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    基于SOP-SeedBS的高維數(shù)據(jù)稀疏變點檢驗

    2022-12-28 04:50:00銀炳皓施三支齊德全
    關(guān)鍵詞:變點高維參數(shù)設(shè)置

    銀炳皓,施三支,齊德全

    (長春理工大學 數(shù)學與統(tǒng)計學院,長春 130022)

    變點估計和檢驗問題是統(tǒng)計學中的一個經(jīng)典問題,用于識別時間序列中的突變,發(fā)生這種突然變化的時間點稱為“變點”。通過估計變點的位置,可以將原始數(shù)據(jù)集劃分為較短的段,然后使用平穩(wěn)時間序列的方法進行分析,解決各個領(lǐng)域相關(guān)的問題。變點問題在金融行業(yè)[1]、互聯(lián)網(wǎng)安全[2]、生物醫(yī)學[3]等領(lǐng)域都有著廣泛的應(yīng)用,例如,變點估計可用于發(fā)出有關(guān)異常金融事件的警報,檢測網(wǎng)絡(luò)上的分布式拒絕服務(wù)攻擊,精確定位人腦中腦波活動的開始等。隨著時代的發(fā)展和科技的進步,現(xiàn)實生活中的數(shù)據(jù)多以高維的形式出現(xiàn),高維數(shù)據(jù)流導致了數(shù)據(jù)量的激增,這就要求變點分析方法能有所進步,并且在運算時間和方法準確性上達到一個良好的平衡效果。

    經(jīng)典的變點檢驗關(guān)注的是單變量時間序列,例如2012年Killick[4]提出的PELT方法是通過找到變點可能的數(shù)量和位置的成本函數(shù)最小值,來推斷變點的最佳數(shù)量和位置。2014年Frick和Munk等人[5]提出的SMUCE算法針對指數(shù)族回歸中的變點問題,引入了一種新的估計量;2014年Fryzlewicz[6]提出的 WBS 算法和 2018 年 Baranowski等人[7]提出的最窄超閾值法(NOT)提高了二元分割算法的性能。然而,經(jīng)典的單變量變點檢驗方法通常不直接適用于現(xiàn)代應(yīng)用中經(jīng)常遇到的高維數(shù)據(jù)集。因此,學者們提出了幾種方法來估計和檢驗高維數(shù)據(jù)中的變點,并且為了解決維數(shù)災難的問題,現(xiàn)有的幾種高維變點檢驗方法假設(shè)了變化信號具有某種形式的稀疏性,稀疏性假設(shè)大大降低了原始高維問題的復雜性。例如,在 2015年 Jirak[8]使用 CUSUM 統(tǒng)計量對不同子部分進行L∞聚合,對于稀疏變點的效果很好;2015 年 Cho 和 Fryzlowicz[9]的稀疏二元分割算法,也考慮了稀疏性;2018年Wang和Samworth[10]基于投影的方法中假設(shè)了一個變點前后的均值差異只在小部分維數(shù)坐標中是非零的;2019 年 Enikeeva和 Harchaoui[11]提出了基于具有稀疏性的掃描統(tǒng)計量的方法。關(guān)于高維數(shù)據(jù)的變點檢驗問題的工具仍在不斷創(chuàng)新和發(fā)展,但大多不具有普適性,且運算時間較長。

    本文通過研究具有稀疏變點的高維數(shù)據(jù)的特點,提出了一種基于稀疏最優(yōu)投影的多變點檢驗方法,SOP-SeedBS方法能夠檢驗出數(shù)據(jù)的維度p在小于或大于等于數(shù)據(jù)量n的情況下變點的位置及個數(shù),并研究了變點間隔大小對該檢驗方法穩(wěn)定性的影響。通過仿真模擬,在多種情況下與Wang和Samworth的Inspect方法(2018)進行了比較,結(jié)果表明,SOP-SeedBS方法具有較高的準確度,并在計算時間方面具有明顯的優(yōu)勢。

    1 SOP-SeedBS高維稀疏多變點檢驗

    1.1 稀疏變點模型

    設(shè)X1,…,Xn是n個相互獨立的p維隨機向量,Xt~Np(μt,σ2Ip),1 ≤t≤n,σ2是方差,記

    其中,p可能與序列的長度n相等,甚至大于序列的長度n。

    假設(shè)存在υ個變點,變點檢驗的問題能被表示為經(jīng)典的假設(shè)檢驗問題

    假設(shè)備擇假設(shè)成立,數(shù)據(jù)可劃分成υ+1段的分段常數(shù)均值結(jié)構(gòu),換句話說,如果有υ個變點 1≤z1<z2<…<zυ,即?0 ≤i≤υ。記z0=0,zυ+1=n, 記θ(i)=μ(i)-μ(i-1),i=1,…,υ。

    本文假設(shè)均值的變化是稀疏的,即一個變點前后的均值差異只在小部分維度(p)中是非零的。記‖θ(i)‖0表示向量θ(i)中非零元素的個數(shù),則‖θ(i)‖0≤k,k∈{1,…,p}且k?p。本文只考慮參數(shù)μ(i)的檢驗問題,其他參數(shù)皆視為討厭參數(shù)。假設(shè)變點位置z1,z2,…,zυ滿足:

    其中,τ是變點的最小間隔,0<τ<1。均值變化的大小滿足:

    其中,?是均值變化大小的閾值。

    1.2 稀疏最優(yōu)投影(SOP)

    Wang等人[10](2018)通過對高維數(shù)據(jù)進行高維CUSUM變換進而推導出數(shù)據(jù)矩陣的最優(yōu)投影方向,并解決了計算第一個左奇異向量引出的凸優(yōu)化問題。因此對于高維稀疏變點數(shù)據(jù),本文根據(jù)類似的思想,并基于奇異值分解和凸松弛優(yōu)化方法將高維數(shù)據(jù)投影成一維數(shù)據(jù),由于本文研究的高維數(shù)據(jù)中均值變化是稀疏的,從而稱該方法為稀疏最優(yōu)投影(Sparse Optimal Projection)。

    對于任意的a∈Rp,滿足 ‖a‖2=1,其中

    選擇a=θ/‖θ‖2來最大限度地擴大兩個數(shù)據(jù)片段之間的均值差異的大小。然而θ在實踐中通常是未知的,本文的想法是尋找一個最優(yōu)的投影方向v=θ/‖θ‖2,文獻[10]啟發(fā)了本文對數(shù)據(jù)矩陣X進行分解,再利用奇異值分解得到一個合適的投影方向后,將數(shù)據(jù)投影到一維空間。

    假設(shè)均值變化只出現(xiàn)在數(shù)據(jù)矩陣X的k個列中,且在沒有發(fā)生均值變化的p-k個列中的元素均值為μt=0,t∈{1,…,n},k∈{1,…,p} 。對數(shù)據(jù)矩陣X進行分解,得到X=μ+W,其中μ=(μ1,…,μn)T∈Rn×p是均值矩陣,W=(W1,…,Wn)T∈Rn×p,W1,…,Wn是獨立的Np(0,σ2Ip)的隨機噪聲。當σ已知,零假設(shè)成立時,μ為恒定的常數(shù)向量,備擇假設(shè)下只存在一個變點z時,矩陣X的元素均值可以計算出:

    其中,Xr,j為矩陣X中第r行,第j列的元素;t∈{1,…,n} ;j∈ {1,…,p}。記前z行向量元素相同,后n-z行向量元素相同。

    這里St,j為第j列中變點z前后分段數(shù)據(jù)之和,t∈{1,…,n},j∈{1,…,p} ,即:

    則有:

    文獻[10]中,計算矩陣XT的第一個左奇異向量是一個組合優(yōu)化問題。公式(10)是一個計算復雜度很高的凸優(yōu)化問題,解決這個問題的一種方法是使用優(yōu)化問題中的凸松弛得到M?來代替X,具體過程如下:

    懲罰函數(shù)可以將有約束的目標函數(shù)轉(zhuǎn)化為無約束的目標函數(shù),即當?shù)玫降腗不滿足約束條件時,估計的?可能會遠離最優(yōu)解。通過添加一個懲罰項 -λ‖M‖1,優(yōu)化問題變?yōu)橐韵滦问剑?/p>

    其中,λ為軟閾值。則有:

    記是的第一個左奇異向量,即:

    將高維數(shù)據(jù)X沿著最優(yōu)方向投影,得到一維數(shù)據(jù),記為Y。

    如果數(shù)據(jù)存在變點,投影后的一維數(shù)據(jù)呈現(xiàn)出了分段常數(shù)的特征,適用于此種數(shù)據(jù)的幾種經(jīng)典的單變量多變點檢驗方法,包括2012年Killick[4]給 出 的 PELT 方 法 、2014 年 Fryzlewicz[6]提出的 WBS方法、2018年 Baranowski等人[7]給出的最窄超閾值方法(NOT)以及2020年Kovács等人[12]提出的SeedBS方法。PELT方法是通過找到變點可能的數(shù)量和位置的成本函數(shù)最小值來推斷變點的最佳數(shù)量和位置,計算復雜度較高。WBS方法和NOT方法都是基于二元分割思想的改進算法,NOT方法中隨機抽取間隔的想法與WBS方法類似,但NOT方法更關(guān)注數(shù)據(jù)中可能存在變點的最小間隔。WBS和NOT方法中用于搜索變點的間隔都是通過隨機抽樣構(gòu)造的,在數(shù)據(jù)量較大的情況下,需要構(gòu)造的隨機間隔數(shù)量會很多,且會出現(xiàn)許多長度與原始序列相同或者重復出現(xiàn)的間隔,這增加了算法復雜度和運算時間,特別是高維稀疏變點數(shù)據(jù)中變點較少的情況下。2020 年 Kovács等人[12]提出的種子二元分割(SeedBS)是一種解決大規(guī)模數(shù)據(jù)變點檢驗問題的方法,該方法能夠有效地降低計算復雜度,提高計算效率。因此,本文選擇SeedBS算法來對投影后的一維數(shù)據(jù)進行多變點檢驗。

    1.3 種子二元分割(SeedBS)

    種子二元分割方法是通過構(gòu)造一個具有確定性,且可以預先計算的搜索區(qū)間集來搜索變點。區(qū)間集的構(gòu)造獨立于潛在的變點數(shù)量,并能達到搜索間隔的總長度盡可能小的效果。

    其中,μt是t時刻的信號;σ是恒定標準差;εt是正態(tài)噪聲,記有υ個變點1≤z1<z2< ...<zυ,則μt可以被分為υ+1段,其中第i段中。

    記a∈(1/2,1]為一個給定的衰減參數(shù),對于任意的q:1≤q≤log1/a(n),將第q層定義為由nq個區(qū)間組成,初始長度為lq且進行確定性位移sq的集合Lq:

    例如當a=1/2時,得到一個重疊的二元分隔區(qū)間。來自前一層的每個間隔都被分成左、右和重疊的中間間隔,每個間隔的大小都是前一層的一半。當間隔的長度在層上迅速衰減時,隨著間隔長度變小,間隔的數(shù)量迅速增加,還保證了在同一層內(nèi)的連續(xù)間隔之間有足夠大的重疊。生成的間隔如圖1所示[12]。

    圖1 a=1/2時生成搜索間隔的可視化圖

    用于種子二元分割的檢驗統(tǒng)計量是定義一段內(nèi)分割點在s的CUSUM統(tǒng)計量:

    其中,0≤l<r≤n和h=r-l為整數(shù),達到CUSUM統(tǒng)計量絕對值最大值的位置s記為最好的分割點。因此,計算m個種子間隔的檢驗統(tǒng)計量,得到一個候選變點集,記為,如果候選變點集合中對應(yīng)間隔的檢驗統(tǒng)計量超過了閾值ζn,就認為得到一個最終的變點估計集合O(0,n],并將聲明為一個變點:

    其中:

    閾值ζn可以通過強化施瓦茨信息準則計算:

    其中,α≥ 1;是模型(2)分段參數(shù)μ(i)的最大似然估計;nυ表示需要估計參數(shù)的總個數(shù),包括變點位置。另外,當α=1時相當于施瓦茨信息準則。

    在具有固定的方差σ2和分段常數(shù)均值的單變量高斯信號模型中,也可以通過貝葉斯信息準則(BIC)來計算閾值:

    其中,σ2是方差;n為樣本量;T={z1,…,zυ} ? {1,…,n} ;|T|為集合T的基數(shù)。通過BIC準則計算出的閾值篩選出的變點個數(shù)要多于強化施瓦茨信息準則篩選出的變點個數(shù)。

    1.4 SOP-SeedBS方法

    本文結(jié)合了類似 Wang等人[10](2018)的投影思想和 Kovács等人[12](2020)提出的種子二元分割(SeedBS)方法,進行高維數(shù)據(jù)的稀疏變點檢驗,先將高維稀疏變點數(shù)據(jù)沿著最優(yōu)的投影方向投影到一維,再利用SeedBS方法對一維數(shù)據(jù)進行多變點檢驗,SOP-SeedBS方法具體步驟如下:

    輸入:數(shù)據(jù)矩陣X=(X1,...,Xn)T∈Rn×p,軟閾值λ,衰減參數(shù)足夠大的變點上界K,max閾值ζn。

    (1)對數(shù)據(jù)矩陣X進行分解并推導出最優(yōu)投影方向。

    (3)對進行SVD分解,得到第一個左奇異向量,計算投影數(shù)據(jù)

    (4)根據(jù)衰減參數(shù)a構(gòu)造包含m個種子區(qū)間的區(qū)間集。

    (5)計算m個種子間隔的檢驗統(tǒng)計量,并根據(jù)閾值ζn確定變點位置:

    2 數(shù)值模擬

    構(gòu)造由模型1生成的具有均值變點的高維數(shù)據(jù)時,設(shè)置參數(shù)σ2=1,數(shù)據(jù)量n分別取200,500,1 000,2 000,維數(shù)p分別為200,500,1 200,將高維數(shù)據(jù)噪聲表示為ε,分別取0.1,0.5,0.7,1,變點位置滿足z/n={0 .25,0.5,0.75},定義?(i)為第i個變點的均值跳躍大小,=(?(1),?(2),?(3))=(0.4,0.8,1.2),?(0)=0,,其中k控制著發(fā)生變化維度數(shù)量的稀疏程度,取值分別為10,40。根據(jù)文獻[10]的建議,。根據(jù)文獻[12]的建議,設(shè)置衰減參數(shù)a= 2。另外,下面三種情形分別考慮了均值結(jié)構(gòu)中發(fā)生變化的維數(shù)坐標(p)上的重疊問題,高維數(shù)據(jù)中均值結(jié)構(gòu)發(fā)生變化的三種不同重疊情形說明如下:

    情形1(S1):在沒有重疊的情況下,對于相應(yīng)的變點,發(fā)生變化的k個維數(shù)坐標是來自完全不相交的坐標集;

    情形3(S3):在完全重疊的情況下,則對于相應(yīng)的變點,變化的維數(shù)發(fā)生在相同的k個坐標上。

    本文先給出了SOP-SeedBS方法在情形3下,參數(shù)設(shè)置為σ2=1,n=2 000,p=200,k=40,??=(?(1),?(2),?(3))=(0.4,0.8,1.2),變點位置z/n={0.25,0.5,0.75}時,不同噪聲下的變點估計結(jié)果可視化,用ε表示高維數(shù)據(jù)的噪聲,不同ε取值對于投影后一維數(shù)據(jù)的變點檢驗結(jié)果如圖2所示,圖2的結(jié)果顯示了當ε的取值越小時,噪聲越小,分段特征越明顯。另外,當均值跳躍越大,分段特征也越明顯。后續(xù)的仿真實驗中,噪聲ε皆設(shè)置為1。

    圖2 不同 ε下的投影后一維數(shù)據(jù)的變點檢驗結(jié)果

    表1給出了σ2=1時,SOP-SeedBS方法和Inspect方法的比較結(jié)果,兩種方法在四組不同的參數(shù)設(shè)置M1、M2、M3、M4下,且每組參數(shù)設(shè)置都具有三種不同的情形,通過100次運行算法(兩種方法通過相同參數(shù)設(shè)置下生成的高維數(shù)據(jù)進行比較)檢測到的變點數(shù)量的頻數(shù)和平均Hausdorff距離dH分別來度量估計變點的數(shù)量和估計變點位置的準確度。M1的參數(shù)設(shè)置為n=2 000,p=200,k=10,=(0.8,1.6,2.4);M2的參數(shù)設(shè)置為n=2 000,p=200,k=40,=(0.4,0.8,1.2);M3的參數(shù)設(shè)置為n=500,p=500,k=40,=(0.4,0.8,1.2);M4的參數(shù)設(shè)置為n=200,p=500,k=40,=(0.4,0.8,1.2)。表中Z1,Z2,Z3,Z4,Z5表示估計到的變點個數(shù),取值分別為1,2,3,4,5。

    表1 兩種方法在不同參數(shù)設(shè)置下進行100次模擬的估計變點頻數(shù)和平均Hausdorff距離的比較

    從表1可以看出,在σ2=1,n=2 000,p=200,k=10的參數(shù)設(shè)置下,SOP-SeedBS方法在三種不同均值變化重疊情況下的結(jié)果都優(yōu)于Inspect方法,進行100次模擬的平均Hausdorff距離分別為 6.87,2.32,0.47,而 Inspect方法分別為12.72,26.01,13.91;第二組實驗將第一組實驗中的發(fā)生變化的維數(shù)k=10替換為k=40,第一個變點的均值跳躍大小由0.8變?yōu)?.4,SOPSeedBS方法在三種情形下進行100次模擬得到的平均Hausdorff距離分別為4.48,2.42,0.34。雖然兩組實驗在變點頻數(shù)上同樣具有良好的檢驗結(jié)果,但第二組結(jié)果與第一組相比,在均值跳躍變小的情況下,第二組結(jié)果中情形1和情形3的平均Hausdorff距離要比第一組更小,說明k的大小也會對實驗結(jié)果產(chǎn)生影響。

    從SOP-SeedBS方法的第三組和第四組實驗結(jié)果可以看出,在其他參數(shù)固定的情況下,n越大,對比實驗結(jié)果顯示n較大時檢驗結(jié)果較好,說明由于樣本量的增加,適當增加種子區(qū)間的個數(shù)有利于進行變點檢驗。本文還通過模擬實驗發(fā)現(xiàn),當其他參數(shù)固定時,維度p變大,對比實驗的結(jié)果表現(xiàn)出檢驗效果相近,因此維度的增加對于變點檢驗效果影響不大。

    圖3給出了SOP-SeedBS方法與Inspect方法在其他參數(shù)不變的情況下,不同的n和p設(shè)置下算法平均運算時間的比較,可以看出SOP-SeedBS方法在算法運算速度上具有較大的優(yōu)勢。圖3(a)給出了當p=200,n分別為 500、1 000、2 000時,兩種方法100次模擬的平均運算時間;圖3(b)給出了當p=500,n分別為 200、500、1 000時,兩種方法進行100次模擬的平均運算時間。

    圖3 SOP-SeedBS方法與Inspect方法計算時間比較

    圖3中的結(jié)果顯示,當p=200,n=2 000時,Inspect方法進行100次模擬的平均運算時間達到了13.7 s,而SOP-SeedBS方法的平均運算時間僅為0.14 s,約是Inspect方法運算時間的1%。當p=500,n=500,Inspect方法進行 100次模擬的平均運算時間是13.6 s,而SOP-SeedBS方法的平均運算時間僅為0.15 s,約是Inspect方法運算時間的1%,由此能體現(xiàn)SOP-SeedBS方法在運算時間上優(yōu)于Inspect方法。

    為了研究變點間隔對實驗結(jié)果準確性的影響,從前面的對比實驗表1中發(fā)現(xiàn),當均值變化為情形1時,SOP-SeedBS方法的效果不如情形2和情形3的情況,這也符合不同變點在不同稀疏維數(shù)坐標中發(fā)生變化時,信號強度會減弱的預期效果。因此,表2顯示的是在情形1下的模擬結(jié)果,即發(fā)生變化的k個維數(shù)坐標是來自完全不相交的坐標集。表中Z1、Z2、Z3、Z4表示估計到的變點個數(shù),取值分別為1,2,3,4。

    表2 不同變點間隔在p=200,σ2=1時四組不同參數(shù)設(shè)置下100次模擬的結(jié)果

    表2中有四組不同的參數(shù)設(shè)置B1,B2,B3,B4,其中B1的參數(shù)設(shè)置為zi+1-zi=20,表示相鄰變點之間間隔20個數(shù)據(jù),信號的均值跳躍大小為=(0.8,1.6,2.4);B2的參數(shù)設(shè)置為zi+1-zi=30,=(0.8,1.6,2.4);B3參數(shù)設(shè)置為zi+1-zi=40,=(0.8,1.6,2.4);B4的參數(shù)設(shè)置為zi+1-zi=50,=(0.8,1.6,2.4)。從表2的結(jié)果可以看出,通過模型1生成的四組不同參數(shù)設(shè)置下的變點數(shù)據(jù),在σ2=1,p=200,n=2 000,k=40,變點間隔為20時,真實變點個數(shù)為3,三個變點的均值跳躍大小分別為 0.6、1.2、1.8,SOP-SeedBS方法在100次模擬中估計正確變點個數(shù)次數(shù)僅為 31 次,而在σ2=1、p=200、n=2 000、k=60時,100次模擬中估計正確變點個數(shù)次數(shù)僅有61次。由最后一組實驗可以看出當變點之間的間隔達到50個數(shù)據(jù)點及以上時,SOP-SeedBS方法不僅能穩(wěn)定地檢測到正確的變點個數(shù),在準確性上也能達到很好的效果。

    3 實證分析

    本節(jié)研究了R中ecp包的膀胱腫瘤微陣列數(shù)據(jù)集(Bladder Tumor Micro-Array Data),目的是檢驗樣本目標區(qū)域染色體拷貝數(shù)的變化,常常用于醫(yī)學中檢驗癌癥的研究,染色體拷貝數(shù)變化反映了DNA的擴增和驟減。從醫(yī)學的角度來說,擴增的片段可能存在致癌基因,驟減的片段可能存在抑癌基因。本文對數(shù)據(jù)集中43個個體(p)的基因組上的2 215個不同基因位點(n)的對數(shù)強度比測量值進行檢驗,圖4繪制了前10個個體在前200個基因位點上的對數(shù)強度比散點圖,并采用SOP-SeedBS方法估計變點位置(其中虛線表示檢測到的變點位置),同時給出了文獻[10]和文獻[14]中Inspect方法和 Adapt-WBS方法的檢驗結(jié)果,來驗證SOP-SeedBS方法的有效性。

    圖4 前10個個體在前200個位點上的ACGH數(shù)據(jù)散點圖

    從圖4中可以看出,SOP-SeedBS方法檢測到的變點結(jié)果為:15,26,28,52(56),73,91,102,134,147(146),177(174),183(180),185(186),188(191),與文獻[10]和文獻[14]中檢驗到的變點相近,其他無法檢測到的變點,例如位點30到40之間的數(shù)據(jù)出現(xiàn)的分段特征不明顯,許多個體在位點110~130之間測量值分布較為分散,沒有呈現(xiàn)出明顯的分段特征,位點155附近的測量值分布非常分散。SOP-SeedBS算法的結(jié)果與Inspect的結(jié)果的相似度約為80%。

    4 結(jié)論與展望

    本文提出SOP-SeedBS方法結(jié)合了奇異值分解和投影的思想,通過分析高維稀疏變點數(shù)據(jù)的特點,對數(shù)據(jù)矩陣進行奇異值分解找到一個最優(yōu)的投影方向,將存在稀疏變點的高維數(shù)據(jù)沿著最優(yōu)的投影方向投影成一維數(shù)據(jù),再利用SeedBS方法對一維數(shù)據(jù)進行多變點檢驗。通過仿真實驗,分別用變點檢驗頻數(shù)和平均Hausdorff距離評估了變點檢驗的準確度。本文提出的SOP-SeedBS方法在運算時間、算法準確度上都優(yōu)于Inspect方法,特別是在時間上具有較大的優(yōu)勢。最后將SOP-SeedBS方法應(yīng)用于ecp包中的膀胱腫瘤微陣列數(shù)據(jù)集中,檢驗結(jié)果與文獻[14]中給出的Inspect方法的檢驗結(jié)果有約80%的相似度。

    本文是先將高維數(shù)據(jù)投影到一維,再進行變點檢驗。進一步還可以研究能否在保持數(shù)據(jù)維度不變的情況下,通過某種方式,例如引入一種針對高維數(shù)據(jù)的檢驗統(tǒng)計量,將SeedBS方法直接用于高維數(shù)據(jù)的變點檢驗問題中。

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