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      金絲楸幼苗響應(yīng)鹽堿脅迫的生理和轉(zhuǎn)錄組分析

      2023-04-29 21:27:23郜新強王小艷焦偉等
      林業(yè)科學(xué)研究 2023年1期
      關(guān)鍵詞:差異表達基因轉(zhuǎn)錄組

      郜新強 王小艷 焦偉等

      關(guān)鍵詞:金絲楸;鹽堿脅迫;轉(zhuǎn)錄組;差異表達基因;耐鹽堿機制

      中圖分類號:S722 文獻標志碼:A 文章編號:1001-1498(2023)01-0166-13

      當(dāng)前,全球土地鹽堿化是人類面臨的主要生態(tài)危機之一,給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)帶來了巨大損失,嚴重威脅人類生存。據(jù)不完全統(tǒng)計,全球鹽堿地面積約為9.54×109hm2,約占可耕地面積的10%,而我國鹽堿地面積約有9.87×108hm2,位居世界第三,大部分為土壤鹽化和堿化同時存在的復(fù)合鹽堿地。目前,科學(xué)合理地開發(fā)和利用鹽堿地已經(jīng)成為我國農(nóng)業(yè)和林業(yè)發(fā)展過程中面臨的嚴峻挑戰(zhàn)。

      楸樹(Catalpa bungei C.A.Mey.)是我國特有的珍貴優(yōu)質(zhì)用材和園林觀賞樹種,屬于紫葳科(Bignoniaceae)梓屬(Catalpa)落葉喬木,其材質(zhì)好、用途廣、經(jīng)濟價值高,自古就有“木王”的美譽。金絲楸自然分布于河南、山東和安徽等省,是楸樹的一個地理變種,具有特殊金色紋理、生長快和干型通直的優(yōu)點,近年來得到大面積推廣。目前,楸樹的研究主要集中在嫁接繁育、組培快繁、扦插繁殖、遺傳轉(zhuǎn)化、遺傳多樣性分析等方面,關(guān)于楸樹耐鹽堿的研究鮮有報道。認識和了解楸樹耐鹽堿機制,對指導(dǎo)楸樹抗鹽堿遺傳改良和利用鹽堿地具有重要的理論價值和現(xiàn)實意義。

      近年來,轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(RNA-Seq)發(fā)展迅速,該技術(shù)無須了解物種基因組信息,彌補了非模式植物轉(zhuǎn)錄組研究中缺乏基因組信息的不足。利用轉(zhuǎn)錄組解析植物的抗逆機制已經(jīng)成為逆境研究的熱點之一。目前,利用RNA-Seq已進行了大麥、水稻、高粱等鹽脅迫的轉(zhuǎn)錄組分析,對這些植物響應(yīng)鹽脅迫機理的探討,加深了人們對植物耐鹽機制的認識。但是,通過轉(zhuǎn)錄組分析楸樹耐鹽堿分子機制的研究尚未見報道,僅有通過轉(zhuǎn)錄組分析楸樹雄性不育和不定根發(fā)育分子機制的極少數(shù)報道。

      本研究以金絲楸幼苗為試驗材料,分析不同鹽堿脅迫對金絲楸生長情況、光合及生理特性的影響,探究其耐鹽堿生理機制。進一步利用RNA-Seq,對處理組和對照組進行DEGs分析,在轉(zhuǎn)錄水平上對楸樹耐鹽堿機制進行探索,以期為楸樹應(yīng)答鹽堿脅迫的分子機制研究提供理論參考,同時也為重要基因的克隆及其功能研究等奠定基礎(chǔ)。

      1研究方法

      1.1試驗材料和設(shè)計

      試驗于安陽工學(xué)院溫室中進行,2020年6月,選擇生長健壯、形態(tài)一致、根系完整的金絲楸幼苗種子盆中,每盆種3株,共種40盆。正常栽培管理,60 d后進行鹽堿脅迫處理。分別設(shè)置中性鹽A(NaCl)、堿性鹽B(Na2CO3)、混合鹽堿C(NaCl:Na2CO3=1:1)3種鹽堿脅迫處理,總鹽濃度設(shè)置50、100、150、200 mmol·L-14個梯度,A1-A4、B1-B4、C1-C4分別代表從低到高的NaCl、Na2CO3、混合鹽堿脅迫的4個濃度,共12個處理濃度。2020年8月,將試驗材料隨機分成13組,每組3盆,每盆澆2.0 L相應(yīng)濃度的處理液,對照組澆等體積的清水。期間正常栽培管理,脅迫30 d后進行生長、光合及生理指標的測定。脅迫7d后取長勢一致且大小相近的4組(CK、A2、B2和C2)葉片用于轉(zhuǎn)錄組測序,生物學(xué)重復(fù)2次。

      1.2鹽堿脅迫危害調(diào)查

      各處理組在鹽堿脅迫后定期(14、21、28d)對植株和葉片進行危害調(diào)查,根據(jù)脅迫傷害癥狀,設(shè)置分級標準(圖1)如下:

      0級:枝條和葉片未見鹽堿脅迫危害癥狀;

      1級:有極少部分葉尖、葉緣和葉脈變黃,枝條外觀正常;

      2級:有少部分的葉尖、葉緣焦枯,枝條外觀正常;

      3級:約有1/4葉片有葉尖、葉緣焦枯和落葉現(xiàn)象;

      4級:約有1/2葉片枝枯、葉落直至死亡。

      1.3生長、光合及生理測定

      1.3.1新增株高和地徑測定 對照組和處理組均選擇3株進行編號,處理前用卷尺和游標卡尺測定株高和地徑,脅迫30d后,再次測定上述指標,計算凈生長量。

      1.3.2生物量測定 脅迫30 d后,取對照組和處理組編號植株的根和地上部稱其鮮質(zhì)量,80℃烘干至恒質(zhì)量,稱其干質(zhì)量,計算生物量(根干質(zhì)量+地上部干質(zhì)量)、根冠比(根干質(zhì)量/地上部于質(zhì)量)及生長脅迫指數(shù)(處理組植株干質(zhì)量,對照組植株干質(zhì)量)。

      1.3.3光合指標測定

      用SPAD-502Plus葉綠素儀測定葉綠素總量,EBA-PE1001高光效儀測定光合速率。

      1.3.4生理生化指標測定 用電導(dǎo)儀法測定相對電導(dǎo)率,用硫代巴比妥酸法測定MDA含量,用氮藍四唑法測定SOD酶活,用蒽酮顯色法測定可溶性糖含量,用酸性茚三酮法測定Pro含量。

      1.4轉(zhuǎn)錄組測序和分析

      1.4.1轉(zhuǎn)錄組測序 樣品經(jīng)過RNA抽提、純化、建庫后,基于Illumina HiSeq測序平臺進行雙末端測序。

      1.4.2測序讀長分析及拼接對原始數(shù)據(jù)進行過濾,將帶接頭、小于50 bp、平均質(zhì)量在Q20以下的Reads去除,得到高質(zhì)量序列(CleanReads),使用Trinity對Clean Reads進行De novo拼接得到轉(zhuǎn)錄本序列,挑選最長的轉(zhuǎn)錄本作為Unigene。

      1.4.3 Unigenes功能注釋、分類、代謝途徑分析以及表達量計算 用Blast對Unigenes進行NR、GO、KEGG、eggNOG、SwissProt和Pfam注釋;對所有Unigenes進行GO功能分析和KEGG代謝途徑分析。用轉(zhuǎn)錄組表達定量軟件RSEM,計算每個基因的FPKM值,來代表每個基因的表達水平。

      1.4.4差異表達基因分析 用DESeq對基因表達進行差異分析,篩選DEGs條件為:表達差異倍數(shù)|log2FoldChange|>1,顯著性P-value<0.05。然后將得到的DEGs再進行GO和KEGG分析。

      1.4.5轉(zhuǎn)錄因子分析 將蛋白質(zhì)序列與Plant TFDB數(shù)據(jù)庫比較,分析得到轉(zhuǎn)錄因子及其所屬家族信息。

      2結(jié)果與分析

      2.1不同鹽堿脅迫對金絲楸生長的影響

      不同鹽堿脅迫后,金絲楸均出現(xiàn)鹽堿脅迫危害癥狀。Na2CO3脅迫對葉片傷害較大,隨脅迫濃度和時間的增加,傷害等級增大,脅迫處理14 d,150 mmol·L-1時傷害等級達到3級,而200mmol·L-1時達到4級;而NaCl脅迫對葉片傷害較小,脅迫處理21 d,150 mmol·L-1時傷害等級達到2級,200 mmol·L-1時達到4級;混合鹽堿脅迫下葉片傷害介于Na2CO3和NaCl之間。

      不同鹽堿脅迫下,金絲楸的生長情況受到不同程度的影響(表1)。NaCl脅迫下,50mmol·L-1時新增株高被極顯著的抑制,且濃度越高抑制作用越顯著;Na2CO3脅迫對新增株高的影響較小,在50 mmol·L-1時新增株高顯著降低,且隨濃度增加株高極顯著降低;混合鹽堿脅迫對新增株高抑制作用最輕,但也都達到極顯著水平。此外,低濃度NaCl和Na2CO3脅迫對地徑有增粗作用,在50mmol·L-1NaCl脅迫下,新增地徑顯著增加,而在150、200 mmol·L-1不同鹽堿脅迫下,新增地徑均極顯著減小。

      植物在鹽堿脅迫下生物量的變化可直觀反映生長狀況(表1)。與對照組相比,NaCl和混合鹽堿處理組,50 mmol·L-1時地上部干質(zhì)量和鮮質(zhì)量都有增加,但隨濃度增加而下降;Na2CO3處理組地上部干質(zhì)量和鮮質(zhì)量隨著濃度增加而下降。根干質(zhì)量和鮮質(zhì)量只在50 mmol·L-1混合鹽堿處理組有增加,其它處理組都隨濃度增加而下降。生物量的變化趨勢與地上部干質(zhì)量的變化基本一致。各處理組的根冠比均顯著降低。不同鹽堿脅迫下生長脅迫指數(shù)均隨脅迫濃度的增加而降低,200 mmol·L-1時各處理組生長脅迫指數(shù)分別為0.26、0.18、0.23,可以看出Na2CO3脅迫降幅較大,NaCl和混合鹽堿脅迫對生長脅迫指數(shù)影響較小。這些結(jié)果表明,Na2CO3和混合鹽堿脅迫對金絲楸的生長發(fā)育抑制更嚴重,與對葉片危害的影響一致。

      2.2不同鹽堿脅迫對金絲楸生理和光合指標的影響

      不同鹽堿脅迫對金絲楸生理和光合指標的影響見表2。各處理組中,MDA含量和相對電導(dǎo)率都隨處理濃度的增加而顯著上升。NaCl和混合鹽堿處理組中,可溶性糖含量在50~150 mmol·L-1時逐漸積累,而在200 mmol·L-1時小幅下降;而Na2CO3處理組中,在100 mmol·L-1時達到最大值,隨濃度增加而下降。各處理組中,Pro含量都明顯增加,均在100 mmol·L-1時達到最大值,之后隨處理濃度的增加而逐漸下降,但仍明顯高于對照組。各處理組中,SOD活性在中低濃度都有所增加,其中,100~150 mmol·L-1時顯著增加,200 mmol·L-1時下降。各處理組中,低濃度時葉綠素總量和光合速率增加,都在100 mmol·L-1時達到最大值,之后隨處理濃度的增加而逐漸下降。

      2.3轉(zhuǎn)錄組測序、組裝和分析

      對試驗中的8個樣品測序后分別獲得了約50 000 000條原始序列,共測得約60.4 Gb原始數(shù)據(jù)。過濾后Clean datas約占原始序列數(shù)據(jù)的93%;堿基數(shù)約占原始堿基數(shù)的93%;Q20和Q30值分別在97%和93%以上?;旌?個樣品的Clean datas,用Trinity軟件進行De novo組裝,共得到171339個Transcripts, 55793個Unigeneso Transcript和Unigene序列平均長度分別為1768.34 bp和1275.65 bp,

      N50分別為2597 bp和2263 bp, GC含量分別為39.59%和38.72%。

      2.4注釋結(jié)果分析

      對55 793個Unigenes進行基因功能注釋,在NR、GO、KEGG、Pfam、eggNOG和Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫中分別注釋28 722個(51.48%)、13185個(23.63%)、11967個(21.45%)、15837個(28.39%)、27 242個(48.83%)和21694個(38.88%),其中,29534 (52.93%)個Unigenes最少被1個數(shù)據(jù)庫注釋,5124(9.18%)個Unigenes被6個數(shù)據(jù)庫注釋。28722個Unigenes在NR數(shù)據(jù)庫中獲得注釋,其中,5.8% Unigenes與之完全匹配,15.94% Unigenes不完全匹配。相似度在95%~100%、80%~95%、60%~80%、40%~60%和≤40%的Unigenes比例分別為5.98%、32.12%、35.43%、20.45%和6.02%。被注釋到芝麻(Sesamum indicum L.)、地黃猴面花(Erythranthe guttata DC.)、施蒴苣苔(Dorcoceras hygrometricum B.)、葡萄(Vitisvinifera L.)、咖啡(Coffea canephora PF.)、大麥(Hordeum vulgare L.)、可可(Theobroma cacao L.)和其他物種Unigenes比例分別為55.95%、14.67%、3.35%、2.09%、0.97%、0.91%、0.76%和21.31%。

      基因GO注釋后,將成功注釋的基因依照GO的三個大類進行分類。Unigenes富集最多的是代謝過程和細胞過程、細胞膜和細胞、結(jié)合和催化活性。KEGG代謝通路上,基因注釋最多的分別為碳水化合物代謝、翻譯、信號分解代謝、運輸分解代謝和內(nèi)分泌系統(tǒng)。eggNOG比對注釋,基因注釋最多目錄分別為功能未知、僅通用功能預(yù)測、信號傳導(dǎo)機制和翻譯后修飾、蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)、伴侶。

      2.5差異表達基因分析

      為進一步了解楸樹對不同鹽堿脅迫反應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組特征,分析比較了對照組和3種處理組的DEGs。對照組與NaCl處理組(A vs C)產(chǎn)生1779個DEGs(上調(diào)844個,下調(diào)935個),對照組與Na2CO3處理組(A vs D)產(chǎn)生2835個DEGs(上調(diào)1326個,下調(diào)1509個),對照組與混合鹽堿處理組(A vs E)產(chǎn)生4059個DEGs(上調(diào)2295個,下調(diào)1764個),說明這些DEGs與不同鹽堿脅迫應(yīng)答密切相關(guān)。根據(jù)差異分析的結(jié)果,維恩圖進一步展示了各比較組間特異DEGs的個數(shù)以及比較組間的重疊關(guān)系。A vsC與Avs D之間有1 036個共有DEGs,A vsD與Avs E之間有1530個共有DEGs,A vsC與Avs E之間有963個共有DEGs,3個比較組之間有717個共有DEGs。Avs C有497個特異DEGs,Avs D有986個特異DEGs,A vsE有2 283個特異DEGs(圖2)。說明共有DEGs可能由不同的鹽堿脅迫共同引起的,特異DEGs可能響應(yīng)不同的鹽堿脅迫反應(yīng)。

      2.6差異表達基因富集分析

      對DEGs進一步GO富集分析發(fā)現(xiàn),在細胞組分、分子功能和生物過程方面存在差異。在細胞組分方面,膜的整體成分、膜的內(nèi)在成分、膜等在不同鹽堿脅迫下被顯著富集。在分子功能方面,催化活性、氧化還原酶活性、信號傳感器活性、單加氧酶活性、水解酶活性、水解o-糖基化合物等在不同鹽堿脅迫下被顯著富集。在生物過程方面,類異戊二烯代謝和生物合成過程、防衛(wèi)反應(yīng)、碳水化合物代謝過程等在不同鹽堿脅迫下被顯著富集(圖3~5)。

      通過對DEGs進一步KEGG分析發(fā)現(xiàn),DEGs主要集中在代謝途徑。NaCl脅迫下顯著富集的通路為:萜類主干生物合成、苯丙素的生物合成、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、光合生物中的碳固定(圖6);Na2CO3脅迫下顯著富集的通路為:淀粉和蔗糖代謝、苯丙素的生物合成、氰氨基酸代謝、精氨酸生物合成(圖7);混合鹽堿脅迫下顯著富集的通路為:淀粉和蔗糖代謝、萜類主干生物合成、苯丙素的生物合成、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(圖8)。

      2.7轉(zhuǎn)錄因子分析

      植物轉(zhuǎn)錄因子廣泛參與多種生物過程,并在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控基因的表達,是許多逆境脅迫響應(yīng)基因的重要調(diào)控因子,在植物對逆境脅迫的應(yīng)答過程中發(fā)揮重要作用。為了進一步研究楸樹中可能參與鹽堿脅迫的轉(zhuǎn)錄因子,筆者共鑒定出6725個差異表達轉(zhuǎn)錄因子,分屬于57個不同的轉(zhuǎn)錄因子家族,其中,bHLH、ERF、MYB-related、NAC、C2H2、WRKY、MYB和bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族成員最多。

      3討論

      3.1不同鹽堿脅迫對金絲楸生長的影響

      鹽堿脅迫對植物最直接的影響就是抑制其正常的生長發(fā)育。本研究發(fā)現(xiàn),Na2CO3脅迫對金絲楸葉片傷害程度最大,NaCl最小,與前人研究結(jié)果一致。不同鹽堿脅迫導(dǎo)致了金絲楸新增株高和地徑、生物量、根冠比不同程度的降低,并且隨著脅迫濃度的增加而加強(表1),表明其對不同鹽堿脅迫的忍耐能力存在差異,這與其它植物中的研究結(jié)果相同。分析對新增株高的影響程度依次為NaCl>Na2CO3>混合鹽堿,3種脅迫的中高濃度都極顯著抑制新增地徑的增長(表1)。對地上部和根的干質(zhì)量以及生物量積累的影響程度依次為Na2CO3>NaCl>混合鹽堿,但50 mmol·L-1時NaCl和Na2C03脅迫對地徑有增粗作用,其中NaCl脅迫顯著增加,50 mmol·L-1時混合鹽堿脅迫對地上部和根的干質(zhì)量和鮮質(zhì)量均顯著或極顯著增加(表1),其它植物的研究也得到類似結(jié)果。

      3.2不同鹽堿脅迫對金絲楸生理代謝和光合作用的影響

      鹽堿脅迫還會影響植物的生理代謝和光合作用。MDA是植物體內(nèi)膜脂過氧化的產(chǎn)物,常作為對逆境反應(yīng)強弱的指標。本研究發(fā)現(xiàn),不同鹽堿脅迫后MDA都不同程度增加,其中,在中高濃度脅迫后顯著增加(表2),該結(jié)果與前人研究結(jié)果一致。Pro能調(diào)節(jié)滲透勢和改善細胞內(nèi)環(huán)境,可溶性糖能維持細胞滲透勢和提供碳源,它們是植物通過滲透調(diào)節(jié)作用對逆境脅迫的一種生理響應(yīng)。本研究發(fā)現(xiàn),不同鹽堿脅迫后,Pro和可溶性糖含量都顯著上升,在100或150 mmol·L-1時達到最大值,濃度繼續(xù)升高后會小幅降低,但仍高于對照組(表2),這一結(jié)果與之前關(guān)于鹽堿脅迫對Pro和可溶性糖含量影響的研究結(jié)果相吻合。說明在一定濃度范圍內(nèi)楸樹可以通過增加體內(nèi)Pro和可溶性糖的含量,降低細胞滲透勢,超過這個范圍,Pro和可溶性糖合成受到抑制。鹽堿脅迫會使植物產(chǎn)生大量的活性氧自由基,破壞細胞膜系統(tǒng),抗氧化酶活性的升高可增強自由基清除能力,減輕傷害。本研究發(fā)現(xiàn),不同鹽堿脅迫下SOD都隨濃度增加呈先升后降的趨勢(表2),這與孫海菁等之前發(fā)現(xiàn)的情況一致。說明當(dāng)鹽堿脅迫超出閾值后,過量的自由基對植物造成損傷,SOD活性降低。葉綠素是植物光合作用的物質(zhì)基礎(chǔ),是反映光合能力的重要指標。本研究發(fā)現(xiàn),在低濃度鹽堿脅迫下葉綠素總量升高,光合速率顯著提高(表2),說明低濃度脅迫能夠促進葉綠素的合成和光合作用,而在高濃度脅迫下葉綠素總量和光合速率下降。該結(jié)果和地上部生物量的結(jié)果基本一致,但與前人的研究結(jié)果不完全一致,可能與物種差異有關(guān),有待進一步研究。

      3.3差異表達基因分析

      RNA-Seq是研究植物非生物脅迫分子機制的良好手段,楸樹作為非模式植物,缺乏基因組背景,RNA-Seq為從轉(zhuǎn)錄水平研究楸樹耐鹽堿分子機制、基因挖掘及相關(guān)代謝通路的發(fā)現(xiàn)提供了可能。本研究分別對NaCl、Na2CO3和混合鹽堿處理組及對照組進行轉(zhuǎn)錄組測序及分析。DEGsGO富集結(jié)果表明,在細胞組分方面,膜的整體成分、內(nèi)在成分和膜在不同鹽堿脅迫下均顯著富集,說明膜及其成分在不同鹽堿脅迫下都發(fā)揮積極作用。在分子功能方面,富集結(jié)果相差較大,催化活性和氧化還原酶活性主要響應(yīng)NaCl脅迫;信號傳感器活性和單加氧酶活性主要響應(yīng)Na2CO3脅迫;催化活性和水解o-糖基化合物主要響應(yīng)混合鹽堿脅迫,說明不同分子功能響應(yīng)不同的鹽堿脅迫。在生物過程方面,類異戊二烯代謝和生物合成過程在不同鹽堿脅迫下都顯著富集,說明類異戊二烯對植物耐鹽堿非常重要;二甲基烯丙基二磷酸生物合成過程、防衛(wèi)反應(yīng)和碳水化合物代謝過程分別單獨顯著富集(圖3~5)。DEGs KEGG分析結(jié)果表明,苯丙素生物合成在不同鹽堿脅迫中均顯著富集,植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和萜類主干生物合成在NaCl和混合鹽堿脅迫中都顯著富集,淀粉和蔗糖代謝在Na2CO3和混合鹽堿脅迫中都顯著富集,還有光合生物碳固定、精氨酸代謝和生物合成分別在NaCl、Na2CO3脅迫中單獨顯著富集(圖6~8)。說明苯丙素生物合成、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、淀粉和蔗糖代謝、萜類主干生物合成、類異戊二烯通路在應(yīng)答鹽堿脅迫時至關(guān)重要,與前人轉(zhuǎn)錄組測序分析結(jié)果一致。以上結(jié)果暗示這些功能與途徑可能在楸樹響應(yīng)不同鹽堿脅迫中起著重要作用,這些注釋信息也為進一步挖掘楸樹抗不同鹽堿基因提供了數(shù)據(jù)資源。

      3.4轉(zhuǎn)錄因子分析

      轉(zhuǎn)錄因子在植物對多種逆境脅迫的應(yīng)答過程中發(fā)揮重要作用。目前,已報道的響應(yīng)鹽堿脅迫的轉(zhuǎn)錄因子有WRKY、NAC、bZIP、MYB、bHLH等家族成員。WRKY是一類鋅指蛋白家族,對植物抗逆有著重要作用。玉米ZmWRKY33、高粱SbWRKY50和花生AhWRKY75等WRKY轉(zhuǎn)錄因子對耐鹽性起作用。NAC是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物發(fā)育、逆境應(yīng)答等過程中發(fā)揮多重作用。水稻ONAC022、小麥TaNAC67和大豆GmSIN1等NAC轉(zhuǎn)錄因子與耐鹽能力有關(guān)。bZIP轉(zhuǎn)錄因子參與依賴ABA信號的途徑,調(diào)控相關(guān)抗鹽堿基因的表達。棉花GhABF2、玉米ABP9和大豆GmbZIP2等bZIP轉(zhuǎn)錄因子控制鹽堿耐性。MYB轉(zhuǎn)錄因子廣泛參與植物的生長發(fā)育、逆境響應(yīng)和激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。擬南芥MYB111、大豆GmMYB12和菠蘿AcoMYB4等MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控鹽脅迫響應(yīng)基因。bHLH轉(zhuǎn)錄因子同樣在非生物脅迫應(yīng)答中起著重要作用。小麥TabHLH1、水稻OsbHLH035和楊梅MfbHLH38等bHLH轉(zhuǎn)錄因子應(yīng)答鹽脅迫反應(yīng)。本研究鑒定出bHLH、ERF、MYB-related、NAC、C2H2、WRKY、MYB和bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族成員最多,這些轉(zhuǎn)錄因子與不同鹽堿耐性相關(guān),說明楸樹耐鹽堿機制是由多種轉(zhuǎn)錄因子共同調(diào)控的。

      4結(jié)論

      本研究通過對不同鹽堿脅迫下金絲楸幼苗生長情況、生理指標和光合特性進行測定及分析,新增株高和地徑、生物量、根冠比等都明顯受到抑制,生長情況受抑制程度為Na2CO3>混合鹽堿>NaCl。金絲楸幼苗主要通過積累滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)、提高抗氧化酶系統(tǒng)和光合作用來共同抵御鹽堿脅迫,但都呈現(xiàn)“低促高抑”的現(xiàn)象,具有一定閾值。通過對對照組和3種處理組葉片進行轉(zhuǎn)錄組測序及分析,3個比較組分別篩選出1779、2835和4059個DEGs。通過DEGs GO功能和KEGG通路分析,理清了DEGs富集的生物過程與代謝通路。金絲楸通過調(diào)節(jié)膜成分、催化活性、類異戊二烯代謝和生物合成過程、苯丙素生物合成、淀粉和蔗糖代謝、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生物過程和代謝途徑,并結(jié)合相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子共同響應(yīng)鹽堿脅迫(圖9)。綜上所述,本研究的首次嘗試為全面解析楸樹耐鹽堿機制研究提供理論參考,同時也為后期重要基因克隆及其功能分析等奠定基礎(chǔ)。

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