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      基于元胞自動機(jī)帶有隔離干預(yù)的傳染病模型

      2014-09-18 09:16:18剛家泰戴欽武李淑娟譚欣欣
      大連大學(xué)學(xué)報(bào) 2014年3期
      關(guān)鍵詞:感者自動機(jī)染病

      剛家泰,戴欽武,李淑娟,譚欣欣*

      (大連大學(xué) 信息工程學(xué)院,遼寧 大連 116622)

      0 引言

      傳染病的爆發(fā)和流行一直都是困擾人們的重大問題。近年來發(fā)生的SARS、禽流感、甲型H1N1流感、艾滋?。℉IV/AIDS)等,以及剛剛發(fā)生的H7N9型禽流感,給國民經(jīng)濟(jì)和人民生活帶來了巨大的傷害。因此,對傳染病預(yù)防和控制措施的研究已迫在眉睫。

      元胞自動機(jī)模型具有時間上、空間上和狀態(tài)上都離散的特性[1],以局部規(guī)則同步演化來反映整個系統(tǒng)的復(fù)雜變化,這與傳染病的傳播機(jī)制十分相似,已經(jīng)成為研究傳染病學(xué)的一個重要方法。

      文獻(xiàn)[2,3]指出,傳染病傳播期間,縮短病人從發(fā)病到醫(yī)院就醫(yī)的時間,是疫情防疫中最先考慮的關(guān)鍵措施;文獻(xiàn)[4]建立了元胞自動機(jī)模型,從醫(yī)療干預(yù)角度,研究了隔離治療對傳染病傳播的影響;文獻(xiàn)[5,6]利用元胞自動機(jī)模型對 SARS的傳播進(jìn)行了仿真模擬,提出較高的隔離水平對抑制傳染病傳播是十分有效的;文獻(xiàn)[7]擴(kuò)展了元胞自動機(jī)模型,建立了Agent動態(tài)網(wǎng)絡(luò)的疾病傳播模型,結(jié)合個體異質(zhì)性研究了隔離力度對傳染病傳播的影響;文獻(xiàn)[8]根據(jù)實(shí)際情況提出了一個與時間有關(guān)的帶有隔離機(jī)制的病毒傳播模型。

      影響傳染病傳播的基本因素有個體的異質(zhì)性,移動性以及發(fā)現(xiàn)疫情后政府采取的隔離措施,但同時考慮這三個因素對傳染病傳播的影響還少有研究。本文建立含有個體異質(zhì)性、移動性和帶有隔離干預(yù)措施的傳染病數(shù)學(xué)模型,結(jié)合甲型H1N1流感染病人數(shù)的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),對傳染病的傳播進(jìn)行模擬仿真,進(jìn)一步分析染病停留時間和隔離力度對傳染病傳播的影響,揭示傳染病傳播的防治機(jī)理。

      1 SIQR傳染病模型

      根據(jù)傳染病傳播的特點(diǎn),采用傳染病動力學(xué)的建模思想,將研究人群劃分為五類:易感者(S),染病者(I),隔離者(Q),康復(fù)者(R)和死亡者(D)。其中S 是不具有免疫力的健康人群;I是已染病但未被隔離的人群,對外具有傳染性;Q是染病后被隔離的人群,對外無傳染性;R是經(jīng)治療痊愈的康復(fù)人群且具有免疫力;D為死亡人群,已退出傳染病傳播過程。整個傳染病傳播的流程圖如圖1所示。其中p為易感者被感染的概率,q為染病者被隔離的概率,μ為隔離者的恢復(fù)率,λ1,λ2為在染病期和隔離期人群的因病死亡率:

      圖1中,易感者本身沒有傳染能力,在自由環(huán)境下可以隨機(jī)移動;染病者具有較強(qiáng)傳染能力,當(dāng)其移動到易感者鄰域內(nèi)或者易感者向它移動時,易感者將會以不同的概率被感染成為染病者;染病者會以一定的概率被隔離,隔離者失去了與外界接觸交流的機(jī)會,不再具有傳染能力;染病者無論是否被隔離,最終結(jié)果是治愈成為康復(fù)者或者因病死亡;康復(fù)者具有較長時期的免疫力,短期內(nèi)不會再次被感染。

      1.1 隔離干預(yù)

      隔離干預(yù)是指對傳染病傳播過程中被感染的患者進(jìn)行隔離治療,使其避免與周圍鄰居接觸交流,防止交叉感染和傳染病的擴(kuò)散。F.B.[9]提出:如果沒有藥物或者疫苗防治,對傳染病傳播的最重要和最有效的防控措施就是隔離干預(yù);在防治傳染病爆發(fā)或者流行期間,增加隔離的力度是最具成本效益的戰(zhàn)略。Franks G. Ball[10]建立了關(guān)于傳染病傳播的SEIR隨機(jī)模型,結(jié)果表明:有效的隔離干預(yù)對傳染病傳播的遏制效果顯著性比單純地對群體進(jìn)行疫苗接種效果高。因此,研究對傳染病傳播的有效隔離干預(yù),可以為控制傳染病傳播提供有力的理論支持。

      假設(shè)傳染病的傳染方式是人與人的近距離接觸和交流,一旦對染病者進(jìn)行隔離干預(yù),就可以達(dá)到控制疾病傳播的目的。本文選取染病停留時間T和隔離力度q這兩個參數(shù),綜合考察隔離干預(yù)這一機(jī)制對傳染病傳播的影響。

      染病停留時間T,表示易感者通過與外界帶菌個體接觸后,從被感染上疾病到被隔離治療這段時間間隔。T值越小,說明染病者被隔離的越早。

      隔離力度q,表示染病者被隔離的概率,反映采取隔離措施的強(qiáng)度。q值越大,說明易感者和帶菌個體相互間交流機(jī)會就越少,被傳染的概率也就越小。

      1.2 異質(zhì)性

      現(xiàn)實(shí)生活中,個體之間是有很大的差異性的[5,11],易感者對疾病具有不同的抵抗能力Ri.j,染病者具有不同的傳染能力fi,j,并且不同傳染性的染病者具有不同的傳染范圍,即個體間存在異質(zhì)性。為在模型中體現(xiàn)個體的異質(zhì)性這一特點(diǎn),引入有效接觸傳染概率

      傳染性疾病的傳播與接觸者之間的距離有關(guān),接觸者之間的距離越遠(yuǎn),彼此被傳染的概率越低,為進(jìn)一步說明接觸傳染概率,本文引入距離影響因子[4]

      Ci,j為中心元胞,為其摩爾鄰域內(nèi)的任一鄰居,是中心元胞Ci,j摩爾鄰域內(nèi)所有鄰居集合。

      綜合這些因素,定義中心元胞Ci,j的有效接觸傳染概率Pi,j為:

      Pi,j值越大說明越容易被傳染得病。

      1.3 移動性

      正是個體具有移動性,使得傳染病得以傳播。移動的比例足夠大或者移動距離較遠(yuǎn),會導(dǎo)致當(dāng)?shù)氐膫魅静∮蔁o病狀態(tài)轉(zhuǎn)為地方性的流行狀態(tài),或者單一性的流行,嚴(yán)重時會導(dǎo)致當(dāng)?shù)卣w的消失[12]。

      個體的移動性反映了實(shí)際中個體的活躍程度,個體活躍程度越高,傳染病的傳播速度越快,越容易造成大規(guī)模的疫情爆發(fā)。

      2 帶有隔離干預(yù)的元胞自動機(jī)原理

      元胞自動機(jī)是一個時間、空間和狀態(tài)都離散的,通過局部元胞的相互作用而引起全局變化的動力系統(tǒng)模型[1,5]??梢杂靡韵滦问奖磉_(dá):

      其中,CA 是指一個元胞自動機(jī)系統(tǒng),Ld 表示d維的元胞空間,本文取d=2,L×L表示元胞空間網(wǎng)格的規(guī)模;S 表示所有元胞狀態(tài)的有限離散集合;N 表示以某一元胞為中心的所有鄰居狀態(tài)的集合;f表示元胞狀態(tài)局部轉(zhuǎn)換函數(shù)。在每一離散的時間步,其轉(zhuǎn)換規(guī)則為f:St+1=f(St,Nt),即某一元胞下一時刻的狀態(tài)由它當(dāng)前時刻的狀態(tài)和周圍鄰居的狀態(tài)共同決定。

      2.1 擴(kuò)展的Moore鄰域

      本文將傳統(tǒng)的 Moore鄰域形式做一擴(kuò)展,不僅考慮鄰域內(nèi)人群局部范圍的交流,如家人,舍友、鄰居等,同時還考慮個體隨機(jī)與 Moore鄰域外區(qū)域的人群交流,如工作需要的出差,遠(yuǎn)方朋友拜訪等原因可能偶爾會接觸到的鄰居,這樣更符合實(shí)際個體運(yùn)動的特征。擴(kuò)展的Moore鄰域如圖2所示。

      在此基礎(chǔ)上,借鑒隨機(jī)行走元胞自動機(jī)的思想來描述個體的移動性,在每一時刻,都有一定比例(Percentage)的個體,以一定步長(Step)在網(wǎng)格空間中隨機(jī)移動,即對網(wǎng)格中所有的元胞進(jìn)行隨機(jī)掃描,對掃面到的元胞,標(biāo)記其坐標(biāo)為(i , j),同時生成兩個獨(dú)立的隨機(jī)數(shù)di和dj(∣di∣≤Step,∣dj∣≤Step),然后將(i , j)處的元胞與( i+di, j+ dj)處的元胞進(jìn)行交換[13,14],視為該元胞完成一次移動。

      2.2 元胞狀態(tài)演化規(guī)則

      本文建立二維的L×L網(wǎng)格空間,將t時刻網(wǎng)格空間的元胞狀態(tài)數(shù)值化,分別以{0,1,2,3,4}代表元胞Ci,j在t時刻{S,I,Q,R,D}五種狀態(tài)。

      設(shè)定所有元胞的初始狀態(tài)=0,即所有的元胞都視為易感者,隨機(jī)在該網(wǎng)格空間中取比例為0.0018的元胞作為初始染病者人數(shù),設(shè)定其狀態(tài)=1,稱為網(wǎng)格空間中的傳染病源。自t=0時刻開始,在每一個離散的時間步對網(wǎng)格空間的所有元胞進(jìn)行掃描,并按以下規(guī)則進(jìn)行元胞狀態(tài)更新。

      當(dāng)=1時,元胞Ci,j為染病者,設(shè)T1為染病周期,當(dāng)t<T1時,患者仍然處于染病期,在傳染病傳播過程中將以概率q被隔離,此時=2;當(dāng)t>T1時,染病者將被強(qiáng)制隔離,為=2。設(shè)病死率為λ1,染病期間部分染病者因病死亡,狀態(tài)變?yōu)樗劳稣?,?4;

      當(dāng)=2時,元胞C為隔離者,代表隔離者, i, j設(shè)T2為隔離周期,在該周期內(nèi),被隔離的染病者經(jīng)過治療,以一定的概率μ痊愈成為康復(fù)者,即更新狀態(tài)為=3,康復(fù)者在免疫周期T3內(nèi)保持很高的免疫力。隔離治療期間會有部分染病者死亡,設(shè)病死率為λ2,狀態(tài)轉(zhuǎn)為死亡者,即=4。

      當(dāng)=3時,元胞C為康復(fù)者,代表康復(fù)者,i, j在免疫周期T3內(nèi)具有較高免疫力,不會再次被感染;

      在每一個仿真步,對所有的元胞都先進(jìn)行一次隨機(jī)掃描,對掃描到的元胞給予記錄,然后按照所定義的最大步長和移動比例進(jìn)行隨機(jī)行走或者移動。

      基于以上的演化規(guī)則,網(wǎng)格空間中所有元胞在每一仿真步將同步更新,局部元胞之間的相互作用結(jié)果,就是下一仿真步整個群體的狀態(tài)。

      3 模型的仿真與結(jié)果分析

      3.1 模型的仿真

      根據(jù)SIQR模型的傳染病傳播流程,將以上元胞狀態(tài)演化規(guī)則應(yīng)用于擴(kuò)展的摩爾鄰域,對傳染病傳播過程進(jìn)行仿真模擬。設(shè)定網(wǎng)格空間由L×L=100×100的單元格構(gòu)成;初始感染概率為0.0018;每一步演化過程都會有Percentage=0.1比例的元胞,以最大的移動步長Step=10進(jìn)行移動。本文選取2009年6月16日至7月15日期間發(fā)生于中國境內(nèi)的甲型H1N1流感數(shù)據(jù)進(jìn)行仿真模擬,根據(jù)中華人民共和國衛(wèi)生部數(shù)據(jù)[15]統(tǒng)計(jì),假設(shè)易感者感染流感病毒后病發(fā)時間為7天,病死率為4%。由于甲型H1N1流感沒有相關(guān)的復(fù)發(fā)情況報(bào)道,認(rèn)為康復(fù)者的免疫周期為365天。圖3顯示 40天內(nèi)的模擬仿真數(shù)據(jù), 結(jié)果與實(shí)際數(shù)據(jù)較為吻合。

      圖3 甲型H1N1實(shí)際數(shù)據(jù)和模擬仿真數(shù)據(jù)對比

      由圖3可以看出,甲型流感在傳播初期,沒有受到任何的干預(yù)影響,流感病毒傳播速度較快,染病累計(jì)人數(shù)很快達(dá)到高峰,隨后開始緩慢下降。染病人數(shù)下降的原因,一是染病人數(shù)死亡,退出了傳播周期,導(dǎo)致被感染的人數(shù)減少;二是流感病毒傳播后期受到控制,染病個體被隔離進(jìn)行治療痊愈后成為康復(fù)者,使得群體中被感染的人數(shù)減少。

      為進(jìn)一步說明流感病毒傳播期間,隔離干預(yù)對傳染病傳播的影響,在設(shè)定的參數(shù)條件下,對上述仿真模型中的染病停留時間T和隔離力度q分別進(jìn)行變量調(diào)控,具體地分析隔離干預(yù)對傳染病傳播的影響。

      3.2 結(jié)果分析

      3.2.1 染病停留時間T對傳染病傳播的影響

      保持初始參數(shù)數(shù)值不變,通過改變仿真過程中的染病停留時間T的數(shù)值,研究染病停留時間的長短對傳染病傳播過程的影響。圖4表示分別取不同的染病停留時間T=5天、T=9天時累計(jì)染病人數(shù)和實(shí)際情況的累計(jì)染病人數(shù)對比。

      從圖4可以看出,在病人被感染后,提前兩天將其隔離,即染病停留時間為T=5天時,累計(jì)染病人數(shù)增加速度將會大大地減緩,染病人數(shù)達(dá)到峰值遠(yuǎn)低于實(shí)際數(shù)據(jù)下的峰值;而如果推后兩天隔離,染病停留時間為T=9天時,累計(jì)染病人數(shù)增加速度則會迅速加大,短時間就可以達(dá)到較高的數(shù)值,不僅高于實(shí)際情況,而且處于高峰期的時間也較長。

      病人所處的染病停留時間越長,病人在自由環(huán)境下活動的時間越久,接觸的易感者就越多,最終病人累計(jì)的人數(shù)就越多。所以,當(dāng)傳染病疫情爆發(fā)初期,及時減少病人處于自由環(huán)境下的滯留時間,縮短病人自被感染到隔離治療的染病停留時間,能夠?qū)魅静∫咔槠鸬矫黠@的抑制作用。因此,減少病人的染病停留時間是控制傳染病傳播的一個關(guān)鍵因素。

      圖4 不同的染病停留時間對甲型流感H1N1傳播的影響

      3.2.2 隔離力度q對傳染病傳播的影響

      隔離干預(yù)的實(shí)施,不僅與染病停留時間有關(guān),同時也和對染病者采取的隔離力度有關(guān)。對上述模型進(jìn)行修正,保持染病停留時間不變,改變隔離力度大小,分析隔離力度對傳染病傳播的影響,分別取q=0.15、q=0.35和q=0.55,圖5顯示了不同隔離力度對傳染病傳播的影響。

      圖5 不同隔離力度對甲型流感H1N1傳播的影響

      從圖5可以看出,在傳染病傳播過程中,隔離力度越大,累計(jì)染病人數(shù)越少,控制傳染病疫情的效果越顯著。當(dāng)q=0.15時,部分染病者由于被隔離治療,減少了他們與外界的接觸交流機(jī)會,被感染的人數(shù)減少,累計(jì)染病人數(shù)增加趨勢較為緩慢;當(dāng)q=0.35時,進(jìn)一步增大對染病者的隔離力度,累計(jì)染病人數(shù)相對實(shí)際情況有了大幅度的下降;當(dāng)q=0.55時,傳播初期,累計(jì)染病人數(shù)增加的趨勢較緩慢,短時間達(dá)到峰值后逐漸減少,疫情得以控制。因此,隔離力度對傳染病傳播具有重要影響,隔離力度越大,傳染病傳播越容易得到控制,當(dāng)隔離力度足夠大時候,傳染病來不及傳播就得以控制。

      4 總結(jié)

      本文建立了基于元胞自動機(jī)的SIQR模型,并以甲型H1N1流感為例進(jìn)行了模擬仿真。該模型說明了人們對已知或未知的傳染病傳播采取積極嚴(yán)格的隔離干預(yù)是十分必要和有效的。仿真結(jié)果表明:傳染病傳播初期,由于人們及相關(guān)部門對其不了解或者防范意識不深,未及時采取相應(yīng)的防控措施,短時期內(nèi)造成疾病的迅速擴(kuò)散,發(fā)展為大范圍內(nèi)的疫情爆發(fā);及早采取隔離措施,加大對染病者的隔離力度,減少患者的染病停留時間,可避免染病者在自由環(huán)境下滯留時間過長而產(chǎn)生更廣范圍的傳染。染病停留時間越短,隔離力度越大,被感染的病人就越少,傳染病傳播持續(xù)的時間越短,對傳染病傳播疫情的控制效果越顯著。

      同時,本文不僅考慮家人,舍友、鄰居等近距離人群之間交流的局部范圍,還考慮工作需要的出差、遠(yuǎn)方朋友拜訪等原因可能偶爾會接觸到的個體間交流,使個體的移動性更貼近實(shí)際。因此, 在元胞自動機(jī)原有的鄰域的基礎(chǔ)上,提出了擴(kuò)展的Moore鄰域,并對傳染病的傳播過程進(jìn)行模擬仿真。

      隨著研究的深入,將進(jìn)一步改進(jìn)完善模型,并結(jié)合中華人民共和國衛(wèi)生部網(wǎng)提供的真實(shí)數(shù)據(jù),考慮接種疫苗、初始感染率和傳染病病毒變異頻數(shù)等因素,從微觀角度分析探究傳染病的傳播機(jī)理,預(yù)測傳染病疫情的發(fā)展趨勢,為政府部門制定傳染病的防控措施提供最有力的理論支持。

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      [15]中華人民共和國國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會. 衛(wèi)生部甲型 H1N1流感防控工作信息通報(bào)[EB/OL]. http://www.nhfpc.gov.cn/search/search.jsp.

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