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      結(jié)核病若干問題研究進展

      2011-09-20 09:58:46成詩明莊玉輝
      中國防癆雜志 2011年9期
      關(guān)鍵詞:基因組學(xué)結(jié)核結(jié)核病

      成詩明 莊玉輝

      結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌引起的一種嚴(yán)重危害人類健康的慢性傳染病。據(jù)世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)2010年全球結(jié)核病控制報告顯示[1],2009年全球新發(fā)結(jié)核病患者940萬,共有結(jié)核病患者1400萬,死于結(jié)核病者130萬。結(jié)核病給人類的健康帶來了如此巨大的負(fù)擔(dān),人類一直致力于結(jié)核病診斷、治療、預(yù)防等方面的研究。筆者將從以下5個方面來介紹結(jié)核病研究的一些進展。

      結(jié)核分枝桿菌基因組和后基因組學(xué)的研究

      隨著人類基因組計劃的成功完成,人類在破譯生命密碼的征程上邁出了堅實的一步。在此背景下,人類對模式生物如酵母、線蟲、果蠅、小鼠等的基因測序也相繼完成。1998年英國Sanger中心和法國Pasteur研究所的科學(xué)家合作完成了結(jié)核分枝桿菌H37Rv株的基因組測序工作,結(jié)核分枝桿菌H37Rv全基因組大小為4 411 529bp,G+C含量為65.6%,編碼3988種蛋白質(zhì)[2]。這標(biāo)志著結(jié)核分枝桿菌的研究已經(jīng)進入了基因組時代。

      隨著人類進入21世紀(jì),人類基因組的研究正在逐漸跨入后基因組時代。后基因組學(xué)又稱為功能基因組學(xué)[3],是在基因組學(xué)前期研究成果,主要是結(jié)構(gòu)基因組學(xué)研究所獲得的信息和產(chǎn)物的基礎(chǔ)上,全面、系統(tǒng)的分析基因的功能,力圖在基因組水平上對其基因的活動規(guī)律進行闡述。目前研究進展比較快的領(lǐng)域包括比較基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)。比較基因組學(xué)是一種鑒定生物體間基因組差異,研究遺傳變異,闡明生物體間生理、生化、毒力差異的有效方法。比較基因組學(xué)的研究結(jié)果表明結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群各菌種在脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)水平上同源性大于99.95%[4]。熊志紅等[5]用差異分析技術(shù)分析了結(jié)核分枝桿菌強毒株H37Rv和弱毒株H37Ra在體外培養(yǎng)條件下基因表達的差異,通過20種引物組合進行mRNA差異顯示,克隆到了兩菌株間的20余個差異表達基因,經(jīng)序列分析及雜交鑒定發(fā)現(xiàn)其中2個基因僅在H37Rv中表達,而在H37Ra中沒有表達。比較基因組分析的結(jié)果顯示了不同結(jié)核分枝桿菌遺傳的多樣性,這可能與不同疫苗的效果不同有關(guān)[6]。

      蛋白質(zhì)組學(xué)可以全面分析細(xì)胞在穩(wěn)定條件下產(chǎn)生的蛋白質(zhì)的概況。應(yīng)用蛋白質(zhì)組可以檢測到基因組中未能檢測到的基因,是對基因組分析方面的補充。蛋白質(zhì)組學(xué)研究主要技術(shù)有[7]:規(guī)?;鞍踪|(zhì)微量鑒定、二維或雙向凝膠電泳分離蛋白質(zhì)譜;“差異顯示”蛋白質(zhì)組學(xué);應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)或酵母雙雜交方法研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用等。目前應(yīng)用雙向凝膠電泳-質(zhì)譜分析技術(shù),從細(xì)菌體外培養(yǎng)物中共檢測到2600種蛋白斑點,如果這些蛋白斑點都是不同的蛋白質(zhì),則相當(dāng)于基因組學(xué)中預(yù)測蛋白質(zhì)總數(shù)的65%,進一步進行其功能學(xué)的研究將有極大的應(yīng)用價值[8]。

      宿主結(jié)核病易感基因的研究

      結(jié)核病的發(fā)病是多因素作用的結(jié)果。在暴露于結(jié)核分枝桿菌的人群中,只有10%的人會發(fā)?。?]。這說明結(jié)核病的發(fā)病不僅與環(huán)境暴露有關(guān),宿主自身的遺傳因素對結(jié)核病的發(fā)病也起著重要作用。目前相關(guān)的研究主要集中在以下幾種基因:自然抗性相關(guān)巨噬細(xì)胞蛋白1(natural resistanceassociated macrophage protein 1,NRAMP1)基因、維生素D受體(vitamin D receptor,VDR)基因,人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-DR基因、甘露糖結(jié)合凝集素(mannose binding lectin,MBL)基因等。

      邵凌云等[10]通過病例對照研究明確了結(jié)核感染與NRAMP1基因多態(tài)性的關(guān)系。NRAMP1的不同基因多態(tài)性的協(xié)同作用導(dǎo)致了對結(jié)核病的易感性。

      劉瑋等[11]采用病例對照研究設(shè)計,用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性分析檢測VDR基因中T/C多態(tài)性位點,在多因素分析中調(diào)整卡介苗接種史和吸煙狀況后,VDR-ff基因型與肺結(jié)核發(fā)病仍有顯著性關(guān)聯(lián)(調(diào)整OR=3.036,95%CI:1.117~8.253)。VDR-ff 基因型可能是中國漢族人群肺結(jié)核病的易感基因型。

      劉志輝等[12]研究發(fā)現(xiàn)HLA-DR16等位基因與南方漢族部分人群的肺結(jié)核的發(fā)病明顯關(guān)聯(lián),或與真正起作用的易感基因連鎖,中國南方漢族部分人群DR1、DR13.3等位基因的表達對結(jié)核分枝桿菌感染者的發(fā)病可能具有拮抗作用。

      劉瑋等[13]采用病例對照的方法對MBL基因多態(tài)性與中國漢族人群肺結(jié)核發(fā)病的關(guān)聯(lián)進行了分析,結(jié)果顯示MBL基因XB組單倍體型與中國漢族人群肺結(jié)核發(fā)生的易感性顯著相關(guān)(調(diào)整OR=1.60,95%CI:1.07~2.41)。

      總而言之,目前的研究結(jié)果顯示人類肺結(jié)核易感性與基因多態(tài)性存在關(guān)聯(lián),何種基因與結(jié)核病的易感性關(guān)系更為密切有待進一步的研究。相關(guān)研究的開展定能揭示結(jié)核病的遺傳學(xué)基礎(chǔ),為結(jié)核病的基因治療提供思路,最終會對結(jié)核病的控制和預(yù)防發(fā)揮重要的作用。

      結(jié)核病疫苗的研究

      自1921年以來,由牛結(jié)核分枝桿菌經(jīng)過13年230次傳代制成的減毒株-卡介苗(Bacille Calmette-Guérin,BCG)是目前世界上惟一批準(zhǔn)用于結(jié)核病預(yù)防的疫苗。BCG對于兒童重癥結(jié)核病如粟粒型結(jié)核、結(jié)核性腦膜炎具有良好的預(yù)防保護效果[14],但是其保護效力隨年齡增長而下降,一般為10~20年。對于青少年和成年人,其保護作用差異較大。有研究顯示BCG對成人肺結(jié)核的免疫保護作用為0%~80%[15]。鑒于BCG疫苗和單一的免疫方案的缺陷,對新型結(jié)核病疫苗和免疫接種方案的研究迫在眉睫。新型結(jié)核病疫苗不僅要對各年齡組未感染結(jié)核菌的人群提供良好的預(yù)防作用,同時要對已感染的人群提供消除體內(nèi)殘留的結(jié)核分枝桿菌,防止結(jié)核病復(fù)燃的保護作用。

      目前正在研發(fā)的新型疫苗包括取代BCG的初免疫苗、增強BCG效果的加強疫苗、治療性結(jié)核病疫苗。(1)取代BCG的初免疫苗:以基因重組的活疫苗為代表?;蛑亟M的活疫苗通過將特定的基因?qū)隑CG株內(nèi),使其表達結(jié)核分枝桿菌特異性抗原。以rBCG30為代表,該疫苗是已經(jīng)進入Ⅰ期臨床試驗的第一個結(jié)核病新型疫苗,通過基因重組技術(shù),使BCG株大量表達結(jié)核菌的重要保護性抗原Ag85B。(2)增強BCG效果的加強疫苗:以腺病毒或痘苗病毒為載體的疫苗屬于該類疫苗,通過表達免疫優(yōu)勢區(qū)抗原,激活免疫應(yīng)答;另一類加強疫苗是基因重組蛋白亞單位疫苗,是由2~3個結(jié)核分枝桿菌或BCG抗原優(yōu)勢區(qū)的抗原構(gòu)成,引起的保護性免疫應(yīng)答集中。但在體內(nèi)滯留時間短,需采用佐劑[16]。結(jié)核分枝桿菌的免疫性保護抗原主要是分泌性蛋白,包括早期分泌 抗原靶-6(ESAT-6)、抗原 85 復(fù) 合 體(Ag85)、CFP10、MPT63、MPT64、熱 休 克 蛋 白 HSP65、HSP70等。ESAT-6、Ag85是一些早期分泌抗原蛋白。近期一項研究顯示以ESAT-6、Ag85和潛伏相關(guān)蛋白R2660C構(gòu)建的H56疫苗,無論是在暴露前還是暴露后的預(yù)防中都表現(xiàn)出了良好的免疫效果[17]。R2660C在感染的早期和晚期均表達。在3種暴露前預(yù)防的小鼠模型中,H56對晚期感染的抑制效果要優(yōu)于以ESAT-6、Ag85構(gòu)建的H1疫苗及BCG疫苗。在結(jié)核菌潛伏感染的2種小鼠模型中,暴露后的H56接種能夠顯著降低疾病復(fù)發(fā),并能顯著降低細(xì)菌負(fù)擔(dān)。(3)治療性結(jié)核病疫苗:將滅活疫苗作為輔助治療以縮短傳統(tǒng)的化學(xué)治療療程,目前該類疫苗包括母牛分枝桿菌疫苗、草分枝桿菌菌苗和結(jié)核分枝桿菌多糖核酸等。

      2006—2015年全球控制結(jié)核病計劃中疫苗研發(fā)的主要目標(biāo)是2010年有2個疫苗進入臨床試驗,2015年有一個安全有效的新型疫苗上市。

      截止到2010年,已經(jīng)有14個疫苗進入臨床試驗(表1),有6個結(jié)核病候選疫苗在臨床前試驗階段,還有33個新一代候選疫苗在研發(fā)早期。

      結(jié)核病疫苗的研發(fā)面臨著許多挑戰(zhàn)[16],如結(jié)核病疫苗的研發(fā)過程需要大量的資金投入,充實候選疫苗的產(chǎn)品線,同時建立大規(guī)模臨床試驗和生產(chǎn)能力,需要增強國家和社區(qū)對新型結(jié)核病疫苗需求的意識和支持等。

      抗結(jié)核藥物的研究

      目前臨床上使用的一線抗結(jié)核藥物主要有異煙肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、鏈霉素等,這些藥物多數(shù)是在40多年前問世的,最晚的利福平也是在1965年問世的。結(jié)核病的治療主要依賴化療,但近40多年沒有突破性新藥問世,結(jié)核病化療時間長,化療方案復(fù)雜,同時結(jié)核分枝桿菌與艾滋病病毒雙重感染,耐藥結(jié)核病的產(chǎn)生使當(dāng)前結(jié)核病防治陷入困境,亟需發(fā)展新的治療藥物。

      新型抗結(jié)核藥物工作組(The Working Group on New TB Drugs)制定的結(jié)核病藥物的研發(fā)目標(biāo)為:(1)縮短治療療程至2個月或更少;(2)有效地治療耐多藥結(jié)核??;(3)為結(jié)核菌潛伏感染者提供治療服務(wù)。

      目前處于臨床試驗階段的新型抗結(jié)核藥物包括[18]:一種是已經(jīng)作為一線或二線結(jié)核病的治療藥物,包括利福霉素類、氟喹諾酮類和嗯唑烷酮類,另一種是具有全新抗結(jié)核作用機制的藥物,包括硝基咪唑類、二芳基喹啉類、乙二胺四乙酸類和吡咯類。

      目前處在臨床試驗階段藥物的研發(fā)進程見表2。

      加替沙星和莫西沙星均屬于喹諾酮類藥物,目前正處于臨床Ⅲ期的評價階段。用于替換一線抗結(jié)核藥物乙胺丁醇(加替沙星和莫西沙星)或異煙肼(莫西沙星),療程從6~9個月可縮短為4個月。如果預(yù)期成功,提示這種方案將為縮短治療療程邁出重要一步[18]。OPC-67683和 PA-824均屬于硝基咪唑類藥物。PA-824目前正處于臨床Ⅱ期的研究

      階段。PA-824在體外抑制活性試驗中,對包括耐藥菌株在內(nèi)的多種結(jié)核分枝桿菌都表現(xiàn)出了較高的活性,它對目前臨床使用的其他抗結(jié)核病藥物沒有表現(xiàn)出交叉耐藥性,并對靜止期的結(jié)核分枝桿菌表現(xiàn)出了體外抑制活性,是一個很有潛力的結(jié)核病治療候選化合物[19]。TMC-207屬于二芳基喹啉類藥物,通過抑制ATP合成酶來發(fā)揮作用。SQ-109屬于乙二胺四乙酸類藥物,該化合物通過抑制細(xì)胞壁的合成來發(fā)揮作用。LL3858屬于吡咯類藥物,目前該藥處于臨床Ⅰ期評價階段。

      表1 臨床試驗階段的疫苗

      表2 臨床試驗階段的藥物2006—2015年的研發(fā)進程[25]

      目前抗結(jié)核藥物的研發(fā)過程同樣也面臨著重要的挑戰(zhàn):新藥的研發(fā)成本投入非常高;臨床試驗耗時長;缺乏支持臨床Ⅱ和Ⅲ期結(jié)核病藥物試驗的合格生物標(biāo)記,也將使研發(fā)項目耗時較長、費用昂貴[18]。

      結(jié)核病新型實驗室診斷方法的研究

      結(jié)核病的早期、特異性的診斷是控制結(jié)核病死亡率的重要前提之一。結(jié)核病的實驗診斷的常規(guī)方法主要是痰涂片和痰培養(yǎng)。痰涂片鏡檢操作方便、廉價,但是陽性率較低,僅為30%~50%,其檢出靈敏度為104~105/L,屬于低靈敏度的方法[8]。熒光顯微鏡可以提高鏡檢的靈敏度,但是價格高,不適合基層使用。發(fā)光二極管(light-emitting diode,LED)顯微鏡價格優(yōu)于現(xiàn)在的熒光顯微鏡,壽命長。Meta分析顯示:LED顯微鏡的靈敏度比傳統(tǒng)鏡檢方法高約10%[20]。同時該方法費用低,可廣泛推廣使用。

      痰培養(yǎng)是診斷結(jié)核病的金標(biāo)準(zhǔn),目前使用的培養(yǎng)基主要是固體羅氏培養(yǎng)基,需要4~6周的培養(yǎng)才能檢測到細(xì)菌的生長,對患者的早期診斷非常不利。目前采用液體培養(yǎng)的方法陽性率高于固體培養(yǎng)約10%~20%,同時較固體培養(yǎng)縮短了2~3周。我國熊禮寬等[21]曾報道,分枝桿菌變色液體培養(yǎng)基陽性率高,污染率低,檢出時間快。WHO推薦采用液體培養(yǎng)的方法用于艾滋病病毒感染者和病人合并肺結(jié)核的診斷。但是我國尚未全面推廣使用,只是在部分地區(qū)開展試點工作。

      隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,分子生物學(xué)的檢測技術(shù)應(yīng)用越來越廣泛。目前分子生物學(xué)技術(shù)的檢測方法包括DNA探針技術(shù)、聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)技術(shù)、DNA指紋圖譜、DNA序列測定、DNA芯片技術(shù)等。其中PCR技術(shù)靈敏度在4%~80%之間波動,特異度為80%~100%[22]。該方法操作不嚴(yán)格易出現(xiàn)假陽性與假陰性。WHO目前推薦一種Cepheid Xpert的實驗室診斷方法,該種方法是一種全自動核酸擴增試驗,采用封閉的系統(tǒng),2h即可獲得結(jié)果,采用該檢測方法可使耐藥結(jié)核病患者的診斷陽性率提高3倍,在結(jié)核病和艾滋病高流行地區(qū)的確診的TB/HIV患者數(shù)翻倍[23]。對5個檢測點(秘魯、阿塞拜疆、南非2個,印度)的1462例結(jié)核病的疑似患者進行檢測[24],敏感度達到了97.6%(95%CI:96.2%~98.5%),特異度達到了98.0%(95%CI:96.6%~98.9%)[23]。但是由于該方法比較昂貴,限制了其在許多國家的推廣使用。

      據(jù)估計全球結(jié)核病患者中1/2由潛伏感染者發(fā)展而來,結(jié)核菌感染者的早期診斷同樣是控制結(jié)核病的一項重要措施。目前各國致力于從結(jié)核分枝桿菌分離出的特異性抗原作為診斷試劑來識別結(jié)核分枝桿菌的早期感染。近年來,γ-干擾素(γ-IFN)釋放試驗(interferon-γrelease assays,IGRA)作為一種新型診斷結(jié)核感染的免疫學(xué)方法得到了越來越廣泛的應(yīng)用。該方法的設(shè)計原理是利用結(jié)核分枝桿菌特異性抗原會刺激致敏的淋巴細(xì)胞釋放γ-IFN,利用酶聯(lián)免疫吸附(ELISA)/酶聯(lián)免疫斑點(ELISPOT)進行的γ-IFN的檢測。ELISA檢測抗原刺激后γ-IFN的含量,ELISPOT檢測抗原刺激后產(chǎn)生γ-IFN的外周血單個核細(xì)胞數(shù),根據(jù)斑點的數(shù)量來確定細(xì)胞分泌細(xì)胞因子的情況。從單細(xì)胞水平評價細(xì)胞免疫應(yīng)答功能,從而判斷結(jié)核分枝桿菌感染的情況。目前全血ELISA商品化的試劑盒有澳大利亞Cellestis公司的Quanti FERON-TB Gold(QFT-G)和 QuantiFERON-TB Gold In Tube(QFT-IT)。ELISPOT商品化的試劑盒是英國牛津公司的T-SPOT TB。

      聯(lián)合國的千年發(fā)展目標(biāo)為到2015年結(jié)核病的發(fā)病率停止上升并逐漸下降;遏制結(jié)核病伙伴制定的相應(yīng)的目標(biāo)為到2015年,結(jié)核病患病率和死亡率在1990年基線上降低50%;到2050年,消除作為公共衛(wèi)生問題的結(jié)核病。世界各國目前正朝著這個方向積極努力,希望隨著各國政府承諾的增強,經(jīng)費投入的增加,在結(jié)核病的診斷、治療、預(yù)防等各個方面在未來都能取得突破,最終真正的實現(xiàn)一個無結(jié)核病世界的美好愿景。

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