盧氏陰道球菌中一種新型的攜帶optrA的偽復(fù)合轉(zhuǎn)座子Tn7363和一個(gè)攜帶cfr(D)的Inc18質(zhì)粒的發(fā)現(xiàn)

包括利奈唑胺和泰地唑胺在內(nèi)的噁唑烷酮類藥物對(duì)MDR 革蘭氏陽性細(xì)菌，如MRSA 和VRE，表現(xiàn)出很高的抗細(xì)菌活性。然而，可移動(dòng)的惡唑烷酮抗性基因的出現(xiàn)和傳播已引起全球關(guān)注。到目前為止，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了7 個(gè)可轉(zhuǎn)移的噁唑烷酮抗性基因，包 括cfr、cfr(B)、cfr(C)、cfr(D)、cfr(E)、optrA和poxtA。其中cfr(D)基因編碼一種甲基化酶，它對(duì)包括噁唑烷酮類在內(nèi)的5 種化學(xué)結(jié)構(gòu)上不同類別的抗菌藥具有抗性，其僅在腸球菌和鏈球菌屬中有發(fā)現(xiàn)。optrA 基因編碼一個(gè)ABC-F 蛋白它通過核糖體保護(hù)賦予對(duì)噁唑烷酮類和酚類藥物的交叉抗性。到目前為止，optrA 基因已經(jīng)在7 個(gè)不同的屬中被發(fā)現(xiàn)，包括腸球菌、葡萄球菌、鏈球菌、梭菌、彎曲桿菌、空氣球菌和乳球菌。陰道球菌屬目前有13 種，最初在水獺上發(fā)現(xiàn)的陰道球菌是一個(gè)重要的菌種，它在人類和豬的感染中發(fā)揮著作用。

近期發(fā)表于《Journal of Antimicrobial Chemotherapy》上的文章“Characterization of the noveloptrA-carrying pseudo-compound transposon Tn7363and an Ⅰnc18 plasmid carryingcfr(D) inVagococcus lutrae”，對(duì)1 株耐利奈唑胺的盧氏陰道球菌BN31 研究發(fā)現(xiàn)，該菌株基因組有2 030 321 bp，含有pBN31-cfrD（33 485 bp）、pBN31-16k（16 159 bp）和pBN31-3k（3 285 bp）三種質(zhì)粒。ResFinder 分析顯示，染色體DNA[optrA、fexA、lsa(E)、erm(A)、erm(B)、aadE、aacA-aphD、aph(3')-lll、spc、tet(L)、tet(M)、lnu(B)、dfrG]或 質(zhì) 粒pBN31-cfrD 中存在大量的ARGs。攜帶optrA基因和fexA、截?cái)嗟霓D(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)基因araC、Y-家族DNA 聚合酶編碼基因impB、ATP 酶編碼基因和4 個(gè)假設(shè)蛋白基因hp的片段被幾乎相同的插入序列所包圍，這些序列僅相差1bp，且位于同一方向。

另外，進(jìn)一步分析了攜帶cfr(D)的Ⅰnc18 質(zhì)粒pBN31-cfrD 的遺傳特性，pBN31-cfrD 的GC 含量低于染色體DNA（37.65%），提示pBN31-cfrD 可能是通過水平轉(zhuǎn)移獲得的。在質(zhì)粒pBN31-cfr(D)上檢測(cè)到cfr(D)和大環(huán)內(nèi)酯林可酰胺鏈霉素B(MLSB)抗性基因erm(B)。序列比對(duì)結(jié)果顯示，cfr(D)基因與原型cfr(D)基因（NG_067192）相比，該基因的序列同源性為99.7%，有3 個(gè)點(diǎn)突變（T324A、T561A 和T690A）。PlasmidFinder 的結(jié)果顯示，在質(zhì)粒pBN31-cfrD 上存在一個(gè)Ⅰnc18 復(fù)制子。本研究首次報(bào)道了在陰道球菌屬中存在Ⅰnc18 質(zhì)粒。Blast 分析顯示，除攜帶cfr(D)的約4 kb 區(qū)域外，質(zhì)粒pBN31-cfrD 與質(zhì)粒pAMβ1（GU128949）具有較高的同源性（0.94%的核苷酸同源性），是Ⅰnc18 質(zhì)粒家族的代表。cfr(D)的遺傳環(huán)境分析表明，含cfr(D)的區(qū)域被兩個(gè)方向相反的ⅠS1216E拷貝包圍（圖S1）。序列比較顯示，該cfr(D)片段與豬鏈球菌質(zhì)粒pH35-cfrD和人屎腸球菌質(zhì)粒4（LR135354）上具有較高的相似性（同源性核苷酸0.99%）。值得注意的是，在不同種類的細(xì)菌中，cfr(D)基因的兩側(cè)有一個(gè)或兩個(gè)ⅠS1216E元件，這意味著ⅠS1216E可能在cfr(D)基因的跨物種轉(zhuǎn)移中發(fā)揮了重要作用。

該研究鑒定了一株含有惡唑烷酮耐藥基因cfr(D)和optrA的盧氏陰道球菌。此外，還鑒定了兩個(gè)新的移動(dòng)元件，即攜帶optrA的偽復(fù)合轉(zhuǎn)座子Tn7363和攜帶cfr(D)的Ⅰnc18 型質(zhì)粒pBN31-cfrD。鑒于惡唑烷酮耐藥基因具有很高的傳播潛力，迫切需要采取必要措施，防止攜帶可移動(dòng)基因元件的惡唑烷酮類耐藥基因向主要細(xì)菌病原體傳播。