全國種豬遺傳評估中心2011年第二次遺傳評估報告

為了更好地貫徹落實 《全國生豬遺傳改良計劃 （2009-2020年）》，按照農(nóng)業(yè)部辦公廳印發(fā)的 《全國生豬遺傳改良計劃 （2009-2020年）實施方案》的要求，推進(jìn)全國種豬性能測定和遺傳評估，加快遺傳改良的進(jìn)展，提高我國種豬的整體質(zhì)量，全國種豬遺傳評估中心根據(jù)24家國家生豬核心育種場上報到“全國種豬遺傳評估信息網(wǎng)”的性能測定數(shù)據(jù)，進(jìn)行了遺傳評估?，F(xiàn)對數(shù)據(jù)情況、評估結(jié)果予以公布和說明。

一、數(shù)據(jù)來源

本次分析數(shù)據(jù)來自24家國家生豬核心育種場于2011年8月12日前 （含8月12日）上報至 “全國種豬遺傳評估信息網(wǎng)”的性能測定數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)范圍2006-2011年，涉及杜洛克、大白和長白3個品種。

二、遺傳評估模型

1.育種值估計

根據(jù) 《全國種豬遺傳評估方案 （牧站 （種） [2000]60號）》， 采用多性狀動物模型最佳線性無偏預(yù)測 （MTBLUP）方法估計達(dá)100kg體重日齡、背膘厚和總產(chǎn)仔數(shù)3個性狀的育種值。具體如下：

（1）達(dá)100kg體重日齡和背膘厚

達(dá)100kg體重日齡或背膘厚觀察值=總平均數(shù)+場年季性別固定效應(yīng)+窩隨機(jī)效應(yīng)+個體隨機(jī)遺傳效應(yīng) +隨機(jī)剩余效應(yīng)

（2）總產(chǎn)仔數(shù)

總產(chǎn)仔數(shù)觀察值 =總平均數(shù)+場年季固定效應(yīng)+母豬出生的窩效應(yīng)+個體隨機(jī)遺傳效應(yīng)+母豬永久環(huán)境效應(yīng)+隨機(jī)剩余效應(yīng)

2.父系指數(shù)和母系指數(shù)

?

根據(jù)達(dá)100kg體重日齡、背膘厚和總產(chǎn)仔數(shù)三個性狀的估計育種值，分別計算杜洛克、長白和大白三個品種的父系指數(shù)和母系指數(shù)，其中父系指數(shù)包括達(dá)100kg日齡和背膘厚2個性狀，母系指數(shù)包括達(dá)100kg日齡、背膘厚和總產(chǎn)仔數(shù)3個性狀。

(1）杜洛克

父系指數(shù)=100-4.21AGE-17.1BF，母系指數(shù)=100-3.16AGE-12.85BF+43.4NB

(2)長白

父系指數(shù)=100-3.62AGE-14.7BF，母系指數(shù)=100-2.5AGE-10.17BF+34.33NB

(3)大白

父系指數(shù)=100-3.79AGE-15.4BF，母系指數(shù)=100-2.54AGE-10.33BF+34.88NB

其中，AGE：達(dá) 100kg體重日齡的育種值，BF：背膘厚的育種值，NB：總產(chǎn)仔數(shù)的育種值。

3.分場計算育種值和選擇指數(shù)

由于各豬場之間的場間遺傳關(guān)聯(lián)不大，不適合進(jìn)行聯(lián)合遺傳評估，因此本次遺傳評估分開計算各豬場的育種值和選擇指數(shù)，各豬場之間的結(jié)果和排名沒有可比性。

三、性能測定數(shù)據(jù)總體情況

根據(jù)2011年8月12日前各核心場上傳至 “全國種豬遺傳評估信息網(wǎng)”的數(shù)據(jù)，統(tǒng)計了24家國家生豬核心育種場從2006-2011年的測定數(shù)據(jù)總體情況（如表1所示），各核心場數(shù)據(jù)統(tǒng)計見附錄。

四、育種值結(jié)果

根據(jù)父系指數(shù)或母系指數(shù)分別列出各豬場公豬前25名和母豬前50名的個體，其中杜洛克根據(jù)父系指數(shù)排序，大白和長白，根據(jù)母系指數(shù)排序。具體結(jié)果詳見附表7。

五、場間關(guān)聯(lián)率

用2006年到2011年8月，24家國家生豬核心育種場，杜洛克、長白和大白豬達(dá)100kg體重日齡的測定記錄，根據(jù)場效應(yīng)的相關(guān)系數(shù)來度量場間關(guān)聯(lián)程度，即關(guān)聯(lián)率 （connectednessrating，CR）的方法，進(jìn)行長白豬和大白豬場間關(guān)聯(lián)度的計算，評價種豬場間的遺傳聯(lián)系程度。三個品種各豬場間的關(guān)聯(lián)率及各場的平均關(guān)聯(lián)率見附表1到附表6。

總體而言，相互有關(guān)聯(lián)的場比較少，有關(guān)聯(lián)的場之間的關(guān)聯(lián)率還比較低。