劉夢,張文靜,呂穆杰,郭閆葵
1 山東中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院 山東濟(jì)南 250355 2 山東省濟(jì)南市中醫(yī)醫(yī)院 山東濟(jì)南 250000
缺血性腦卒中是因腦血管阻塞或血液供應(yīng)障礙,導(dǎo)致腦組織缺血缺氧性病變壞死,進(jìn)而產(chǎn)生臨床上對應(yīng)的神經(jīng)功能缺失表現(xiàn),約占卒中患者總數(shù)的 75%~85%[1]。失眠是指由于人體睡眠-覺醒系統(tǒng)紊亂,導(dǎo)致睡眠不足或睡眠不連貫,并伴有心煩、多夢等癥狀,對失眠有憂慮或恐懼心理可形成惡性循環(huán), 從而使癥狀持續(xù)存在[2]。失眠是腦卒中后常見的并發(fā)癥,腦卒中后失眠發(fā)病率75%~95%,缺血性腦卒中患者發(fā)病率更高[3]。同時,失眠也會增加缺血性腦卒中的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),失眠會導(dǎo)致交感神經(jīng)興奮性增高、下丘腦-垂體-腎上腺軸的激活,使再梗死的危險(xiǎn)系數(shù)加大[4]。因此,發(fā)揮中醫(yī)中藥治療毒副作用小、無藥物依賴等的特點(diǎn)和優(yōu)勢,尋求新的治療方法改善患者的癥狀,對疾病的預(yù)后和減少復(fù)發(fā)意義重大。
川芎辛溫香燥,《神農(nóng)本草經(jīng)》將其列為上品, 稱其“主中風(fēng)入腦頭痛,寒痹……”。紅花性味辛溫,為治瘀血阻滯之要藥,常與川芎相須為用。臨床上,川芎紅花常用于治療中風(fēng)病,用以活血化瘀,化痰通絡(luò)。周建偉等以活血化瘀為主的基本方 (芍藥、川芎、紅花、當(dāng)歸、生地、丹參)治療老年失眠22例, 有效率優(yōu)于對照組[5]。說明川芎紅花在治療缺血性腦卒中與失眠均有一定療效。藥理研究顯示,紅花中富含多種黃酮類、生物堿類物質(zhì),可通過上調(diào)一氧化氮合成酶活性、清除腦自由基,從而起到神經(jīng)保護(hù)作用[6]。川芎可通過抑制NF-κB 信號通路減少腦缺血后梗死面積,降低OGD膠質(zhì)細(xì)胞凋亡率,發(fā)揮神經(jīng)保護(hù)作用[7]。但川芎紅花治療缺血性腦卒中與失眠合病的內(nèi)在分子作用機(jī)制未見報(bào)道,應(yīng)進(jìn)入深入研究。
近年來,基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)理論探討中藥異病同治的研究也逐漸出現(xiàn),從整體系統(tǒng)的角度闡釋了藥物異病同治的分子機(jī)制。因川芎紅花藥對對干預(yù)兩種疾病“異病同治”的內(nèi)在分子作用機(jī)制尚不清楚。因此,本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),通過“異病同治”角度來闡述川芎紅花治療缺血性腦卒中以及失眠的分子作用機(jī)制,為后續(xù)臨床以及實(shí)驗(yàn)研究提供理論基礎(chǔ)。
在TCMSP 數(shù)據(jù)庫(中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺 https://tcmsp-e.com/)中檢索川芎、紅花,設(shè)定篩選條件為生物利用度(OB)≥30%,類藥性(DL)≥0.18,血腦屏障穿透性BBB≥-0.3得到有效化學(xué)成分及對應(yīng)靶點(diǎn);查找有效成分sdf結(jié)構(gòu)式導(dǎo)入swisstargetprediction數(shù)據(jù)庫(http://www.swisstargetprediction.ch/)得到對應(yīng)靶點(diǎn)。將兩種方法得到的有效成分靶點(diǎn)信息整合,通過Uniprot數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)對篩選的靶點(diǎn)進(jìn)行名稱標(biāo)準(zhǔn)化處理。
通 過DrugBank(https://www.drugbank.ca/)、DisGeneT(http://www.disgenet.org/web/DisGeneT/menu/ho)、OMIM(https://omim.org/)、Genecards(https://www.genecards.org/)數(shù)據(jù)庫,分別以關(guān)鍵詞“Cerebral ischemic stoke”、“insomnia”檢索缺血性腦卒中以及失眠的相關(guān)基因,并將得到的基因整合去重得到疾病靶點(diǎn)。
通過Venny 2.1.0(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/),將藥物預(yù)測的靶點(diǎn)與兩種疾病預(yù)測的靶點(diǎn)取交集,獲得川芎-紅花異病同治缺血性腦卒中和失眠的共同作用靶點(diǎn)。把藥物的有效成分與共同作用靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape3.8.2構(gòu)建成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)。
將篩選得到的共同靶點(diǎn)上傳到 String在線基因數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/),物種選擇為人類,保存結(jié)果中的tsv文件。將文件導(dǎo)入Cytoscape3.8.2構(gòu)建可視化網(wǎng)絡(luò),并利用MCODE插件對該網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行聚類分析,篩選出關(guān)鍵靶點(diǎn)。
將潛在靶點(diǎn)輸入Metascape數(shù)據(jù)庫((https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1),限定物種為人,篩選P<0.01,分別進(jìn)行GO功能及KEGG生物通路分析,將得到的結(jié)果通過微生信在線數(shù)據(jù)分析平臺(http://www.bioinformatics.com.cn/?p=5)進(jìn)行可視化。
iGEMDOCK 是一個集成環(huán)境,它集成了大量修改和增強(qiáng)的內(nèi)部工具蛋白質(zhì)配體圖譜、藥理相互作用和化合物簇。藥理相互作用對于活性化合物的結(jié)合往往是必不可少的,并涉及生物機(jī)制。藥理相互作用可以減少基于能量的評分函數(shù)的不良影響,以提高 VS 的命中率[8]。其能量打分函數(shù)通過蛋白質(zhì)-化合物相互作用的靜電、氫鍵和范德華力打分,化合物分子與受體結(jié)合的構(gòu)象穩(wěn)定時能量越低,結(jié)合性越高[9]。首先導(dǎo)入從PDB數(shù)據(jù)庫(https: //www.rcsb.org/)中搜索的蛋白結(jié)構(gòu),其次下載核心成分的mol格式文件,選擇標(biāo)準(zhǔn)對接模式進(jìn)行對接。
在TCMSP數(shù)據(jù)庫中檢索川芎共有189種化學(xué)成分,紅花共189種化學(xué)成分,經(jīng)篩選OB≥30%, DL≥0.18,BBB≥-0.3后得到川芎6種主要成分,紅花12種主要成分,見表1。通過swisstargetprediction數(shù)據(jù)庫及TCMSP數(shù)據(jù)庫預(yù)測靶點(diǎn),經(jīng)由Uniprot數(shù)據(jù)庫校對后,獲得紅花靶點(diǎn)388個,川芎靶點(diǎn)359個,合并后共有靶點(diǎn)537個。其中八氫番茄紅素、六氫番茄紅素?zé)o相關(guān)靶點(diǎn)。
表1 川芎-紅花主要活性成分
檢索到缺血性腦卒中靶點(diǎn)共982個,失眠靶點(diǎn)共1169個。
將川芎-紅花預(yù)測得到的537個靶點(diǎn)與疾病預(yù)測的靶點(diǎn)導(dǎo)入venny2.1.0得到共同靶點(diǎn)72個,見圖1。這些靶點(diǎn)為川芎-紅花異病同治缺血性腦卒中及失眠的潛在作用靶點(diǎn)。
圖1 川芎-紅花治療缺血性腦卒中及失眠的潛在靶點(diǎn)韋恩圖
把有效成分與潛在靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape3.8.2構(gòu)建成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò),見圖2。網(wǎng)絡(luò)共有92個節(jié)點(diǎn),382條邊,經(jīng)拓?fù)浞治龊蟮贸龀煞值淖畲蠖戎禐?8,度值>15的成分有黃芩素(baicalein)、β-谷甾 醇(beta-sitosterol)、豆 甾 醇(Stigmasterol)、木 脂素(Lignan)、紅花素(Carthamidin)、川芎萘呋內(nèi)酯(Wallichilide),推測這些成分可能是藥物治療疾病的核心成分。
圖2 成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)
將從string下載好的文件導(dǎo)入Cytoscape3.8.2得到共同靶點(diǎn)相互作用的網(wǎng)絡(luò),見圖3。網(wǎng)絡(luò)有72個節(jié)點(diǎn),586條邊,聚類分析后共得到5個子網(wǎng)絡(luò)。根據(jù)得分最高創(chuàng)建潛在靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖,共得到21個核心靶點(diǎn),見圖4,再根據(jù)接近中心性(ClosenessCentrality)和度值(Degree)排序,排名較前的蛋白有AKT1、FOS、CASP3、APP,推測這些蛋白是川芎紅花干預(yù)卒中及失眠的關(guān)鍵靶點(diǎn)。
圖3 共同靶點(diǎn)PPI作用網(wǎng)絡(luò)
圖4 潛在靶點(diǎn)PPI作用網(wǎng)絡(luò)
潛在靶點(diǎn)共涉及199條通路,根據(jù)p值由小到大進(jìn)行排序選取與人類相關(guān)的前20條通路并進(jìn)行可視化,具體信息見表2、圖5。與疾病相關(guān)的主要通路有神經(jīng)活性配體-受體相互作用、環(huán)腺苷酸信號通路、鈣信號通路、膽堿能突觸等信號通路,并將主要信號通路可視化,見圖6-圖9。
圖5 潛在作用靶點(diǎn)的KEGG通路
圖6 神經(jīng)活性配體-受體相互作用
圖9 膽堿能突觸
表2 川芎-紅花治療缺血性腦卒中及失眠潛在作用靶點(diǎn)的KEGG通路
潛在靶點(diǎn)涉及的生物過程(BP)1314條,分子功能(MF)115條,細(xì)胞組分(CC)99條,根據(jù)富集值排序,選取前10個條目,其主要參與的生物過程有腎上腺素-去甲腎上腺素對心率的正調(diào)節(jié)作用、腺苷酸環(huán)化酶抑制G蛋白偶聯(lián)乙酰膽堿受體信號通路、神經(jīng)元-膠質(zhì)細(xì)胞信號、腎上腺素-去甲腎上腺素對血壓的正向調(diào)節(jié)作用等,主要分子功能有α1 -腎上腺素受體活性、G蛋白偶聯(lián)乙酰膽堿受體活性、腎上腺素受體活性、G蛋白偶聯(lián)的神經(jīng)遞質(zhì)受體活性等,主要細(xì)胞組分有多巴胺能突觸、軸膜、突觸前膜的整體成分、樹突骨架等。具體見圖10。
圖10 川芎紅花干預(yù)缺血性腦卒中及失眠的潛在靶點(diǎn)GO分析
采用iGEMDOCK V2.1軟件將川芎紅花的核心成分黃芩素、β-谷甾醇、豆甾醇、木脂素、紅花素、川芎萘呋內(nèi)酯,與篩選的關(guān)鍵靶點(diǎn)AKT1、FOS、CASP3、APP進(jìn)行分子對接,對接結(jié)果見表3,其中結(jié)合性最強(qiáng)的是APP與lignan,見圖11。
表3 成分與靶點(diǎn)對接結(jié)果
圖11 APP與lignan分子對接圖
圖7 環(huán)腺苷酸信號通路
圖8 鈣信號通路
缺血性腦卒中和失眠是兩種常見的神經(jīng)系統(tǒng)疾病。現(xiàn)代研究表明,腦缺血后會引起Ca2+內(nèi)流、神經(jīng)炎性反應(yīng)、細(xì)胞凋亡、氧化應(yīng)激反應(yīng),并激活TLR4/NF-κB信號通路、MAPK信號通路等,進(jìn)一步促進(jìn)炎癥細(xì)胞因子的產(chǎn)生與神經(jīng)細(xì)胞凋亡,破壞血腦屏障,加重缺血性損傷[10-11]。失眠的病理機(jī)制較為復(fù)雜,當(dāng)機(jī)體處于應(yīng)激狀態(tài)時,會調(diào)節(jié)下丘腦生物鐘節(jié)律、神經(jīng)遞質(zhì)、褪黑素以及細(xì)胞炎癥因子的生成,有多種因素共同參與,任何環(huán)節(jié)的異常均會引起失眠的發(fā)生[12]。根據(jù)兩種疾病的潛在機(jī)制聯(lián)系,為兩種疾病的交叉治療提供新方法,有助于深入理解神經(jīng)系統(tǒng)疾病及尋找更有效的治療。
通過查閱相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn)川芎紅花的主要作用成分大部分在本次研究中有所體現(xiàn),但羥基紅花黃色素A、川芎嗪、6-羥基山奈酚因不符合篩選條件而未納入研究,說明此法仍有不充足和完善的地方,需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證以及文獻(xiàn)整理加以補(bǔ)充。在篩選得到的主要成分中,黃芩素可顯著抑制NF-κB、i NOS、COX-2的表達(dá)及磷酸化,減少神經(jīng)炎性因子的釋放,改善氧化應(yīng)激,發(fā)揮神經(jīng)保護(hù)作用[13]。β-谷甾醇可通過血腦屏障,影響GABA神經(jīng)突觸通路,調(diào)節(jié)神經(jīng)營養(yǎng)因子,并進(jìn)入線粒體,提高線粒體跨膜電位和ATP量,從而減少神經(jīng)元的凋亡[14]。除此之外,β-谷甾醇可抑制NF- κ B p65、p38 和 ERK的磷酸化,減少小膠質(zhì)細(xì)胞中促炎介質(zhì)的產(chǎn)生,保護(hù)神經(jīng)元[15]。]木脂素可調(diào)節(jié)腸道微生物菌群分泌神經(jīng)遞質(zhì)和神經(jīng)肽,通過腸腦軸增加腦循環(huán)中一氧化氮的水平,調(diào)節(jié)血管張力、血管舒張和血流[16]。豆甾醇能減少自由基的產(chǎn)生和脂質(zhì)過氧化,從而表現(xiàn)出良好的抗氧化損傷作用。還可抑制 NF-κB通路,降低 NO 水平和 COX-2 表達(dá)并減少其介導(dǎo)的神經(jīng)損傷,減少促凋亡基因、caspase-3 和增加抗凋亡基因來保護(hù)神經(jīng)細(xì)胞[17]。通過對主要化學(xué)成分的分析可發(fā)現(xiàn)成分可通過抑制神經(jīng)細(xì)胞凋亡、減少神經(jīng)炎性反應(yīng)、抗氧化應(yīng)激達(dá)到干預(yù)疾病的目的。
本研究通過靶點(diǎn)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)提取AKT1、FOS、CASP3、APP共4個關(guān)鍵靶點(diǎn)。AKT1能夠活化NF-κB炎癥信號通路,激活NF-κB二聚體并轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核內(nèi)促進(jìn)炎癥因子轉(zhuǎn)錄,導(dǎo)致失眠的發(fā)生[18]。生物鐘基因可激活A(yù)KT信號通路調(diào)節(jié)受損的神經(jīng)細(xì)胞,同時AKT信號通路可磷酸化Clock基因,改變和Bmal1的結(jié)合,調(diào)節(jié)晝夜節(jié)律[19]。C-FOS可調(diào)控氧化應(yīng)激和線粒體功能、抑制神經(jīng)細(xì)胞凋亡來調(diào)節(jié)缺血性卒中過程,并推測C-FOS可調(diào)控失眠大鼠神經(jīng)細(xì)胞凋亡過程來調(diào)節(jié)快速動眼睡眠[20-21]。Casp-3 是內(nèi)源性和外源性凋亡途徑的匯合點(diǎn),是凋亡的主要執(zhí)行者,是細(xì)胞凋亡蛋白酶級聯(lián)反應(yīng)的必經(jīng)途徑,降低腦組織中Casp-3的表達(dá)可減少缺血后腦組織中神經(jīng)細(xì)胞的凋亡[22]。此外,在大鼠睡眠剝奪后,會激活Casp-3,誘導(dǎo)神經(jīng)細(xì)胞凋亡,加重腦損傷和神經(jīng)功能障礙[23]。APP可控制GABA能突觸傳遞,對神經(jīng)元、軸突形成、樹突分支和樹突棘起營養(yǎng)作用。還可通過調(diào)節(jié)L型鈣通道調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)鈣穩(wěn)態(tài),抑制鈣振蕩,在控制神經(jīng)元興奮性中起關(guān)鍵作用[24]。本研究表明,川芎紅花藥對主要通過調(diào)節(jié)炎癥因子、影響晝夜節(jié)律、減少神經(jīng)細(xì)胞凋亡、促進(jìn)神經(jīng)營養(yǎng)因子的表達(dá)來發(fā)揮治療缺血性腦卒中以及失眠的作用。
通過KEGG分析,神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路在生理學(xué)上與神經(jīng)功能的關(guān)系最為密切。cAMP通路可由5-HT1AR介導(dǎo),調(diào)控PKA基因參與睡眠和晝夜節(jié)律調(diào)控,延長慢波睡眠和總睡眠時間,縮短入睡潛伏期,有明顯的促睡眠效應(yīng)[25]。腦缺血后會激活處于神經(jīng)元突觸位置的γ-氨基丁酸B受體(GABAB),降低細(xì)胞內(nèi)的cAMP濃度,妨礙神經(jīng)元突觸部位的囊泡聚集,對神經(jīng)元的內(nèi)生長狀態(tài)產(chǎn)生不利影響[26]。腦缺血時,氧化應(yīng)激損傷等原因可以增加Ca2+內(nèi)流,引起細(xì)胞內(nèi)Ca2+超載,導(dǎo)致Ca2+級聯(lián)反應(yīng), 加重缺血腦組織區(qū)細(xì)胞線粒體膜損傷,引發(fā)腦神經(jīng)元的細(xì)胞凋亡。此外,胞內(nèi)Ca2+可以與Ca M結(jié)合形成復(fù)合物,促進(jìn)神經(jīng)遞質(zhì)5-羥色胺和去甲腎上腺素的釋放來引起缺血腦組織的血管發(fā)生強(qiáng)烈收縮,從而加重腦缺血、缺氧的程度,造成惡性循環(huán)[27]。且研究發(fā)現(xiàn),L-型鈣通道阻斷劑可通過影響Ca2+信號通路中的下游分子蛋白激酶C和鈣調(diào)蛋白II來促進(jìn)戊巴比妥鈉誘導(dǎo)的催眠[28]。 基于膽堿能神經(jīng)調(diào)節(jié)和抑制全身炎癥反應(yīng)的功能提出膽堿能抗炎通路,由迷走神經(jīng),乙酰膽堿和乙酰膽堿受體組成,可通過轉(zhuǎn)導(dǎo)NF- κ B 信號通路、JAK/STAT信號通路、AMPK信號通路以及PI3K/AKT信號通路調(diào)控炎癥因子釋放,發(fā)揮抗炎作用,減輕腦缺血后神經(jīng)細(xì)胞的炎癥損傷[29]。這些結(jié)果可能會為增強(qiáng)缺血性腦卒中以及失眠的大腦修復(fù)提供新的治療策略。同時,GO分析的結(jié)果也提示這些信號通路或途徑是川芎紅花“異病同治”潛在作用機(jī)制。綜上所述,川芎紅花主要通過神經(jīng)活性配體-受體相互作用、環(huán)腺苷酸信號通路、鈣信號通路、膽堿能突觸等信號通路來減少神經(jīng)細(xì)胞凋亡,參與晝夜節(jié)律調(diào)控、調(diào)控炎癥因子釋放,發(fā)揮異病同治缺血性腦卒中、失眠的作用。
綜上,川芎、紅花可能通過多成分,多靶點(diǎn),多通路改善缺血性腦卒中以及失眠。基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與分子對接相結(jié)合的技術(shù)手段探討其改善缺血性腦卒中以及失眠的作用機(jī)制為后續(xù)深入驗(yàn)證川芎、紅花改善缺血性腦卒中以及失眠的作用機(jī)制奠定基礎(chǔ)。但由于中藥成分復(fù)雜,數(shù)據(jù)庫中僅納入已知的成分研究,新的化學(xué)成分及分子機(jī)制未完全納入,存在一定局限性。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是一種基于分子網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)及計(jì)算機(jī)模擬分析的研究技術(shù),因此對于川芎-紅花藥對的劑量、給藥時間等因素對藥效的影響,以及各項(xiàng)數(shù)據(jù)庫的納入范圍、計(jì)算方法等對于數(shù)據(jù)預(yù)測的影響,后續(xù)工作將結(jié)合體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步加以證實(shí)。