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    大豆胞囊線蟲相關(guān)基因GmWRKY-3克隆及功能探究

    2024-12-05 00:00:00劉芳曲碩孫浩姜海鵬趙雪韓英鵬
    江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年23期
    關(guān)鍵詞:胞囊線蟲抗性

    摘要:大豆是世界四大糧食作物之一,與小麥、水稻和玉米并列。大豆胞囊線蟲(SCN,Heterodera glycines Ichinohe)是全球大豆最有害的病原體之一。利用大豆胞囊線蟲3號(hào)生理小種(SCN 3)、感病品種綏農(nóng)14、抗病品種東農(nóng)L10為材料,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,篩選出差異表達(dá)基因GmWRKY-3。為探究大豆GmWRKY-3基因的生物學(xué)功能及潛在用途,克隆GmWRKY-3基因,對(duì)GmWRKY-3基因的理化性質(zhì)、編碼的蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)以及系統(tǒng)進(jìn)化等生物信息學(xué)分析;構(gòu)建pCAMBIA1302-GmWRKY-3利用農(nóng)桿菌侵染煙草,并進(jìn)行亞細(xì)胞定位分析;構(gòu)建pCAMBIA3300-GmWRKY-3植物重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌K599后瞬時(shí)侵染大豆毛狀根,初步探究GmWRKY-3基因的功能。結(jié)果表明,GmWRKY-3基因編碼的蛋白分子量約為 24.93 ku,等電點(diǎn)為8.46,分子式為C1 086H1 722N312O343S9,不穩(wěn)定系數(shù)為67.73,屬于不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。二級(jí)結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主,三級(jí)結(jié)構(gòu)由1個(gè)α-螺旋和5個(gè)β-折疊組成;該基因含有多個(gè)光響應(yīng)元件和多種激素順式作用元件等。亞細(xì)胞定位結(jié)果表明,GmWRKY-3基因主要定位于細(xì)胞核。農(nóng)桿菌瞬時(shí)侵染大豆毛狀根結(jié)果表明,與pCAMBIA3300空載體轉(zhuǎn)基因植株相比,pCAMBIA3300-GmWRKY-3重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)基因受體植株東農(nóng)50中根部線蟲數(shù)量相對(duì)較少。上述結(jié)果表明,GmWRKY-3基因?qū)CN有一定的抵抗能力。

    關(guān)鍵詞:大豆;大豆胞囊線蟲;GmWRKY-3;亞細(xì)胞定位

    中圖分類號(hào):S435.651" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

    文章編號(hào):1002-1302(2024)23-0030-08

    劉" 芳,曲" 碩,孫浩文,等. 大豆胞囊線蟲相關(guān)基因GmWRKY-3克隆及功能探究[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2024,52(23):30-38.

    doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.23.004

    收稿日期:2023-10-18

    基金項(xiàng)目:黑龍江省重點(diǎn)基金(編號(hào):ZD2022C002);黑龍江省重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目(編號(hào):JD22A015);國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):U22A20473);國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)崗位體系項(xiàng)目(編號(hào):CARS-04-PS07);東北農(nóng)業(yè)大學(xué)科研項(xiàng)目(編號(hào):NEAU2023QNLJ-003)。

    作者簡(jiǎn)介:劉" 芳(2000—),女,黑龍江齊齊哈爾人,碩士研究生,主要從事大豆作物遺傳育種,E-mail:18846913802@139.com;共同第一作者:曲" 碩(1994—),男,吉林長(zhǎng)春人,博士研究生,主要從事大豆作物遺傳育種,E-mail:531140417@qq.com。

    通信作者:韓英鵬,博士,教授,博士生導(dǎo)師,主要從事大豆基因組學(xué)遺傳育種研究,E-mail:hyp234286@aliyun.com;趙" 雪,博士,研究員,博士生導(dǎo)師,主要從事大都基因組學(xué)和分子育種研究,E-mail:xuezhao@neau.edu.cn。

    大豆[Glycine max (Linn.) Merr.]原產(chǎn)于我國(guó),為豆科大豆屬一年生草本植物,是我國(guó)重要的糧食和油料作物[1]。生物脅迫是造成大豆減產(chǎn)的主要因素之一,其中大豆胞囊線蟲(SCN)病是大豆主要的病蟲害之一[2]。大豆胞囊線蟲在世界各地的大豆主產(chǎn)區(qū)均有廣泛分布,在我國(guó)首次發(fā)現(xiàn)于東北地區(qū)[3]。SCN平均每年造成的大豆產(chǎn)量損失為 10%~30%[4-6]。目前主要的防治措施為輪作和施用農(nóng)藥,但農(nóng)藥嚴(yán)重影響生態(tài)環(huán)境,因此提高大豆對(duì)SCN的抵抗能力迫在眉睫。

    大豆胞囊線蟲的生命周期為3~4周,分為3個(gè)主要階段,即卵期、幼蟲期和成蟲期,其中幼蟲期又可以分為4個(gè)階段(J1~J4)[7]。卵在胞囊內(nèi)形成,卵蛻皮進(jìn)入J1階段,J1階段蛻皮進(jìn)入蠕蟲狀的J2階段,J2階段是線蟲唯一具有侵害大豆根系能力的階段[8]。SCN通過表皮細(xì)胞侵染大豆根部,使其不能正常生長(zhǎng),進(jìn)而造成大豆減產(chǎn)。合胞體是SCN和大豆宿主之間的生物營(yíng)養(yǎng)界面,它的功能必須保持約3周的時(shí)間,線蟲才能通過J3、J4階段的生長(zhǎng)發(fā)育,形成成年雌性或雄性。雌性SCN的體內(nèi)攜帶幾百個(gè)卵,在根表皮生長(zhǎng),同時(shí)在根維管圓柱體上保持不斷擴(kuò)大的合胞體攝食位點(diǎn)。雄性SCN放棄合胞體,離開根部,遷移給雌性受精。受精的雌性SCN通常會(huì)釋放一些卵,這些卵會(huì)釋放后不久孵化,從而在同一生長(zhǎng)季節(jié)實(shí)現(xiàn)線蟲種群增加和植物損傷。但仍有幾百個(gè)卵通常保留在雌性體內(nèi),隨著雌性線蟲死亡,形成硬化的胞囊。目前大豆對(duì)SCN的主要抗性位點(diǎn)為Rhg1和Rhg4,伴隨著不同生理小種的突變和環(huán)境的變化,發(fā)現(xiàn)更多的抗性位點(diǎn)具有重要意義。

    WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物中最大的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子家族之一,是調(diào)節(jié)許多植物過程信號(hào)網(wǎng)的組成部分[9]。WRKY在植物中的表達(dá)量非常豐富,與植物的生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān),其中最主要的作用是調(diào)節(jié)植物的免疫與病原體發(fā)育。目前,距第1次發(fā)現(xiàn)該轉(zhuǎn)錄因子已超過20年。近些年關(guān)于WRKY的研究越來越廣泛,如在耐旱、耐鹽、抗病等方面都有所研究,且在煙草、馬鈴薯、擬南芥、水稻等植物中均已被鑒定和分析[10-13]。WRKY第1次是在甘薯中被鑒定出來的[14]。WRKY功能主要是由其結(jié)構(gòu)域決定的,長(zhǎng)度約為60個(gè)氨基酸殘基,WRKYGQK位于其N末端,其C端還具有鋅指結(jié)構(gòu)。

    WRKY基因在很多植物中都發(fā)揮著重要功能,但相關(guān)研究主要集中在擬南芥和一些其他作物中,而在大豆胞囊線蟲上的研究較為少見。楊雪梅等發(fā)現(xiàn),擬南芥WRKY51轉(zhuǎn)錄因子可以抑制RPW8.1啟動(dòng)子的活性,通過敲除該基因可以調(diào)控RPW8.1啟動(dòng)子的活性,從而影響植物對(duì)白粉病的抗性,說明WRKY51介導(dǎo)基本防御反應(yīng)[15]。Meher等在對(duì)稻瘟病抗性基因進(jìn)行研究時(shí)發(fā)現(xiàn),OsWRKY蛋白可與2個(gè)稻瘟病抗病基因Pi2和Pi54的啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合,對(duì)稻瘟病的發(fā)展具有重要意義[16]。劉麗麗等采用VIGS策略,沉默基因SlWRKY80,發(fā)現(xiàn)植株根部對(duì)線蟲的敏感性增強(qiáng),根結(jié)數(shù)量增多,植株病情指數(shù)由感病態(tài)變?yōu)楦吒袘B(tài),說明SlWRKY80可能作為正調(diào)控因子參與番茄對(duì)根結(jié)線蟲的抵抗[17]。Wang等在對(duì)柑橘的研究中發(fā)現(xiàn),CsWRKY33定位于細(xì)胞核,瞬時(shí)過表達(dá)CsWRKY33可顯著增強(qiáng)寄主對(duì)綠霉病的抗性[18]。通過過往的研究發(fā)現(xiàn),WRKY轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物抵抗逆境脅迫具有重要意義。

    目前,關(guān)于WRKY基因家族在SCN脅迫下發(fā)揮的功能和機(jī)制還沒有相關(guān)研究報(bào)道。因此對(duì)于抗SCN的研究提供了重要的基因資源。本研究利用大豆胞囊線蟲3號(hào)生理小種(SCN3)、感病品種綏農(nóng)14、抗病品種東農(nóng)L10為材料,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,篩選出差異表達(dá)基因GmWRKY-3,通過克隆GmWRKY-3基因,對(duì)GmWRKY-3基因編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行理化性質(zhì)和蛋白質(zhì)二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)分析以及系統(tǒng)進(jìn)化樹生物信息學(xué)分析。構(gòu)建pCAMBIA1302-GmWRKY-3重組質(zhì)粒進(jìn)行亞細(xì)胞定位分析,并構(gòu)建pCAMBIA3300-GmWRKY-3重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌K599,對(duì)大豆毛狀根進(jìn)行瞬時(shí)侵染,初步探究GmWRKY-3基因的功能。

    1" 材料與方法

    1.1" 試驗(yàn)材料

    本研究于2023年在東北農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆遺傳育種實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行。大豆感病品種綏農(nóng)14、東農(nóng)50和抗病品種東農(nóng)L10均來自東北農(nóng)業(yè)大學(xué)向陽基地(45.76°N,126.93°E)。大豆胞囊線蟲3號(hào)生理小種取自黑龍江省大慶市安達(dá)試驗(yàn)基地。具體鑒定方法參照文獻(xiàn)[19]。

    1.2" 試驗(yàn)方法

    1.2.1" GmWRKY-3基因克隆

    利用TRIzol法提取抗病大豆品種東農(nóng)L10 的mRNA,利用TOYOBO ReverTra Ace qPCR RT Master Mix with gDNA Remover試劑盒反轉(zhuǎn)錄合成 cDNA,置于-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.2" GmWRKY-3基因擴(kuò)增

    在Phytozome數(shù)據(jù)庫(kù)(https://phytozome-next.jgi.doe.gov/)中查找GmWRKY-3基因全長(zhǎng)序列,根據(jù)CDS序列設(shè)計(jì)引物(表1)。反應(yīng)體系為20 μL,其中上下游引物(10 μmol/L)各1 μL、模板2 μL、KOD ONE 10 μL、ddH2O 6 μL。反應(yīng)程序:98 ℃預(yù)變性3 min;98 ℃變性10 s,58 ℃退火5 s,68 ℃延伸5 s,35個(gè)循環(huán);68 ℃終延伸10 min。擴(kuò)增程序結(jié)束后,取4 μL PCR產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè)。

    1.2.3" GmWRKY-3基因亞細(xì)胞定位分析

    根據(jù)GmWRKY-3基因的CDS序列,選取pCAMBIA1302載體的NcoⅠ酶切位點(diǎn)側(cè)翼各15 bp同源序列進(jìn)行引物修飾,利用Primer 5設(shè)計(jì)基因亞細(xì)胞定位引物(表1)。以抗病品種東農(nóng)L10 的cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系同“1.2.2”節(jié)。參照南京諾唯贊生物科技股份有限公司的ClonExpress Ⅱ One Step Cloning Kit試劑盒的操作步驟,應(yīng)用同源重組技術(shù),將目的片段與酶切后的pCAMBIA1302載體進(jìn)行in-fusion連接,取GmWRKY-3-sub PCR擴(kuò)增產(chǎn)物1 μL、pCAMBIA1302載體 3 μL、5×Mix Buffer 4 μL、酶2 μL、ddH2O 10 μL 混勻,30 ℃連接30 min。將連接好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α中,經(jīng)菌落PCR擴(kuò)增及測(cè)序,確定已成功將GmWRKY-3連接入pCAMBIA1302載體。參照說明書,將pCAMBIA1302-GmWRKY-3轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌GV3101中,涂布于含有Kana抗性的LB固體培養(yǎng)基上,挑取的單菌落轉(zhuǎn)移至含有液體LB的2 mL EP管中,之后轉(zhuǎn)移至50 mL液體LB培養(yǎng)基中進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng);室溫收集菌體;使用MES重懸至D600 nm=1.0,室溫黑暗靜置2~3 h;注射至 4 周齡煙草葉片背部,25 ℃ 黑暗培養(yǎng)12 h后,正常培養(yǎng) 2 d。采用注射器在侵染葉片上選取4~6個(gè)葉圓片進(jìn)行制片;隨后在倒置熒光顯微鏡下檢測(cè)綠色熒光信號(hào)。

    1.3" 基因生物信息學(xué)分析

    1.3.1" 理化性質(zhì)及編碼蛋白質(zhì)分析

    利用Expasy(https://web.expasy.org/protparam/)分析GmWRKY-3轉(zhuǎn)錄因子的理化性質(zhì);使用SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)分析GmWRKY-3轉(zhuǎn)錄因子編碼蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),用SWISS-MODEL(https://www.swissmodel.expasy.org)分析蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)。研究差異表達(dá)基因編碼蛋白的二級(jí)、三級(jí)空間結(jié)構(gòu)。

    1.3.2" 啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件分析

    利用PlantCARE分析GmWRKY-3轉(zhuǎn)錄因子啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件。

    1.3.3" 系統(tǒng)發(fā)育樹分析

    利用MEGA 10.0軟件對(duì)基因編碼蛋白進(jìn)行比對(duì),采用鄰接法(NJ法)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,分析基因在不同物種中的分布情況和親緣遠(yuǎn)近關(guān)系。

    1.4" pCAMBIA3300-GmWRKY-3重組質(zhì)粒連接及測(cè)序

    根據(jù)GmWRKY-3基因的CDS序列、pCAMBIA3300載體的XbaⅠ酶切位點(diǎn)側(cè)翼各15 bp同源序列進(jìn)行引物修飾,利用Primer 5對(duì)GmWRKY-3基因進(jìn)行引物設(shè)計(jì),結(jié)果見表1。PCR擴(kuò)增、目的片段與載體的連接、重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化與鑒定過程參照“1.2.2”“1.2.3”節(jié)。

    1.5" pCAMBIA3300-GmWRKY-3農(nóng)桿菌瞬時(shí)侵染

    提取測(cè)序正確的大腸桿菌pCAMBIA3300-GmWRKY-3的質(zhì)粒,并轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌K599中。初步鑒定過程參照“1.2.3”節(jié)。選取籽粒大小均勻、完整、無病斑的感病品種綏農(nóng)14與東農(nóng)50,播種至蛭石中。蘸取上述發(fā)根農(nóng)桿菌K599菌液涂布于LB固體培養(yǎng)基上,置于28" ℃培養(yǎng)箱中過夜培養(yǎng),將菌落輕輕刮下,使用共培養(yǎng)液體培養(yǎng)基重懸菌體,直至D600 nm=0.8,得到菌液侵染液。選取3~4 d苗齡的幼苗,使用1 mL注射器,在幼苗子葉節(jié)點(diǎn)或近端下胚軸處注射菌液,重復(fù)2~3次,進(jìn)行菌液接種,并在傷口下端約1 cm處剪斷,放回蛭石中培養(yǎng)2~3周,取適量根部組織利用Bar試紙條進(jìn)行轉(zhuǎn)基因根系鑒定。將在Bar試紙條水平上檢測(cè)為轉(zhuǎn)基因陽性的植株,保留陽性根部組織,移栽至接種大豆胞囊線蟲卵懸液的病土中,繼續(xù)培養(yǎng)2~3周。

    1.6" 陽性根表型鑒定

    以感病品種東農(nóng)50為受體試驗(yàn)材料,將含有pCAMBIA3300-GmWRKY-3重組載體與pCAMBIA3300空載體的K599農(nóng)桿菌菌液接種于根系生長(zhǎng)點(diǎn),接種15 d后,進(jìn)行側(cè)根取樣,采用Bar試紙條進(jìn)行鑒定,根據(jù)Bar試紙條驗(yàn)證結(jié)果,選取轉(zhuǎn)基因陽性根接種HG type 0(3號(hào)生理小種)。接種SCN 15 d后,采用酸性品紅染色法分別對(duì)2個(gè)試驗(yàn)組合(接種pCAMBIA3300-GmWRKY-3重組載體和pCAMBIA3300空載體農(nóng)桿菌菌液)發(fā)生突變和未發(fā)生突變的大豆根部進(jìn)行染色,在體式顯微鏡下觀察線蟲侵染情況,每株取3個(gè)側(cè)根作為生物學(xué)重復(fù)。

    2" 結(jié)果與分析

    2.1" GmWRKY-3基因克隆

    以抗病品種東農(nóng)L10大豆根部的cDNA為模板進(jìn)行PCR特異性擴(kuò)增后,將擴(kuò)增產(chǎn)物利用2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè),克隆載體測(cè)序結(jié)果(圖1)表明,目的片段大小為663 bp,該序列長(zhǎng)度與GmWRKY-3 CDS序列相符。

    2.2" 基因序列生物信息學(xué)分析

    2.2.1" GmWRKY-3基因理化性質(zhì)及編碼蛋白質(zhì)分析

    使用Phytozome在線網(wǎng)站查找GmWRKY-3的基因信息,該基因的CDS序列長(zhǎng)度為663 bp,編碼220個(gè)氨基酸。利用ExPASy在線工具對(duì)GmWRKY-3編碼蛋白的基本理化特性進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,該

    蛋白分子量約為24.93 ku,等電點(diǎn)為8.46,分子式為C1 086H1 722N312O343S9,脂肪指數(shù)為51.37,不穩(wěn)定系數(shù)為67.73,表明該蛋白為不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。該蛋白質(zhì)中絲氨酸個(gè)數(shù)最多,占總氨基酸數(shù)量的10.0%,其次為谷氨酸、蘇氨酸,占比均在8.0%以上,最少的是蛋氨酸,占比為1.4%。通過SOPMA網(wǎng)站對(duì)GmWRKY-3編碼的氨基酸序列進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),結(jié)果(圖2)顯示,不同結(jié)構(gòu)類型的占比分別為無規(guī)則卷曲48.64%、α-螺旋32.27%、延伸鏈15.91%、β-轉(zhuǎn)角3.18%。使用SWISS-MODEL對(duì)三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行同源建模,預(yù)測(cè)該蛋白的結(jié)構(gòu)域主要由1個(gè)α-螺旋和5個(gè)β-折疊組成。

    2.2.2" 啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件分析

    使用PlantCARE啟動(dòng)子預(yù)測(cè)網(wǎng)站分析GmWRKY-3基因的順式作用元件,結(jié)果(表2)表明,上游區(qū)域含有MYB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),G-box、TCT-motif光響應(yīng)元件,MBS參與干旱誘導(dǎo)的MYB結(jié)合位點(diǎn),ABRE、Myb等脅迫相關(guān)激素的響應(yīng)元件。MYB轉(zhuǎn)錄起始關(guān)鍵調(diào)控位點(diǎn)是最多作用元件。根據(jù)以上結(jié)果推測(cè),GmWRKY-3基因的表達(dá)可能受到光、脅迫、激素等多種信號(hào)的調(diào)控,從而影響植物抵抗生物脅迫的能力。

    2.2.3" 系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

    為了解GmWRKY-3的進(jìn)化關(guān)系,從NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出與GmWRKY-3基因編碼蛋白同源性較高的多種植物的WRKY蛋白序列,包括向日葵(sunflower)、傘形葡萄(umbrella grape)、角荬菜(endive)、菜豆(pea bean)、三葉草(whitetip clover)、日本蓮花(Japanese lotus)、白蕨(white fern)、龍眼雙果(longan double fruit)、本氏煙草(ben tobacco)等,同時(shí)利用MEGA 10.0軟件構(gòu)建與大豆同源度較高的物種間的系統(tǒng)進(jìn)化樹, 結(jié)果(圖3)表明,大豆的GmWRKY-3基因與同物種大豆WRKY40轉(zhuǎn)錄因子(XP 025983959.1)親緣關(guān)系最近,不同物種之間與野生大豆(RZC15262.1)、赤豆(XP 017429633.1 )、洋紫荊(KAI4337249.1)、木豆(XP 020206663.1、KYP34952.1)等聚為同一分支,親緣關(guān)系較近,同源性較高。

    2.3" pCAMBIA1302-GmWRKY-3載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位

    將重組質(zhì)粒pCAMBIA1302-GmWRKY-3連接轉(zhuǎn)化至DH5α后,在具有Kana抗性的LB培養(yǎng)基上進(jìn)行篩選培養(yǎng),使用引物GmWRKY-3-1302-F和 GmWRKY-3-1302-R(表1)對(duì)陽性單菌落進(jìn)行特異性擴(kuò)增,對(duì)獲得含有目的條帶的陽性菌液(圖4)進(jìn)行測(cè)序,并保存至-80 ℃冰箱中。

    將含有重組質(zhì)粒pCAMBIA1302-GmWRKY-3的農(nóng)桿菌K599菌液注射入本氏煙草中。結(jié)果顯示,在瞬時(shí)表達(dá)pCAMBIA1302-GmWRKY-3融合蛋白的煙草葉片細(xì)胞中,細(xì)胞核和細(xì)胞膜上均能檢測(cè)到熒光信號(hào),但主要定位于細(xì)胞核;而單獨(dú)表達(dá)

    pCAMBIA1302的對(duì)照細(xì)胞,熒光信號(hào)分布于整個(gè)細(xì)胞(圖5)。可見GmWRKY-3蛋白屬于核定位蛋白。

    2.4" pCAMBIA3300-GmWRKY-3載體構(gòu)建

    將重組質(zhì)粒pCAMBIA3300-GmWRKY-3連接轉(zhuǎn)化至DH5α后,在具有Kana抗性的培養(yǎng)基上進(jìn)行篩選培養(yǎng),使用引物GmWRKY-3-3300-F和 GmWRKY-3-3300-R(表1)對(duì)陽性單菌落進(jìn)行特異性擴(kuò)增,對(duì)獲得的目的條帶正確的菌液(圖6)進(jìn)行測(cè)序,并保存于-80 ℃冰箱內(nèi)。

    2.5" GmWRKY-3基因抗病性驗(yàn)證

    分別選取轉(zhuǎn)入pCAMBIA3300-GmWRKY-3基因與pCAMBIA3300空載體的植株,利用Bar試紙條在蛋白水平進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果(圖7)表明,pCAMBIA3300-GmWRKY-3基因與pCAMBIA3300空載體均成功轉(zhuǎn)入植株。由圖8可知,與對(duì)照相比,pCAMBIA3300-GmWRKY-3轉(zhuǎn)基因植株在莖、葉水平上無明顯差別,但對(duì)照組毛狀根明顯少于pCAMBIA3300-GmWRKY-3轉(zhuǎn)基因植株。接種SCN 15 d后,對(duì)大豆根部進(jìn)行酸性品紅染色,并在20×體式顯微鏡下觀察線蟲侵染情況。圖9-a~圖9-c 為pCAMBIA3300-GmWRKY-3轉(zhuǎn)基因陽性植株根中大豆胞囊線蟲侵染情況,平均每個(gè)側(cè)根有 1~5頭大豆胞囊線蟲,根部線蟲數(shù)量平均值為 4.30個(gè)/cm;圖9-d為pCAMBIA3300空載體對(duì)照植株根部線蟲侵染情況,根部線蟲數(shù)量平均值為6.30個(gè)/cm,可見轉(zhuǎn)基因陽性植株根部線蟲數(shù)量明顯少于對(duì)照植株,初步證實(shí),GmWRKY-3基因?qū)Υ蠖拱揖€蟲病有一定的抵抗能力。

    3" 討論

    大豆最早在我國(guó)被發(fā)現(xiàn),隨后傳入其他國(guó)家,

    我國(guó)大豆胞囊線蟲主要分布于東北地區(qū)和黃淮海地區(qū)。大豆胞囊線蟲于1954年在美國(guó)北卡羅來納州第1次被發(fā)現(xiàn),是一種土傳性病害,在土壤中沒有寄主存在時(shí),在某些儲(chǔ)存條件下可以存活9年[20]。由于鑒別的寄主不同,大豆胞囊線蟲被分為16個(gè)生理小種, 我國(guó)主要有11個(gè)生理小種,其中關(guān)于3號(hào)生理小種的研究最為廣泛,4號(hào)生理小種的侵染能力最強(qiáng)[21]。

    目前,選育并種植抗大豆胞囊線蟲病大豆品種是防治SCN最經(jīng)濟(jì)有效的措施,而篩選抗源是抗性品種選育的基礎(chǔ)。Concibido等使用遺傳標(biāo)記,分析了3種分離大豆F2代種群,并將結(jié)果與之前涉及PI 209332的研究結(jié)果進(jìn)行了比較,總結(jié)了有關(guān)SCN相互作用的廣泛遺傳數(shù)據(jù),為SCN研究人員和大豆育種者提供了資源[22]。有研究表明,在不同的大豆產(chǎn)區(qū),SCN也可以在PI 88788、PI 437654、Peking上繁殖,嚴(yán)重影響產(chǎn)量及其他農(nóng)藝性狀。因此迫切需要從不同抗性來源培育穩(wěn)定的抗性品種。近年來,關(guān)于大豆胞囊線蟲抗性基因的篩選取得了重大進(jìn)展,Rhg1(18號(hào)染色體)和Rhg4(8號(hào)染色體)為主要的抗性位點(diǎn)。來自PI 88788的Rhg1位點(diǎn)是商業(yè)品種中可用的抗性的主要來源,可以最大限度地減少侵染SCN的產(chǎn)量損失。Rhg1包含3個(gè)主要的基因,其中1個(gè)為t-SNARE,是大豆Rhg1基因抵抗胞囊線蟲的關(guān)鍵決斷因素[23]。為抵御細(xì)菌、真菌和線蟲等病原體的入侵,許多植物利用囊泡運(yùn)輸來應(yīng)對(duì)免疫反應(yīng),t-SNARE編碼的蛋白是囊泡運(yùn)輸?shù)闹饕鞍字唬?4]。來自Peking的Rhg4位點(diǎn)主要抵抗3號(hào)生理小種和14號(hào)生理小種。目前大多數(shù)抗性品種的抗性均來源于PI88788、Peking和PI437654基因型背景,主要抵抗3號(hào)生理小種[22,25],因此,挖掘新的抗性基因至關(guān)重要。

    同時(shí)研究發(fā)現(xiàn),線蟲的取食位點(diǎn)還受信號(hào)激素的影響,Kammerhofer等于2015年發(fā)現(xiàn),擬南芥中的茉莉酸(JA)對(duì)甜菜胞囊線蟲(Heterodera schachtii)取食起著防御作用,乙烯則對(duì)線蟲取食起著積極作用,水楊酸(SA)抑制合胞體的形成[26];Nahar等于2011年在對(duì)水稻的研究中發(fā)現(xiàn),外源施加乙烯利和茉莉酸甲酯(MeJA)后,線蟲在抵消根系防御途徑方面效果較差,從而增強(qiáng)植物對(duì)線蟲的抵抗能力[27]。胡巖峰等于2018年研究發(fā)現(xiàn)了茉莉酸(JA)和水楊酸(SA)對(duì)SCN的防御效應(yīng)和作用機(jī)制[28]。SCN是植物病原體中最具挑戰(zhàn)性的病原體之一,主要原因在于胞囊在土壤中存活時(shí)間長(zhǎng)達(dá)數(shù)十年,它的卵在胞囊內(nèi)孵化,可免受破壞性環(huán)境的影響,包括免受迄今為止已知的最具侵略性(不可接受的侵略性)殺蟲劑的侵害[29]。一旦SCN在農(nóng)田中建立,就很難根除。遠(yuǎn)離大豆輪作5~7年是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的,在下一個(gè)種植季節(jié)仍然會(huì)有未孵化的SCN卵孵化,并且在有利于發(fā)病的環(huán)境范圍內(nèi)廣泛傳播。SCN侵?jǐn)_的地理范圍延伸到美國(guó)中部和加拿大的主要大豆產(chǎn)區(qū)以及巴西和阿根廷,現(xiàn)在在我國(guó)也很常見[30]。

    WRKY蛋白可以根據(jù)WRKY結(jié)構(gòu)域的數(shù)量和鋅指基序的類型分為Ⅰ~Ⅲ組。WRKY也可以根據(jù)其基因內(nèi)含子類型分為2組,即R型或V型。WRKY轉(zhuǎn)錄因子可以通過結(jié)合順式作用元件激活下游基因,涉及生理變化以及對(duì)生物和非生物脅迫的反應(yīng)。WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物先天免疫系統(tǒng)許多方面的核心組成部分,包括MTI或PTI、ETI、基礎(chǔ)防御和全身性抵抗。WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與種子發(fā)育、種子休眠和發(fā)芽、開花、衰老、代謝途徑以及毛狀體形態(tài)發(fā)生和植物生長(zhǎng)。它們主要通過與特定基因啟動(dòng)子中存在的保守W-box元件結(jié)合來發(fā)揮調(diào)節(jié)作用。此外,WRKY轉(zhuǎn)錄因子,尤其是Ⅲ組,可參與對(duì)食草動(dòng)物、病原體和線蟲的反應(yīng)?,F(xiàn)在有許多例子證明,WRKY基因的過表達(dá)或敲除對(duì)植物防御能力有影響,Grunewald等已初步探索了AtWRKY23在擬南芥中對(duì)線蟲的抵抗能力,為后續(xù)從WRKY轉(zhuǎn)錄因子中挖掘大豆胞囊線蟲抗性基因提供了試驗(yàn)基礎(chǔ)[31]。

    4" 結(jié)論

    本研究成功克隆了大豆GmWRKY-3基因,該基因的CDS序列長(zhǎng)度為663 bp,共編碼220個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,GmWRKY-3基因編碼的蛋白質(zhì)屬于不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。二級(jí)結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主,三級(jí)結(jié)構(gòu)由1個(gè)α-螺旋和5個(gè) β-折疊組成。由啟動(dòng)子順式作用元件分析結(jié)果可知,該基因含有多個(gè)光響應(yīng)元件和多種激素順式作用元件等。為了進(jìn)一步研究其功能,本研究構(gòu)建pCAMBIA1302-GmWRKY-3重組質(zhì)粒,并進(jìn)行亞細(xì)胞定位,在倒置熒光顯微鏡下觀察發(fā)現(xiàn),GmWRKY-3基因主要在細(xì)胞核中行使功能。本研究構(gòu)建了植物過表達(dá)載體pCAMBIA3300-GmWRKY-3,利用發(fā)根農(nóng)桿菌侵染大豆毛狀根,結(jié)果表明,pCAMBIA3300-GmWRKY-3轉(zhuǎn)基因陽性植株根中線蟲數(shù)量平均值為4.30個(gè)/cm;pCAMBIA3300空載體對(duì)照植株根部線蟲數(shù)量平均值為6.30個(gè)/cm,說明轉(zhuǎn)基因陽性植株根部雌蟲平均數(shù)明顯少于對(duì)照植株,初步證實(shí)GmWRKY-3對(duì)大豆胞囊線蟲有一定的抵抗能力。結(jié)果可為進(jìn)一步探究在SCN脅迫下,GmWRKY2-3增強(qiáng)大豆抵抗能力的相關(guān)研究提供重要的理論依據(jù)。

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