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      基于環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌特異性檢測(cè)

      2021-01-19 02:37:26徐曉可郭卉鄧梅清張菊梅吳清平丁郁
      現(xiàn)代食品科技 2021年1期
      關(guān)鍵詞:增菌蠟樣芽胞

      徐曉可,郭卉,鄧梅清,張菊梅,吳清平,丁郁,

      (1.廣東嶺南職業(yè)技術(shù)學(xué)院健康管理學(xué)院,廣東廣州 510663)(2.暨南大學(xué)理工學(xué)院食品科學(xué)與工程系,廣東廣州 510632)(3.廣東省微生物研究所省部共建華南應(yīng)用微生物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東廣州 510070)

      蠟樣芽胞桿菌(Bacillus cereus)是一種兼性需氧的革蘭氏陽(yáng)性菌,產(chǎn)芽胞,廣泛分布于土壤、水、空氣和各類生熟食品中[1]。食用了該菌污染的食品容易導(dǎo)致食物中毒,引起的食物中毒類型主要包括腹瀉型中毒和嘔吐型中毒,其中腹瀉型中毒主要與某些菌株分泌腸毒素相關(guān),而嘔吐型中毒主要是由于某些菌株產(chǎn)生嘔吐毒素引起[2-4]。

      國(guó)內(nèi)外均有報(bào)道蠟樣芽胞桿菌引起的食物中毒事件。1950年在挪威發(fā)表了第一起蠟樣芽胞桿菌食物中毒的報(bào)告,之后許多國(guó)家,尤其是歐洲一些國(guó)家相繼報(bào)告了類似食物中毒的爆發(fā)。挪威和荷蘭將蠟樣芽胞桿菌認(rèn)定為食品中最易檢出的病原微生物[5]。我國(guó)在上世紀(jì)70年代報(bào)道蠟樣芽胞桿菌中毒事件后,此類中毒事件的報(bào)道逐年增多。據(jù)2008~2015年我國(guó)國(guó)家食源性疾病監(jiān)測(cè)網(wǎng)統(tǒng)計(jì)資料顯示,微生物性食源性疾病占比39%,其中蠟樣芽胞桿菌引起的中毒事件占17%,在細(xì)菌性病原體中排在第三[6],危害極為嚴(yán)重。嘔吐型蠟樣芽胞桿菌引發(fā)的食物中毒時(shí)有發(fā)生,約占蠟樣芽胞桿菌食物中毒總數(shù)的 75.9%[7]。因此,建立一種快速、特異的方法檢測(cè)食品中產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌至關(guān)重要。

      目前檢測(cè)蠟樣芽胞桿菌的方法是食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)食品微生物學(xué)檢驗(yàn)蠟樣芽胞桿菌(GB 4789.14-2014),主要包括增菌、分離培養(yǎng)、鏡檢、生化鑒定、生化分型。對(duì)于分離的蠟樣芽胞桿菌主要是采用PCR或熒光定量PCR的方法鑒定其是否是嘔吐毒株(嘔吐毒素合成酶基因存在與否)。環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新興的檢測(cè)技術(shù),它以其特異性強(qiáng)、等溫靈敏、操作簡(jiǎn)單、產(chǎn)物易檢測(cè)等優(yōu)點(diǎn)在食品安全檢測(cè)等領(lǐng)域得到了日益廣泛的應(yīng)用。在食源性致病菌方面,目前已經(jīng)建立了副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、沙門氏菌(Salmonellaspp.)、克羅諾桿菌(Cronobacterspp.)和蠟樣芽胞桿菌等致病菌的LAMP技術(shù),但沒(méi)有從蠟樣芽胞桿菌中區(qū)分出產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌的LAMP檢測(cè)方法報(bào)道[8-11]。本研究旨在以產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌基因cesB為靶基因,設(shè)計(jì)LAMP反應(yīng)特異性引物,構(gòu)建LAMP反應(yīng)體系,建立一種產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌的特異快速檢測(cè)技術(shù),為衛(wèi)生檢驗(yàn)和食品質(zhì)量安全提供技術(shù)保障,不斷提高我國(guó)食品安全與公共衛(wèi)生控制水平。

      1 材料與方法

      1.1 菌株

      本試驗(yàn)收集菌株62株,所有菌株均由廣東省微生物研究所提供。

      1.2 培養(yǎng)基和試劑

      胰蛋白胨肉湯、LB肉湯等培養(yǎng)基:廣東環(huán)凱微生物科技有限公司;BstDNA聚合酶:NEB公司;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,2×PCR Mix:廣州東盛生物科技有限公司;顯色劑:廣州迪奧生物科技有限公司;dNTPs,DNA Marker2000:生工生物工程(上海)股份有限公司;MgSO4和甜菜堿:Sigma公司。

      1.3 主要儀器

      低溫高速離心機(jī):SIGMA 3K30,德國(guó)sigma公司;酶標(biāo)儀:EPOCH2,美國(guó)BioTek公司;PCR儀:Mini3220,杭州朗基科學(xué)儀器有限公司;電泳儀:DDR-6B,北京六一生物科技有限公司;凝膠成像系統(tǒng):Tanon-4600SF,上海天能科技有限公司;移液槍:德國(guó)Eppendorf公司;生化培養(yǎng)箱:SPX-150B-Z,上海博迅實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠;恒溫水浴鍋:XMTD-8222,上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司。

      1.4 方法

      1.4.1 細(xì)菌培養(yǎng)

      將菌株接種至在胰蛋白胨肉湯(TSB)培養(yǎng),36±1 ℃培養(yǎng) 16~18 h。

      1.4.2 DNA抽提

      試劑盒法:按照試劑盒說(shuō)明書提取細(xì)菌基因組DNA。

      煮沸法:取1 mL菌液或樣品增菌液于12000 r/min離心5 min,棄上清。加入200 μL無(wú)菌水洗滌1次后,用100 μL TE懸浮混勻,于100 ℃水浴10 min,冰浴3 min,12000 r/min離心5 min,取上清備用。

      1.4.3 引物設(shè)計(jì)

      表1 本研究所用引物序列Table 1 The sequence of primers

      (1)LAMP引物設(shè)計(jì):以產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌cesB為靶基因,設(shè)計(jì)LAMP引物,引物序列見(jiàn)表1,由上海生物工程公司合成。

      (2)PCR引物:參考文獻(xiàn)序列[12],由上海生物工程公司合成。

      1.4.4 LAMP擴(kuò)增

      LAMP 反 應(yīng) 體 系 25 μL, 包 括 2.5 μL 10×Thermopol反應(yīng)緩沖液、1.6 mmol/L dNTPs、0.2 μmol/L上游外引物F3、0.2 μmol/L下游外引物B3、1.6 μmol/L上游內(nèi)引物FIP、1.6 μmol/L下游內(nèi)引物BIP、6 mmol/L MgSO4、1 mol/L甜菜堿、8 UBstDNA聚合酶、3 μL細(xì)菌DNA模板,加dd H2O至體積25 μL,加入顯色劑在PCR管蓋。擴(kuò)增反應(yīng)條件:63 ℃恒溫水浴1 h,不用開(kāi)蓋,通過(guò)顏色直接觀察結(jié)果。

      1.4.5 PCR擴(kuò)增

      PCR反應(yīng)體系和PCR擴(kuò)增程序參考張志鴻等的報(bào)道[10]。用1×TAE電泳緩沖液配制2%瓊脂糖凝膠,上樣5 μL,100 V電壓下30 min電泳,用凝膠成像系統(tǒng)觀察電泳結(jié)果并進(jìn)行分析。

      1.4.6 LAMP特異性驗(yàn)證

      將表2中所有菌株接種至TSB增菌液中37 ℃培養(yǎng)16~18 h后,取1 mL菌液用煮沸法提取DNA,然后進(jìn)行LAMP擴(kuò)增,驗(yàn)證LAMP反應(yīng)體系的特異性。

      1.4.7 LAMP靈敏度評(píng)價(jià)

      1.4.7.1 基因組靈敏度

      將產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌F4810/72在TSB增菌液中37 ℃培養(yǎng)16~18 h后,取1 mL菌液,用DNA抽提試劑盒抽提DNA,用酶標(biāo)儀測(cè)定DNA濃度。將上述DNA進(jìn)行梯度稀釋,進(jìn)行LAMP擴(kuò)增,評(píng)價(jià)該方法的DNA靈敏度。

      1.4.7.2 純菌靈敏度

      將產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌F4810/72在TSB增菌液中37 ℃培養(yǎng)16~18 h后,取1 mL菌液,進(jìn)行梯度稀釋,用DNA抽提試劑盒抽提不同稀釋度的DNA,進(jìn)行LAMP擴(kuò)增,評(píng)價(jià)該方法的純菌靈敏度。同時(shí)對(duì)含不同稀釋度的菌液進(jìn)行平板計(jì)數(shù)。

      1.4.8 人工污染樣品檢測(cè)

      稱取經(jīng)國(guó)標(biāo)方法檢驗(yàn)不含蠟樣芽胞桿菌的新鮮米飯樣品25 g至225 mL LB培養(yǎng)基中,接種計(jì)數(shù)的產(chǎn)嘔吐毒素的蠟樣芽胞桿菌F4810/72菌液,人工模擬樣品的最終濃度分別為100cfu/g、101cfu/g、102cfu/g和103cfu/g,37 ℃靜置培養(yǎng),在0、2、4和6 h后分別從增菌培養(yǎng)基中取1 mL上清液于無(wú)菌離心管中,提取DNA進(jìn)行LAMP檢測(cè)。同時(shí)對(duì)含不同稀釋度的菌液進(jìn)行平板計(jì)數(shù)。

      表2 特異性試驗(yàn)所用菌株及實(shí)驗(yàn)結(jié)果Table 2 The specific detection of strains

      1.4.9 食品中產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌的檢測(cè)

      購(gòu)買各大超市和快餐店的食品 72份,其中熟食24份,水產(chǎn)品24份,奶制品24份。每份樣品平均分成2份,一份按GB 4789.14-2014分離檢測(cè);另一份直接用胰酪胨大豆多黏菌素肉湯培養(yǎng)基增菌培養(yǎng),取1.5 mL增菌液按上述煮沸法提取DNA,進(jìn)行LAMP檢測(cè)。

      2 結(jié)果與討論

      2.1 LAMP特異性

      為了驗(yàn)證所建立產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽孢桿菌LAMP方法的特異性,本研究將設(shè)計(jì)的LAMP引物分別擴(kuò)增2株產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌、19株蠟樣芽胞桿菌和41株非蠟樣芽胞桿菌的基因組DNA,檢測(cè)結(jié)果如表2所示。其中2株產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌均為陽(yáng)性,顯色反應(yīng)呈現(xiàn)綠色;19株蠟樣芽胞桿菌和41株非蠟樣芽胞桿菌均為陰性,顯色反應(yīng)呈現(xiàn)橙色。說(shuō)明該LAMP引物僅針對(duì)產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽孢桿菌cesB基因產(chǎn)生特異性擴(kuò)增,對(duì)蠟樣芽胞桿菌、蘇云金桿菌(Bacillus thuringiensis)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、單增李斯特菌(Listeria monocytogenes)、沙門氏菌等的DNA未產(chǎn)生擴(kuò)增反應(yīng),LAMP擴(kuò)增的特異性良好,可用于產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽孢桿菌的特異檢測(cè)。

      2.2 LAMP靈敏度

      2.2.1 DNA靈敏度

      圖1 LAMP DNA靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.1 Sensitivity of the LAMP assay with genomic DNA

      用DNA抽提試劑盒抽提產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌F4810/72基因組DNA,用酶標(biāo)儀測(cè)定DNA的濃度為124 ng/μL。將上述DNA進(jìn)行梯度稀釋,進(jìn)行LAMP擴(kuò)增結(jié)果表明,LAMP的靈敏度為1.49 pg/μL(圖1)。這與徐匆等(2020)建立的單增李斯特菌的LAMP基因組靈敏度相當(dāng)[13]。

      2.2.2 純菌靈敏度

      培養(yǎng)產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌F4810/72,純菌原始濃度為 5.0×108cfu/mL,梯度稀釋,分別取不同稀釋度菌懸液提取DNA,LAMP檢出情況見(jiàn)圖2。LAMP純菌靈敏度為 5.0×103cfu/mL。楊滴等建立了蠟樣芽胞桿菌的實(shí)時(shí)熒光定量PCR,其純菌靈敏度為1.0×103cfu/mL[14],與本研究的靈敏度相當(dāng)。周巍等建立了LAMP技術(shù)檢測(cè)酸乳中蠟樣芽孢桿菌,其純菌靈敏度為6.4 cfu/mL,高于本研究的靈敏度[15]。

      圖2 LAMP純菌靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.2 Sensitivity of the LAMP assay in pure culture

      2.3 人工污染樣品檢測(cè)

      培養(yǎng)產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌F4810/72,人工污染米飯的接種濃度分別為2.0×100、2.0×101、2.0×102、2.0×103cfu/g,0、2、4和6 h后分別取樣品增菌液用試劑盒和煮沸法提取 DNA,LAMP檢出情況見(jiàn)表 3和圖3。當(dāng)起始污染菌量為2 cfu/g時(shí),37 ℃增菌培養(yǎng)6 h,用試劑盒法和煮沸法提取的DNA,都可以檢出產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌。Martina(2007)等建立了產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌的實(shí)時(shí)熒光定量PCR。產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌人工污染米飯,經(jīng)過(guò)6 h增菌,煮沸法提取DNA,靈敏度為100cfu/g[16],本研究建立的LAMP體系靈敏度與其相當(dāng)。張志鴻等(2014)同樣建立了產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌的實(shí)時(shí)熒光定量PCR,產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌人工污染米飯,經(jīng)過(guò)2 h增菌,靈敏度為100cfu/g[12],高于本研究中的2 cfu/g,但該研究需要使用特定的熒光定量PCR儀器和專業(yè)人員操作,不利于在基層檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室大規(guī)模推廣使用,無(wú)法滿足現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)的要求。當(dāng)起始污染菌量大于2.0×103cfu/g時(shí),不用經(jīng)過(guò)增菌培養(yǎng),LAMP可直接檢測(cè)出產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌。Zhang(2014)等建立了產(chǎn)嘔吐毒素和非嘔吐毒素的蠟樣芽胞桿菌多重PCR,人工污染食品,不用經(jīng)過(guò)增菌培養(yǎng),其靈敏度為3.6×103cfu/g[17],與本研究的靈敏度相當(dāng)。

      綜上所述,在大批量實(shí)際樣品檢測(cè)時(shí),可以采用煮沸法提取DNA,從而節(jié)省時(shí)間和試劑。當(dāng)產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌污染食品的濃度超過(guò)103cfu/g時(shí),不需要增菌培養(yǎng)過(guò)程,可以直接檢出,從而縮短了檢測(cè)周期。由于食用蠟樣芽胞桿菌數(shù)量大于105cfu/g時(shí)有可能引起食物中毒甚至死亡,因此可以用本研究開(kāi)發(fā)的 LAMP方法直接快速篩查產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌,排查其風(fēng)險(xiǎn)。

      表3 產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌人工污染米飯不同濃度不同增菌時(shí)間的LAMP檢測(cè)Table 3 Effects of different levels and pre-incubation times of artificially contaminated rice on sensitivity of the LAMP detection of emetic B. cereus

      圖3 產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌人工污染米飯不同濃度不同增菌時(shí)間的LAMP檢測(cè)結(jié)果Fig.3 Results of different levels and pre-incubation times of artificially contaminated rice on sensitivity of the LAMP detection of emetic B. cereus

      2.4 食品中產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌的檢測(cè)

      72份食品樣品用傳統(tǒng)方法檢出2份產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌陽(yáng)性樣品,包括一份熟食和一份巴氏奶。直接用LAMP檢測(cè)72份食品樣品,也檢出2份產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌陽(yáng)性樣品,且同傳統(tǒng)方法一致,但比傳統(tǒng)方法的檢測(cè)時(shí)間大大縮短。

      3 結(jié)論

      本研究首次建立了基于cesB基因的產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌LAMP檢測(cè)方法。建立的方法具有特異性強(qiáng)、快速的優(yōu)點(diǎn)。在基因組DNA水平的靈敏度為1.49 pg/μL,純菌靈敏度為5.0×103cfu/mL。人工污染米飯樣品,當(dāng)起始污染量為2 cfu/g時(shí),37 ℃增菌培養(yǎng)6 h,即可檢出。當(dāng)產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌污染食品的濃度超過(guò)103cfu/g時(shí),不需要增菌培養(yǎng)過(guò)程,亦可以直接檢出。本研究建立的LAMP技術(shù)可應(yīng)用于食品樣品中產(chǎn)嘔吐毒素蠟樣芽胞桿菌的快速篩查檢測(cè),簡(jiǎn)便快捷,具有較好的推廣應(yīng)用前景。

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