李娜,覃磊,嚴(yán)佳文,陳佩,鄧子牛*
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 園藝園林學(xué)院,湖南 長沙 410128; 2.湖南省作物種質(zhì)創(chuàng)新與資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖南 長沙 410128)
柑橘葉片中蛋白質(zhì)含量低,所含有的鹽、有機(jī)酸、色素、酚、多糖等物質(zhì)干擾蛋白質(zhì)樣品的制備.柑橘潰瘍?。–itrusbacterial canker disease)是一種世界性的檢疫性病害,病原基因pthA是致病所必需的因子[1].筆者前期以柑橘潰瘍病致病基因pthA為出發(fā)點(diǎn),利用病原基因誘導(dǎo)植物獲得抗性原理,已將致病基因pthA的核定位信號NLSs導(dǎo)入感病甜橙中.筆者研究柑橘葉片蛋白質(zhì)的提取,旨在建立一套適合SDS-PAGE電泳、質(zhì)譜分析和Western blot的蛋白質(zhì)提取方法;對柑橘潰瘍病致病基因pthA誘導(dǎo)表達(dá)的PthA進(jìn)行Western blot分析,將致病基因pthA導(dǎo)入甜橙中,使表達(dá)蛋白質(zhì)具有免疫反應(yīng)活性,為PthA抗病機(jī)理的研究提供理論基礎(chǔ).
供試材料為普通糖橙、普通冰糖橙、轉(zhuǎn)pthA-nls基因糖橙和轉(zhuǎn)pthA-nls基因冰糖橙的葉片,均采自國家柑橘改良中心長沙分中心溫室.抗PthA-NLS多肽單克隆抗體由湖南省作物種質(zhì)創(chuàng)新與資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存;Bradford蛋白質(zhì)定量試劑盒購自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司;辣根過氧化物酶標(biāo)記羊抗鼠抗體、增強(qiáng)型辣根過氧化物酶底物顯色試劑盒(HRP-DAB)購自天根生化科技北京有限公司.勻漿機(jī)為德國IKA公司生產(chǎn)的T10,電泳設(shè)備為美國GE公司生產(chǎn),轉(zhuǎn)印設(shè)備為美國伯樂公司生產(chǎn).MALDI TOF/TOF質(zhì)譜儀及相關(guān)軟件均為德國布魯克·道爾頓公司生產(chǎn).
1.2.1 柑橘葉片蛋白質(zhì)的提取
(1) 用改良PBS法提?。簩en等[2]報(bào)道的方法進(jìn)行優(yōu)化.取葉片約0.5 g,洗凈,加入液氮研磨成粉末后加入10 mL離心管中,立即加入3 mL PBS (NaCl 137 mmoL/L,KCl 2.7 mmoL/L,Na2HPO410 mmoL/L,KH2PO41.76 mmoL/L,pH 7.4),混勻,在冰水混合物中勻漿,離心(9 500 g,15 min,4 ℃),取上清液,超聲破碎(開8 s,停5 s,共3 min),離心(12 000g,15 min,4 ℃),取上清液.
(2) 用Tris-HCl法[3-5]提?。?/p>
(3) 用三氯乙酸-丙酮法[6-7]提?。?/p>
1.2.2 蛋白質(zhì)含量的測定
用Bradford蛋白質(zhì)定量試劑盒進(jìn)行定量,含考馬斯亮蘭G-250染色液和牛血清白蛋白(BSA)標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)溶液,測定595 nm波長下的吸光值,以不含BSA的樣品為空白對照,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算樣品中蛋白質(zhì)的含量.
1.2.3 鈉十二烷基的硫酸鹽聚丙烯酰胺凝膠電泳
12%分離膠及5%濃縮膠制備參照文獻(xiàn)[8].將樣品置于5×凝膠加樣緩沖液中,100 ℃加熱5 min,以使蛋白質(zhì)變性.等量加樣,重復(fù),同時(shí)200 V等壓SDS-PAGE電泳.電泳結(jié)束后另一塊膠考馬斯亮蘭染色(0.1%考馬斯亮蘭R-250,50%甲醇,10%冰醋酸,40%蒸餾水)1 h,脫色(5%甲醇,7%冰醋酸,88%蒸餾水)2 h.膠片燈上觀察,拍照.
1.2.4 質(zhì)譜鑒定
用 MALDI TOF/TOF 進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過Mascot查詢NCBI 數(shù)據(jù)庫,如果Mascot 分?jǐn)?shù)高于66分(P< 0.05) 則認(rèn)為得到陽性鑒定,分?jǐn)?shù)越大匹配程度越高,否則視為未得到鑒定.將凝膠上的蛋白質(zhì)條帶切下,膠內(nèi)酶解,將酶解產(chǎn)物濃縮后點(diǎn)于Anchorchip 樣品靶上,與 α-氰基-4-羥基肉桂酸(CHCA) 共結(jié)晶,室溫干燥后,用MALDI TOF/TOF進(jìn)行鑒定,獲得的質(zhì)譜圖經(jīng)軟件Flex Analysis 3.0分析后,用Biotools 3.0 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)庫搜索.
1.2.5 潰瘍病PthA蛋白質(zhì)的Western blot分析
從轉(zhuǎn)pthA-nls基因冰糖橙、轉(zhuǎn)pthA-nls基因糖橙和未轉(zhuǎn)化普通冰糖橙、普通糖橙葉片中提取可溶性總蛋白質(zhì),經(jīng)SDS-PAGE電泳,電轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜進(jìn)行Western印跡雜交.將凝膠、濾紙、0.45 μL硝酸纖維素膜(NC)置于盛有電泳轉(zhuǎn)移緩沖液的容器中,浸泡15 min后,恒壓100 V在1 L含20%甲醛電極緩沖液中轉(zhuǎn)移90 min,將NC膜置于封閉液中封閉.漂洗,加入相應(yīng)的抗PthA-NLS多肽單克隆抗體(1∶1 000稀釋)[9-10]孵育,洗滌.加入辣根過氧化物酶標(biāo)記羊抗鼠抗體,室溫下于搖床孵育,洗滌,用HRP-DAB試劑盒在室溫下染色8 min,顯色后拍照.
利用三氯乙酸-丙酮法、Tris-HCl提取法、改良的PBS法對0.5 g柑橘葉片進(jìn)行了蛋白質(zhì)提取,并對得到的蛋白質(zhì)液的濃度、體積、技術(shù)繁瑣程度進(jìn)行比較(表1).
表 1 不同方法提取柑橘葉片蛋白質(zhì)的效果Table 1 Results comparison in different protein extraction methods
從表1可以看出,3種方法提取的蛋白質(zhì)效果及電泳結(jié)果差異較大,其中以改良PBS法的效果最好.用該方法提取的蛋白質(zhì)液濃度較高,量多,能滿足平行試驗(yàn)需要,而且技術(shù)操作簡單,費(fèi)時(shí)少,所需試劑少,成本低,所用試劑比使用丙酮、三氯乙酸等有機(jī)溶劑環(huán)保、無公害,有利于試驗(yàn)操作者的身體健康.
圖1結(jié)果表明,1~2泳道帶型模糊,蛋白質(zhì)濃度低;3~4泳道背景較深,蛋白質(zhì)濃度較低;5~8泳道帶型清晰可見.
圖 1 不同方法提取蛋白質(zhì)的SDS-PAGE電泳結(jié)果Fig.1 SDS-PAGE results of different extraction methods
在鑒定的2個(gè)特異性蛋白質(zhì)條帶中,Mascot得分分別為400和177,說明結(jié)果準(zhǔn)確可靠.鑒定結(jié)果見表2,與已報(bào)道的柑橘屬已知蛋白質(zhì)匹配,表明經(jīng)SDS-PAGE電泳分離的目的蛋白質(zhì)已達(dá)到質(zhì)譜對樣品的要求.
表 2 蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定結(jié)果Table 2 Proteins identified by MALDⅠ TOF/TOF
圖2結(jié)果表明,轉(zhuǎn)pthA-nls基因冰糖橙、轉(zhuǎn)pthA-nls基因糖橙在相對分子質(zhì)量48 000處呈陽性免疫性反應(yīng),與陽性對照(PthA重組蛋白質(zhì))一致,而未轉(zhuǎn)化普通冰糖橙、普通糖橙無條帶,說明pthA-nls基因已整合進(jìn)甜橙基因組并獲得表達(dá),表達(dá)蛋白質(zhì)具有免疫反應(yīng)活性.
圖2 潰瘍病PthA蛋白質(zhì)的Western blot分析結(jié)果Fig.2 Western blot results of transgenic pthA-nls plants
提取的蛋白質(zhì)質(zhì)量直接關(guān)系到Western blot及后續(xù)其他蛋白質(zhì)組學(xué)試驗(yàn)的成?。畟鹘y(tǒng)的三氯乙酸-丙酮法[11]是很有效的蛋白質(zhì)沉淀方法,能夠消除瞬時(shí)的蛋白質(zhì)水解作用和其他蛋白質(zhì)酶的修飾,其最大的缺點(diǎn)是蛋白質(zhì)很難重新溶解,步驟較繁瑣,耗時(shí)較多.Tris-HCl提取法經(jīng)丙酮反復(fù)清洗,雖能較好地脫去鹽離子[12],但損失較大,所得蛋白質(zhì)條帶數(shù)少.改良PBS法在試驗(yàn)中加以超聲波處理,使混合液均勻,大大增加了與提取液的接觸面積[13],進(jìn)而提高了蛋白質(zhì)樣品的質(zhì)量.該技術(shù)操作簡單,適合柑橘葉片蛋白質(zhì)的提取,且提取的蛋白質(zhì)經(jīng)SDS-PAGE電泳可得到帶型清晰、表達(dá)量較高的目的條帶,并可直接用于質(zhì)譜鑒定.
柑橘潰瘍病致病基因pthA是亞洲型(A型)病菌引發(fā)病癥所必需的因子.pthA基因位于柑橘潰瘍病菌大質(zhì)粒上,Swarup[14]在1991年克隆得到pthA基因全長,共有4 275 bp,編碼1 163個(gè)氨基酸殘基,其中核定位信號區(qū)(NLSS)是致病基因pthA的重要功能區(qū)和識別定位于寄主細(xì)胞的關(guān)鍵部位.點(diǎn)突變核定位信號區(qū)不能對柑橘誘發(fā)潰瘍病,但對非寄主植物土豆能誘發(fā)病癥,說明核定位信號是柑橘潰瘍病的致病關(guān)鍵因素,阻止其發(fā)揮功能,就有可能實(shí)現(xiàn)抗?。捌谝褜thA-nls基因轉(zhuǎn)入感病品種糖橙和冰糖橙中,希望阻斷其致病途徑,從而實(shí)現(xiàn)抗病;或者使致病基因pthA的核定位信號NLSs在甜橙中過量表達(dá),使原有致病蛋白質(zhì)失去功能,或表達(dá)蛋白質(zhì)失去原有的時(shí)空性,或表達(dá)蛋白質(zhì)激活甜橙本身的防御系統(tǒng),從而干擾病原菌的正常生理代謝,以致轉(zhuǎn)基因甜橙表現(xiàn)出抗性.本研究結(jié)果證實(shí)了pthA-nls基因已整合進(jìn)甜橙基因組并獲得表達(dá),表達(dá)蛋白質(zhì)具有免疫反應(yīng)活性,為進(jìn)一步研究PthA的抗病機(jī)理奠定了基礎(chǔ).
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英文編輯:羅文翠