張志東, 顧美英, 唐琦勇, 楚敏, 朱靜, 孫建, 楊蓉, 徐萬里
(1.新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院微生物應(yīng)用研究所, 新疆特殊環(huán)境微生物實(shí)驗(yàn)室, 烏魯木齊 830091;2.新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院土壤肥料與農(nóng)業(yè)節(jié)水研究所, 烏魯木齊 830091)
新疆鹽堿土地分布廣,鹽堿化種類多樣,被稱為世界鹽堿土的博物館[1]。同時(shí),由于長(zhǎng)期耕作管理不當(dāng),以及當(dāng)前膜下滴灌模式的采用,近50% 宜耕土地受不同程度鹽漬化和次生鹽漬化的威脅,嚴(yán)重影響了作物生長(zhǎng)發(fā)育及產(chǎn)量。如何利用新技術(shù)、新方法有效減緩鹽漬化對(duì)農(nóng)業(yè)作物的影響,推動(dòng)新疆農(nóng)業(yè)高效可持續(xù)發(fā)展,已成為科研工作者亟待解決的重大課題[2-3]。
植物根際促生菌(plant growth-promoting rhizobateria, PGPR)是指生存在植物根際或根表,直接或間接促進(jìn)或調(diào)節(jié)植物生長(zhǎng)的一類微生物菌群[4]。相關(guān)研究表明,根際細(xì)菌在共同適應(yīng)和進(jìn)化過程中,能夠通過多種機(jī)制促進(jìn)植物生長(zhǎng),一方面可通過產(chǎn)生植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑來直接促進(jìn)作物生長(zhǎng),也可以通過其固氮、溶磷、解鉀的作用轉(zhuǎn)化土壤中礦物質(zhì),以促進(jìn)植物相關(guān)營養(yǎng)元素的吸收利用[4-7];另一方面,根際細(xì)菌也可通過產(chǎn)生抗菌物質(zhì)、誘導(dǎo)作物產(chǎn)生系統(tǒng)抗性,以增強(qiáng)植物的抗逆特性[8-9]。同時(shí),PGPR代謝活動(dòng)能夠增強(qiáng)土壤中有機(jī)物的分解,促進(jìn)植物營養(yǎng)元素的礦化,改良土壤結(jié)構(gòu)和營養(yǎng)成分,提高土壤肥力[10-12]。國內(nèi)外相關(guān)學(xué)者已對(duì)多種農(nóng)作物如煙草、棉花、花生等開展植物根際促生細(xì)菌研究,結(jié)果表明,PGPR在農(nóng)作物防病、增產(chǎn)中具有重要作用[12-15]。同時(shí),在荒漠耐鹽植物根際耐鹽促生菌方面也有研究[13],為利用相關(guān)菌株提高農(nóng)作物耐鹽性、促生長(zhǎng)、開發(fā)相關(guān)菌劑提供了理論依據(jù)。
新疆地區(qū)鹽生植物種類多、分布廣,其中藜科多年生灌木鹽爪爪[Kalidiumfoliatum(Pall.)Moq]是典型的鹽生植物,廣泛分布在鹽堿荒漠生境,具有較強(qiáng)抗逆特性。前期研究表明,鹽爪爪根際存在豐富的耐鹽微生物,部分菌株具有產(chǎn)生吲哚乙酸(indoleacetic acid,IAA)和解磷等植物促生作用[14]。因此,進(jìn)一步開展鹽爪爪根際微生物耐鹽促生菌的研究,將有利于相關(guān)微生物菌肥的研制,進(jìn)而為新疆鹽漬土地的治理開發(fā)提供新技術(shù)和新方法。本研究以鹽爪爪根際微生物為研究對(duì)象,開展了其耐鹽促生細(xì)菌的分離鑒定及促生特性分析,并進(jìn)行了棉花盆栽效果驗(yàn)證試驗(yàn),旨在為進(jìn)一步篩選和復(fù)配耐鹽促生菌肥提供科學(xué)依據(jù)和前期基礎(chǔ)。
1.1.1供試植物 鹽爪爪于2016年4月采自新疆和碩地區(qū)。供試棉種為陸地棉新陸中42號(hào),購自新疆明珠花卉市場(chǎng)。
1.1.2培養(yǎng)基 解磷基礎(chǔ)培養(yǎng)基(NBRIP培養(yǎng)基)、Ashby培養(yǎng)基、硅酸鹽細(xì)菌培養(yǎng)基、Pikovskaya’s培養(yǎng)基、TSA培養(yǎng)基等,均由青島高科技工業(yè)園海博生物技術(shù)有限公司生產(chǎn)。DF培養(yǎng)基、ADF培養(yǎng)基參照許芳芳[13]的方法配制。上述培養(yǎng)基在滅菌使用前,均另加2% NaCl。
1.2.1根際土壤的收集 鹽爪爪植株樣品采用垂直挖掘法,盡可能保證根部的完整性。選擇完整植株根部,采用抖落法去除非根際土壤,并在無菌條件下,利用無菌細(xì)毛刷輕刷根部,收集根際土壤樣品。土樣充分混合后轉(zhuǎn)移至無菌離心管中,于4 ℃環(huán)境保存?zhèn)溆肹14]。
1.2.2PGPR菌株的分離 在超凈工作臺(tái)中稱取5 g鹽爪爪根際土樣,加入裝有50 mL 2% NaCl無菌溶液的三角瓶中。30 ℃、120 r·min-1振蕩 0.5 h,靜置10 min。吸取上述懸液1 mL,經(jīng)適度梯度稀釋后,涂布至含有2% NaCl的分離培養(yǎng)基平板上,于30 ℃恒溫培養(yǎng)3~15 d,待菌落長(zhǎng)出后,根據(jù)菌落的形態(tài)、大小、顏色等進(jìn)行初步篩選,分離純化后,接至2% NaCl R2A培養(yǎng)基斜面上,4 ℃保存?zhèn)溆肹14]。
1.2.3菌株的分子鑒定 使用菌落PCR法,采用細(xì)菌16S rDNA序列通用引物27 F和1 492 R擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物經(jīng)切膠純化后,送往北京鼎國生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。所得序列經(jīng)手工校對(duì)后,上傳至EzTaxon(http://www.ezbiocloud.net/eztaxon/identify)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),并調(diào)取相關(guān)同源性最高模式菌株序列, 使用MEGA 5.0進(jìn)行CLUSTAL X多重比對(duì)[15],并使用NJ(Neighbor-Joining)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,自舉值(Bootstrap)為1 000,初步確定菌株的生物學(xué)分類地位。
1.2.4菌株耐受性測(cè)定 選取各屬種代表性的14株菌株進(jìn)行耐鹽促生實(shí)驗(yàn),菌株接種于含有2% NaCl的1/10 TSA液體培養(yǎng)基中,分別采用10和45 ℃恒溫培養(yǎng),確定其低溫和高溫生長(zhǎng)情況。菌株接種于含有10% NaCl的1/10 TSA培養(yǎng)基中,于 30 ℃恒溫培養(yǎng)3~15 d,連續(xù)觀察并進(jìn)行耐鹽特性統(tǒng)計(jì)[14]。
1.2.5解磷和固氮能力測(cè)定 將14株代表性菌株點(diǎn)植到改良PKO 固體培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)72 h,根據(jù)溶磷圈直徑與菌落直徑的比值大小初步判斷菌株溶磷能力的強(qiáng)弱。菌株的固氮特性以菌株在Ashby培養(yǎng)基上生長(zhǎng),初步確定為固氮陽性[13]。
1.2.6ACC脫氨酶陽性菌篩選 參考Penrose等[16]的方法,將14株代表性菌株接種至液體無氮培養(yǎng)基中,30 ℃、200 r·min-1振蕩培養(yǎng)24 h。吸取培養(yǎng)液0.1 mL 接種至5 mL DF液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)24 h。吸取上述培養(yǎng)液0.1 mL接種至ADF液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)48 h后,重復(fù)轉(zhuǎn)接ADF培養(yǎng)基中,能生長(zhǎng)的菌株判定為ACC脫氨酶陽性菌株。
1.2.7IAA產(chǎn)生能力測(cè)定 將待測(cè)菌株接種含有2% NaCl的1/10 TSA液體培養(yǎng)基,于120 r·min-1、30 ℃ 恒溫震蕩培養(yǎng)5 d。取菌液,10 000 r·min-1離心15 min,每1 mL上清液加0.5 mL Salkowski 試劑。室溫暗處顯色1 h 后,于530 nm處測(cè)OD值[17]。以空白培養(yǎng)基作對(duì)照,并以IAA標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算發(fā)酵液中IAA濃度。
1.2.8棉花促生的穴盤驗(yàn)證試驗(yàn) 菌株通過相關(guān)促生定性定量分析后,選取12株代表性菌株進(jìn)行盆栽驗(yàn)證。采用4×5穴的穴栽盤,以水洗黃沙烘干后為穴栽土壤。土壤用5% NaCl溶液浸潤后,添加過夜放置自來水并混勻,最終使土壤含水量達(dá)到50%,含鹽量達(dá)到0.75%。選擇顆粒飽滿且無明顯破損的棉種,使用0.1%的升汞消毒5 min,無菌水洗凈后,浸于1/100濃度菌液4 h后,點(diǎn)植入穴栽盤,每穴為4粒,深度約1.5 cm,放置于人工氣候箱培養(yǎng),光照強(qiáng)度24 000 lx,光照時(shí)間14 h·d-1,光照時(shí)溫度控制到30 ℃,無光照時(shí)溫度控制到25 ℃,濕度控制為40%。每種菌劑處理重復(fù)4穴,以在清水浸泡為對(duì)照1(CK1),并以清水浸泡點(diǎn)植于無鹽土壤中為對(duì)照0(CK0),每天用過夜放置自來水噴灑2次。待發(fā)芽后,每隔5 d澆灌一次(每穴約10 mL)。待發(fā)芽20 d后,測(cè)量各試驗(yàn)組和對(duì)照組棉花植株的各種形態(tài)學(xué)參數(shù),包括發(fā)芽率、株高、根長(zhǎng)、干重等[18-19]。
采用DPS 7.05軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用Office Excel 2003軟件繪制圖表。
2.1.1鹽爪爪PGPR菌株分離純化 培養(yǎng)3~15 d后,通過觀察菌落形態(tài),共挑取各類菌株74株。通過進(jìn)一步分離純化,菌落形態(tài)和顯微形態(tài)觀察去重后,共獲得試驗(yàn)菌株57株。所得菌株保存至2% NaCl的R2A斜面上,用于進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)分析。
2.1.2鹽爪爪PGPR菌株多樣性分析 由圖1可知,鹽爪爪根際PGPR菌株存在豐富的多樣性,所得菌株共歸屬在4個(gè)門12個(gè)屬。其中,放線菌門(Actinobacteria)所含菌屬最多,共涉及6個(gè)屬;其次為變形桿菌門(Proteobacteria),涉及3個(gè)屬;再次為厚壁菌門(Firmicutes),涉及2個(gè)屬;擬芽孢桿菌(Bacteroidetes)最少,僅涉及Sinomicrobium屬。
圖1 基于菌株16S rDNA序列的NJ進(jìn)化樹
表1顯示,經(jīng)測(cè)試,86%的試驗(yàn)菌株具有耐受10% NaCl的能力,50%的菌株具有產(chǎn)ACC脫氨酶能力,50%的菌株具有解無機(jī)磷能力,42.8%具有固氮能力,86%的菌株具有產(chǎn)IAA的能力。其中,菌株CM7產(chǎn)IAA能力最強(qiáng),最高可達(dá)45.32 mg·L-1(圖2),展現(xiàn)了鹽爪爪根際PGPR菌株在耐鹽促生中應(yīng)用前景。
圖2 典型菌株產(chǎn)IAA的測(cè)定結(jié)果
表1 典型菌株耐鹽及促生特性分析結(jié)果
2.3.1菌株對(duì)棉花發(fā)芽率和干重的影響 從圖3可以看出,鹽分對(duì)棉花發(fā)芽率有明顯的抑制作用,與正常發(fā)芽率95%相比,試驗(yàn)條件下未加菌液處理的棉種發(fā)芽率幾乎降低了一半,僅為50%左右,但對(duì)成活棉株的平均干重影響不明顯。多數(shù)試驗(yàn)菌株處理可提高棉種在鹽脅迫下的發(fā)芽率,其中接種菌株R11提高最為明顯,發(fā)芽率達(dá)到75%,較未接種菌液處理發(fā)芽率最高可以提高25%;其次為菌株K18,其發(fā)芽率可以提高65%;其他菌株提高不明顯。而添加了MM18后,發(fā)芽率反而下降,僅為35%。干重?cái)?shù)據(jù)顯示,以CK1處理的干重為基準(zhǔn),添加R11、K27、CM7等菌株處理后,棉株干重明顯提高,其中CM7處理最為明顯,干重較CK1處理提高了22.1%;而T25、K18等菌株處理對(duì)干重增加不明顯;菌株Y24處理后,棉株干重反而下降。
圖3 菌株處理對(duì)棉花發(fā)芽率和棉株干重的影響
2.3.2菌株處理對(duì)棉花株高和根長(zhǎng)的影響 圖4顯示,試驗(yàn)菌株處理可以有效提高棉苗根的生長(zhǎng),在出芽后3 d,與CK1比較,菌株處理后的棉苗根系生長(zhǎng)即有明顯變化,其中R11、T25、K18等菌株處理后根系生長(zhǎng)較好。進(jìn)一步培養(yǎng)至20 d后,不同處理間根系差異更為明顯(圖5),其中R11提高最為顯著,與CK1相比提高了135.2%。棉苗株高結(jié)果(圖6)也表明,菌株處理可以有效提高棉株生長(zhǎng),與CK1比較,R11、Y24、H9、T25、K18等菌株處理后,株高明顯提高,其中R11提高最為明顯,較CK1提高了46.1%。
圖4 典型菌株處理下棉花發(fā)芽3 d后的生長(zhǎng)情況
注:不同小寫字母表示差異在P<0.05水平具有顯著性。
注:不同小寫字母表示差異在P<0.05水平具有顯著性。
已有研究表明,PGPR可有效提高種子萌發(fā)率、促進(jìn)根系生長(zhǎng)、增加植物干重,特別是其定殖能力強(qiáng),對(duì)根部的病原物具有抑制作用,是現(xiàn)代綠色農(nóng)業(yè)、生態(tài)農(nóng)業(yè)發(fā)展中化肥、農(nóng)藥的理想替代品。目前,國內(nèi)外相關(guān)學(xué)者已從多種植物根際分離到豐富多樣的根際,如芽孢桿菌屬[7,8,12]、假單胞菌屬[9,13,18]、腸桿菌屬[13-14]、土壤桿菌屬[14]、德氏菌屬[10,19]、克雷伯氏菌屬[19]、固氮菌屬[4,19]等菌株。本研究中,從鹽爪爪根際微生物中,分離到在4個(gè)門12個(gè)屬21個(gè)種,多數(shù)菌株具有根際促生作用,其中,如Isoptericola、Sinomicrobium等屬此前鮮有相關(guān)報(bào)道,也暗示鹽生植物中可能蘊(yùn)藏著豐富的尚未開發(fā)利用根際促生微生物,有待進(jìn)一步挖掘。
一般而言,高濃度鹽分對(duì)植物生長(zhǎng)有不同程度的抑制作用,但鹽生植物在長(zhǎng)期的適應(yīng)和進(jìn)化中,也形成了多種耐鹽機(jī)理,主要可分為泌鹽、拒鹽和稀鹽3種類型[20]。新疆素有世界鹽堿土博物館之稱,鹽堿種類多分布廣,耐鹽植物也多有分布。關(guān)于根際促生細(xì)菌提高植物耐鹽特性的機(jī)理主要包括誘導(dǎo)植物體內(nèi)激素變化或自身產(chǎn)生相關(guān)植物激素,如IAA等,誘導(dǎo)植物產(chǎn)生滲透保護(hù)劑,產(chǎn)生胞外多糖減輕鹽脅迫,調(diào)控植物體內(nèi)離子平衡等[13,18]。同時(shí),部分菌株具有解磷解鉀、固氮等功能,也為植物生長(zhǎng)提供了營養(yǎng)物質(zhì),以促進(jìn)植物生長(zhǎng),減輕鹽脅迫對(duì)植株的影響。
鹽爪爪作為典型稀鹽植物,在鹽脅迫下,植株地上和地下部分積累 Na+的程度隨著土壤環(huán)境 NaCl濃度升高而增強(qiáng)。同時(shí),鹽爪爪根際土壤中多種離子濃度顯著提高,鹽分積累可在根際形成“鹽島”效應(yīng)。鹽爪爪根際存在豐富的微生物多樣性,且多數(shù)菌株呈現(xiàn)較高的耐鹽特性[14]。前期研究表明,鹽爪爪根際微生物群落活性總體呈現(xiàn)根際>根區(qū)>環(huán)境的趨勢(shì)[21]。本研究中,86%的試驗(yàn)菌株具有耐受10% NaCl的能力,50%的菌株具有產(chǎn)ACC脫氨酶能力,50%的菌株具有解無機(jī)磷能力,42.8%具有固氮能力,86%的菌株具有產(chǎn)IAA的能力。一方面展現(xiàn)了鹽爪爪根際存在著豐富的耐鹽促生菌株,另一方面耐鹽促生菌株有可能參與了鹽爪爪耐鹽、聚鹽等生理特性,這有待進(jìn)一步深入研究。
本研究采用耐鹽促生細(xì)菌處理棉種后,通過穴栽試驗(yàn)證明了R11、T25、K18等菌株處理能有效提高棉花在鹽堿脅迫下的生長(zhǎng)。其中,菌株R11處理后植株的株高和根長(zhǎng)提高了135.2%和46.1%,這與趙雅峰等[22]的研究結(jié)果一致,也展現(xiàn)了菌株R11在棉花促生中良好前景。同時(shí),采用菌株Y24處理后,盡管棉株的根系和株高增加了,但其干重反而下降,可能原因是Y24具有較強(qiáng)的促生長(zhǎng)作用,由于穴載培養(yǎng)營養(yǎng)不足,加之種植時(shí)間短,過度的生長(zhǎng)反而導(dǎo)致消耗能量比較多,不利于苗期植物干物質(zhì)的增加,相關(guān)機(jī)理還需進(jìn)一步驗(yàn)證。此外,部分鹽爪爪根際促生菌對(duì)棉花生長(zhǎng)的影響不明顯,甚至出現(xiàn)一定的抑制作用,這可能與相關(guān)菌株對(duì)棉花定殖效果差,或影響棉花根際正常菌群生長(zhǎng)等有關(guān),相關(guān)問題還有待進(jìn)一步分析。同時(shí),在進(jìn)行棉花穴栽試驗(yàn)時(shí),采用水洗沙作為穴栽土壤,存在著澆水后隨著水分的蒸發(fā),鹽分向上聚積的情況,可能造成植株所受的鹽分脅迫大于采用松軟基質(zhì)。同時(shí),也存在水洗沙營養(yǎng)不足等情況,導(dǎo)致部分菌株處理后植株發(fā)芽率和干重增加不明顯,上述問題還將有待進(jìn)一步驗(yàn)證。