楊建輝 魯葆春
泛素-蛋白酶體通路及其與膽道疾病相關(guān)性研究進展
楊建輝 魯葆春
泛素-蛋白酶體通路(UPP)是真核生物細胞質(zhì)和細胞核內(nèi)依賴于ATP、非溶酶體途徑的蛋白質(zhì)降解通路。UPP通路不僅能降解變性、異?;蚱鸲虝鹤饔玫牡鞍踪|(zhì),而且能降解植物色素、轉(zhuǎn)錄因子、內(nèi)膜蛋白和細胞周期蛋白等天然蛋白質(zhì),因而在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)降解、蛋白質(zhì)穩(wěn)定狀態(tài)調(diào)節(jié)、程序性細胞死亡、細胞周期控制和免疫介導等過程中起重要作用,因此泛素介導的蛋白質(zhì)降解通路的異常與許多疾病,如惡性腫瘤、膿毒血癥所致肌肉萎縮等密切相關(guān)。筆者就UPP與膽道疾病相關(guān)性的研究進展作一綜述。
真核細胞主要有兩種蛋白質(zhì)降解通路,一種是溶酶體通路,主要降解經(jīng)胞吞進入細胞的胞外蛋白質(zhì);另一種是非溶酶體通路,即UPP,主要經(jīng)細胞內(nèi)的蛋白酶體降解泛素化蛋白質(zhì)。UPP主要由泛素(Ub)、泛素活化酶(E1)、泛素偶聯(lián)酶(E2)、泛素連接酶(E3)、泛素鏈延長酶(E4)、去泛素化酶(DUB)、蛋白酶體等組成。
1.1 Ub Ub是真核細胞內(nèi)一種由76個氨基酸組成的球形熱穩(wěn)定蛋白,分子量為8.45kD,其結(jié)構(gòu)在真核細胞中高度保守,在不同生物體間組成Ub的氨基酸序列差別很小,如酵母和人的Ub僅有3個氨基酸序列的差別。因其在體內(nèi)廣泛存在、含量豐富而被稱為Ub。Ub以自由形式和復合物形式兩種存在,其功能位點為C2端的76位Gly殘基和Lys殘基,Gly殘基上的羧基能與靶蛋白的Lys殘基上的氨基形成異構(gòu)肽鍵。另外,不同Ub分子的Gly殘基與Lys殘基之間結(jié)合,可形成一條長鏈[1]。Ub的功能主要是通過異構(gòu)肽鍵結(jié)合胞漿內(nèi)錯誤折疊或半衰期較短的蛋白,并以此指導蛋白酶體依賴的蛋白質(zhì)降解。
1.2 Ub相關(guān)酶 蛋白的Ub化是由Ub相關(guān)酶啟動的,是蛋白降解的關(guān)鍵步驟,是一種蛋白級聯(lián)反應。E1水解ATP釋放能量,使其半胱氨酸殘基(Cys)的氨基與UbC2端的Gly的羧基形成高能硫酯鍵,從而激活Ub。而后活化的Ub(E1-Ub復合物)轉(zhuǎn)?;饔帽晦D(zhuǎn)移到E2活性Cys上,并釋放出E1,以新的高能硫酯鍵結(jié)合形成E2-Ub復合物。E2-Ub復合物可直接與特定的靶蛋白形成Ub-蛋白復合物。而在大多數(shù)情況下,需通過E3這個底物連接因子先與靶蛋白特異性結(jié)合,E2-Ub才獲得與靶蛋白相互接近,繼而靶蛋白與E2酶連接的Ub結(jié)合,從而完成靶蛋白的Ub化。在啤酒酵母菌研究中發(fā)現(xiàn),Ub鏈延長酶E4,多個靶蛋白-E3復合物在其幫助下能連接形成長Ub鏈,稱之為多聚Ub化修飾[2]。部分靶蛋白必須經(jīng)多聚Ub化修飾后才能被蛋白酶體識別水解[3]。
細胞內(nèi)同時存在去Ub化,是Ub化過程的逆轉(zhuǎn)。Ub-靶蛋白偶聯(lián)后,進入26S蛋白酶體內(nèi)靶蛋白被降解,同時在特異性水解酶(去Ub化酶)的作用下能夠解離Ub分子,可被重復利用。去Ub化酶主要有兩大類:Ub羧基端水解酶(UCHs)和Ub特異性修飾酶(UBPs/USPs),均能催化水解Ub和底物蛋白之間的硫酯鍵,起到去Ub化作用,還能將錯誤識別的底物從Ub化復合體中釋放出來,并重新釋放出Ub分子。UCHs屬于半胱氨酸蛋白酶,可以通過裂解UbC末端Gly將Ub分子從小的多肽底物上釋放出來,也參與多聚Ub鏈產(chǎn)生Ub單體的過程。UBPs含有2個短而保守的片段,即Cys盒和Hi盒,能將Ub分子從大的蛋白上移除。兩類酶都能參與去除和解聚底物蛋白質(zhì)上的多聚Ub鍵,從而防止多聚Ub在底物蛋白的聚集,而以Lys48方式連接的多聚Ub鏈結(jié)構(gòu)對去Ub化酶有對抗作用[4]。
1.3 蛋白酶體 蛋白酶體是Ub化蛋白的降解場所,存在于細胞核和細胞質(zhì)內(nèi),主要發(fā)揮生物性效應是26S蛋白酶體。26S蛋白酶體包含1個20S核心蛋白酶和兩個19S調(diào)控復合物,20S是具有蛋白酶體催化活性的核心顆粒,由4個并列環(huán)狀中空圓柱狀顆粒物構(gòu)成,兩端的顆粒物構(gòu)成2個α環(huán),中間的顆粒物構(gòu)成2個β環(huán)。α環(huán)亞基負責靶蛋白的識別,而β環(huán)參與靶蛋白的降解,3個不同肽酶活性均位于β環(huán)的亞基上,分別為糜蛋白酶樣、胰蛋白酶樣和半胱氨酸蛋白酶樣活性。進入26S蛋白酶體的蛋白質(zhì)被多次切割,最后形成3~22個氨基酸殘基的小肽。19S是具有調(diào)節(jié)功能的調(diào)節(jié)顆粒,由包含6個AAA-ATP酶的堿性亞復合體和包含8個非ATP酶的亞復合體組成,參與對靶蛋白的特異性識別。多聚Ub鏈形成后,可與蛋白酶體19S Ub受體相互作用,使靶蛋白去折疊進入26S蛋白酶體催化中心被降解。
Ub和蛋白酶體分別是整個UPP的起始環(huán)節(jié)和核心位點,利用Ub化或去Ub化可以調(diào)控細胞內(nèi)蛋白質(zhì)水平并影響其功能。研究已證實,Ub介導了細胞內(nèi)80%~90%的蛋白降解,參與了細胞周期循環(huán)、信號轉(zhuǎn)導、炎癥反應、DNA損傷修復、細胞凋亡及抗原遞呈等許多生命過程。
細胞周期調(diào)控因子Ub化,然后由26S蛋白酶體降解,導致周期因子依賴的激酶失活,從而使細胞有絲分裂期中止。p53作為轉(zhuǎn)錄因子可以誘導細胞周期抑制因子和促凋亡基因的表達,當DNA受到損傷或發(fā)生不正常的細胞增殖時p53就會被激活,使細胞周期停止或使細胞發(fā)生凋亡。Anwar等[5]用蛋白酶體抑制物MG-132處理黑色瘤細胞,p53蛋白水平升高,半衰期延長,由此可見細胞中p53蛋白水平的調(diào)節(jié)主要是通過UPP通路來實現(xiàn)。
細胞信號轉(zhuǎn)導通路中多種調(diào)節(jié)蛋白通過UPP活化和降解,控制著細胞的分化、生長、凋亡等過程,如UPP對核內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子NF-κB信號通路的調(diào)控。NF-κB是一多亞基組成的轉(zhuǎn)錄因子,其抑制因子IκB磷酸化后被26S蛋白酶體降解從而導致NF-κB以活性方式存在,相關(guān)的基因表達增強[6]。NF-κB可與IL-1、IL-2、IL-6、TNF-α等細胞因子和炎性介質(zhì)的基因啟動子區(qū)域固定核苷酸序列結(jié)合,啟動基因轉(zhuǎn)錄。
抗原分子Ub化后被26S蛋白酶體降解成多肽,然后由組織相容性復合體MHC I類分子提呈至細胞表面,應用蛋白酶體抑制劑可阻滯提呈至MHCⅠ類分子細胞表面多肽的產(chǎn)生。而膿毒癥狀態(tài)下的骨骼肌蛋白過度代謝亦是由UPP介導的。可見免疫、炎癥反應、各種病理狀態(tài)下的骨骼肌代謝等都與Ub-蛋白酶體通路有關(guān)。
UPP降解許多蛋白,而這些蛋白帶有某些能被Ub系統(tǒng)識別的信號,稱作降解信號。有些天然蛋白,其降解信號被隱藏在疏水核心中,蛋白不被降解,但當?shù)鞍捉Y(jié)構(gòu)變化出現(xiàn)部分解鏈區(qū),降解信號就會暴露而被Ub系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)并降解,這證實為何部分折疊、異常和突變蛋白易被降解的原因。有些氨基酸序列就是降解的信號,如轉(zhuǎn)錄因子Gcn4p,有281個氨基酸,91~106位氨基酸序列稱為PEST序列,此蛋白正常的半衰期大約為5min,若將PEST序列移除,半衰期增加到50min。蛋白質(zhì)N-末端氨基酸序列可預測它的半衰期,即N-末端規(guī)則,如蛋白質(zhì)N-末端是天冬氨酸,半衰期為3min,若是絲氨酸,半衰期可長達20h。一旦多聚Ub化鏈接到蛋白上,蛋白必將運送到蛋白酶體,被展開然后降解,這些步驟依賴于降解信號或靶蛋白自身特性的調(diào)控。
UPP被特異性調(diào)控,主要是E3對靶蛋白序列或降解信號來特異性地識別和降解,決定反應的特異性。根據(jù)識別靶蛋白序列中結(jié)構(gòu)域不同,E3分為兩類:(1)HECT型E3連接酶,結(jié)構(gòu)域上的半胱氨酸殘基與E2攜帶的Ub以硫酯鍵連接形成復合物Ub-E3,再將Ub轉(zhuǎn)移到靶蛋白上[7]。(2)RING-finger E3連接酶,包含一個RING-finger結(jié)構(gòu)域,可以與Ub-E2形成復合體,但其本身不與Ub發(fā)生作用,不能以硫酯鍵直接與Ub結(jié)合,只是將Ub轉(zhuǎn)移給靶蛋白[8]。
4.1 UPP與膽道感染 急性重癥膽管炎(ACST)是在膽道完全梗阻的基礎(chǔ)上發(fā)生的一種嚴重的急性膽道感染,存在著細菌易位和腸源性內(nèi)毒素血癥。占全身單核巨噬細胞系統(tǒng)85%~90%的肝枯否細胞(KCs)是膽血屏障的重要組成部分,是清除來自膽道和腸道內(nèi)細菌及其內(nèi)毒素的主要場所。
ACST時,動物血循環(huán)中內(nèi)毒素(LPS)水平顯著增加,KCs吞噬能力受到嚴重損害。而膽道梗阻后血循環(huán)中的脂多糖結(jié)合蛋白(LBP)水平也顯著提高[9]。LPSLBP復合物形成后,與KCs表面脂多糖受體CD14借助于糖基磷脂酸肌醇相結(jié)合并將LPS的刺激信號傳遞細胞內(nèi),激活KCs胞漿內(nèi)的NF-κB核轉(zhuǎn)錄因子。在靜息狀態(tài)下,NF-κB存在于胞質(zhì)內(nèi)并與抑制因子(IκB)結(jié)合形成無活性的三聚體復合物。ACST時,當LPS的刺激信號傳人細胞內(nèi)后激活NF-κB誘導激酶,使IκB磷酸化,通過UPP被26S蛋白酶體降解,從而使NF-κB活化,并露出其核定位信號,特異性結(jié)合在DNA序列上,引起許多因子的轉(zhuǎn)錄,包括促炎因子IL-1β、IL-6等。Gong等[10]的研究表明,ACST患者外周血單核細胞內(nèi)NF-κB活性明顯增強,其增強的程度與膽道感染的程度密切相關(guān),并與患者的預后相關(guān)。
ACST時,膿毒癥發(fā)生率為100%,伴有嚴重的代謝性酸中毒,且常伴發(fā)1個或多個臟器的功能障礙。研究表明,膿毒癥時骨骼肌蛋白的降解是由于Ub-蛋白酶體途徑被激活的。內(nèi)毒素、TNF-α等介質(zhì)是直接或間接導致骨骼肌蛋白降解的重要誘導或調(diào)節(jié)因子,抑制炎癥介質(zhì)NF-κB途徑可有效降低嚴重膿毒癥狀態(tài)下的骨骼肌蛋白降解率[11]。Mutsvangwa等[12]建立奶牛酸中毒模型研究酸性代謝中肌蛋白降解增加的機制,發(fā)現(xiàn)ATP參與了其反應過程,而溶酶體和鈣離子激活酶則未參與,酸中毒大鼠骨骼肌組織中UbmRNA量增加了25%、E2mRNA量增加了34%,蛋白酶體C8亞基mRNA增加了20%,從而進一步證實UPP上調(diào)是酸中毒時骨骼肌流失的蛋白質(zhì)增加內(nèi)在機制。
4.2 UPP與膽道梗阻 急慢性膽道梗阻可引起膽汁性肝硬變,可伴隨機體負氮平衡,體重的減輕。Lin等[13]將成年雄性大鼠膽道結(jié)扎誘導膽汁性肝硬變,發(fā)現(xiàn)膽道結(jié)扎大鼠的肌肉蛋白降解率增高,Ub、Ub載體蛋白E2、蛋白酶體亞基C8和C2的基因表達增強,肌肉蛋白中游離Ub和結(jié)合Ub的水平均升高,而其中TNF-α在整個機制中起到了重要作用。Wang等[14]的研究表明,膽道結(jié)扎誘導膽汁性肝硬變大鼠,骨骼肌蛋白硝化、Ub化明顯加強,注射左旋-硝基精氨酸甲脂治療后骨骼肌Ub化水平明顯下降。在原發(fā)性膽汁性肝硬變患者研究中,免疫組化染色提示膽管上皮細胞Ub明顯提高,熊去氧膽酸可減少其表達[15]。
4.3 UPP與膽道腫瘤 E3為Ub蛋白酶體降解途徑中的關(guān)鍵酶,能特異性識別底物蛋白并使其Ub化,RING-finger E3連接酶以cullins蛋白作為模板裝配而成,cullin家族已發(fā)現(xiàn)有cul-1、cul-2、cul-3、cul4A、cul4B、cul-5和cul-7等7個成員;cul-1作為cullins蛋白代表性成員,其組裝的復合體具有典型的Ub連接酶活性。新近研究證實,cu1-1介導許多細胞相關(guān)的功能蛋白的降解過程,有效地調(diào)節(jié)著細胞周期進程,其異常改變可能在惡性腫瘤發(fā)生、發(fā)展中有極重要作用。劉棟才等[16]的研究表明,膽囊腺癌Ub和cul-1表達陽性率分別為51.9%和48.1%,明顯高于癌旁組織、腺瘤性息肉、慢性膽囊炎膽囊上皮,膽囊腺癌中Ub表達水平與cul-1表達水平呈高度一致性。劉燕雷等[17]采用免疫組織化學法結(jié)合蛋白印跡技術(shù)檢測人膽道腫瘤組織、正常膽道組織及炎性組織中Ub蛋白的表達,發(fā)現(xiàn)膽道腫瘤組織中Ub蛋白的表達顯著高于正常組織及炎性組織中Ub蛋白的表達,表明Ub蛋白在人膽道腫瘤組織中表達水平升高,可能與膽道系統(tǒng)腫瘤的惡性程度、疾病的進程密切相關(guān)。
USP14屬于Ub特異性蛋白酶家族,Chuensumran等[18]采用實時定量PCR方法研究發(fā)現(xiàn),在膽管細胞癌患者腫瘤組織中USP14基因表達明顯上調(diào),其表達水平與腫瘤臨床病理特征、組織學分級相關(guān),與病理分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等無明顯相關(guān)。人突變基因p27表達蛋白是一種熱穩(wěn)定蛋白,主要抑制細胞周期因子E-CDK2復合體的活性,同時也能抑制細胞周期因子D-CDK4和細胞周期因子A-DK2復合體,還能下調(diào)細胞周期因子B的表達。p27蛋白的降解主要由受Ub介導的第187位蘇氨酸磷酸化引起的。Sasaki等[19]采用腺病毒誘導野生型 p27kip1突變,基因片段由 Thr-187/Pro-188(ACGCCC)轉(zhuǎn)為Met-187/Ile-188(ATGATC),然后轉(zhuǎn)染膽管癌細胞系TFK-1和HuCCT-1,引起表達p27 kip1蛋白的UPP降解通路受阻,p27 kip1蛋白大量堆積導致細胞在G0/G1期停留,從而促進腫瘤細胞凋亡及明顯抑制腫瘤細胞增殖。
UPP是高效、廣泛、有選擇性的蛋白質(zhì)降解途徑,參與細胞周期調(diào)節(jié)、信號轉(zhuǎn)導、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、免疫應答等各種細胞生物學功能,其改變與膽道疾病的發(fā)生、發(fā)展及治療密切相關(guān),是研究膽道疾病的一個新靶點。胰島素在ACST膿毒癥狀態(tài)下具有直接調(diào)節(jié)免疫炎癥反應的作用,減少炎癥介質(zhì)分泌,抑制骨骼肌蛋白質(zhì)降解,其調(diào)節(jié)機制證實通過對UPP的研究而被了解。膽管腫瘤起病隱匿,預后差,UPP的研究對于闡明發(fā)病機制、推動早期診斷及開發(fā)分子靶向治療提供了新思路和新策略。
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2013-02-06)
(本文編輯:歐陽卿)
浙江省公益性技術(shù)應用研究計劃項目(2011C33023)
312000 紹興市人民醫(yī)院普外科(肝膽外科)
魯葆春,E-mail:lbc111@yeah.net