秦春曉,李 瑩,張?jiān)佈?,戴紹軍
(1.東北林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院東北鹽堿植被恢復(fù)與重建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江哈爾濱150040;2.上海師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院上海植物種質(zhì)資源工程技術(shù)研究中心,上海200234)
溶解素基序(LysM)一般由42~48個(gè)氨基酸殘基組成,N端的16個(gè)氨基酸和C端的10個(gè)氨基酸相對(duì)保守[1],含有對(duì)稱的βααβ的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),其中兩個(gè)α螺旋位于雙鏈反向平行的β折疊一側(cè)[2].除古細(xì)菌外,幾乎所有生物都具有含LysM的蛋白質(zhì),且多為分泌蛋白或膜蛋白[3].含LysM的植物受體激酶可以識(shí)別或感應(yīng)共生菌并誘導(dǎo)其對(duì)真菌的抗性[4].根據(jù)蛋白是否含有激酶結(jié)構(gòu)域,LysM家族蛋白分為兩類,包括LysM受體類蛋白(LYP)和LysM受體激酶(LYK)[2],都在植物免疫應(yīng)答中具有重要作用.
水稻幾丁質(zhì)激發(fā)子結(jié)合蛋白(CEBiP)胞外具有2個(gè)LysM結(jié)構(gòu)域和1個(gè)跨膜域,是首個(gè)被鑒定的真菌幾丁質(zhì)觸發(fā)子結(jié)合的多糖受體,在感知幾丁質(zhì)觸發(fā)子和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮作用.敲除OsCEBiP基因的水稻植株,幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的活性氧(ROS)爆發(fā)和下游幾丁質(zhì)響應(yīng)基因被嚴(yán)重抑制[5].此外,OsCERK1(chitin elicitor receptor kinase)含有1個(gè)LysM結(jié)構(gòu)域、1個(gè)跨膜域和1個(gè)胞內(nèi)激酶功能域,對(duì)水稻幾丁質(zhì)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)至關(guān)重要.敲低OsCERK1也會(huì)顯著抑制幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的防御反應(yīng).雖然OsCERK1不具有直接結(jié)合殼聚糖的能力.但在感知到幾丁質(zhì)寡糖信號(hào)后,OsCEBiP和OsCERK1會(huì)迅速形成異源二聚體,激活下游信號(hào)以進(jìn)行防御反應(yīng)[6].此外,在水稻中OsLYP4和OsLYP6均含有LysM,作為感受細(xì)菌肽聚糖(PGN)和幾丁質(zhì)的共受體發(fā)揮作用,兩者可以形成同源和異源二聚體,并與OsCEBiP相互作用,參與幾丁質(zhì)感知與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程[7].
感 知 到 幾 丁 質(zhì) 后,OsCERK1與OsRacGEF1(guanine nucleotide exchange factors)互 作 并 將OsRacGEF1的C末端S549磷酸化,進(jìn)而OsRacGEF1作為OsRac1的鳥(niǎo)嘌呤核苷酸交換因子激活OsRac1[8],隨后OsRac1與OsMAPK3/6(mitogen-activated protein kinase)互作并將其激活[9].同時(shí),OsCERK1與多種類受體胞質(zhì)激酶(RLCK)互作.質(zhì)膜上OsCERK1的激酶結(jié)構(gòu)域與OsRLCK185互作并將其磷酸化[10],進(jìn)而OsRLCK185磷酸化OsMAPKKKε C末端調(diào)控域,從而級(jí)聯(lián)磷酸化OsMAPKK4和MAPK3/6[11],激活MAPK級(jí)聯(lián)信號(hào)通路.OsMAPK3/6可以磷酸化bHLH轉(zhuǎn)錄因子OsRAI1,調(diào)節(jié)幾丁質(zhì)誘導(dǎo)基因OsPAL1和OsWRKY19的轉(zhuǎn)錄水平[9,12],啟動(dòng)植物免疫應(yīng)答反應(yīng).此外,OsCERK1也可以調(diào)控其他類受體胞質(zhì)激酶,如OsRLCK57,OsRLCK107,OsRLCK118和OsRLCK176等,參與幾丁質(zhì)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[13-15],如圖1(a)所示.
擬南芥基因組共編碼5個(gè)LYK,包括LYK1/CERK1和LYK2~LYK5[16-17].擬南芥AtCERK1含有3個(gè)LysM結(jié)構(gòu)域、1個(gè)跨膜域和1個(gè)胞內(nèi)激酶域[18].與OsCERK1不同,AtCERK1可以直接與幾丁質(zhì)結(jié)合[19],AtCERK1胞外的3個(gè)LysM結(jié)構(gòu)域都是幾丁質(zhì)結(jié)合所必需的,任何一個(gè)LysM結(jié)構(gòu)域缺失都會(huì)破壞其穩(wěn)定的空間結(jié)構(gòu)[20].胞外的幾丁質(zhì)、幾丁質(zhì)寡聚體和殼聚糖與LysM結(jié)構(gòu)域結(jié)合,導(dǎo)致AtCERK1同源二聚化,進(jìn)而激活A(yù)tCERK1胞內(nèi)近膜和激酶結(jié)構(gòu)域的多個(gè)氨基酸快速磷酸化[20-21].保守的跨膜結(jié)構(gòu)域中C端近膜區(qū)(部分序列)也調(diào)節(jié)AtCERK1激酶活性,參與幾丁質(zhì)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[22].AtCERK1對(duì)幾丁質(zhì)的識(shí)別具有特異性,cerk1突變體中,幾丁質(zhì)觸發(fā)的ROS爆發(fā)、MAPK級(jí)聯(lián)反應(yīng),以及幾丁質(zhì)響應(yīng)基因的表達(dá)等幾乎都喪失了[18,23].然而,AtCERK1對(duì)幾丁質(zhì)的親和力相對(duì)較低.將AtCERK1幾丁質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)A138突變?yōu)镠并未阻斷AtCERK1自磷酸化,這表明雖然AtCERK1是響應(yīng)幾丁質(zhì)必需的,但是還有其他蛋白參與幾丁質(zhì)結(jié)合,并與AtCERK1互作共同激活下游信號(hào)通路[22].擬南芥中的AtLYK4和AtLYK5可能具有這樣的作用[24-25].AtLYK4可以識(shí)別幾丁質(zhì),作為AtCERK1的共受體增加其幾丁質(zhì)親和性和激酶活性[24].在lyk4突變體中,受幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)錄水平下降,胞內(nèi)鈣離子(Ca2+)濃度增加受抑制,但其表型不如cerk1突變體明顯[26].此外,AtLYK5也是幾丁質(zhì)的主要受體,與AtCERK1形成幾丁質(zhì)誘導(dǎo)復(fù)合物,是幾丁質(zhì)誘導(dǎo)AtCERK1形成同源二聚體和磷酸化所必需的.AtLYK5與幾丁質(zhì)的親和力比AtCERK1高很多,lyk5-2突變體對(duì)幾丁質(zhì)反應(yīng)顯著降低,缺乏ROS爆發(fā)表型.將點(diǎn)突的AtLYK5(AtLYK5S206P和AtLYK5Y128G)回補(bǔ)到lyk5-2突變體中,無(wú)法恢復(fù)其表型;LYK5S206P不與幾丁質(zhì)結(jié)合,而AtLYK5Y128G與幾丁質(zhì)結(jié)合能力下降,這表明S206和Y128是AtLYK5調(diào)控幾丁質(zhì)結(jié)合的關(guān)鍵位點(diǎn)[25].AtLYK4與AtLYK5的胞外域可以相互作用形成同源二聚體.幾丁質(zhì)誘導(dǎo)AtCERK1與AtLYK4,AtLYK5形成復(fù)合物[27].正常狀態(tài)下,AtCERK1,AtLYK4和AtLYK5均定位于質(zhì)膜[28];幾丁質(zhì)觸發(fā)后,磷酸化的AtCERK1仍停留在質(zhì)膜上,而AtLYK5受到誘導(dǎo)而內(nèi)化.然而,在cerk1或AtCERK1蛋白活性降低的突變植株中,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的AtLYK5內(nèi)吞作用[28].
擬南芥免疫應(yīng)答過(guò)程中,AtCERK1介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路可能包括類受體胞質(zhì)激酶AtBIK1(botrytisinduced kinase 1),AtBAK1(BRI1-associated receptor kinase 1),AtPBL1(BIK1-like protein kinase),AtPBL27和RLCKⅦ-4等組分.AtCERK1與AtBIK1互作并將其磷酸化[29],AtBIK1能與AtBAK1互作[30].AtBIK1和AtPBL1對(duì)幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的胼胝質(zhì)積累起作用,AtBIK1與過(guò)氧化氫(H2O2)積累也相關(guān)[29].相比于AtBIK1,AtCERK1可以優(yōu)先磷酸化AtPBL27,AtCERK1的磷酸化位點(diǎn)S493突變不影響其自磷酸化活性,卻降低AtPBL27的轉(zhuǎn)磷酸化水平,從而影響幾丁質(zhì)信號(hào)感知與轉(zhuǎn)導(dǎo)的起始階段[31].擬南芥AtPBL27是水稻OsRLCK185的同源蛋白,可以磷酸化AtMAPKKK5,激活A(yù)tMKK2,AtMKK4和AtMKK5的磷酸化[32],進(jìn)而調(diào)節(jié)AtMAPK3/6[33],調(diào)控相關(guān)防御基因(AtNit4和AtWRKY75)表達(dá)[33].AtPBL27和AtMAPKKK5也參與幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的胼胝質(zhì)沉積[32-33].AtCERK1也可以磷酸化RLCKⅦ-4,進(jìn)而激活MAPK級(jí)聯(lián)反應(yīng),啟動(dòng)免疫應(yīng)答[34],如圖1(b)所示.此外,受細(xì)菌病原體誘導(dǎo)后,AtBAK1可以與AtCERK1互作,磷酸化AtCERK1的近膜區(qū),增強(qiáng)植株真菌抗性[35].
LysM蛋白響應(yīng)幾丁質(zhì)的免疫過(guò)程也受到負(fù)調(diào)節(jié)因子的調(diào)控,從而保護(hù)植物生長(zhǎng)免受幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的持續(xù)性的免疫損傷[36].目前,對(duì)此方面的認(rèn)識(shí)僅僅局限于擬南芥AtCERK1相關(guān)的負(fù)調(diào)控研究.
AtCERK1調(diào)節(jié)的免疫過(guò)程可能受到蛋白質(zhì)可逆磷酸化的調(diào)控.在感知幾丁質(zhì)信號(hào)后,AtCERK1會(huì)募集其互作蛋白PP2C絲/蘇氨酸磷酸酶(CIPP1),使AtCERK1的Tyr428去磷酸化,AtCIPP1會(huì)與去磷酸化的AtCERK1解離,進(jìn)而AtCERK1的Tyr428再發(fā)生自磷酸化并恢復(fù)待命(standby)狀態(tài)[37].此外,AtCERK1與富含亮氨酸重復(fù)的類受體激酶(LRR-RLK)LIK1互作并將其直接磷酸化,負(fù)調(diào)節(jié)幾丁質(zhì)觸發(fā)的免疫過(guò)程[38].幾丁質(zhì)處理后,lik1突變體植株會(huì)產(chǎn)生更多的ROS,AtMAPK3和AtMAPK6磷酸化水平顯著增加,這表明AtCERK1磷酸化AtLIK1會(huì)抑制下游的信號(hào)通路,但對(duì)其分子調(diào)控機(jī)制并不清楚[38],如圖1(c)所示.
依賴或不依賴泛素連接酶U-box蛋白介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解途徑都可能對(duì)AtCERK1活性具有負(fù)調(diào)控作用.AtCERK1磷酸化的胞內(nèi)激酶結(jié)構(gòu)域與泛素連接酶U-box蛋白12或13(PUB12/13)的ARM結(jié)構(gòu)域相互作用[36],這表明幾丁質(zhì)激活A(yù)tCERK1的自磷酸化是其與AtPUB12/13相互作用的關(guān)鍵.pub12,pub13突變體幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的ROS爆發(fā)、MAPK激活和胼胝質(zhì)沉積等一系列免疫反應(yīng)增強(qiáng)[36].這暗示著AtPUB12和AtPUB13參與了幾丁質(zhì)受體復(fù)合物的負(fù)調(diào)控作用,這種負(fù)調(diào)控是否是通過(guò)泛素化AtCERK1介導(dǎo)其降解有待進(jìn)一步研究.有意思的是,AtCERK1也可以與AtPUB4相互作用.從pub4突變體表型上看,PUB4正調(diào)節(jié)幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的ROS產(chǎn)生和胼胝質(zhì)沉積,負(fù)調(diào)節(jié)MAPK激活與防御基因表達(dá),這種看起來(lái)相互矛盾的表型可能是pub4突變引用的水楊酸(SA)合成紊亂有關(guān),但具體機(jī)制尚不清楚[39].而AtCERK1的磷酸化位點(diǎn)S493突變會(huì)降低AtPUB4的轉(zhuǎn)磷酸化水平[31].此外,AtCERK1可以與RLCKⅦ-4家族中的組成型差異生長(zhǎng)蛋白1(CDG1)互作并將其磷酸化.AtCDG1獨(dú)立于PUB12/13途徑來(lái)促進(jìn)AtCERK1降解,進(jìn)而負(fù)調(diào)節(jié)免疫反應(yīng).但該過(guò)程需要具有激酶活性的AtMEKK1參與,失活的AtMEKK1可以抑制AtCDG1介導(dǎo)的AtCERK1降解和免疫缺陷[40],如圖1(c)所示.
圖1 植物L(fēng)ysM蛋白參與幾丁質(zhì)激活免疫反應(yīng)通路.
含LysM的蛋白在不同植物中也參與多種生物學(xué)功能.如在感知幾丁質(zhì)和信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程中,雖然AtLYK2有助于誘導(dǎo)胼胝質(zhì)沉積,但是其作用并不明顯.但AtLYK2會(huì)增強(qiáng)由鞭毛蛋白誘導(dǎo)的灰霉病菌和丁香假單胞菌的抗性,以及在真菌感染過(guò)程中激活防御基因的表達(dá)[41].
棉花GhLYK1和GhLYK2具有結(jié)合幾丁質(zhì)的能力,受大麗輪枝菌感染后被誘導(dǎo),對(duì)棉花抗黃萎病有一定的作用[42].棉花GhLYP1,GhLYK7和細(xì)胞外LysM蛋白3(GhLysMe3)是識(shí)別幾丁質(zhì)信號(hào)的受體,可激活下游SA、茉莉酸(JA)和ROS信號(hào)通路,以及相關(guān)防御基因的表達(dá),增強(qiáng)對(duì)黃萎病的抗性[43].細(xì)胞壁相關(guān)激酶GhWAK7A直接與GhCERK1和GhLYK5相互作用[44].被真菌病原菌感染后,GhLYK5識(shí)別幾丁質(zhì),刺激GhLYK5與GhCERK1結(jié)合.GhWAK7A對(duì)GhLYK5的磷酸化或起支架(scaffolding)作用,可能促進(jìn)GhLYK5與GhCERK1復(fù)合物的形成,從而啟動(dòng)下游ROS產(chǎn)生、MAPK激活和防御相關(guān)基因表達(dá),提高黃萎病和枯萎病抗性[44].
在桑樹(shù)中鑒定了MmLYP1(CEBiP同源物)和MmLYK2(CERK1同源物).用幾丁質(zhì)處理后,MmLYP1的表達(dá)顯著上升,但MmLYK2沒(méi)有明顯變化.此外,MmLYP1對(duì)不溶性幾丁質(zhì)聚合物具有親和力,而MmLYK2的親和能力較低.這表明雖然MmLYP1缺乏胞內(nèi)激酶結(jié)構(gòu)域,但MmLYP1通過(guò)與MmLYK2相互作用參與幾丁質(zhì)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[45].
在番茄中,SlLYK1參與幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的免疫反應(yīng),SlLYK10和SlLYK12參與調(diào)節(jié)叢枝菌根(AM)共生,而異源過(guò)表達(dá)SlLYK1和SlLYK13將誘導(dǎo)細(xì)胞死亡[46-47].
LysM結(jié)構(gòu)域作為一類古老并廣泛存在的結(jié)構(gòu)域,在植物免疫應(yīng)答過(guò)程中起作用.LysM蛋白介導(dǎo)的植物免疫途徑的調(diào)控機(jī)制已經(jīng)取得了顯著進(jìn)展,但LysM蛋白對(duì)不同聚糖結(jié)構(gòu)的特異性識(shí)別機(jī)制仍不清楚,其激酶可逆磷酸化與泛素化調(diào)節(jié)的蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)機(jī)制也有待研究.進(jìn)一步挖掘免疫應(yīng)答過(guò)程中LysM蛋白調(diào)控的下游因子并明確關(guān)鍵調(diào)控位點(diǎn),解析LysM家族成員之間及其與其他膜定位類受體激酶在質(zhì)膜上的招募與互作分子機(jī)制,明確LysM與其互作蛋白形成的分子模塊對(duì)下游靶蛋白的調(diào)控作用,將為深入揭示LysM蛋白對(duì)植物免疫應(yīng)答的分子調(diào)控機(jī)理提供重要信息.