尹春蕾,劉榮榮,李麗娟,3*
(1.大理大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,云南大理 671000;2.棗莊市疾病預(yù)防控制中心,山東棗莊 277000;3.大理大學(xué)瀾湄人類(lèi)健康研究中心,云南大理 671000)
精神分裂癥是一種常見(jiàn)的重型精神疾病,累及世界1%的人口,其終身患病率為0.16%~1.21%〔1〕,伴有年齡和性別差異。該病多起于青壯年,以其思維、情感、人格和行為障礙的分裂,個(gè)性改變和精神活動(dòng)與其環(huán)境發(fā)生不協(xié)調(diào)為主要特征,通常無(wú)智能和意識(shí)障礙,一些患者會(huì)有認(rèn)知障礙。其病程多遷延,臨床表現(xiàn)具有異質(zhì)性,對(duì)患者的身心健康及社會(huì)生活質(zhì)量產(chǎn)生嚴(yán)重影響,造成了巨大的經(jīng)濟(jì)壓力和社會(huì)負(fù)擔(dān)。隨著生物學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,國(guó)內(nèi)外對(duì)精神分裂癥的認(rèn)識(shí)在其疾病描述、發(fā)展規(guī)律、產(chǎn)生機(jī)制及防治領(lǐng)域等方面逐步深入。目前對(duì)于精神分裂癥與神經(jīng)發(fā)育和炎性免疫方面的研究關(guān)注較多。有研究者提出,腸道菌群可以調(diào)節(jié)人體的免疫炎性反應(yīng)并影響神經(jīng)發(fā)育,由此推測(cè)腸道菌群與精神分裂癥之間可能存有某種關(guān)聯(lián)〔2-3〕,然而,目前關(guān)于腸道微生物群與精神分裂癥關(guān)系的研究仍然有限。本研究對(duì)有無(wú)精神疾病家族史的精神分裂癥患者發(fā)作期和控制期的腸道菌群進(jìn)行測(cè)定,并比較精神分裂癥患者發(fā)作期和控制期兩個(gè)階段腸道菌群的差異以及精神疾病家族史對(duì)精神分裂癥患者腸道菌群的結(jié)構(gòu)是否有影響,初步探知其精神疾病家族史、精神分裂癥患者病情控制與腸道菌群結(jié)構(gòu)的分布是否有關(guān)聯(lián),了解精神分裂癥患者癥狀得以控制后腸道菌群結(jié)構(gòu)和多樣性的變化情況。
1.1 研究對(duì)象將2017年12月至2018年8月在大理白族自治州第二人民醫(yī)院精神科住院,確診為精神分裂癥患者納入研究,共60例,入組時(shí)均為發(fā)作期組;經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的治療,患者病情得到控制后為控制期組。考慮精神分裂癥的家族遺傳特性,本研究依據(jù)患者不同病期(發(fā)作期、控制期)與有無(wú)精神疾病家族史將研究對(duì)象分為4組,分別是發(fā)作期有家族史組(1-1組)、控制期有家族史組(1-2組)、發(fā)作期無(wú)家族史組(2-1組)和控制期無(wú)家族史組(2-2組)。結(jié)合入院第一次采樣結(jié)果,對(duì)不符合要求的患者給予剔除。剔除標(biāo)準(zhǔn):①中途出院失訪者;②合并患有肝膽胃腸道疾病、自身免疫性疾病及傳染病等其他疾病者;③出院診斷與入院診斷不一致者。最終納入研究患者共10例,男女各5例,有無(wú)家族史患者各5例。研究對(duì)象平均年齡為(39.70±9.11)歲,平均體質(zhì)指數(shù)為(22.71±2.29)kg/m2。研究經(jīng)大理大學(xué)醫(yī)學(xué)倫理學(xué)會(huì)批準(zhǔn),所有入組者均知情同意。
1.2 研究方法
1.2.1 樣本采集與菌群提取 所有患者入院3 d內(nèi)采集一次早晨新鮮糞便,進(jìn)入控制期后再進(jìn)行一次糞便采集,均由研究人員收集,分裝,-80℃凍存。所有樣本收集完畢后,進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室處理,包括DNA提取,PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物純化。
1.2.2 基因測(cè)序 利用羅寧生物Hiseq 2500平臺(tái)PE250模式上機(jī)測(cè)序。
1.3 數(shù)據(jù)分析測(cè)序數(shù)據(jù)分析包括序列處理、物種注釋、群落組成分析、多樣性分析和物種差異分析等。應(yīng)用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,數(shù)據(jù)無(wú)特殊說(shuō)明均用(x±s)表示。兩組獨(dú)立樣本物種分析采用Wilcoxon秩和檢驗(yàn),多組獨(dú)立樣本物種分析采用Kruskal-Wallis H檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。多重比較分析調(diào)整P值,α=0.05/2n(n為比較組數(shù))時(shí),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 樣本測(cè)序結(jié)果通過(guò)高通量測(cè)序,20個(gè)樣品共獲得843 516條Raw PE序列,對(duì)序列進(jìn)行質(zhì)控得到Clean Tags(去除低質(zhì)量數(shù)據(jù))784 844條。使用UCHIME算法去除嵌合體,得到760 123條Effective tags(高質(zhì)量有效序列)。對(duì)736 338條Effective tags在97%的一致性水平上進(jìn)行聚類(lèi)共獲得1 756個(gè)OTUs(操作分類(lèi)單元),其中,1-1組、2-1組、1-2組和2-2組中的OTUs數(shù)目分別為1 310、1 115、1 334和1 139個(gè)。各樣品的操作分類(lèi)單元和高質(zhì)量有效序列數(shù)目見(jiàn)圖1。
圖1 各樣品操作分類(lèi)單元和高質(zhì)量有效序列數(shù)目
2.2 腸道群落物種組成每個(gè)樣品注釋到各分類(lèi)水平中通常包括界、門(mén)、綱、目、科、屬、種。所有樣品共注釋了30個(gè)門(mén),62個(gè)綱,118個(gè)目,178個(gè)科和322個(gè)屬。本研究注釋的絕大部分菌群主要分屬于4個(gè)菌門(mén):厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)、變形菌門(mén)和放線菌門(mén)。厚壁菌門(mén)在4組樣品中的相對(duì)豐度均最高,與擬桿菌門(mén)、變形菌門(mén)和放線菌門(mén)構(gòu)成精神分裂癥患者的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門(mén)。在綱水平上,患者腸道菌群中的梭桿菌綱、擬桿菌綱、γ-變形菌綱、芽孢桿菌綱、Negativicutes綱和放線菌綱相對(duì)豐度較高。梭桿菌綱在4組樣品中的相對(duì)豐度均最高。在屬水平上,擬桿菌屬、糞桿菌屬、大腸埃希菌-志賀氏菌、乳桿菌屬、普雷沃氏菌屬9和罕見(jiàn)小球菌屬是患者的主要優(yōu)勢(shì)菌屬。
2.3 多樣性分析Alpha多樣性指數(shù)用于反映微生物群落的豐度、均勻性及多樣性。Observed species指數(shù)、Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)和Simpson指數(shù)常用來(lái)估算物種總數(shù)和多樣性,值越高代表物種越多、多樣性越豐富。Shannon指數(shù)用于評(píng)價(jià)樣本中物種構(gòu)成的豐度和均勻性,值越大表示該環(huán)境的物種越豐富,各物種分配越均勻。結(jié)果顯示,4組患者糞便菌群中的Observed species指數(shù)、Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)和Simpson指數(shù)差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。Shannon指數(shù)患者控制期有家族史組(1-2組)顯著低于發(fā)作期有家族史組(1-1組),控制期無(wú)家族史組(2-2組)顯著高于發(fā)作期無(wú)家族史組(2-1組),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);控制期有家族史組(1-2組)與控制期無(wú)家族史組(2-2組)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);發(fā)作期有家族史組(1-1組)顯著高于發(fā)作期無(wú)家族史組(2-1組),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)表1。
表1 精神分裂癥患者糞便菌群Alpha多樣性指數(shù)
2.4 差異物種分析隨機(jī)森林分析可用來(lái)尋找重要的生物標(biāo)記物,結(jié)果發(fā)現(xiàn),患者控制期與發(fā)作期相比,優(yōu)勢(shì)物種是放線菌門(mén)的丙酸桿菌目、類(lèi)諾卡氏菌科、阿托波菌屬、鏈霉菌屬和類(lèi)諾卡氏菌屬,厚壁菌門(mén)的明串珠菌科、魏斯氏菌屬和糞球菌屬2;患者發(fā)作期優(yōu)勢(shì)物種是厚壁菌門(mén)毛螺菌科的CAG-56屬?;颊哂屑易迨方M的優(yōu)勢(shì)物種是擬桿菌門(mén)的F082菌科、擬普雷沃氏菌屬和厚壁菌門(mén)的糞球菌屬2;無(wú)家族史組的優(yōu)勢(shì)物種是變形菌門(mén)的琥珀酸弧菌科。提示4組腸道菌群結(jié)構(gòu)和多樣性存在差異,控制期組和有家族史組腸道菌群多樣性更加豐富,腸道菌群結(jié)構(gòu)更加穩(wěn)定。見(jiàn)圖2。
圖2 隨機(jī)森林分析
近年來(lái),隨著分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,基于16SrRNA基因研究的高通量測(cè)序技術(shù)在微生物生態(tài)學(xué)中得到廣泛應(yīng)用。16SrRNA是構(gòu)成原核生物核糖體小亞基組分,其基因序列中有10個(gè)保守區(qū)域和9個(gè)高變區(qū)域。物種間保守區(qū)域差異較小,高變區(qū)域因物種親緣關(guān)系的不同具有一定的種屬特異性,因而,選用16SrDNA發(fā)現(xiàn)不同物種的特征核酸序列,被廣泛應(yīng)用于微生物結(jié)構(gòu)和多樣性的研究。人們對(duì)腸道菌群的關(guān)注也逐漸走向腸道微生物群整體多樣性、復(fù)雜性以及動(dòng)態(tài)性的研究,進(jìn)一步探討腸道菌群變化與人類(lèi)健康和疾病的相關(guān)性,如腸易激綜合征、肥胖、高血壓、阿爾茨海默病、抑郁癥等〔4-7〕。由4組患者顯著差異物種分布結(jié)果可知,精神分裂癥患者的腸道微生物結(jié)構(gòu)和多樣性存在差異,患者病情控制對(duì)腸道菌群結(jié)構(gòu)分布有影響,控制期組較發(fā)作期組顯著差異物種更加復(fù)雜豐富,有益菌群結(jié)構(gòu)和多樣性增加,提示精神分裂癥患者其病情控制與腸道菌群結(jié)構(gòu)可能存在關(guān)聯(lián)。精神分裂癥患者發(fā)作期較控制期腸道菌群結(jié)構(gòu)和數(shù)量發(fā)生改變,控制期腸道菌群結(jié)構(gòu)得到改善,腸道有益菌群多樣性增加。精神疾病家族史可能對(duì)精神分裂癥患者腸道菌群結(jié)構(gòu)分布有影響,有家族史組比無(wú)家族史組顯著差異物種更加復(fù)雜豐富,腸道菌群結(jié)構(gòu)和多樣性增加,并且發(fā)作期有家族史組比無(wú)家族史組顯著差異物種更豐富,有益菌群增加,控制期有家族史組比無(wú)家族史組顯著差異物種豐富,但有益菌群不顯著。提示精神分裂癥患者無(wú)家族史組比有家族史組腸道菌群結(jié)構(gòu)和數(shù)量可能更易改變,并且精神疾病家族史可能對(duì)精神分裂癥患者發(fā)作期腸道菌群影響較大,而對(duì)精神分裂癥患者控制期腸道菌群影響不大。有遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),有家族史的精神分裂癥患者神經(jīng)系統(tǒng)軟體征更顯著,神經(jīng)系統(tǒng)的成熟和協(xié)調(diào)性受到明顯的影響,學(xué)習(xí)、領(lǐng)悟以及語(yǔ)言表達(dá)出現(xiàn)障礙,記憶能力發(fā)生損害〔8-9〕。說(shuō)明有家族史的精神分裂癥患者神經(jīng)心理功能損害更為嚴(yán)重,影響中樞神經(jīng)系統(tǒng)。大腦通過(guò)神經(jīng)-免疫-內(nèi)分泌系統(tǒng)調(diào)控胃腸功能,影響腸道菌群的結(jié)構(gòu),導(dǎo)致腸道菌群發(fā)生變化〔10-11〕。提示精神分裂癥患者無(wú)家族史組可能易受外因影響,其疾病發(fā)作期時(shí)腸道菌群數(shù)量、結(jié)構(gòu)和多樣性發(fā)生改變。而精神分裂癥患者有家族史組腸道菌群結(jié)構(gòu)可能本身就存在特征分布,不易受外因影響,其疾病發(fā)作期時(shí)有家族史組較無(wú)家族史組腸道菌群結(jié)構(gòu)不易改變。控制期病情癥狀得到改善,腸道菌群結(jié)構(gòu)逐漸得以改善,腸道菌群多樣性增加,此時(shí),精神疾病家族史對(duì)精神分裂癥影響較小。目前,關(guān)于精神疾病家族史對(duì)精神分裂癥患者腸道菌群影響的研究還比較缺乏,其對(duì)腸道菌群的具體影響作用還有待進(jìn)一步研究。
本次研究發(fā)現(xiàn),腸道菌群中有很多菌群參與機(jī)體代謝產(chǎn)生短鏈脂肪酸(SCFA),如患者控制期組的乳酸桿菌屬、瘤胃梭菌屬9、毛螺菌屬、罕見(jiàn)小球菌屬和患者有家族史組的普雷沃氏菌屬2、瘤胃梭菌屬等顯著高于患者發(fā)作期組和無(wú)家族史組,它們可以促進(jìn)腸道內(nèi)短鏈脂肪酸的產(chǎn)生,保護(hù)腸道健康、加強(qiáng)胃腸道機(jī)能活動(dòng),降低代謝障礙和炎癥反應(yīng)等的發(fā)生〔12-13〕,從而緩解精神分裂癥癥狀。
由于本研究的樣本量相對(duì)少、縱向采樣時(shí)間短,可能影響測(cè)序結(jié)果的穩(wěn)定性;雖然患者發(fā)病期和控制期來(lái)自同一研究對(duì)象,采用自身對(duì)照,但是組間存在個(gè)體差異,可能影響結(jié)果;研究對(duì)象來(lái)自同一醫(yī)院,短期內(nèi)飲食相似,采用聯(lián)合用藥,但未排除發(fā)病前期飲食、個(gè)人飲食習(xí)慣和具體用藥情況的差異。這提示在下一步的研究中應(yīng)增加樣本量,延長(zhǎng)縱向隊(duì)列觀察時(shí)間,同時(shí)控制飲食、藥物等因素對(duì)腸道菌群的影響,得出信度更高、更加全面的精神分裂癥患者腸道菌群的變化圖譜。另外,為了更好地確定精神分裂癥患者腸道菌群的變化特征,應(yīng)增加健康正常人組(無(wú)精神疾病家族遺傳史組和有精神疾病家族遺傳史組)樣本的采集,進(jìn)一步明確精神疾病家族史對(duì)腸道菌群的影響,為下一步人們根據(jù)菌群變化特征防治疾病,發(fā)展新的疾病防治思路提供可能。