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      燕麥?zhǔn)人峋廾氐奶峒兗捌浠钚詸z測

      2013-09-13 11:46:52伍甜劉瑩余超邊強(qiáng)田芳黃瓊陳華民何晨陽
      生物技術(shù)通報(bào) 2013年7期
      關(guān)鍵詞:層析柱鞭毛粗提物

      伍甜 劉瑩 余超 邊強(qiáng) 田芳 黃瓊 陳華民 何晨陽

      鞭毛素(flagellin)是細(xì)菌鞭毛的主要組分,不僅與鞭毛運(yùn)動(dòng)性有關(guān),而且可以作為病原相關(guān)分子模式(PAMP)激發(fā)植物的免疫反應(yīng)(PTI)[1]。其N 端有一個(gè)由 22 個(gè)氨基酸組成的保守肽段 flg22,通過與植物受體FLS2 的識別及其信號傳導(dǎo),最終誘導(dǎo)了擬南芥、番茄和煙草等植物的防衛(wèi)反應(yīng)[2-5]。同樣,通過flg22與水稻受體 OsFLS2 的識別作用,也可引起水稻的防衛(wèi)反應(yīng),但這種反應(yīng)很微弱;而flg22或鞭毛素卻能激發(fā)過表達(dá)OsFLS2的水稻懸浮細(xì)胞強(qiáng)烈的防衛(wèi)反應(yīng)[6]。燕麥?zhǔn)人峋ˋcidovorax avenae sub.avenae,簡稱Aaa)不親和菌株N1141的鞭毛素能夠引起水稻過敏反應(yīng),并伴隨著大量H2O2的產(chǎn)生[7,8]。表明細(xì)菌鞭毛素作為PAMP對單子葉植物水稻PTI 的誘導(dǎo)作用機(jī)理比較復(fù)雜,有必要進(jìn)行深入的探究。

      本研究采用機(jī)械震蕩、丙酮沉淀以及離子交換層析進(jìn)行了蛋白提純,并對其誘導(dǎo)水稻產(chǎn)生 H2O2的能力進(jìn)行測定,旨在探索一種能夠大量提純的可行方法,并且獲得提純、有活性的鞭毛素蛋白,用于后續(xù)的水稻 PTI 機(jī)理的解析。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 試驗(yàn)材料 供試菌株:Aaa菌株NB001由中國檢驗(yàn)檢疫科學(xué)院趙文軍研究員提供。水稻品種:日本晴(Oryza sativa ssp.japonica)由本實(shí)驗(yàn)室保存。Aaa 菌株NB001與水稻品種日本晴的存在不親和互作關(guān)系。

      1.1.2 主要試劑 KB 培養(yǎng)基(20g蛋白胨、10mL甘油、1.5 g K2HPO4、1.5gMgSO4·7H2O、1000mL H2O);2×SDS 電 泳上樣緩沖液(0.0615mmol/L Tris-HCl,pH6.8;1% SDS,10% 甘油,5% β-巰基乙醇,0.002%溴酚藍(lán));染色液(0.125g考馬斯亮藍(lán)R250、30mL甲醇、10mL冰乙酸、加H2O定容至100mL);脫色液(30mL甲醇、10mL冰乙酸,加H2O 定 容 至100mL);PBS(0.27 g KH2PO4、1.42 g Na2HPO4、NaCl 8g,KCl0.2 g、調(diào)節(jié)pH至7.4,加水定容至1L);抗鞭毛素蛋白兔多克隆抗體(華大公司);HRP標(biāo)記的羊抗兔 IgG 抗體(華大公司);Super Ecl發(fā)光液(北京普利萊基因技術(shù)有限公司);DAB(AMRESCO公司);蛋白Marker(預(yù)染蛋白質(zhì)Marker Ⅲ)(天根公司)。

      1.1.3 儀器和設(shè)備 臺式恒溫振蕩器(太倉市實(shí)驗(yàn)設(shè)備廠);離心機(jī)(BECKMAN公司);震蕩混勻器(VORTGX公司);HPLC系統(tǒng)(GE公司);陰離子交換柱(GE公司,5mL HiTrapTMSP HP);陽離子交換柱(GE公司,5mL HiTrapTMQP HP);垂直電泳槽(Junyi公司);半干電轉(zhuǎn)儀(Bio-Rad公司);化學(xué)發(fā)光采集系統(tǒng)(GE公司);水浴鍋(PolyScience公司);光學(xué)顯微鏡(OLYPUS 公司)。

      1.2 方法

      1.2.1 鞭毛素等電點(diǎn)和分子量預(yù)測 根據(jù)已測序的鞭毛素基因的編碼序列,通過Primer 5.0翻譯成為氨基酸序列,通過生物信息學(xué)網(wǎng)站 ExPASy(http://web.expasy.org/compute_pi/)對 Aaa鞭毛素等電點(diǎn)(pI)、分子量進(jìn)行預(yù)測。

      1.2.2 菌體培養(yǎng)與蛋白粗提 接種細(xì)菌于4 L KB培養(yǎng)基中,在28℃下震蕩(200r/min)培養(yǎng)24h。離心(7000r/min×20min,28℃),收集菌體沉淀;加玻璃珠與30-40mL的ddH2O于離心管中,振蕩3min,收集上清為鞭毛素蛋白粗提液。

      1.2.3 粗提液檢測及純化前處理 緩慢加入粗提液4倍體積的預(yù)冷丙酮,慢慢攪拌至析出大量蛋白,4℃放置過夜,沉淀蛋白。離心除去上清,收集蛋白后,靜置于通風(fēng)廚10min,待殘余丙酮揮發(fā)。加入50mL ddH2O 重懸蛋白,留取100μL粗提液重懸物,采用5%濃縮膠(上層),12%分離膠(下層)進(jìn)行SDS-PAGE電泳,檢測粗提物純度。其余粗提物用HCl調(diào)節(jié)至pH2.0,在常溫下攪拌30min,此時(shí)鞭毛素蛋白從鞭毛上解離出來,形成解離液。將解離液分成等體積2份,分別稀釋至300mL以降低鹽濃度,并分別調(diào)節(jié) pH至3.5和7.5,用濾膜(2.2μm)過濾,備用。

      1.2.4 離子交換層析法純化 使用高效蛋白純化儀,分別通過陰、陽離子交換層析進(jìn)行蛋白純化。用濃度為15mmol/L的Tris-HCl,pH8.0的緩沖液作為A液(Start buffer),用1mol/L NaCl,通過加入HCl調(diào)節(jié)pH至7.0作為B液(elution buffer)。先用5倍柱體積的A液以5mL/min流速平衡層析柱,然后以3mL/min的流速,通過上樣泵上蛋白樣品(陽離子層析柱上pH為 3.5的粗提物樣品,陰離子層析柱上pH7.5的粗提物樣品)。然后用 2倍柱體積的A液,以5mL/min的流速?zèng)_洗層析柱。最后以線性方式洗脫蛋白(鹽梯度使用NaCl的濃度由0-1mol/L),洗脫10個(gè)柱體積,用UV 214nm 監(jiān)測洗脫峰,收集出峰的組份。

      1.2.5 SDS-PAGE 檢測和 Western blot 驗(yàn)證 取出峰組份,吸取20μL與等體積的2×SDS上樣緩沖液,沸水浴中煮5min。處理好的樣品經(jīng)5%濃縮膠(上層),12%分離膠(下層)的SDS-PAGE凝膠電泳。一塊膠用考馬斯亮藍(lán)染色2h,脫色液脫色12h,檢測結(jié)果。另一塊膠用半干轉(zhuǎn)膜系統(tǒng),在25 V恒壓下轉(zhuǎn)膜1h,所用的膜為PVDF膜;然后膜經(jīng)過5%的脫脂奶粉室溫封閉2h,PBS漂洗3次后,加入用PBS 1∶5000稀釋的鞭毛素蛋白多克隆抗體,孵育2h,用PBS漂洗3次,加入HRP標(biāo)記的羊抗兔IgG,孵育2h,使用PBS漂洗4次,最后加入Super Ecl發(fā)光液,采集化學(xué)信號成像。

      1.2.6 生物活性檢測 用DAB染色法進(jìn)行蛋白活性檢測。用浸潤法將純化蛋白(濃度0.3mg/mL)接種苗齡14d的水稻葉片,以15mmol/L的Tris-HCl(pH7.0)緩沖液作為對照。對接種部位葉組織取樣,浸入含0.01% Triton-X-100和1mg/mL DAB的水溶液中,同時(shí)真空30min。葉片在室溫下過夜孵育,出現(xiàn)褐色-紅色沉淀物質(zhì)后,再將葉片浸入在95%乙醇∶乳酸∶苯酚(2∶1∶1)中,65℃孵育30min后,用50%乙醇沖洗,再用清水沖洗后,在光學(xué)顯微鏡下觀察結(jié)果。

      2 結(jié)果

      2.1 鞭毛素等電點(diǎn)和分子量的預(yù)測

      根據(jù)已經(jīng)測序的Aaa鞭毛素的基因序列,通過生物信息學(xué)分析,預(yù)測該菌株的鞭毛素 pI 為 5.46,分子量為 49.37kD。

      2.2 鞭毛素蛋白的提純

      通過加入玻璃珠劇烈震蕩菌體的方法,使鞭毛與菌體分離。采用丙酮沉淀上清的方法,得到了大量的粗提物。SDS-PAGE電泳檢測(圖 1)發(fā)現(xiàn),粗提物中鞭毛素蛋白含量較高,但是仍然含有較多的雜蛋白。

      圖 1 燕麥?zhǔn)人峋廾卮痔嵛?SDS-PAGE 電泳分析

      在pH3.5或 pH7.5的條件下,粗提物中大量蛋白均能夠結(jié)合到陽、陰離子層析柱上,洗脫峰較為單一(圖 2)。

      2.3 鞭毛素蛋白的檢測

      為了檢測蛋白的純化效果,對離子交換層析組份進(jìn)行驗(yàn)證。SDS-PAGE結(jié)果(圖 3)顯示,陰、陽離子交換層析純化后均能獲得一條明顯的蛋白條帶(45kD左右);相比較而言,陽離子交換層析純化產(chǎn)物更純,未發(fā)現(xiàn)其它蛋白。Western blot分析表明,經(jīng)陰、陽離子交換層析純化的為鞭毛素蛋白。

      圖 2 燕麥?zhǔn)人峋廾仉x子交換層析洗脫峰

      圖 3 純化后燕麥?zhǔn)人峋廾氐臋z測

      2.4 鞭毛素蛋白的活性檢測

      通過 DAB 染色分析(圖4)顯示,純化后的鞭毛素蛋白能引起水稻葉片產(chǎn)生大量的 H2O2,而緩沖液處理則沒有 H2O2的產(chǎn)生,說明純化得到的鞭毛素蛋白具有生物學(xué)活性。

      圖4 DAB 染色法檢測鞭毛素蛋白誘導(dǎo)水稻葉片 H2O2 產(chǎn)生

      3 討論

      由于細(xì)菌鞭毛素含量較低,在大規(guī)模提純等方面一直存在一些困難。目前大多數(shù)報(bào)道采用超高速離心提純法[9],但由于受到儀器容量、離心條件的限制,提取量少,該法不適合大量提取。本研究對燕麥?zhǔn)人峋廾靥崛『图兓椒ㄟM(jìn)行了不同嘗試,采用機(jī)械震蕩、丙酮沉淀以及離子交換層析,成功地獲得了純化蛋白,為后續(xù)的大規(guī)模制備提供了技術(shù)支撐。

      本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn):(1)通過玻璃珠機(jī)械震蕩,使鞭毛更易從菌體上脫落;(2)針對鞭毛素結(jié)構(gòu)較保守、耐受性較強(qiáng)的特點(diǎn),通過加入丙酮破壞蛋白水化層,使粗提蛋白沉淀,從而有利于在酸性條件下蛋白解離;(3)鞭毛素(pI=5.46)無論帶負(fù)或正電荷,都可分別結(jié)合到陰、陽離子交換層析柱上。但陽離子交換層析的蛋白組份單一,而陰離子交換層析的有較多的雜帶。其可能的原因是,在pH=7.5條件下,粗提物中很多雜蛋白也帶負(fù)電荷,與鞭毛素一起結(jié)合到陰離子層析柱上,且結(jié)合力相仿,從而進(jìn)行線性洗脫時(shí),兩者一同被洗脫下來;而在pH=3.5條件下,鞭毛素帶正電荷,能夠結(jié)合到陽離子層析柱上,并且能夠被洗脫下來;粗提物中雜蛋白在此pH條件,引發(fā)變性和空間構(gòu)象變化,不能結(jié)合到陽離子層析柱上,或結(jié)合力過大,導(dǎo)致無法洗脫。用1mol/L NaOH對層析柱重生過程中,發(fā)現(xiàn)大量雜蛋白被洗脫出來(實(shí)驗(yàn)室資料)。

      此外,本研究純化的鞭毛素能引起水稻葉片產(chǎn)生H2O2,表明這種蛋白具有生物活性。鞭毛素是一種PAMP能夠引起水稻的PTI。因此,這種純化的、具有生物活性的鞭毛素蛋白可用于后續(xù)的水稻 PTI分子機(jī)理的解析。

      4 結(jié)論

      成功地組合利用機(jī)構(gòu)震蕩、丙酮沉淀和離子交換層析法,從Aaa中提純了具有生物活性的鞭毛素蛋白。

      [1] 武曉麗, 陳華民, 吳茂森, 等.細(xì)菌鞭毛素對植物免疫防衛(wèi)反應(yīng)及其信號機(jī)制的激發(fā)[J].植物保護(hù), 2011, 37(3):12-16.

      [2] Felix G, Duran JD, Volko S, Boller T.Plantshave a sensitive perception system for themost conserved domain of bacterial flagellin[J].The Plant Journal, 1999, 18(3):265-276.

      [3] Robatzek S, Bittel P, Chinchilla D, et al.Molecular identification and characterization of the tomato flagellin receptor LeFLS2, an orthologue of Arabidopsis FLS2 exhibiting characteristically different perception specificities[J].Plant Molecular Biology, 2007, 64(5):539-547.

      [4] Meindl T, Boller T, Felix G.The bacterial elicitor flagellin activates its receptor in tomato cells according to the address-message concept[J].The Plant Cell, 2000, 12(9):1783-1794.

      [5] Hann DR, Rathjen JP.Early events in the pathogenicity of Pseudomonas syringae on Nicotiana benthamiana[J].The Plant Journal,2007, 49(4):607-618.

      [6] Takai R, Isogai A, Takayama S, et al.Analysis of flagellin perceptionmediated by flg22 receptor OsFLS2 in rice[J].Molecular Plant-Microbe Interactions, 2008, 21(12):1635-1642.

      [7] Hirai H, Takai R, Iwano M, et al.Glycosylation regulates specific induction of rice immune responses by Acidovorax avenae flagellin[J].Journal of Biological Chemistry, 2011, 286(29):25519-25530.

      [8] Takakura Y, Che FS, Ishida Y, et al.Expression of a bacterial flagellin gene triggers plant immune responses and confers disease resistance in transgenic rice plants[J].Molecular Plant Pathology,2008, 9(4):525-529.

      [9] Kobayashi T, Rinker JN, Koffler H.Purification and chemical properties of flagellin[J].Arch Biochem Biophys, 1959, 84:342-362.

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