張建逵 趙彥輝 尹海波 王 冰 楊丹丹 樊麗娜
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東北地產(chǎn)藥用植物數(shù)據(jù)庫的建設(shè)與應(yīng)用※
張建逵 趙彥輝 尹海波 王 冰 楊丹丹 樊麗娜
(遼寧中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,大連116600)
為了滿足現(xiàn)代教學(xué)、科研手段的需要,我們開展了東北地產(chǎn)藥用植物數(shù)據(jù)庫的建設(shè)工作。本文就數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的開發(fā)、研究方法、特色與創(chuàng)新、應(yīng)用效益等方面內(nèi)容進(jìn)行介紹,希望能對其他數(shù)據(jù)庫建設(shè)提供有益的借鑒。
藥用植物;東北地區(qū);數(shù)據(jù)庫;信息系統(tǒng)
東北地區(qū)藥用植物資源豐富,是我國重要的藥用植物資源分布區(qū)之一,出產(chǎn)人參、黃柏、細(xì)辛、五味子等多種道地藥材。關(guān)于其藥用植物記載的資料較多,但相關(guān)的數(shù)據(jù)庫建設(shè)卻未見報道,在互聯(lián)網(wǎng)、信息技術(shù)高速發(fā)展的今天,傳統(tǒng)的利用信息的方法已不能滿足教學(xué)、科研和交流的需要,特別是現(xiàn)代教學(xué)、科研手段的需要。因此,建設(shè)一個將圖像信息、文字信息等集于一體的藥用植物數(shù)據(jù)庫是解決以上問題的較好選擇之一,這能更好地實(shí)現(xiàn)資源共享,助推教學(xué)、科研和資源的開發(fā)利用工作。近三年來,我們結(jié)合遼寧中醫(yī)藥大學(xué)現(xiàn)有藥用植物信息,建成東北地區(qū)地產(chǎn)藥用植物數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建了相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫功能,并在教學(xué)、科研工作中進(jìn)行了應(yīng)用實(shí)踐。現(xiàn)介紹如下。
本數(shù)據(jù)庫是以JavaEE版網(wǎng)站管理系統(tǒng)(JEECMS)為開發(fā)平臺,結(jié)合hibernate3+struts2+spring2+ freemarker框架結(jié)構(gòu)和WEB信息發(fā)布技術(shù),采用MySQL作為數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)[1-2]。
2.1資料收集、圖像信息采集課題組成員采集到原植物標(biāo)本數(shù)百份,收集到相關(guān)圖像信息幾千幅,均為現(xiàn)場實(shí)物拍攝所得。這些信息包括:不同生態(tài)環(huán)境、不同生長期下的同種植物的形態(tài)以及莖、葉、花、果實(shí)等器官的特寫圖像,這樣才能從多個角度反映出該植物的全貌。
我們查閱了如《東北藥用植物》、《長白山藥用植物》、《遼寧中藥志》、《遼寧植物志》、《東北植物檢索表》、《黑龍江植物志》、《中國植物志》等書籍,對采集到的標(biāo)本進(jìn)行科、屬、種的鑒定。最后從中整理出《中國藥典》2010年版一部所收載的東北地區(qū)地產(chǎn)的植物藥材(約100種),尤其是東北地區(qū)的道地藥材。其次是省部級標(biāo)準(zhǔn)如《部頒藥品標(biāo)準(zhǔn)》、《遼寧省中藥材標(biāo)準(zhǔn)》、《吉林省藥品標(biāo)準(zhǔn)》、《黑龍江省中藥材標(biāo)準(zhǔn)》收載的藥用植物(約90種),最后是民間習(xí)用的藥用植物(約180種)。我們撰寫出其描述信息,主要包括:植物種名、原植物形態(tài)描述、化學(xué)成分、功能主治、性味歸經(jīng)等內(nèi)容。以上內(nèi)容結(jié)合各類書籍、文獻(xiàn)所報道的各藥用植物近年來的研究進(jìn)展,加以充實(shí)完善而成。
2.2前期處理這個階段工作量較大而繁瑣,內(nèi)容包括:圖像挑選、壓縮,文字內(nèi)容的取舍、內(nèi)容格式的統(tǒng)一與匹配等,使之形成電子資源。
2.3數(shù)據(jù)庫設(shè)計整個信息系統(tǒng)分為前臺和后臺兩大模塊,在功能上,后臺管理員擁有數(shù)據(jù)錄入、存儲、修改、添加、查詢、檢索和系統(tǒng)維護(hù)模塊等功能;為前臺用戶擁有信息瀏覽、查詢、發(fā)表及查看評論等功能。
2.4系統(tǒng)樹的建立系統(tǒng)樹是整個數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)分類的依據(jù)和骨架,管理員在后臺登錄后,利用“添加欄目”的下拉框,選擇“文章模型”來添加欄目名(顯示名)、路徑名,選擇之后可選擇要添加內(nèi)容的樹枝,同時添加文章內(nèi)容。按照上述方法,分別添加“藻菌地衣類,苔蘚類植物,蕨類植物,裸子植物,被子植物”子欄目。按照此分類,將各個植物都分類到各個欄目中。
2.5信息錄入在對所有信息進(jìn)行整理和編號后,將其錄入數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)(見圖1),最后對錄入內(nèi)容進(jìn)行了交叉校對。
圖1 東北地區(qū)地產(chǎn)藥用植物數(shù)據(jù)庫后臺錄入界面
2.6數(shù)據(jù)發(fā)布將所有庫資源按照數(shù)據(jù)庫軟件要求,上傳至數(shù)據(jù)庫服務(wù)器進(jìn)行數(shù)據(jù)發(fā)布,并檢驗(yàn)是否符合設(shè)計要求,對其中不滿意的地方進(jìn)行微調(diào)。用戶在前臺可以進(jìn)行數(shù)據(jù)查詢(見圖2)。
該數(shù)據(jù)庫是國內(nèi)首個東北地產(chǎn)藥用植物數(shù)據(jù)庫,具有極強(qiáng)的地域性;其內(nèi)容較為豐富,包括了東北地區(qū)常用的中藥材和民間藥用植物;該數(shù)據(jù)庫收載的圖像信息非常豐富,不僅包括整體外觀形態(tài)的展現(xiàn),還有不同生態(tài)環(huán)境、不同生長期下的植物的形態(tài)及其器官的特寫,能為藥用植物的鑒別提供更大的幫助,這是國內(nèi)一般數(shù)據(jù)庫所不具備的[3]。本數(shù)據(jù)庫還具有實(shí)用性強(qiáng)、適用性強(qiáng)、擴(kuò)充性強(qiáng)的特點(diǎn)。
圖2 東北地區(qū)地產(chǎn)藥用植物數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站
由于本數(shù)據(jù)庫擴(kuò)充性較強(qiáng),因此建設(shè)—試運(yùn)行—改進(jìn)—更新工作同時進(jìn)行,大大提高了使用效率和相關(guān)功能的完善。在教學(xué)方面,對于中藥學(xué)專業(yè),該數(shù)據(jù)庫的使用在野外實(shí)習(xí)前起到了預(yù)習(xí)作用,在實(shí)習(xí)之后起到了復(fù)習(xí)的作用,改善了實(shí)習(xí)的學(xué)習(xí)效果;對于沒有任何的野外實(shí)踐教學(xué)的專業(yè)如制藥工程、藥物制劑、藥學(xué)等專業(yè),該數(shù)據(jù)庫加強(qiáng)了學(xué)生對于植物的感性認(rèn)識,提高了學(xué)生對知識的形象化認(rèn)識,而不僅僅去死記硬背知識點(diǎn),同樣起到了改善學(xué)習(xí)效果的作用。本數(shù)據(jù)庫收載的數(shù)據(jù)信息,突出了藥用植物鑒別特征和科特征,有利于學(xué)生對藥用植物學(xué)系統(tǒng)分類部分知識的學(xué)習(xí)和野外辨認(rèn)藥用植物能力的培養(yǎng),經(jīng)過藥學(xué)院2009級~2011級三個年級本科生的應(yīng)用實(shí)踐,許多同學(xué)感覺到數(shù)據(jù)庫改善了學(xué)習(xí)效果,提高了學(xué)習(xí)效率。
在科研方面,本數(shù)據(jù)庫很好地配合了中藥資源學(xué)、中藥鑒定學(xué)相關(guān)課題的研究,極大地提高了中藥資源學(xué)、中藥鑒定學(xué)專業(yè)研究生和青年教師的藥用植物辨別能力和經(jīng)驗(yàn),取得了較好的效果,截止目前總點(diǎn)擊率已達(dá)到3000余次。隨著即將到來的全國第四次中藥資源普查工作(遼寧地區(qū))的開展,該數(shù)據(jù)庫將發(fā)揮更大的作用。
5.1數(shù)據(jù)庫的更新與維護(hù)數(shù)據(jù)庫更新與維護(hù)包括硬件、軟件和數(shù)據(jù)三個方面??稍趯W(xué)校財力允許的情況下對數(shù)據(jù)庫的軟、硬件進(jìn)行更新維護(hù),以保證其運(yùn)行的順暢和功能的開發(fā)。數(shù)據(jù)的更新是數(shù)據(jù)庫建設(shè)的核心,數(shù)據(jù)庫建設(shè)不是一勞永逸的工作,應(yīng)不斷收集新的藥用植物資源到數(shù)據(jù)庫中,提高時效性。下一步的建設(shè)計劃中就包括增加藥材個子貨及飲片等內(nèi)容的更新。
5.2數(shù)據(jù)庫功能的開發(fā)盡管目前數(shù)據(jù)庫的功能已經(jīng)可以基本滿足大部分用戶的需求,但相對于國內(nèi)已經(jīng)開發(fā)的較為成熟的數(shù)據(jù)庫[4-5],其功能有待于進(jìn)一步的完善。隨著學(xué)校數(shù)字化校園建設(shè)工作的開展,我們也將在不久的將來推出該數(shù)據(jù)庫的手機(jī)版,更方便地為用戶提供服務(wù)。同時考慮擴(kuò)大訪問權(quán)限,實(shí)現(xiàn)更大范圍的信息資源共享,不僅為從事中藥學(xué)專業(yè)用戶服務(wù),也為全省需要這些資源的用戶服務(wù),為遼寧省的經(jīng)濟(jì)、文化建設(shè)做出貢獻(xiàn)。
[1]林曉宇,賴賢偉,寧正元.JAVA程序設(shè)計[M].南京:東南大學(xué)出版社,2007,1-4.
[2]李冬.建設(shè)網(wǎng)站寶典[M].北京:人民郵電出版社,2000,159-160.
[3]王國良,謝秋蘭.植物數(shù)據(jù)庫構(gòu)建研究進(jìn)展綜述[J].江蘇林業(yè)科技,2007,34(6):37-40.
[4]黃克南,郭超峰,侯小濤,等.中泰藥用植物專業(yè)數(shù)據(jù)庫中圖片的拍攝與制作[J].中國中醫(yī)藥現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育,2012,10(16):109-110.
[5]謝波,周欣欣,許秀.單味中藥數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)式教學(xué)應(yīng)用探索[J].中國中醫(yī)藥現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育,201311(8):73-74.
Construction and Application of Pharmaceutical Botany Database in Northeast of China
Zhang Jiankui Zhao YanhuiYin Haibo Wang Bing Fan Lina Yang Dandan
(Coliege of Pharmacy,Liaoning University of Traditional Chinese Medicine,Dalian,116600,China)
To meet the needs of modern teaching and researching,construction of pharmaceutical botany in Northeast of China database was carried out.In this paper,the exploitation of database,the research methods,characteristics and innovation,the application benefit are introduced in the hope that will provide useful references for other database construction.
Pharmaceutical Botany;Northeast of China;Database;information system
10.3969/j.issn.1672-2779.2014.04.081
:1672-2779(2014)-04-0125-02
蘇 玲 本文校對:王 冰
2013-10-31)
遼寧中醫(yī)藥大學(xué)教育科學(xué)研究課題;遼寧省“大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃”項(xiàng)目[No:201310162045]