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      5-氟尿嘧啶與Mg2+配位選擇性的理論研究

      2010-11-30 13:44:04孫建武
      唐山師范學(xué)院學(xué)報 2010年5期
      關(guān)鍵詞:雜化氟尿嘧啶唐山

      和 芹,周 莉,孫建武

      (1.唐山師范學(xué)院 化學(xué)系,河北 唐山 063000;2.河北省定州中學(xué),河北 定州 073000;3.河北省唐山市開灤一中,河北 唐山 063000)

      ?化學(xué)研究?

      5-氟尿嘧啶與Mg2+配位選擇性的理論研究

      和 芹1,周 莉2,孫建武3

      (1.唐山師范學(xué)院 化學(xué)系,河北 唐山 063000;2.河北省定州中學(xué),河北 定州 073000;3.河北省唐山市開灤一中,河北 唐山 063000)

      在B3LYP/6-31G(d,p)、B3LYP/6-311G(d,p)水平上對5-氟尿嘧啶(5-FU)與Mg2+配合物幾何結(jié)構(gòu)、穩(wěn)定性進行研究,計算結(jié)果顯示5-FU···Mg2+(F12O6)配合物穩(wěn)定性更高,NBO分析表明O6、O9與F12位點孤對電子雜化方式不同,與Mg2+作用也存在一定差異。

      B3LYP;5-氟尿嘧啶;Mg2+;NBO

      5-氟尿嘧啶(5-FU)能抑制胸腺嘧啶核苷酸合成酶的作用,干擾DNA的合成,是臨床上常用的抗腫瘤藥物之一,因此一直是理論與實驗研究的熱點[1-5]。張貴珠等[1]研究發(fā)現(xiàn)金屬離子配位的5-FU更易于達到癌細胞靶分子,且抗癌活性顯著增強,因此研究5-FU與金屬離子的相互作用對于了解藥物在體內(nèi)的存在和運輸形式,進而了解其高效抗癌機理具有重要意義。盡管如此,關(guān)于5-FU與金屬離子作用的理論研究至今仍未見報道,因此當(dāng)前研究尤為必要。Mg2+是生物體內(nèi)含量最豐富的金屬離子,本文選取5-FU···Mg2+為研究體系,在分子水平上研究5-FU對金屬離子的配位選擇性。

      1 計算方法

      B3LYP方法在金屬離子配合物計算時非常可靠[6-8],因此為研究基組大小對體系的影響,在B3LYP/6-311G(d,p)水平上全優(yōu)化,頻率分析表明所有結(jié)構(gòu)均為穩(wěn)定結(jié)構(gòu),全部計算由GAUSSIAN03[9]程序完成,NBO分析由NBO5.0[10]完成。

      2 結(jié)果與討論

      2.1 幾何結(jié)構(gòu)

      為尋找5-FU合適配位點,在B3LYP/6-311G(d,p)水平上做靜電勢,所得靜電勢3D圖如圖1(d)所示。由圖1(d)可知O6位點靜電勢最負(fù),O9位點次之,而F12位點靜電勢最低,因此,合適的配位位點為O6,其次為O9,F(xiàn)12最差。由單體與配合物幾何結(jié)構(gòu)圖可以看到,Mg2+-F12鍵長為2.076,明顯高于Mg2+-O6與Mg2+-O9(分別為1.905、1.818?),因此可以推斷前者配位作用最弱。另外,由于在5-FU···Mg2+(F12O6)配合物中Mg2+同時與F12、O6配位,在幾何結(jié)構(gòu)上需滿足一定的拓?fù)潢P(guān)系;另一方面,5-FU···Mg2+(O9)配合物中Mg2+明顯偏離配位平面,因此,此時不能由簡單的鍵長數(shù)據(jù)判斷Mg2+-O6與Mg2+-O9鍵強弱,具體判斷方法見NBO分析。

      2.2 能量分析

      B3LYP/6-31G(d,p)與B3LYP/6-311G(d,p)水平上計算穩(wěn)定化能列于表1。由表1可知,B3LYP/6-31G(d,p)與B3LYP/6-311G(d,p)水平上計算O6F12位點配合物穩(wěn)定化能絕對值更高,分別高于O9位點配合物102.0、89.0kJ/mol,因此可以推斷金屬離子更易與前者配位。另一方面,由表1數(shù)據(jù)可知基組水平對穩(wěn)定化能存在顯著影響,例如對于O6F12位點配合物,在B3LYP/6-31G(d,p)水平上計算穩(wěn)定化能較B3LYP/6-311G(d,p)水平低32.6kJ/mol,因此為得到更準(zhǔn)確的穩(wěn)定化能,有必要使用大基組。

      表1 配合物穩(wěn)定化能(單位kJ/mol)

      2.3 NBO分析

      表2 B3LYP/6-311G(d,p)水平上NBO分析

      給體孤對電子轉(zhuǎn)移到受體反鍵軌道有關(guān)的二階微擾能E(2)列于表2。由表2可以看到,Mg2+與O6位點作用最強,二階微擾能最高,為150.3 kJ/mol,與O9位點作用次之(133.5 kJ/mol),與F12位點作用最弱。另外,由表2與圖2可以看到,O6本身的兩孤對電子并不等價,其能量和對稱性都不相同。通過NBO計算,可知O6的3對孤對電子LP(1)O6、LP(2)O6與LP(3)O6雜化方式分別為sp0.72、sp24.78與sp1.00。LP(1)O6、LP(3)O6雜化軌道與金屬離子孤對電子反鍵軌道LP*Mg2+作用相似,LP(1)O6、LP(3)O6雜化軌道p成分分別占41.8%、50%,與LP*Mg2+從側(cè)面發(fā)生軌道作用(如圖2所示),作用較弱,因此對應(yīng)二階微擾能均較低,分別為26.5,24.7kJ/mol;而LP(2)O6雜化軌道p軌道成分占96.1%,更接近p軌道性質(zhì),與LP*Mg2+軌道作用則是“頭碰頭”,在該作用方向上排斥作用最小,因此對應(yīng)二階微擾能明顯較高,為99.1 kJ/mol。其它配位鍵作用類似,不再累述。

      圖2 B3LYP/6-311G(d,p)水平上配合物軌道作用3D圖

      3 結(jié)論

      在B3LYP/6-31G(d,p)、B3LYP/6-311G(d,p)水平上對5-氟尿嘧啶與金屬離子Mg2+所得配合物幾何結(jié)構(gòu)、穩(wěn)定性等進行研究。計算結(jié)果表明:

      (1)Mg2+與F12O6位點作用所得配合物穩(wěn)定性更高,為主要作用方式。

      (2)5-氟尿嘧啶配位位點O6、O9與F12的三孤對電子雜化方式不同,與Mg2+作用也存在一定差異,在二階微擾能及軌道作用3D圖上均有所體現(xiàn)。

      [1] 盧繼新,張貴珠,王月梅.金屬離子存在下5-氟尿嘧啶與脫氧核糖核酸、血清白蛋白的相互作用[J].分析化學(xué)研究簡報,2001,29(2):192-194.

      [2] 葛存旺,王南平,顧寧.DNA與5-氟尿嘧啶相互作用的電化學(xué)和譜學(xué)研究[J].化學(xué)學(xué)報,2006,64(17):1837-1842.

      [3] 卓仁禧,范昌烈,趙儒林.含5-氟尿嘧啶的氨基酸衍生物的合成及其抗腫瘤活性研究[J].高等學(xué)?;瘜W(xué)學(xué)報,1986, 7(6):508-512.

      [4] 和芹,霍愛新,孟祥軍,楊靜.Theoretical Study on Hydrogen Interaction between 5-Fluorouracil and Glycine[J].結(jié)構(gòu)化學(xué),2010,29(5):738-746.

      [5] 趙儒林.5-氟尿嘧啶酯類衍生物的合成及其腫瘤活性研究[J].高等學(xué)校化學(xué)學(xué)報,1989,10(6):605-608.

      [6] 和芹,王克誠,周立新.甘氨酸與二價金屬離子相互作用的理論研究[J].南開大學(xué)學(xué)報,2007,40(4):36-41.

      [7] 章志強,周立新,和芹. Interaction of Cisplatin Adducts with Guanine Tautomers: A Theoretical Study of Metalated Tautomeric Forms [J].中國化學(xué),2005,23(10):1327-1332

      [8] 和芹,周立新.鉑配合物與DNA堿基對間相互作用的理論研究[J].物理化學(xué)學(xué)報,2005,21(8):846-851.

      [9] Frisch, M. J.; Trucks, G.. W.; Schlegel, H. B. et al GAUSSIAN 03; Revision E. 01; Gaussian; Inc.; Pittsburgh PA 2003

      [10] Glendening, E. D.; Badenhoop, J. K.; Reed, A. E.; et al. Nature bond orbital program. Version 5.0. Madison, WI:Theoretical Chemistry Institute, University of Wisconsin, 2001.

      (責(zé)任編輯、校對:琚行松)

      Theoretical Study of the Interaction between 5-Fluorouracil and Mg2+

      HE Qin1, ZHOU Li2, SUN Jian Wu3

      (1. Department of Chemistry, Tangshan Teachers College, Tangshan 063000, China; 2. Hebei Dingzhou Middle School, Dingzhou 073000, China; 3. No.1 Middle School of Kai Luan, Tangshan 063000, China)

      The geometries and stabilities of dimers formed with 5-fluorouracil (5-FU) and Mg2+were studied at the level of B3LYP/6-31G(d,p) and B3LYP/6-311G(d,p). The results showed that 5-FU···Mg2+(F12O6) should be more stable, the NBO analysis suggested that hybrization of the lone pair of O6 and O9, as well as F12 should be more differently, thus interacted with Mg2+differently.

      B3LYP; 5-fluorouracil; Mg2+; NBO

      唐山師范學(xué)院發(fā)展基金資助項目(07C22)

      2010-06-02

      和芹(1978-),女,河北保定人,碩士,唐山師范學(xué)院化學(xué)系講師,研究方向為應(yīng)用量子化。

      O641

      A

      1009-9115(2010)05-0001-03

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