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      植物甘油醛-3-磷酸脫氫酶作用機制的研究進展

      2013-09-14 12:47:46盧倩弭曉菊崔繼哲
      生物技術通報 2013年8期
      關鍵詞:葉綠體糖酵解復合體

      盧倩 弭曉菊 崔繼哲

      甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDHs)是所有生物中高度保守的蛋白質,在細胞的碳代謝中起著核心作用,是維持生命活動能量形成的最基本酶之一。長期以來,普遍認為這個基因及其蛋白的功能是有限的,它一直被作為“持家”基因,用于研究目標基因相對表達的內對照[1];它也被認為是一個經典的模式蛋白,常被用于蛋白質結構的分析和酶催化機理的研究中。但近年的研究發(fā)現(xiàn),GAPDHs是一個多功能的酶,參與細胞內膜分揀、受體介導的信號轉導、細胞凋亡等事件,在許多細胞路徑中起關鍵作用。哺乳動物中GAPDH的基因結構、生化機理及其功能特性等已有比較深入的了解[2],植物中GAPDH的作用及其機制也不斷被揭示。本文概述有關的研究進展,以期為植物GAPDH的深入研究提供參考。

      1 GAPDH的類型

      高等植物中GAPDH是糖酵解、糖異生和卡爾文循環(huán)過程中的關鍵酶,其催化的相關反應如圖1所示[3,4]。高等植物中的GAPDH可分為磷酸化和非磷酸化兩大類。

      磷酸化的甘油醛-3-磷酸脫氫酶,因其細胞學定位的不同分為GAPC、GAPCp 和GAPA/B 三類同工型。GAPC是細胞質中的GAPDH(EC 1.2.1.12),特異地以NAD+(H)為輔酶,催化甘油醛-3-磷酸形成1,3-二磷酸甘油酸的可逆反應,這是糖酵解(糖異生)中唯一的氧化(還原)反應[5]。擬南芥中有2個GAPC,GAPC1和GAPC2的氨基酸序列一致性高達98%,都由4個相同亞基組成,有高度的結構相似性[6]。擬南芥、煙草中GAPCs的cDNA序列可能具有生態(tài)型的特異性[7]。

      GAPCp和GAPA/B都是質體型GAPDH,但GAPCp主要定位于非綠色質體中,依賴于NAD+,通過該酶和磷酸甘油酸激酶(PGK)催化的兩個連續(xù)反應,形成3-磷酸甘油酸和ATP。擬南芥中GAPCp1和GAPCp2氨基酸序列的一致性為93%,N端有質體定位信號,葉片中定位于葉綠體和非綠質體中,根中定位于非綠質體[8]。

      GAPA/B是葉綠體中的GAPDH(EC 1.2.1.13),多以NADPH(有的也以NADH)為輔酶,催化糖酵解的逆反應,將1,3-二磷酸甘油酸還原為甘油醛-3-磷酸,該酶在同化CO2的卡爾文循環(huán)中起中心作用[9]。高等植物葉綠體GAPDH有GapA和GapB兩種亞基,GapA和GapB亞基的一致性為80%[10],但GapA缺少GapB的C末端可調控區(qū)。GapB的這個可調控區(qū)由30個氨基酸殘基組成,含有2個硫氧還蛋白作用的Cys[9,11]。由GapA和GapB組成的異四聚體A2B2是GAPDH的主要活性形式[12]。此外,還有A4和

      非磷酸化的甘油醛-3-磷酸脫氫酶,表示為NPGAPDH或GAPN(EC 1.2.1.9),定位于胞質中,被認為是催化糖酵解“旁路”反應的酶,其催化依賴于NADP+的將3-磷酸甘油醛氧化為3-磷酸甘油酸[13],同時伴有NADPH生成的不可逆反應(圖1)。NP-GAPDH是醛脫氫酶(ALDH)超家族中的一員,最新的研究將其歸為ALDH11家族[14],該酶與磷酸化的甘油醛-3-磷酸脫氫酶在基因與蛋白序列上并沒有同源性。

      圖1 植物細胞糖酵解及卡爾文循環(huán)中不同同工型GAPDH的作用[3,4]

      2 GAPDH的作用

      擬南芥的GAPC1在維持細胞ATP水平、保持植株育性中起關鍵作用。對GAPC1缺失和反義突變體的研究發(fā)現(xiàn)二者葉和根基本正常,但植株生長延緩、果實形狀改變、種子數(shù)減少、育性降低,gapc1中ATP水平和呼吸率降低顯示,GAPC1的缺失導致糖酵解和三羧酸循環(huán)中間物發(fā)生改變,影響了碳源的流向和線粒體中氧化磷酸化作用,進而影響了主要通過呼吸作用提供能量的生殖器官的發(fā)育[6]。

      擬南芥中的兩個GAPCp功能冗余,活性低于胞液中的同工型。但是,GAPCp通過影響根中Ser的合成和供應,在植物發(fā)育過程中起重要作用[3]。gapcp雙突變體嚴重矮化,根系短小,植株不育。其機制在于GAPCp的失活,影響了糖酵解路徑中通過該酶和磷酸甘油酸激酶(PGK)催化的3-磷酸甘油酸的形成。而Ser的體內合成是在質體中以3-磷酸甘油酸為前體進行的(圖1),在 gapcp雙突變體根中由于3-磷酸甘油酸的不足致使Ser 合成受阻,進而可能導致鞘脂合成受抑制,細胞變小而致植株矮化[8]。研究證明,根中GAPCp的主要功能是提供絲氨酸合成所必需的3-磷酸甘油酸[3]。可見,糖酵解質體路徑在代謝中的重要性和代謝路徑區(qū)室化的必要性。

      胞質中催化糖酵解“旁路”反應的NP-GAPDH,直接將3-磷酸甘油醛氧化為3-磷酸甘油酸,同時生成的是NADPH,而不是NADH和ATP。該酶催化的反應具有重要的意義,其一為機體合成代謝提供還原力NADPH,維持胞質中NADPH的水平;二是保證逆境條件下碳源流的通暢。許多植物中甘露醇等合成所需的NADPH主要來源于該反應[14];在磷饑餓或ADP水平低下而無法合成ATP時,NPGAPDH上調表達,而包括GAPC1在內的其他基因則被下調。通過NP-GAPDH的作用,可以使碳源順利流經糖酵解途徑[6]。

      NP-GAPDH缺失誘使胞液GAPDH表達提高,葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G6PDH)的mRNA含量和酶活性也提高,但編碼糖酵解和光合作用中的幾個其他酶的基因下調,由此選擇性封阻了糖酵解路徑,使更多的葡萄糖-6-磷酸通過磷酸戊糖途徑的G6PDH作用產生NADPH,這對于保持細胞中NADPH水平具有重要意義[15]。

      3 GAPDH與NAD(P)互作的特異性

      GAPDH屬于結合酶,需要NAD或NADP輔酶的參與才有活性。NADP比NAD僅多一個磷酸基團,但這兩個輔酶與GAPDH的作用不同,胞質GAPDH的酶活特異性地依賴于NAD,而葉綠體GAPDH對NADP親和性更強。Tien等[10]首次分析了水稻胞質OsGAPDH晶體結構,并通過對菠菜葉綠體GAPDH(SoGAPDH)晶體結構[16]的比較研究,提出了高等植物中GAPDH與NAD或NADP特異性互作的機制。

      水稻胞質GAPDH(OsGAPDH)是由4個單體組成的同源四聚體,有3個結構域:NAD結合域、催化域和一個S-loop。OsGAPDH只與NAD互作,主要是因為幾個關鍵基團不同于葉綠體中的SoGAPDH,其中在S-loop處,OsGAPDH比SoGAPDH多出一個外突的Phe37,其苯環(huán)成為NADP進入結合位點的障礙。而Phe37是OsGAPDH穩(wěn)定結合NAD 的關鍵,Phe37突變體顯著影響了OsGAPDH的催化效率和對NAD的親和性。同時,Asp35和Pro193也是OsGAPDH特異性結合NAD的必需基團。

      菠菜葉綠體GADPH(SoGAPDH)為同源四聚體A4。OsGAPDH 和SoGAPDH的氨基酸序列一致性僅為47%,但二者的整體結構相似,它們與NAD或NADP主要都是通過氫鍵結合,但SoGAPDH一個單體中的Thr33和另一個相鄰單體的Ser188能與NADP多出的磷酸基團上的氧原子形成2個氫鍵,因此SoGAPDH對 NADP有更大的親和性[10]。

      葉綠體A2B2型GAPDH通過GapB的C端兩個Cys之間的二硫鍵調節(jié)著酶活。黑暗條件下,Cys殘基間形成二硫鍵,誘導C端構型改變,導致GapB的Glu362與S-loop互作,由此可阻止NADPH進入酶的結合位點,從而降低GAPDH活性。光照條件下,還原型硫氧還蛋白破壞二硫鍵,產生了有利于NADPH進入酶活性位點的構型,使酶激活,而以NADH為輔酶時則沒有發(fā)現(xiàn)這種調節(jié)作用[11]。黑暗條件下,NADPH下調GAPDH的活性,可能的意義在于降低或關閉卡爾文循環(huán),將NADPH作為還原力用于脂肪酸合成和氮還原。NADPH對GAPDH活性的調控可能是暗-光轉化下GAPDH活性調控的一種方式,但這是蛋白-蛋白互作的直接還是間接效應尚需試驗確定[9]。

      4 PRK/GAPDH/CP12復合體及其調節(jié)

      卡爾文循環(huán)受光調節(jié)。光通過光反應改變葉綠體的內環(huán)境,間接地影響著酶的活性,光可激活GAPDH、磷酸核酮糖激酶(PRK)等參與卡爾文循環(huán)的酶,在黑暗中這些酶則被鈍化。

      GAPDH和PRK通過與葉綠體內在蛋白CP12形成可逆的PRK/GAPDH/CP12多酶復合體協(xié)同調控卡爾文循環(huán)[12]。CP12首先通過C端與GAPDH結合成GAPDH-CP12復合體,而后通過CP12的N端結合PRK而形成超分子復合體,復合體中PRK和GAPDH處于失活狀態(tài)。形成復合體時,CP12的C末端插入到GAPDH活性位點區(qū),與GAPDH上底物的幾個結合基團互作,完全覆蓋了底物的結合位點,由此導致對GAPDH的競爭性抑制[17]。GAPDHCP12復合體形成后,CP12發(fā)生部分折疊,在其表面形成負電荷區(qū),通過靜電作用,使PRK與之N端結合[17]。光照下葉綠體基質中NADP(H)/NAD(H)升高,促使GAPDH-CP12解離,激活GAPDH;而黑暗下 NADP(H)/NAD(H)降低,激活GAPDHCP12復合體,使GAPDH失活。

      較早的研究認為,由于GapA缺少GapB中C末端的可調控區(qū),僅A4型GAPDH以PRK/GAPDH/CP12復合體調控酶活[18]。進一步的研究發(fā)現(xiàn),GAPDH的兩種四聚體形式 A4和 A2B2都能參與PRK/GAPDH/CP12復合體的形成,PRK/GAPDH/CP12復合體的作用并不僅僅是調控“不可調節(jié)”的A4型GAPDH。PRK/GAPDH/CP12的豐度和性質在不同的物種中不同,不同物種的CP12狀態(tài)、與其結合的PRK和 GAPDH的數(shù)目、亞基組成也不同。因此,不同物種對PRK和 GAPDH的調節(jié)有很大的不同[12]。

      5 逆境脅迫下GAPDH 的應答及機理

      在澇害所致低氧、氧化、熱激、傷害等脅迫條件下,植物GAPDH表現(xiàn)出不同的脅迫響應,對此已有較多的研究,王幼寧等[19]、梁穎等[20]對較早的工作已進行比較系統(tǒng)的綜述。近期的研究明確,綠藻(D. bardawil)葉綠體DbGAPDH的啟動子區(qū)有氧應答元件、光調節(jié)元件、冷脅迫調控元件等6個明顯的調控元件,也預示DbGAPDH調控的復雜性及其功能的多樣性[5]。黃瓜受到澇脅迫危害時,CsGAPDH在根中快速響應并且高表達[21]。本實驗室的研究發(fā)現(xiàn),NaCl脅迫下羊草GAPDH在灰綠型和黃綠型兩種生態(tài)型中的表達隨NaCl脅迫濃度的不同差異顯著。各種生物或非生物的逆境脅迫過程都會產生氧化脅迫,GAPDH在植物抗氧化脅迫和應答氧化還原信號轉導中發(fā)揮著重要作用。gapc1、np-gapdh中氧化脅迫增強,體內ROS水平升高[6];過表達OsGAPC3的水稻植株中,OsGAPC3通過提高過氧化氫酶(CAT)控制了逆境下H2O2的過高累積,避免了鹽脅迫下ROS對細胞的傷害,轉基因植株的耐鹽性提高[22]。擬南芥中,H2O2通過氧化GAPC1催化位點的Cys,促進GAPC1與質膜上的磷脂酶PLDδ互作,提高了PLDδ的活性,其以磷脂酰乙醇胺為底物生成磷脂酸PA[23],H2O2激活GAPC與PLDδ的互作,可能建立起了在植物應答ROS和水脅迫過程中膜質信號與能量代謝和生長調控之間的直接聯(lián)系[23]。

      從目前的研究看,GAPDH的谷胱甘肽化及其巰基的亞硝基化是GAPDH在植物抗氧化脅迫和應答氧化還原信號轉導中發(fā)揮作用的一種重要機制。

      蛋白質的谷胱甘肽化(S-glutathionylation)是一種可逆的特異修飾,是指蛋白質上的半胱氨酸殘基和谷胱甘肽(GSH)形成混合型二硫鍵。去谷胱甘肽化由體內的巰基-二硫鍵氧化還原酶,如谷氧還蛋白Grx、硫氧還蛋白Trx、小分子氧化還原蛋白Srx等催化[24]。GAPDH的催化亞基Cys能被H2O2氧化,致使GAPDH完全或部分地失活[23]。擬南芥GAPC1的活性嚴格依賴于催化亞基Cys149[4],Cys149對H2O2極為敏感,H2O2使Cys149的-S-不可逆地氧化為-SO2-和-SO3-。還原型的谷胱甘肽GSH能夠使GAPC1谷胱甘肽化,形成Cys149-SSG,從而避免上述不可逆的氧化過程[4]。通過谷胱甘肽化GAPC1,可使糖酵解途徑的反應下調,從而增加葡萄糖通過磷酸戊糖途徑的氧化而產生合成更多的抗氧化酶所需的NADPH。在植物胞質中GR和NTR是主要的抗氧化酶。以NADPH為電子供體,Grx通過胞漿的谷氧還原酶提供還原劑(GSH)可有效的使GAPC1去谷胱甘肽化。另外,還可以通過涉及NADPH、NTR和胞質Trxh的系統(tǒng)去谷胱甘肽化,GAPC1被再激活(圖1)。GAPN對H2O2則表現(xiàn)為抗性,在氧化脅迫下,小麥和玉米的幼苗中GAPN活性提高兩倍,通過旁路反應形成NADPH,保證有充足的NADPH為抗氧化酶供應??傊?,在脅迫條件下,植物細胞可以通過對關鍵酶活性的調解,重定向主要代謝路徑,不僅強化了植物抗氧化系統(tǒng),并且通過如使谷胱甘肽化的GAPC1被再激活等為植物恢復創(chuàng)造條件。

      葉綠體中GAPDH的同工型A4也可被H2O2氧化和谷胱甘肽化,擬南芥A4-GAPDH的Cys149經谷胱甘肽化可避免脅迫造成的不可逆轉的氧化。參與光合作用的GAPDH主要同工型 A2B2或A8B8也對氧化劑敏感,但似乎并不被明顯地谷胱甘肽化[4]。GAPDH的谷胱甘肽化可能是脅迫下避免其不可逆氧化的調節(jié)和保護的一種重要機制[7]。

      蛋白質巰基的亞硝基化(S-nitrosylation)是指NO及其衍生物與蛋白質Cys的巰基-SH作用生成-SNO[25]。S-亞硝基化修飾與磷酸化修飾類似,通過改變蛋白質空間構象修飾其活性[26]。擬南芥中,NO使GAPC的活性位點的Cys基團S-亞硝基化,抑制GAPDH的活性,DTT能使酶活得以恢復[27];在病原入侵的超敏反應中GAPDH也會發(fā)生S-亞硝基化修飾[28]。鹽脅迫下,煙草BY-2細胞中GAPDH與SnRK2蛋白激酶NtOSAK直接互作,但GAPDH并不被NtOSAK磷酸化,而是受NO作用被S-亞硝基化。S-亞硝基化的GAPDH不影響NtOSAKGAPDH復合體的形成,也不影響NtOSAK蛋白激酶的活性,但不排除GAPDH與NtOSAK信號路徑中其他分子的互作[7],GAPDH可能參與了包括磷酸化事件在內的植物信號級聯(lián)轉導過程[7,29]。

      擬南芥、菠菜胞液中GAPDH的 S-亞硝基化修飾都發(fā)生在酶活性位點的Cys上。GAPDH同時受NO和H2O2的調控,表明GAPDH很可能是這兩個信號分子調控途徑的交匯點之一,揭示這些交聯(lián)對話的重要性將是未來深入研究面臨的主要挑戰(zhàn)。

      綜上所述,近年在植物GAPDH多樣性作用機理方面的研究取得了較大進展,但哺乳動物中GAPDH通過蛋白質-DNA互作、蛋白質-RNA互作和蛋白質-蛋白質互作參與DNA修復、轉錄及轉錄后調控、細胞信號轉導、細胞凋亡等生命過程展示的多功能性[5]和擬南芥磷脂酸PA與GAPC特異性互作發(fā)現(xiàn)[30],GAPDH的許多功能并不需要其糖酵解的活性,植物中GAPDH很可能與哺乳動物采用相似的方式調控著細胞中基因的表達。在植物細胞中GAPDH這類參與經典代謝酶的如何進入細胞核與DNA互作,如何在細胞之中與其他蛋白、脂質等互作影響相關基因mRNA的穩(wěn)定性而進行轉錄后的調節(jié),值得特別關注和展開深入研究。

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