg對(duì)No.3號(hào)噬菌體與包被HBsAg結(jié)合的抑制
HBV感染是全球重要的公共衛(wèi)生問(wèn)題[7]。目前應(yīng)用于慢性乙型肝炎治療的藥物主要是干擾素和核苷酸類(lèi)似物,但干擾素因具有明顯的不良反應(yīng)限制了其長(zhǎng)期應(yīng)用,核苷酸類(lèi)似物停藥后易發(fā)生病毒DNA的反跳和肝功能異常[8]。本研究室和國(guó)內(nèi)外大量實(shí)驗(yàn)表明,RNA干擾(RNAi)可以有效抑制HBV的復(fù)制和基因表達(dá),有望成為一種新的HBV感染治療策略[1-5]。但是化學(xué)合成的siRNA和質(zhì)?;虿《据d體表達(dá)的shRNA缺乏肝細(xì)胞和肝臟的靶向性,限制了RNAi技術(shù)在臨床上的應(yīng)用。如何將siRNA或siRNA表達(dá)盒靶向?qū)際BV感染的肝細(xì)胞,是將RNAi技術(shù)應(yīng)用于HBV感染的臨床治療研究必須予以解決的問(wèn)題之一。目前有多種方法用于細(xì)胞靶向的 RNAi,包括細(xì)胞表面特異性蛋白的單鏈抗體(scFv)[4,9]、適配子(aptamer)[10]所介導(dǎo)的siRNA導(dǎo)入,以及配體修飾的納米顆粒[11]介導(dǎo)的siRNA導(dǎo)入。它們共同點(diǎn)是找到了細(xì)胞特異性的蛋白分子,以此分子為靶標(biāo),再通過(guò)能與靶標(biāo)分子特異結(jié)合的橋梁分子(如單鏈抗體、適配子等)介導(dǎo)siRNA導(dǎo)入。
小分子多肽具有結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、分子量小、穿透性好、不易引起機(jī)體免疫應(yīng)答等優(yōu)點(diǎn),可以作為一種良好的橋梁分子,而噬菌體肽庫(kù)展示技術(shù)為篩選具有靶向作用的橋梁分子提供了一種有效的工具[12]。本次技術(shù)方案是通過(guò)噬菌體肽庫(kù)展示技術(shù)篩選靶向HBV感染肝細(xì)胞的靶向性多肽。在靶分子的選擇方面剛開(kāi)始從兩個(gè)方向考慮,一是HBV表達(dá)的蛋白分子,優(yōu)點(diǎn)是特異性強(qiáng),但表達(dá)豐度低;二是肝細(xì)胞表面特異性表達(dá)的分子,優(yōu)點(diǎn)是表達(dá)豐度高,但特異性一般。最終選取HBsAg為靶分子,HBsAg表達(dá)于HBV感染的肝細(xì)胞表面且表達(dá)豐度較高,未感染的肝細(xì)胞不表達(dá)此抗原,是靶向HBV感染的肝細(xì)胞最特異的靶分子[13]。本研究以酵母表達(dá)的HBsAg作為靶物質(zhì),對(duì)噬菌體隨機(jī)十二肽庫(kù)進(jìn)行了4輪篩選,第4輪的回收率比第1輪的回收率增加20倍,輪次ELISA鑒定發(fā)現(xiàn)與HBsAg結(jié)合的噬菌體得到了有效的富集。隨機(jī)挑選了15個(gè)噬菌體克隆進(jìn)行測(cè)序,并用ELISA方法檢測(cè)各個(gè)克隆對(duì)HB-sAg的親和力,結(jié)果顯示1個(gè)展示肽為SSYAPYVWQPIA的優(yōu)勢(shì)噬菌體克隆(No.3號(hào))對(duì)HBsAg具有較強(qiáng)的親和力。隨后的HBsAg劑量依賴結(jié)合實(shí)驗(yàn)中No.3號(hào)噬菌體與HBsAg的結(jié)合隨著HBsAg包被量的增加而增加,而與無(wú)關(guān)蛋白m1ECD的結(jié)合沒(méi)有這種劑量依賴性,表明No.3號(hào)噬菌體與HBsAg的結(jié)合是特異性的。進(jìn)一步的競(jìng)爭(zhēng)抑制實(shí)驗(yàn),先用游離HBsAg與No.3號(hào)噬菌體預(yù)先孵育后,能夠抑制噬菌體與包被HBsAg的結(jié)合,且游離的HBsAg濃度越高,抑制作用越強(qiáng),而無(wú)關(guān)蛋白m1ECD對(duì)No.3號(hào)噬菌體與包被的HBsAg結(jié)合沒(méi)有抑制作用,這個(gè)結(jié)果進(jìn)一步證明了該噬菌體展示肽與HBsAg結(jié)合是特異性的,因此認(rèn)為十二肽SSYAPYVWQPIA可以作為橋梁分子用于乙型肝炎的基因治療。
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