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    松材線蟲檢測技術(shù)研究進展

    2022-12-30 12:42:35李敏葉建仁陳鳳毛
    中國森林病蟲 2022年3期
    關(guān)鍵詞:凝膠電泳松材線蟲

    李敏,葉建仁,陳鳳毛

    (南京林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心,江蘇南京 210037)

    松材線蟲病(pine wilt disease)又稱松樹萎蔫病,其病原是松材線蟲Bursaphelenchus xylophilus(Steiner &Buhrer) Nickle[1-2]。 松材線蟲起源于北美洲[3],我國于1982 年首次在南京中山陵的黑松Pinus thunbergii上分離到松材線蟲[4]。 此后,松材線蟲病在我國呈持續(xù)擴散蔓延態(tài)勢,造成嚴(yán)重經(jīng)濟損失[5]。 隨著該病害向高緯度地區(qū)擴散,對我國高緯度、高海拔地區(qū)的松林資源威脅進一步加大[6]。40 年來,我國松材線蟲病疫情尚未得到根本性的控制。

    松材線蟲病防控的首要措施是檢測與監(jiān)測。 在我國發(fā)生松材線蟲病的前20 年,疫情監(jiān)測難以真正在基層開展,不能做到及時發(fā)現(xiàn)、及早除治。 疫木控制更是因為沒有可行的快速檢測技術(shù),人為傳播現(xiàn)象嚴(yán)重。 因此,松材線蟲的檢測鑒定工作十分重要,致力于快速、準(zhǔn)確、便捷的病害診斷技術(shù)的研究工作一直在不斷推進。

    1 基于形態(tài)學(xué)特征的檢測方法

    松材線蟲的形態(tài)學(xué)檢測是一種在顯微鏡下觀察和分析形態(tài)特征的傳統(tǒng)檢測方法[7],根據(jù)線蟲的體長、尾長、尾尖突形狀、中食道球的寬度、陰門的位置以及陰門蓋的有無等特征對線蟲進行鑒定[8]。

    形態(tài)學(xué)檢測方法是最基本的鑒定方法,不需要貴重的儀器與設(shè)備,投入成本相對較小。 生產(chǎn)、科研、教學(xué)單位常采用該方法。 但是,形態(tài)學(xué)鑒別也有其自身的不足,最大難點在于區(qū)分與松材線蟲同屬的其它傘滑刃線蟲,尤其是與擬松材線蟲Bursaphelenchus mucronatus的區(qū)別難度最大。 在形態(tài)學(xué)特征出現(xiàn)重疊的情況下,鑒定往往帶有主觀性。 此外,通過形態(tài)學(xué)方法幾乎難以確定幼蟲和雄成蟲的種類。 因此,形態(tài)學(xué)檢測需要檢測人員具備豐富的線蟲學(xué)專業(yè)知識背景和實踐經(jīng)驗。 形態(tài)學(xué)檢測的時間相對較長,在沒有發(fā)現(xiàn)分離樣品中存在典型雌成蟲的情況下,需要對所分離的樣品逐一觀察,有時需要培養(yǎng)至成蟲出現(xiàn)再進行鑒定。

    2 基于分子生物學(xué)的檢測方法

    鑒于形態(tài)學(xué)鑒定存在的不足之處,研究人員先后研發(fā)了以核酸為基礎(chǔ)的松材線蟲分子生物學(xué)檢測方法。 主要有限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)、隨機擴增多態(tài)性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)、序列特異擴增區(qū)域(sequence characterized amplified region,SCAR)、巢氏PCR(nested PCR)、實時熒光定量PCR(real-time PCR)、環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)、重組聚合酶擴增(recombinase polymerase amplification,RPA)等。

    2.1 RFLP 技術(shù)

    20 世紀(jì)80 年代Lander 等[9]最早提出將RFLP標(biāo)記方法用于區(qū)別不同物種。 由于不同物種的DNA 序列結(jié)構(gòu)不同,內(nèi)切酶的識別位點以及數(shù)目不同,其被不同種類的限制性內(nèi)切酶酶切后,所表現(xiàn)出的凝膠電泳圖譜必然會反映物種間的差異。

    在松材線蟲與其近似種的區(qū)別方面,很多學(xué)者利用ITS-RFLP 技術(shù)進行了探索[10-17]。 其中發(fā)現(xiàn)DraI 酶能夠酶切松材線蟲群體,產(chǎn)生兩個長度分別約510 bp 和380 bp 的片段,而近似種擬松材線蟲群體均不能被DraI 酶切;此外,SalI 酶不能酶切松材線蟲群體,但擬松材線蟲群體均能被酶切為兩條720 bp 和220 bp 的片段。 因此,內(nèi)切酶DraI、SalI可以很好地用來區(qū)分松材線蟲與擬松材線蟲這兩個近似種。

    RFLP 是分析植物寄生線蟲種間和種下群體遺傳變異的有效工具。 但該方法所需操作步驟多,整個分析過程耗時過長,操作程序過于復(fù)雜。 此外,實驗對提取的線蟲DNA 有較高的要求,須保證DNA的純度。

    2.2 PCR 技術(shù)

    1)常規(guī)PCR。 Mullis 最早于1983 年提出聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)設(shè)想,1985 年P(guān)CR 技術(shù)誕生[18]。 此后,該技術(shù)成為最常用、最重要的分子生物學(xué)技術(shù)之一。DNA 的半保留復(fù)制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA 在高溫時發(fā)生變性解鏈成為兩條單鏈,在低溫時兩條單鏈又可復(fù)性成為一條雙鏈。 因此,可通過溫度升降變化來控制DNA 的變性和復(fù)性,從而可實現(xiàn)某特定基因的體外復(fù)制,即PCR 技術(shù)。

    PCR 技術(shù)的應(yīng)用,使植物寄生性線蟲的分子診斷和致病性的基礎(chǔ)研究發(fā)生了質(zhì)的變化。 基于序列差異的分子診斷方法已成為植物病理學(xué)的一種通用方法。 常規(guī)PCR 已廣泛應(yīng)用于系統(tǒng)發(fā)育研究、種源鑒定研究和致病基因探索等領(lǐng)域。 使用PCR 技術(shù)可通過擴增特異性區(qū)域來區(qū)分形態(tài)類似的線蟲[19],采用不同的引物進行檢測,將擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳儀驗證后可以提高線蟲鑒定的靈敏度。 與其它分子生物學(xué)技術(shù)相結(jié)合,將充分發(fā)揮PCR 在特定物種鑒定方面的作用。 該技術(shù)還可以實現(xiàn)對待測樣品的批量檢測。 PCR 檢測技術(shù)的核心是用于檢測物種的引物是否具有特異性,這需要在長期的實踐中進行檢驗。 常規(guī)PCR 檢測也需要借助凝膠電泳進行判斷,這也需要較長的時間,并非真正意義上的快速檢測。

    2)巢式PCR。 常規(guī)PCR 在對模板進行擴增的過程中,引物與模板之間會出現(xiàn)非特異性配對,導(dǎo)致產(chǎn)生非特異性產(chǎn)物。 為提高PCR 擴增的特異性,Lee 等[20]對常規(guī)PCR 進行技術(shù)改良,發(fā)明了巢式PCR。 它是通過增加和擴增一組引物來提高PCR的特異性。 第1 對引物稱為普通PCR 引物,第2 對引物稱為巢氏引物。 首先使用普通PCR 引物進行擴增,然后針對第一次PCR 擴增產(chǎn)物使用巢氏引物進行第二次擴增,這使得第二次PCR 擴增的片段要短于第一次擴增。

    2011 年,Huang 等[21]構(gòu)建了以拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ為靶點的松材線蟲特異性巢式PCR,對44 株形態(tài)特征明顯的線蟲株系進行了檢測,包括松材線蟲、擬松材線蟲、霍夫曼尼傘滑刃線蟲Bursaphelenchus hofmanni、吳氏長尾線蟲Seinura wuae、李氏長尾線蟲Seinura lii和大核滑刃線蟲Aphelenchoides macronucleatus,所有松材線蟲株系均有509 bp 擴增產(chǎn)物。該巢式PCR 體系可以檢測到50 fg 模板DNA 或一個卵大小的線蟲個體。 通過對田間線蟲侵染木材中提取的線蟲樣品分析,該方法是一種特異性強、靈敏度高的檢測方法。

    巢氏PCR 的優(yōu)點是特異強,即使提取線蟲DNA 的量非常少,也能擴增特異性區(qū)域。 但如果第一次擴增發(fā)生錯誤,第二次就無法成功擴增,該方法很難同時檢測和區(qū)分多種病原物。

    3)實時熒光定量PCR。 1989 年Choo 等[22]研發(fā)了實時熒光定量PCR 技術(shù),也稱為RT -PCR 或qPCR(quantitative PCR)。 在PCR 反應(yīng)體系中加入熒光染料或者帶熒光基團的探針,利用每次擴增循環(huán)后熒光信號的加倍積累,實時監(jiān)測PCR 進程,對標(biāo)標(biāo)準(zhǔn)曲線,從而實現(xiàn)對物種未知模板初始含量的分析。

    RT-PCR 已經(jīng)發(fā)展成為一種較為常用的線蟲種間鑒定方法[23-24]。 陳鳳毛 等[25]以松材線蟲的rDNA 內(nèi)部轉(zhuǎn)錄區(qū)為靶標(biāo),設(shè)計了一對實時熒光定量PCR 引物和特異探針,構(gòu)建了松材線蟲實時熒光定量PCR 檢測方法。 特異引物組合F11/R11 與探針TaqMan-11 能夠較好地區(qū)分來自枯死松樹體內(nèi)的松材線蟲、擬松材線蟲、大核滑刃線蟲、霍夫曼尼傘滑刃線蟲和長尾屬Seinura線蟲。 在10 μL 的反應(yīng)體系中,能夠檢測出0.005 pg 的物種DNA 含量。表明該技術(shù)具有靈敏、準(zhǔn)確等優(yōu)點。 RT -PCR 存在的不足主要是實驗過程相對較為耗時,且相關(guān)試劑和設(shè)備較為昂貴。

    2009 年南京林業(yè)大學(xué)線蟲創(chuàng)新研究團隊在原有實時PCR 檢測技術(shù)的基礎(chǔ)上,進一步優(yōu)化高效線蟲裂解液,實現(xiàn)對松木樣本中的線蟲直接進行組織裂解釋放DNA;同時對線蟲特異性片段檢測過程、結(jié)果判讀和報告輸出等環(huán)節(jié)進行自動化設(shè)計,研制出松材線蟲專項自動化檢測系統(tǒng)。 該系統(tǒng)已在全國20 多省推廣應(yīng)用。

    2.3 基于PCR 技術(shù)的分子標(biāo)記

    1)RAPD 技術(shù)。 20 世紀(jì)90 年代,Williams[26]和Welsh[27]等研發(fā)了RAPD 分子標(biāo)記。 其引物是一條10 bp 的寡核苷酸單鏈隨機引物。 通常在物種的基因組中,每2 000 bp 長的序列內(nèi)約有10 個左右的反向重復(fù)序列,在兩條模板DNA 單鏈上就可能各有1 個引物的結(jié)合位點,若2 個結(jié)合位點間的序列在3 000 bp 的長度范圍之內(nèi),便可擴增出該引物的譜帶。 通過不同的隨機引物就可以檢測到覆蓋整個基因組的位點,由此反映出該物種的真實多樣性。

    RAPD 技術(shù)也曾用于線蟲檢測。 Braasch 等采用RAPD-PCR 技術(shù)對松材線蟲及其近似種擬松材線蟲的遺傳多樣性進行研究[28-31]。 Braasch 等發(fā)現(xiàn)隨機引物OPY-01、OPB-7N、OPPZ-08 能區(qū)分松材線蟲、假傘滑刃線蟲B.fraudulentus和擬松材線蟲。 陳鳳毛 等[32]研究發(fā)現(xiàn)隨機引物OPK09 與隨機引物組合OPC18 +OPN18 可以很好地區(qū)分松材線蟲和擬松材線蟲。

    RAPD 所含信息量大,圖譜比較復(fù)雜,對實驗反應(yīng)體系和條件要求嚴(yán)格,擴增靈敏,重復(fù)性相對較低。 在物種鑒定(包括松材線蟲檢測)上存在一定難度。

    2)SCAR 技術(shù)。 該技術(shù)是Paran 等[33]在RAPD技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展的一種新的分子標(biāo)記。 在物種特異的RAPD 片段序列上設(shè)計一對24 個堿基的互補引物,并對原來的模板DNA 擴增,特征序列擴增區(qū)域(SCARs)即被擴增檢測到。

    SCAR 標(biāo)記在品種的抗病檢測、種質(zhì)鑒定等多領(lǐng)域廣泛應(yīng)用[34-36]。 陳鳳毛 等采用SCAR 標(biāo)記構(gòu)建了松材線蟲檢測試劑盒,其檢測的靈敏度達(dá)到1/7條線蟲,并實現(xiàn)了對幼蟲的準(zhǔn)確檢測[37]。

    SCAR 標(biāo)記可以快速檢測大量個體,結(jié)果穩(wěn)定性好,重現(xiàn)性高。 但該方法程序多,完成全部檢測過程需要2.5 ~3.0 h。

    2.4 環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(LAMP)

    LAMP 是Notomi 等[38]研發(fā)的一種新的核酸擴增方法。 不同于PCR 僅需要設(shè)計上、下游引物,LAMP 則需要設(shè)計包括外引物、內(nèi)引物等4 ~6 條引物。 僅需要在60 ~65 ℃的恒溫下,利用具有鏈置換效應(yīng)以及識別延伸效應(yīng)的BstDNA 聚合酶,對目的片段進行大量且快速的擴增。

    LAMP 技術(shù)自開發(fā)以來,已經(jīng)在國內(nèi)外醫(yī)學(xué)病原物檢測、食品安全檢測及基因芯片等方面有廣泛的應(yīng)用且效果良好,近些年也逐漸應(yīng)用到植物病原檢測領(lǐng)域[39]。 在LAMP 擴增產(chǎn)物中,添加SYBR Green I 染料,以便于對檢測結(jié)果的判讀。 目前常通過ITS 區(qū)段、β-actin 區(qū)段、果膠酸裂解酶3 基因和expansin-like 基因檢測和區(qū)分致病線蟲是否為松材線蟲[40-41]。 據(jù)Kikuchi 等[42]報道,日本開發(fā)了一種商業(yè)化的、用LAMP 方法檢測松材線蟲的試劑盒,診斷結(jié)果需要1.5 h 左右。

    LAMP 操作簡單、成本低廉且設(shè)備需求不高,不需要昂貴的儀器設(shè)備即可用于具有熒光樣品的現(xiàn)場檢測。 然而LAMP 擴增的產(chǎn)物不是連續(xù)的片段,這使得克隆或在其他方面的應(yīng)用變得局限。 在高溫和長時間放大過程中,由于陽性樣品的氣溶膠交叉污染,有可能獲得假陽性樣品。 此外,通過顏色判讀結(jié)果,也存在一定誤差。

    鑒于顏色判別存在的主觀差異問題,南京林業(yè)大學(xué)于2009 年在LAMP 技術(shù)基礎(chǔ)上,成功研發(fā)了CPA(crossing priming amplification) 技 術(shù)。 該 技術(shù)具有靈敏度高、特異性強、易于判讀、檢測設(shè)備簡單、一次性投資低廉、易于普及等優(yōu)點。 目前已在浙江、江蘇、上海、四川、重慶、安徽、山東等7 省推廣應(yīng)用。

    2.5 重組酶聚合酶擴增(recombinase polymerase amplification,RPA)

    RPA 是TwistDx Inc 公司于2006 年開發(fā)的一項技術(shù)[43]。 該技術(shù)主要依賴于能結(jié)合單鏈核酸(寡核苷酸引物)重組酶T4 UvsX、單鏈結(jié)合蛋白(SSB)和鏈置換DNA 聚合酶等。 重組酶與擴增引物結(jié)合形成重組酶引物復(fù)合體,插入雙鏈DNA 形成D -環(huán)結(jié)構(gòu),啟動鏈置換反應(yīng)。 SSB 蛋白與解開的DNA鏈結(jié)合防止進一步被置換。 重組酶從復(fù)合體中被水解,3′端引物暴露并與DNA 聚合酶結(jié)合,DNA 開始復(fù)制延伸,2 條母鏈分離,形成2 條新的互補雙鏈DNA,從而實現(xiàn)對模板上的目標(biāo)區(qū)域進行指數(shù)式擴增。

    RPA 不需要熱變性,也不需要溫控設(shè)備。 在23 ~45 ℃條件下,20 min 內(nèi)即可完成擴增過程,實現(xiàn)快速檢測目標(biāo)。 可與實時熒光檢測、側(cè)向?qū)游龊湍z電泳以及橋聯(lián)絮凝分析、比色反應(yīng)、電化學(xué)轉(zhuǎn)導(dǎo)、電化學(xué)生物傳感器、硅微環(huán)諧振器(SMR)光子檢測和表面增強拉曼散射(SERS)等檢測方法結(jié)合,以實現(xiàn)快速檢測[44]。

    Cha 等[45]將便攜式光學(xué)等溫裝置(POID),結(jié)合應(yīng)用松木中松材線蟲gDNA 的快速提取緩沖液(DAP buffer),進一步簡化檢測程序,能在田間25 min內(nèi)完成松材線蟲病診斷,實現(xiàn)對松材線蟲的現(xiàn)場檢測。 用于檢測松材線蟲的POCD-RPA 將有助于該領(lǐng)域的流行病學(xué)調(diào)查以及木材貿(mào)易的檢疫過程。 對于沒有線蟲專業(yè)知識背景的人員而言,該檢測方法相對容易,且檢測結(jié)果比較準(zhǔn)確,但需要專用檢測設(shè)備。

    3 基于蛋白的檢測方法

    蛋白在生物體中起著非常關(guān)鍵的作用,如參與細(xì)胞的增殖分化、能量轉(zhuǎn)換或信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等。 膜蛋白的分布并不均勻,而且特定物種之間存在較大差異,因此不同物種的蛋白就相當(dāng)于一個獨特身份的“條形”碼,通過分析蛋白的表達(dá)水平和表達(dá)模式可以確定線蟲的種類和不同線蟲的種間差異[46-47]。 從樹體分離的線蟲中提取蛋白后,可通過蛋白質(zhì)序列差異分析、同工酶分析(isozyme analysis)、二維凝膠電泳(Two-dimensional gel electrophoresis,2-DGE)和蛋白飛行時間質(zhì)譜技術(shù)等較為成熟的技術(shù)手段,對線蟲進行鑒定。

    3.1 雙向凝膠電泳(2-DGE)

    該技術(shù)是由Farrell、Klose 以及Scheele 等人于1975 年發(fā)明[48]。 其原理是第一向基于蛋白質(zhì)的等電點不同,在一個穩(wěn)定和連續(xù)的pH 梯度中進行分離和分析,具有相同等電點的蛋白質(zhì)無論分子大小,均會聚集在其特定位置;第二向則按分子量的不同,用SDS-PAGE 分離,把復(fù)雜蛋白混合物中的蛋白質(zhì)在二維平面分開。 因此,根據(jù)不同線蟲種類間所含蛋白質(zhì)分子的大小及質(zhì)荷比等差異,可用雙向凝膠電泳分離技術(shù)進行鑒定。 Fu 等從松材線蟲和擬松材線蟲中提取蛋白后,采用雙向凝膠電泳技術(shù)比較了這兩種物種間的蛋白質(zhì)表達(dá)模式,與擬松材線蟲相比,在松材線蟲中共鑒定出15 種高表達(dá)特異蛋白[49]。

    雙向凝膠電泳的優(yōu)點是快速、分辨率高,同時也是唯一能夠?qū)⑸锨ХN蛋白質(zhì)同時分離和展示的技術(shù)。 其缺點也很明顯,通過分離的蛋白數(shù)量和觀察到的多態(tài)性結(jié)果取決于使用的程序和分析的樣品數(shù)量,有時很難對蛋白斑點進行區(qū)分,因為很難評估觀察到的相似或差異是真實的還是凝膠形變導(dǎo)致的,操作較為復(fù)雜。

    3.2 同工酶分析

    Dias 等1994 年描述了同工酶分析技術(shù)[50]。 同工酶作為一類蛋白質(zhì),廣泛存在于生物中,其主要分離方法有電泳法、層析法、酶學(xué)法和免疫學(xué)法,其中以電泳法應(yīng)用最為廣泛[51]。 從線蟲中提取可溶性蛋白后,對其特定的同工酶進行染色,根據(jù)不同同工酶的分子結(jié)構(gòu)、活性以及免疫原性等特異性,通過聚丙烯酰胺凝膠電泳分析法可對不同線蟲物種進行鑒定。 胡凱基等對松材線蟲和擬松材線蟲的酶電泳進行分析,結(jié)果表明其蘋果酸脫氫酶譜、纖維素酶譜和酯酶譜等有差異,但并不穩(wěn)定,只有谷氨酸草酰乙酸轉(zhuǎn)氨酶可將松材線蟲和擬松材線蟲成功區(qū)分[52]。盡管目前蘋果酸脫氫酶、超氧化物歧化酶等在線蟲蛋白檢測中被使用,但該方法操作繁瑣且費時,必須有一個已知樣品作為參考,因此使用較為受限。

    3.3 蛋白飛行時間質(zhì)譜技術(shù)

    該技術(shù)是一種精確測定物種蛋白質(zhì)質(zhì)量的新型技術(shù),又稱為基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization - time of flight mass spectrometry,MALDI - TOF MS),由Karas 等于1987 年發(fā)明[53],其原理是將不同物種或種群間蛋白質(zhì)譜中產(chǎn)生的特定峰作為生物標(biāo)記來鑒定不同物種。 Fu 等[49]通過雙向凝膠電泳比較了松材線蟲和擬松材線蟲的蛋白表達(dá),并使用MALDITOF/TOF 對強度出現(xiàn)差異的15 個蛋白斑點進行了分析,鑒定出松材線蟲特有的蛋白。 雙向凝膠電泳技術(shù)和蛋白飛行質(zhì)譜技術(shù)聯(lián)用為線蟲分類提供了一個強有力的工具,但其結(jié)果會受到諸多因素的影響,包括蛋白的提取方法、雙向凝膠電泳結(jié)果的質(zhì)量以及儀器的操作準(zhǔn)確性等,線蟲的不同齡期和生長條件也會導(dǎo)致表達(dá)譜的變化[54]。

    4 展望

    松材線蟲形態(tài)鑒定是基本的方法,是其他檢測方法的基礎(chǔ)。 鑒于形態(tài)鑒定的缺點而研發(fā)高效率的各種分子檢測方法,面臨的最核心問題就是檢測的準(zhǔn)確性。 多種近似種以及超大樣本量對研發(fā)分子檢測技術(shù)具有決定性作用。 準(zhǔn)確性還取決于后期實踐檢測過程中的不斷檢驗。 目前,南京林業(yè)大學(xué)建有國內(nèi)唯一的松樹寄生線蟲蟲株資源庫,也是國內(nèi)外松樹寄生線蟲蟲株數(shù)量最多的蟲株資源庫,收集有全國各疫區(qū)松材線蟲蟲株資源,其中松材線蟲蟲株460 個,擬松材線蟲蟲株110 個,其他松樹寄生線蟲蟲株140 個。 該蟲株資源庫為松材線蟲分子生物學(xué)檢測方法的研發(fā)提供了堅實的支撐。

    20 世紀(jì)末期,RFLP、RAPD、SCAR 等技術(shù),對推動松材線蟲種類鑒定起到了積極作用,但由于這些技術(shù)存在復(fù)雜性、重復(fù)性、操作程序和檢測時間等問題,沒有真正在生產(chǎn)實際上廣泛應(yīng)用。

    2006 年,我國研發(fā)出的松材線蟲分子檢測技術(shù)成功應(yīng)用于生產(chǎn)實踐,并在全國推廣應(yīng)用。 尤其是2009 年研發(fā)出松材線蟲自動化分子檢測鑒定技術(shù),實現(xiàn)了松材線蟲病分子檢測技術(shù)在我國各省市縣的推廣和普及化,依靠該檢測技術(shù),結(jié)合形態(tài)學(xué)方法,基本解決了我國松材線蟲病檢疫和監(jiān)測過程中的鑒定技術(shù)難題[55-56]。

    近年來興起的LAMP、POCD -RPA 等檢測方法,在檢測便利性、檢測時間、檢測成本等方面都具有較大的優(yōu)勢。 但這些方法還需要在生產(chǎn)實踐中繼續(xù)檢驗。 基于蛋白質(zhì)的方法為今后物種鑒定提供了一種可期待的研究方向。 但確定蛋白表達(dá)模式需要繁瑣的實驗步驟,提取的蛋白也比較容易降解,這可能會影響判斷的準(zhǔn)確性,這也是該方法難以大量應(yīng)用的主要原因。

    在松材線蟲病感染初期,樹體基本沒有病癥顯現(xiàn),無法精準(zhǔn)判斷林間樹體是否感病,通過傳統(tǒng)分子生物學(xué)檢測方法和基于蛋白的檢測方式判斷林中疫木較為困難;一旦植物感病晚期相關(guān)癥狀開始出現(xiàn)時,基本已無法治療。 因此,在松材線蟲病侵染初期未顯現(xiàn)癥狀的松林同樣需要快速檢測和治療,未來可通過基于樹體外觀癥狀、線蟲形態(tài)學(xué)、DNA 以及蛋白的檢測方法與化學(xué)或物理檢測方式(如感染松材線蟲病的標(biāo)志性揮發(fā)性氣體、樹體外觀光譜學(xué)分析或樹體導(dǎo)電率差異等)相結(jié)合,以實行快速有效的檢測。

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