王衛(wèi)文 李有武 夏永祥 劉才冬
南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京第一醫(yī)院檢驗(yàn)科,江蘇省南京市 210006
超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended-spectrumβ-lactamases,ESBLs)是由質(zhì)粒介導(dǎo)可水解含氧亞氨基的β-內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素,并可被β-內(nèi)酰胺酶抑制劑克拉維酸等抑制的一類(lèi)β-內(nèi)酰胺酶,主要由大腸埃希菌和肺炎克雷伯菌產(chǎn)生。產(chǎn)ESBLs菌不僅對(duì)第三代頭孢菌素和氨曲南耐藥,而且對(duì)氨基糖苷類(lèi)、喹諾酮類(lèi)、磺胺類(lèi)抗菌藥物也有交叉耐藥。根據(jù)2001年Bradford的分類(lèi),將ESBLs分為T(mén)EM型、SHV型、CTX-M型、OXA型及其他型五類(lèi)[1,2]。為了解南京地區(qū)產(chǎn)ESBLs菌的基因型流行情況,筆者收集了南京地區(qū)四家三級(jí)甲等醫(yī)院臨床標(biāo)本中分離的60株產(chǎn)ESBLs的大腸埃希菌和肺炎克雷伯菌分別用TEM型、SHV型、CTX-M型、OXA型ESBLs的特定引物進(jìn)行擴(kuò)增并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序分析,得到南京地區(qū)產(chǎn)ESBLs菌的基因型流行病學(xué)資料。
1.1 材料
1.1.1 菌株:30株產(chǎn)ESBLs大腸埃希菌和30株產(chǎn)ESBLs肺炎克雷伯菌分別分離自江蘇省人民醫(yī)院、南京市鼓樓醫(yī)院、南京市第一醫(yī)院和南京市中大醫(yī)院臨床標(biāo)本,所有菌株均經(jīng)法國(guó)生物梅里埃公司ATB Expression自動(dòng)細(xì)菌鑒定儀重新鑒定,并經(jīng)ESBLs確證試驗(yàn)確定。質(zhì)控菌株為大腸埃希菌ATCC25922,肺炎克雷伯菌ATCC700603。
1.1.2 藥敏紙片:頭孢噻肟(30μg/片),頭孢他啶(30μg/片),頭孢噻肟/克拉維酸(30μg/10μg),頭孢他啶/克拉維酸(30μg/10μg)以上紙片均為英國(guó)Oxoid公司產(chǎn)品。
1.1.3 儀器及試劑:ATB Expression細(xì)菌鑒定及藥敏智能系統(tǒng),細(xì)菌鑒定試條、M-H瓊脂均為法國(guó)生物梅里埃公司產(chǎn)品。TaqDNA酶、dNTP、PCR純化試劑盒購(gòu)自上海生工生物工程公司。
1.2 方法
1.2.1 ESBLs確證試驗(yàn)[3]:按照標(biāo)準(zhǔn)紙片擴(kuò)散法的規(guī)定接種M-H平板,在M-H平板上貼上頭孢噻肟(30μg/片),頭孢噻肟/克拉維酸(30μg/10μg)和頭孢他啶(30μg/片),頭孢他啶/克拉維酸(30μg/10μg)紙片,35℃孵育16~18h,對(duì)兩組中任何一個(gè)藥物,在加克拉維酸后抑菌圈直徑與不加克拉維酸的抑菌圈直徑相比增大值≥5mm時(shí),判定為產(chǎn)ESBLs菌。
1.2.2 PCR擴(kuò)增:PCR擴(kuò)增用煮沸法提取細(xì)菌DNA,取2μL用于PCR擴(kuò)增。反應(yīng)參數(shù):94℃1min,56℃1min,72℃1min,循環(huán)30次,最后72℃延伸10min。引物設(shè)計(jì)如下:TEM型5’-TCGGGGAAATGTGCG-3’(1-15),5’-TGCTTAATCAGTGAGGCACC-3’(953-972);SHV型5’-GCCTTTATCGGCCTTCACTCAAG-3’(37-59),5’-TTAGCGTTGCCAGTGCTCGATCA-3’(912-934);CTX-M型CTX-M-1組5’-GGCCCATGGTTAAAAAATCCTGC-3’(60-81,5’加GG),5’-CCGTTTCCGCTATTACAAACCGTTG-3’(926-950);CTX-M-2組5’-CTCAGAGCATTCGCCGCTCA-3’(13-32),5’-CCGCCGCAGCCAGAATATCC-3’(836-855);CTX-M-8組5’-ACTTCAGCCACACGGATTCA-3’(237-256),5’-AAGTGGAGCGACAGAGC-3’(1168-1184);CTX-M-9組5’-GTCACAGCCCTTCGGC-GAT-GATTC-3’(854-876,5’加G),5’-GCGCATGGTGACAAAGAGA-GTGCAA-3’(1-21,5’加GCGC);OXA型OXA-2組5’-GGAGCAGCAACGATGTTACG-3’(54-73),5’-GGCGGTAACGCTTCAATAGA-3’(896-915);OXA-10組5’-CCACCAAGAAGGTGCCATGA-3’(106-125),5’-GCGACCTTGAGCGACTTGTT-3’(921-940)。
1.2.3 PCR產(chǎn)物克隆測(cè)序:PCR產(chǎn)物純化后與pGEM-T載體連接,轉(zhuǎn)化入大腸埃希氏菌DH5α后,經(jīng)含氨芐西林的麥康凱培養(yǎng)基篩選陽(yáng)性克隆白斑,堿法抽提質(zhì)粒DNA,EcoRI酶切分析鑒定插入片段,并對(duì)質(zhì)粒DNA進(jìn)行序列分析,將所測(cè)序列與GeneBank頒布的序列進(jìn)行比對(duì),確定基因型。
2.1 表型確證試驗(yàn) 30株產(chǎn)ESBLs大腸埃希菌和30株產(chǎn)ESBLs肺炎克雷伯菌在ESBLs確證試驗(yàn)中對(duì)頭孢噻肟和頭孢他啶加克拉維酸后抑菌圈直徑與不加克拉維酸的抑菌圈直徑相比增大值≥5mm情況見(jiàn)表1。
表1 60株產(chǎn)ESBLs菌表型確證試驗(yàn)結(jié)果(單位:株)
2.2 基因型分布 60株產(chǎn)ESBLs菌株CTX-M-2組、CTX-M-8組、OXA-2組及OXA-10組PCR擴(kuò)增未發(fā)現(xiàn)陽(yáng)性標(biāo)本。39株TEM型PCR擴(kuò)增陽(yáng)性,序列分析證實(shí)均為T(mén)EM-1型廣譜酶。CTX-M-1組擴(kuò)增陽(yáng)性有16株,為13株CTX-M-3、3株CTX-M-15。CTX-M-9組擴(kuò)增陽(yáng)性有37株,為32株CTXM-14、5株CTX-M-24。SHV型PCR擴(kuò)增陽(yáng)性有8株:6株為SHV-1、1株為SHV-11、1株為SHV-28,SHV-11與SHV-1相比僅在35位上由谷氨酰胺取代亮氨酸,這些位點(diǎn)的改變不影響酶活性和酶的底物范圍,所以SHV-11和SHV-1不是ESBLs[1],SHV-28也為廣譜酶[4]。有9株未擴(kuò)增到ESBLs基因型,它們的具體基因型有待進(jìn)一步研究。詳細(xì)的基因型分布見(jiàn)表2。
表2 ESBLs基因型分布
不同地區(qū)由于抗生素使用的種類(lèi)不同,造成ESBLs流行的基因型也不盡相同。歐洲國(guó)家主要以TEM型和SHV型為主,我國(guó)主要以CTX-M型流行為主[5,6],這與我國(guó)頭孢噻肟的大量使用有著密切的關(guān)系,而歐洲國(guó)家頭孢他啶使用得更普遍一些。本次調(diào)查對(duì)南京地區(qū)產(chǎn)ESBLs菌TEM型、SHV型、CTX-M型及OXA型基因型進(jìn)行了一次較為全面的檢測(cè),發(fā)現(xiàn)南京地區(qū)ESBLs基因型以CTX-M型為主,主要為CTX-M-3、CTX-M-14,OXA型未擴(kuò)增到陽(yáng)性,TEM型、SHV型PCR擴(kuò)增陽(yáng)性產(chǎn)物經(jīng)測(cè)序?yàn)門(mén)EM-1、SHV-1、SHV-11和SHV-28,它們都屬于廣譜酶。CTX-M型ESBLs對(duì)頭孢噻肟水解能力較強(qiáng),而對(duì)頭孢他啶的水解能力很弱。從表型確證試驗(yàn)的結(jié)果也能看出:60株菌中41株菌表現(xiàn)為僅頭孢噻肟組陽(yáng)性。本次試驗(yàn)有9株菌PCR擴(kuò)增陰性,說(shuō)明本地區(qū)可能存在上述引物無(wú)法擴(kuò)增出的其他ESBLs基因型。
現(xiàn)在世界各地不斷有新的ESBLs基因型報(bào)道,隨著抗生素的大量使用還會(huì)有更多的基因型出現(xiàn),因?yàn)椴煌幕蛐退獾牡孜锊煌虼思皶r(shí)、準(zhǔn)確的了解本地區(qū)的基因型流行情況,對(duì)指導(dǎo)臨床合理使用抗生素有著重要的意義,以達(dá)到控制耐藥菌株的蔓延。
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