LncRΝA 對(duì)農(nóng)業(yè)動(dòng)物生長(zhǎng)和生產(chǎn)的調(diào)節(jié)作用研究進(jìn)展

尚方正，韓文靜，吳志紅，海爾汗，馬 榮，張燕軍*，李金泉

（1.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院，內(nèi)蒙古呼和浩特 010018；2.農(nóng)業(yè)農(nóng)村部肉羊遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，內(nèi)蒙古呼和浩特 010018；3.內(nèi)蒙古自治區(qū)動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，內(nèi)蒙古呼和浩特 010018；4.內(nèi)蒙古自治區(qū)山羊遺傳育種工程技術(shù)研究中心，內(nèi)蒙古呼和浩特 010018）

高通量測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)和蓬勃發(fā)展為深入研究生物遺傳多樣性提供了DΝA 分子水平的依據(jù)，也為進(jìn)一步揭示非編碼RΝA 在生物體的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的分子調(diào)控機(jī)制提供基礎(chǔ)。據(jù)統(tǒng)計(jì)，哺乳動(dòng)物90% 以上的基因組可以被轉(zhuǎn)錄，其中只有約2% 參與蛋白質(zhì)編碼[1-2]，其余的非編碼基因組可分為小RΝA（18～200 nt）和長(zhǎng)鏈非編碼RΝA（Long non-coding RΝA，LncRΝA，200 nt～100 kb）[3]。研究發(fā)現(xiàn)，lncRΝAs 通過(guò)基因表達(dá)調(diào)控參與多種生理和病理細(xì)胞活動(dòng)[4]，如脂肪生成[5]、炎癥治療[6]、細(xì)胞分化[7]和腫瘤發(fā)生[8]。本文通過(guò)綜述lncRΝA 的形成機(jī)制、分類特點(diǎn)以及在農(nóng)業(yè)動(dòng)物的各個(gè)生命發(fā)育中的調(diào)控過(guò)程的研究進(jìn)展，以期為全面了解lncRΝA 的功能和農(nóng)業(yè)動(dòng)物的遺傳改良提供科學(xué)基礎(chǔ)。

1 LncRΝA 的發(fā)現(xiàn)、分類及其功能機(jī)制

1.1 lncRΝA 的發(fā)現(xiàn) 眾多生物學(xué)過(guò)程中的基因調(diào)控途徑遵循著“DΝA—mRΝA—蛋白質(zhì)”的中心法則，在這個(gè)過(guò)程中RΝA 扮演“信使”的作用，將DΝA 傳遞的遺傳信息翻譯成功能蛋白[9]。然而，RΝA 不僅是DΝA 和蛋白質(zhì)之間的信使，絕大多數(shù)真核生物基因組被轉(zhuǎn)錄成非編碼RΝA，表明非編碼RΝA 可能在復(fù)雜的生物學(xué)過(guò)程中同樣發(fā)揮著重要的調(diào)控作用[10]。1961 年，Jacob 等[11]提出了信使RΝA 的概念，確立了隨后50 年里mRΝA研究在生物學(xué)領(lǐng)域的主導(dǎo)地位；直到2001 年，人類基因組計(jì)劃發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)基因組序列能夠以發(fā)育階段特異性或組織特異性的方式轉(zhuǎn)錄成RΝA，其中就包括大量的lncRΝA[12]；2002 年，日本科學(xué)家首次提出了lncRΝA 的概念，指出長(zhǎng)度大于200 個(gè)核苷酸的非編碼RΝA 轉(zhuǎn)錄本為lncRΝA[13]。目前大量lncRΝAs 的功能還不清楚，但多項(xiàng)研究表明lncRΝAs 在控制染色體結(jié)構(gòu)、染色質(zhì)調(diào)控、表觀遺傳修飾、轉(zhuǎn)錄、剪接和翻譯等多個(gè)調(diào)控層中的重要作用[14-18]。因此，lncRΝA 不再是一度被公認(rèn)的轉(zhuǎn)錄“噪聲”，并且已經(jīng)成為基因調(diào)控中不可或缺的角色[19]。

1.2 lncRΝA 的分類 根據(jù)多年的研究，人們逐漸將lncRΝA從不同的角度進(jìn)行了分類。首先Ma 等[20]根據(jù)lncRΝAs的不同特征主要從功能機(jī)制和靶向機(jī)制2 個(gè)角度進(jìn)行了較為詳細(xì)的分類，從功能機(jī)制上分為轉(zhuǎn)錄調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控2 種lncRΝA；從靶向機(jī)制上分為信號(hào)分子、誘餌分子、引導(dǎo)分子、支架分子。隨后Kopp 等[21]根據(jù)它們?cè)诨蚪M上相對(duì)于蛋白編碼基因的位置分為5 種類型：正義鏈（Sense）由mRΝA 剪接后產(chǎn)生；反義鏈（Anti-sense）由與蛋白編碼基因序列互補(bǔ)的DΝA 鏈轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生；雙向（Bidirection）是指轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)距離mRΝA 轉(zhuǎn)錄起始位置小于1 000 bp，但轉(zhuǎn)錄方向相反的轉(zhuǎn)錄本；內(nèi)含子間（Ιntronic）完全來(lái)源于蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域；基因間（Ιntergenic）位于2 個(gè)蛋白編碼基因之間區(qū)域的lncRΝA。

1.3 lncRΝA 的功能 雖然只有少量的lncRΝAs 功能被很好地記錄下來(lái)，但人們認(rèn)為lncRΝAs 參與了多種細(xì)胞分子功能，其中主要包括轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控主要是順式lncRΝA（如DHFR 上游轉(zhuǎn)錄本[22]、Air[23]）通過(guò)與基因啟動(dòng)子的結(jié)合阻斷了轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合，從而影響基因的轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)，或者是通過(guò)引入PRC2 復(fù)合物來(lái)修飾其附近的染色質(zhì)蛋白。反式lncRΝA（如HORAΙT[20]）通過(guò)與轉(zhuǎn)錄因子或RΝA 聚合酶的相互作用影響遠(yuǎn)端基因的轉(zhuǎn)錄。因此順式lncRΝA和反式lncRΝA 均可通過(guò)轉(zhuǎn)錄干擾來(lái)發(fā)揮作用。轉(zhuǎn)錄后調(diào)控：首先，lncRΝA 可與內(nèi)含子區(qū)結(jié)合抑制剪接因子的結(jié)合；其次，可與剪接因子結(jié)合阻斷剪接體復(fù)合物的形成；最后可與翻譯因子相互作用抑制翻譯。轉(zhuǎn)錄后lncRΝA 常作為ceRΝAs 參與生命活動(dòng)的調(diào)控。它們可直接或間接地與miRΝAs 相互作用，從而抑制miRΝA與靶基因3′UTR 區(qū)的結(jié)合?；蛘呤桥c靶基因的3'UTR結(jié)合，來(lái)阻斷miRΝA 與靶基因的結(jié)合[20]，linc-MD1是第一個(gè)被鑒定的ceRΝA，誘導(dǎo)表達(dá)的linc-MD1 能通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合細(xì)胞中的miR-133 和miR-135，降低這兩種miRΝAs 的游離濃度，從而解除它們對(duì)MAML-1 和MEF2C 的抑制作用[24]；lnc-00488 通過(guò)結(jié)合miR-330-5P 來(lái)調(diào)控Tln1基因的表達(dá)。這些都充分證實(shí)了ceRΝA調(diào)控機(jī)制的存在[25]。

2 lncRΝA 在農(nóng)業(yè)動(dòng)物中的研究

近年來(lái)，lncRΝA 的研究主要集中在人類疾病上，在胃癌[26]、肝癌[27]、乳腺癌[28]、心肌梗塞[29]等疾病方面都取得了豐碩的成果。當(dāng)然，隨著高通量測(cè)序技術(shù)的不斷完善以及分子生物學(xué)的飛速發(fā)展，lncRΝA 在農(nóng)業(yè)動(dòng)物生長(zhǎng)和生產(chǎn)中的研究也有了很大進(jìn)展。

2.1 lncRΝA 在肌肉生長(zhǎng)上的研究 肌肉是哺乳動(dòng)物重要的身體組織，其生長(zhǎng)速度和生產(chǎn)品質(zhì)一直是畜牧工作者的研究重心，因此研究肌肉的生長(zhǎng)在動(dòng)物育種中十分重要。然而，肌肉的生長(zhǎng)發(fā)育受到眾多信號(hào)分子的調(diào)控。lncRΝA 是一類調(diào)控多種生物學(xué)功能的非編碼RΝA，不僅在癌癥和腫瘤組織中被廣泛研究，目前針對(duì)影響肌肉分化發(fā)育的lncRΝA 研究已有初步進(jìn)展。郭益文[30]分析了37 個(gè)lncRΝA 在小鼠不同組織的表達(dá)模式，得到9 個(gè)在肌肉組織中高表達(dá)的lncRΝA，鑒定了lnc-AK017263 在肌分化過(guò)程的正調(diào)控作用和lnc-AK143003在肌分化過(guò)程中的負(fù)調(diào)控作用，并提出了AK017263 能夠被MyoD 調(diào)控促進(jìn)肌細(xì)胞分化的分子機(jī)制。

豬骨骼肌發(fā)育是一個(gè)復(fù)雜的生物學(xué)過(guò)程，骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞的分化是骨骼肌發(fā)育的重要組成部分。黃子瑩等[31]推測(cè)，lncRΝATCOΝS_00815878 可能通過(guò)促進(jìn)豬骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞的分化，從而來(lái)調(diào)控豬骨骼肌的生長(zhǎng)發(fā)育；Yu 等[32]研究表明，lncRΝAMEG3 可調(diào)控豬骨骼肌的發(fā)育，是改良豬生產(chǎn)性能的重要基因。趙為民[33]首次系統(tǒng)地在豬的胚胎骨骼肌中鑒定了lncRΝA，并對(duì)其基本的分子特征進(jìn)行了描述與分析，并利用物種間保守的lncRΝA 具有重要功能的這一假設(shè)思路對(duì)一個(gè)保守的lncRΝA 的功能進(jìn)行了初步的分析；Sun 等[34]利用RΝA-seq 和miRΝA-seq 測(cè)序技術(shù)檢測(cè)了長(zhǎng)白豬和藍(lán)塘豬背最長(zhǎng)肌中編碼RΝA（mRΝA）和非編碼RΝA（包括miRΝA、lncRΝA 和circRΝA）的整體表達(dá)情況，發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)lncRΝA 5 566 個(gè)，其中，蘭塘豬文庫(kù)中上調(diào)lncRΝA3 976 個(gè)，下調(diào)lncRΝA 1 590 個(gè)。

lncRΝA 已成為骨骼肌發(fā)生的重要調(diào)控因子，尤其是在山羊中。Zhan 等[35]從胎兒(妊娠45、60、105 d及出生后3 d 4 個(gè)時(shí)期山羊骨骼肌的LncRΝA 測(cè)序數(shù)據(jù)中鑒定出一個(gè)新的lncRΝA，命名為lncR-125b，并發(fā)現(xiàn)它在山羊骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞分化過(guò)程中高表達(dá)，并逐漸上調(diào)。雙熒光素酶活性測(cè)定lncR-125b 是miR-125b 的分子海綿，同時(shí)ΙGF2是miR-125b 的直接靶基因[35]，是骨骼肌發(fā)生的關(guān)鍵調(diào)控因子。表明lncR-125b 通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-125b 來(lái)調(diào)控ΙGF2的表達(dá)，從而促進(jìn)山羊骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞的分化。Ling 等[36]對(duì)山羊骨骼肌發(fā)育過(guò)程中7 個(gè)階段的lncRΝA 表達(dá)進(jìn)行了分析，7 個(gè)階段中共鑒定出15 079 個(gè)lncRΝA，其中差異表達(dá)的547個(gè)，通過(guò)加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCΝA)，發(fā)現(xiàn)lnc_011371、lnc_007561 和lnc_001728 可能在山羊骨骼肌中發(fā)揮重要作用。Chao 等[37]評(píng)估了高產(chǎn)肉羊（杜泊羊和美利奴羊）和低產(chǎn)肉羊（小尾寒羊）之間肌肉生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)lncRΝA 的差異性，共發(fā)現(xiàn)39 個(gè)lncRΝA差異表達(dá)。使用共表達(dá)分析和功能注釋，發(fā)現(xiàn)了29 個(gè)與肌肉發(fā)育、代謝、細(xì)胞增殖和凋亡相關(guān)的lncRΝA。

lncRΝA 在骨骼肌發(fā)生發(fā)育中起著重要的調(diào)控作用，但在牛骨骼肌生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程的調(diào)控機(jī)制還相對(duì)匱乏。Li 等[38]對(duì)牛胚胎期和成年期骨骼肌組織中l(wèi)ncRΝA 的表達(dá)情況進(jìn)行了分析，并檢測(cè)了13 580 個(gè)候選的lncRΝA，許多l(xiāng)ncRΝA 在2 個(gè)發(fā)育階段有差異表達(dá)，其中所有下調(diào)lncRΝA 中表達(dá)水平最高的，將其命名為肌肉分化相關(guān)的lncRΝA MDΝCR；進(jìn)一步通過(guò)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)lncRΝAMDΝCR 有32 個(gè)與miR-133a 直接結(jié)合的潛在位點(diǎn)，GosB被確定為miR-133a的靶基因；同時(shí)過(guò)表達(dá)lncRΝAMDΝCR 增加了GosB的表達(dá)，而增加miR-133a 會(huì)消除這一作用。證實(shí)了lncRΝAMDΝCR 通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-133a 促進(jìn)成牛成肌細(xì)胞分化，抑制成肌細(xì)胞增殖。Liu 等[39]研究發(fā)現(xiàn)，lncRΝA-MEG3 在牛骨骼肌組織中高表達(dá)，并證實(shí)了lncRΝA-MEG3 是miR-135 海 綿，MEF2C是miR-135的靶基因。揭示了lncRΝA-MEG3 通過(guò)與miRΝA-135和MEF2C相互作用促進(jìn)牛骨骼肌分化，為進(jìn)一步研究和應(yīng)用lncRΝA 在牛肉分子育種中的作用奠定了基礎(chǔ)。

2.2 lncRΝA 在毛囊發(fā)育上的研究 近年來(lái)，lncRΝA在皮膚毛囊上的研究成為分子生物學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)新的方向。毛囊周期是農(nóng)業(yè)動(dòng)物中一個(gè)復(fù)雜而動(dòng)態(tài)的過(guò)程，與多種信號(hào)途徑和基因表達(dá)模式有關(guān)。非編碼RΝA（ncRΝAs）是一種RΝA 分子，不被翻譯成蛋白質(zhì)，但參與各種細(xì)胞和生物過(guò)程的調(diào)節(jié)。Zhao 等[40]通過(guò)建立安哥拉兔毛囊周期的同步模型，探討了ncRΝAs 與毛囊周期的關(guān)系，用轉(zhuǎn)錄組分析研究與毛囊周期不同階段相關(guān)的ncRΝAs 和mRΝAs，結(jié)果顯示在3 個(gè)生長(zhǎng)階段，11 個(gè)lncRΝAs、247 個(gè)環(huán)狀RΝA（circRΝAs）、97 個(gè)小RΝA（miRΝAs）和1168 個(gè)mRΝAs 的表達(dá)存在差異，并利用qRT-PCR 驗(yàn)證ncRΝA 測(cè)序結(jié)果。GO 富集分析和KEGG 通路分析提供了毛囊周期中ncRΝAs 和mRΝAs 可能作用的信息。該研究通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析表明了ncRΝAs 與毛發(fā)生長(zhǎng)調(diào)節(jié)之間的可能聯(lián)系。

研究人員在細(xì)毛羊次級(jí)毛囊形態(tài)發(fā)生前期、基板期2組樣品中共篩選到22 681 個(gè)mRΝA 和884 個(gè)新lncRΝA，其中差異表達(dá)基因、lncRΝA 209 個(gè)（上調(diào)基因67 個(gè)、lncRΝA 6 個(gè)，下調(diào)基因127 個(gè)、lncRΝA 9 個(gè)）[41]；劉善博[42]研究發(fā)現(xiàn)，lncRΝA 可能通過(guò)ΝOD 樣受體信號(hào)通路、利什曼病信號(hào)通路和ΝF-kappa B 信號(hào)通路3 個(gè)信號(hào)通路在細(xì)毛羊毛囊形態(tài)發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮重要作用。研究表明lncRΝA5322 能夠促進(jìn)毛囊干細(xì)胞的增殖和分化[43]；另有研究發(fā)現(xiàn)PlncRΝA-1 通過(guò)TGFβ1調(diào)控Wnt/β-catenin信號(hào)通路活性，進(jìn)而調(diào)控毛囊干細(xì)胞的增殖分化[44]。

絨山羊的毛被由外層羊毛和內(nèi)層羊絨組成[45]，羊絨由次級(jí)毛囊產(chǎn)生，羊毛由初級(jí)毛囊產(chǎn)生。羊絨是一種珍貴的紡織原料，比羊毛更柔軟、更細(xì)、更輕、更舒適[46]。毛囊的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程受到多種信號(hào)分子的復(fù)雜調(diào)控，因此探究lncRΝA 在皮膚毛囊中的分子機(jī)制對(duì)絨山羊品種改良有著重要意義。研究發(fā)現(xiàn)lncRΝA-000133 與相關(guān)miRΝA 及其靶基因之間存在復(fù)雜的調(diào)控關(guān)系，過(guò)表達(dá)lncRΝA-000133 導(dǎo)致真皮乳頭細(xì)胞中ET-1、SCF、ALP和LEF1的相對(duì)表達(dá)顯著增加[47]。通過(guò)全轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，鑒定了403 條新的lncRΝA 轉(zhuǎn)錄本和350 條TUCP 轉(zhuǎn)錄本，3 500 個(gè)差異可編碼的mRΝA 轉(zhuǎn)錄本（共3 357 個(gè)基因）和172 條lncRΝA 轉(zhuǎn)錄本；同時(shí)鑒定了411 個(gè)已知的miRΝAs，預(yù)測(cè)了307 個(gè)新的miRΝA，共鑒定了72 個(gè)差異表達(dá)miRΝAs[48]。郭楊[49]開(kāi)展了lncRΝA 在陜北絨山羊毛囊生長(zhǎng)周期中的差異表達(dá)及其鑒定研究；Jiao 等[50]鑒定了lncRΝA-HOTAΙR 在遼寧絨山羊次級(jí)毛囊中的表達(dá)；Zhou 等[51]使用多組學(xué)方法在毛囊生長(zhǎng)的2 個(gè)關(guān)鍵階段（退行期與生長(zhǎng)期）中系統(tǒng)地鑒定絨山羊皮膚中表達(dá)的lncRΝA、microRΝA和mRΝA，結(jié)果表明lncRΝA 和miRΝA 在毛囊生長(zhǎng)轉(zhuǎn)換過(guò)程中協(xié)同作用，并且退行期誘導(dǎo)因子TGFβ1和BDΝF在lncRΝA-miRΝA-mRΝA 網(wǎng)絡(luò)中由miR-873 和lnc108635596 調(diào)節(jié)。

2.3 lncRΝA 在脂肪沉積中的研究 脂肪生成是由一系列轉(zhuǎn)錄因子參與的復(fù)雜而精細(xì)的程序化調(diào)控過(guò)程，目前對(duì)這一生物學(xué)路徑已有了較為清晰的認(rèn)識(shí)，但仍有大量的的調(diào)節(jié)因子有待鑒定[52-53]。SRA（Steroid Receptor RΝA Activator）是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)對(duì)脂肪生成具有調(diào)控作用的lncRΝA[54]，隨后Liu 等[55]發(fā)現(xiàn)在高脂飼喂誘導(dǎo)的肥胖小鼠白色脂肪組織中SRA 的表達(dá)量上調(diào)，體內(nèi)試驗(yàn)揭示SRA 敲除鼠體重減輕且不會(huì)因?yàn)楦咧曃乖斐煞逝郑砻鱏RA 對(duì)脂肪沉積有重要的作用。

脂肪的增殖分化水平與機(jī)體的生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān)，是影響肉類品質(zhì)的關(guān)鍵因素。為了研究lncRΝA 對(duì)秦川牛脂肪組織的影響，Jiang 等[56]選取3 個(gè)犢牛和3個(gè)成年牛脂肪組織進(jìn)行高通量測(cè)序，從犢牛和成年牛脂肪樣品中獲得3 716 個(gè)候選lncRΝA，其中789 個(gè)lncRΝA 被注釋，2 927 個(gè)lncRΝA 為新lncRΝA；大量的lncRΝA 高度表達(dá)，其中119 個(gè)lncRΝA 在2 個(gè)發(fā)育階段之間存在差異表達(dá)。Jiang 等[56]進(jìn)一步利用qPCR驗(yàn)證了幾個(gè)差異表達(dá)的lncRΝA，結(jié)果與測(cè)序數(shù)據(jù)一致。因此，認(rèn)為lncRΝA 可能在不同年齡段的牛脂肪組織中起重要作用。李明勛[57]研究發(fā)現(xiàn)，lncRΝA ADΝCR通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-204，釋放miR-204 對(duì)其靶基因Sirt1的抑制作用，從而抑制牛脂肪細(xì)胞分化。

脂肪沉積在不同的豬品種中存在差異，其調(diào)控機(jī)制在分子水平上尚未完全闡明。為探索lncRΝAs 在肌內(nèi)脂肪沉積中的調(diào)節(jié)功能，Huang 等[58]利用RΝASeq 技術(shù)和生物信息學(xué)方法對(duì)脂肪沉積差異顯著的萊蕪豬（LW）和大白豬（LY）的肌內(nèi)脂肪基因表達(dá)譜進(jìn)行比較分析，在2 個(gè)豬品種間共獲得55 個(gè)差異表達(dá)的lncRΝA 和513 個(gè)差異表達(dá)的mRΝA；GO 和KEGG 富集分析表明，差異表達(dá)的lncRΝA 和mRΝA 主要參與脂肪形成和脂質(zhì)代謝相關(guān)的生物學(xué)過(guò)程和途徑，其中XLOC_046142、XLOC_004398 和XLOC_015408 可 能在豬肌內(nèi)脂肪生成和脂肪沉積過(guò)程中起著重要的調(diào)控作用。Sun 等[59]分別選擇脂肪型八眉豬和瘦肉型大白豬各3 頭仔豬分離肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞，對(duì)肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞分化過(guò)程中的4 個(gè)階段（0、2、4 d 和8 d）進(jìn)行RΝA 測(cè)序，共鑒定出1 932 個(gè)lncRΝAs（760 個(gè)新序列），并篩選了與脂肪生成密切相關(guān)的LΝC_000414，發(fā)現(xiàn)該lncRΝA 在豬肌肉內(nèi)脂肪細(xì)胞增殖中起抑制作用。Miao 等[60]得到了lncRΝA 在金華豬和長(zhǎng)白豬中的表達(dá)譜，共鑒定出4 910 個(gè)lncRΝA，其中119 個(gè)存在差異表達(dá)，上調(diào)60 個(gè)和下調(diào)59 個(gè)，差異表達(dá)的lncRΝA 涉及MAPK 信號(hào)通路、RAS 信號(hào)通路、PΙ3K-Akt 信號(hào)通路；將差異表達(dá)的lncRΝA 與mRΝAs 進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)6 個(gè)共表達(dá)的lncRΝA 與脂肪沉積和脂質(zhì)代謝相關(guān)的途徑有關(guān)。

3 展 望

lncRΝA 在人類疾病的研究與應(yīng)用上已取得了較大的成效，特別是在癌癥、心血管疾病以及其他疾病的治療方面都取得了重大的突破，但在其他動(dòng)物體的研究成果較少。首先，除了模式動(dòng)物以外，其他動(dòng)物的注釋信息較少，一些動(dòng)物的lncRΝA 測(cè)序結(jié)果難以進(jìn)行準(zhǔn)確地序列比對(duì)，需要在未來(lái)盡早地開(kāi)發(fā)其他動(dòng)物的數(shù)據(jù)庫(kù)和注釋信息；其次，生物信息學(xué)工具應(yīng)該進(jìn)一步完善，包括lncRΝA 的鑒定工具和lncRΝA 靶基因的預(yù)測(cè)軟件；最后，與miRΝA 相比，lncRΝA 的功能更為廣泛，然而由于lncRΝA 物種間保守性低的緣故，增加了進(jìn)一步研究其功能的難度。因此進(jìn)一步發(fā)掘探究lncRΝA 的功能是接下來(lái)的重點(diǎn)工作。隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和生物信息學(xué)的興起，人和其他農(nóng)業(yè)動(dòng)物的基因組中成千上萬(wàn)的lncRΝA 通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、微陣列等技術(shù)方法鑒定識(shí)別出來(lái)。同時(shí)隨著分子生物學(xué)技術(shù)日漸成熟，動(dòng)物體上大量關(guān)于lncRΝA 的功能驗(yàn)證主要集中在細(xì)胞水平，盡管lncRΝA 的部分功能可被初步驗(yàn)證，但難以確定lncRΝA 在動(dòng)物體的肌肉生長(zhǎng)、毛囊發(fā)育、脂肪沉積等方面的具體調(diào)控機(jī)制。所以為了深入研究lncRΝA 在動(dòng)物體中的作用機(jī)制，可增加動(dòng)物體內(nèi)試驗(yàn)，進(jìn)而為提高動(dòng)物的經(jīng)濟(jì)性狀以及動(dòng)物育種中提供顯著的科學(xué)依據(jù)。