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    文心蘭側(cè)花瓣轉(zhuǎn)錄組分析與調(diào)控唇瓣化變異相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的挖掘

    2024-01-01 00:00:00曾思嫻余讓才范燕萍
    熱帶作物學(xué)報(bào) 2024年5期
    關(guān)鍵詞:差異表達(dá)基因

    關(guān)鍵詞:文心蘭;唇瓣化;轉(zhuǎn)錄組測(cè)序;差異表達(dá)基因

    中圖分類號(hào):S432.1 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

    蘭科植物因其獨(dú)特的花型倍受人們喜愛(ài),MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子是花的起始和發(fā)育過(guò)程中的關(guān)鍵調(diào)控成分,在參與花器官的發(fā)育、開(kāi)花時(shí)間的調(diào)節(jié)等過(guò)程中均起著重要作用[1]。ABCDE 模型由MADS-box 基因家族中的五類同源基因組成,這些基因通過(guò)相互作用共同決定花器官身份[2]。因此,大多數(shù)關(guān)于蘭花花器官發(fā)育的研究都集中在這些ABCDE 基因上,而關(guān)于調(diào)控蘭花唇瓣發(fā)育的其他轉(zhuǎn)錄因子及下游相關(guān)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)仍不清晰,因此,探究其他相關(guān)調(diào)控機(jī)制對(duì)蘭花植物分子育種具有重要意義。

    文心蘭是蘭科文心蘭屬植物,因其獨(dú)特的花型和艷麗的顏色是世界上具有較高觀賞價(jià)值的切花品種[3]。在長(zhǎng)期的文心蘭生長(zhǎng)進(jìn)化過(guò)程中,極易產(chǎn)生花型多樣性,這種花型多樣性主要體現(xiàn)在唇瓣的變化上,使其具有更高的觀賞價(jià)值和生物學(xué)價(jià)值[4]。因此揭示文心蘭唇瓣多樣性形成機(jī)制顯得極其重要?!盎ū幻艽a模型”是目前被廣泛接受的蘭花花器官發(fā)育模型, 該模型中, 不同MADS-box 基因分別組成唇瓣復(fù)合物和萼片/花瓣復(fù)合物,這2 種蛋白復(fù)合物相互競(jìng)爭(zhēng)決定蘭花花器官身份形成[5],而文心蘭花瓣形態(tài)結(jié)構(gòu)多樣化的其他調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究仍鮮有報(bào)道。本研究以檸檬綠文心蘭(Oncidium. flexuosum‘Honey Angel’)和其側(cè)花瓣唇瓣化變異種(突變體)為材料,對(duì)2 種側(cè)花瓣進(jìn)行RNA 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序, 通過(guò)MADS-box 及其他轉(zhuǎn)錄因子的差異表達(dá)挖掘調(diào)控文心蘭唇瓣化變異關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,為建立文心蘭唇瓣化變異調(diào)控關(guān)系網(wǎng)絡(luò),培育花型獨(dú)特蘭花新品種奠定基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    供試材料為種植在華南農(nóng)業(yè)大學(xué)花卉研究中心種質(zhì)資源圃中生長(zhǎng)健壯的檸檬綠文心蘭側(cè)花瓣發(fā)生唇瓣化變異種(突變體),對(duì)照為檸檬綠文心蘭(圖1)。對(duì)2種側(cè)花瓣表皮細(xì)胞觀察,發(fā)現(xiàn)在8 mm 花蕾時(shí)期表皮細(xì)胞數(shù)目差異最大,因此在9月和10 月采集8 mm 花蕾并分離其側(cè)花瓣迅速置于液氮中凍存,然后保存于–80 ℃冰箱,用于后續(xù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及相關(guān)試驗(yàn)。

    1.2 方法

    1.2.1 總RNA 提取、文庫(kù)構(gòu)建與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(1)總RNA 提取。使用天根多糖多酚試劑盒(QIAGEN, Germany)提取檸檬綠文心蘭和唇瓣化變異種的側(cè)花瓣組織樣品的總RNA,并檢測(cè)其總量和完整性。RNA 提取與檢測(cè)均委托北京諾禾致源科技股份有限公司完成。

    (2)文庫(kù)構(gòu)建、質(zhì)檢與測(cè)序。選取符合質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的總RNA 通過(guò)Oligo(dT)磁珠富集帶有polyA 尾的mRNA。隨后在NEB FragmentationBuffer 中用二價(jià)陽(yáng)離子將得到的mRNA 隨機(jī)打斷,按照NEBNext? Ultra? RNA Library Prep Kitfor Illumina?試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行cDNA 文庫(kù)的構(gòu)建。文庫(kù)構(gòu)建完成后,使用Qubit 2.0 Fluorometer熒光分光光度計(jì)進(jìn)行初步定量,隨后使用Agilent2100 bioanalyzer 生物分析儀對(duì)文庫(kù)的insert size進(jìn)行檢測(cè),通過(guò)RT-qPCR 對(duì)文庫(kù)有效濃度進(jìn)行準(zhǔn)確定量,以保證文庫(kù)質(zhì)量。把不同文庫(kù)按照有效濃度及目標(biāo)下機(jī)數(shù)據(jù)量的需求pooling 后,使用Illumina NovaSeq 6000(Illumina,USA)測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。

    1.2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)分析 (1)數(shù)據(jù)質(zhì)控與轉(zhuǎn)錄本拼接。為了保證數(shù)據(jù)分析的質(zhì)量和可靠性,將測(cè)序獲得的原始數(shù)據(jù)(raw reads)進(jìn)行過(guò)濾,去除帶接頭reads、含N 堿基的reads、低質(zhì)量reads(Q 值lt;20),經(jīng)過(guò)原始數(shù)據(jù)過(guò)濾、測(cè)序錯(cuò)誤率檢查、GC 含量分布檢查,獲得后續(xù)分析使用的高質(zhì)量clean reads。使用Trinity 程序?qū)lean reads進(jìn)行拼接, 對(duì)拼接獲得的轉(zhuǎn)錄本去除冗余以Corset 層次聚類后得到最長(zhǎng)Cluster 序列進(jìn)行后續(xù)分析。

    (2)unigene 功能注釋。得到拼接轉(zhuǎn)錄本后,將轉(zhuǎn)錄本通過(guò)NCBI Blastx 后比對(duì)到蛋白質(zhì)的7 個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)[Nr、Nt、Pfam、KOG、Swissprot、KEGG、GO,(E-value≤0.000001)],獲得與目標(biāo)序列相似度最高的蛋白質(zhì),并對(duì)其unigenes 進(jìn)行功能注釋。

    1.2.3 差異表達(dá)基因篩選及富集分析 利用RSEM(RNA-seq by Expectation Maximization)軟件[6]對(duì)基因在不同樣本之間進(jìn)行定量分析,并使用DESeq2 軟件對(duì)原始的read count 進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理, 通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)模型進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn)概率(P-value)計(jì)算后進(jìn)行FDR 矯正獲得padj值。為了得到顯著差異表達(dá)基因,將篩選條件設(shè)為padjlt;0.005 且差異倍數(shù)|log2(fold change)|gt;1。分別使用GOseq[7]和KOBAS 軟件進(jìn)行差異表達(dá)基因的GO 和KEGG 的富集分析,當(dāng)padjlt;0.05 時(shí),為顯著富集。

    1.2.4 差異表達(dá)基因的RT-qPCR 驗(yàn)證 以檸檬綠文心蘭及其唇瓣化變異種為材料,基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,篩選出與唇瓣變異相關(guān)的差異轉(zhuǎn)錄因子基因進(jìn)行RT-qPCR 驗(yàn)證。提取8 mm 花蕾期檸檬綠和唇瓣化變異種文心蘭的側(cè)花瓣的RNA,利用湖南艾克瑞生物工程有限公司的Evo M-mlV反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA 單鏈。利用Primer Premier5.0 軟件設(shè)計(jì)引物,委托上海生物工程有限公司合成引物。RT-qPCR 反應(yīng)體系和程序按照Hieff?qPCR SYBR Green Master Mix(Low Rox Plus)試劑盒操作說(shuō)明進(jìn)行,參考文心蘭屬植物相關(guān)研究以Actin 為內(nèi)參基因[8],通過(guò)Applied BiosystemsABI7500 熒光定量PCR 儀檢測(cè)10 個(gè)相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因的相對(duì)表達(dá)量,每個(gè)樣品設(shè)置3 個(gè)生物學(xué)重復(fù),反應(yīng)結(jié)束后確認(rèn)擴(kuò)增曲線和熔解曲線,使用2-ΔΔCT 法計(jì)算相關(guān)基因在不同樣品中的表達(dá)情況。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序質(zhì)量分析

    取檸檬綠文心蘭和唇瓣化變異種8 mm 花蕾時(shí)期側(cè)花瓣進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。測(cè)序共獲得46 436 745個(gè)raw reads,原始數(shù)據(jù)過(guò)濾后獲得45 525 415 個(gè)高質(zhì)量clean reads。經(jīng)質(zhì)量評(píng)估,數(shù)據(jù)整體測(cè)序錯(cuò)誤率不超過(guò)0.03%,Q20 堿基百分比(測(cè)序錯(cuò)誤率不小于1%)分布在96.61%~98%之間,Q30(測(cè)序錯(cuò)誤率小于0.1%)介于91.63%~94.25%之間,GC 含量介于45.92%~46.67%之間,表明測(cè)序質(zhì)量較好,可用于后期數(shù)據(jù)分析。

    2.2 轉(zhuǎn)錄組unigenes 功能注釋

    將高質(zhì)量clean reads 進(jìn)行拼接后共獲得52253 個(gè)unigenes,利用NR、Swissport、PFAM、GO、NT、KO、KOG 等7 個(gè)常用蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)及基因功能注釋,根據(jù)比對(duì)蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)的序列同源性結(jié)果可知,至少在1 個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)注釋成功的unigenes 有36 118,占69.12%,其中與NR數(shù)據(jù)庫(kù)匹配的unigenes 數(shù)目最多為31 828 條,占60.91%;其次為Swissport 數(shù)據(jù)庫(kù)23 174 條(占44.34%),PFAM 數(shù)據(jù)庫(kù)21 369 條(占40.89%),GO 數(shù)據(jù)庫(kù)21 367 條(占40.89%),NT 數(shù)據(jù)庫(kù)20830 條(占39.86%),KO 數(shù)據(jù)庫(kù)10 523 條(占20.13%),KOG 數(shù)據(jù)庫(kù)6465 條(占12.37%);在以上7 個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中都注釋成功的unigenes 數(shù)目為3549 條,占6.79%。

    2.3 文心蘭側(cè)花瓣差異表達(dá)基因分布

    對(duì)2 種側(cè)花瓣的unigenes 表達(dá)量進(jìn)行比較,以|log2(fold change)|≥1 且padjlt;0.05 作為篩選基準(zhǔn),在2 種側(cè)花瓣中共檢測(cè)到差異表達(dá)基因(differentially expressed gene, DEG)3120 條,其中與檸檬綠文心蘭相比,在突變體側(cè)花瓣中上調(diào)表達(dá)的DEG 有1526 條,下調(diào)表達(dá)的DEG 有1594條(圖2)。

    2.4 差異表達(dá)基因的GO功能分析

    將檢測(cè)到的DEG 進(jìn)行GO 功能富集分析,以注釋其生物學(xué)功能。共有1537 條差異表達(dá)基因注釋到細(xì)胞組分(cellular component, CC)、生物學(xué)過(guò)程( biological process, BP ) 和分子功能(molecular function, MF)3 個(gè)功能群組。其中差異表達(dá)基因更多富集在生物學(xué)過(guò)程功能中,主要途徑包括生物學(xué)過(guò)程功能中的碳水化合物代謝過(guò)程(carbohydrate metabolic process)、脂質(zhì)代謝過(guò)程(lipid metabolic process)和含核堿基化合物分解代謝過(guò)程( nucleobase-containing compoundcatabolic process);在細(xì)胞組分功能上,主要富集在核質(zhì)(nucleoplasm)和染色體(chromosome)中;分子功能中差異基因重點(diǎn)富集在氧化還原酶活性(oxidoreductase activity)和裂解酶活性(lyaseactivity)上(圖3)。

    2.5 差異表達(dá)基因的KEGG 富集分析

    將差異表達(dá)的基因進(jìn)行KEGG 富集分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在2 種側(cè)花瓣中有690 個(gè)差異表達(dá)的基因在KEGG 途徑中顯著富集,KEGG 富集的前20個(gè)途徑如圖4 所示,其中代謝途徑(metabolicpathways)、次生代謝物的生物合成(biosynthesisof secondary metabolites ) 和抗生素生物合成(biosynthesis of antibiotics)是富集差異表達(dá)基因個(gè)數(shù)較多的通路。

    2.6 文心蘭唇瓣化變異相關(guān)基因的挖掘與分析

    MADS-box 基因是一類廣泛存在于植物中且被證明在蘭花花器官發(fā)育中具有極其重要的調(diào)控作用。為了挖掘文心蘭唇瓣化變異相關(guān)調(diào)控基因,首先從差異表達(dá)基因中重點(diǎn)關(guān)注MADS-box轉(zhuǎn)錄因子,在該轉(zhuǎn)錄組中共挖掘5 個(gè)存在顯著差異( 以|log2(fold change)|gt;1 為篩選依據(jù)) 的MADS-box 基因(MADS1、MADS10、MADS11、MADS7、MADS5)。在植物中MADS-box 基因主要通過(guò)調(diào)節(jié)其他基因的轉(zhuǎn)錄來(lái)發(fā)揮作用[9]。因此,也對(duì)文心蘭的側(cè)花瓣轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果進(jìn)行其他轉(zhuǎn)錄因子的數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)存在差異表達(dá)的其他轉(zhuǎn)錄因子主要包括WRKY、TCP、NAC、MYB等(表1)。

    將MADS1、MADS10、MADS11、MADS7、MADS5、TCP1、TCP2、NAC1、MYB1 蛋白與其他物種同源蛋白序列構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),結(jié)果表明,MADS-box 蛋白與扇葉文心蘭(Erycina pusilla)的MADS-box 親緣關(guān)系最近,聚為一類,其次與鐵皮石斛(Dendrobium catenatum)親緣關(guān)系較近;NAC 與鐵皮石斛(Dendrobium catenatum)、蝴蝶蘭(Phalaenopsis equestris)親緣關(guān)系較近,聚為一類;TCP 與蝴蝶蘭(Phalaenopsis equestris)、蕙蘭(Cymbidium faberi)親緣關(guān)系最近,聚為一類;MYB 與建蘭(Cymbidium ensifolium)親緣關(guān)系最近,聚為一類,其次與扇葉文心蘭(Erycinapusilla)、鐵皮石斛(Dendrobium catenatum)親緣關(guān)系較近(圖5)。

    2.7 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序RT-qPCR驗(yàn)證

    為了驗(yàn)證文心蘭側(cè)花瓣轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的真實(shí)性,共選擇10 個(gè)差異表達(dá)基因,通過(guò)RT-qPCR的方法檢測(cè)其在花蕾期階段的側(cè)花瓣中的表達(dá)水平,與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的基因表達(dá)水平相比,二者變化趨勢(shì)一致(圖6),說(shuō)明本研究的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果具有良好的可靠性。

    3 討論

    本研究對(duì)檸檬綠文心蘭和其側(cè)花瓣唇瓣化變異種花蕾期側(cè)花瓣進(jìn)行RNA 測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組分析,共獲得52 253 個(gè)unigenes。利用NR、Swissprot、PFAM、GO、NT、KO、KOG 七個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)分別進(jìn)行基因功能注釋,分別注釋到31 828(60.91%)、23 174(44.34%)、21 369(40.89%)、21367(40.89%)、20 830(39.86%)、10 523(20.13%)、6465(12.37%)條unigenes,說(shuō)明本轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量較高,為文心蘭唇瓣發(fā)育相關(guān)研究及其分子育種提供理論基礎(chǔ)。

    檢測(cè)到差異表達(dá)基因3120 條,與檸檬綠文心蘭相比,在突變體側(cè)花瓣中上調(diào)基因有1526 條,下調(diào)基因有1594 條。其中1537 條差異表達(dá)基因經(jīng)GO 功能富集分析注釋到生物過(guò)程、細(xì)胞組分和分子功能3 個(gè)功能群組,經(jīng)KEGG 功能富集主要分布在代謝途徑、次生代謝物生物合成途徑等。表明文心蘭唇瓣化變異是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程,涉及多條代謝通路并受多種轉(zhuǎn)錄因子基因共同協(xié)調(diào)影響。

    現(xiàn)有的研究揭示了MADS-box 基因尤其是B類MADS-box 基因在蘭花花器官中的重要作用[10]。同時(shí),同源性蘭花Tepal(HOT)模型可以解釋蘭花MADS-box 基因如何調(diào)控花器官的發(fā)育并推測(cè)B 類基因中的不同基因與其他類別的MADS-box基因結(jié)合,以調(diào)節(jié)萼片、側(cè)花瓣和唇瓣身份的復(fù)雜性[11]。截至目前,B 類MADS-box 基因通過(guò)基因復(fù)制事件產(chǎn)生大量同源基因,有學(xué)者從南茜文心蘭中分離到4 個(gè)B 類MADS-box 基因(OMADS3、OMADS5、OMADS8 和OMADS9),這些基因相互作用形成同源或異源二聚體共同參與調(diào)控花被器官的形成,當(dāng)OMADS5 缺失而OMADS9 存在時(shí)會(huì)導(dǎo)致大唇瓣以及萼片/側(cè)花瓣唇瓣化突變體的產(chǎn)生[12]。除了B 類MADS-box 基因,“花被密碼”模型認(rèn)為B 類AP3 基因與E 類AGL6 基因相互組成萼片/側(cè)花瓣復(fù)合物和唇瓣復(fù)合物,這2 種蛋白復(fù)合物相互競(jìng)爭(zhēng)調(diào)控著蘭花復(fù)雜花被器官的形成[5]。在蝴蝶蘭唇狀花瓣突變體中,B 類MADS-box 基因(PeMADS4)在3 個(gè)唇瓣?duì)罨ò曛芯哂忻黠@的表達(dá)差異[13],說(shuō)明B 類MADS-box 基因在蝴蝶蘭唇瓣發(fā)育中具有重要調(diào)控作用。此外,建蘭花器官類型非常多樣,并通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察和轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)其花型突變體與MADS-box 基因的異常表達(dá)有關(guān)。在建蘭唇狀花瓣突變體以及唇狀萼片突變體中,CeAP3-3、CeAP3-4 和CeAGL6-2 基因的高表達(dá)導(dǎo)致了這種唇瓣突變表型[14]。上述研究結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了“花被密碼”模型及該模型在蘭科植物的廣泛適應(yīng)性。本研究通過(guò)對(duì)檸檬綠文心蘭和其唇瓣化變異種的側(cè)花瓣進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,從差異基因中篩選到5 個(gè)差異表達(dá)MADS-box 基因MADS1、MADS10、MADS11、MADS7、MADS5,其中MADS5為B 類基因且在突變體側(cè)花瓣中下調(diào)表達(dá),這與在南茜文心蘭中該基因負(fù)向調(diào)控唇瓣器官的形成結(jié)果一致,推測(cè)其可能參與組成文心蘭萼片/側(cè)花瓣復(fù)合物促進(jìn)檸檬綠文心蘭正?;ò甑男纬伞ADS1、MADS10、MADS11、MADS7 為E 類基因且在突變體側(cè)花瓣中上調(diào)表達(dá)(除MADS7),大量研究已經(jīng)證實(shí)MADS1(AGL6-2)參與唇瓣復(fù)合物組成并促進(jìn)文心蘭大唇瓣、蝴蝶蘭唇瓣?duì)罨ò晖蛔凅w及建蘭花瓣/萼片唇瓣化突變體的產(chǎn)生[13-15],其他E 類基因是否同樣參與唇瓣復(fù)合物的組成,或與其他調(diào)控元件一起共同參與文心蘭唇瓣器官的發(fā)育還需要通過(guò)大量實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)。

    盡管已有研究表明,MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子在蘭花花瓣及唇瓣多樣性的形成上扮演著重要的角色,但該基因家族是如何調(diào)控蘭花唇瓣多樣性形成機(jī)理尚不清楚。花器官身份基因的下游靶基因是花器官發(fā)生的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,直接或間接作用于花器官組織[16]。通過(guò)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)及整合多種生物學(xué)數(shù)據(jù)可以推斷出相關(guān)的基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。因此,本研究也對(duì)轉(zhuǎn)錄組中差異表達(dá)的其他轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)NAC、TCP、MYB、WRKY 等轉(zhuǎn)錄因子在文心蘭唇瓣發(fā)育過(guò)程中存在差異表達(dá)。有研究發(fā)現(xiàn),在玫瑰花瓣中NAC轉(zhuǎn)錄因子控制花朵花瓣中乙烯調(diào)節(jié)的細(xì)胞擴(kuò)張,為NAC 轉(zhuǎn)錄因子的功能提供新見(jiàn)解[17]。在小蘭嶼蝴蝶蘭中,挖掘到PeNAC67 是調(diào)控小蘭嶼蝴蝶蘭唇瓣發(fā)育的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,且該基因與唇瓣發(fā)育相關(guān)的MADS3 基因存在互作,揭示了蘭花唇瓣發(fā)育的分子機(jī)制[18]。將蝴蝶蘭TCP 轉(zhuǎn)錄因子PhCYCs 基因在夏堇中進(jìn)行異源表達(dá),發(fā)現(xiàn)蝴蝶蘭PhCYCs 基因在夏堇中能正常轉(zhuǎn)錄,且所有轉(zhuǎn)基因株系分株增多且花型改變,初步說(shuō)明蝴蝶蘭TCP 轉(zhuǎn)錄因子可能既參與花型發(fā)育又調(diào)控分枝過(guò)程[19]。植物MYB 轉(zhuǎn)錄因子除了在調(diào)控植物花青素生物合成上有重要貢獻(xiàn)外,也有研究發(fā)現(xiàn)該基因家族在水稻中會(huì)調(diào)控花器官和小穗的分化[20],而該轉(zhuǎn)錄因子在花卉植物花器官形成的相關(guān)調(diào)控作用尚未見(jiàn)報(bào)道。本研究通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析鑒定出的這些可能調(diào)控文心蘭唇瓣發(fā)育的其他轉(zhuǎn)錄因子基因是否會(huì)與MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子相互作用共同調(diào)控文心蘭唇瓣器官的發(fā)育仍需要通過(guò)大量實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步深入研究,以確定其具體功能和調(diào)控方式。

    因此,本研究對(duì)唇瓣化變異文心蘭側(cè)花瓣進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,獲得了大量差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子,為深入闡明這些轉(zhuǎn)錄因子的功能,完善文心蘭唇瓣發(fā)育相關(guān)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及分子機(jī)理奠定基礎(chǔ)。

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    生物信息學(xué)分析患有乳腺癌的乳腺球樣本中與自我更新相關(guān)的關(guān)鍵基因
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