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    基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的煙草病毒研究知識(shí)圖譜分析

    2024-03-26 08:07:32趙宇婷謝晏芬曾朝懿彭瑞琦廖勇
    中國(guó)煙草學(xué)報(bào) 2024年1期
    關(guān)鍵詞:抗病毒煙草領(lǐng)域

    趙宇婷,謝晏芬,曾朝懿,彭瑞琦,廖勇

    基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的煙草病毒研究知識(shí)圖譜分析

    趙宇婷1,謝晏芬1,曾朝懿2,彭瑞琦1,廖勇1

    1 曲靖市煙草公司陸良分公司,生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)科,云南省曲靖市 655600;2 西華大學(xué),食品與生物工程學(xué)院,四川省成都市 610039

    【目的】挖掘并整理煙草病毒領(lǐng)域的發(fā)展脈絡(luò)和整體研究框架,為煙草病毒病害防控的創(chuàng)新與突破提供參考。【方法】采用CiteSpace等文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)工具對(duì)中國(guó)知網(wǎng)和Web of Science兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中的煙草病毒文獻(xiàn)從論文發(fā)文量、國(guó)家/地區(qū)分布、主題知識(shí)圖譜等維度進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,挖掘煙草病毒領(lǐng)域的研究特點(diǎn)?!窘Y(jié)果】(1)本領(lǐng)域整體發(fā)文量呈增長(zhǎng)趨勢(shì),美國(guó)與中國(guó)發(fā)文量占優(yōu)勢(shì)地位。其中中國(guó)發(fā)文量增速最快,特別是近3年發(fā)文量占比超總量(中、英文文獻(xiàn)總和)的6成。(2)國(guó)外研究主題比較側(cè)重于對(duì)病毒感染過程、發(fā)病機(jī)理等方面。國(guó)內(nèi)研究則更關(guān)注病毒防治方法、病毒檢測(cè)方面的內(nèi)容。(3)本領(lǐng)域熱點(diǎn)研究方向?yàn)椋簾煵莶《静『φ{(diào)查、煙草病毒致病機(jī)制研究、抗病毒分子篩選與合成、抗病毒煙草品種選育、病毒檢測(cè)方法開發(fā)等。

    煙草;煙草病毒;文獻(xiàn)計(jì)量學(xué);知識(shí)圖譜;CiteSpace;HistCite

    在煙草種植過程中,煙草病害是威脅煙草安全生產(chǎn)的重要因素。而在眾多煙草病害中,病毒病是一類嚴(yán)重的病害[1]。早在1857年記載了煙草病毒病的發(fā)生,隨后證明病毒是感染源,并具有傳染性[2]。病毒感染煙草會(huì)導(dǎo)致植株不能正常發(fā)育,如植株矮化、葉片皺縮、邊緣彎曲、嫩葉出現(xiàn)明脈現(xiàn)象等,嚴(yán)重影響煙葉的品質(zhì)和產(chǎn)量。1989—1991年針對(duì)我國(guó)主要產(chǎn)煙區(qū)的病害調(diào)查發(fā)現(xiàn)至少有17種病毒能夠引起煙草病毒病[3],其中煙草普通花葉病毒(,TMV)、黃瓜花葉病毒(,CMV)和馬鈴薯Y病毒(,PVY)等常見病毒病嚴(yán)重威脅煙葉的安全生產(chǎn),輕則減產(chǎn),重則絕收[1]。

    加強(qiáng)對(duì)病毒的理解能夠指導(dǎo)煙草病害的高效防治。例如,受病毒傳播方式的啟發(fā),通過間作可實(shí)現(xiàn)蚜傳煙草病毒病的防治[4-5]。針對(duì)病毒的結(jié)構(gòu)特征,挖掘獲得的多種靶向外殼蛋白或RNA的新型藥物能顯著抑制病毒組裝[6-8]?;诓《具z傳信息,通過育種或分子手段開發(fā)抗病毒煙草豐富了種質(zhì)資源[9-11]。然而,煙草病毒的研究橫跨“植物”“病毒”兩個(gè)學(xué)科,嚴(yán)重阻礙了不同學(xué)科的研究人員對(duì)這一交叉領(lǐng)域的探索。為了進(jìn)一步促進(jìn)該領(lǐng)域的創(chuàng)新與突破,有必要對(duì)現(xiàn)有研究進(jìn)行系統(tǒng)回顧與分析。

    跨領(lǐng)域的研究有助于學(xué)科的突破性進(jìn)展[12]。通過系統(tǒng)分析現(xiàn)有文獻(xiàn)以獲取新知識(shí)的文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)得到了越來越多的關(guān)注[13-15]。文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)通過挖掘并可視化特定領(lǐng)域的學(xué)科全景及演化進(jìn)程,不僅能夠有效解決文獻(xiàn)數(shù)量多而廣的問題,還能讓研究者更好把握研究趨勢(shì)和方向。目前,文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于計(jì)算機(jī)科學(xué)[16]、經(jīng)濟(jì)學(xué)[17]、物理學(xué)[18]、化學(xué)[19]、數(shù)學(xué)[20]、醫(yī)學(xué)[21]等領(lǐng)域。

    本研究應(yīng)用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)工具系統(tǒng)地分析中國(guó)知網(wǎng)(CNKI)和Web of Science(WoS)數(shù)據(jù)庫(kù)中有關(guān)“煙草病毒”的期刊文獻(xiàn),構(gòu)建“煙草病毒”研究的知識(shí)圖譜,系統(tǒng)回顧“煙草病毒”研究的發(fā)展和重點(diǎn),以期為“煙草病毒”領(lǐng)域的研究提供一些跨學(xué)科的建議和數(shù)據(jù)支持。

    1 材料與方法

    1.1 文獻(xiàn)收集

    中文文獻(xiàn)和英文文獻(xiàn)分別以CNKI和WoS數(shù)據(jù)庫(kù)核心合集為來源。(1)使用CNKI數(shù)據(jù)庫(kù)的“專業(yè)檢索”模式,將文獻(xiàn)類型限定為“期刊”,來源類別設(shè)置為SCI或EI或北大核心或CSCD,采用“SU=病毒 AND (TI=煙草 OR KY=煙草)”檢索策略,檢索得到785篇主題為“病毒”并且題名或關(guān)鍵詞為“煙草”的中文文章。CNKI數(shù)據(jù)庫(kù)檢索得到的中文文獻(xiàn)以Refworks格式導(dǎo)出,導(dǎo)出的題錄內(nèi)容包括題目、作者、發(fā)文機(jī)構(gòu)、關(guān)鍵詞、摘要等。(2)使用WoS數(shù)據(jù)庫(kù)核心合集的“高級(jí)檢索”模式,檢索策略為“(TS=((tobacco OR nicotiana) NOT (cancer OR human OR fish OR mice OR rice* OR rat* OR fruit OR *veget*)) AND TI=(virus* NOT (SARS* OR covid* OR plant OR bark OR stem* OR nano* OR electr* OR maiz* OR rabies OR crista* OR cauli* OR *patho* OR straw* OR grape* OR citrus* OR rod* OR petunia* OR prunus* OR cotton* OR lettuce* OR pepper* OR plum* OR *settia* OR sendai* OR *water* OR *tomato* OR alfalfa* OR panicum* OR galinsoga* OR beet* OR *pea* OR poty* OR *yam* OR arabidopsis* OR cassava* OR *top* OR progeny OR turnip* OR *olive* OR *gold* OR spodoptera OR *tospo* OR radish* OR soil* OR papaya* OR solanum* OR ringspot* OR cymbidium* OR *berry OR frang* OR brassino* OR pepino* OR clover* OR morph* OR respir* OR *bean* OR *sweet* OR herp* OR *white* OR *yellow* OR green* OR *hepat* OR *seed* OR capsicum* OR wheat* OR brome* OR *lea* OR *crop* OR *insect* OR *flower* OR sindbis* OR abutilon* OR dengue* OR nematode* OR carnat* OR chenopodium* AND aphid* AND triticum* OR squash* OR *melon* OR legume* OR narcissus* OR triticum* OR *cardi* OR bamboo* OR artichoke* OR youcai* OR artichoke* OR barley* OR pig*))) AND DT=(Article OR Review)”,時(shí)間跨度為“所有年份”。在上述條件下,精準(zhǔn)檢索到了1446篇英文文章。WoS數(shù)據(jù)庫(kù)檢索得到的英文文獻(xiàn)以純文本格式導(dǎo)出,導(dǎo)出的題錄內(nèi)容包括全記錄與引用的參考文獻(xiàn)。

    根據(jù)CNKI數(shù)據(jù)庫(kù)專業(yè)檢索操作指南,檢索式中SU=主題、TI=題名、KY=關(guān)鍵詞。根據(jù)WoS數(shù)據(jù)庫(kù)高級(jí)檢索使用說明,檢索式中TS=主題、TI=標(biāo)題、DT=文獻(xiàn)類型。所有文獻(xiàn)檢索的起始日期為1980年1月1日,截止日期為2021年12月31日。檢索獲得的題錄下載日期為2021年12月31日。

    1.2 數(shù)據(jù)分析

    CiteSpace是基于共引分析理論和尋路網(wǎng)絡(luò)算法的科學(xué)文獻(xiàn)分析與可視化工具[22-24],能夠?qū)μ囟I(lǐng)域中的文獻(xiàn)進(jìn)行共現(xiàn)分析及信息挖掘以揭示該研究領(lǐng)域的知識(shí)圖譜。本文采用CiteSpace(5.8.R1版本)對(duì)上述檢索得到的文獻(xiàn)進(jìn)行計(jì)量分析。設(shè)置參數(shù):時(shí)間范圍(Time Slicing)為1987—2021年,時(shí)間切片(Year Per Slice)為1;節(jié)點(diǎn)類型(Node Types)分別選擇Country、Institution、Keyword、Category;閾值(Top N)為50;網(wǎng)絡(luò)生成采用Pathfinder法,網(wǎng)絡(luò)裁剪(Pruning)方式為Pruning sliced networks。其余參數(shù)均為默認(rèn)值。

    此外,HistCite作為一款強(qiáng)大的引文分析工具[25],能夠挖掘樣本文獻(xiàn)之間的引用關(guān)系。LCS(Local Citation Score)是HistCite重要的指標(biāo)之一,表征某一文獻(xiàn)在文獻(xiàn)樣本集中的被引用頻次。如果某一篇文獻(xiàn)的LCS較高,代表該文獻(xiàn)在文獻(xiàn)樣本集中受到的關(guān)注就越高,即該文獻(xiàn)在此研究領(lǐng)域比較重要。在本文中,使用HistCite軟件以LCS指標(biāo)分析英文樣本文獻(xiàn)中的重要文獻(xiàn),參數(shù)為默認(rèn)值。

    1.3 圖譜可視化

    基于CiteSpace分析獲得的國(guó)家/地區(qū)合作網(wǎng)絡(luò)、領(lǐng)域分布網(wǎng)絡(luò)、關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)知識(shí)圖譜直接使用CiteSpace軟件進(jìn)行可視化。

    Gephi是一個(gè)用于圖形和網(wǎng)絡(luò)分析的工具[26],具有布局算法、數(shù)據(jù)過濾、聚類等功能,能夠清晰地展示復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)之間的連接?;贑iteSpace分析獲得的機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)(中、英文)、高質(zhì)量中文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜和基于HistCite分析獲得的高質(zhì)量英文文獻(xiàn)共被引網(wǎng)絡(luò)通過Gephi軟件進(jìn)行可視化。

    2 結(jié)果

    2.1 時(shí)間分布

    文獻(xiàn)數(shù)量變化能反映特定研究領(lǐng)域的科研活動(dòng)強(qiáng)度及整體成果狀況。煙草病毒文獻(xiàn)檢索時(shí)間跨度為1985—2021年。從圖1A中可以看出,中文文獻(xiàn)整體呈現(xiàn)先增后降的趨勢(shì),其中1991—1995年發(fā)文量增長(zhǎng)顯著,2006—2010年、2011—2015年發(fā)文量均超過200篇。中文文獻(xiàn)發(fā)表的時(shí)間分布可能與兩次全國(guó)性的研究項(xiàng)目相關(guān),其一是在1989—1991開展的“全國(guó)煙草侵染性病害調(diào)查研究”,其二是在2009—2013開展的“全國(guó)煙草有害生物調(diào)查研究”。英文文獻(xiàn)整體發(fā)文量維持在較高水平,表現(xiàn)出持續(xù)增長(zhǎng)的趨勢(shì),但增長(zhǎng)幅度不大,2010—2015年、2016—2021年發(fā)文量均超過280篇。

    2.2 國(guó)家/地區(qū)分布

    在英文文獻(xiàn)中,各個(gè)國(guó)家發(fā)文量隨時(shí)間的分布如圖1 B所示。前十發(fā)文量國(guó)家/地區(qū)分別為美國(guó)(USA)、中國(guó)(CHN)、日本(JPN)、英格蘭(ENG)、德國(guó)(DEU)、韓國(guó)(KOR)、法國(guó)(FRA)、加拿大(CAN)、俄羅斯(RUS)、蘇格蘭(SCO)。這些國(guó)家/地區(qū)中,大部分的發(fā)文量比較穩(wěn)定,而中國(guó)的發(fā)文量從2006年開始快速增長(zhǎng),發(fā)文總量截至2021年底已攀升至第二。特別是最近3年中國(guó)的英文文獻(xiàn)發(fā)文量在英文文獻(xiàn)總量中占比均超過45%,若考慮中文文獻(xiàn)的數(shù)量,國(guó)內(nèi)研究人員近3年在該領(lǐng)域的發(fā)文量超總量(中、英文文獻(xiàn)總和)的60%,以上數(shù)據(jù)表明中國(guó)學(xué)者對(duì)煙草病毒的關(guān)注度在不斷提升,在發(fā)文量方面保持增長(zhǎng)態(tài)勢(shì)。

    圖1 中英文煙草病毒文獻(xiàn)的時(shí)間分布(A)以及英文文獻(xiàn)各國(guó)家發(fā)文量的時(shí)間分布(B)

    Fig.1 Time distribution of tobacco virus literatures in English and Chinese (A) and Time distribution of English literatures by country(B)

    2.3 機(jī)構(gòu)分析

    機(jī)構(gòu)發(fā)文量與所發(fā)表文章被引用頻次是衡量科研機(jī)構(gòu)在該領(lǐng)域科研實(shí)力的重要指標(biāo)。在WoS數(shù)據(jù)庫(kù)中,1987—2021年時(shí)間段,發(fā)文量前15位的國(guó)際機(jī)構(gòu)如表1所示。發(fā)文量方面,莫斯科羅蒙諾索夫國(guó)立大學(xué)、英國(guó)詹姆斯赫頓研究所和中國(guó)科學(xué)院系統(tǒng)分列1~3位,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院、山東農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)都進(jìn)入前15名。引用頻次方面,馬里蘭大學(xué)、赫爾辛基大學(xué)、康奈爾大學(xué)、加州大學(xué)河濱分校文章的平均引用頻次均超過40,對(duì)該領(lǐng)域研究的影響較大。國(guó)內(nèi)機(jī)構(gòu)文章的引用頻次雖與國(guó)際頭部機(jī)構(gòu)有一定差距,但考慮到國(guó)內(nèi)研究人員在該領(lǐng)域的發(fā)文量于2006年才開始快速增長(zhǎng),且文章的引用需要時(shí)間的積累,國(guó)內(nèi)機(jī)構(gòu)在該領(lǐng)域研究的影響力還有明顯的增長(zhǎng)潛力。

    表1 英文文獻(xiàn)樣本集中發(fā)文量前15位科研機(jī)構(gòu)

    Tab.1 Top 15 scientific research institutions in terms of publication volume in English literature sample set

    在CNKI數(shù)據(jù)庫(kù)中,1992—2021年時(shí)間段,關(guān)于“煙草病毒”研究發(fā)文量前15位的科研機(jī)構(gòu)如表2所示。發(fā)文量方面,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所、西北農(nóng)林科技大學(xué)與云南省煙草農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院的發(fā)文量位居前三。引用頻次方面,福建農(nóng)林大學(xué)、浙江大學(xué)和山東農(nóng)業(yè)大學(xué)文章的平均引用頻次均超過20,領(lǐng)先其它機(jī)構(gòu),對(duì)該領(lǐng)域研究的影響較大。

    表2 中文文獻(xiàn)樣本集中發(fā)文量前15位科研機(jī)構(gòu)

    Tab.2 Top 15 scientific research institutions in terms of publication volume in Chinese literature sample set

    注:a原云南省煙草科學(xué)研究所的論文數(shù)據(jù)被合并到云南省煙草農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院。

    2.4 主題分析

    關(guān)鍵詞出現(xiàn)的頻次反映了關(guān)鍵詞所對(duì)應(yīng)的主題在樣本載文中被研究的次數(shù),進(jìn)而幫助對(duì)相關(guān)領(lǐng)域研究主題的分析。CiteSpace的關(guān)鍵詞的突現(xiàn)檢測(cè)和關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)圖能夠揭示領(lǐng)域研究的演化進(jìn)程及歷史全景,可分析不同時(shí)期的熱點(diǎn)主題[27]。因此,在這部分主要采用關(guān)鍵詞突現(xiàn)及關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)圖分析“煙草病毒”領(lǐng)域的研究主題。

    英文文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞突現(xiàn)如圖2所示,這些關(guān)鍵詞的突變大致可以將本領(lǐng)域的研究重點(diǎn)分為3個(gè)階段:

    (1)1991—2000年。主要研究病毒基因組RNA、基因序列分析、外殼蛋白基因、致病相關(guān)蛋白等內(nèi)容,對(duì)相關(guān)煙草病毒有了初步的認(rèn)識(shí),同時(shí),也持續(xù)關(guān)注病毒防治的內(nèi)容,相關(guān)關(guān)鍵詞invitro、protection的突現(xiàn)強(qiáng)度非常高。

    (2)2001—2010年。經(jīng)過持續(xù)不斷的探索,轉(zhuǎn)基因煙草成為這一時(shí)期抗病毒的重要解決方案,其突現(xiàn)強(qiáng)度高達(dá)10.37。此外,從分子水平研究病毒感染煙草這一過程,對(duì)應(yīng)的突現(xiàn)關(guān)鍵詞數(shù)量增多,涉及plasmodesmata、localization、cell to cell、endoplasmic reticulum、suppression、crystallization等。

    (3)2011—2021年?;谇捌诘闹R(shí)積累,這一階段的研究熱點(diǎn)為病毒防治內(nèi)容,相關(guān)突現(xiàn)關(guān)鍵詞有salicylic acid、nanoparticles、defense、transmission。另外,也從不同角度持續(xù)關(guān)注煙草病毒侵染的分子機(jī)制,比如探索RNA病毒自我復(fù)制過程(dependent RNA ploymerase)。

    圖2 英文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞突現(xiàn)圖

    Fig.2 Burst keywords of English literatures

    進(jìn)一步通過關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)圖探索本領(lǐng)域的全貌。如圖3所示,共現(xiàn)關(guān)鍵詞主要被分為16個(gè)集群。可以明顯發(fā)現(xiàn)每個(gè)集群中出現(xiàn)頻次最高的關(guān)鍵詞幾乎都處于圖譜左側(cè),說明早在1991年就開始探索領(lǐng)域內(nèi)的重要問題并持續(xù)到現(xiàn)在,而在后30年的研究中,并沒有出現(xiàn)能與上述核心關(guān)鍵詞頻次相當(dāng)?shù)男屡d熱點(diǎn)出現(xiàn),這與其他領(lǐng)域的關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)分布差異明顯[28-29],同時(shí)也表明該領(lǐng)域的核心目標(biāo)是病毒防治。具體而言,前5個(gè)集群為主要研究?jī)?nèi)容,其主題詞分別為#0 movement、#1 replication、#2 CMV、#3 RNA interference和#4 TMV。首先,#0集群包含hypersensitive response、antiviral activity、systemic acquired resistance、movement protein、cell death、immunity、host-virus interaction等高頻關(guān)鍵詞,說明這部分內(nèi)容主要涉及病毒感染植株過程以及宿主細(xì)胞的防御行為。其次,#1集群包括replication、genome、localization、RNA virus、dsRNA、mRNA、plasmodesmata、transport、ER等關(guān)鍵詞,這部分側(cè)重于認(rèn)識(shí)和解析病毒復(fù)制和移動(dòng)的分子機(jī)制。然后,#2和#4集群主要圍繞TMV與CMV展開,高頻關(guān)鍵詞包括capsid protein gene、coat protein、infection、pathogenesis、serology property、host range等,聚焦于病毒的外殼蛋白、感染及發(fā)病機(jī)理、血清學(xué)鑒定等內(nèi)容,以全面地認(rèn)識(shí)煙草病毒。最后,#3集群內(nèi)容主要為acquired resistance、defense、induction、crystallization、RNAi、gene silencing、transmission、biocontrol,這部分主要討論煙草病毒的防治方法,而集群主題詞RNAi正是這些防治方法的重要一種。根據(jù)謝麗娟等人的綜述,RNAi技術(shù)不僅應(yīng)用于煙草抗病和蟲害防治中,還能應(yīng)用于煙草基因功能調(diào)控及煙草品質(zhì)改良[30]。其余的集群關(guān)注的主題是前5個(gè)集群的補(bǔ)充或外延,#6 virus structure、#7 RNA、#11 triple gene block、#14 protein主要探索不同大分子在病毒侵染煙草植株過程中所扮演的角色,#5 nanotechnology、#8 salicylic acid屬于煙草病毒防治方法的內(nèi)容;#9 expression、#10 molecular biology、#13 in vitro涉及構(gòu)建抗性植株的分子操作。

    圖3 英文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)知識(shí)圖譜

    Fig.3 Knowledge mapping of keywords timezone in English literatures

    中文文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞突現(xiàn)如圖4所示,這些關(guān)鍵詞的突變明顯分為三個(gè)階段:

    (1)1987—2000年。這一階段主要內(nèi)容是病毒防治。種質(zhì)資源是關(guān)注的重點(diǎn),并長(zhǎng)期研究?jī)?yōu)質(zhì)種源的抗性來源,以期選育出抗病毒煙草植株。同時(shí),對(duì)煙草病毒進(jìn)行了探索,涉及關(guān)鍵詞主要有檢測(cè)、雙生病毒等。

    (2)2001—2010年。得益于生物化學(xué)與分子生物學(xué)等學(xué)科的快速發(fā)展,此階段的突現(xiàn)關(guān)鍵詞數(shù)量較多,但關(guān)注熱點(diǎn)依然是病毒防治,其中轉(zhuǎn)基因煙草的研究貫穿整個(gè)過程。另外,對(duì)病毒侵染的認(rèn)識(shí)也進(jìn)入分子層面,相關(guān)突現(xiàn)關(guān)鍵詞有誘導(dǎo)抗性、防御酶等。

    (3)2011—2021年。這一階段突現(xiàn)關(guān)鍵詞只有病毒檢測(cè)和抗病毒活性,表明本階段對(duì)煙草病毒的關(guān)注熱點(diǎn)變化不大,沒有出現(xiàn)更多的新興研究趨勢(shì)。

    圖4 中文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞突現(xiàn)圖

    Fig.4 Burst keywords of Chinese literatures

    對(duì)應(yīng)的關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)圖如圖5所示。中文高頻關(guān)鍵詞數(shù)量較少,其整體時(shí)間分布與英文文獻(xiàn)的差異較大。早在1987年,研究熱點(diǎn)TMV和PVY病毒已開始得到關(guān)注,其中TMV相關(guān)研究分布在各個(gè)階段并一直持續(xù)到現(xiàn)在,而PVY相關(guān)研究主要集中在第三階段。1993年左右出現(xiàn)了轉(zhuǎn)基因煙草、煙草病毒病、CMV等高頻關(guān)鍵,其余年份的關(guān)鍵詞出現(xiàn)頻次分布比較均勻,領(lǐng)域內(nèi)并未出現(xiàn)新興研究方向。中文文獻(xiàn)共現(xiàn)關(guān)鍵詞主要被分為15個(gè)集群,涉及的研究?jī)?nèi)容與英文文獻(xiàn)的大致相似。病毒防治相關(guān)主題有#0稀釋極點(diǎn)、#1種質(zhì)資源、#2轉(zhuǎn)基因煙草、#5煙草病毒病、#7抗病毒活性和#8 RNA干擾。病毒學(xué)相關(guān)主題有#3防御酶、#4序列分析、#9外殼蛋白、#13 DNAβ。病毒檢測(cè)也是國(guó)內(nèi)研究的重點(diǎn),相關(guān)主題有#11 RT-PCR和#12病毒檢測(cè)。總的來看,中文文獻(xiàn)對(duì)于病毒侵染植株及其復(fù)制和移動(dòng)的分子機(jī)制關(guān)注較少,對(duì)應(yīng)的關(guān)鍵詞出現(xiàn)頻次并不高。而對(duì)病毒防治方法興趣濃厚,早期提出了稀釋病毒和鈍化病毒等方法(#0集群),中后期在病毒侵染煙草分子機(jī)制的指導(dǎo)下開發(fā)出轉(zhuǎn)基因煙草(#2集群)、化學(xué)防治(#7集群)、RNA干擾(#8集群)等手段。

    圖5 中文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)知識(shí)圖譜

    Fig.5 Knowledge mapping of keywords timezone in Chinese literatures

    2.5 高質(zhì)量文獻(xiàn)分析

    文獻(xiàn)的被引頻次能夠反映文獻(xiàn)的質(zhì)量,高質(zhì)量文獻(xiàn)是一個(gè)研究領(lǐng)域的重要知識(shí)來源,因此,對(duì)高質(zhì)量文獻(xiàn)的分析能促進(jìn)對(duì)本領(lǐng)域研究方向的整體認(rèn)識(shí)。對(duì)于英文文獻(xiàn)樣本,使用HistCite軟件分析其被引情況,該軟件中的LCS值表征文獻(xiàn)在樣本集中的影響力,即在對(duì)應(yīng)研究領(lǐng)域的影響力,因此取LCS排名前200的文獻(xiàn),通過Gephi獲得高質(zhì)量英文文獻(xiàn)的共被引網(wǎng)絡(luò),如圖6所示。

    圖6 基于HistCite的高質(zhì)量英文文獻(xiàn)的共被引知識(shí)圖譜

    Fig.6 HistCite based co-citation knowledge graph of high-quality English literatures

    整體來看,第一、二、四、五、六類之間的相互引用比較頻繁,是“煙草病毒”領(lǐng)域內(nèi)的重要參考內(nèi)容。通過聚類分析可以發(fā)現(xiàn)這些文獻(xiàn)的研究主題主要分為8個(gè)類別。詳細(xì)分析其研究?jī)?nèi)容發(fā)現(xiàn),第一、二類的關(guān)鍵詞分別為movement protein和cell-to-cell movement,相關(guān)重要文獻(xiàn)如表3所示(序號(hào)2、4、6、9),主要關(guān)注病毒在煙草宿主細(xì)胞之間傳遞的分子機(jī)制,加強(qiáng)對(duì)煙草病毒侵染過程的理解。第三類聚焦于煙草病毒特征的研究,主要涉及病毒的核酸與蛋白質(zhì)的表征(代表文獻(xiàn)表3序號(hào)3、5、7、8)以及與煙草的相互作用(代表文獻(xiàn)表3序號(hào)2、4、6、9、10)。第四類的主要側(cè)重點(diǎn)為CMV,表明CMV是本領(lǐng)域重點(diǎn)關(guān)注的病毒,相關(guān)的抗CMV基因挖掘、感染煙草的性質(zhì)描述、基因組結(jié)構(gòu)、侵染與增殖機(jī)理等基礎(chǔ)研究?jī)?nèi)容在近30年得到了廣泛的關(guān)注(代表文獻(xiàn)表3序號(hào)3)。第五類的主要研究方向是antivirus-related genes,這部分文獻(xiàn)主要聚焦于煙草抗病毒基因資源分析與挖掘(代表文獻(xiàn)表3序號(hào)1),而抗病毒相關(guān)基因的挖掘是煙草病毒防治的重要手段之一。第六類的主題是virus RNA replication,這類文獻(xiàn)主要探索了煙草病毒在宿主細(xì)胞中復(fù)制過程的分子機(jī)制,與第一、二類類似,這部分研究?jī)?nèi)容加強(qiáng)了對(duì)病毒增殖過程的理解(代表文獻(xiàn)為表3序號(hào)10)。總的來說,通過英文文獻(xiàn)的被引分析發(fā)現(xiàn),高質(zhì)量英文文獻(xiàn)的研究重點(diǎn)側(cè)重于病毒感染煙草這一過程中的機(jī)制解析,這是開發(fā)病毒防治方法的重要理論參考。

    表3 高LCS代表性英文文獻(xiàn)

    Tab.3 Representative English literatures with high LCS

    對(duì)于中文文獻(xiàn)樣本,由于CNKI數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)出題錄時(shí)未提供引文信息,因此這里采用被引頻次≥20作為篩選標(biāo)準(zhǔn),共獲得141篇高質(zhì)量文獻(xiàn),用于關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析。另外,在這141篇高質(zhì)量文獻(xiàn)中,通過手動(dòng)計(jì)算LCS得到10篇高LCS代表性的中文文獻(xiàn),如表4所示??梢悦黠@發(fā)現(xiàn)這些高質(zhì)量中文文獻(xiàn)發(fā)表年份幾乎都在2001—2010年時(shí)間段,與國(guó)內(nèi)該領(lǐng)域快速發(fā)展時(shí)間段重合。

    表4 高LCS代表性中文文獻(xiàn)

    Tab.4 Representative Chinese literatures with high LCS

    通過Citespace分析141篇文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜,并使用Gephi可視化,結(jié)果如圖7所示??梢悦黠@發(fā)現(xiàn)TMV是這些文獻(xiàn)重點(diǎn)關(guān)注的病毒種類,其相關(guān)研究涉及大部分的關(guān)鍵詞。由于TMV對(duì)煙草生產(chǎn)的威脅最大[3],針對(duì)TMV的詳細(xì)研究可以加強(qiáng)煙草病毒感染的理解以及開發(fā)對(duì)應(yīng)的防治方法,減少或者避免農(nóng)業(yè)生產(chǎn)損失,側(cè)面說明在國(guó)內(nèi)煙草的安全種植是本領(lǐng)域的核心內(nèi)容。綜合分析表明這些高質(zhì)量文獻(xiàn)的研究主題主要包括煙草病毒種類表征(代表文獻(xiàn)表4序號(hào)1、2、6、8、9)、抗病毒物質(zhì)的活性分析(代表文獻(xiàn)表4序號(hào)3、4、10)、病毒感染的分子機(jī)制解析(代表文獻(xiàn)表4序號(hào)5、7)、抗病毒株的育種、病毒鑒定與檢測(cè)等,這與主題分析部分的結(jié)果一致。其中,煙草的生產(chǎn)中對(duì)病毒防治是“煙草病毒”領(lǐng)域的研究目的,病毒種類表征、病毒感染及宿主防御機(jī)制的解析是開發(fā)防治方法的理論基礎(chǔ),而抗病毒物質(zhì)和煙草育種是實(shí)施手段,可以看出,這些文獻(xiàn)覆蓋了該領(lǐng)域的大部分研究?jī)?nèi)容,對(duì)后續(xù)的相關(guān)研究具有重要的參考價(jià)值。

    圖7 高質(zhì)量中文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜

    Fig.7 Keywords co-occurrence mapping of high-quality Chinese literatures

    3 研究熱點(diǎn)與趨勢(shì)分析

    基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)工具的輔助,通過對(duì)“煙草病毒”領(lǐng)域知識(shí)圖譜的分析,本領(lǐng)域的研究目的、理論基礎(chǔ)、實(shí)施手段等方面的整體框架逐漸清晰。在這部分內(nèi)容中,圍繞知識(shí)圖譜,進(jìn)一步對(duì)該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)與趨勢(shì)進(jìn)行整理。

    3.1 病毒病害調(diào)查

    我國(guó)煙草種植區(qū)的地理分布較廣,煙草種植的生態(tài)環(huán)境因素也不完全一樣,導(dǎo)致不同煙區(qū)的主要煙草病毒種類有所差異。在中、英文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)知識(shí)圖譜中(圖3和圖5),出現(xiàn)了多種病毒的身影,比如煙草曲頂病毒()、煙草曲葉病毒()、煙草環(huán)斑病毒()、煙草脈帶花葉病毒()、番茄黃化曲葉病毒()。因此,對(duì)不同煙區(qū)主要病毒的種類、分布、傳播規(guī)律、遺傳信息及生理特性的調(diào)查是制定煙草病毒高效防控策略的基礎(chǔ)[3,31-33]。

    3.2 煙草病毒致病機(jī)制研究

    煙草病毒與煙草在演化過程中,經(jīng)過長(zhǎng)期“軍備競(jìng)賽”,分別形成了對(duì)應(yīng)的感染策略與防御系統(tǒng)。煙草感染病毒病所經(jīng)歷的一系列復(fù)雜事件,大致可以分為4個(gè)主要階段。(1)煙草病毒通過媒介進(jìn)入宿主細(xì)胞后,病毒會(huì)先脫去外殼蛋白以將基因組暴露出來,方便后續(xù)的翻譯和復(fù)制。(2)植株在主要感染部位激活HR(hypersensitive response)樣細(xì)胞死亡,并伴隨著其他防御反應(yīng)的激活[34],包括水楊酸(SA)、茉莉酸(JA)和乙烯(ETH)的積累以及離子通道的開放,從而全面調(diào)節(jié)植株的抗性。(3)煙草病毒躲過宿主細(xì)胞的多道防線后,開始合成相關(guān)蛋白和RNA。首先通過基因組RNA合成病毒復(fù)制蛋白,然后復(fù)制蛋白定位在細(xì)胞內(nèi)膜上,并與基因組RNA、宿主相關(guān)蛋白(TOM1和ARL8)形成復(fù)制復(fù)合物,最后在復(fù)合物環(huán)境中完成病毒RNA的合成[35-36]。(4)在病毒RNA復(fù)制的初始階段,亞基因組RNA開始翻譯合成運(yùn)動(dòng)蛋白(movement protein,MP),同時(shí)病毒RNA招募“順風(fēng)車”MP通過胞間連絲以實(shí)現(xiàn)在相鄰細(xì)胞間的運(yùn)動(dòng),最終導(dǎo)致煙草植株的系統(tǒng)性發(fā)病[37-39]。

    基于中、英文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞時(shí)區(qū)知識(shí)圖譜(圖3和圖5),本研究發(fā)現(xiàn)英文文獻(xiàn)中對(duì)煙草病毒學(xué)的研究早在上世紀(jì)90年代就已經(jīng)開始了全面的探索,但中文文獻(xiàn)對(duì)這方面的研究起步較晚。病毒感染與宿主防御是動(dòng)態(tài)平衡且不斷演化的過程,所涉及的事件繁多且復(fù)雜,對(duì)應(yīng)分子機(jī)制的解析依然不清晰、不全面。然而,理解煙草病毒致病的相關(guān)分子機(jī)制是高效、綠色防治方法開發(fā)的前提,也是本領(lǐng)域重要的知識(shí)來源。因此后續(xù)還應(yīng)加強(qiáng)對(duì)病毒學(xué)的研究力度,促進(jìn)本領(lǐng)域的前沿創(chuàng)新與突破。

    3.3 抗病毒分子篩選與合成

    抗病毒劑是煙草種植過程中控制病毒病流行的重要手段[40-42]。這些抗性分子通過抑制病毒的侵染、病毒的增殖、誘導(dǎo)宿主的防御系統(tǒng)等方式實(shí)現(xiàn)抗煙草病毒活性。目前抗病毒分子可分為大分子物質(zhì)(蛋白質(zhì)、核酸、糖類和脂肪酸等)及小分子化合物[43]。比如,TEER降低蛋白(TEER-decreasing protein)可誘導(dǎo)水楊酸介導(dǎo)的系統(tǒng)獲得性抗性來防御TMV的感染[44],油酸通過增強(qiáng)煙草防御相關(guān)基因的表達(dá)平以抑制TMV增殖[45],寧南霉素(圖7)通過干擾RNA及外殼蛋白的合成抑制TMV的擴(kuò)增[46]。其中,小分子化合物由于易于篩選、方便合成等特點(diǎn),在抗病毒分子中占比越來越高[47]。

    對(duì)于抗病毒物質(zhì)的篩選,天然提取物是一類重要途徑(圖7)[48]。植物天然提取物是抗病毒物質(zhì)的主要來源[49],真菌提取物中也發(fā)現(xiàn)明顯抗病毒的活性物質(zhì)[50]。此外,小分子化合物的直接設(shè)計(jì)與合成也是重要手段(圖7)。Lv等人通過引入結(jié)構(gòu)優(yōu)化的吡唑席夫堿支架,篩選出抗TMV活性與寧南霉素相當(dāng)?shù)幕衔颷51];Zhou等人設(shè)計(jì)含有查爾酮的新型-氨基膦酸鹽衍生物,結(jié)果顯示可靶向TMV外殼蛋白的分解[40]。進(jìn)一步地,為了高效篩選小分子化合物,篩選策略的開發(fā)尤為關(guān)鍵[52-54]。針對(duì)此問題,Zhang等人基于綠色熒光蛋白開發(fā)了一套用于監(jiān)測(cè)病毒復(fù)制與篩選抗TMV分子的方法,并且借助計(jì)算機(jī)程序識(shí)別熒光點(diǎn)和計(jì)算熒光面積,穩(wěn)健、省時(shí)且靈敏地自動(dòng)化完成小分子的定性、定量篩選[54]。通過該篩選方法了發(fā)現(xiàn)咔唑生物堿、β-咔啉生物堿具有與寧南霉素相當(dāng)?shù)目共《净钚?,這一結(jié)果為抗病毒分子的高通量篩選提供強(qiáng)有力的參考。

    為了將篩選獲得的抗煙草病毒分子實(shí)際應(yīng)用到煙草病毒防控中,對(duì)這些快速積累的活性分子的大規(guī)模制備也成了研究的焦點(diǎn)(圖7)。通過有機(jī)化學(xué)的方法合成抗煙草病毒活性分子在國(guó)內(nèi)是當(dāng)前主流制備手段[55-60]。比如基于活性基團(tuán)拼接原理,結(jié)合結(jié)構(gòu)改造和構(gòu)型優(yōu)化,實(shí)現(xiàn)新型寡肽手性膦酸酯硫脲衍生物的合成,產(chǎn)物收率最高可達(dá)95%[60]。此外,生物合成作為溫和、高選擇性和環(huán)境友好的合成策略,為低成本、大規(guī)模生產(chǎn)抗煙草病毒分子提供新的途徑[61-62]。

    3.4 抗病毒煙草品種選育

    為了增強(qiáng)植株抵御病毒的能力,抗病毒煙草品種的選育在生物防治中尤為重要。煙草作物的遺傳多樣性使得抗病毒品種的選育成為可能,而抗病毒種質(zhì)資源的挖掘是品種選育的基礎(chǔ)。國(guó)內(nèi)對(duì)煙草種質(zhì)資源的挖掘與分析做了廣泛研究(圖5 #1集群),比如林世鋒等人從900多份煙草植株中挖掘出19份高抗PVY資源,通過基因型分析推斷這些PVYN抗性來源于隱性抗病基因eIF4E1[63]。另外,抗CMV、TMV種質(zhì)的篩選與鑒定也是種質(zhì)資源挖掘的重點(diǎn)[64-66]。

    對(duì)于煙草育種,目前常用的方法可以簡(jiǎn)單地歸結(jié)為兩類選育策略:(1)以結(jié)果為導(dǎo)向然后分析原因。(2)以目標(biāo)為驅(qū)動(dòng)篩選對(duì)應(yīng)結(jié)果。采用第一種策略,陳榮平通過人工接種,田間篩選獲得多株高抗、中抗PVY的煙草單株,并提出通過“富集”多種弱抗性基因以選育抗性更強(qiáng)的品種。隨后抗性遺傳分析發(fā)現(xiàn)在抗性植株的eIF4E基因上兩個(gè)突變位點(diǎn),導(dǎo)致病毒基因不能翻譯[67]。采用第二種策略,粟陽(yáng)萌以抗TMV的基因作為錨點(diǎn),構(gòu)建高效且穩(wěn)定分子標(biāo)記作為篩選標(biāo)準(zhǔn),隨后結(jié)合分離集團(tuán)分組分析法和簡(jiǎn)單序列重復(fù)標(biāo)記技術(shù)成功篩選獲得含N基因的抗TMV種質(zhì)資源[9]??梢园l(fā)現(xiàn)兩種方法各有優(yōu)勢(shì),第一種保留了抗病毒的遺傳多樣性,有利于新型抗病毒基因資源的發(fā)現(xiàn),但針對(duì)性較弱且育種周期較長(zhǎng)。第二種目標(biāo)性強(qiáng)、篩選方法簡(jiǎn)單,但強(qiáng)烈依賴豐富的經(jīng)驗(yàn)知識(shí)??偟膩碚f,對(duì)種質(zhì)資源的挖掘可以加速抗病毒煙草品種的選育。

    除了傳統(tǒng)育種方法,CRISPR技術(shù)為抗病毒煙草品種的開發(fā)注入了新的動(dòng)力[68-71]。解屹等人基于CRISPR-Cas13a構(gòu)建了多靶標(biāo)、和基因的編輯系統(tǒng),驗(yàn)證了CRISPR強(qiáng)大編輯能力的同時(shí),也在本氏煙和枯斑三生煙中實(shí)現(xiàn)了對(duì)TMV的抑制[72]。轉(zhuǎn)基因煙草是本領(lǐng)域的重點(diǎn)(圖5 #2集群),因此借助CRISPR技術(shù)構(gòu)建高抗或多抗的抗病毒煙草具有巨大的應(yīng)用潛力。

    3.5 病毒檢測(cè)方法的開發(fā)

    煙草種植中,病毒的檢測(cè)對(duì)于質(zhì)量控制、防止病毒傳播、減少生產(chǎn)損失具有重要意義[73],也是本領(lǐng)域重要研究?jī)?nèi)容(圖5 #11集群、#12集群)。低檢測(cè)限、快速和精準(zhǔn)是病毒檢測(cè)的三大主要目標(biāo)。低檢測(cè)限是為了及早發(fā)現(xiàn)病毒的身影,在病毒擴(kuò)散之前扼殺;快速是為了減緩病毒的快速傳播,防止大范圍爆發(fā);而精準(zhǔn)則是為了提高檢出效率以及準(zhǔn)確鑒定不同病毒種類。

    在降低檢測(cè)限方面,有多個(gè)團(tuán)隊(duì)進(jìn)行了探索[74-77]。其中,Zhang等人開發(fā)了一種基于電子轉(zhuǎn)移原子轉(zhuǎn)移自由基聚合再生的活化劑結(jié)合雙鏈特異性核酸酶輔助靶標(biāo)回收的電化學(xué)生物檢測(cè)系統(tǒng),該檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)TMV的RNA展現(xiàn)出高靈敏度,在最優(yōu)實(shí)驗(yàn)參數(shù)條件下,檢測(cè)限最低可到2.9 fM[77]。

    在縮短檢測(cè)時(shí)間方面,早期研究中通過逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法(RT-LAMP)在60 min內(nèi)實(shí)現(xiàn)對(duì)煙草病毒的檢測(cè)[78-79],并且其靈敏度比傳統(tǒng)的RT-PCR方法高10~100倍。而近期一項(xiàng)研究報(bào)道了一種新型等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)技術(shù)—逆轉(zhuǎn)錄-重組酶聚合酶擴(kuò)增法(RT-RPA),該方法可以在38℃下僅用20 min實(shí)現(xiàn)煙草中辣椒脈斑駁病毒(ChiVMV)的檢測(cè),并且具有現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)ChiVMV的可行性[80]。

    在檢測(cè)精準(zhǔn)度方面,當(dāng)前少有研究單獨(dú)提高檢出效率,而對(duì)多種病毒的同時(shí)檢測(cè)表現(xiàn)出濃厚的興趣,得到了本領(lǐng)域?qū)W者的長(zhǎng)期關(guān)注[81-86]。比如,周濤等開發(fā)了一種多重RT-PCR檢測(cè)方法,能夠同時(shí)檢測(cè)四川地區(qū)感染雪茄和烤煙的常見RNA病毒—TMV、ChiVMV、TVBMV、PVY和CMV,對(duì)應(yīng)的檢測(cè)率分別為55%、55%、45%、36%和9%[87]。

    此外,對(duì)煙草病毒的即時(shí)檢測(cè)能實(shí)時(shí)反饋煙葉的病毒感染情況,這將顯著提高田間管理水平,保證煙草的安全種植。然而,煙草種植農(nóng)戶和田間管理者通常未儲(chǔ)備豐富的病毒檢測(cè)知識(shí),因此開發(fā)攜帶方便、操作簡(jiǎn)單、檢測(cè)精準(zhǔn)的煙草病毒即時(shí)檢測(cè)系統(tǒng)非常有必要。針對(duì)此問題,基于膠體金顆粒的快檢試紙條由于操作簡(jiǎn)單、檢測(cè)迅速、準(zhǔn)確率高等優(yōu)點(diǎn),是目前重要的研究方向[88-90]。而在新冠檢測(cè)領(lǐng)域中,復(fù)旦大學(xué)團(tuán)隊(duì)開發(fā)的新型微機(jī)電檢測(cè)系統(tǒng)為這類問題提供了另一套解決方案,該檢測(cè)系統(tǒng)能夠?qū)ξ磾U(kuò)增樣品實(shí)現(xiàn)4min精準(zhǔn)、微量的新冠檢測(cè),不僅具有高度集成、高效率、低成本及便攜的特性,還表現(xiàn)出商業(yè)化的可行性[91]。這一新冠檢測(cè)領(lǐng)域的成果為煙草病毒即時(shí)檢測(cè)系統(tǒng)的開發(fā)提供了新的思路。

    4 結(jié)論

    (1)“煙草病毒”領(lǐng)域研究起步很早,發(fā)文量總體表現(xiàn)為穩(wěn)步增長(zhǎng),但在近幾年增長(zhǎng)放緩。美國(guó)與中國(guó)的發(fā)文量占據(jù)前兩名。其中中國(guó)的發(fā)文量增速最快,近3年發(fā)文量占比已超總量(中、英文文獻(xiàn)總和)的6成。(2)本領(lǐng)域的核心目標(biāo)是病毒防治,保證農(nóng)業(yè)安全生產(chǎn)。國(guó)外關(guān)注的主題沒有顯著的偏好,在病毒感染過程、發(fā)病機(jī)理等方面的成果較多。國(guó)內(nèi)關(guān)注的主題主要在病毒防治方法、病毒檢測(cè)方面,并且成就卓越,然而在煙草病毒致病機(jī)制方面的探索起步較晚,相比于國(guó)際前沿水平還有一定的進(jìn)步空間。(3)根據(jù)知識(shí)圖譜分析,煙草病毒病害調(diào)查、煙草病毒致病機(jī)制研究、抗病毒分子篩選與合成、抗病毒煙草品種選育、病毒檢測(cè)方法開發(fā)等是本領(lǐng)域的熱點(diǎn)研究方向,后續(xù)可加強(qiáng)對(duì)這些主題的探索與突破。

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    Knowledge mapping analysis of tobacco virus research based on bibliometrics

    ZHAO Yuting1*, XIE Yanfen1, ZENG Chaoyi2, PENG Ruiqi1, LIAO Yong1

    1 Production and Management Section, Luliang Branch of Qujing Tobacco Company, Qujing, 655600, China;2 School of Food and Biological Engineering, Xihua University, Chengdu, 610039, China

    This paper aims to uncover and organize the development lineage and overall research framework in the field of tobacco viruses, with a view to providing references for innovation and breakthroughs in the prevention and controls of tobacco virus diseases.Bibliometric tools such as CiteSpace were used to analyze the data of tobacco virus literature in two databases, CNKI and Web of Science. This analysis covered dimensions such as the number of publications, country/region distribution, and thematic knowledge maps, thus unveiling the research characteristics of the tobacco virus domain.(1) The overall publication volume in this field is on the srise, with the United States and China dominating in terms of number of articles. In particular, China has shown the fastest growth in publication growth rate, especially in the last three years, where the number of publications accounted for more than 60% of the total volume (sum of Chinese and English publications). (2) Foreign research topics are more focused on the virus infection process and pathogenesis, while Chinese studies are more concerned with virus control methods and virus detection. (3) Hot research directions in this field include: tobacco virus disease investigation, tobacco virus pathogenic mechanism, antiviral agents screening and synthesis, breeding of antiviral tobacco varieties, and development of virus detection methods.

    tobacco; tobacco virus; bibliometrics; knowledge mapping; CiteSpace; HistCite

    . Email:zyt94817@163.com

    趙宇婷(1994—),碩士,主要研究方向?yàn)闊煵莶《緦W(xué),Email:zyt94817@163.com

    2022-03-29;

    2023-09-07

    趙宇婷,謝晏芬,曾朝懿,等. 基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的煙草病毒研究知識(shí)圖譜分析[J]. 中國(guó)煙草學(xué)報(bào),2024,30(1). ZHAO Yuting, XIE Yanfen, ZENG Chaoyi, et al. Knowledge mapping analysis of tobacco virus research based on bibliometrics [J]. Acta Tabacaria Sinica, 2024, 30(1). doi:10.16472/j.chinatobacco.2022.T0051

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