魏麗萍,岳思琦,何成彥
(吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院 檢驗(yàn)科,吉林 長春130033)
結(jié)直腸癌的發(fā)病率在發(fā)達(dá)國家位列第三,死亡人數(shù)在男性排行中最多的是肺癌、前列腺癌和結(jié)直腸癌,女性為肺癌、乳腺癌和結(jié)直腸癌[1]。生活方式導(dǎo)致年輕化趨勢且患病率不斷增加[2],超過90%的胃腸道癌癥是由飲食習(xí)慣引起的。我們實(shí)驗(yàn)室運(yùn)用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù),通過對10名結(jié)直腸癌患者的腫瘤組織與癌旁正常組織進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示出差異表達(dá)的蛋白質(zhì),隨后對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行了差異分析,發(fā)現(xiàn)RBBP9在結(jié)直腸腫瘤中高表達(dá),是潛在的結(jié)直腸癌標(biāo)記物。
我們在此次實(shí)驗(yàn)中所用的結(jié)直腸癌組織標(biāo)本,是經(jīng)過病理學(xué)檢查證實(shí)的結(jié)直腸癌腺癌組織,在癌組織10 cm外減取癌旁組織。篩選出的患者要求在手術(shù)前未接受任何方式的治療。據(jù)上述標(biāo)準(zhǔn),我們從吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院組織標(biāo)本庫,申請到符合標(biāo)本的結(jié)直腸癌組織標(biāo)本10例。
1.2.1蛋白提取及濃度測定 取吉林大學(xué)組織標(biāo)本庫結(jié)直腸癌及正常組織,研磨機(jī)研磨后,加入預(yù)冷的蛋白提取試劑200 μl,在碎冰中裂解30 min,將離心管轉(zhuǎn)移到高速離心機(jī)中,低溫高速離心,留上清用考馬斯亮藍(lán)法測定液體蛋白濃度,其余蛋白提取樣品存于-80℃。
1.2.2二維質(zhì)譜-色譜聯(lián)用技術(shù)鑒定蛋白多肽 多肽溶解于0.1%FA,分離條件:流速2 μl/min洗脫3 h。全掃描,10次二級掃描,碰撞能量35%,進(jìn)行質(zhì)譜儀檢測。
1.2.3免疫印跡實(shí)驗(yàn)鑒定蛋白的表達(dá)水平 SDS-PAGE電泳,配置5%濃縮膠70v電壓30 min,10%分離膠110v電壓將目的蛋白條帶跑至分離膠中下位置按照分子量的不同進(jìn)行分離,轉(zhuǎn)膜后對其進(jìn)行快速封閉,RBBP9一抗在低溫條件下過夜孵育,洗膜,室溫條件下孵育二抗,再洗膜5次?;瘜W(xué)法(ECI法)發(fā)光顯色,壓片20秒,顯影劑5分鐘,定影劑5分鐘。
結(jié)果要求差異蛋白要求滿足蛋白質(zhì)譜數(shù)比值≥1且蛋白圖譜數(shù)差≥72。我們得到具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異蛋白34個,ATB5B,COL6A3,KRT18,RBBP,CA199,CA153等上調(diào)蛋白18個,CNN1,F(xiàn)LNA,MYL9,MYL6,TUBB2A等下調(diào)蛋白16個。其中RBBP9蛋白質(zhì)譜結(jié)果見圖1。
圖1 RBBP9蛋白質(zhì)譜
癌組織與癌旁組織的Western blotting檢測結(jié)果如圖2。
圖2 RBBP9在結(jié)直腸腫瘤組織中的表達(dá)量高于癌旁正常組織
視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤蛋白是研究最廣泛的腫瘤抑制基因之一[3]。既往研究的視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤結(jié)合蛋白中,RBBP4,RBBP6等的研究較多,其中RBBP6的研究發(fā)現(xiàn)在腫瘤細(xì)胞增殖、凋亡及細(xì)胞周期中均發(fā)揮重要調(diào)控作用,乳腺癌[4],食管癌[5],宮頸癌[6]等腫瘤中RBBP6高表達(dá)。RBBP4在肝癌患者中高表達(dá)者預(yù)后水平較差,可作為原發(fā)性肝癌的潛在靶點(diǎn)[7],RBBP4 在胃癌中也促進(jìn)癌細(xì)胞的生長和轉(zhuǎn)移導(dǎo)致患者預(yù)后不良[8]。但是對于RBBP9的相關(guān)研究較少。
視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤結(jié)合蛋白9,RBBP9——以前稱為 Bog[9]和 RBBP10[10]。
在結(jié)構(gòu)上研究發(fā)現(xiàn)RBBP9含有Rb結(jié)合基序LxCxE,經(jīng)酵母雙雜交和共免疫沉淀研究鑒定可與Rb蛋白結(jié)合[9]。除了結(jié)合 Rb 外,還發(fā)現(xiàn) RBBP9 與 p107(RBL1) 和 p130(RBL2) 形成復(fù)合物,RBBP9 可以與 E2F1-Rb 復(fù)合物競爭并取代E2F1。RBBP9 可能通過與 p107 相互作用來調(diào)節(jié) p107-E2F4/5-DP1-Smad3 復(fù)合物的形成。NESG確定了人類RBBP9的高分辨率 1.72 ?晶體結(jié)構(gòu),分子量約為 21 kDa[11],主要位于核外區(qū)。在歸類上,RBBP9是α/β水解酶家族-Pfam家族DUF1234(PF06821)的成員[12],RBBP9作為伐昔洛韋酶得到化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定[13]。
在功能上,少量研究表明 RBBP9 具有兩種不同的活性:(1)結(jié)合 RB 蛋白并調(diào)節(jié) RB/E2F 細(xì)胞周期通路活性的能力,以及(2)作為絲氨酸水解酶[14]。非癌癥性疾病研究表明RBBP9可能在細(xì)胞對慢性低劑量輻射的反應(yīng)中發(fā)揮作用[15],并且是造血干細(xì)胞衰老的候選調(diào)節(jié)劑[16]。RBBP9在ALS(肌萎縮側(cè)索硬化)型的人類間充質(zhì)干細(xì)胞表達(dá)比非ALS型人類間充質(zhì)干細(xì)胞的表達(dá)水平比較明顯偏低[17]。Takumi Adachi等推測肺源性損傷相關(guān)分子模式(DAMP) 能誘導(dǎo)活性的IL-33(IL33ia)。蛋白質(zhì)組學(xué)分析將RBBP9鑒定為誘導(dǎo)IL33ia的主要DAMP,并通過實(shí)驗(yàn)得出結(jié)論,RBBP9 刺激通過激活PGE2-EP2/EP4途徑誘導(dǎo)肺成纖維細(xì)胞產(chǎn)生 IL-33[18]。癌癥性疾病少數(shù)研究顯示,RBBP9在胰腺癌中顯示出較高的活性,在40%的胰腺腫瘤活檢,絲氨酸水解酶活性升高,RBBP9在胰腺腫瘤增生過程中促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖[19]。RBBP9在骨肉瘤中過表達(dá),與朊病毒蛋白(PRNP 和 PRND)在腫瘤發(fā)生和細(xì)胞凋亡相關(guān)[20]。結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移是導(dǎo)致患者死亡的主要原因[21],利用生物信息分析方法篩選出RBBP9與CRC肝轉(zhuǎn)移有關(guān)[22]。RBBP9活性在肺癌、乳腺癌和卵巢癌中也可檢測到,這表明這種酶可能影響廣泛的癌癥[19]。然而,人們對RBBP9在癌癥進(jìn)展所起的作用知之甚少。
我們運(yùn)用LC-MS,western bolt方法發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證了RBBP9在結(jié)直腸腫瘤中高表達(dá),RBBP9可能是結(jié)直腸癌潛在生物標(biāo)志物,為進(jìn)一步的探索研究RBBP9在結(jié)直腸癌的作用做出微薄貢獻(xiàn)。