陳蒙恩,侯建光,張振科,韓素娜,李建民,陳偉平,王二英,胡曉龍
(1.河南仰韶酒業(yè)有限公司,河南 三門峽 472400;2.河南仰韶生物科技有限公司,河南 三門峽 472400;3.鄭州輕工業(yè)大學(xué),河南 鄭州 450002)
中國(guó)白酒歷史悠久,它是以高粱等谷物為原料,以酒曲為糖化發(fā)酵劑,經(jīng)蒸煮、發(fā)酵、蒸餾等工藝而制成的,因此,酒曲在釀酒過程中扮演著重要的角色[1-3]。固態(tài)法白酒大多采用大曲作為糖化發(fā)酵劑,它蘊(yùn)含了釀酒所需的多種微生物和酶,可促使原料發(fā)生糖化、發(fā)酵和產(chǎn)香等生化反應(yīng),從而賦予白酒獨(dú)特的風(fēng)味,而大曲中的微生物則是決定大曲品質(zhì)的核心因素[4-7]。研究表明,大曲在白酒釀造過程中不僅提供了大量的釀酒功能微生物,其本身所含有的大量風(fēng)味物質(zhì)或其前體物質(zhì)在釀造過程中亦可直接或間接地進(jìn)入酒體,從而賦予白酒獨(dú)特的風(fēng)味,并對(duì)白酒的質(zhì)量起到關(guān)鍵作用[1,5,8]。目前,對(duì)大曲的研究多趨向于單一的風(fēng)味或微生物指標(biāo)[9],而對(duì)微生物與風(fēng)味成分之間的相關(guān)性以及如何基于現(xiàn)代檢測(cè)手段,建立更加全面科學(xué)的大曲評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)的研究較少。
以往對(duì)大曲微生物的研究多采用傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法[10],但該方法自身存在一定缺陷,無法全面地認(rèn)識(shí)大曲中的微生物[11-12]。相比之下,高通量測(cè)序技術(shù)作為新一代測(cè)序手段,可方便快捷地對(duì)樣品中復(fù)雜的微生物菌群結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析[9,13-14],且高通量測(cè)序檢測(cè)到的是樣品中所有微生物的脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)序列,能夠更加客觀的反應(yīng)樣品中微生物群落結(jié)構(gòu)的真實(shí)性[15]。目前,利用高通量技術(shù)對(duì)大曲中微生物群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,并進(jìn)一步對(duì)大曲的揮發(fā)性風(fēng)味成分進(jìn)行相關(guān)性研究已有文獻(xiàn)報(bào)道[16-17],但對(duì)陶融型大曲[18-19]微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性與揮發(fā)性風(fēng)味成分的相關(guān)性研究尚未見報(bào)道。
本研究采用高通量測(cè)序手段,對(duì)成品陶融型大曲的微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性進(jìn)行研究,得出陶融型大曲中主要的微生物群落構(gòu)成,并與大曲的揮發(fā)性風(fēng)味成分進(jìn)行相關(guān)性分析,為解析陶融型大曲的生香機(jī)理及篩選優(yōu)良釀造功能微生物提供堅(jiān)實(shí)的理論依據(jù);同時(shí),可通過進(jìn)一步研究,將個(gè)別優(yōu)勢(shì)釀酒功能微生物作為優(yōu)質(zhì)大曲的評(píng)判指標(biāo),結(jié)合原有評(píng)價(jià)體系,有望形成一套更加合理的大曲評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。
1.1.1 大曲樣品
對(duì)河南某公司夏季同時(shí)培養(yǎng)的4房陶融型大曲成品進(jìn)行取樣,大曲的培養(yǎng)時(shí)間為30 d,每房曲均采用四點(diǎn)中心法進(jìn)行取樣(大曲在入房培養(yǎng)室時(shí)對(duì)要取樣的曲塊進(jìn)行標(biāo)記,在大曲培養(yǎng)過程中進(jìn)行翻曲、打攏、并房時(shí)仍將其放至指定位置),樣品粉碎后過40目篩,采用四分法濃縮后至于無菌袋內(nèi)4 ℃保存。
1.1.2 主要試劑
DNA Ladder 2000、DL 2000 TMDNA Marker:寶生物工程(大連)有限公司;Soil DNA Kit提取試劑盒:美國(guó)OMEGA公司;蛋白酶K、溶菌酶:美國(guó)Sigma公司;AxyPrep DNA凝膠回收試劑盒:美國(guó)AxyPrepDNA公司。
SW-CJ-VS2 型超凈工作臺(tái):無錫易純凈化設(shè)備有限公司;TGL-20M高速冷凍離心機(jī):上海盧湘儀離心機(jī)儀器有限公司;NanoDrop 2000微量分光光度計(jì):美國(guó)ThermoFisher公司;GeneAmp?9700 型聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀:美國(guó)ABI公司;MX-S型可調(diào)式混勻儀:美國(guó)SCILOGEX公司;QuantiFluorTM-ST 藍(lán)色熒光定量系統(tǒng):美國(guó)Promega公司。
1.3.1 大曲揮發(fā)性風(fēng)味成分檢測(cè)
利用頂空固相微萃取及氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(headspacesolidphasemicroextractionandgaschromatographymass spectrometry,HS-SPME-GC-MS)[20]對(duì)剛培養(yǎng)成熟的4房陶融型大曲的揮發(fā)性風(fēng)味成分進(jìn)行檢測(cè)。
HS-SPME條件:準(zhǔn)確稱取3.0 g大曲樣品置于20 mL頂空瓶中;孵化爐溫度設(shè)為60 ℃,孵化10 min;萃取40 min;進(jìn)樣口溫度設(shè)為260 ℃,解吸2 min;后自動(dòng)進(jìn)行GC-MS分析。
GC-MS條件:毛細(xì)管色譜柱為DB-FFAP(60m×250μm×0.25 μm),260 ℃條件下自動(dòng)不分流進(jìn)樣;程序升溫:35 ℃保持3 min,5 ℃/min升至100 ℃保持3 min,5 ℃/min升至150 ℃保持3min,10℃/min升至230℃保持3 min;載氣:高純度氦氣(He),流速為1.00 mL/min;離子源:電子電離(electron ionization,EI)源,電子能量70 eV,傳輸線溫度280 ℃,離子源溫度300 ℃,掃描范圍30~550 u。
定性及半定量:將大曲揮發(fā)性風(fēng)味物質(zhì)的質(zhì)譜圖與標(biāo)準(zhǔn)譜庫(kù)(NIST05a.L)進(jìn)行對(duì)比鑒定,匹配度>800的鑒定結(jié)果予以確認(rèn);以乙酸正丁酯為內(nèi)標(biāo),將大曲樣品中鑒定的揮發(fā)性化合物的濃度與乙酸丁酯質(zhì)量濃度作比進(jìn)行計(jì)算。
1.3.2 大曲微生物總DNA提取及PCR擴(kuò)增定量
采用Soil DNA Kit對(duì)大曲微生物總基因組DNA進(jìn)行提取,提取方法按照試劑公司提供的實(shí)驗(yàn)操作指南進(jìn)行。利用NanoDrop 2000微量分光光度計(jì)對(duì)提取的微生物DNA濃度及純度進(jìn)行檢測(cè),將檢測(cè)合格的DNA提取物置于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>
PCR采用TransGen AP221-02,TransStart Fastpfu DNA聚合酶,20μL反應(yīng)體系:5×FastPfuBuffer4μL,2.5mmol/L脫氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphates,dNTPs)2 μL;正向引物(5μmol/L)0.8μL;反向引物(5μmol/L)0.8μL;FastPfu聚合酶0.4μL;牛血清蛋白(bovineserumalbumin,BSA)0.2 μL;Template DNA 10 ng;補(bǔ)雙蒸水(ddH2O)至20 μL。PCR擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,28個(gè)循環(huán)后;72 ℃延伸10 min,10 ℃保持至停止。每個(gè)樣本按照正式實(shí)驗(yàn)進(jìn)行3個(gè)重復(fù),同一樣本的擴(kuò)增產(chǎn)物合并混合后進(jìn)行電泳檢測(cè),采用AxyPrepDNA凝膠回收試劑盒對(duì)不同樣本的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行切膠回收,Tris HCl洗脫;2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),同時(shí)對(duì)不同大曲樣本的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行熒光定量。
1.3.3 高通量測(cè)序與數(shù)據(jù)分析
樣本的建庫(kù)和測(cè)序由上海凌恩生物科技有限公司完成。高通量測(cè)序針對(duì)細(xì)菌16S rRNA基因515F_907R區(qū)域,真菌ITS1F_ITS2R區(qū)序列,設(shè)計(jì)帶核苷酸便簽[21]的特異引物,測(cè)序平臺(tái)為Illumina MiSeq。通過雙末端測(cè)序[22],將基因序列進(jìn)行初級(jí)篩選,通過barcode找對(duì)應(yīng)編號(hào)樣本,去掉引物,再把質(zhì)量差的序列剔除。通過提取優(yōu)化序列中的非重復(fù)序列,降低分析中間過程冗余計(jì)算量(http://drive5.com/usearch/manual/dereplication.html);去除沒有重復(fù)的單序列(http://drive5.com/usearch/manual/singletons.html);操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU)聚類采用97%的相似性進(jìn)行,去除嵌合體后得到OTU的代表序列。
1.3.4 相關(guān)性分析[23]
數(shù)據(jù)采用SPSS19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析、繪圖采用Origin9.0軟件、相關(guān)性分析采用SPSS19.0軟件,顯著性水平設(shè)定在5%。
對(duì)剛培養(yǎng)成熟的4房陶融型大曲的揮發(fā)性風(fēng)味成分進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果見表1。由表1可知,4房大曲共檢測(cè)到45種揮發(fā)性風(fēng)味成分,分為9類,其中酯類化合物種類及含量最高(17種,含量為331.92 μg/g),其次是醇類化合物(7種,含量為273.34 μg/g)、芳香族類化合物(3種,含量為184.88 μg/g)和吡嗪類化合物(4種,含量為65.99 μg/g)。
通過Illumina PE250高通量測(cè)序篩選獲取有效基因組序列信息,測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)見表2。由表2可知,經(jīng)過分析統(tǒng)計(jì),4房大曲樣品共獲得細(xì)菌有效序列145 532條,平均長(zhǎng)度在370 bp以上,測(cè)序長(zhǎng)度主要分布在351~400 bp(99.98%)之間,與設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增長(zhǎng)度接近,由此判斷測(cè)序結(jié)果較好。共獲得真菌有效序列149 091條,平均長(zhǎng)度約為280 bp,測(cè)序長(zhǎng)度集中分布在251~300 bp,與設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增序列長(zhǎng)度為300 bp左右較接近,說明本次測(cè)序結(jié)果較合理,保證了足夠的測(cè)序數(shù)量,可以滿足后續(xù)的數(shù)據(jù)分析。
表2 文庫(kù)測(cè)序情況數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)Table 2 Statistics of sequences data
稀釋曲線可以用來比較測(cè)序數(shù)據(jù)量不同的樣本中物種的豐富度,當(dāng)曲線趨向平緩時(shí),更多的數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的OTU,反之則表明繼續(xù)測(cè)序還可能產(chǎn)生較多新的OTU[16]。對(duì)不同樣品之間共有的以及獨(dú)有的OTU數(shù)進(jìn)行疊加,得出4個(gè)大曲樣本中微生物OTU分布的Venn圖[26-28]見圖1。由圖1可知,4房陶融型大曲中共獲得細(xì)菌OTU數(shù)目為68個(gè),其中共同擁有的OTU數(shù)目為44個(gè),占OTU總數(shù)的65%;共獲得真菌OTU數(shù)目為47個(gè),其中共同擁有的OTU數(shù)目為25個(gè),占OTU總數(shù)的53%。
圖1 大曲文庫(kù)內(nèi)OTU的韋恩圖Fig.1 Venn diagram of OTUs of Daqu libraries
為研究樣品的取樣量能否代表原樣品物種豐富度,對(duì)樣品的個(gè)數(shù)和物種的種類做稀釋分布曲線[29-30],從而評(píng)估所構(gòu)建的文庫(kù)的覆蓋率是否達(dá)到飽和,結(jié)果見圖2;以97%的序列相似度水平作為OTU的界定,通過分析樣品的OTU數(shù)目及分布情況,來反映樣品中所含種群的多樣性及豐富度;通過Shannon指數(shù)[31]反映樣本中微生物多樣性;Rank-Abundance[32]來解釋樣品物種豐度和物種均勻度,結(jié)果見圖3、圖4。
圖2 樣品稀釋性曲線Fig.2 Rarefaction curve of samples
圖3 樣本的Shannon曲線Fig.3 Shannon curves of samples
圖4 OTU等級(jí)豐度曲線Fig.4 OTU rank-abundance curves
根據(jù)圖2和圖3的結(jié)果可得,各曲樣的稀釋性曲線和Shannon曲線都隨測(cè)序深度的增加呈現(xiàn)先增加后趨于平緩的趨勢(shì),這表明測(cè)序數(shù)據(jù)量合理,測(cè)序深度能夠反映出樣品中絕大多數(shù)微生物的物種信息。圖2中細(xì)菌文庫(kù)內(nèi)OTU數(shù)目表現(xiàn)為ZW4>ZW5>ZW1>ZW2;真菌文庫(kù)的OTU數(shù)目表現(xiàn)為ZW4>ZW1>ZW5>ZW2,與細(xì)菌文庫(kù)基本一致。從Rank-abundance曲線(圖4)可以看出,細(xì)菌微生物多樣性豐度及均勻度均高于真菌。
對(duì)大曲樣品中微生物OTUs信息豐度進(jìn)行加權(quán)聚類分析[33-34],結(jié)果見圖5、圖6。由圖5、圖6可知,從獲得的145 532條大曲細(xì)菌優(yōu)質(zhì)序列中可以歸類到7個(gè)門,分別為變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)、藍(lán)藻門(Cyanobacteria)、梭桿菌門(Fusobacteria)、未分類細(xì)菌(Bacteria-Unclassified)。其中變形菌門、厚壁菌門和放線菌門占比較大,分別為52.22%、41.51%和2.52%,厚壁菌門為大曲中的優(yōu)勢(shì)微生物,可能是優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬屬于該門,且厚壁菌門主要由芽孢桿菌綱(Bacilli)和梭菌綱(Clostridia)等微生物組成[35],具有很強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)性,能夠在相對(duì)極端的條件保持生長(zhǎng)代謝;放線菌廣泛分布于土壤環(huán)境、海洋環(huán)境、植物體及其他極端自然生態(tài)環(huán)境中,和厚壁菌門相似,也具有極強(qiáng)的耐受性[36]。從獲得的149 091條大曲真菌優(yōu)質(zhì)序列中可以歸類到3個(gè)門,分別為子囊菌門(Ascomycota)、接合菌門(Zygomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)。其中子囊菌門真菌占比最大,達(dá)99.38%,接合菌門和擔(dān)子菌門共占0.62%。
圖5 聚類樹與柱狀圖組合Fig.5 Cluster tree and histogram combination
圖6 微生物群落結(jié)構(gòu)Fig.6 Structure of microbial community
在屬的水平上細(xì)菌共得到40個(gè)屬,將豐度低于1%的合并為一類(Others),由圖6可知,4個(gè)曲樣中豐度較高的為泛菌屬(Pantoea,45.32%)、芽孢桿菌屬(Bacillus,15.15%)、明串珠菌屬(Leuconostoc,10.89%)、克羅諾桿菌屬(Cronobacter,8.36%)、乳桿菌屬(Lactobacillus,6.02%)、魏斯氏菌屬(Weissella,5.02%)、糖多孢菌屬(Saccharopolyspora,1.88%)、嗜熱放線菌(Thermoactinomyces,1.63%)、克羅彭斯特菌屬(Kroppenstedtia,1.58%)、葡萄球菌屬(Staphylococcus,1.02%)、Mitochondrianorank(1.08%)、乳球菌屬(Lactococcus,0.86%)。4個(gè)曲樣的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬為泛菌屬、芽孢桿菌屬、明串珠菌屬、克羅諾桿菌屬、乳桿菌屬和魏斯氏菌屬。
4個(gè)曲樣中,在屬的水平上真菌OTU可歸為28個(gè)屬。真菌群落豐度不如細(xì)菌群落,是因?yàn)榇笄谂囵B(yǎng)過程中頂火溫度超過50 ℃,致使大部分真菌死亡,只有少部分耐熱和嗜熱真菌得以存活[37-38]。4個(gè)曲樣中的優(yōu)勢(shì)真菌屬為嗜熱子囊菌屬(Thermoascus,44.07%)、Unidentified(37.58%)、曲霉屬(Aspergillus,10.04%)、嗜熱真菌屬(Thermomyces,3.79%)、鏈格孢霉屬(Alternaria,1.78%)、泡波曲霉屬(Emericella,1.02%)、威克漢姆酵母(Wickerhamomyces,0.78%)、根毛霉屬(Rhizomucor,0.42%)。
大曲優(yōu)勢(shì)微生物與風(fēng)味物質(zhì)的相關(guān)性分析結(jié)果見表3。由表3可知,芽孢桿菌屬(Bacillus)、乳桿菌屬(Lactobacillus)與吡嗪類、芳香族類、酸類、酯類均呈顯著正相關(guān)性(P<0.05),芽孢桿菌等耐熱微生物是大曲中吡嗪類、芳香族類等風(fēng)味物質(zhì)的主要產(chǎn)生菌,在其他學(xué)者的研究成果中已有報(bào)道[39-43],這與本研究結(jié)果保持一致;魏斯氏菌屬(Weissella)與吡嗪類、酮類、酸類、酯類均呈顯著正相關(guān)性(P<0.05),這與現(xiàn)有文獻(xiàn)相一致[44]。通過對(duì)大曲中的微生物和揮發(fā)性風(fēng)味成分進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)合傳統(tǒng)感官對(duì)大曲的認(rèn)識(shí),能夠找到感官指標(biāo)與微生物形態(tài)呈現(xiàn)的關(guān)系,如果通過進(jìn)一步研究,將個(gè)別優(yōu)勢(shì)微生物作為大曲評(píng)判的指標(biāo),結(jié)合原有評(píng)價(jià)體系,能夠形成一套對(duì)大曲更加合理的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。
表3 微生物與風(fēng)味成分的相關(guān)性Table 3 Correlation between microbe and flavor component
續(xù)表
大曲是白酒釀造中功能微生物的主要來源,大曲微生物群落結(jié)構(gòu)的組成往往決定著白酒的質(zhì)量。本研究利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)成品陶融型大曲的微生物群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了系統(tǒng)研究,結(jié)果表明,剛出房的成品陶融型大曲中細(xì)菌的物種多樣性高于真菌,大曲中共檢測(cè)到細(xì)菌OTU數(shù)為68,真菌OTU數(shù)為47。微生物豐度統(tǒng)計(jì)表明,大曲細(xì)菌優(yōu)勢(shì)菌屬主要為泛菌屬、芽孢桿菌屬、明串珠菌屬、克羅諾桿菌屬、乳桿菌屬和魏斯氏菌屬六大類,六類菌屬共占大曲細(xì)菌多樣性的90.76%,同時(shí)還檢測(cè)到了糖多孢菌屬、嗜熱放線菌、Mitochondrianorank、乳球菌屬等;大曲的優(yōu)勢(shì)菌屬主要為嗜熱子囊菌屬、曲霉屬、嗜熱真菌屬、鏈格孢霉屬、泡波曲霉屬五大類,五類菌屬共占大曲真菌多樣性的60.70%,同時(shí)還檢測(cè)到了鏈格孢霉屬、泡波曲霉屬、威克漢姆酵母、根毛霉屬等。相關(guān)性分析結(jié)果表明,大曲中厚壁菌門下的芽孢桿菌屬、乳桿菌屬與大曲中吡嗪類、酯類、芳香族類等多數(shù)揮發(fā)性風(fēng)味成分呈顯著正相關(guān)性,說明這兩類微生物是大曲制作過程中風(fēng)味物質(zhì)的主要產(chǎn)生菌,這與以往其他學(xué)者的研究結(jié)果相一致。
開放的制作環(huán)境是大曲微生物的主要來源,獨(dú)特的制曲工藝和地域菌群環(huán)境是造酒陶融型大曲特有微生物菌群構(gòu)成的根本。因此,對(duì)大曲微生物群落結(jié)構(gòu)的構(gòu)成及大曲揮發(fā)性風(fēng)味成分的相關(guān)性進(jìn)行系統(tǒng)研究,將有助于解析陶融型白酒典型風(fēng)格的成因。同時(shí),可結(jié)合大曲傳統(tǒng)的感官評(píng)價(jià)體系,將個(gè)別優(yōu)勢(shì)釀酒功能微生物作為大曲評(píng)判的指標(biāo),有望形成一套對(duì)大曲更加合理的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。該研究結(jié)果為解析陶融型大曲揮發(fā)性風(fēng)味物質(zhì)的形成機(jī)理及完善大曲質(zhì)量評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)提供了新的視角。