(煙臺市公安局刑偵支隊(duì),山東 煙臺 264000)
在全國罪犯DNA數(shù)據(jù)庫的建設(shè)過程中,需對大量人員樣本進(jìn)行檢驗(yàn),增加了檢驗(yàn)人員的工作量。本實(shí)驗(yàn)將磁珠法與自動化核酸提取設(shè)備相結(jié)合以提高檢驗(yàn)過程的準(zhǔn)確性,減少因手工操作引起的失誤,縮短檢驗(yàn)時間,提高每次檢驗(yàn)結(jié)果的可重復(fù)性及均一性。
人員血樣100份,為本實(shí)驗(yàn)室2009年上半年采集,載體為公安部物證鑒定中心生產(chǎn)的血樣采集卡。采集卡上的血斑面積達(dá)到4 cm2,自然晾干后放入紙制包裝袋室溫保存。使用BSD PP電動手持打樣器(煙臺澳斯邦公司)打取直徑為2.0 mm的血斑濾紙放在96孔板中,封膜保存在4℃冰箱中,以備提取。
將樣本板、加樣尖、AGOWA?DNA提取試劑盒(煙臺澳斯邦公司)、PCR板(保存提純的DNA)、廢液槽按照操作要求放在安利斯達(dá)標(biāo)準(zhǔn)型自動化核酸提取工作站(煙臺澳斯邦公司)指定的位置上。運(yùn)行DNA提取程序,儀器自動進(jìn)行樣品的裂解、DNA吸附、洗滌、洗脫提取。100份血樣經(jīng)磁珠法提取后的DNA模板,使用ModulusTM單管型多功能檢測儀(美國 Turner Biosystems公司),應(yīng)用PicoGreen定量試劑盒(北京原平皓生物技術(shù)有限公司)對DNA進(jìn)行定量,每份樣品檢測3次。
采用Identifiler試劑盒(美國AB公司)在9700型擴(kuò)增儀(美國AB公司)上進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物用3130XL遺傳分析儀(美國AB公司)進(jìn)行檢測,得到基因分型結(jié)果。
經(jīng)過對100份磁珠法提取后的DNA模板定量檢測,樣本 DNA 質(zhì)量濃度在(0.490±0.113)ng/μL。100 份人員血樣采用自動化磁珠提取法,經(jīng)擴(kuò)增及電泳檢測后峰高可達(dá)到1000~3000RFU,成功率達(dá)到100%。
磁珠法提取核酸是通過細(xì)胞裂解液裂解細(xì)胞,從細(xì)胞中游離出來的核酸分子被特異地吸附到磁性顆粒表面,而蛋白質(zhì)等雜質(zhì)不被吸附而留在溶液中。本研究中提取的 DNA 模板質(zhì)量濃度在(0.490±0.113)ng/μL,符合目前普遍采用的熒光檢測商品試劑盒對PCR模板濃度的要求。磁珠法不需要離心、不需要加入多種試劑,操作簡單,將其用于自動化核酸提取平臺中,樣品的裂解、DNA吸附、洗滌、洗脫、磁珠回收,都在工作站內(nèi)按照事先編好的程序自動進(jìn)行,65 min內(nèi)可完成96孔板的提取工作。操作簡單快捷,自動化程度高,減少人為因素的影響。
運(yùn)用自動化工作站解決了批量樣本前期提取工作中的繁瑣,同時通過制定血樣采集標(biāo)準(zhǔn)、統(tǒng)一打樣孔徑,以及控制磁珠用量和洗脫液體積即可實(shí)現(xiàn)對DNA模板濃度的半定量,從而達(dá)到在電泳檢測后所獲得的基因分型均衡,分析數(shù)據(jù)時減少了人工干預(yù),易于基因分型判斷和DNA數(shù)據(jù)入庫。