欽州市36656份上呼吸道標(biāo)本新型冠狀病毒核酸檢測結(jié)果分析

卓訓(xùn)妮

摘要：目的：了解欽州市新型冠狀病毒肺炎感染情況，為疫情防控工作提供依據(jù)。方法：采用實時熒光RT-PCR法對欽州市2020年各縣（區(qū)）和海關(guān)送檢的標(biāo)本進(jìn)行新型冠狀病毒核酸檢測，收集陽性病例流行病學(xué)調(diào)查資料，統(tǒng)計分析檢測結(jié)果。結(jié)果：在36656份上呼吸道標(biāo)本中，共檢出新型冠狀病毒核酸陽性10例，其中8例為無國外旅行史人員，檢出率為0.02%（8/36273），2例為輸入性外籍船員，檢出率為0.52%（2/383），兩類人群檢出率比較有統(tǒng)計學(xué)意義（P<0.01，X2=34.760）。10例陽性病例中，男性7例，女性3例，男女比為2.33∶1;最小年齡12歲，最大年齡50歲;輕型2例，普通型4例，無癥狀感染者4例，無死亡病例。本地8例病例中，6例為家庭聚集性病例。結(jié)論：入境船員是高危人群，應(yīng)密切聯(lián)系港口相關(guān)部門，加強監(jiān)測，及時發(fā)現(xiàn)和隔離陽性病例，加強疫情防控知識宣傳，開展群防群控，防止疫情爆發(fā)流行。

關(guān)鍵詞：新型冠狀病毒;核酸;實時熒光定量PCR;檢測;分析

Abstract： Objective： to understand the infection situation of COVID-19 in Qinzhou and to provide basis for epidemic prevention and control. Methods： real time fluorescence RT-PCR was used to detect COVID-19 nucleic acids in samples collected from counties （districts） and customs in Qinzhou in 2020， and the epidemiological data of positive cases were collected， and the results were analyzed statistically. Results： among the 36656 upper respiratory tract specimens， 10 cases were found positive for COVID-19 nucleic acid， 8 of them were non foreign travel history personnel， the detection rate was 0.02% （8/36273）， 2 cases were imported foreign sailors， the detection rate was 0.52% （2/383）， and the detection rate of two groups was statistically significant （P< 0.01， x2=34.760）. Among the 10 positive cases， 7 were male and 3 were female， the ratio of male to female was 2.33∶1; The youngest was 12 years old and the oldest was 50 years old; There were 2 mild cases， 4 common cases， 4 asymptomatic cases and no death cases. Among the 8 local cases， 6 were family cluster cases. Conclusion： the entry crew is a high-risk group， we should closely contact the relevant departments of the port， strengthen monitoring， timely detect and isolate positive cases， strengthen the publicity of epidemic prevention and control knowledge， carry out group prevention and control， and prevent the outbreak of the epidemic.

Keywords： COVID-19; Nucleic acids; Real time fluorescence RT-PCR; Test; Analysis

一、前言

新型冠狀病毒肺炎（新冠肺炎，COVID-19）為新發(fā)急性呼吸道傳染病，由新型冠狀病毒（2019-nCoV）引起[1]，目前已肆虐全球。據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計數(shù)據(jù)，截至2021年4月8日，全球累計新冠肺炎確診病例1.324億例，累計死亡病例2875672例，新冠肺炎已嚴(yán)重危害人類的身心健康和社會的經(jīng)濟(jì)發(fā)展。本實驗室自疫情爆發(fā)以來，積極開展病原檢測工作，應(yīng)用實時熒光RT-PCR法對欽州市疑似新冠肺炎病例及其他排查者標(biāo)本進(jìn)行檢測，截止2020年12月31日，共完成36656份上呼吸道標(biāo)本新型冠狀病毒核酸檢測。本文對2020年本市各縣（區(qū)）及海關(guān)送檢標(biāo)本的核酸檢測結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計分析，了解欽州市新型冠狀病毒肺炎感染情況，為進(jìn)一步做好疫情防控提供依據(jù)。

二、材料與方法

（一）標(biāo)本來源及保存

所有標(biāo)本來自欽州市轄區(qū)內(nèi)各市縣（區(qū)）和海關(guān)，于2020年1月21日至2020年12月31日冷藏送至本中心實驗室的疑似新冠肺炎病例和其他排查者標(biāo)本，共36656份，其中36088份為咽拭子標(biāo)本，568份為鼻咽拭子標(biāo)本;無境外旅行史人員標(biāo)本36273份，入境船員標(biāo)本383份;在24 h內(nèi)檢測的標(biāo)本置于4℃保存，24 h內(nèi)無法檢測的標(biāo)本置于-70℃或以下保存。

（二）病毒RNA提取試劑

采用西安天隆科技有限公司生產(chǎn)的RNA提取試劑盒。

（三）病毒核酸檢測試劑

采用上海伯杰醫(yī)療科技有限公司2019新型冠狀病毒（ORFlab/N基因）核酸檢測試劑盒（雙重?zé)晒釶CR法）。

（四）檢測方法

依據(jù)國家衛(wèi)生健康委辦公廳發(fā)布的《新型冠狀病毒實驗室生物安全指南》（第二版）[2]和《新型冠狀病毒肺炎防控方案》[3]進(jìn)行生物安全防護(hù)和實驗操作，采用實時熒光RT-PCR法進(jìn)行檢測，嚴(yán)格按試劑說明書操作，結(jié)果判讀以試劑盒說明書為準(zhǔn)。

（五）主要儀器設(shè)備

1. ABI7500型熒光定量PCR儀。

2. NP968-C西安天隆核酸提取儀。

3. 恒溫水浴箱。

（六）質(zhì)量控制

每次實驗均設(shè)陽性對照、陰性對照和外部質(zhì)控，陰性對照Ct值>38或未檢出，陽性對照的擴(kuò)增曲線呈S型，且Ct值≤30，同一實驗必須滿足這兩個條件，否則實驗結(jié)果視為無效;樣本內(nèi)標(biāo)須正常檢出，有明顯的S線。所有陽性標(biāo)本均上送廣西壯族自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心復(fù)核確認(rèn)。

（七）結(jié)果判讀

嚴(yán)格按照《新型冠狀病毒肺炎防控方案》附件6新型冠狀病毒肺炎實驗室檢測技術(shù)指南[3]判定，實驗室確認(rèn)陽性病例需滿足以下兩個條件中的一個：第一，同一份標(biāo)本中新型冠狀病毒2個靶標(biāo)（ORFlab、N），實時熒光RT-PCR檢測結(jié)果均為陽性，如果出現(xiàn)單個靶標(biāo)陽性的檢測結(jié)果，則需要重新采樣，重新檢測。如果仍然為單靶標(biāo)陽性，判定為陽性。第二，兩種標(biāo)本實時熒光RT-PCR同時出現(xiàn)單靶標(biāo)陽性，或同種類型標(biāo)本兩次采樣檢測中均出現(xiàn)單個靶標(biāo)陽性的檢測結(jié)果，可判定為陽性。結(jié)合試劑盒說明書，由Ct值大小及擴(kuò)增曲線圖進(jìn)行判斷：Ct值>38或未檢出，判為陰性;當(dāng)擴(kuò)增曲線呈S型，且Ct值≤ 35，判為陽性;當(dāng)擴(kuò)增曲線呈S型，且35MNzfaiBvD1eJJTj4YC6T6Q56Q+DiXQRJykptb1vOknY=