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    向日葵HaLACS1的克隆、表達(dá)及酵母功能互補(bǔ)鑒定

    2022-07-22 03:19:44楊佳寶周至銘張展馮麗孫黎
    生物技術(shù)通報(bào) 2022年6期
    關(guān)鍵詞:擬南芥向日葵底物

    楊佳寶 周至銘 張展 馮麗 孫黎

    (1. 石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,石河子 832003;2. 兵團(tuán)興新職業(yè)技術(shù)學(xué)院,巴州 841007)

    向日葵(Helianthus annuus L.)是我國(guó)四大油料作物之一,主要種植在內(nèi)蒙古、新疆、甘肅等北方地區(qū),種植面積約100萬(wàn)hm2,總產(chǎn)約200萬(wàn)t[1]。傳統(tǒng)葵花籽油中含有大量的不飽和脂肪酸,主要為油酸(14%-43%)和亞油酸(44%-75%),約占總脂肪酸含量的85%[2],是最健康的食用植物油之一,而且向日葵耐鹽堿、抗旱、耐瘠薄,被譽(yù)為“鹽堿地的先鋒作物”[3],在生態(tài)環(huán)境保護(hù)和地方經(jīng)濟(jì)可持續(xù)發(fā)展中具有不可替代的重要作用。

    植物油主要以三酰甘油(triacylglycerol,TAG)形式儲(chǔ)存在成熟種子中,為種子萌發(fā)和幼苗生長(zhǎng)提供能量[4]。在TAG合成與分解代謝過(guò)程中,長(zhǎng)鏈脂酰CoA合成酶(long chain acyl-CoA synthetase,LACS)是極為重要的一類酶,它可催化游離脂肪酸生成脂酰CoA,這是其他脂代謝酶利用脂肪酸所必需的關(guān)鍵步驟[5-6]。LACS的催化作用主要分為兩步:首先游離脂肪酸和ATP反應(yīng)形成中間體,然后中間反應(yīng)產(chǎn)物與CoA的硫酯鍵反應(yīng)形成脂酰CoA[6-8]。形成的脂酰CoA可進(jìn)入β-氧化途徑,參與脂肪酸的降解過(guò)程[7],也可作為TAG合成的前體物質(zhì)發(fā)揮 作用[5]。

    LACS廣泛存在于哺乳動(dòng)物、植物、酵母以及大腸桿菌等生物體中,在生物油脂合成及分解代謝中發(fā)揮著重要作用。LACS屬于?;鵆oA合成酶(acyl-CoA synthetase,ACS)超家族,具有ACS家族的共同特征:其一是含有一個(gè)高度保守的AMP結(jié)合結(jié)構(gòu)域(AMP-binding domain,PROSITE PS00455), 是ATP的結(jié)合位點(diǎn)[9];其二是含有ACS信號(hào)序列,可能是ACS的激活位點(diǎn)和脂肪酸結(jié)合部位[10]。與其他ACS不同的是,LACS蛋白具有一個(gè)由大約45個(gè)氨基酸殘基組成的連接域(linker)[11]。

    高等植物L(fēng)ACS基因家族包含多個(gè)成員,對(duì)擬南芥LACS各成員的功能研究工作開展得較為深入。擬南芥基因組中共有9個(gè)LACS基因(AtLACS1-AtLACS9),除了AtLACS6和AtLACS7以外,均能互補(bǔ)LACS缺陷型酵母的表型,使其恢復(fù)生長(zhǎng)[12]。其中AtLACS1編碼的蛋白定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),在發(fā)育的種子中優(yōu)勢(shì)表達(dá),與AtLACS9存在部分功能冗余,在種子油脂合成中發(fā)揮重要作用[13]。此外,AtLACS1還與表皮蠟質(zhì)及花粉脂質(zhì)的形成有關(guān)[13-14]。由于角質(zhì)層是植物抵御生物和非生物脅迫的天然屏障,因此,LACS在植物抗逆響應(yīng)中也具有重要作用[15],擬南芥單或雙突變體如atlacs2和atlacs1atlacs2提高了表皮的滲透性、水分散失率和對(duì)干旱的敏感 性[16-17]。在釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中發(fā)現(xiàn)LACS有4種形式,分別為Faa1p、Faa2p、Faa3p和Faa4p,其中Faa1p和Faa4p的催化活性較高,主要參與長(zhǎng)鏈脂肪酸的活化[18]。

    雖然LACS基因在擬南芥中已經(jīng)有較為詳盡的研究,然而向日葵LACS基因在TAG合成和逆境脅迫中的作用至今仍不甚清楚。本研究通過(guò)分析向日葵基因組發(fā)現(xiàn)LACS為多基因家族,進(jìn)一步從實(shí)驗(yàn)室前期獲得的向日葵種子發(fā)育轉(zhuǎn)錄組發(fā)現(xiàn),LACS家族成員在種子發(fā)育過(guò)程中呈現(xiàn)差異表達(dá)模式,篩選獲得一個(gè)包含完整編碼區(qū)的LACS基因序列,命名為HaLACS1,使用反轉(zhuǎn)錄PCR克隆獲得該基因并對(duì)其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,研究其亞細(xì)胞定位、組織表達(dá)及在干旱、鹽和ABA處理下的表達(dá)模式,并通過(guò)酵母突變體功能互補(bǔ)試驗(yàn)進(jìn)一步明確HaLACS1編碼酶的活性和底物偏好性,以期為揭示該基因的功能及其在向日葵油脂合成和抗逆中的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 材料及處理 供試向日葵品種為油葵T303(含油量約49%),于2020年春季種植于石河子大學(xué)農(nóng)試場(chǎng)試驗(yàn)田。將開花后第0天的植株進(jìn)行人工自花授粉,并做標(biāo)記,取開花當(dāng)天及油脂積累3個(gè)不同時(shí)期(初期、中期和后期,即開花后10、24和31 DAF(day after flowering))的種子,液氮速凍后于-80℃保存。

    將向日葵種子播種于花盆中,置于溫室中培養(yǎng)[(25±2)℃,16 h光照/8 h黑暗],當(dāng)幼苗生長(zhǎng)至2片真葉時(shí),分別取根、莖、葉和子葉,液氮速凍后-80℃保存,同時(shí)以盆栽幼苗為材料,以無(wú)菌水處理為對(duì)照,進(jìn)行不同濃度的鹽脅迫(0、150、200和300 mmol/L NaCl)處理24 h;干旱脅迫(15% PEG 6000)和外源ABA(100 μmol/L)處理0、1、3、6、12和24 h。每個(gè)樣品進(jìn)行3個(gè)生物學(xué)重復(fù)。

    1.1.2 菌株與主要試劑 pMD18-T載體購(gòu)自TaKaRa公司。大腸桿菌(E. coli)DH5α、亞細(xì)胞定位載體pAN580-eGFP和酵母穿梭表達(dá)載體pYES2由石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院植物功能基因?qū)嶒?yàn)室保存。pAN580帶有增強(qiáng)型綠色熒光蛋白(enhanced green fluorescent protein,eGFP)報(bào) 告 基 因。LACS缺陷型酵母(Saccharomyces cerevisiae)YB525菌株(faa1△faa4△)由朱駿教授(上海師范大學(xué))惠贈(zèng)。

    1.2 方法

    1.2.1 HaLACS1的克隆及序列分析 使用FastPure Plant Total RNA Isolation Kit(Vazyme,南京,中國(guó)) 提取向日葵總RNA,使用PrimeScriptTMReverse Transcriptase(TaKaRa,大連)反轉(zhuǎn)錄cDNA。根據(jù)向日葵基因組,用Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)HaLACS1編碼區(qū)引物(L1F/L1R),并添加Hind Ⅲ和XhoⅠ酶切位點(diǎn),用于構(gòu)建PYES2-HaLACS1載體(表1)。使用在線網(wǎng)站ExPASy(https://web.expasy.org/protparam/)預(yù)測(cè)HaLACS1蛋白分子量和等電點(diǎn)。使用MEGA 7.0軟件的鄰接法(neighbor-joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,采用Clustal W結(jié)合GeneDoc軟件對(duì)蛋白序列進(jìn)行比較和可視化分析。利用在線軟件PlantCARE與TBtools分析HaLACS1啟動(dòng)子順式作用元件。

    表1 引物信息Table 1 Information of primers used in this study

    1.2.2 亞細(xì)胞定位分析 使用引物PF和PR擴(kuò)增HaLACS1,經(jīng)瓊脂糖凝聚檢測(cè)、純化后,與亞細(xì)胞定位載體pAN580-eGFP連接,構(gòu)建融合表達(dá)載體pAN580-HaLACS1-eGFP。將構(gòu)建好的融合表達(dá)載體、pAN580-eGFP空載體及mCherry-HDEL-eRFP(內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位marker)質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化擬南芥原生質(zhì)體,弱光下培養(yǎng)8-10 h,利用激光共聚焦顯微鏡觀察GFP在細(xì)胞內(nèi)的分布,判斷HaLACS1的亞細(xì)胞定位。

    1.2.3 HaLACS1的表達(dá)分析 以向日葵18S rRNA(AF107577)基因?yàn)閮?nèi)參,使用ChamQTM Universal SYBR qPCR Master Mix(Vazyme,南京)進(jìn)行qRTPCR反應(yīng),分析HaLACS1的表達(dá)水平。反應(yīng)程序?yàn)?5℃ 30 s;95℃ 10 s,60℃ 30 s,72℃ 20 s,40個(gè)循環(huán)。采用2-ΔΔCT法計(jì)算基因相對(duì)表達(dá)量[19]。

    1.2.4 HaLACS1 在酵母中的功能驗(yàn)證 使用引物L(fēng)1F和L1R(表1)擴(kuò)增HaLACS1的編碼區(qū)序列,構(gòu)建酵母表達(dá)載體pYES2-HaLACS1。采用LiAc轉(zhuǎn)化法[20],分別將重組質(zhì)粒和對(duì)照質(zhì)粒pYES2轉(zhuǎn)化至LACS缺陷型酵母YB525中。轉(zhuǎn)基因酵母在含2%(W/V)半乳糖的尿嘧啶缺陷培養(yǎng)基(yeast synthetic drop-out agar medium without uracil,SCU)上進(jìn)行誘導(dǎo)培養(yǎng)[21-22]。

    1.2.5 底物偏好性分析 將轉(zhuǎn)基因酵母接種于SCU培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期中后期,收集酵母細(xì)胞。加入2 mol/L山梨醇清洗2次。將酵母細(xì)胞轉(zhuǎn)入3-5 mL SCU液體培養(yǎng)基(含2%半乳糖),30℃培養(yǎng)4 h,誘導(dǎo)外源基因表達(dá)。測(cè)OD600,然后吸取30 μL菌液加入到3 mL含2%半乳糖、98 μmol/L脂肪酸(C12: 0、C14:0、C16:0、C18:0、C18:1)的SCU液體培養(yǎng)基中,并添加0.1% Triton X-100溶解脂肪酸。30℃震蕩培養(yǎng)48 h,使用分光光度計(jì)測(cè)量菌體密度,推測(cè)HaLACS1催化反應(yīng)的底物偏好性[23]。

    1.2.6 酵母細(xì)胞油脂的檢測(cè) 利用蘇丹黑B染色法[24]分析轉(zhuǎn)基因酵母細(xì)胞中的油脂含量(脂肪粒散布在細(xì)胞質(zhì)中,可被蘇丹黑B氧化成黑藍(lán)色,在580 nm波長(zhǎng)下酵母細(xì)胞油脂含量與吸光值呈線性關(guān)系)。首先用無(wú)菌水懸浮收集半乳糖誘導(dǎo)后的酵母菌體,將OD600處菌液濃度調(diào)為0.5,5 000 r/min離心10 min收集菌體。用0.3%的蘇丹黑(蘇丹黑0.3 g,70%乙醇100 mL)染色15 min后,棄去染料,用70%酒精懸浮菌體漂洗3次后懸浮于無(wú)菌水, 測(cè)OD580。

    1.2.7 統(tǒng)計(jì)和分析 采用SPSS 26.0(one-way ANOVA)和Duncan法對(duì)qRT-PCR和底物偏好性進(jìn)行單因素方差和多重比較分析(P<0.05)。使用SPSS 26.0和Turkey’s法對(duì)中性油脂含量進(jìn)行單因素方差和多重比較分析。所有數(shù)據(jù)均用3個(gè)生物學(xué)重復(fù)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,并使用GraphPad Prism 8.0.2進(jìn)行繪圖。

    2 結(jié)果

    2.1 HaLACS1的克隆及序列分析

    以向日葵cDNA為模板,擴(kuò)增得到了1 980 bp的HaLACS1完整開放閱讀框(圖1-A)。該基因編碼659個(gè)氨基酸,分子量為74.672 kD,等電點(diǎn)為5.82,與擬南芥AtLACS1蛋白的同源性為64%,與萵苣(Lactuca sativa)LsLACS1的同源性為79%。通過(guò)染色體定位發(fā)現(xiàn)其位于第4染色體63 100 598-63 107 432基因座,具有19個(gè)外顯子和18個(gè)內(nèi)含子(圖1-B)。將HaLACS1編碼的氨基酸序列與其他5個(gè)植物L(fēng)ACS氨基酸序列進(jìn)行同源性比對(duì),結(jié)果(圖2)顯示,向日葵HaLACS1蛋白序列中含有高度保守的AMP結(jié)合結(jié)構(gòu)域(AMP-binding domain)和ACS信號(hào)結(jié)構(gòu)域(ACS signature domain),同時(shí)HaLACS1還含有LACS酶特異的LACS特異的連接域(LACS-specific linker domain)。不同植物中LACS連接域的氨基酸序列相似性差異較大。保守結(jié)構(gòu)域分析表明,HaLACS1具備LACS家族蛋白的共同特征,可以確定所克隆的基因?yàn)橄蛉湛鸏ACS基因。

    圖1 向日葵HaLACS1的克隆(A)及染色體定位分析(B)Fig. 1 Cloning(A)and chromosome location(B)of the HaLACS1 gene in H. annuus

    圖2 不同植物L(fēng)ACS1蛋白序列多重比對(duì)結(jié)果Fig. 2 Multiple alignment results of LACS1 proteins from different plants

    2.2 HaLACS1啟動(dòng)子序列分析

    從向日葵基因組數(shù)據(jù)中獲得了HaLACS1開放閱讀框(ORF)上游2 000 bp的啟動(dòng)子序列,利用在線軟件PlantCARE與TBtools對(duì)HaLACS1啟動(dòng)子順式作用元件進(jìn)行分析(圖3)。發(fā)現(xiàn)含有TATAbox(RNA聚合酶Ⅱ結(jié)合位點(diǎn),可以保證轉(zhuǎn)錄精確起始)、參與厭氧誘導(dǎo)的ARE元件(AAACCA)、參與水楊酸反應(yīng)的TCA元件(CCATCTTTTT);另外還發(fā)現(xiàn)了GARE-motif(TCTGTTG)赤霉素、TGAelement(AACGAC)生長(zhǎng)素及CGTCA-motif茉莉酸甲酯響應(yīng)元件;除此之外,還發(fā)現(xiàn)低溫響應(yīng)元件LTR(CCGAAA)和一個(gè)參與干旱誘導(dǎo)的MYB結(jié)合位點(diǎn)元件MBS(CAACTG)。結(jié)果表明,HaLACS1可能通過(guò)激素調(diào)控來(lái)發(fā)揮調(diào)節(jié)植物生長(zhǎng)和響應(yīng)外界環(huán)境脅迫的作用。

    圖3 向日葵HaLACS1啟動(dòng)子的順式作用元件Fig. 3 Cis-acting elements of the H. annuus HaLACS1 gene promoter

    2.3 HaLACS1蛋白序列的系統(tǒng)發(fā)育分析

    系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果(圖4)表明,向日葵HaLACS1與擬南芥AtLACS1的同源性為64%,與萵苣LsLACS1同源性最高(79%)。HaLACS1與芝麻SiLACS1、蓖麻RcLACS1、花生AhLACS1、大豆GmLACS1等雙子葉植物L(fēng)ACS1在同一進(jìn)化支上,與單子葉植物水稻、玉米、小麥的LACS蛋白同源關(guān)系較遠(yuǎn)。而釀酒酵母與三角褐指藻的LACS蛋白序列聚為另一分支上,親緣關(guān)系較近。

    圖4 向日葵HaLACS1蛋白與其他植物L(fēng)ACS1的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析Fig. 4 Phylogenetic relationships of the HaLACS1 protein in H. annuus with other plant LACS1

    2.4 HaLACS1的亞細(xì)胞定位分析

    PCR擴(kuò)增HaLACS1的編碼區(qū),經(jīng)SpeⅠ和NcoⅠ 雙酶切、測(cè)序、連接、轉(zhuǎn)化,獲得HaLACS1與綠色熒光蛋白(GFP)融合的表達(dá)載體pAN580-HaLACS1-eGFP。通過(guò)與攜帶紅色熒光蛋白(RFP)的mCherry-HDEL-RFP質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化擬南芥原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)后,在激光共聚焦顯微鏡下觀察定位情況。結(jié)果(圖5)表明,攜帶有GFP的HaLACS1與攜帶RFP的mCherry-HDEL-eRFP在共聚焦顯微鏡下可以共定位,表明HaLACS1定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。

    圖5 HaLACS1在擬南芥原生質(zhì)體中的亞細(xì)胞定位Fig. 5 Subcellular localization of the HaLACS1 protein in the protoplasts of Arabidopsis

    2.5 HaLACS1組織特異性表達(dá)分析

    使用qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)HaLACS1在向日葵各組織中的表達(dá)情況,結(jié)果(圖6)表明,HaLACS1在向日葵根、莖、葉、子葉、花和種子中均有表達(dá),在花和種子發(fā)育初期(10 DAF)表達(dá)量較高,其中,在種子發(fā)育早期表達(dá)量最高,是根中表達(dá)量的17倍,隨后表達(dá)量下降,推測(cè)HaLACS1參與向日葵種子的油脂積累,且發(fā)揮作用的時(shí)段主要為早期,同時(shí)該基因可能還與向日葵花器官中的油脂積累有關(guān)。

    圖6 HaLACS1在不同組織中的表達(dá)Fig. 6 Tissue expression analysis of the HaLACS1 gene

    2.6 HaLACS1對(duì)非生物脅迫和外源ABA的響應(yīng)

    向日葵是一種抗旱、耐鹽堿的作物,為了明確向日葵HaLACS1對(duì)干旱和鹽脅迫的響應(yīng),采用qRTPCR方法分析HaLACS1在2種脅迫下的表達(dá)情況。結(jié)果(圖7)表明,HaLACS1響應(yīng)干旱和鹽脅迫,且不同組織(根、莖、葉)具有不同的響應(yīng)模式。在干旱脅迫下(圖7-A),HaLACS1在莖和葉中的表達(dá)量呈“升-降-升”的趨勢(shì),莖中的表達(dá)量在干旱處理1 h時(shí)達(dá)到最高,為對(duì)照的2倍左右,葉中表達(dá)量在處理12 h時(shí)達(dá)到最高,為對(duì)照的3倍左右。根中的表達(dá)量在處理后先降低,在3 h處其表達(dá)量開始升高,于12 h處達(dá)到最高,為對(duì)照的3倍左右。

    用不同濃度NaCl(0、150、200和300 mmol/L)處理向日葵幼苗,處理24 h后檢測(cè)HaLACS1的相對(duì)表達(dá)量,結(jié)果(圖7-B)表明,供試組織(根、莖、葉)在150 mmol/L NaCl處理下,HaLACS1的表達(dá)較對(duì)照顯著上調(diào),在根、莖和葉中的相對(duì)表達(dá)量約為對(duì)照的8-10倍。隨著NaCl濃度的升高,HaLACS1在莖、葉中的表達(dá)量呈下降趨勢(shì),而在200 mmol/L NaCl脅迫后,在根中的表達(dá)下調(diào),300 mmol/L NaCl脅迫后又顯著升高,表明HaLACS1受干旱和鹽脅迫誘導(dǎo)。

    圖7 向日葵在干旱(A)和鹽(B)脅迫下不同組織中HaLACS1的表達(dá)分析Fig. 7 Relative expressions of the HaLACS1 gene in H. annuus tissues under drought(A)and salt stresses(B)

    ABA處理后(圖8),HaLACS1在根中的表達(dá)在處理1 h時(shí)下調(diào),然后持續(xù)上調(diào),在12 h表達(dá)量最高,約為對(duì)照的2倍;HaLACS1在莖中的表達(dá)較對(duì)照顯著上調(diào),在莖中12 h時(shí)表達(dá)量最高,為對(duì)照的5倍左右,在24 h時(shí)略有下調(diào)。在葉的表達(dá)量在ABA處理后出現(xiàn)“升-降-升”趨勢(shì),在12 h時(shí)表達(dá)量最高,約為對(duì)照的3倍,表明HaLACS1受ABA 誘導(dǎo)。

    圖8 向日葵在ABA處理下不同組織中HaLACS1的表達(dá)分析Fig. 8 Expression pattern of HaLACS1 in H. annuus tissues under ABA treatment

    2.7 酵母功能互補(bǔ)試驗(yàn)及底物偏好性分析

    為明確HaLACS1是否具有LACS酶活性,構(gòu)建pYES2-HaLACS1酵母表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)化至LACS缺陷型釀酒酵母菌株YB525中,置于以脂肪酸為唯一碳源的液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)。YB525為酵母LACS缺陷型菌株,不能在含有脂肪酸為唯一碳源的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)[25]。在培養(yǎng)基里添加不同鏈長(zhǎng)的外源脂肪酸作為底物,根據(jù)酵母生長(zhǎng)情況確定HaLACS1是否具有LACS酶活性,并探究HaLACS1的底物偏好性,以轉(zhuǎn)pYES2空載體的菌株為對(duì)照。結(jié)果(圖9)表 明,30℃震蕩培養(yǎng)48 h后,轉(zhuǎn)化pYES2-HaLACS1的酵母彌補(bǔ)了該突變菌株不能在以脂肪酸為唯一碳源的SCU培養(yǎng)基中正常生長(zhǎng)的缺陷,恢復(fù)了其正常生長(zhǎng)速率,說(shuō)明HaLACS1具有LACS酶活性。并且轉(zhuǎn)基因酵母在棕櫚酸(C16:0)和油酸(C18:1)的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)速率更快,說(shuō)明HaLACS1對(duì)底物 C16:0和C18:1脂肪酸具有偏好性。

    圖9 重組酵母的生長(zhǎng)狀況Fig. 9 Growth status of recombinant yeast cells

    2.8 轉(zhuǎn)基因酵母油脂含量分析

    半乳糖誘導(dǎo)48 h后的陽(yáng)性酵母菌用于轉(zhuǎn)基因酵母的油脂檢測(cè),通過(guò)蘇丹黑B染色法檢測(cè)酵母細(xì)胞油脂含量,結(jié)果(圖10)顯示,pYES2-HaLACS1的酵母轉(zhuǎn)化子中蘇丹黑B染色程度較對(duì)照顯著升高(P<0.01),表明pYES2-HaLACS1的酵母轉(zhuǎn)化子相較于對(duì)照含有更高的油脂,說(shuō)明HaLACS1可以提高酵母油脂含量。

    圖10 重組酵母細(xì)胞的蘇丹黑B染色Fig. 10 Sudan black B staining of recombinant yeast cells

    3 討論

    LACS基因家族在高等植物中廣泛分布,在植物甘油酯的合成與分解、角質(zhì)和蠟質(zhì)合成、逆境響應(yīng)等多個(gè)過(guò)程中具有重要作用。已有研究表明,高等植物L(fēng)ACS家族蛋白定位于不同的細(xì)胞器,如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)[26]、葉綠體[27]、過(guò)氧化物酶體[26-28]和質(zhì)膜[15,25]。前期研究發(fā)現(xiàn),向日葵基因組中具有13個(gè)LACS基因家族成員,本研究從向日葵基因組中克隆了一個(gè)HaLACS1基因,與擬南芥AtLACS1具有較高的相似性。構(gòu)建GFP融合表達(dá)載體在擬南芥原生質(zhì)體中表達(dá)發(fā)現(xiàn),HaLACS1定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),這與擬南芥同源蛋白AtLACS1的亞細(xì)胞定位結(jié)果一致[11]。前人也報(bào)道了向日葵中的2個(gè)LACS基 因[29],本研究對(duì)其序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)已報(bào)道的這兩個(gè)向日葵LACS基因與擬南芥AtLACS8和AtLACS9的相似性較高,其中向日葵HaLACS8蛋白定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),HaLACS9蛋白定位于葉綠體。并且研究表明,位于不同細(xì)胞器中的LACS蛋白具有不同的生物學(xué)功能。位于質(zhì)體中的LACS蛋白與質(zhì)體中從頭合成的長(zhǎng)鏈脂肪酸的激活有關(guān),并參與質(zhì)體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)之間的脂質(zhì)運(yùn)輸[26]。定位于過(guò)氧化物酶體的AtLACS6、AtLACS7和一種大豆蛋白GmLACS2參與脂肪酸的降解[26-27]。位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的AtLACS1、AtLACS2、AtLACS4和AtLACS8參與脂質(zhì)的合成[12]。本研究發(fā)現(xiàn)HaLACS1定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),推測(cè)該蛋白可能與擬南芥中定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的LACS蛋白具有相似的脂質(zhì)合成功能。

    研究表明,擬南芥AtLACS基因家族成員可在根、莖、葉、花和種子等多個(gè)器官中高表達(dá)[12-13],其表達(dá)模式上的多樣化也印證了AtLACS基因功能的多樣化。其中,AtLACS1在擬南芥莖、葉表皮細(xì)胞、花和發(fā)育的種子中高表達(dá),參與擬南芥表皮蠟和角質(zhì)、花粉外壁脂質(zhì)和種子TAG的合成等多個(gè)生物過(guò)程[12]。AtLACS1突變體導(dǎo)致莖和葉的C16角質(zhì)單體分別減少了37%和22%,同時(shí),AtLACS1具有超長(zhǎng)鏈脂肪酸(C20-C30)合成酶活性,尤其對(duì)C30脂肪酸具有高活性,在擬南芥表皮蠟質(zhì)代謝中發(fā)揮重要作用[14]。AtLACS1和AtLACS4雙突變體導(dǎo)致花粉敗育,花粉外壁脂質(zhì)顯著降低[30]。AtLACS1和AtLACS9雙突變體的研究表明,二者在籽粒TAG的合成功能上存在部分冗余[13],此外,AtLACS2、AtLACS4和AtLACS8也在擬南芥種子中高表達(dá),在TAG的合成中發(fā)揮重要作用[15]。研究表明,HaLACS9在向日葵種子發(fā)育前期有較高的表達(dá),HaLACS8主要在種子發(fā)育后期表達(dá)[29]。本研究克隆的HaLACS1在向日葵花和種子發(fā)育的前期(花后10 d)表達(dá)量較高。HaLACS1和HaLACS9雖然定位于不同的細(xì)胞器,但都在種子發(fā)育前期表現(xiàn)出最強(qiáng)的活性,說(shuō)明其在向日葵種子TAG的合成功能上存在部分冗余,這與報(bào)道的擬南芥AtLACS1和AtLACS9相似[13]。而HaLACS8雖然定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),但在向日葵種子發(fā)育后期表現(xiàn)出高活性,推測(cè)這些基因的表達(dá)在種子發(fā)育過(guò)程中受到不同機(jī)制的調(diào)控。本研究結(jié)果推測(cè)HaLACS1參與向日葵花和種子中脂質(zhì)的積累過(guò)程,尤其參與向日葵種子TAG合成早期的調(diào)控。

    植物角質(zhì)層的主要成分是超長(zhǎng)鏈脂肪酸及其衍生物[31],是隔離外界的天然屏障,具有防止植物非氣孔性失水、抵御病蟲害和非生物逆境等多種功能[32]。從蘋果中鑒定了11個(gè)MdLACS,其中多個(gè)MdLACS在ABA處理后表達(dá)上調(diào),并且MdLACS1的過(guò)表達(dá)增強(qiáng)了蘋果愈傷組織對(duì)PEG、ABA和NaCl的耐受性,表明MdLACS1是響應(yīng)非生物脅迫的重要調(diào)節(jié)因子[33]。異源表達(dá)2個(gè)蘋果LACS基因(MdLACS2和MdLACS4)導(dǎo)致擬南芥表皮細(xì)胞的滲透性降低,減少了水分散失,增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因擬南芥對(duì)干旱和鹽脅迫的耐受性[34]。這些結(jié)果表明LACS在植物角質(zhì)合成中的作用增強(qiáng)了植物的抗旱性。向日葵作為一種耐鹽堿、抗旱性較強(qiáng)的油料作物,在我國(guó)西北地區(qū)廣泛種植,探究向日葵的抗逆機(jī)制具有重要意義。在擬南芥中的研究表明,干旱、鹽和ABA均可誘導(dǎo)MYB轉(zhuǎn)錄因子家族中的MYB41高表達(dá),而且可通過(guò)MYB41的下游調(diào)控基因AtLACS2來(lái)調(diào)控角質(zhì)的合成,從而提高擬南芥對(duì)干旱和鹽脅迫的耐受性[35]。本研究證實(shí),ABA、PEG和NaCl脅迫均能誘導(dǎo)HaLACS1在向日葵莖、葉中的表達(dá)上調(diào),并且該基因上游啟動(dòng)子序列中包含MYB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),因此,猜測(cè)HaLACS1受MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控參與向日葵角質(zhì)的合成,與向日葵的耐逆代謝有關(guān),具體功能有待進(jìn)一步深入研究。

    盡管擬南芥LACS酶是個(gè)小的多基因家族,但對(duì)不同碳鏈長(zhǎng)度的脂肪酸具有明顯的底物偏好性差異,這與其功能差異和亞細(xì)胞定位是相一致 的[12,15]。棉花(Gossypium hirsutum)GhACS1偏好長(zhǎng)鏈脂肪酸作為底物,尤其是油酸(C18:1)[28]。油菜(Brassica napus)BnLACS2參與種子油脂的合成,偏好肉蔻酸(C14:0)、軟脂酸(C16:0)、硬脂酸 (C18:0)、油酸(C18:1)和芥酸(C22:1)為底 物[5]。這些研究表明,LACS酶在高等植物中的功能較為保守。但由于種子油脂組分和脂質(zhì)代謝過(guò)程在不同植物中具有多樣性的特點(diǎn),LACS酶的底物偏好性在不同的植物中是不同的。為了明確向日葵HaLACS1的活性和底物偏好性,將HaLACS1轉(zhuǎn)入LACS缺陷型酵母細(xì)胞YB525中進(jìn)行功能互補(bǔ)試驗(yàn),結(jié)果證明HaLACS1能夠補(bǔ)償酵母突變體YB525的生長(zhǎng)缺陷,證實(shí)了HaLACS1具有長(zhǎng)?;o酶A合成酶活性。通過(guò)在不同脂肪酸培養(yǎng)基中測(cè)定酵母的生長(zhǎng)速率來(lái)間接分析其底物偏好性,結(jié)果表明,HaLACS1偏好軟脂酸和油酸等長(zhǎng)鏈脂肪酸作為底物。在對(duì)酵母油脂含量的檢測(cè)中發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因酵母的油脂含量顯著升高,結(jié)合HaLACS1定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的分析結(jié)果,說(shuō)明HaLACS1參與了向日葵的油脂合成過(guò)程中軟脂酸和油酸的活化。

    4 結(jié)論

    成功克隆了一個(gè)向日葵長(zhǎng)鏈?;o酶A合成酶基因HaLACS1,該基因全長(zhǎng)1 980 bp,編碼659個(gè)氨基酸,分子量為74.672 kD,等電點(diǎn)為5.82。HaLACS1定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。該蛋白序列具有典型的酰基輔酶A合成酶特征。HaLACS1主要在向日葵種子發(fā)育早期高表達(dá),可能參與向日葵種子油脂積累,并響應(yīng)干旱、高鹽和ABA的調(diào)控。HaLACS1可能參與了向日葵油脂的合成代謝,并對(duì)軟脂酸和油酸具有偏好性。

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