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      siRNA靶向干擾circ_0055625表達對胃癌細胞增殖及轉(zhuǎn)移的影響

      2023-01-28 03:47:10劉奕明孫銀平鐘平玉楊柏?zé)?/span>福建醫(yī)科大學(xué)附屬龍巖第一醫(yī)院消化內(nèi)科龍巖364000
      中國免疫學(xué)雜志 2022年21期
      關(guān)鍵詞:劃痕熒光素酶克隆

      劉奕明 孫銀平 鐘平玉 楊柏?zé)槪ǜ=ㄡt(yī)科大學(xué)附屬龍巖第一醫(yī)院消化內(nèi)科,龍巖 364000)

      胃癌是威脅我國人民生命安全的消化道惡性腫瘤之一,每年全球胃癌的發(fā)病例數(shù)超過103萬例,且病死率在所有腫瘤中占據(jù)第三位,由于胃癌早期癥狀較為隱匿導(dǎo)致40%左右的患者確診時已發(fā)生轉(zhuǎn)移,治療后胃癌患者五年生存率<10%,因而抑制胃癌轉(zhuǎn)移是提高胃癌治療效果及改善患者預(yù)后的關(guān)鍵[1]。環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是由前體mRNA通過剪切形成的閉合環(huán)狀RNA分子,其具有穩(wěn)定性與組織特異性,并可通過吸附微小RNA(miRNA)而參與翻譯蛋白等多種生物學(xué)過程從而參與腫瘤發(fā)生發(fā)展過程。近年來,越來越多的研究表明circRNA可調(diào)控胃癌細胞增殖、侵襲等多種生物學(xué)行為,并可能作為胃癌治療的潛在靶點[2-4]。circ_0055625在結(jié)腸癌細胞中呈高表達,并可通過吸附miR-106b-5p而促進細胞增殖及轉(zhuǎn)移[5]。但circ_0055625在胃癌中的表達及其可能生物學(xué)功能尚未可知。通過靶基因預(yù)測網(wǎng)站預(yù)測顯示circ_0055625與miR-1225-3p存在結(jié)合位點,研究表明miR-1225-3p在非小細胞肺癌中呈低表達,上調(diào)其表達可抑制非小細胞肺癌細胞轉(zhuǎn)移[6]。但circ_0055625/miR-1225-3p軸在胃癌形成及轉(zhuǎn)移過程中的作用機制尚未可知。因此,本研究主要探討circ_0055625是否可通過靶向調(diào)控miR-1225-3p的表達從而影響胃癌細胞增殖及轉(zhuǎn)移,為胃癌的治療提供潛在靶點。

      1 資料與方法

      1.1 資料

      1.1.1 一般資料收集2019年1月至2020年6月于福建醫(yī)科大學(xué)附屬龍巖第一醫(yī)院進行胃癌根治術(shù)的55例胃癌患者的癌組織及其癌旁組織(癌組織>5 cm范圍外正常組織)標(biāo)本,于液氮中保存,其中 男35例,女20例,年 齡46~67歲,平 均 年 齡(53.68±7.49)歲。所有組織標(biāo)本均經(jīng)病理診斷確診。本研究經(jīng)福建醫(yī)科大學(xué)附屬龍巖第一醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)。

      1.1.2 試劑與儀器人胃癌細胞AGS購自湖南豐暉生物;DMEM培養(yǎng)基購自美國Hyclone;胎牛血清、胰蛋白酶購自美國Gibco;LipofectamineTM3000 Transfection Reagent、Trizol試劑、circ_0055625過表達載體(pcDNA-circ_0055625)及其對照空載體(pcDNA)購自美國Invitrogen;反轉(zhuǎn)錄試劑與qRTPCR試劑購自北京天根生化;circ_0055625小分子干擾RNA(si-circ_0055625)及其陰性對照(si-NC)、miR-1225-3p寡核苷酸模擬物(miR-1225-3p mimics)及陰性對照mimic NC序列(miR-NC)、miR-1225-3p特異性寡核苷酸抑制劑(anti-miR-1225-3p)及其陰性對照(anti-miR-NC)購自廣州銳博生物;MTT試劑、Matrigel基質(zhì)膠購自北京索萊寶;Transwell小室購自美國Corning;兔抗人vimentin、YAP-1多克隆抗體購自沈陽萬類生物;兔抗人Snail多克隆抗體、二抗購自美國Abcam;蛋白質(zhì)提取相關(guān)試劑與SDS凝膠電泳相關(guān)試劑購自上海碧云天生物;低溫離心機購自美國Thermo Fisher;EON型酶聯(lián)免疫檢測儀購自美國Bio-Tek;Nikon ECLIPSE Ti-S熒光倒置顯微鏡購自日本尼康;StepOnePlus實時熒光定量PCR儀購自美國ABI;DYY-6C型雙穩(wěn)定電泳儀購自北京六一生物。

      1.2 方法

      1.2.1 細胞轉(zhuǎn)染及分組AGS細胞常規(guī)培養(yǎng),按1×105個/孔的密度接種于直徑為6 cm的培養(yǎng)皿中,待細胞生長融合度達到70%左右時用LipofectamineTM3000 Transfection Reagent進行轉(zhuǎn)染,每孔取4μg的si-NC、si-circ_0055625、miR-NC、miR-1225-3p mimics、si-circ_0055625與anti-miR-NC(共轉(zhuǎn)染)、si-circ_0055625與anti-miR-1225-3p(共轉(zhuǎn)染)分別進行轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染6 h后將培養(yǎng)基更換為含有10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)24 h,分別記為si-NC組、si-circ_0055625組、miR-NC組、miR-1225-3p組、si-circ_0055625+anti-miR-NC組、si-circ_0055625+anti-miR-1225-3p組。

      1.2.2 qRT-PCR檢 測circ_0055625、miR-1225-3p的表達水平收集各組AGS細胞與癌旁組織、胃癌組織,采用Trizol法分別提取組織標(biāo)本與細胞的總RNA,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。PCR擴增反應(yīng)體系:SYBR Green Master Mix 10μl、正反向引物各0.8μl、cDNA 2μl、ddH2O補足體系至20μl;反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性2 min,95℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,40次循環(huán)。circ_0055625以GAPDH為內(nèi)參,miR-1225-3p以U6為內(nèi)參,采用2-ΔΔCt法計算基因相對表達量。

      1.2.3 MTT檢測細胞增殖取各組AGS細胞按照3 000個/孔接種于96孔板,于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)12 h后,每孔分別加入MTT溶液20μl繼續(xù)培養(yǎng)4 h,3 000 r/min離心5 min后棄上清,每孔分別加入150μl DMSO,室溫避光孵育5 min,應(yīng)用酶標(biāo)儀檢測各孔光密度值(OD)。細胞存活率(%)=實驗組OD值/對照組OD值×100%。

      1.2.4克隆形成實驗取各組AGS細胞懸液接種于6孔板(500個/孔),于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)12 d(0肉眼可見克?。? d更換1次培養(yǎng)基,終止培養(yǎng)后用4%多聚甲醛固定30 min,1%結(jié)晶紫染色液染色20 min,計算克隆形成數(shù)。

      1.2.5 劃痕實驗將各組AGS細胞按照1×104個/孔接種于6孔板,待細胞生長融合度達到90%時用10μl移液槍的槍頭在6孔板的中間劃線,PBS沖洗劃掉的細胞后再加入2 ml含有10%胎牛血清的培養(yǎng)液,此時記為0 h,于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24 h后在相同位置拍照并應(yīng)用Image J軟件計算細胞劃痕距離,計算劃痕愈合率(%)=(0 h劃痕寬度-24 h劃痕寬度)/0 h劃痕寬度×100%。

      1.2.6 Transwell實驗檢測細胞侵襲用不含血清的DMEM培養(yǎng)基按照1∶5的比例稀釋Matrigel基質(zhì)膠,將其加入小室的上室(30μl/孔)后于培養(yǎng)箱內(nèi)孵育3 h,然后加入各組AGS細胞(2×104個/ml)400μl,小室的上室,下室中加入600μl含有10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)48 h后取出小室,PBS洗滌細胞后用4%多聚甲醛固定20 min,0.05%結(jié)晶紫染色液染色20 min,PBS洗滌后晾干,于倒置顯微鏡下計數(shù)細胞。

      1.2.7 雙熒光素酶報告基因檢測circ_0055625與miR-1225-3p的靶向關(guān)系Circular RNA Interactome預(yù)測顯示circ_0055625與miR-1225-3p存在結(jié)合位點,用點突變試劑盒將結(jié)合位點進行突變,分別構(gòu)建含有結(jié)合位點與突變位點的熒光素酶報告基因載體(野生型載體WT-circ_0055625、突變型載體MUT-circ_0055625),利用LipofectamineTM3000 Trans?fection Reagent試劑盒分別將WT-circ_0055625、MUT-circ_0055625與miR-NC或miR-1225-3p mimics共轉(zhuǎn)染至AGS細胞,將其置于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24 h后收集細胞并檢測熒光素酶活性。分別將si-NC、si-circ_0055625、pcDNA、pcDNA-circ_0055625轉(zhuǎn)染至AGS細胞24 h后收集細胞并采用qRT-PCR實驗檢測miR-1225-3p的表達量。

      1.2.8 Western blot檢測Snail、Vimentin、YAP-1蛋白表達收集各組AGS細胞后加入蛋白裂解液提取細胞總蛋白,取40μg蛋白樣品進行10%SDSPAGE電泳分離蛋白,用210 mA恒流的方式將分離的蛋白凝膠轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,5%脫脂牛奶封閉2 h,加入Snail(1∶1 000)、Vimentin(1∶1 000)、YAP-1(1∶1 000)一抗與內(nèi)參GAPDH抗體(1∶3 000)稀釋液,4℃孵育過夜后TBST洗膜,加入二抗稀釋液(1∶5 000)37℃孵育1 h后TBST洗膜,電化學(xué)發(fā)光液顯影,應(yīng)用Image J軟件分析各條帶灰度值,以目的蛋白與內(nèi)參GAPDH條帶灰度值的比值表示目的蛋白相對表達量。

      1.3 統(tǒng)計學(xué)分析采用SPSS21.0統(tǒng)計學(xué)軟件分析數(shù)據(jù),計量資料以±s表示且均符合正態(tài)分布,兩組間比較采用獨立樣本t檢驗,多組間比較采用單因素方差分析,Pearson法進行相關(guān)性分析,以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

      2 結(jié)果

      2.1 circ_0055625與miR-1225-3p在胃癌組織及癌旁組織中的表達與癌旁組織比較,胃癌組織中circ_0055625的表達量升高(P<0.05),miR-1225-3p的表達量降低(P<0.05),見表1。Pearson法分析胃癌組織中circ_0055625與miR-1225-3p表達量的相關(guān)性,結(jié)果顯示circ_0055625與miR-1225-3p呈負相關(guān)(r=-0.881 6,P<0.001),見圖1。

      圖1 胃癌組織中circ_0055625與miR-1225-3p表達量的相關(guān)性分析Fig.1 Correlation analysis of circ_0055625 and miR-1225-3p expression in gastric cancer tissues

      表1 circ_0055625與miR-1225-3p在胃癌組織及癌旁組織中的表達量(±s,n=55)Tab.1 Expression of circ_0055625 and miR-1225-3p in gastric cancer tissues and adjacent tissues(±s,n=55)

      表1 circ_0055625與miR-1225-3p在胃癌組織及癌旁組織中的表達量(±s,n=55)Tab.1 Expression of circ_0055625 and miR-1225-3p in gastric cancer tissues and adjacent tissues(±s,n=55)

      Note:Compared with adjacent tissues,1)P<0.05.

      Groups Adjacent tissues Gastric cancer tissues t P circ_0055625 1.00±0.11 3.46±0.621)28.973 0.000 miR-1225-3p 1.00±0.18 0.36±0.091)23.585 0.000

      2.2 干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響與si-NC組比較,si-circ_0055625組細胞存活率降低(P<0.05),克隆形成數(shù)和侵襲細胞數(shù)減少(P<0.05),劃痕愈合率降低(P<0.05),Snail、Vimentin、YAP-1蛋白水平降低(P<0.05),見圖2、表2。

      表2 干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響(±s,n=9)Tab.2 Effect of interference with expression of circ_0055625 on proliferation,clone formation,migration and invasion of AGS cells(±s,n=9)

      表2 干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響(±s,n=9)Tab.2 Effect of interference with expression of circ_0055625 on proliferation,clone formation,migration and invasion of AGS cells(±s,n=9)

      Note:Compared with si-NC group,1)P<0.05.

      Groups si-NC si-circ_0055625 t P circ_0055625 1.00±0.04 0.28±0.051)33.734 0.000 Cell survival rate(%)99.69±3.87 35.73±4.611)31.879 0.000 Number of clones formed 114.44±10.75 45.33±8.721)14.978 0.000 Scratch healing rate(%)56.06±2.86 25.88±5.501)14.605 0.000 Number of invasion cells 137.67±7.83 55.11±6.571)24.232 0.000

      圖2 干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響Fig.2 Effect of interference with expression of circ_0055625 on proliferation,clone formation,migra?tion and invasion of AGS cells

      2.3 雙熒光素酶報告實驗與qRT-PCR實驗驗證circ_0055625與miR-1225-3p的靶向調(diào)控關(guān)系Cir?cular RNA Interactome預(yù) 測 顯 示circ_0055625與miR-1225-3p存在結(jié)合位點,見圖3A。上調(diào)miR-1225-3p表達可降低野生型載體WT-circ_0055625的熒光素酶活性(P<0.05),而對突變型載體MUTcirc_0055625的熒光素酶活性無顯著影響,見圖3B。與si-NC組比較,si-circ_0055625組miR-1225-3p的表達量升高(P<0.05);與pcDNA組比較,pcDNAcirc_0055625組miR-1225-3p的 表 達 量 降 低(P<0.05),見圖3C。

      圖3 circ_0055625與miR-1225-3p的靶向調(diào)控作用Fig.3 Targeted regulatory effects of circ_0055625 and miR-1225-3p

      2.4 上調(diào)miR-1225-3p表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響與miR-NC組比較,miR-1225-3p組細胞存活率降低(P<0.05),克隆形成數(shù)和侵襲細胞數(shù)減少(P<0.05),劃痕愈合率降低(P<0.05),Snail、Vimentin、YAP-1蛋白水平降低(P<0.05),見圖4、表3。

      表3 上調(diào)miR-1225-3p表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響(±s,n=9)Tab.3 Effect of up-regulation of miR-1225-3p expression on proliferation,clone formation,migration and invasion of AGS cells(±s,n=9)

      表3 上調(diào)miR-1225-3p表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響(±s,n=9)Tab.3 Effect of up-regulation of miR-1225-3p expression on proliferation,clone formation,migration and invasion of AGS cells(±s,n=9)

      Note:Compared with the miR-NC group,1)P<0.05.

      Groups miR-NC miR-1225-3p t P miR-1225-3p 1.00±0.05 3.12±0.081)67.416 0.000 Cell survival rate(%)99.64±3.26 57.62±4.091)24.309 0.000 Number of clones formed 113.33±11.75 52.67±9.381)12.104 0.000 Scratch healing rate(%)56.13±4.67 23.54±3.661)16.478 0.000 Number of invasion cells 136.22±8.89 70.67±4.851)19.419 0.000

      圖4 上調(diào)miR-1225-3p表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的影響Fig.4 Effect of up-regulation of miR-1225-3p expression on proliferation,clone formation,migration and invasion of AGS cells

      2.5 抑制miR-1225-3p表達部分逆轉(zhuǎn)干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的抑制作用與si-circ_0055625+anti-miR-NC組比較,si-circ_0055625+anti-miR-1225-3p組細胞存活率升高(P<0.05),克隆形成數(shù)和侵襲細胞數(shù)增多(P<0.05),劃痕愈合率升高(P<0.05),Snail、Vimentin、YAP-1蛋白水平升高(P<0.05),見表4、圖5。

      表4 抑制miR-1225-3p表達部分逆轉(zhuǎn)干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的抑制作用(±s,n=9)Tab.4 Inhibition of miR-1225-3p expression partially reversed inhibitory effects of interference with circ_0055625 expres?sion on AGS cell proliferation,clone formation,migration and invasion(±s,n=9)

      表4 抑制miR-1225-3p表達部分逆轉(zhuǎn)干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的抑制作用(±s,n=9)Tab.4 Inhibition of miR-1225-3p expression partially reversed inhibitory effects of interference with circ_0055625 expres?sion on AGS cell proliferation,clone formation,migration and invasion(±s,n=9)

      Note:Compared with si-circ_0055625+anti-miR-NC group,1)P<0.05.

      Groups si-circ_0055625+anti-miR-NC si-circ_0055625+anti-miR-1225-3p t P miR-1225-3p 1.00±0.05 0.41±0.041)27.643 0.000 Cell survival rate(%)35.85±4.97 79.94±5.451)17.933 0.000 Number of clones formed 45.33±2.24 85.11±8.101)14.200 0.000 Scratch healing rate(%)25.28±3.07 47.02±3.221)14.660 0.000 Number of invasion cells 55.11±6.05 93.78±6.281)13.304 0.000

      圖5 抑制miR-1225-3p表達部分逆轉(zhuǎn)干擾circ_0055625表達對AGS細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲的抑制作用Fig.5 Inhibition of miR-1225-3p expression partially reversed inhibitory effect of interference with circ_0055625 expression on proliferation,clone forma?tion,migration and invasion of AGS cells

      3 討論

      circRNA廣泛存在于真核細胞中,其主要是由外顯子與內(nèi)含子構(gòu)成的一種共價閉合環(huán)狀RNA分子,其在腫瘤發(fā)生及發(fā)展過程中可發(fā)揮重要調(diào)控作用,同時circRNA分子富含miRNA的結(jié)合位點,并可在細胞中發(fā)揮miRNA海綿的作用,circRNA_100782、circRNA_100876在胃癌細胞中表達上調(diào),并可發(fā)揮miRNA海綿的作用而調(diào)控其靶基因表達從而促進胃癌細胞增殖及轉(zhuǎn)移[7-8]。circRNA_0005075、circ_0000190、circ_0004872、circRHOBTB3

      在胃癌細胞中表達下調(diào),并可通過調(diào)節(jié)miRNA/靶mRNA表達而抑制胃癌細胞增殖、遷移及侵襲從而抑制胃癌進展[9-12]。

      circ_0055625在結(jié)腸癌患者血清中表達上調(diào)且與化療耐藥性有關(guān)[13]。但circ_0055625在胃癌中的表達及其可能作用機制尚未見報道。本研究結(jié)果顯示,胃癌組織中circ_0055625的表達量高于癌旁組織,通過體外細胞實驗證實,siRNA靶向干擾circ_0055625表達后胃癌細胞存活率降低且克隆形成數(shù)減少,提示干擾circ_0055625表達可抑制胃癌細胞增殖及克隆形成。YAP-1屬于Hippo/YAP通路的關(guān)鍵蛋白,上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化是腫瘤細胞遷移及侵襲的重要環(huán)節(jié),其可通過將上皮細胞重構(gòu)后促使細胞失去黏合連接進而導(dǎo)致細胞轉(zhuǎn)移,YAP-1表達上調(diào)可促進轉(zhuǎn)錄因子Snail表達進而上調(diào)Vimentin的表達[14-15]。本研究結(jié)果顯示,干擾circ_0055625表達后胃癌細胞侵襲細胞數(shù)減少且劃痕愈合率降低,并可抑制Snail、Vimentin、YAP-1蛋白表達,提示干擾circ_0055625表達后可抑制胃癌細胞遷移及侵襲。

      circ_0055625與胃癌細胞生物學(xué)功能的相關(guān)性研究尚未見報道,本研究通過在線靶基因預(yù)測顯示circ_0055625與miR-1225-3p存在結(jié)合位點,并檢測到胃癌組織中miR-1225-3p的表達量低于癌旁組織,且胃癌組織中circ_0055625與miR-1225-3p表達量呈負相關(guān),提示circ_0055625可能通過靶向結(jié)合miR-1225-3p而負向調(diào)控其表達進而參與胃癌發(fā)生發(fā)展過程。研究表明miR-1225-3p在骨肉瘤中表達量降低,circ_0016347通過調(diào)節(jié)miR-1225-3p/KCNH1表達而促進骨肉瘤進展[16]。miR-1225-3p在膽道癌、結(jié)直腸癌中表達下調(diào),并可能作為腫瘤早期診斷及評估患者預(yù)后的潛在標(biāo)記物[17-18]。本研究通過雙熒光素酶報告實驗與qRT-PCR實驗證實circ_0055625可靶向調(diào)控miR-1225-3p的表達,上調(diào)miR-1225-3p表達可抑制胃癌細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲,而抑制其表達可拮抗干擾circ_0055625表達對胃癌細胞增殖及轉(zhuǎn)移的抑制作用。提示circ_0055625可通過靶向結(jié)合miR-1225-3p而抑制其表達從而促進胃癌細胞增殖及轉(zhuǎn)移。

      綜上所述,胃癌組織中circ_0055625表達上調(diào),而miR-1225-3p的表達下調(diào),二者存在負相關(guān)關(guān)系且存在靶向結(jié)合作用,干擾circ_0055625表達可通過上調(diào)miR-1225-3p表達而抑制胃癌細胞增殖、克隆形成、遷移及侵襲,可為進一步揭示胃癌的發(fā)病機制奠定實驗基礎(chǔ),還可為胃癌的治療提供潛在靶點。但circ_0055625序列上富含多個miRNA結(jié)合位點,其是否可通過調(diào)控其他miRNA表達而參與胃癌發(fā)生、發(fā)展過程尚需進一步探究。

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