周恪馳 何長(zhǎng)安 紀(jì)春學(xué) 王輝 張恒
摘 要:本文以實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)技術(shù)為例,對(duì)于玉米轉(zhuǎn)基因成分進(jìn)行分析。在具體處理中,會(huì)組建實(shí)驗(yàn)來(lái)完成陽(yáng)性質(zhì)粒、調(diào)控元件、目的基因、標(biāo)記基因等內(nèi)容的檢測(cè),從而積累有價(jià)值的數(shù)據(jù)信息,為后續(xù)同類型檢測(cè)活動(dòng)的順利開(kāi)展奠定基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:陽(yáng)性質(zhì)粒;轉(zhuǎn)基因成分;熒光PCR檢測(cè)技術(shù)
轉(zhuǎn)基因作物由于抗逆性強(qiáng)或產(chǎn)量高的優(yōu)點(diǎn),在全球范圍內(nèi)得以廣泛種植。近年來(lái),隨著轉(zhuǎn)基因作物種植面積的不斷增加,關(guān)于其在食品和環(huán)境安全等方面存在的爭(zhēng)議也越來(lái)越多,急需通過(guò)加強(qiáng)檢測(cè)來(lái)為監(jiān)管提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。熒光PCR技術(shù)具有實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)、靈敏度高、精密度高、定量準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),將其應(yīng)用到玉米轉(zhuǎn)基因成分檢測(cè)當(dāng)中,可以提升檢測(cè)效率和檢測(cè)精準(zhǔn)度,從而為食品安全性的不斷提升奠定基礎(chǔ)。
1 實(shí)驗(yàn)組建要點(diǎn)
1.1 材料和儀器
在此次實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,所使用到的材料為轉(zhuǎn)基因玉米樣品和非轉(zhuǎn)基因玉米樣品。而使用到的如下:①Probe ?q ?PCR ?Super ?Mix,為提升實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性,需評(píng)估合作公司,篩選綜合實(shí)力最強(qiáng)的公司進(jìn)行試劑的購(gòu)買(mǎi)。②核酸蛋白質(zhì)分析儀,可選擇Nanodrop 2000c這一型號(hào),以滿足相應(yīng)的分析需求。③實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增儀,選用7300plus型號(hào)儀器,使用前做好調(diào)試,確保后續(xù)活動(dòng)的順利推進(jìn)。④高速臺(tái)式離心機(jī),結(jié)合實(shí)際情況進(jìn)行選擇,以滿足后續(xù)應(yīng)用要求。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 進(jìn)行DNA提取
在對(duì)DNA進(jìn)行提取時(shí),多使用溴化十六烷三甲基銨來(lái)作為提取載體,從而獲取到轉(zhuǎn)基因玉米與非轉(zhuǎn)基因玉米的DNA基因組。對(duì)于提取后的DNA基因組,也需要利用核算蛋白質(zhì)分析儀來(lái)檢測(cè)具體濃度,此過(guò)程中也會(huì)提前將母液稀釋到100ng/μl,隨后將其放置在定量PCR模板中,并且在-20℃環(huán)境中進(jìn)行保存。
1.2.2 陽(yáng)性質(zhì)粒的構(gòu)建
作為陽(yáng)性質(zhì)控的陽(yáng)性質(zhì)粒對(duì)于轉(zhuǎn)基因檢測(cè)至關(guān)重要,陽(yáng)性質(zhì)控的檢出屬于非常重要的內(nèi)容,這也是順利完成轉(zhuǎn)基因檢測(cè)的基礎(chǔ)條件。在具體研究中,根據(jù)轉(zhuǎn)基因外源序列的信息構(gòu)建陽(yáng)性質(zhì)粒為核心的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。通過(guò)人工合成的方法來(lái)合成啟動(dòng)子基因、終止子基因、抗蟲(chóng)基因草丁膦抗性基因和篩選基因的堿基序列,隨后也會(huì)將其關(guān)聯(lián)在TOPO載體中,借助轉(zhuǎn)化的方式融入到感受態(tài)細(xì)胞中,等待基因穩(wěn)定之后,也會(huì)依次進(jìn)行PCR檢測(cè)處理、酶切處理、基因測(cè)序,獲取到相應(yīng)的數(shù)據(jù)信息,而搭建的陽(yáng)性質(zhì)粒也會(huì)用作陽(yáng)性質(zhì)控,滿足后續(xù)的應(yīng)用需求。
1.2.3 實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增
完成上述工作后,會(huì)對(duì)轉(zhuǎn)基因玉米樣品中的DNA序列進(jìn)行熒光PCR擴(kuò)增處理,所使用到的試劑如下:①Probe ?q ?PCR Super ?Mix共10μL;②正反向引物各1μL;③反應(yīng)探針1μL;④滅菌雙蒸水共計(jì)7μL。在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的反應(yīng)過(guò)程如下,在94℃溫度下進(jìn)行預(yù)變性處理,時(shí)間長(zhǎng)度為10min,隨后在94℃溫度下進(jìn)行變性處理,總時(shí)長(zhǎng)為30s,最后在94℃溫度下進(jìn)行延伸處理,總時(shí)長(zhǎng)為34s,如此循環(huán)處理40次后可以得到目標(biāo)物。在實(shí)驗(yàn)中也會(huì)將陽(yáng)性質(zhì)粒作為陽(yáng)性對(duì)照,而非轉(zhuǎn)基因玉米的DNA則會(huì)作為陰性對(duì)照,而滅菌處理后的超純水和空模板則會(huì)作為空白對(duì)照,由此來(lái)提升統(tǒng)計(jì)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
1.2.4 進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
完成上述工作后,利用實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增儀來(lái)對(duì)擴(kuò)增后數(shù)據(jù)進(jìn)行測(cè)量,然后利用分析軟件來(lái)對(duì)擴(kuò)增數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,主要以擴(kuò)增曲線、表格等方式進(jìn)行展示,從而提高數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果的直觀性。
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
2.1 陽(yáng)性質(zhì)粒檢測(cè)
在此次實(shí)驗(yàn)中,會(huì)將陽(yáng)性質(zhì)粒稀釋液作為模板,隨后向其中添加調(diào)控基因引物、目的基因引物和篩選基因引物,隨后利用熒光PCR實(shí)驗(yàn)儀來(lái)采集相應(yīng)數(shù)據(jù)。根據(jù)所統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)信息可以了解到,相較于其他載體,使用陽(yáng)性質(zhì)粒可以更好的和探針與引物進(jìn)行匹配,可以將其作為轉(zhuǎn)基因玉米樣品檢測(cè)時(shí)使用到的陽(yáng)性對(duì)照物,能夠基于此獲取到更加有效的分析數(shù)據(jù)。并且和轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性樣品的DNA進(jìn)行對(duì)比,所使用到的陽(yáng)性質(zhì)粒會(huì)作為質(zhì)控參考,而且利用其對(duì)外輸出時(shí)得到的數(shù)據(jù)也更加穩(wěn)定,這樣也更加有利于標(biāo)準(zhǔn)化陽(yáng)性質(zhì)控活動(dòng)的推進(jìn),得到準(zhǔn)確的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)信息。
2.2 調(diào)控元件檢測(cè)
在具體實(shí)驗(yàn)中,會(huì)將轉(zhuǎn)基因玉米樣品的DNA組,分別利用啟動(dòng)子(包括pCaMV35S引物、pRice-Actin引物和p ?FMV35S引物)、終止子引物(包括tNOS引物、tE9引物和tCaMV35S引物)進(jìn)行處理,待探針完成處理之后,也會(huì)借助熒光PCR儀對(duì)其進(jìn)行定量處理,隨后對(duì)于Ct數(shù)值進(jìn)行求解,常規(guī)情況下會(huì)將Ct≤35.0作為檢出時(shí)的判斷依據(jù)?;谒玫降南嚓P(guān)數(shù)據(jù)可以了解到,利用啟動(dòng)子引物處理的DNA組和終止子引物處理的DNA組中都順利檢出,所得到Ct平均值為29.35±0.13(pCaMV35S基因)、31.23±0.23(pRice-Actin基因)、28.35±0.35(tNOS基因)、30.11±0.21(tCaMV35S基因)、36.75±0.12(p ?FMV35S基因)和40.32±0.25(tE9基因),由數(shù)據(jù)可以看出,轉(zhuǎn)基因玉米樣品中并不包含p ?FMV35S基因和tE9基因,但其他基因都包含在內(nèi)[1]。
2.3 目的基因分析
在目的基因分析過(guò)程中,主要目的是篩選抗蟲(chóng)基因(包括Cry1A(c)基因、Cry3A基因)、抗除草劑基因(包括CP4-EPSPS基因、CTP2-CP4-EPSPS基因)、草丁膦抗性基因(Bar基因),查看其在轉(zhuǎn)基因玉米樣品中的存在情況。具體實(shí)踐中會(huì)借助熒光PCR儀對(duì)其進(jìn)行定量處理,隨后對(duì)于Ct數(shù)值進(jìn)行求解,常規(guī)情況下會(huì)將Ct≤35.0作為檢出時(shí)的判斷依據(jù)。根據(jù)所得到的檢測(cè)數(shù)據(jù)可以了解到,所得到的Ct數(shù)值為27.35±0.13(Cry1A(c)基因)、31.23±0.23(CP4-EPSPS基因)、29.35±0.25(CTP2-CP4-EPSPS基因)、36.11±0.21(Cry1A(c)基因)和41.75±0.12(Bar基因),根據(jù)數(shù)據(jù)可以了解到,在轉(zhuǎn)基因玉米樣品中,Cry1A(c)基因和Bar基因并沒(méi)有檢出,而其它基因都順利檢出,表示樣品中含有這些基因[2]。
2.4 篩選標(biāo)記基因
在標(biāo)記基因分析過(guò)程中,主要目的是篩選PMI基因、NPTII基因,具體實(shí)踐中會(huì)借助熒光PCR儀對(duì)其進(jìn)行定量處理,隨后對(duì)于Ct數(shù)值進(jìn)行求解,常規(guī)情況下會(huì)將Ct≤35.0作為檢出時(shí)的判斷依據(jù)。根據(jù)所得到的檢測(cè)數(shù)據(jù)可以了解到,所得到的Ct數(shù)值為33.36±0.21(PMI基因)、42.35±0.45(NPTII基因),根據(jù)所得數(shù)據(jù)可以了解到,在轉(zhuǎn)基因玉米樣品中包含了PMI基因,但是沒(méi)有NPTII基因[3]。
結(jié)束語(yǔ):綜上所述,在本文研究中,利用熒光PCR檢測(cè)法來(lái)確定轉(zhuǎn)基因玉米中的基因組成,并且具備了良好的應(yīng)用效果[4]。通過(guò)梳理應(yīng)用時(shí)需要注意的相關(guān)內(nèi)容,不僅可以積累價(jià)值數(shù)據(jù),而且也為后續(xù)檢測(cè)活動(dòng)的順利開(kāi)展提供了科學(xué)參考。
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