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    生物阻抗譜參數(shù)提取算法研究

    2024-01-10 10:08:32任朝輝
    關(guān)鍵詞:等效電路細胞膜遺傳算法

    任朝輝,張 博

    (楊凌職業(yè)技術(shù)學(xué)院,陜西咸陽)

    概述

    生物組織的電特性即生物領(lǐng)域中的“靜鉀動鈉”概念,簡單來講,生物體內(nèi)的組織、細胞在進行正常生理活動時,由大腦下達行動“指令”,這一指令表現(xiàn)在生物體內(nèi),就是一系列的電信號[4]。細胞在靜態(tài)電位時,主要由體內(nèi)的鉀離子控制,而在動作電位時,主要由體內(nèi)的鈉離子控制,陽離子的內(nèi)流或者外流導(dǎo)致了細胞膜兩側(cè)存在電位差,這一差值就產(chǎn)生了生物組織的電特性。

    眾所周知,細胞是構(gòu)成生物的最小單位。在不同的生理及病理狀況下,生物細胞具有不同的電特性,細胞膜、細胞內(nèi)液、細胞外液構(gòu)成單個細胞的等效電路模型[5]。基于此,生物阻抗測量得以實現(xiàn)。在低頻電流下,激勵無法穿過細胞膜,生物細胞呈介電特性;在高頻電流下,激勵穿過細胞膜,生物細胞呈導(dǎo)電特性[6]。研究生物細胞的電特性,特別是其隨頻率的變化特征,將有助于準確辨識生物組織的功能狀態(tài)。

    利用Cole-Cole 生物電阻抗特征方程可以有效的對生物阻抗參數(shù)提取和分析。查閱文獻之后發(fā)現(xiàn),生物阻抗參數(shù)提取多采用Cole-Cole 擬合的方式。

    盡管復(fù)阻抗- 頻率函數(shù)呈現(xiàn)出顯著的非線性特性,傳統(tǒng)的方法如梯度下降法卻無法達到預(yù)期的擬合精度。非線性最小二乘法在執(zhí)行擬合任務(wù)時,常常遇到無法收斂或僅能找到局部解的問題,這種現(xiàn)象通常是由于初始值的選擇不當所導(dǎo)致的。此外,該方法對于等效電路擬合的適應(yīng)性也存在一定問題。相比之下,遺傳算法憑借其隨機搜索能力,能夠擺脫初始值的影響,因此在初始值估計方面表現(xiàn)得更為優(yōu)越。本文計劃采用遺傳算法(GA)與非線性最小二乘法(NLS)相結(jié)合的方式(NLS-GA)進行等效電路擬合。通過非線性最小二乘程序進行迭代求解再加上遺傳算法提供的參數(shù)初始值,收斂結(jié)果為最終的電路擬合參數(shù)。

    1 生物阻抗譜檢測方法

    單個細胞在通入低頻交流電時,低頻電流被細胞膜阻斷而無法通過,此時細胞膜處于高阻態(tài)。當不斷增加激勵電流的大小時,高阻態(tài)逐漸消失,此時電流可以輕松穿過[2]。圖1 所示為生物細胞的三元件等效電路模型。由于細胞膜存在介電特性,所以加入一個與細胞膜并聯(lián)的等效電容Cm來模擬真實的細胞狀態(tài),當電流達到一定頻率時,就可以輕松穿過細胞膜,Re在這里用來模擬近似細胞外的電阻值,Ri在這里用來模擬近似細胞內(nèi)的電阻值[3]。

    圖1 理想狀態(tài)下的生物細胞三元件等效模型

    通常情況下,當電極接觸到細胞懸浮液時,會產(chǎn)生一個具有相同電量且符號相反的過剩電荷,這種現(xiàn)象被稱為雙電層(Electrical Double Layer,EDL)。為了模擬實際生物測量的環(huán)境,我們需要引入等效電阻和等效電容來構(gòu)建等效電路模型,修正后的檢測等效電路如圖2 所示。

    圖2 細胞等效電路模型

    在對等效電路進行擬合時,主要涉及到5 個待估參數(shù)作為遺傳算法的決策分量,分別是:Cdl:雙電層電容;Rdl:雙電層電阻;CM:細胞膜電容;Rcyto:細胞質(zhì)電阻;RS:細胞外液電阻,圖中ZD表示細胞檢測阻抗。

    生物組織的復(fù)阻抗特性與頻率之間的關(guān)系通過Cole-Cole 圖表得以呈現(xiàn)。對于精確地識別和分析生物組織的電學(xué)屬性,一種常見的策略是利用Cole-Cole擬合技術(shù)對阻抗譜進行分析,從而揭示出生物組織內(nèi)電阻原件和電容原件的組成元素如何隨著頻率的變化而調(diào)整其行為模式。等效電路的Cole-Cole 模型為第四象限內(nèi)的一段圓弧,圓心在第一象限。如圖3 所示。

    圖3 Cole-Cole 等效模型

    構(gòu)建生物阻抗特征方程為我們提供了一個有力的理論框架,用于獲取并解析生物阻抗參數(shù),科爾擬合法多用于生物阻抗參數(shù)的提取??茽栐碜鳛樯镒杩棺V測量的基礎(chǔ),其建立起來的特征方程,為生物組織的特征參數(shù)提取提供了良好助力。由于生物組織存在介電特性,此時若對生物組織外加激勵電流,那么節(jié)點參數(shù)會隨著激勵頻率的改變而發(fā)生改變,即Schwan[1]提出的生物組織測量過程中存在三種頻率散射現(xiàn)象,如圖4 所示。

    圖4 生物組織頻率特性曲線

    2 基于遺傳算法的初始值估計

    利用等效電路模型,我們能夠構(gòu)建一個包含所有元件參數(shù)作為求解變量的復(fù)阻抗- 頻率響應(yīng)函數(shù)模型。然而,這個模型呈現(xiàn)出顯著的非線性特性,因此需要運用非線性最小二乘法來處理這些復(fù)雜的曲線。此外,我們還借助了遺傳算法(GA)來估算初始值,從而進一步降低擬合誤差。

    2.1 遺傳算法

    阻抗參數(shù)出發(fā)點是從滿足約束條件的可行解中優(yōu)選出使得最符合目標函數(shù)要求的解,在此處即最小的解。除此之外,遺傳算法對全局變量進行最優(yōu)檢索的方式在最優(yōu)解擬合方面具有更大的優(yōu)勢,具體描述為求解目標函數(shù)極值(最小值)的數(shù)學(xué)模型:

    式中:向量X=[x1,x2,...,xn]T為所要求解的擬合參數(shù);(fx)為目標函數(shù);U 為可行解空間。

    2.2 適應(yīng)度函數(shù)模型建立

    在得到生物組織等效電路之后,可以根據(jù)復(fù)阻抗- 頻率數(shù)學(xué)模型建立相應(yīng)的遺傳算法目標函數(shù)模型和適應(yīng)度評價指標,在對等效電路進行擬合求解時,建立如下標函數(shù)模型:

    式中:z'和z"分別為通過測量得到的阻抗譜數(shù)據(jù)的實部和虛部標準值;z'和z"分別為通過遺傳算法擬合得到的實部和虛部擬合值。

    尋找等效電路擬合的最優(yōu)參數(shù)估計x 的過程,實際上是通過計算一系列目標函數(shù)來達到這一目的。根據(jù)公式(2),我們知道目標函數(shù)的值必須大于零,而且個體目標函數(shù)值越小,其對應(yīng)的參數(shù)估計值x 就越精確,這意味著這個參數(shù)的適應(yīng)程度更高。因此,我們可以將適應(yīng)度函數(shù)模型定義為:

    Q 的值越大,F(xiàn)(x)的個體適應(yīng)程度越小;Q 的值越小,F(xiàn)(x)的個體適應(yīng)程度越大。

    在建立了相應(yīng)的適應(yīng)度評價指標后,在每次演化計算之前,對每個個體適應(yīng)度進行計算,然后通過選擇算子對個體進行優(yōu)選。

    3 非線性最小二乘擬合

    最小二乘擬合的基本原理就是使得實驗測量值和預(yù)測值之間的誤差平方和最小,從而找到最佳函數(shù)匹配模型。非線性最小二乘問題可以定義為:

    式中:x=[x1,x2,...,xn]T為需要求解的擬合參數(shù);函數(shù)F(x)為需要求解的代價函數(shù);F(x*)為函數(shù)預(yù)測值;a為實驗測量值;e(x)為二者之差;x*為代價函數(shù)的全局最優(yōu)點。若x*為局部最優(yōu)點,則在x*的搜索區(qū)域δ處,滿足如下條件:

    3.1 目標函數(shù)模型建立

    在生物阻抗譜研究領(lǐng)域,一旦構(gòu)建了等效電路模型,我們就可以通過角頻率和m 個電路元件的特性x1,x2,…,xm來描述阻抗z。具體來說,阻抗z 可以被表示為z(ω,x)的形式。為了實現(xiàn)生物等效電路的最小二乘擬合,我們的目標是找到m 個參數(shù)的最佳估計值,從而使得目標函數(shù)F 達到最小值,最終可建立如下目標函數(shù)模型:

    3.2 高斯- 牛頓求解

    對式(7)進行高斯- 牛頓求解。在對生物電阻抗譜數(shù)據(jù)擬合過程中,由于參數(shù)初始值x0l已由遺傳算法給出,與預(yù)測真值之間較為接近,所以在進行高斯-牛頓求解時常把非線性誤差函數(shù)轉(zhuǎn)化為線性函數(shù)。令該擬合參數(shù)初始值x0l和預(yù)測真值xl的差值Δl=xl-x0l,最終通過不停迭代計算尋找函數(shù)的局部最小值,所以誤差函數(shù)fRe和fIm(x)可以近似為:

    雅可比矩陣JRe(x)和JIm(x)為函數(shù)fRe和fIm(x)的一階導(dǎo)數(shù),對Δl 進行求解,使得目標函數(shù)變?yōu)槭剑?0):

    為了求解目標函數(shù)極值,對F(x+Δx)進行求導(dǎo),并使得F'(x+Δx)=0,可求得:

    因此,對于生物阻抗譜系統(tǒng)而言,在建立了生物組織對應(yīng)的等效電路函數(shù)模型之后,對函數(shù)模型進行高斯- 牛頓求解并設(shè)定擬合參數(shù)的初始值,就可以通過方程(11)計算出目標函數(shù)初始估計值和最優(yōu)估計之差Δl。將求解結(jié)果代入下式,即可求得估算值:

    在混合算法的設(shè)計中,遺傳算法已經(jīng)提供了足夠優(yōu)良的初始參數(shù)估計,且滿足一定的收斂條件。迭代收斂條件定義為:

    當最終結(jié)果滿足最終收斂條件,當前計算所得的估計值近似等于真實值。

    4 擬合實驗及結(jié)果分析

    為了比較非線性最小二乘法(NLS)、遺傳算法(GA)以及它們的結(jié)合體——混合算法(GA-NLS)在數(shù)據(jù)擬合方面的表現(xiàn),我們選擇了一個特定的細胞等效電路模型作為測試對象。首先,我們構(gòu)建了一個待測電路,該電路由預(yù)先確定的標準電阻和電容組成。然后,利用阻抗分析儀獲取了阻抗譜的數(shù)據(jù),并通過計算平均值來減小隨機誤差的影響。接下來,我們使用這三種算法對阻抗數(shù)據(jù)進行了多次處理,目的是讓擬合結(jié)果具備統(tǒng)計學(xué)的有效性。

    最后,我們分別使用這三類算法對細胞等效電路的阻抗譜數(shù)據(jù)進行了擬合,并且希望找到一個能夠盡可能地使擬合數(shù)據(jù)與測量數(shù)據(jù)相匹配的擬合算法。因此,我們主要依賴于殘差平方和來評估擬合算法的精確度。擬合情況對比如圖5 所示。

    圖5 不同算法擬合效果

    不同算法標擬合結(jié)果統(tǒng)計如表1 所示。

    表1 不同算法擬合結(jié)果對比

    從圖5 可以看出,在單獨使用NLS 擬合時,由于參數(shù)初始值具有隨機性,存在較大的擬合誤差。在單獨使用GA 擬合的情況下,雖然最終的擬合結(jié)果相比于NLS 精度要高很多,但最終的擬合精度仍然要比經(jīng)過進一步NLS 迭代的要小。且從表1 可以看出,NLS-GA 數(shù)據(jù)變化總量SS 最小,Significance F 的值也最小,這表明NLS-GA 的值更有意義,更貼近實際測量值。

    5 結(jié)論

    本文在生物組織等效模型的基礎(chǔ)上,提出了一種阻抗譜參數(shù)提取方法,采用遺傳算法(GA)提供參數(shù)初始值,結(jié)合非線性最小二乘法(NLS)迭代的混合方式(GA-NLS)進行阻抗譜參數(shù)提取。實驗結(jié)果表明,NLS-GA 在等效電路擬合方面更加接近實際測量值,其所得數(shù)據(jù)更具有意義。

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