常彥斌,游靈玲,張曉兵
重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院檢驗科,重慶 400016
銅綠假單胞菌(PA)是醫(yī)院內(nèi)感染和呼吸機(jī)相關(guān)性肺炎最常見的細(xì)菌[1-5]。PAⅢ型分泌系統(tǒng)(T3SS)的發(fā)現(xiàn)是細(xì)菌致病機(jī)制研究的突出進(jìn)展,其T3SS主要分泌4種毒力蛋白,即胞外酶(Exo)S、ExoT、ExoY、ExoU,細(xì)菌通過Ⅲ型分泌系統(tǒng)的導(dǎo)管裝置把T3SS毒力因子注入細(xì)胞,誘導(dǎo)細(xì)胞壞死、凋亡[6-10]。
據(jù)報道,群體感應(yīng)(QS)系統(tǒng)抑制劑能減弱PA的毒力[11],阿奇霉素能夠影響PA的QS系統(tǒng)信號分子[12-13]。本研究中,選擇對PA毒力機(jī)制更為關(guān)鍵的毒力基因exoS和exoU作為研究對象[14-15],通過PCR分析細(xì)菌T3SS毒力基因exoS和exoU的分布。用K-B紙片法研究細(xì)菌耐藥情況,選取exoS、exoU陽性株通過RT-PCR方法研究阿奇霉素對銅綠假單胞菌exoS、exoU mRNA表達(dá)的影響。
1.1菌株來源 從本實驗室自2010-2019年保存的臨床菌株庫中隨機(jī)選擇50株P(guān)A,其中38株來自痰液,6株來自尿液,5株來自分泌物,1株來自血液。使用VITEK-2 Compact全自動微生物鑒定系統(tǒng)鑒定所有菌株到種。
1.2抗菌藥物藥敏試驗 通過K-B法測定PA對10種抗菌藥物的耐藥率。藥敏紙片:頭孢他啶、頭孢吡肟、左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、阿米卡星、慶大霉素、哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、亞胺培南、美羅培南均為英國Oxoid公司產(chǎn)品。MH培養(yǎng)基由重慶龐通醫(yī)療器械有限公司提供。
1.3exoS、exoU基因檢測 以煮沸法制備細(xì)菌總DNA。用PCR方法檢測exoS、exoU基因。依據(jù)exoS(GenBank no.AE004091)和exoU(GenBank no.AAC16023)的完整基因序列,采用Primer 3 Plus在線軟件設(shè)計引物,引物由上海生工生物公司合成。引物序列見表1。各靶基因PCR擴(kuò)增體系:10 μmol/L上、下游引物各1.25 μL,10 mmol/L dNTPs 0.5 μL,5×PCR反應(yīng)緩沖液5 μL,DNA聚合酶 0.25 μL,總反應(yīng)體積25 μL(其中模板5 μL),其余用雙蒸水補(bǔ)足至25 μL。PCR檢測exoS熱循環(huán)參數(shù):93 ℃預(yù)變性5 min,然后93 ℃ 60 s,55 ℃ 60 s,72 ℃ 60 s,共35個循環(huán),最后72 ℃延伸5 min。PCR檢測exoU熱循環(huán)參數(shù):93 ℃預(yù)變性5 min,然后93 ℃ 45 s,57 ℃ 45 s,72 ℃ 60 s,共35個循環(huán),最后72 ℃延伸5 min。對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行2.00%瓊脂糖凝膠電泳,于紫外凝膠電泳成像儀下觀察,并記錄結(jié)果。
表1 PCR引物序列及預(yù)計產(chǎn)物長度
1.4阿奇霉素處理細(xì)菌 T3SS毒素誘導(dǎo)培養(yǎng)基[16]:胰蛋白胨(Tryptone) 10 g,酵母浸膏粉(Yeast extract) 5 g,氯化鈉(NaCl) 10 g,乙二醇二乙醚二胺四乙酸(EGTA)1.902 g溶于1 L蒸餾水,調(diào)節(jié)pH值至7.0,高壓(1.034×105Pa)滅菌20 min。隨機(jī)選擇exoS、exoU陽性菌株各1株,在LB培養(yǎng)基中37 ℃水浴震蕩培養(yǎng)過夜,次日取0.1 mL菌液加入含不同藥物濃度的誘導(dǎo)培養(yǎng)基5 mL中37 ℃水浴震蕩6~8 h,細(xì)菌生長OD600為0.6~1.0,取1.0 mL菌液加入1.5 mL無菌離心管,6 000 r/min離心5 min,收集細(xì)菌。
1.5RT-PCR檢測exoS、exoU mRNA相對表達(dá)水平 細(xì)菌總RNA的提取參照EZgeneTMbacterial RNA Kit(Biomiga公司)操作說明進(jìn)行。RT-PCR試劑盒mRNA selective PCR Kit(特異擴(kuò)增mRNA)購自TaKaRa公司。依據(jù)exoS(GenBank no.AE004091)和exoU(GenBank no.AAC16023)的編碼序列,用Primer 3 Plus在線軟件設(shè)計RT-PCR引物,引物由上海生工生物公司合成。引物序列見表2。
表2 RT-PCR引物序列及預(yù)計產(chǎn)物長度
對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行2.00%瓊脂糖凝膠電泳。將電泳凝膠置于凝膠圖像分析系統(tǒng),照相后,采用Gel-Pro(USA)凝膠圖像分析軟件分析處理。PCR產(chǎn)物量以積分光密度(IOD)表示擴(kuò)增產(chǎn)物量,計算各mRNA與16S rRNA的比值,即為該mRNA的相對表達(dá)水平。
1.6統(tǒng)計學(xué)處理 數(shù)據(jù)采用SPSS22.0統(tǒng)計軟件處理。計數(shù)資料采用χ2檢驗,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.150株P(guān)A臨床株exoS、exoU基因的攜帶情況 PCR檢測50株臨床分離PA exoS、exoU基因,結(jié)果exoS基因檢測在573 bp有條帶,部分菌株P(guān)CR產(chǎn)物的電泳結(jié)果見圖1,隨機(jī)選擇1株P(guān)CR陽性株進(jìn)行擴(kuò)增出的測序和比對結(jié)果見圖3;exoU基因檢測在428 bp有條帶,部分菌株P(guān)CR產(chǎn)物的電泳結(jié)果見圖2,隨機(jī)選擇1株P(guān)CR陽性株進(jìn)行擴(kuò)增出的測序和比對結(jié)果見圖4。50株P(guān)A兩種毒力基因的分布情況見表3。
表3 50株銅綠假單胞菌兩種毒力基因分布(株)
注:M為DNA Marker;1、3、5泳道為exoS基因陽性PA臨床株;2、4、6泳道為exoS基因陰性PA臨床株。
圖3 PA臨床株exoS PCR擴(kuò)增的基因測序和序列比對圖
圖4 PA臨床株exoU PCR擴(kuò)增的基因測序和序列比對圖
2.2exoS與exoU陽性PA臨床株對常用抗菌藥物耐藥情況 用K-B法分析exoS與exoU陽性PA對10種抗菌藥物耐藥情況,結(jié)果見表4。從結(jié)果可以看出exoU陽性PA對10種抗菌藥物的耐藥率均高于exoS陽性株,其中環(huán)丙沙星、左氧氟沙星的耐藥率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
表4 exoS與exoU陽性的兩組PA對常用抗菌藥物耐藥率[n(%)]
注:M為DNA Marker;1、2、3、5、6泳道為exoU基因陰性PA臨床株;泳道4為exoU基因陽性PA臨床株。
2.3不同濃度阿奇霉素對exoS mRNA相對表達(dá)水平的影響 用微量肉湯稀釋法測得exoS 基因陽性的PA阿奇霉素最低抑菌濃度(MIC)為64 μg/mL,用0 μg/mL、1 μg/mL、2 μg/mL、4 μg/mL、8 μg/mL、16 μg/mL的阿奇霉素作用于exoS基因陽性的PA臨床分離株。在實驗中未觀察到這些濃度的阿奇霉素對細(xì)菌生長的影響,通過RT-PCR檢測exoS mRNA的相對表達(dá)水平,結(jié)果顯示,exoS mRNA的相對表達(dá)水平在阿奇霉素4 μg/mL時最高,當(dāng)阿奇霉素濃度增加時,exoS mRNA逐漸下降至空白對照水平。見表5。
2.4不同濃度阿奇霉素對exoU mRNA相對表達(dá)水平的影響 用微量稀釋法測得exoU 基因陽性的PA阿奇霉素MIC為128 μg/mL,用0 μg/mL、1 μg/mL、2 μg/mL、4 μg/mL、8 μg/mL、16 μg/mL的阿奇霉素作用于exoU 基因陽性的PA臨床分離株。在實驗中未觀察到這些濃度的阿奇霉素對細(xì)菌生長的影響,通過RT-PCR檢測exoU基因mRNA相對表達(dá)水平,阿奇霉素作用exoU 基因陽性的PA后exoU mRNA表達(dá)持續(xù)降低。見表5。
表5 不同濃度阿奇霉素作用于exoS基因陽性PA后exoS基因mRNA相對表達(dá)水平
PA是一種在環(huán)境中普遍存在的革蘭陰性桿菌,是院內(nèi)感染和呼吸機(jī)相關(guān)性肺炎最常見病原菌之一,而抗菌藥物的使用及濫用使細(xì)菌的耐藥性逐漸增加,并且由于細(xì)菌毒力因子的釋放[17],許多重癥肺炎患者只用敏感抗菌藥物,所以往往不能改善疾病持續(xù)時間和嚴(yán)重程度[18]。隨著人們對細(xì)菌毒力機(jī)制理解的深入,毒力因子逐漸成為治療細(xì)菌感染的新靶位。近幾年發(fā)現(xiàn),T3SS廣泛存在于PA中,與細(xì)菌的毒力機(jī)制密切相關(guān)。PA T3SS主要分泌4種毒力因子:exoS、exoT、exoU、exoY,通過T3SS的導(dǎo)管裝置可將毒力因子轉(zhuǎn)運至宿主細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì),麻痹宿主細(xì)胞以促進(jìn)PA感染[19]。PA T3SS 毒力因子介導(dǎo)組織損傷、抑制傷口愈合,對PA的感染至關(guān)重要[19]。本文研究了50株P(guān)A T3SS毒力基因 exoS和exoU的分布情況,結(jié)果顯示72.00%菌株攜帶exoS基因,28.00%的攜帶exoU基因,無同時攜帶兩種基因的菌株,與文獻(xiàn)[20]報道類似。
本研究結(jié)果還顯示,exoU陽性PA株多為多重耐藥菌,比exoS陽性株有更高的耐藥性,這可能與exoU陽性株細(xì)胞膜上外排泵表達(dá)水平更高有關(guān)[21-22]。有文獻(xiàn)報道,PA exoU陽性對喹諾酮類抗菌藥物耐藥性明顯高于exoS陽性株[21],這是由于藥物靶位gyrA突變和外排泵過表達(dá)引起。但本研究中exoU陽性株只有14株,數(shù)量上遠(yuǎn)遠(yuǎn)少于exoS陽性株的36株,這些數(shù)量上的差異是否對本研究結(jié)果造成的誤差,有待今后增加檢測菌株數(shù)量后進(jìn)一步確定。
大環(huán)內(nèi)酯類抗菌藥物通常不是抗PA的抗菌藥物,然而近年來研究表明,大環(huán)內(nèi)酯類抗菌藥物在治療PA感染的囊性纖維化、慢性阻塞性肺疾病和彌散性全細(xì)支氣管炎患者中有良好效果[23-24],其具體機(jī)制可能是大環(huán)內(nèi)酯類抗菌藥物具有一定的抗炎[25]和抗細(xì)菌毒力作用[13]。有研究表明,阿奇霉素是通過抑制lasI/lasR和rhlI/rhlR基因的轉(zhuǎn)錄,進(jìn)一步抑制毒力因子的產(chǎn)生[13,26]。本文通過RT-PCR分析了阿奇霉素對試驗菌株毒力基因exoS和exoU mRNA表達(dá)的作用,結(jié)果表明低濃度阿奇霉素對exoS mRNA的表達(dá)有促進(jìn)作用,阿奇霉素濃度為4 μg/mL時菌株exoS mRNA的相對表達(dá)水平最高,隨著藥物濃度的增加,exoS mRNA的相對表達(dá)水平逐漸降低,而阿奇霉素對exoU mRNA的表達(dá)有抑制作用。有研究發(fā)現(xiàn),阿奇霉素可以抑制PA大部分毒力基因的表達(dá),并抑制細(xì)菌生物膜的形成[13],但本文研究發(fā)現(xiàn)低濃度阿奇霉素具有促進(jìn)exoS mRNA表達(dá),而抑制exoU mRNA表達(dá)的作用,因此,與感染exoS陽性菌株患者相比,阿奇霉素可能對感染exoU陽性株的患者更有益。值得注意的是,低劑量阿奇霉素具有促進(jìn)PA exoS mRNA表達(dá)作用,提示臨床針對相應(yīng)感染患者抗感染治療時應(yīng)嚴(yán)格按照規(guī)范服用該藥,以便快速達(dá)到有效濃度,并在有效濃度范圍維持足夠時間。