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      重組SCIRR39多克隆抗體的制備及檢測

      2013-10-29 09:37:02倪艷麗李欣劉少君
      生物技術(shù)通訊 2013年1期
      關(guān)鍵詞:表位瓊脂糖效價

      倪艷麗,李欣,劉少君

      軍事醫(yī)學科學院 基礎(chǔ)醫(yī)學研究所,蛋白質(zhì)組學國家重點實驗室,北京 100850

      脊髓損傷與修復反應(yīng)受多種因素影響,是有多種分子參與的復雜的病理過程,目前其分子機理仍不明確,因而無法找到有效干預措施。脊髓損傷與修復蛋白39(spinal cord injury and regeneration re?lated protein 39,SCIRR39)基因是我們克隆到的在大鼠脊髓損傷及修復過程中上調(diào)表達的基因[1],是大鼠核糖核酸酶抑制因子基因的突變體[2-4],其編碼的蛋白以前只發(fā)現(xiàn)存在于胞漿內(nèi),而近年有報道顯示該蛋白還存在于細胞核及線粒體中[5],但功能不詳。為進一步研究該蛋白在中樞神經(jīng)系統(tǒng)和其他組織中的分布,及其在脊髓損傷修復過程中可能的作用,我們制備了針對該蛋白的特異性抗體,為中樞神經(jīng)系統(tǒng)損傷與修復機理研究提供有效的臨床干預線索。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      雄性成年日本大耳白兔(體質(zhì)量2.5 kg)購自軍事醫(yī)學科學院動物中心;大腸桿菌BL21(DE3)由本室保存;克隆載體pGEM-T/T easy、瓊脂糖、質(zhì)粒提取試劑盒購自Promega公司;EcoRⅠ、BamHⅠ等常用限制性內(nèi)切酶,DL2000 DNA marker,T4DNA連接酶,LA Taq、Pyrobest DNA 聚合酶,IPTG,X-gal,dNTP均購自TaKaRa公司;Super ScriptⅡ反轉(zhuǎn)錄酶、TRIzol試劑購自Invitrogen公司;瓊脂糖凝膠回收試劑盒購自Qiagen公司;其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

      1.2 PCR擴增Scirr39基因

      從大鼠全橫斷損傷脊髓提取RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,以此為模板擴增Scirr39基因片段。兩端引物分 別 為 39-ORF-5'(ATGTCTCTGGACATCCAGTC)和 39-ORF-3'(TCAGGAGATGACCCTCAGGGATG GC)。PCR 條件:94℃ 2 min,然后以 94℃ 20 s、60℃ 30 s、72℃ 2 min 進 行 30 個 循 環(huán) ,72℃ 7 min。PCR產(chǎn)物行1%瓊脂糖凝膠電泳,用膠回收試劑盒回收后,T-A克隆入pGEM-T easy載體中,將重組載體轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌DH5α,以EcoRⅠ酶切鑒定重組克隆后進一步測序鑒定,保存含有正確重組載體的菌種。

      1.3 pGEX-GST-SCIRR39-C融合表達載體的構(gòu)建

      以構(gòu)建的Scirr39 ORF載體為模板PCR擴增SCIRR39-C端抗原表位編碼DNA序列,引物分別為E39-N(CGTGGATCCGGCGGCGGCGGCAGCGGCG GCGGCGGCAGCGCGGAACTGTGCCAGGGCCCG)和E39-C(CGGGAATTCTCAGCTAATCACGCGCAGGC TCGGTTTATCT),兩端分別引入BamHⅠ和EcoRⅠ酶切位點(下劃線序列)及保護堿基,并在上游引物的5'端引入10個甘氨酸接頭。PCR條件:94℃ 5 min,然后以 94℃ 30 s、60℃ 30 s、72℃ 1 min 進行25個循環(huán),72℃ 7 min。PCR產(chǎn)物行1%瓊脂糖凝膠電泳,用膠回收試劑盒回收后,BamHⅠ和EcoRⅠ雙酶切回收目的片段,與經(jīng)相同酶消化的表達載體pGEX-4T-2連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,獲得表達載體 pGEX-GST-SCIRR39-C,經(jīng) BamHⅠ、EcoRⅠ雙酶切和測序驗證,表明目的基因已插入pGEX-4T-2。

      1.4 GST-SCIRR39-C融合蛋白的原核表達和純化

      把pGEX-GST-SCIRR39-C轉(zhuǎn)化表達菌株BL21(DE3),陽性克隆用LB培養(yǎng)基于37℃振搖過夜,取100 μL菌液加入10 mL氨芐西林抗性的LB培養(yǎng)基中,繼續(xù)培養(yǎng),D600nm達0.6~0.8時加入0.2 mmol/L IPTG誘導12~16 h,收集菌體,PBS洗3次,超聲波破碎,收集上清,用預裝谷胱甘肽瓊脂糖凝膠的GST rap FF柱親和純化,再用還原性谷胱甘肽洗脫GST-SCIRR39-C融合蛋白,所有純化操作均在GE Health公司?KTA Prime蛋白純化系統(tǒng)上進行,最后用SDS-PAGE鑒定融合蛋白的純化結(jié)果。

      1.5 SCIRR39-C抗原表位蛋白的分離

      用1 mL注射器,將80 μL凝血酶與920 μL 1×PBS的混合液注入GST rap柱,封閉柱兩端,23~24℃放置16 h;采用1 mL注射器,用3 mL 1×PBS以1 mL/min的流速洗下柱中解離下來的SCIRR39-C蛋白(懸于冰上操作),隨后用10 mL洗脫緩沖液以1 mL/min的流速洗脫柱中的GST蛋白(懸于冰上操作),以評價凝血酶酶切效率。純化后的SCIRR39-C蛋白經(jīng)冷凍干燥濃縮,以備檢測抗體效價時使用。

      1.6 抗體制備

      取飼養(yǎng)1周、體質(zhì)量為2.5 kg的純種日本大耳白兔,免疫前從耳緣靜脈取正常血清作為對照。將1 mg抗原與等體積弗氏完全佐劑混合直到形成乳濁液,采用背部多點皮下注射;2周后,取1 mg抗原與等體積弗氏不完全佐劑充分混勻,背部多點注射進行二次加強免疫;免疫后7~10 d從耳緣靜脈取血,ELISA測定抗體效價,若滴度小于1∶1000,進一步加強免疫,要求每2周免疫一次,直到抗體效價達到所需滴度;到所需滴度后的第10 d從頸動脈采血,采集的血液室溫斜置30 min,移到4℃冰箱待血清析出,收集血清后1000 r/min離心10 min,0.5 mL/支分裝,-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.7 ELISA測定抗體滴度

      用pH9.6的包被緩沖液將免疫所用蛋白稀釋至所需濃度(100 ng/100 μL),在酶標板每孔中加入100 μL,并將板置于濕盒中,4℃過夜或37℃保溫4 h;用PBS-T洗板3次后每孔加入200 μL封閉液,于37℃保溫1 h,隨后用PBS-T洗板3次;一抗用生理鹽水進行 1/10 梯度稀釋,100 μL/孔,4℃過夜,用PBS-T洗板3次,接著進行二抗反應(yīng),37℃保溫2 h,用PBS-T洗板3次;進行顯色反應(yīng),用BIO-RAD 680酶標儀測定D492nm值。

      1.8 Western印跡檢測抗體特異性

      取SCIRR39-C重組抗原表位蛋白進行SDSPAGE,采用預染蛋白標準以便于檢測轉(zhuǎn)移效率。15 V以下恒壓轉(zhuǎn)移45 min,于1%脫脂牛奶中室溫封閉1 h,加入制備的一抗Anti-SCIRR39(1∶500)室溫孵育1 h,用0.1%PBST洗3次,各10 min;以封閉液稀釋HRP標記的二抗(1∶2000),與硝酸纖維素膜一起于室溫共孵育1 h;用0.1%PBST洗3次,各10 min;ECL試劑顯色。

      2 結(jié)果

      2.1 Scirr39基因的克隆及鑒定

      以大鼠全橫斷損傷脊髓的總RNA為模板,加入上下游引物,PCR擴增得到特異目的片段,1%瓊脂糖凝膠電泳分析表明擴增片段長1386 bp(圖1)。

      2.2 GST-SCIRR39-C融合表達載體的構(gòu)建

      為了免疫動物制備抗體,我們將Scirr39編碼區(qū)C端的1077~1383 bp(圖2)克隆到pGEX-4T-2原核表達載體中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),挑選陽性克隆,經(jīng)過測序保證其序列正確。

      2.3 GST-SCIRR39-C融合蛋白在大腸桿菌BL21(DE3)中的表達

      在30℃、0.2 mmol/L IPTG誘導條件下表達GST-SCIRR39-C融合蛋白。GST相對分子質(zhì)量(Mr)為 26×103,SCIRR39-C為 11.9×103,融合蛋白為37.9×103。圖3顯示表達的融合蛋白Mr與理論值一致。

      圖1 Scirr39基因編碼區(qū)的PCR擴增產(chǎn)物

      圖2 SCIRR39-C端抗原表位編碼DNA片段的擴增

      圖3 SDS-PAGE檢測GST-SCIRR39-C的表達

      2.4 融合蛋白的純化

      在GE Health公司?KTA Prime蛋白純化系統(tǒng)上進行,圖4為SDS-PAGE檢驗純化結(jié)果。

      2.5 融合蛋白的酶切

      GST-SCIRR39-C融和蛋白經(jīng)凝血酶消化后,SCIRR39-C蛋白流出液及GST洗脫液如圖5所示,主要蛋白條帶Mr分別約為 26×103和11.9×103。

      2.6 抗SCIRR39蛋白兔抗血清的ELISA效價測定

      干燥后的融合蛋白溶于0.1 mol/L PBS,終濃度1 mg/mL,采用背部多點皮內(nèi)注射的方法免疫大耳白兔,多次加強免疫后第10 d抽取血清,用ELISA檢測抗體滴度,以免疫前抽取的兔血清為對照,其效價達到1∶104,可以取血收集血清(圖6)。

      2.7 Western印跡檢測兔抗血清的特異性

      以兔抗血清對原核表達的SCIRR39-C蛋白進行Western印跡檢測,圖7顯示該蛋白條帶可被檢測到,且其相對分子質(zhì)量與預期的SCIRR39-C一致,說明制備的抗血清結(jié)合性較好。

      3 討論

      圖4 SDS-PAGE檢測GST-SCIRR39-C的純化

      圖5 SDS-PAGE檢測GST-SCIRR39-C融合蛋白凝血酶切結(jié)果

      圖6 ELISA檢測抗體效價

      圖7 Western印跡檢測Anti-SCIRR39的抗體特異性

      由于SCIRR39是新近發(fā)現(xiàn)的大鼠RNase抑制劑(RNH)的同源蛋白[6-7],目前尚無針對其的商業(yè)化特異性抗體,而為了研究SCIRR39在神經(jīng)系統(tǒng)的分布及其在脊髓損傷/修復過程中可能的作用[8-10],以至其他功能,我們要制備針對其的特異性抗體。為此,我們采用GST融合蛋白表達系統(tǒng)表達重組SCIRR39。該表達系統(tǒng)可以高效表達融合蛋白,且產(chǎn)物易純化,用凝血酶切除GST也比較容易。但由于原核細胞中缺乏真核生物中翻譯后修飾所需酶類,以及在重組蛋白表達過程中缺乏某些蛋白質(zhì)折疊的輔助因子,且表達環(huán)境不同于真核細胞,無法形成正確的次級鍵等原因,故使得表達的融合蛋白很難折疊成正確的空間構(gòu)象。我們在表達SCIRR39全長蛋白時就遇到這方面的重重困難,由于蛋白序列中含有多達32個Cys殘基,很可能在表達過程中發(fā)生二硫鍵錯配,使得我們沒有得到目的蛋白。而通過降低誘導溫度和IPTG濃度等方法也沒有提高蛋白的可溶表達量,這種極少量的目的蛋白對于抗體制備來說是遠遠不夠的。因此,我們選擇表達抗原表位的方法制備抗體。通過抗原表位分析,選擇C端359~461位103個氨基酸殘基作為SCIRR39的抗原表位,免疫家兔制備多克隆抗體。經(jīng)過對宿主菌的選擇及誘導條件的優(yōu)化,我們將構(gòu)建的重組質(zhì)粒誘導表達;之后用純化的SCIRR39免疫成年日本大耳白兔,得到了針對SCIRR39的多克隆抗體[11],該兔抗血清的ELISA效價約為1∶104,表明抗血清具有較好的特異性。SCIRR39重組蛋白多克隆抗體的成功制備,為進一步深入研究其生物學功能提供了良好的工具。

      [1]李欣,闕海萍,馬振蓮,等.應(yīng)用錨定消減雜交技術(shù)克隆分析大鼠脊髓原代神經(jīng)元損傷、修復相關(guān)基因[J].解放軍醫(yī)學雜志,2005,30(12):1072-1075.

      [2]Hofsteenge J,Kieffer B,Matthies R,et al.Amino acid se?quence of the ribonuclease inhibitor from porcine liver re?vealsthe presence ofleucine-rich repeats[J].Biochemistry,1988,27(23):8537-8544.

      [3]Kobe B,Deisenhofer J.The leucine-rich repeats:a versatile binding motif[J].Trends Biochem Sci,1994,19:415-421.

      [4]Kobe B,Kajava A.The leucine-rich repeats as a protein rec?ognition motif[J].Curr Opin Struct Biol,2001,11:725-732.

      [5]Adriana F,Marco M,Elio P,et al.The ribonuclease/angio?genin inhibitor is also present in mitochondria and nuclei[J].FEBS Lett,2011,585:613-617.

      [6]Chen C Z,Shapiro R.Site-specific mutagenesis reveals differ?ences in the structural bases for tight binding of RNase inhib?itor to angiogenin and RNase A[J].Proc Natl Acad Sci USA,1997,94(5):1761-1766.

      [7]Hofsteenge J.Ribonuclease inhibitor[M]∥ D'Alessio G,Rior?dan J F,eds.Ribonucleases:Structures and Functions.New York:Academic Press,1997.

      [8]Lee F S,Vallee B L.Modular mutagenesis of human placen?tal ribonuclease inhibitor,a protein with leucine-rich repeats[J].Proc Natl Acad Sci USA,1990,87(5):1879-1883.

      [9]Lee F S,Shapiro R,Vallee B L.Tight-binding inhibition of angiogenin and ribonuclease A by placental ribonuclease inhib?itor[J].Biochemistry,1989,28(1):225-230.

      [10]Shapiro R,Vallee B L.Human placental ribonuclease inhibi?tor abolishes both angiogenic and ribonucleolytic activities of angiogenin[J].Proc Natl Acad Sci USA,1987,84(8):2238-2241.

      [11]黎燕.分子免疫學實驗指南[M].北京:化學工業(yè)出版社,2008:20-28.

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