王國興,徐福利,王渭玲,王偉東
(1.西北農(nóng)林科技大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,陜西 楊凌712100;2.中國科學(xué)院 水利部 水土保持研究所,陜西 楊凌712100)
自然界的氮素以分子態(tài)(N2)、無機(jī)態(tài)(銨態(tài)氮和硝態(tài)氮等)和有機(jī)態(tài)(蛋白質(zhì)和核酸等)形式存在,分布在地球的各個(gè)部位。進(jìn)入土壤中的動(dòng)植物殘?bào)w,除各類不含氮有機(jī)物質(zhì)外,還有含氮有機(jī)物質(zhì)。生物來源的含氮有機(jī)物主要是蛋白質(zhì),還有核酸、尿素、尿酸、幾丁質(zhì)等。尿素作為土壤氮素的主要來源之一,主要源于有機(jī)肥料如動(dòng)植物組織的核酸降解產(chǎn)物。植物雖然可以直接吸收尿素,但進(jìn)到土壤中的尿素一般都很快地被土壤中的細(xì)菌和土壤中的尿素酶分解成為氨、二氧化碳和水。氨可以與土壤中碳酸鹽結(jié)合產(chǎn)生碳酸銨。近年來,研究顯示土壤中細(xì)菌利用尿素產(chǎn)生氨不僅直接影響土壤中N源的循環(huán)利用,并且可以用于酸化土質(zhì)的改良。本文就土壤中細(xì)菌利用尿素產(chǎn)生氨的生物學(xué)特征以及對(duì)農(nóng)業(yè)的意義作一綜述,為深入研究利用土壤中尿素代謝,給土壤提供N素營養(yǎng),滿足植物生長對(duì)N素營養(yǎng)需求,提高植物產(chǎn)量與品質(zhì),促進(jìn)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和土壤N素肥力提供科學(xué)依據(jù)。
尿素酶(E.C.3.4.1.5)在自然界中廣泛存在。土壤微生物作為土壤生物系統(tǒng)能量循環(huán)的重要組成部分,為土壤中尿素酶的活性提供了主要來源[1]。尿素在細(xì)菌尿素酶的作用下快速分解產(chǎn)生氨,二氧化碳以及ATP[2]。尿素酶催化產(chǎn)氨是自然界三條微生物氮源代謝產(chǎn)氨的途徑之一[2-5]。研究發(fā)現(xiàn)土壤中有大量的微生物具有產(chǎn)生尿素酶的能力,包括真菌,酵母菌,細(xì)菌,藍(lán)細(xì)菌(cyanobacteria)和放線菌。尿素酶通過分解有機(jī)氮源對(duì)土壤培肥起到極其關(guān)鍵的作用。土壤中氮源的轉(zhuǎn)化和利用與土壤中尿素酶密切相關(guān);此外,土壤中尿素酶的活性直接影響到土壤中尿素肥料的使用,氮源揮發(fā)與過濾,以及環(huán)境中氮源污染[6]。土壤中尿素酶活性的檢測(cè)被認(rèn)為是檢測(cè)土壤質(zhì)量以及衡量土壤肥沃程度的重要指標(biāo)[7]。
關(guān)于細(xì)菌尿素酶生物學(xué)特征以及分子調(diào)控機(jī)制在放線菌和鏈球菌中曾被深入研究[2,8-10]。土壤中大量微生物均具有尿素酶活性,并作為一種細(xì)胞內(nèi)酶的形式存在[11]。目前,對(duì)土壤細(xì)菌尿素酶的研究主要集中于桿菌,如巴斯德氏芽胞桿菌(Bacillus pasteurizing),該菌具有較高尿素酶活性[11]。研究發(fā)現(xiàn)巴斯德氏芽胞桿菌尿素酶的活性在pH 8.0的弱堿性環(huán)境活性較低,在pH 5.0的酸性環(huán)境酶活性顯著增強(qiáng)[12]。這種在酸性環(huán)境下尿素酶活性被誘導(dǎo)增強(qiáng)的表達(dá)方式在其他細(xì)菌,如唾液鏈球菌,內(nèi)氏放線菌以及幽門螺桿菌也曾被檢測(cè)到[9,13-14]。從細(xì)菌生理學(xué)角度講,細(xì)菌在酸性環(huán)境下尿素酶代謝有利于維持細(xì)菌自身酸堿平衡,尿素水解產(chǎn)生的ATP同時(shí)為細(xì)菌生長提供能量,因此尿素代謝被認(rèn)為是細(xì)菌耐受酸性環(huán)境壓力的重要生理機(jī)制[15-16]。與唾液鏈球菌,內(nèi)氏放線菌以及幽門螺桿菌等其他細(xì)菌尿素酶不同的是,巴斯德氏芽胞桿菌尿素酶不僅以自由形式存在,也可以結(jié)合的方式存在[12]。Gianfreda等人研究發(fā)現(xiàn)土壤中無機(jī)成分黏土,氧化鋁,黏土有機(jī)復(fù)合物均能與尿素酶結(jié)合[11,16]。此外,尿芽胞八疊球菌(Sporosarcina ureae)也是土壤中一種具有較高尿素酶活性的細(xì)菌,該菌為周生鞭毛的四聯(lián)或八聯(lián)球菌,細(xì)胞大小為1.2~2.5um,能形成芽胞(0.8~1.0mm),這是唯一能形成芽孢的球菌。
土壤樣本中能夠直接提取分離有活性的尿素酶,尿素酶可以與土壤的有機(jī)物或無機(jī)物相結(jié)合從而防止酶被降解。與其它細(xì)菌尿素酶類似,土壤中尿素酶的活性也同時(shí)受到多種因素的影響,這些因素包括土壤的化學(xué)特性,環(huán)境因素,尿素來源以及微生物間相互作用[9,17]。土壤中尿素酶活性與細(xì)菌(包括放線菌,真菌和固氮細(xì)菌)組成比例和尿素酶活性均呈現(xiàn)隨季節(jié)變遷呈周期性變化,從年季變化分析,四月最高,從七月開始下降至十二月最低,因此,Liu等人提出土壤中細(xì)菌比例被認(rèn)為尿素酶活性直接相關(guān)[18]。McCarty等人利用不同形式的氮源研究其對(duì)土壤中細(xì)菌尿素酶活性的影響,發(fā)現(xiàn)具有生物活性的左旋丙胺酸、精氨酸、天冬酰胺酸、谷氨酸鹽能夠抑制土壤中尿素酶活性,右旋氨基酸和谷氨酸鹽對(duì)土壤中尿素酶活性沒有顯著的抑制作用。因此,McCarty等人提出土壤中細(xì)菌尿素酶的合成受全局氮源調(diào)節(jié)子調(diào)控[19]。研究發(fā)現(xiàn)在土壤中加入有機(jī)成分能夠有效的促進(jìn)土壤中細(xì)菌生長以及土壤中尿素酶的活性,例如殺蟲劑[20-21]。最近,Yu等人對(duì)使用殺蟲劑百菌清(Chlorothalonil)后土壤中具有尿素酶活性的細(xì)菌和土壤尿素酶活性進(jìn)行檢測(cè),研究發(fā)現(xiàn)第一次使用百菌清后,土壤中具有尿素酶活性的細(xì)菌如放線菌數(shù)量和土壤尿素酶活性明顯下降,然而四次使用(21d)后,土壤中具有尿素酶活性的細(xì)菌對(duì)百菌清出現(xiàn)耐受,并能對(duì)百菌清進(jìn)行降解。因此,Yu等人認(rèn)為反復(fù)使用百菌清不會(huì)對(duì)土壤中具有尿素酶活性的細(xì)菌和土壤尿素酶活性造成影響[22]。Tabatabai M發(fā)現(xiàn)土壤中金屬元素的含量可以抑制土壤尿素酶活性,包括鉛和鉻[23]。Nourbakhsh等人通過研究伊朗中部地區(qū)土壤發(fā)現(xiàn),土壤中尿素酶的活性與土壤的濕潤程度無明顯的相關(guān)性;不同的土壤酸堿值,碳酸鈣含量以及陽離子滲透程度對(duì)土壤中尿素酶活性也沒有影響;但是土壤中尿素酶的活性與土壤中可分離的具有尿素酶活性的細(xì)菌含量呈明顯的正相關(guān),而與土壤的電流傳導(dǎo)性呈負(fù)相關(guān)[24]。
土壤中尿素酶的活性直接影響到土壤中尿素肥料的使用,氮源揮發(fā)與淋失,以及環(huán)境中氮源對(duì)環(huán)境的污染[6]。土壤中尿素酶活性的檢測(cè)被認(rèn)為是檢測(cè)土壤質(zhì)量和土壤肥力的重要指標(biāo)之一[7]。在一些已知的具有尿素酶的土壤細(xì)菌中,一些氨氧化細(xì)菌(ammonia oxidizing bacteria-AOB),如亞硝化單孢菌,可以通過氧化氨或者其它尿素酶催化產(chǎn)物產(chǎn)生細(xì)菌生長所需能量,這一過程被成為固氮[25]。AOB細(xì)菌的氨氧化作用是生態(tài)系統(tǒng)中固氮的重要環(huán)節(jié),其作用水平主要受到系統(tǒng)中氨水平的限制。
腐植酸是土壤中植物,動(dòng)物和微生物等生物和化學(xué)降解產(chǎn)生的大分子復(fù)合物。腐植酸可以通過影響氮源的分布,生物供給以及有機(jī)氮的最終走向[26]。研究發(fā)現(xiàn)腐植酸可以抑制土壤微生物群的組成比例和微生物數(shù)量,從而影響土壤尿素酶活性降低氨的產(chǎn)生,并且改變AOB細(xì)菌比例從而影響氨氧化作用最終影響固氮作用[27]。
在尿素酶的作用下,尿素分解產(chǎn)生的氨可以升高周圍環(huán)境的pH值,引起環(huán)境中礦物離子(如鈣離子和碳酸根離子)的沉積。土壤生物鈣化是指在產(chǎn)堿細(xì)菌的誘導(dǎo)作用下土壤中鈣鹽沉積(Microbial induced calcium carbonate precipitation- MICP)[28]。這 一過程與細(xì)菌細(xì)胞濃度,離子強(qiáng)度以及pH值密切相關(guān)。將MICP用于改良土壤的機(jī)械特性,近年來受到了大量關(guān)注。Whiffin等學(xué)者認(rèn)為MICP可以增強(qiáng)砂質(zhì)土壤的強(qiáng)度和持久度[29]。與其它利用化學(xué)或者cement grouting techniques改良土壤的方法相比,MICP對(duì)環(huán)境的污染更小[30]。研究發(fā)現(xiàn)巴斯德氏芽胞桿菌尿素酶可以被土壤吸收固定,被吸收固定的細(xì)菌尿素酶穩(wěn)定性增強(qiáng)。細(xì)菌尿素酶被土壤吸收固定的過程與土壤中氯化鈉的濃度密切相關(guān),此外,呈弱酸性的土壤更有利于細(xì)菌尿素酶的吸收固定[11]。
精氨酸脫氨酶是自然界微生物三條主要的產(chǎn)堿代謝之一,精氨酸在細(xì)菌精氨酸脫氨酶系統(tǒng)的作用下分解產(chǎn)生氨,二氧化碳,水和 ATP[31-32]。然而,與其他植物與人體的細(xì)菌相比,土壤中細(xì)菌利用精氨酸脫氨酶系統(tǒng)進(jìn)行產(chǎn)氨通常被認(rèn)為是一條很弱的產(chǎn)氨活性[33-34]。2008年,Liu等學(xué)者通過從西湖和無錫水渠的土壤中成功分離到54株具有精氨酸脫氨酶的活性的土壤菌株,通過16SrDNA測(cè)序分析鑒定所有分離株均屬于假單胞菌屬。其中Pseudomonas plecoglossicida菌精氨酸脫氨酶很高。研究發(fā)現(xiàn)具有高活性精氨酸脫氨酶的Pseudomonas plecoglossicida對(duì)人類腫瘤細(xì)胞HEPG2具有高度的抑制作用[35]。此外,Williams在利用蛋白組學(xué)的方法研究土壤細(xì)菌功能蛋白的作用以及隨土壤環(huán)境因素變化所發(fā)生的功能變化時(shí),發(fā)現(xiàn)在丙酮處理的土壤樣本中,細(xì)菌精氨酸脫氨酶表達(dá)明顯增高[36]。因此,Williams等學(xué)者提出土壤中細(xì)菌精氨酸脫氨酶在特殊的環(huán)境下可能成為土壤中重要的產(chǎn)氨固氮途徑。
土壤微生物區(qū)系和土壤酶活性是土壤肥力和農(nóng)作物生產(chǎn)基礎(chǔ)物質(zhì)的重要基礎(chǔ)[37]。其中尿酶對(duì)土壤氮素轉(zhuǎn)化和氮肥有效利用作用更大[38-40]。本綜述認(rèn)為,土壤細(xì)菌利用尿素產(chǎn)氨不僅可以直接影響土壤中氮源的循環(huán)利用和土壤氮素肥力,并且可以酸化土質(zhì)的改良。分析指出了土壤中細(xì)菌利用尿素產(chǎn)氨的生物學(xué)特征及分子調(diào)控機(jī)制。
同時(shí),影響土壤尿素酶活性的壤的化學(xué)特性,環(huán)境因素,尿素來源以及微生物間相互作用,土壤中尿素酶活性被認(rèn)為是檢測(cè)土壤質(zhì)量和土壤肥力的重要指標(biāo)之一,它與固氮作用、土壤改良和土壤中其他產(chǎn)氨代謝因素有著密切關(guān)系[9,11,20-21]。土壤中尿素 酶的活性對(duì) 土壤氮素肥力評(píng)價(jià)和農(nóng)作物生產(chǎn)具有重要意義。
[1] Martens D,Bremner J M.Urea hydrolysis in soils:Factors influencing the effectiveness of phenylphosphorodiamidate as a retardant[J].Soil Biol.and Biochem.,1984,16(5):515-519.
[2] Liu Y,Hu T,Zhang J,et al.Characterization of the Actinomyces naeslundii ureolysis and its role in bacterial aciduricity and capacity to modulate pH homeostasis[J].Microbiological Research,2006,161(4):304-310.
[3] 劉婭玲.牙菌斑中尿素代謝與微生態(tài)平衡[J].國外醫(yī)學(xué):口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè),2003,20(3):201-203.
[4] Liu Y,Burne R A.Multiple two-component systems of Streptococcus mutans regulate agmatine deiminase gene expression and stress tolerance[J].J.Bacteriol.,2009,191(23):7363-7366.
[5] Liu Y,Zeng L,Burne R A.AguR is required for induction of the Streptococcus mutans agmatine deiminase system by low pH and agmatine[J].Appl.and Environ.Microbiol.,2009,75(9):2629-2637.
[6] Cookson P,Lepiece A G.Urease enzyme activities in soils of the Batinah region of the Sultanate of Oman[J].J.Arid Environ.,1996,32(3):225-238.
[7] Nannipieri P K,Ruggiero P.Enzyme Activities and Microbiological and Biochemical Processes in Soil[M]∥Enzymes in the Environment.Dekker:New York,2002.
[8] Liu Y,Dan J,Hu T,et al.Regulation of urease expression of Actinomyces naeslundii in biofilms in response to pH and carbohydrate[J].Oral Microbiolo.and Immunol.,2008,23(4):315-319.
[9] Liu Y,Hu T,Jiang D,et al.Regulation of urease gene of Actinomyces naeslundii in biofilms in response to environmental factors[J].FEMS Microbiol.Lett.,2008,278(2):157-163.
[10] 劉婭玲,胡濤,張靜儀,等.內(nèi)氏放線茵尿素酶對(duì)牙菌斑生物膜酸堿平衡調(diào)節(jié)作用的初步研究[J].上??谇会t(yī)學(xué),2005,14(6):605-607.
[11] Gianfreda L,Rao M A,Violante A.Adsorption,activity and kinetic properties of urease on montmorillonite,aluminium hydroxide and Al(OH)xmontmorillonite complexes[J].Soil Biol.Biochem.,1992,24(1):51-58.
[12] Ciurli S,Marzadori S,Benini S,et al.Urease from the soil bacterium Bacillus pasteurii:Immobilization on Ca-polygalacturonate[J].Soil Biol.Biotech.,1996,28(6):811-817.
[13] 劉婭玲,胡濤,張靜儀,等.影響內(nèi)氏放線菌尿素酶活性相關(guān)因素的初步研究[J].四川大學(xué)學(xué)報(bào):醫(yī)學(xué)版,2007,38(4):675-677.
[14] Liu Y,Hu T,Jiang D,et al.Analysis of urease gene expression by Actinomyces naeslundii in biofilm[J].J.Dent.Res.,2006,85(B):315.
[15] 劉婭玲,胡濤,周學(xué)東.尿素水解對(duì)內(nèi)氏放線菌增殖及耐酸力的影響[J].實(shí)用口腔醫(yī)學(xué)雜志,2006,22(3):145-147.
[16] Burne R A,Liu Y,Zeng L.Acid tolerance strategies of commensal and pathogenic oral streptococci[C]∥Society for General Microbiology Autumn 2010Meeting,University of Nottingham,2010.
[17] Mobley H L,Hausinger R P.Microbial ureases:significance,regulation,and molecular characterization[J].Microbiological reviews,1989.53(1):85-108.
[18] Liu J,Guo L,Hao Y,et al.Ecological Distribution of Soil Microorganism and Activity Characteristic of Soil Enzymes in Camellia Oleifera Stands[R]∥International Conference on Challenges in Environmental Science and Computer Engineering.2010.
[19] McCarty G,Shogren D R,Bremner J M.Regulation of urease production in soil by microbial assimilation of nitrogen[J].Biol.Fertil.Soil s,1992,12(4):261-264.
[20] Zantua M I,Bremner J M.Stability of urease in soils[J].Soil Biol.Biochem.,1977,9(2):135-140.
[21] Kandeler E,Gerber H.Short-term assay of soil urease activity using colorimetric determination of ammonium[J].Biol.Fertil.Soils,1988,6:68-72.
[22] Yu Y,Shan M,F(xiàn)ang H,et al.Responses of Soil Microorganisms and Enzymes to Repeated Applications of Chlorothalonil[J].J.Agric.Food Chem,2006,54:10070-10075.
[23] Tabatabai M.Effects of traceelements on ureaseactivity in soils[J].Soil Biology and Biochemistry,1977,9(1):9-13.
[24] Nourbakhsh F,Monreal C M.Effects of soil properties and trace metals on urease activities of calcareous soils[J].Biol.Fertil.Soils,2004,40(5):359-362.
[25] Marsh K,Sims G K,Mulvaney R L.Availability of urea to autotrophic ammonia-oxidizing bacteria as related to the fate of 14C-and 15N-labeled urea added to soil[J].Biol.Fert.Soil,2005,42:137-135.
[26] Lichtfouse E C C,Baudin F,Leblond C,et al.A novel pathway of soil organic matter formation by selective preservation of resistant straight-chain biopolymers:chemical and isotope evidence[J].Organic Geochemistry,1998,28:411-415.
[27] Dong L,Cordova-Kreylos A L,Yang J,et al.Humic acids buffer the effects of urea on soil ammonia oxidizersand potential nitrification[J].Soil Biol Biochem,2009,41(8):1612-1621.
[28] Chu J,ab,Stabnikova V,Ivanova V.Microbially Induced Calcium Carbonate Precipitation on Surface or in the Bulk of Soil[J].ACI Mater J,2012,29(6):544-549.
[29] Whiffin V,van Paassen L A,Harkes M P.Microbial carbonate precipitation as a soil improvement technique[J].Geomicrobiol.J.,2007,24(5):417-413.
[30] Le Metayer-Levrel G,Castanier S,Orial G,et al.Applications of bacterial carbonatogenesis to the protection and regeneration of limestones in buildings and historic patrimony[J].Sediment.Geol.,1999,126(23/34).
[31] Liu Y,Burne R A.The major autolysin of Streptococcus gordonii is subject to complex regulation and modulates stress tolerance,Biofilm formation,and Extracellular-DNA release[J].J.Bacteriol.,2011,193(11):2826-2837.
[32] Liu Y,Burne R A.Multiple two-component systems modulate alkali generation in Streptococcus gordonii in response to environmental stresses[J].J.Bacteriol,2009,191(23):7353-7362.
[33] Liu Y,Dong Y,Chen Y Y,et al.Environmental and growth phase regulation of the Streptococcus gordonii arginine deiminase genes[J].Appl.Environ.Microbiol.,2008,74(16):5023-5030.
[34] Burne R,Zeng L,Ahn S J,et al.Progress Dissecting the Oral Microbiome in Caries and Health[J].Adv.Dent.Res.,2012,4(3):135-140.
[35] Liu Y,Sun Z H,Ni Y,et al.Isolation and identification of an arginine deiminase producing strain Pseudomonas plecoglossicida CGMCC2039[J].World J.Microbiol Biotechnol,2008,24:2213-2219.
[36] Williams M,Taylor E B,Mula H P.Metaproteomic characterization of a soil microbial community following carbon amendment[J].Soil Biology & Biochemistry,2010,42:1148-1156.
[37] 欒曉波,徐福利,汪有科.施肥對(duì)山地紅棗林土壤微生物區(qū)系及酶活性的影響[J].西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2012,21(7):149-154.
[38] 李慧杰,徐福利,林云.施用氮磷鉀對(duì)黃土丘陵區(qū)山地紅棗林土壤酶與土壤肥力的影響[J].干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究,2012,30(4):54-59.
[39] 王叔起,韓曉增,喬云發(fā),等.不同土地利用和施肥方式對(duì)土壤酶活性及相關(guān)肥力因子的影響[J].植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào),2009,15(6):1311-1316.
[40] 王燦,王德建,孫瑞娟,等.長期不同施肥方式下土壤酶活性與肥力因素的相關(guān)性[J].生態(tài)環(huán)境,2008,17(2):688-692.