欽 鵬,樊世軍,高 鵬,李仕貴
(四川農(nóng)業(yè)大學(xué)水稻研究所,成都 611130)
隨著全球氣候變暖加劇,高溫?zé)岷σ殉蔀橄拗妻r(nóng)作物產(chǎn)量形成的重要外在因素[1]。相關(guān)研究表明[2]:氣溫每升高1℃,小麥產(chǎn)量將下降6%,玉米下降約7.4%,水稻則下降3.2%。水稻是我國(guó)重要的糧食作物,也是全球一半以上人口的主食,我國(guó)主要的水稻產(chǎn)區(qū)常常在抽穗灌漿期因7月中旬至8月中下旬副熱帶高壓影響遭遇持續(xù)極端高溫天氣,造成大面積減產(chǎn)甚至絕收[3]。因此,克隆一些重要的耐高溫相關(guān)基因,解析分子機(jī)理并進(jìn)一步挖掘其育種應(yīng)用價(jià)值對(duì)水稻育種和糧食安全具有重要的理論價(jià)值和現(xiàn)實(shí)意義。
過高或過低的環(huán)境溫度對(duì)水稻各個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育階段均具有明顯的影響,導(dǎo)致植株生長(zhǎng)遲緩、花期延遲、小穗不育和米質(zhì)變差等[2]。在細(xì)胞水平上,熱脅迫會(huì)改變?nèi)~綠體結(jié)構(gòu),破壞光合系統(tǒng),誘導(dǎo)胞內(nèi)毒性蛋白積累和代謝紊亂等[4]。由于高溫相關(guān)表型屬于復(fù)雜的數(shù)量性狀,且難以準(zhǔn)確穩(wěn)定評(píng)價(jià),導(dǎo)致水稻耐高溫分子機(jī)理研究較為緩慢。儲(chǔ)成才和林鴻宣團(tuán)隊(duì)分別從高溫對(duì)水稻生理變化和信號(hào)響應(yīng)機(jī)理角度綜述了水稻熱脅迫研究進(jìn)展[5-6]。本文在此基礎(chǔ)上,著眼當(dāng)前水稻耐高溫領(lǐng)域相關(guān)研究工作,重點(diǎn)對(duì)關(guān)鍵的耐高溫基因功能及其信號(hào)通路進(jìn)行分類闡釋,旨在總結(jié)該領(lǐng)域已有研究基礎(chǔ)并對(duì)未來可能亟待開展的研究問題提出見解,為進(jìn)一步揭示新的耐高溫基因、明確分子機(jī)理并挖掘其育種應(yīng)用奠定理論基礎(chǔ)。
目前水稻中已克隆大量與高溫相關(guān)基因,從基因功能上大致可將其分為5類,包括熱激蛋白、熱激轉(zhuǎn)錄因子、逆境相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子、酶蛋白和其他相關(guān)蛋白(表1)。以下將對(duì)這些基因功能進(jìn)行分類闡述。
表1 水稻耐高溫基因分類Table 1 Classification of genes related to rice high temperature resistance
熱激蛋白又名熱休克蛋白(HSPs,heat shock proteins),因最初在果蠅體內(nèi)熱誘導(dǎo)試驗(yàn)中被發(fā)現(xiàn)而得名。這類蛋白在植物中種類繁多且含量豐富,是目前發(fā)現(xiàn)的主要分子伴侶蛋白之一,在植物脅迫應(yīng)激過程中幫助蛋白質(zhì)正確折疊并協(xié)助其跨膜轉(zhuǎn)移,對(duì)增強(qiáng)植物體脅迫承受能力具有重要的生物學(xué)意義。水稻中已報(bào)道該類蛋白約17個(gè),它們多數(shù)僅被報(bào)道受到熱激誘導(dǎo),具體生物學(xué)功能尚未明確[8,12]。其中,OsHSP26.7被報(bào)道編碼一個(gè)葉綠體定位的熱激蛋白,在保護(hù)葉綠體免受高溫和紫外線引起的氧化損害中發(fā)揮重要作用[51];sHSP17.7是從熱應(yīng)激脅迫的水稻中分離出來的一個(gè)新的熱激蛋白,過表達(dá)試驗(yàn)顯示該基因表達(dá)量提升帶來植株耐熱性的顯著提高[9];HSA32和HSP101被證明相互作用形成正反饋調(diào)節(jié)環(huán)在轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮作用,幫助水稻延長(zhǎng)熱鍛煉效應(yīng)形成高溫記憶[10]。
熱應(yīng)激轉(zhuǎn)錄因子(HSFs,heat stress factors)是熱脅迫響應(yīng)的調(diào)節(jié)樞紐,其負(fù)責(zé)在熱應(yīng)激過程中將信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)并激活熱激蛋白表達(dá)。序列同源比對(duì)發(fā)現(xiàn)水稻中至少存在25個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子,其中受到熱激誘導(dǎo)的約13個(gè)(表1),但關(guān)于該類基因功能的研究尚缺乏深入探究,分子機(jī)制有待揭示[19]。其中OsHsfA2d被報(bào)道編碼兩種剪切異構(gòu)體,分別在正常溫度和高溫脅迫下發(fā)揮功能,幫助細(xì)胞建立蛋白折疊平衡[16];OsHsfA2e定位于細(xì)胞核并具有C端轉(zhuǎn)錄活性,在擬南芥中超表達(dá)該基因可以顯著增強(qiáng)擬南芥耐受環(huán)境脅迫能力[17];OsHsfA2a存在多個(gè)轉(zhuǎn)錄本,它們?cè)谒旧L(zhǎng)發(fā)育和脅迫應(yīng)答過程中扮演重要角色[14]。
除HSF外,一些含逆境脅迫元件的轉(zhuǎn)錄因子也陸續(xù)被發(fā)現(xiàn)參與高溫脅迫。OsDREB1B是一個(gè)AP2/EREBP轉(zhuǎn)錄因子,該基因同時(shí)受到低溫和高溫誘導(dǎo)表達(dá),在擬南芥中表達(dá)后可以顯著提高植株耐冷和耐熱能力[20];OsWRKY11編碼一個(gè)含WRKY結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子,在水稻中受到熱脅迫誘導(dǎo),用HSP101啟動(dòng)子啟動(dòng)OsWRKY11表達(dá)后轉(zhuǎn)入水稻可以顯著提升后代耐熱性和耐旱性[21];OsAREB1和OsbZIP60分別編碼一個(gè)bZIP轉(zhuǎn)錄因子,二者均被發(fā)現(xiàn)受熱脅迫誘導(dǎo)并作為正向調(diào)控因子對(duì)水稻耐高溫具有重要貢獻(xiàn)[22-23];HYR是一個(gè)直接激活光合作用的關(guān)鍵調(diào)控因子,在干旱和高溫脅迫下HYR可以調(diào)控下游碳代謝基因影響形態(tài)-生理程序以穩(wěn)定水稻產(chǎn)量[26];SNAC3作為一個(gè)NAC轉(zhuǎn)錄因子過表達(dá)會(huì)顯著增強(qiáng)水稻抗高溫能力,該基因介導(dǎo)活性氧代謝調(diào)控水稻脅迫耐受性[25];OsMYB55作為R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控氨基酸代謝,過表達(dá)該基因可以顯著提升水稻高溫耐受性,降低高溫對(duì)產(chǎn)量帶來的負(fù)面影響[24]。
近年來,大量酶蛋白被報(bào)道參與水稻溫度脅迫過程,它們涉及多個(gè)生物學(xué)途徑。GAD3和OsGSr分別編碼一個(gè)谷氨酸脫羧酶和谷氨酰胺合成酶,它們被OsMYB55激活后高表達(dá)促進(jìn)逆境相關(guān)氨基酸合成,對(duì)水稻耐高溫具有重要貢獻(xiàn)[24];OsHCI1編碼一個(gè)環(huán)指E3連接酶,高溫下該蛋白在核內(nèi)大量積累介導(dǎo)核底物輸出泛素化,在擬南芥中異源表達(dá)該基因可以顯著增強(qiáng)植株高溫耐受性[27];OsHTAS編碼一個(gè)泛素連接酶,該基因同時(shí)定位在核和胞質(zhì),介導(dǎo)過氧化氫誘導(dǎo)的氣孔開閉,對(duì)水稻耐熱具有正向調(diào)控作用[28];OsTT1是從非洲稻CG14中被鑒定到的一個(gè)耐高溫位點(diǎn),該基因編碼26S蛋白酶體α2亞基,參與有毒蛋白泛素化降解過程,對(duì)水稻高溫應(yīng)答具有重要意義[29];OsGIRL1編碼一個(gè)富亮氨酸重復(fù)類受體蛋白激酶,熱脅迫刺激下該基因過表達(dá)植株苗期存活率顯著高于野生型[30];TOGR1編碼一個(gè)RNA解旋酶,在25~40℃ 范圍內(nèi)該基因酶活持續(xù)增加,參與高溫情況下rRNA前體的加工,對(duì)高溫下的細(xì)胞增殖十分重要[31];AET1是一個(gè)tRNAHis鳥苷轉(zhuǎn)移酶,該基因具有鳥苷轉(zhuǎn)移酶活性,調(diào)控核糖體蛋白翻譯過程,對(duì)維持高溫下蛋白翻譯穩(wěn)定性具有重要意義[32];OsNSUN2編碼一個(gè)mRNA m5C甲基轉(zhuǎn)移酶,通過調(diào)節(jié)mRNA翻譯效率維持高溫下水稻生長(zhǎng)發(fā)育的正常進(jìn)行[33];PGL編碼葉綠素a氧化酶1,主要在綠色組織中表達(dá),其突變體對(duì)熱脅迫敏感[34];TCM5是一個(gè)Deg蛋白酶,該基因被證明參與高溫下葉綠體發(fā)育,對(duì)光合系統(tǒng)Ⅱ的功能維持至關(guān)重要[35];EG1是一個(gè)高溫介導(dǎo)的線粒體脂肪酶,它可以保護(hù)高溫下花器官基因表達(dá),維持花器官發(fā)育穩(wěn)定[36];OsAPX2是水稻細(xì)胞質(zhì)抗壞血酸過氧化物酶基因,參與水稻苗期熱誘導(dǎo)下抗壞血酸過氧化物酶的表達(dá)[37];OsGSK1是擬南芥BR信號(hào)通路關(guān)鍵調(diào)控因子BIN2的同源蛋白,該激酶敲除后對(duì)熱脅迫敏感[38];GSA1編碼一個(gè)水稻糖基轉(zhuǎn)移酶UGT83A1,該蛋白具有廣譜糖基轉(zhuǎn)移酶活性,調(diào)控黃酮類代謝物合成,同時(shí)調(diào)控水稻產(chǎn)量和抗逆,在耐高溫育種中具有重要貢獻(xiàn)[39]。
除以上幾大類基因外,還有一些與高溫相關(guān)的基因被報(bào)道。FLO2是一個(gè)含三十四肽重復(fù)序列的蛋白,其被報(bào)道可以控制水稻種子直鏈淀粉含量,過表達(dá)引起谷粒增大,高溫脅迫下不同水稻品種間FLO2表達(dá)差異顯著表明該基因可能參與種子灌漿過程中耐高溫[40];Fie1是一個(gè)不依賴于受精的胚乳自主發(fā)生基因,該基因調(diào)控種子大小并調(diào)控灌漿過程中種子夜間高溫敏感性,對(duì)高溫下水稻產(chǎn)量維持具有重要意義[42];RBG1是一個(gè)新的正調(diào)控籽粒大小的基因,該基因被報(bào)道可通過生長(zhǎng)素和細(xì)胞分裂素途徑增強(qiáng)水稻對(duì)熱、滲透、鹽脅迫的耐受性[41];OsLEA4和OsLEA5編碼兩個(gè)晚期胚胎富集蛋白,在大腸桿菌中表現(xiàn)出顯著的高溫耐受,暗示其可能對(duì)逆境耐受性具有一定貢獻(xiàn)[43];ZFP177編碼一個(gè)A20/AN1型鋅指蛋白,該基因受熱脅迫誘導(dǎo),在煙草中過表達(dá)該基因能夠提升熱脅迫耐受能力[45];OsRZFP34編碼一個(gè)環(huán)鋅指蛋白,該基因同樣受熱誘導(dǎo),缺失功能后會(huì)導(dǎo)致氣孔直徑變小,溫度耐受性降低[46];OsANN1是一個(gè)鈣結(jié)合蛋白,具有ATP酶活性,該基因敲除后對(duì)熱脅迫敏感,導(dǎo)致體內(nèi)氧化還原嚴(yán)重失衡[47];OsCNGC14和OsCNGC16是兩個(gè)環(huán)核苷酸門控離子通道蛋白,定位于質(zhì)膜,負(fù)責(zé)調(diào)控細(xì)胞質(zhì)鈣離子內(nèi)流,其突變體對(duì)溫度脅迫敏感[48];SLG1編碼一個(gè)保守的細(xì)胞質(zhì)tRNA 2-硫醇化蛋白2(RCTU2),參與tRNA修飾,在水稻幼苗和生殖發(fā)育階段耐高溫均具有重要貢獻(xiàn),過表達(dá)后可顯著增強(qiáng)水稻耐高溫能力[49];OsGR-RBP4是一個(gè)富含甘氨酸RNA結(jié)合蛋白,該基因從水稻CDNA熱激文庫中篩選獲得,在幼苗中組成性表達(dá)且受熱脅迫誘導(dǎo),酵母細(xì)胞中過表達(dá)該基因可顯著提高酵母高溫脅迫耐受性[50]。
溫度作為復(fù)雜的物理信號(hào),對(duì)生物體影響的表型難以準(zhǔn)確鑒定,其分子機(jī)制的解析相較于其他非生物脅迫也更為困難。近年來,隨著大量高溫相關(guān)基因的克隆,水稻中一些關(guān)鍵的耐高溫信號(hào)通路被逐步明確。筆者將這些通路主要?dú)w納為轉(zhuǎn)錄后調(diào)控、泛素蛋白酶體途徑、物質(zhì)代謝途徑、鈣離子信號(hào)、活性氧信號(hào)和激素信號(hào)途徑六大類(圖1)。
圖1 水稻耐高溫關(guān)鍵信號(hào)通路Figure 1 Signal pathway about rice high temperature resistance
擬南芥中研究早已表明,轉(zhuǎn)錄修飾對(duì)環(huán)境溫度感知和熱脅迫應(yīng)答具有重要意義[52]。水稻中近年已報(bào)道4個(gè)與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控相關(guān)的耐高溫相關(guān)基因,包括RNA 解旋酶TOGR1[31]、tRNAHis鳥苷轉(zhuǎn)移酶AET1[32]、RNA甲基轉(zhuǎn)移酶OsNSUN2[33]和細(xì)胞質(zhì)tRNA 2-硫醇化蛋白2基因SLG1[49]。其中TOGR1是核仁中SSU復(fù)合體的伴侶蛋白,參與高溫下rRNA前體的加工過程[31];AET1則對(duì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和核糖體上前體tRNAHis成熟和后期蛋白質(zhì)翻譯具有決定性作用[32];OsNSUN2介導(dǎo)高溫下細(xì)胞核中光合作用相關(guān)解毒蛋白的mRNA甲基化修飾,提升翻譯效率以保證水稻高溫下正常生長(zhǎng)[33];SLG1負(fù)責(zé)胞質(zhì)中tRNA硫醇化修飾,正向調(diào)控水稻耐熱性[49]。
在高等植物中,泛素分子與底物的連接可以通過Ub/26S蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)各種細(xì)胞功能,此途徑也是植物耐高溫的重要機(jī)制[53]。水稻中目前已報(bào)道3個(gè)參與此途徑的基因,分別是OsHCI1[27]、HTAS[28]和OsTT1[29]。其中HTAS和OsHCI1均屬于E3泛素連接酶,HTAS體外具有泛素連接酶活性,可以與抗壞血酸過氧化物酶互作介導(dǎo)氣孔開閉影響高溫耐受性,OsHCI1高溫下在核中大量積累,介導(dǎo)核中底物蛋白沿細(xì)胞骨架快速輸出泛素化降解[27-28];OsTT1作為一個(gè)26S蛋白酶體α2亞基可以幫助水稻更高效降解有毒蛋白維持高溫應(yīng)答[29]。
植物對(duì)高溫的響應(yīng)是一個(gè)復(fù)雜的過程,一些代謝物的累積對(duì)耐高溫過程具有顯著貢獻(xiàn)。如水稻中MYB55轉(zhuǎn)錄因子被報(bào)道可以調(diào)控下游谷氨酸脫氫酶GAD3和谷氨酰胺合成酶OsGS1.2的表達(dá),在高溫下促進(jìn)L-谷氨酸、氨基丁酸等逆境脅迫相關(guān)氨基酸的積累增強(qiáng)植株耐高溫能力[24]。此外,UDP葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶基因GSA1可以在非生物脅迫下促進(jìn)代謝流下類黃酮和花青素合成,增強(qiáng)水稻抗逆能力[39]。脂肪酶基因EG1定位在線粒體和質(zhì)體,介導(dǎo)高溫下線粒體脂肪酶通路,調(diào)控脂質(zhì)代謝和下游基因表達(dá)[36]。
鈣離子作為第二信使在植物響應(yīng)非生物脅迫中具有重要作用,在熱脅迫早期,胞內(nèi)鈣離子濃度上調(diào)是一個(gè)關(guān)鍵的逆境信號(hào),但其具體的分子機(jī)制仍有待解析[54]。水稻中目前報(bào)道了3個(gè)鈣離子相關(guān)蛋白參與熱脅迫過程,其中CNGC14和CNGC16作為環(huán)核苷酸門控離子通道調(diào)控高溫下質(zhì)膜上的鈣離子內(nèi)流[48],而胞質(zhì)中的鈣結(jié)合蛋白OsANN1則通過提高活性氧清除酶活性調(diào)控高溫下的氧化還原平衡[47]。
ROS信號(hào)是高溫脅迫下胞內(nèi)另一個(gè)重要的信號(hào)分子,擬南芥中42熱激45℃即可檢測(cè)到強(qiáng)烈的活性氧信號(hào)[54]。水稻中大多數(shù)高溫相關(guān)基因突變也伴隨著胞內(nèi)ROS失衡,其中APX2和SNAC3是兩個(gè)被報(bào)道與ROS清除直接相關(guān)的基因[25,37]。抗壞血酸過氧化物酶基因APX2高溫下在胞質(zhì)中大量合成,增強(qiáng)水稻過氧化氫清除能力,保護(hù)小穗免于脂質(zhì)過氧化進(jìn)而維持育性[37]。轉(zhuǎn)錄因子SNAC3在核內(nèi)正調(diào)控ROS清除基因的表達(dá),介導(dǎo)活性氧代謝,增強(qiáng)水稻高溫耐受性[25]。
高溫脅迫下,多種激素信號(hào)在水稻體內(nèi)交互發(fā)生。其中OsGSK1作為BR信號(hào)負(fù)調(diào)控因子介導(dǎo)水稻熱脅迫應(yīng)答過程[38],質(zhì)膜受體激酶OsGIRL1通過響應(yīng)ABA或SA信號(hào)參與熱脅迫調(diào)控[30],熱脅迫相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子OsAREB1是ABA信號(hào)的正向調(diào)節(jié)子[22],OsRZFP34則參與熱脅迫下ABA介導(dǎo)的氣孔開閉[46]。
隨著全球氣候變暖加劇,選育耐高溫水稻品種對(duì)糧食安全至關(guān)重要,因此克隆高溫相關(guān)基因、解析其分子機(jī)理且挖掘優(yōu)異等位基因?qū)Υ_保水稻糧食安全具有重要意義。目前水稻中已克隆的與高溫相關(guān)基因,多數(shù)局限于分子機(jī)理研究,可直接用于改良水稻耐高溫性的優(yōu)異等位基因極少。因此未來該領(lǐng)域研究需要更多地與生產(chǎn)實(shí)際相結(jié)合,克隆關(guān)鍵的耐高溫基因,挖掘更優(yōu)自然優(yōu)異等位基因,為培育耐高溫水稻新品種提供更多的基因資源。另外,隨著更多高溫相關(guān)基因相繼被報(bào)道,部分與高溫相關(guān)信號(hào)通路逐步明確,但關(guān)于水稻如何感知高溫信號(hào)并向下游傳遞信號(hào)的分子機(jī)制和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究仍十分有限,因此研究植物如何將溫度的物理信號(hào)編碼為體內(nèi)的化學(xué)信號(hào),并傳遞給下游調(diào)控網(wǎng)絡(luò)將是該研究領(lǐng)域熱門方向之一。