將140年的計(jì)算量縮短為1天完成

張偉

H1N1型流感病毒正在多個國家肆虐,確診患者數(shù)目的每一個變化都牽動著全球數(shù)十億人民的心。醫(yī)療研究人員正積極尋找治療流感新藥,但這些藥品研究需要的計(jì)算量非常龐大,可能要花上相當(dāng)長時間。IBM全球網(wǎng)格大同盟(WCG)近日與美國德州大學(xué)醫(yī)學(xué)院啟動了“研究流感病毒計(jì)劃”的實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目,可極大加速新的抗流感藥物的研制進(jìn)度。

WCG利用成熟的網(wǎng)格技術(shù)可使用海量的志愿注冊設(shè)備的閑置計(jì)算資源,進(jìn)行虛擬化學(xué)實(shí)驗(yàn),確定幾百萬小分子中哪些可以附著到流感病毒上并阻止其傳播。目前,全世界已經(jīng)有45萬志愿者加入WCG,注冊計(jì)算機(jī)超過120萬臺。據(jù)統(tǒng)計(jì),WCG整合所有注冊設(shè)備的計(jì)算資源,平均每個日歷日期運(yùn)行的時間相當(dāng)于140多年。

德州大學(xué)醫(yī)學(xué)院副教授兼研究組長Stan Watowich博士說:“由于在IBM全球網(wǎng)格大同盟上進(jìn)行抗登革藥項(xiàng)目,獲得了很多寶貴經(jīng)驗(yàn),我們有望在不到一個月的時間里找到新的抗流感藥并進(jìn)行測試?！?/p>

“現(xiàn)在,任何擁有可以上網(wǎng)電腦的人都可以為解決這一關(guān)鍵的健康隱患問題提供解決方案。”IBM大中華區(qū)公眾事業(yè)合作部總經(jīng)理郭維德表示。任何機(jī)構(gòu)或個人均可為該項(xiàng)目志愿貢獻(xiàn)自己電腦閑置的計(jì)算能力。志愿者注冊后,在電腦上安裝一個免費(fèi)、安全、無侵害性的軟件程序。WCG把研究任務(wù)分割成不計(jì)其數(shù)的可同時處理的微型片斷,自動分配給各個志愿者。當(dāng)志愿者電腦待機(jī)或計(jì)算負(fù)載較低時,該軟件就會從WCG的服務(wù)器請求數(shù)據(jù),并使用這些數(shù)據(jù)進(jìn)行藥物探索計(jì)算,完成后把結(jié)果反饋給服務(wù)器,再請求新任務(wù)。據(jù)IBM大中華區(qū)公眾事業(yè)合作部項(xiàng)目經(jīng)理張紅捷介紹,由于代理軟件占用的資源十分有限,因此不會影響計(jì)算機(jī)的運(yùn)行速度,而且它的安全性十分有保障,志愿者無需顧慮?！把芯苛鞲胁《居?jì)劃”一開始,IBM中國公司就號召全體員工及業(yè)務(wù)合作伙伴單位加入WCG的項(xiàng)目,短短兩天內(nèi)就有數(shù)百位人員加入該計(jì)劃,且還在增長中。

WCG項(xiàng)目啟動于2004年11月,已經(jīng)或者正在進(jìn)行的研究項(xiàng)目包括:全球營養(yǎng)水稻、非洲氣候研究、幫助征服癌癥、對抗艾滋病、聯(lián)手尋找治療登革熱藥物等項(xiàng)目。今年WCG又增加了治療兒童癌癥、研究抗流感藥品、治療肌肉萎縮癥三個項(xiàng)目。目前共有13個項(xiàng)目在WCG上運(yùn)行。

WCG設(shè)有顧問委員會,由國際上從事健康科學(xué)、技術(shù)和慈善事業(yè)的專家組成,他們會對研究項(xiàng)目申請進(jìn)行審查。據(jù)張紅捷介紹,審查標(biāo)準(zhǔn)主要有兩條:第一,項(xiàng)目必須對人類有益,且為公益性質(zhì);第二,項(xiàng)目需要大量計(jì)算,而研究者本身沒有超級計(jì)算機(jī)或相應(yīng)的計(jì)算能力。網(wǎng)格計(jì)算雖然已經(jīng)是成熟的技術(shù)且有不少應(yīng)用,但WCG是全世界唯一一家完全公益且同時運(yùn)行多個研究項(xiàng)目的網(wǎng)格平臺。據(jù)悉,WCG網(wǎng)站上現(xiàn)在有5種語言版本,中文版于2008年6月底上線。目前為止,中國志愿者有3000多人,注冊計(jì)算機(jī)4500多臺。