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    基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接探討金銀花口服液防治新型冠狀病毒感染的作用機(jī)制

    2023-10-14 02:14:48柯昌虎吳亞晴丁雪茹黃慧敏嚴(yán)慧
    生物技術(shù)進(jìn)展 2023年5期
    關(guān)鍵詞:草素金銀花口服液

    柯昌虎 , 吳亞晴 , 丁雪茹 , 黃慧敏 , 嚴(yán)慧

    1.湖北醫(yī)藥學(xué)院附屬國藥東風(fēng)總醫(yī)院,湖北 十堰 442008;2.湖北醫(yī)藥學(xué)院藥學(xué)院,湖北 十堰 442000

    新型冠狀病毒感染(corona virus disease 2019,COVID-19,簡稱新冠感染)是由嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2,簡稱新冠病毒)引起的一種急性傳染病,在全球范圍內(nèi)迅速蔓延,已成為構(gòu)成嚴(yán)重威脅人類健康的突發(fā)公共衛(wèi)生事件[1]。初期,尚無治療COVID-19的特效藥物,治療方案主要是對癥支持。在臨床治療中發(fā)現(xiàn),中醫(yī)藥在COVID-19的治療中發(fā)揮了重要作用,它們能夠加快輕中度患者康復(fù),顯著降低感染患者由中度向重度發(fā)展比例,有效改善重癥和危重癥患者的呼吸困難,穩(wěn)定血氧飽和度,促進(jìn)疾病好轉(zhuǎn)[2]。中醫(yī)藥全面參與COVID-19的救治過程,使用中藥治療的患者達(dá)到90%,有效率為80%,且無不良反應(yīng)。相關(guān)研究證實(shí)中藥可以抑制病毒復(fù)制和轉(zhuǎn)錄,阻止SARS-CoV-2與宿主結(jié)合,并減輕病毒感染引起的細(xì)胞因子風(fēng)暴和免疫缺陷[3],從而有效發(fā)揮抗COVID-19的作用。

    金銀花口服液的主要藥效成分為金銀花?!渡褶r(nóng)本草經(jīng)》中指出金銀花性寒味甘,具有清熱解毒、涼血化瘀之功效。研究發(fā)現(xiàn),金銀花具有抗炎、抗病毒、調(diào)節(jié)非特異性免疫等作用[4],且是連花清瘟膠囊、雙黃連口服液、痰熱清注射液、清開靈顆粒等諸多COVID-19治療藥物的重要組分。湖北省衛(wèi)生健康委員會(huì)在2021、2022年均將金銀花口服液納入《湖北省新冠肺炎中醫(yī)藥防治方案》,作為兒童預(yù)防、隔離人群防治結(jié)合、無癥狀感染者治療的推薦用藥。臨床應(yīng)用證實(shí),金銀花口服液對187例COVID-19普通型患者的肺部病變具有較好地改善作用,并能夠縮短住院天數(shù)及病毒核酸轉(zhuǎn)陰時(shí)長[5]。金銀花湯劑中的MIR2911在體內(nèi)可以有效抑制新冠病毒復(fù)制,加速新冠患者轉(zhuǎn)陰[6]。金銀花聯(lián)合常規(guī)治療有利于COVID-19患者肺部CT、臨床癥狀和實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)的改善和臨床治愈率的提高,降低重癥轉(zhuǎn)化率[7]。現(xiàn)代藥理研究發(fā)現(xiàn),金銀花可以抑制SARS-CoV-2 Mpro活性,從而抑制病毒的侵入和復(fù)制[8];金銀花水提取物可以在體內(nèi)外誘導(dǎo)let-7a抑制腸道病毒71型(enterovirus 71,EV71)復(fù)制和發(fā)病,并對SARSCoV-2產(chǎn)生抑制作用[9]。盡管金銀花口服液在臨床上應(yīng)用廣泛,但其防治COVID-19的作用機(jī)制尚待明確。本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討金銀花口服液防治COVID-19的分子機(jī)制,以期為后續(xù)金銀花口服液的臨床應(yīng)用及深入研究防治COVID-19的機(jī)制提供參考。

    1 材料與方法

    1.1 金銀花口服液成分及靶點(diǎn)的篩選

    以“金銀花”為檢索詞,在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)收集金銀花口服液的活性成分,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和類藥性(drug-likeness,DL)≥0.18進(jìn)行成分篩選[10]。在PubChem數(shù)據(jù)庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)查找成分的SMILES格式,并將其導(dǎo)入Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫(http://www.swisstargetprediction.ch/)中,獲取可能性(probability)>0的靶點(diǎn)。

    1.2 COVID-19疾病相關(guān)靶點(diǎn)的篩選

    以“COVID-19”為檢索詞,分別在GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)、比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(comparative toxicogenomics database,CTD,http://ctdbase.org/)、治療靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(therapeutic target database,TTD,https://db.idrblab.net/ttd/)和DrugBank(https://www.drugbank.com/)中篩選COVID-19相關(guān)靶點(diǎn),其中GeneCards根據(jù)相關(guān)性評分(relevance score)篩選前500的靶點(diǎn),CTD根據(jù)推理得分(inference score)大小順序取前500個(gè)靶點(diǎn)。

    1.3 藥物-疾病共有靶點(diǎn)的篩選

    在Venny分析平臺(tái)(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)上傳金銀花口服液與COVID-19的靶點(diǎn),分別命名為藥物名稱、疾病名稱,風(fēng)格(style)選擇“顏色(colors)”,其余條件默認(rèn)。繪制韋恩圖,獲取二者的共有靶點(diǎn)。

    1.4 藥物-成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

    使用Cytoscape 3.8.2軟件,繪制金銀花口服液防治COVID-19的“藥物-成分-疾病-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖,使用軟件的Network Analyzer功能,以節(jié)點(diǎn)度值(degree)為指標(biāo)進(jìn)行可視化。

    1.5 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

    將共有靶點(diǎn)上傳至String數(shù)據(jù)庫(https://www.string-db.org/),選擇最低要求互動(dòng)得分(minimum required interaction score)>0.4的靶點(diǎn),下載TSV格式文件并導(dǎo)入Cytoscape 3.8.2軟件中進(jìn)行可視化。

    1.6 功能和通路富集分析

    在DAVID數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/)進(jìn)行基因本體論(gene ontology,GO)功能富集與京都基因和基因組百科全書(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,以P<0.05為閾值進(jìn)行篩選,探討金銀花口服液防治COVID-19的生物學(xué)過程和信號通路。

    1.7 分子對接

    利用TCMSP數(shù)據(jù)庫中獲取成分的mol2格式,從PDB數(shù)據(jù)庫(http://www.rcsb.org/)中下載對應(yīng)的蛋白受體的三維結(jié)構(gòu)。在AutoDock軟件中對關(guān)鍵蛋白和成分進(jìn)行對接分析,再應(yīng)用PyMOL軟件對生成的結(jié)果進(jìn)行可視化。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 藥物主要活性成分及作用靶點(diǎn)

    在TCMSP數(shù)據(jù)庫中共獲取236個(gè)金銀花口服液成分,經(jīng)OB≥30%和DL≥0.18篩選后獲得23個(gè)活性成分。在Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫中獲取probability>0的靶點(diǎn),去除重復(fù)靶點(diǎn)同時(shí)剔除沒有對應(yīng)靶點(diǎn)的成分,最后得到16種成分,對應(yīng)314個(gè)靶點(diǎn),具體結(jié)果見表1。

    表1 金銀花口服液的活性成分信息Table 1 Information on active components of Jinyinhua oral liquid

    2.2 疾病靶點(diǎn)檢索及藥物-疾病共有靶點(diǎn)篩選

    使用GeneCards、CTD、TTD和DrugBank數(shù)據(jù)庫篩選COVID-19的靶點(diǎn),依次得到靶點(diǎn)數(shù)目為500、500、65、23個(gè),合并去重后共獲得968個(gè)靶點(diǎn)。在Venny中繪制金銀花口服液防治COVID-19的韋恩圖,最后得到共有靶點(diǎn)88個(gè)(圖1)。

    圖1 金銀花口服液防治COVID-19的靶點(diǎn)匹配韋恩圖Fig. 1 Venn diagram of Jinyinhua oral liquid in the treatment of COVID-19

    2.3 藥物-成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

    將金銀花口服液中16個(gè)成分與共有靶點(diǎn)信息輸入Cytoscape 3.8.2軟件中,繪制“藥物-成分-靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)圖。從圖2可以看出,共有106個(gè)節(jié)點(diǎn),395條邊,其中黃色六邊形代表金銀花口服液,綠色菱形代表藥物成分,藍(lán)色圓形代表共有靶點(diǎn),紅色四邊形代表COVID-19。Degree排名前6位的成分依次是傘房花耳草素(degree=33)、金圣草素(degree=32)、木犀草素(degree=32)、亞油酸乙酯(degree=31)、山奈酚(degree=31)、槲皮素(degree=31),它們可能是金銀花口服液防治COVID-19的關(guān)鍵活性成分。

    2.4 蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

    在String數(shù)據(jù)庫中錄入金銀花口服液和COVID-19共有靶點(diǎn),物種設(shè)定為“Homo sapiens”,選取置信度>0.4的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù),游離靶點(diǎn)2個(gè),得到金銀花口服液防治COVID-19的靶點(diǎn)蛋白互作數(shù)據(jù),并進(jìn)行可視化分析。由圖3可知,共有97個(gè)節(jié)點(diǎn),1645條邊,緊密度(closeness centrality)平均值為0.5088,介度(betweenness centrality)平均值為0.0119,degree平均值為28.8214,大于平均度值靶點(diǎn)的有45個(gè)。Degree排名前10位的靶點(diǎn)為RAC-α絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine protein kinase,AKT1,degree=61)、類固醇受體輔助活化因子(steroid receptor coactivator,SRC,degree=49)、表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR,degree=45)、缺氧誘導(dǎo)因子1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF1A,degree=43)、過氧化物酶體增殖物激活受體γ(peroxisome proliferator activated receptor gamma,PPARG,degree=39)、基質(zhì)金屬蛋白酶9(human matrix metalloproteinase 9,MMP9,degree=39)、雌激素受體α(estrogen receptor alpha,ESR1,degree=36)、絲裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1,degree=35)、前列腺素內(nèi)過氧化物合成酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2,degree=34)、基質(zhì)金屬蛋白酶2(human matrix metalloproteinase 2,MMP2,degree=33),這些蛋白可能在治療COVID-19中具有重要的調(diào)控作用。

    圖3 靶點(diǎn)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)Fig. 3 Interaction network of targets

    2.5 GO功能分析結(jié)果

    GO分析結(jié)果顯示,共有399個(gè)條目(P<0.05),其中生物過程(biological process,BP)共275條,主要涉及細(xì)胞遷移的正調(diào)控、對外源性刺激的反應(yīng)、膠原蛋白分解代謝過程、平滑肌細(xì)胞增殖的正調(diào)控等;細(xì)胞組分(cell component,CC)共45條,主要涉及質(zhì)膜、胞液、細(xì)胞質(zhì)、膜筏等;分子功能(molecular function,MF)共79條,主要涉及腺嘌呤核苷三磷酸(adenosine triphosphate,ATP)結(jié)合、酶結(jié)合、蛋白酪氨酸激酶活性、跨膜受體蛋白酪氨酸激酶活性等。分別選取3個(gè)部分排名前10的條目繪制氣泡圖(圖4)。結(jié)果表明金銀花口服液通過調(diào)控多重生物學(xué)過程對COVID-19發(fā)揮防治的作用。

    2.6 KEGG通路分析結(jié)果

    KEGG分析結(jié)果顯示,共獲得108條信號通路(P<0.05),主要涉及HIF-1信號通路(11個(gè)靶點(diǎn))、化學(xué)致癌-受體激活(14個(gè)靶點(diǎn))、內(nèi)分泌抵抗(10個(gè)靶點(diǎn))、粘著斑(13個(gè)靶點(diǎn))、磷脂酰肌醇3激酶-絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(phosphati dylinositol 3 kinase-serine/threonine kinase,PI3K-Akt)信號通路(16個(gè)靶點(diǎn))、血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信號通路(8個(gè)靶點(diǎn))、松弛素信號通路(10個(gè)靶點(diǎn))、紅細(xì)胞白血病病毒致癌基因同源物(erythroblastic leukemia viral oncogene homolog,ErbB)信號通路(8個(gè)靶點(diǎn))、丙型肝炎(10個(gè)靶點(diǎn))、乙型肝炎(10個(gè)靶點(diǎn))、RAS相關(guān)蛋白1(RAS-associated protein 1,RAP1)信號通路(11個(gè)靶點(diǎn))、雌激素信號通路(9個(gè)靶點(diǎn))、催乳素信號通路(7個(gè)靶點(diǎn))、磷脂酶D信號通路(9個(gè)靶點(diǎn))、甲狀腺激素信號通路(8個(gè)靶點(diǎn))等。選擇前30條繪制氣泡圖(圖5),這些結(jié)果表明金銀花口服液的作用靶點(diǎn)分布于不同的信號通路中,并經(jīng)多途徑對COVID-19起到防治作用。

    圖5 金銀花口服液防治COVID-19的KEGG富集分析Fig. 5 KEGG pathway enrichment bubble chart of Jinyinhua oral liquid in the treatment of COVID-19

    2.7 分子對接結(jié)果

    從PDB數(shù)據(jù)庫中篩選受體AKT1、SRC、EGFR、HIF1A、PPARG、MMP9、ESR1、MAPK1、PTGS2、MMP2的蛋白三維結(jié)構(gòu),將其分別與配體傘房花耳草素、金圣草素、木犀草素、亞油酸乙酯、山奈酚、槲皮素在AutoDock中進(jìn)行分子對接,結(jié)合能小于0,則表明受體和配體可以進(jìn)行自發(fā)結(jié)合,結(jié)合能越小則越穩(wěn)定,金銀花口服液中10個(gè)靶點(diǎn)與6個(gè)活性成分之間均可以自發(fā)產(chǎn)生結(jié)合(圖6)。

    圖6 結(jié)合能熱圖Fig. 6 Heat map of binding energy

    受體MMP9與配體傘房花耳草素、金圣草素、木犀草素、亞油酸乙酯、山奈酚、槲皮素均可以產(chǎn)生較強(qiáng)的結(jié)合,結(jié)合能<-6.0 kcal·mol-1,如圖7所示。其中,MMP9與傘房花耳草素可以通過氨基酸殘基ALA242、GLU247、TYR248、VAL223產(chǎn)生5個(gè)氫鍵作用,與金圣草素可以通過氨基酸殘基ARG249、GLU227、PRO240產(chǎn)生4個(gè)氫鍵作用,與木犀草素可以通過氨基酸殘基ARG249、GLU227、PRO240產(chǎn)生5個(gè)氫鍵作用,與亞油酸乙酯可以通過氨基酸殘基ALA189、GLU227、HIS226、HIS230、HIS236產(chǎn)生5個(gè)氫鍵作用,與山奈酚可以通過氨基酸殘基ALA242、ARG249、GLU227產(chǎn)生4個(gè)氫鍵作用,與槲皮素可以通過氨基酸殘基ALA189、GLU227、LEU188、LEU243、TYR245、TYR248產(chǎn)生9個(gè)氫鍵作用。

    圖7 分子對接圖Fig. 7 Diagrams of molecular docking

    3 討論

    COVID-19是由新型冠狀病毒引發(fā)的傳染疾病,屬于中醫(yī)疫病范疇,病因?yàn)楦惺芤哽逯畾猓?1]。中醫(yī)藥“治未病”思想和辨證論治凸顯特色,未病先防、已病防變、病愈促康,深度介入新冠肺炎預(yù)防、救治、康復(fù)全過程,突出中醫(yī)藥在新冠肺炎疫情常態(tài)化防控工作中的優(yōu)勢作用[12]。金銀花口服液是臨床上常用的抗炎抗病毒中成藥,對機(jī)體起到清熱解毒、疏散風(fēng)熱的作用。臨床應(yīng)用證實(shí),金銀花口服液應(yīng)用于1例輕型或普通型COVID-19患者,不僅可以緩解癥狀,還可以明顯改善肺部影像[13]。在常規(guī)治療基礎(chǔ)上加用金銀花口服液,可以顯著緩解80例COVID-19患者的發(fā)熱等癥狀,并加速核酸轉(zhuǎn)陰[14]。本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對金銀花口服液防治COVID-19的機(jī)制進(jìn)行了探討。

    從金銀花口服液中篩選出傘房花耳草素、金圣草素、木犀草素、亞油酸乙酯、山奈酚、槲皮素等活性成分。其中,木犀草素、山奈酚、槲皮素屬于黃酮類化合物,具有抗炎、抗病毒、抗氧化、免疫調(diào)節(jié)等作用。研究發(fā)現(xiàn),木犀草素可以作為SARSCoV-2潛在的抑制劑[15],具有明顯地抑制奧密克戎毒株核酸復(fù)制的作用[16]。山奈酚可以通過抑制氧化應(yīng)激、誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(inducible nitric oxidesynthase,iNOS)和細(xì)胞間黏附分子-1(intercellular cell adhesion molecule-1,ICAM-1)通路,減輕膿毒癥引起的小鼠急性肺損傷[17];也對SARSCoV-2具有抑制活性,可以減少Vero E6細(xì)胞感染引起的細(xì)胞病變效應(yīng),能夠保護(hù)細(xì)胞免受病毒誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡[18]。槲皮素是一種對抗傳染性非典型肺炎(severe acute respiratory syndrome,SARS)和中東呼吸綜合征(Middle East respiratory syndrome,MERS)的活性劑,可以作用于ACE2、3CLpro、IL-6等,對COVID-19發(fā)揮治療作用[19]。例如,槲皮素通過抑制NLRP3炎癥小體成分和pro-IL-1β的產(chǎn)生,干擾NF-κB等信號通路,從而在COVID-19中發(fā)揮抗炎作用[20];對SARS-CoV-2具有中和作用,與血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2(angiotensinconverting enzyme 2,ACE2)具有良好的結(jié)合親和力,從而影響病毒S蛋白與ACE2受體的結(jié)合[21];可以通過抑制mTOR和HIF1A對SARS-CoV-2感染和COVID-19相關(guān)癌癥進(jìn)展發(fā)揮潛在作用[22]。因此,槲皮素被認(rèn)為是抑制COVID-19的病理生理過程中發(fā)揮作用的最重要的中藥成分之一,有望作為COVID-19治療的潛在藥物。

    經(jīng)金銀花口服液和COVID-19共有靶點(diǎn)交集篩選出AKT1、SRC、EGFR、HIF1A、PPARG、MMP9、ESR1、MAPK1、PTGS2、MMP2等靶點(diǎn)。其中,SARS-CoV-2感染后Akt/mTOR信號激活和HIF1A被抑制,Akt/mTOR/HIF-1信號級聯(lián)的失調(diào)可能是COVID-19治療干預(yù)的潛在目標(biāo)[23]。EGFR在SARS-CoV-2等許多病毒進(jìn)入細(xì)胞和復(fù)制中發(fā)揮重要作用,EGFR的參與影響COVID-19患者C-反應(yīng)蛋白(C-reactive protein,CRP)水平、D-二聚體水平以及重癥患者的肺纖維化的發(fā)展[24]。HIF1A可以抑制ACE2受體和跨膜蛋白酶絲氨酸2(transmembrane serine protease 2,TMPRSS2),并上調(diào)去整合素-金屬蛋白酶17(a disintegrin and metalloproteinase 17,ADAM17),HIF1A的蛋白靶點(diǎn)與促炎細(xì)胞因子表達(dá)的激活和隨后的炎癥過程有關(guān)[25]。PPARG(PPARγ)在脂肪組織和巨噬細(xì)胞中高度表達(dá),PPARG激動(dòng)劑通過靶向COVID-19患者的細(xì)胞因子風(fēng)暴可以作為炎癥和免疫調(diào)節(jié)藥物調(diào)節(jié)劑,通過增加ACE2的表達(dá)在COVID-19的治療中發(fā)揮有益作用[26]。MMP-9和MMP-2水平與COVID-19之間存在顯著的關(guān)聯(lián)。在COVID-19重癥患者中,MMP-2下調(diào)而MMP-9上調(diào),MMP-2與COVID-19疾病的死亡率獨(dú)立相關(guān),可能是COVID-19的潛在預(yù)后預(yù)測因子[27]。雌激素可以與ESR 1/2受體相互作用,通過抑制SARS-CoV-2感染引起的炎癥和免疫反應(yīng)來降低COVID-19患者的死亡率[28]。MAPK調(diào)節(jié)許多細(xì)胞過程,對免疫細(xì)胞功能至關(guān)重要。例如,miR-194-5p通過磷酸酶張力蛋白樣同源物(phosphatase and tensin homolog,PTEN)/AKT途徑靶向MAPK1的表達(dá),抑制心肌細(xì)胞凋亡和損傷[29]。

    經(jīng)GO功能分析獲取細(xì)胞遷移的正調(diào)控、對外源性刺激的反應(yīng)、膠原蛋白分解代謝過程、質(zhì)膜、胞液、細(xì)胞質(zhì)、ATP結(jié)合、酶結(jié)合、蛋白酪氨酸激酶活性等399條生物學(xué)過程。經(jīng)KEGG通路分析獲取HIF-1、化學(xué)致癌-受體激活、內(nèi)分泌抵抗、粘著班、PI3K-Akt、VEGF、松弛素、ErbB、丙型肝炎、乙型肝炎、Rap1等108條信號通路。其中,HIF-1調(diào)節(jié)可以控制連接缺氧和新冠肺炎的不同信號通路,HIF1A通過減少ACE2的表達(dá)來抑制SARS-CoV-2對肺上皮細(xì)胞的感染[30];在SARSCoV-2感染期間,開放閱讀框(open reading frames,ORF)3a誘導(dǎo)HIF1A,進(jìn)而加劇病毒感染和炎癥反應(yīng)[31]。PI3K/AKT/mTOR信號在細(xì)菌感染誘導(dǎo)的敗血癥以及冠狀病毒感染中的宿主反應(yīng)中至關(guān)重要,SARS-CoV-2 S蛋白在感染早期通過激活PI3K/AKT途徑抑制肺泡上皮Ⅱ型細(xì)胞的炎癥反應(yīng)[32]。SARS-CoV-2刺突假病毒(SCV-2-S)通過上調(diào)細(xì)胞內(nèi)活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平來抑制PI3K/AKT/mTOR途徑,促進(jìn)自噬反應(yīng),并引發(fā)感染細(xì)胞的炎癥反應(yīng)和凋亡[33]。VEGFR-2在SARS-CoV-2感染中表達(dá)上調(diào),VEGF/VEGFR-2相互作用與SARS-CoV-2相關(guān)的肺水腫有關(guān),以VEGF/VEGFR-2信號通路為靶點(diǎn)可能是治療新冠感染的潛在治療策略[34]。SARS-CoV-2可以刺激腸中產(chǎn)生過量的VEGF,細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶(extracellular regulated protein kinases,ERK)/VEGF可以作為腸道炎癥和COVID-19疾病進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)[35]。內(nèi)皮的血管通透性過高,導(dǎo)致COVID-19等各種疾病的發(fā)生和發(fā)展,Rap1可以調(diào)節(jié)血管內(nèi)皮通透性,可能是預(yù)防血管通透性過高相關(guān)疾病中血管屏障功能障礙的理想藥物靶點(diǎn)[36]。最后,通過分子對接發(fā)現(xiàn)藥物成分與靶點(diǎn)之間具有較強(qiáng)的結(jié)合作用,表明金銀花口服液具有防治COVID-19的功效。

    綜上所述,本研究以網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)聯(lián)合分子對接方法對金銀花口服液防治COVID-19的物質(zhì)基礎(chǔ)和分子機(jī)制進(jìn)行探索,發(fā)現(xiàn)金銀花口服液中的傘房花耳草素、金圣草素、木犀草素、山奈酚、槲皮素等成分可以作用于AKT1、SRC、EGFR、HIF1A、PPARG、MMP9、ESR1、MAPK1、PTGS2、MMP2等靶點(diǎn)通過多途徑防治COVID-19,從而為金銀花口服液的臨床應(yīng)用和機(jī)制研究提供了依據(jù)。然而由于數(shù)據(jù)庫的局限性,本研究基于分子水平的預(yù)測以及黃酮類成分對COVID-19的影響仍需進(jìn)一步的細(xì)胞或動(dòng)物實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。

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