陳媛媛 唐艷 李玲
胃癌(gastric cancer,GC)是世界第五大最常見的癌癥,也是全球第三大癌癥死亡原因,嚴重威脅著人類的健康[1]。因此,研究胃癌診斷、預后和藥物治療的靶點具有重要的醫(yī)學意義。越來越多的證據(jù)表明,非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)在胃腸道惡性腫瘤中發(fā)揮調節(jié)作用。近年來,研究人員利用高通量測序技術和生物信息學在哺乳動物細胞中發(fā)現(xiàn)了大量的環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNAs),并證實其參與胃癌細胞的增殖、凋亡和遷移侵襲[2]。近期有研究報道,新發(fā)現(xiàn)的環(huán)狀RNA SH3結構域激酶結合蛋白1(circular RNA SH3 binding protein 1,CircSHKBP1)在胃癌患者組織和血清中的表達均異常上調,并且與胃癌的惡性進展有關[3],但是CircSHKBP1發(fā)揮促進癌癥惡化的機制尚未清楚。大量研究證實,circRNA通過吸附miRNAs的方式發(fā)揮癌癥發(fā)展中的調控蛋白翻譯功能[4]。miR-1294在多種癌癥中表達異常下調,發(fā)揮抑制癌癥惡化的作用,其中包括胃癌[5,6]。但是,CircSHKBP1在胃癌中的調控作用是否與miR-1294相關聯(lián),有待進一步研究。本研究擬以胃癌細胞為研究對象,觀察過表達CircSHKBP1對胃癌細胞增殖、遷移侵襲和凋亡的影響,旨在揭示其作用機制與CircSHKBP1靶向miR-1294有關,為胃癌的診斷、治療提供新方向。
1.1 實驗材料 本實驗所用組織標本收集于2019年3月至2021年2月,本醫(yī)院確診并行外科手術切除的胃癌標本及其正常組織40例,其中處理T1~T2級的有12例,T3~T4級的有28例。涉及的患者及其家屬全部簽署知情同意書。本試驗跟蹤回訪調查本醫(yī)院確診的90例胃癌患者的5年生存期。正常胃上皮細胞GES1、胃癌細胞MGC803、HGC27、BGC823均購自上海中國科學研究院細胞庫。DMEM培養(yǎng)基購自北京康為世紀;胎牛血清購自杭州四季青;CCK-8試劑購自日本同仁化學研究所;胰蛋白酶均購自美國Sellect公司;LipofectamineTM3000購自大連TaKaRa公司;熒光素酶報告基因檢測試劑盒購自上海艾博抗貿易有限公司;Transwell小室購自美國Corning公司;膜聯(lián)蛋白V-異硫氰酸熒光素和碘化丙錠細胞凋亡檢測試劑盒(Annexin V-fluorescein isothiocyanate,Annexin V/FITC)購自北京索萊寶公司;ABI 7500型實時熒光定量PCR系統(tǒng)購自美國ABI公司;細胞培養(yǎng)箱購自美國Forma Scientific公司。
1.2 實驗方法
1.2.1 組織樣本的處理:取出冰凍保存的組織,緩慢融化,無菌研磨,用2倍組織體積的無菌蒸餾水稀釋研磨,最后保存?zhèn)溆?。將癌旁的正常胃組織標記為正常胃組織組,T1~T2級癌組織標記為T1~T2組,T3~T4級癌組織標記為T3~T4組。
1.2.2 細胞培養(yǎng)與分組:將GES1、MGC803、HGC27、BGC823在培養(yǎng)的時候使用DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)(混有10%胎牛血清)。培養(yǎng)溫度為37℃,所用氣體為5%CO2,95%O2,隔天換液。將培養(yǎng)48 h的這些細胞分別標記為GES1組、MGC803組、HGC27組、BGC823組。將pcDNA、pcDNA-CircSHKBP1、miR-NC、miR-1294、pcDNA-CircSHKBP1+miR-NC、pcDNA-CircSHKBP1+miR-1294用脂質體LipofectamineTM3000轉染或共轉染入常規(guī)培養(yǎng)的BGC823(轉染18 h后,換液培養(yǎng)),分別標記為pcDNA組、pcDNA-CircSHKBP1組、miR-NC組、miR-1294組、pcDNA-CircSHKBP1+miR-NC組、pcDNA-CircSHKBP1 +miR-1294組。用qRT-PCR法檢測細胞轉染效率(>70%)。
1.2.3 RT-qPCR實驗:使用RNA抽提試劑盒提取細胞總RNA,在19℃將其逆轉錄為cDNA,置于-40℃保存?zhèn)溆谩S肦T-qPCR試劑盒檢測CircSHKBP1、miR-1294的mRNA表達水平。以GAPDH、U6為內參,2-△△Ct法計算CircSHKBP1 mRNA、miR-1294 mRNA的表達。每個樣品做3個重復,實驗重復3次。引物信息:CircSHKBP1:上游引物,5’-AGGTCAGGCAGAGGAAGTCA-3’,下游引物,5’-CGCGTCATAACTGGTGATGG-3’;miR-1294:上游引物,5’-TATGATCTCACCGAGTCCT-3’,下游引物,5’-CACCTTCCTAATCCTCAGTT-3’;GAPDH,上游引物,5’-GGACCTGACCTGCCGTCTAG-3’;下游引物,5’-TAGCCCAGGATGCCCTTGAG-3’;內參U6用通用引物。
1.2.4 CCK-8實驗:將待檢測的細胞密度調至約2×105個/ml,使用CCK-8試劑盒檢測細胞在490 nm波長下檢測細胞OD值。每個樣品做3個重復,實驗重復3次。細胞增殖率(%)=(OD490處理組/OD490 對照組-1)×100%。
1.2.5 Transwell小室實驗:先將待檢測的細胞用無血清培養(yǎng)基饑餓處理12 h,再將細胞消化,離心棄上清,用1%血清的培養(yǎng)液調整至105個/ml,待用。取100 μl 置于上室,取600 μl含10%血清的培養(yǎng)液置于下室,常規(guī)培養(yǎng)12 h。用甲醇固定結晶紫染色染色后,對細胞拍照計數(shù)。每個樣品做3個重復,實驗重復3次。細胞遷移率(%)=穿膜細胞數(shù)/細胞總數(shù)×100%;細胞侵襲率(%)=侵襲細胞數(shù)/細胞總數(shù)×100%。
1.2.6 Annexin V-/FITC實驗:Annexin V-/FITC測定法用于評估細胞的凋亡。按照Annexin V-/FITC細胞凋亡檢測試劑盒的制造商說明要求操作,用冷PBS洗滌細胞,并用500 μl的結合緩沖液懸浮。接著將5 μl的 Annexin V-FITC和5 μl的碘化丙啶加入到結合緩沖液中,最后在室溫下在黑暗環(huán)境中孵育5min,上流式細胞儀分析細胞的染色情況。細胞凋亡率為細胞的早期凋亡率與晚期凋亡率之和。
1.2.7 熒光素酶報告基因檢測實驗:通過預測網站https://circinteractome.nia.nih.gov/預測到CircSHKBP1與miR-1294存在潛在的結合位點。將CircSHKBP1-WT(含CircSHKBP1結合位點)和CircSHKBP1-MUT(不含CircSHKBP1結合位點)的克隆到pGL3熒光素酶報告質粒載體。將BGC823細胞培養(yǎng)24 h后,與報告質粒共轉染,轉染48 h,用熒光素酶報告基因試劑盒測定熒光活性。
2.1 CircSHKBP1在胃癌組織、胃癌細胞中的表達 CircSHKBP1高表達患者的生存期顯著低于低表達的患者(P<0.05)。CircSHKBP1mRNA在胃癌組織中的表達較正常胃組織明顯上調(P<0.05)。CircSHKBP1mRNA在胃癌細胞中的表達顯著高于GES1細胞(P<0.05)。見圖1,表1、2。
圖1 不同CircSHKBP1表達水平的胃癌患者的生存率
表1 CircSHKBP1 mRNA在胃癌組織中的表達
表2 CircSHKBP1 mRNA在胃癌細胞中的表達
2.2 過表達CircSHKBP1的BGC823細胞的增殖、遷移、侵襲和凋亡 與pcDNA組比較,pcDNA-CircSHKBP1組細胞中CircSHKBP1 mRNA表達顯著升高(P<0.05),細胞增殖率、遷移率和侵襲率均明顯升高(P<0.05),細胞凋亡率顯著降低(P<0.05)。見圖2,表3。
圖2 過表達 CircSHKBP1的胃癌細胞遷移侵襲圖和凋亡圖;A 過表達CircSHKBP1的胃癌細胞遷移侵襲圖(HE×200);B 過表達CircSHKBP1的胃癌細胞凋亡圖
表3 過表達CircSHKBP1的BGC823細胞的增殖、遷移、侵襲和凋亡情況
2.3 CircSHKBP1靶向miR-1294 通過Circinteractome網站預測到CircSHKBP1與miR-1294存在連續(xù)的7個結合位點。熒光素酶檢測顯示,miR-1294組細胞的熒光活性顯著低于miR-NC組(P<0.05),與anti-miR-NC組比較,anti-miR-1294組熒光活性變化不明顯(P>0.05)。胃癌組織中miR-1294與CircSHKBP1的mRNA的表達水平呈負相關(P<0.05)。見圖3、4,表4。
表4 雙熒光素酶報告基因檢測試驗結果
圖3 CircSHKBP1與miR-1294的結合位點
圖4 胃癌組織中CircSHKBP1和miR-1294的mRNA表達
2.4 miR-1294在胃癌組織和細胞中的表達 與正常胃組織組比較,T1-T2組、T3-T4組胃癌組織中的miR-1294 mRNA的表達水平均顯著降低(P<0.05)。與GES1組比較,MGC803、HGC27、BGC823細胞中的miR-1294 mRNA的表達水平也均顯著降低(P<0.05)。見表5、6。
表5 miR-1294在胃癌組織中的表達
表6 miR-1294 mRNA在胃癌細胞中的表達
2.5 過表達miR-1294的BGC823細胞的增殖、遷移、侵襲和凋亡 與miR-NC組比較,miR-1294組細胞中miR-1294表達顯著升高(P<0.05),細胞增殖率、遷移率和侵襲率均顯著降低(P<0.05),細胞凋亡率顯著升高(P<0.05)。見圖5,表7。
表7 過表達miR-1294對BGC823細胞的增殖、遷移、侵襲和凋亡的調控
圖5 過表達miR-1294的BGC823細胞遷移侵襲圖和凋亡圖;A 過表達miR-1294的BGC823細胞遷移侵襲圖(HE×200);B 過表達miR-1294的BGC823細胞凋亡圖
2.6 過表達miR-1294逆轉CircSHKBP1對BGC823細胞的增殖、遷移、侵襲和凋亡的調控 與pcDNA-SHKBP1+miR-NC組比較,pcDNA-SHKBP1+ miR-1294組細胞的增殖率、遷移率和侵襲率均顯著降低(P<0.05),細胞的凋亡率顯著升高(P<0.05)。見圖6,表8。
圖6 過表達miR-1294和CircSHKBP1的BGC823細胞遷移侵襲圖和凋亡圖;A BGC823細胞遷移侵襲圖(HE×200);B BGC823細胞凋亡圖
表8 過表達miR-1294逆轉CircSHKBP1對BGC823細胞的調控作用
環(huán)狀RNA(circRNAs)是一類通過反向剪接產生的ncRNAs,具有穩(wěn)定的環(huán)狀結構。CircRNA在組織中富集豐富,有數(shù)千種circRNAs在腫瘤組織和正常組織中存在差異表達[7]。據(jù)報道,CircRNA hsa_circ_0004872、CircRNA-hsa-circ_ 0000670、CircRNA-circ_0026359均在胃癌的發(fā)展進程中具有重要的調控作用,并且其作用機制均與靶向吸附miRNA有關[8-10]。最近,Xie等[3]在胃癌的研究中報道,外泌體circSHKBP1表達異常升高,促進胃癌細胞的增殖、遷移侵襲和血管形成,其作用機制與CircSHKBP1吸附miR-582-3p,結合HSP90,進而阻礙STUB1與HSP90的相互作用,抑制HSP90的泛素化有關。
本研究發(fā)現(xiàn),CircSHKBP1在胃癌組織中的表達異常升高,過表達CircSHKBP1具有促進胃癌細胞增殖、遷移侵襲和抑制凋亡的作用,這與Xie等[3]的研究結果相吻合。此結果再次證實了CircSHKBP1在胃癌中的促進癌癥惡化的功能,為CircSHKBP1用于胃癌的診斷治療提供支持。通過熒光素酶檢測實驗發(fā)現(xiàn),CircSHKBP1可靶向miR-1294,猜測miR-1294可能參與CircSHKBP1在胃癌中的促癌作用。
隨著高通量RNA測序技術和新型生物信息學工具的發(fā)展,已經在各種生物體中鑒定出了數(shù)千種circRNAs。circRNAs可以通過影響轉錄、mRNA轉換以及通過吸附RNA結合蛋白和miRNA來調控基因表達[11,12]。Wu等[13]報道,miR-1294在胃癌組織和細胞中異常下調,作為豐富核轉錄本1 的靶基因調控miR-1294/AKT1-PI3K/AKT/mTOR信號通路發(fā)揮促癌作用。Wang等[14]報道,miR-1294在胃癌患者組織和細胞中表達下調,并且miR-1294高表達組的總生存期明顯長于miR-1294低表達組,其還可直接靶向FOXK1調節(jié)上皮間質轉化。Shi等[15]報道,miR-1294在胃癌組織中的表達明顯低于相鄰正常組織,這與腫瘤大小、淋巴結轉移等臨床病理參數(shù)相關,此外,miR-1294表達較低的胃癌患者與miR-1294表達較高的患者相比,無病生存(DFS)和總生存(OS)時間更短。
本研究發(fā)現(xiàn),miR-1294在胃癌組織和細胞中的表達水平也是異常降低。進一步研究發(fā)現(xiàn),過表達miR-1294能夠抑制CircSHKBP1對胃癌細胞的增殖、遷移侵襲促進和凋亡抑制作用。這個實驗結果展示了CircSHKBP1與miR-1294在胃癌中的相互作用關系,為研究CircSHKBP1在胃癌中的作用機制奠定理論基礎。
綜上所述,CircSHKBP1在胃癌中表達異常上調,并且可促進胃癌細胞發(fā)生增殖、遷移侵襲,抑制凋亡的進行,不利于患者生存,產生這種作用的機制與靶向miR-1294相關,為胃癌的臨床治療提供潛在靶點。