刁雨菲,熊雄,鄭金柱,靳紀(jì)洋,于成明*,劉會香*
蘋果樹腐爛病菌絲氨酸蛋白酶基因的功能分析
刁雨菲1,熊雄2,鄭金柱3,靳紀(jì)洋2,于成明1*,劉會香1*
1. 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院/山東省林業(yè)有害生物防控工程技術(shù)研究中心, 山東 泰安 271018 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)院, 山東 泰安 271018 徂徠山林場, 山東 泰安 271027
蘋果是我國種植面積最廣的溫帶水果之一,由蘋果黑腐皮殼菌()引起的蘋果樹腐爛?。╟anker of apple)是危害我國蘋果樹最為嚴(yán)重的病害之一。明確病原菌生長發(fā)育、響應(yīng)環(huán)境脅迫及致病作用,解析病原菌的適應(yīng)性及致病分子機(jī)制,有利于提出病害新的防控措施。本研究應(yīng)用Double-joint PCR以及gap-repair方法獲得基因的缺失突變體和回補(bǔ)菌株。利用十字交叉法和傷口接種等方法,研究了基因?qū)Σ【L發(fā)育和致病性的影響。通過在PDA培養(yǎng)基中分別添加400 μg/mL的熒光增白劑、200 μg/mL的剛果紅、0.01%的SDS三種細(xì)胞壁干擾劑和0.5 M的NaCl、0.5 M山梨醇兩種滲透脅迫因子,研究了該基因?qū)Σ【?xì)胞壁完整性的維持及滲透脅迫的影響。通過設(shè)置不同pH的培養(yǎng)基,研究了基因在不同pH下對病菌生長發(fā)育的影響。研究結(jié)果顯示,與野生型sdau11-175相比,基因缺失突變體在菌落顏色、菌絲致密度、生長速率無顯著差異,分生孢子器產(chǎn)生數(shù)量減少;在含有200 μg/mL剛果紅、0.01%SDS的培養(yǎng)基上,抑制率顯著降低,在含有0.5 M NaCl的培養(yǎng)基上的抑制率顯著增加,而在含有400 μg/mL熒光增白劑和0.5 M山梨醇的培養(yǎng)基上,無顯著差異;在pH為4-10時(shí),生長速率顯著降低,而在pH為11-12時(shí),無顯著性差異;在蘋果果實(shí)和蘋果枝條上的病斑大小無顯著性差異,回補(bǔ)菌株均恢復(fù)到野生型水平。表明基因在病菌分生孢子器的產(chǎn)生、酸堿度的響應(yīng)、維持細(xì)胞壁完整性以及滲透脅迫方面發(fā)揮重要作用。
蘋果樹腐爛病菌;基因; 絲氨酸蛋白酶; 表型分析
蘋果是我國種植面積最廣的溫帶水果之一,由蘋果黑腐皮殼菌(Miyabe et Yamada)引起的蘋果樹腐爛病(canker of apple)是分布廣泛、危害嚴(yán)重、防治困難的一種枝干性病害,該病害主要危害主干和大枝,造成蘋果樹皮腐爛,樹勢衰弱,嚴(yán)重時(shí)可造成整株死亡[1, 2]。對蘋果腐爛病菌適應(yīng)性及致病分子機(jī)制進(jìn)行研究有利于提出病害新的防控措施。
絲氨酸蛋白酶(S)是蛋白酶中最龐大的家族,以絲氨酸為活性中心蛋白水解酶,絲氨酸蛋白酶在治療心血管疾病、胚胎發(fā)育、組織重建、細(xì)胞分化、血管形成和病原侵入等過程中都發(fā)揮著重要的作用[3,4]。在植物病原真菌中,研究發(fā)現(xiàn),煙曲霉()中的絲氨酸蛋白酶基因ALP2缺失后,菌絲生長速度減慢,分生孢子產(chǎn)生數(shù)量減少,分生孢子囊直徑減少[5]。在稻瘟病菌()中,絲氨酸蛋白酶基因和在cAMP誘導(dǎo)的孢子萌發(fā)和附著胞形成階段均上調(diào)表達(dá)[6],基因的缺失突變體表現(xiàn)為氣生菌絲減少,分生孢子產(chǎn)生數(shù)量減少,致病性下降,而基因的缺失在生長發(fā)育和致病性上與野生型相比無顯著差異[7]。蘋果腐爛病菌中絲氨酸蛋白酶基因位于10號染色體上,全長1888bp,編碼606個(gè)氨基酸,登錄號為KUI73074.1,具有Peptidases_S8_S53超家族結(jié)構(gòu)域,該基因?qū)Σ【L發(fā)育及致病作用調(diào)控功能尚未研究報(bào)道。
本研究以基因?yàn)槟康幕颍肈ouble-joint PCR技術(shù)構(gòu)建敲除載體,通過PEG介導(dǎo)原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法獲得敲除突變體,利用gap-repair技術(shù)獲得回補(bǔ)菌株;通過對野生型菌株、基因缺失突變體、回補(bǔ)菌株的生長發(fā)育、對脅迫因子響應(yīng)、致病性等方面的比較分析,研究結(jié)果為明確基因在病菌生長發(fā)育、響應(yīng)環(huán)境脅迫及致病等方面功能提供理論依據(jù)。
蘋果樹腐爛病菌野生型菌株sdau11-175由山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院林木病原與寄主分子互作研究室提供。菌株保存在20%的甘油中,蘋果樹2年生枝條采自山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植保實(shí)驗(yàn)站,蘋果果實(shí)購于市場上生長一致的富士蘋果
從蘋果腐爛病菌基因組數(shù)據(jù)庫[8]NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)中獲得基因序列,通過替換基因開放閱讀框(ORF),構(gòu)建基因敲除突變體,以野生型菌株sdau11-175 DNA為模板,分別擴(kuò)增基因的上游片段、HPH片段以及下游片段,所用引物見表1(其中08720-SY-R和08720-XY-F小寫部分,分別與HPH-F、HPH-R兩端序列反向互補(bǔ))。應(yīng)用Double-joint PCR方法構(gòu)建敲除載體[9],利用PEG介導(dǎo)法將得到的敲除載體轉(zhuǎn)化到sdau11-175的原生質(zhì)體中[10]。用3對引物(表1)驗(yàn)證是否敲除成功[11]。用gap repair的方法構(gòu)建回補(bǔ)載體,以sdau11-175為模板,用表1的回補(bǔ)引物擴(kuò)增基因片段,后與pFL2質(zhì)粒相連,將得到的回補(bǔ)載體轉(zhuǎn)到敲除突變體的原生質(zhì)體中,篩選得到回補(bǔ)菌株[12]。
表1 本研究所使用的引物
將野生型菌株sdau11-175、基因缺失突變體和回補(bǔ)菌株接種到PDA培養(yǎng)基上,25℃黑暗培養(yǎng)3d后測定菌落直徑大小,觀察菌落形狀、顏色、菌絲生長狀況。每個(gè)處理重復(fù)3次,試驗(yàn)共重復(fù)3次,數(shù)據(jù)處理采用SPSS方法(<0.05)[13]。繼續(xù)將野生型菌株sdau11-175、基因缺失突變體和回補(bǔ)菌株置于光暗交替的培養(yǎng)基中培養(yǎng)25 d后,觀察分生孢子器的產(chǎn)生情況,實(shí)驗(yàn)方法同上。
在PDA培養(yǎng)基中添加了400 μg/mL的熒光增白劑、200 μg/mL的剛果紅、0.01%的SDS三種細(xì)胞壁干擾劑,觀察突變體對細(xì)胞壁干擾劑的敏感性,評價(jià)基因?qū)Σ【?xì)胞壁完整性的調(diào)控作用,上述均在3 d后測定菌落直徑大小,每個(gè)處理重復(fù)3次,試驗(yàn)共重復(fù)3次。
在PDA培養(yǎng)基中添加了0.5 M的NaCl、0.5 M的山梨醇兩種滲透脅迫因子,測定基因?qū)B透脅迫的響應(yīng),上述均在3 d后測定菌落直徑大小,每個(gè)處理重復(fù)3次,試驗(yàn)共重復(fù)3次。
將培養(yǎng)3 d的野生型菌株sdau11-175、基因缺失突變體、回補(bǔ)菌株接種到不同pH值(pH為4-12)的PDA平板上,25 ℃培養(yǎng)3 d,測量菌落直徑。每個(gè)處理重復(fù)3次,試驗(yàn)重復(fù)3次。
選取PDA培養(yǎng)基上培養(yǎng)3 d的野生型菌株sdau11-175、基因缺失突變體和回補(bǔ)菌株及生長一致的成熟蘋果果實(shí)和2年生蘋果枝條,采用傷口接種法,接種后的蘋果果實(shí)和枝條置于25℃下保濕培養(yǎng)7 d,每個(gè)處理重復(fù)10次,試驗(yàn)共重復(fù)3次。
以sdau11-175基因組DNA為模板,用引物08720-SY-F/R、08720-XY-F/R擴(kuò)增得到了上游片段、下游片段;以PCB1003為模板,用引物HPH-F/R擴(kuò)增得到了HPH片段,三片段融合后得到敲除載體,轉(zhuǎn)入原生質(zhì)體后,用3對引物進(jìn)行驗(yàn)證,證明敲除成功(圖1A)。
以sdau11-175為模板,用引物08720HB-F/R擴(kuò)增得到了回補(bǔ)片段,轉(zhuǎn)入原生質(zhì)體后,用引物08720HB-F/R進(jìn)行PCR驗(yàn)證,證明回補(bǔ)成功,成功獲得回補(bǔ)菌株(圖1B)。
圖1 蘋果腐爛病菌基因VM1G_08720缺失突變體及回補(bǔ)菌株P(guān)CR鑒定
備注:A:3對引物對缺失突變體進(jìn)行PCR驗(yàn)證;B:回補(bǔ)菌株的PCR鑒定。
Note:A:PCR identification for deletion mutants with three pairs of primers;B:PCR identification for complementation strains.
在25 ℃生長3 d后,與野生型菌株sdau11-175相比,基因缺失突變體在菌落顏色、菌絲致密度、生長速率無顯著差異(圖2A、2B)。繼續(xù)將菌株光暗交替培養(yǎng)25 d后,觀察分生孢子器產(chǎn)生情況,與野生型菌株sdau11-175相比,基因缺失突變體分生孢子器產(chǎn)生數(shù)量減少(圖2C),野生型菌株分生孢子器平均產(chǎn)生數(shù)量為120個(gè),而基因缺失突變體分生孢子器平均產(chǎn)生數(shù)量為83個(gè),回補(bǔ)菌株分生孢子器產(chǎn)生數(shù)量恢復(fù)到野生型水平(圖2D)。
圖2 野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株對病菌生長發(fā)育的影響
備注:A:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株的菌落形態(tài);B:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株的菌落直徑大?。籆:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株分生孢子器產(chǎn)生情況;D:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株分生孢子器產(chǎn)生數(shù)量統(tǒng)計(jì)。
Note: A: Colony morphology of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains; B: Colony diameters of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains; C: Pycnidia formation of the wild-type sdau11-175, deletion mutants and complementary strains; D: Analysis pycnidial numbers on wild-type sdau11-175, deletion mutants and complementary strains.
相對于野生型菌株sdau11-175,在含有200 μg/mL剛果紅、0.01%SDS的培養(yǎng)基上,菌絲生長抑制率顯著降低,分別降低了50%和18%;而在含有400 μg/mL熒光增白劑的培養(yǎng)基上,無顯著差異,回補(bǔ)菌株恢復(fù)到野生型水平(圖3)。這些結(jié)果表明基因?qū)S持細(xì)胞壁的完整性有重要作用。
備注:A:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株在不同脅迫因子下的菌落生長情況;B:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株在不同脅迫因子時(shí)的菌落直徑大小。
Note: A: Colony growth of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains under different stress factors; B: Colony diameter of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains under different stress factors.
相對于野生型菌株sdau11-175、基因缺失突變體在含有0.5 M NaCl的培養(yǎng)基上的菌絲生長抑制率顯著增加,增加了15%,而在含有0.5 M山梨醇的培養(yǎng)基上無顯著差異,回補(bǔ)菌株恢復(fù)到野生型水平(圖4)。這些結(jié)果表明基因?qū)Σ【鷿B透脅迫有重要作用。
圖4 基因VM1G_08720對病菌滲透脅迫的影響
備注:A:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株在不同脅迫因子下的菌落生長情況;B:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株在不同脅迫因子下的菌落直徑大小。
Note: A: Colony growth characters of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains under different stress factors; B: Colony diameters of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains under different stress factors.
相野生型菌株sdau11-175、基因缺失突變體及回補(bǔ)菌株在pH值為4-12時(shí)均能生長。與野生型菌株sdau11-175相比,在pH為4-10時(shí),基因缺失突變體的生長速率顯著降低;而在pH為11-12時(shí),無顯著性差異,回補(bǔ)菌株恢復(fù)到野生型水平(圖5)。
圖5 基因VM1G_08720對病菌酸堿適應(yīng)性的影響
備注:A:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株在不同pH條件下的生長特征;B:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株在不同pH條件下的菌落直徑大小。
Note:A: Growth characters of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains under different pH; B: Colony diameter status of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains under different pH.
基因缺失突變體及回補(bǔ)菌株在蘋果果實(shí)和蘋果枝條上的病斑大小與野生型菌株sdau11-175無顯著性差異(圖6)。說明基因?qū)μO果腐爛病菌致病性影響不大,調(diào)控作用不明顯。
圖6 基因VM1G_08720對病菌致病力的影響
備注:A:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株接種蘋果果實(shí)后的癥狀;B:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株接種蘋果果實(shí)后的病斑大?。籆:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株接種枝條后的癥狀;D:野生型菌株sdau11-175、缺失突變體、回補(bǔ)菌株接種枝條后的病斑大小。
Note: A: Symptom of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains on apple fruit after inoculation; B: Lesion sizes of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains on apple fruit; C: Symptom of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains on twigs after inoculation; D: Lesion sizes of wild-type strains sdau11-175, deletion mutants and complementary strains on apple twigs.
本研究以基因?yàn)檠芯繉ο螅ㄟ^Double-joint PCR的方法獲得了缺失突變體,利用gap-repair方法獲得回補(bǔ)菌株。通過對病菌生長發(fā)育、細(xì)胞壁完整性、滲透脅迫、酸堿度以及致病性測定,基因缺失突變體對病菌生長無影響,正調(diào)控分生孢子器的產(chǎn)生,在受到200 μg/ml剛果紅、0.01%SDS、0.5M NaCl脅迫時(shí),生長受到抑制;在受到400 μg/ml CFW、0.5 M山梨醇脅迫時(shí),與野生型菌株相比無顯著差異,在pH為4-10時(shí),與野生型菌株相比生長速率顯著降低;在pH為11-12時(shí),與野生型菌株相比無顯著性差異,在蘋果果實(shí)和蘋果枝條上的病斑大小與野生型菌株無顯著性差異,其回補(bǔ)菌株均恢復(fù)原有功能。結(jié)果表明基因在病菌發(fā)育、維持細(xì)胞壁完整性、滲透脅迫以及酸堿適應(yīng)響應(yīng)方面發(fā)揮重要作用;對病菌生長、致病性調(diào)控作用不顯著。
絲氨酸蛋白酶在病菌生長發(fā)育方面有著重要的作用,在煙曲霉()中,絲氨酸蛋白酶基因缺失后導(dǎo)致無性生長速度輕微減緩,分生孢子的產(chǎn)生減少,這表明絲氨酸蛋白酶在煙曲霉生長發(fā)育中發(fā)揮重要作用[5],水稻稻瘟病菌()中的絲氨酸蛋白酶基因可能存在冗余現(xiàn)象,絲氨酸蛋白酶基因缺失后能夠產(chǎn)生附著胞,但分生孢子產(chǎn)生數(shù)量減少,而另一個(gè)絲氨酸蛋白酶基因缺失后對菌絲生長及分生孢子的產(chǎn)生均無影響[7]。本研究中發(fā)現(xiàn),當(dāng)蘋果腐爛病菌絲氨酸蛋白酶基因缺失后,突變體菌絲生長無影響,但分生孢子器產(chǎn)生數(shù)量減少。在稻瘟病菌中,絲氨酸蛋白酶基因的缺失能夠正調(diào)控細(xì)胞壁的完整性,但不參與滲透脅迫調(diào)節(jié),本研究中基因的缺失正調(diào)控細(xì)胞壁完整性,這與稻瘟病菌研究結(jié)果相同,基因的缺失負(fù)調(diào)控滲透脅迫,這與稻瘟病菌中的研究結(jié)果不相同。煙曲霉的絲氨酸蛋白酶基因2在pH為4.5-11之間有著廣泛的活性,這與本試驗(yàn)結(jié)果一致。本研究基因缺失突變體與野生型菌株相比,致病性無顯著性差異,表明基因在致病性方面調(diào)控作用不明顯,上述結(jié)果表明基因可能與其它絲氨酸蛋白酶基因互作共同調(diào)控病菌生長發(fā)育、致病性等,今后尚需對該基因參與的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)繼續(xù)深入研究,以解析其在病菌生長發(fā)育、環(huán)境脅迫及致病性調(diào)控中的分子作用機(jī)制。
[1] 李保華,練森,王彩霞,等.從病菌自剪鋸口木質(zhì)部侵染再談蘋果樹腐爛病的防治[J].中國果樹,2017(2):88-90
[2] Wang C, Li C, Li B,. Toxins produced byvar.and their relationship with pathogenicity [J]. Toxins, 2014,6:1139-1154
[3] 何智,陳政良.補(bǔ)體系統(tǒng)絲氨酸蛋白酶的結(jié)構(gòu)與功能[J].國外醫(yī)學(xué)免疫學(xué)分冊,2004,27(6):316-319
[4] Maxwell MK, Enrico DC. Molecular markers of serine protease evolution [J]. Embo Journal, 2001,20(12):3036-3045
[5] Shen HD, Tam MF, Chou H,. The importance of serine proteinases as aeroallergens associated with asthma [J]. Int Arch Allergy Immunol, 1999,119(4):259-264
[6] Oh Y, Donofrio N, Pan H,. Transcriptome analysis reveals new insight into appressorium formation and function in the rice blast fungus[J]. Genome Biol, 2008,9(5):R85
[7] Donofrio NM, Oh Y, Lundy R,. Global gene expression during nitrogen starvation in the rice blast fungus,[J]. Fungal Genet Biol, 2006,43(9):605-617
[8] Yin ZY, Liu HQ, Li ZP,. Genome sequence ofcanker pathogens uncovers a potental adaptation of colonization of woody bark [J]. New Phytologist, 2015,208(4):1202-1216
[9] Yu JH, Hamari Z, Han KH,. Double-joint PCR: a PCR-based molecular tool for gene manipulations in filamentous fungi [J]. Fungal Genetics and Biology, 2004,41(11):973-981
[10] 陳亮,倫瑩瑩,孫庚午,等.蘋果腐爛病菌原生質(zhì)體制備與再生條件優(yōu)化[J].山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,46(8):109-112
[11] Li ZP, Yin ZY, Fan YY,. Candidate effector proteins of the necrotrophic apple canker pathogencan suppress BAX-induced PCD [J]. Frontiers in Plant Science, 2015,6:579
[12] Zhou XY, Zhang HF, Li GT,. The Cyclase-associated protein Cap1 is important for proper regulation of infection-related morphogenesis in[J]. Plos Pathog, 2012,8(9):503-512
[13] 賈曉曼,王怡霖,孫庚午,等.蘋果腐爛病菌基因敲除突變體獲得及表型分析[J].核農(nóng)學(xué)報(bào),2018,32(3):448-454
Functional Analysis of Serine Protease Genein
DIAO Yu-fei1, XIONG Xiong2, ZHENG Jin-zhu3, JIN Ji-yang2, YU Cheng-ming1*, LIU Hui-xiang1*
1.,/,271018,2./,271018,3.271027,
Apple is one of the most widely planted temperate fruits in China.canker of apple caused byis one of the most serious diseases of apple tree in China. Therefore, strengthen the scientific prevention and control of, and clarify the adaptability and pathogenic effect of pathogens to the environment is the key problem for diease. In this paper, Double-joint PCR and gap-repair methods were used to obtain deletion mutants and complement strains of the gene. The effect of the geneon nutritional growth and pathogenicity was investigated used the cross-over method and the wound inoculation. The role on the maintenance of cell wall integrity and the regulation of osmotic stress of the genewere investigated by adding 400 μg/mL calcofluor white, 200 μg/mL Congo red, 0.01% SDS, and 0.5 M NaCl, 0.5 M sorbitol. The effect of the geneon the hyphal growth of the pathogen under different pH was investigated by setting the medium for different gradient. The results showed that the genedeletion mutant was no significant differences in colony color, mycelium density, growth rate compared with wild-type sdau11-175. The numbers of pycnidial production were reduced. The inhibition rate was significantly reduced on medium containing 200 μg/mL of congo red and 0.01% SDS, and the inhibition increased significantly on medium containing 0.5 M NaCl, and there was no significant difference in the culture medium containing 400 μg/mL calcofluor white and 0.5 M sorbitol. Growth rate was significantly reduced at pH 4-10, with no significant difference at pH 11-12. There was no significant difference in diseased spot sizes between mutant and wild strain on apple fruit and apple branches. All the complement strains were recovered to wild-type levels. It indicates that the geneplays an important role in pycnidial production, pH response, maintenance of cell wall integrity, and osmotic stress.
;gene; serine proteinase; phenotype analysis
S436.611.1+1
A
1000-2324(2022)05-0735-07
2022-06-25
2022-06-05
國家自然基金項(xiàng)目(31770684);山東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(ZR2017MC042)
刁雨菲(1996-),女,博士研究生,專業(yè)方向林果病原與寄主分子互作機(jī)制研究. E-mail:1031151284@qq.com
通訊作者:Author for correspondence. E-mail:ycm2006.apple@163.com; hxliu@sdau.edu.cn
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)2022年5期