羅氏沼蝦不同育種群體遺傳多樣性研究

唐瓊英 謝巨洪 夏正龍 蔡繆熒 吳云明 白鹿淮 杜厚寬李景芬 楊國(guó)梁,

(1. 湖州師范學(xué)院浙江省水生生物資源養(yǎng)護(hù)與開發(fā)技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院水生動(dòng)物繁育與營(yíng)養(yǎng)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 湖州 313000; 2. 江蘇數(shù)豐水產(chǎn)種業(yè)有限公司, 高郵 225654)

羅氏沼蝦(Macrobrachium rosenbergii)原產(chǎn)于東南亞的熱帶和亞熱帶地區(qū), 是淡水蝦類養(yǎng)殖中個(gè)體最大的品種[1]。中國(guó)大陸自1976年引進(jìn)以來(lái), 已產(chǎn)生了可觀的經(jīng)濟(jì)效益并擁有良好的發(fā)展前景。但長(zhǎng)期以來(lái), 由于人工養(yǎng)殖中親本管理不嚴(yán)謹(jǐn)(如近交等)導(dǎo)致種質(zhì)衰退嚴(yán)重(如生長(zhǎng)緩慢、病害頻發(fā)等)[2], 尤其是近年來(lái)發(fā)生的長(zhǎng)不大、性成熟提前的“鐵蝦”, 使羅氏沼蝦產(chǎn)業(yè)遭受了巨大危害。因此,進(jìn)一步培育滿足產(chǎn)業(yè)與市場(chǎng)需求的經(jīng)濟(jì)性狀優(yōu)良的羅氏沼蝦新品種或新品系迫在眉睫。遺傳多樣性是物種進(jìn)化的基礎(chǔ), 與進(jìn)化潛力和適應(yīng)力呈正相關(guān), 遺傳多樣性越高的群體, 其生產(chǎn)性狀如活力、生長(zhǎng)速度、產(chǎn)卵量、環(huán)境適應(yīng)力及抗病性能等提高的潛力越大[3]。因此, 遺傳多樣性水平不僅制約著生物的適應(yīng)性進(jìn)化, 也是選擇育種的前提。

微衛(wèi)星(Microsatellite)即短串聯(lián)重復(fù)序列(Short tandem repeats, STRs)或簡(jiǎn)單重復(fù)序列(Simple sequence repeats, SSR), 是一種廣泛應(yīng)用于群體遺傳多樣性檢測(cè)及親緣關(guān)系鑒定的分子標(biāo)記[4,5]。線粒體DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)是一種核外的遺傳物質(zhì), 因具有結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、進(jìn)化速度適中、易擴(kuò)增等優(yōu)點(diǎn), 被認(rèn)為是研究群體遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的有力工具[6,7]。目前, 針對(duì)羅氏沼蝦不同野生或養(yǎng)殖群體, 已有一些采用微衛(wèi)星標(biāo)記[3,8—12]或線粒體基因[13—15]進(jìn)行遺傳多樣性的研究報(bào)道, 但這些研究多集中在不同的養(yǎng)殖群體上, 親本來(lái)源背景未知, 且部分研究采用的群體較少, 如鐘丹丹等[3]僅研究了2個(gè)群體。另外, 在已有的線粒體基因研究中, 各群體覆蓋的個(gè)體數(shù)極少, 如楊學(xué)明等[13]3個(gè)群體僅17個(gè)個(gè)體, 姚茜等[14]3個(gè)群體僅16個(gè)個(gè)體, 且研究采用的基因片段大多數(shù)較短, 約400—500 bp, 提供的信息量有限。目前羅氏沼蝦中還未見(jiàn)將微衛(wèi)星和線粒體基因相結(jié)合對(duì)群體遺傳多樣性進(jìn)行研究的報(bào)道。微衛(wèi)星和線粒體分別是細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)遺傳, 將二者相結(jié)合進(jìn)行研究, 能更全面地反映生物的遺傳多樣性, 應(yīng)用較為廣泛, 如東北林蛙(Rana dybowskii)[16]、中華蜜蜂(Apiscerana cerana)[17]、梨小食心蟲(Grapholita molesta)[18]等物種的遺傳多樣性研究等。

本研究將微衛(wèi)星和線粒體基因相結(jié)合, 對(duì)羅氏沼蝦不同種質(zhì)資源的育種群體進(jìn)行遺傳多樣性研究, 期望全面了解國(guó)內(nèi)已有種質(zhì)資源的遺傳背景,為優(yōu)良品種選育提供參考資料。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料

實(shí)驗(yàn)材料為取自羅氏沼蝦育種基地(江蘇數(shù)豐水產(chǎn)種業(yè)有限公司)培育及收集的不同來(lái)源的4個(gè)育種群體, 包括: 選育3代的數(shù)豐核心群體(SF)、引進(jìn)的正大群體(ZD)、正大和數(shù)豐雜交的群體(ZDS)、正大子代和數(shù)豐雜交的群體(ZD2S)。數(shù)豐核心群體因群體數(shù)量較大選取60個(gè)個(gè)體, 其他每個(gè)群體各取30個(gè)個(gè)體, 分別剪取蝦尾肌肉組織, 用95%的乙醇保存, 并凍存于-20℃冰箱, 供后續(xù)DNA提取。

1.2 基因組DNA提取、PCR擴(kuò)增和測(cè)序

肌肉組織基因組DNA提取采用高鹽抽提法,用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)提取DNA的完整性,微量分光光度計(jì)檢測(cè)濃度和純度后, 用滅菌水稀釋至50 ng/μL供后續(xù)PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)。

采用7對(duì)熒光修飾標(biāo)記(HEX或FAM)的微衛(wèi)星引物對(duì)各群體進(jìn)行PCR擴(kuò)增。微衛(wèi)星引物來(lái)自文獻(xiàn)[3, 8]及本團(tuán)隊(duì)開發(fā)的引物。引物序列、目的片段大小及擴(kuò)增條件見(jiàn)表 1。PCR反應(yīng)體系為20 μL,包括: 2×TaqMix (TaKaRa) 10 μL、10 μmol/L的上下游引物各1 μL、滅菌水 7 μL和DNA 1 μL。PCR反應(yīng)程序?yàn)? 95℃預(yù)變性3min, 然后94℃變性30s、54—62℃退火30s、72℃延伸45s, 重復(fù)35次循環(huán), 最后72℃延伸10min。

線粒體COⅠ和12S rRNA基因的引物根據(jù)羅氏沼蝦GenBank中的線粒體基因組全序列(登錄號(hào)為AY659990和NC006880)進(jìn)行設(shè)計(jì)。PCR反應(yīng)體系為50 μL, 其中包括: 滅菌水31 μL、10×buffer 5 μL、2.5 mmol/L的dNTP(TaKaRa) 4 μL、25 mmol/L的MgC12(TaKaRa) 3 μL、10 μmol/L的上下游引物分別為 1 μL、5 U/μL的Taq酶(TaKaRa) 0.2 μL和DNA 4.8 μL。PCR反應(yīng)采用Touchdown程序: 95℃預(yù)變性5min; 然后95℃變性30s、56—62℃退火30s、72℃延伸30s, 重復(fù)10次循環(huán), 每次循環(huán)降低1℃; 然后再95℃變性30s、52℃退火30s、72℃延伸30s, 重復(fù)25次循環(huán); 最后72℃延伸20min。

表1 用于本研究的微衛(wèi)星引物相關(guān)信息Tab. 1 Primers used in the present study

PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè)。微衛(wèi)星分型使用ABI3730XL全自動(dòng)DNA測(cè)序儀進(jìn)行, 獲得每個(gè)個(gè)體在不同微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)據(jù), 采用軟件GeneMarker V2.2.0對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小進(jìn)行讀取。線粒體基因采用與PCR擴(kuò)增相同的引物進(jìn)行雙向測(cè)序。以上測(cè)序工作均由武漢天一輝遠(yuǎn)生物科技公司完成。

1.3 數(shù)據(jù)處理

對(duì)獲得的微衛(wèi)星位點(diǎn)分型數(shù)據(jù)進(jìn)行校正。利用Genepop 4.0軟件進(jìn)行哈迪溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE)檢驗(yàn)。采用Cervus 3.0軟件計(jì)算等位基因數(shù)(Na)、觀測(cè)雜合度(Ho)、期望雜合度(He)和多態(tài)信息量(PIC)。利用Arlequin 3.5軟件來(lái)估計(jì)各種群間遺傳分化指數(shù)(FST), 進(jìn)行分子變異分析(AMOVA), 包括群體內(nèi)以及群體間變異。

線粒體基因序列用Clustal X2.1軟件進(jìn)行比對(duì),并在Seaview中進(jìn)行手工校正。采用MEGA7.0.26對(duì)序列的基本信息進(jìn)行統(tǒng)計(jì), 如序列長(zhǎng)度、堿基組成、變異位點(diǎn)的數(shù)目和簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)目等。利用軟件DnaSP 5.0和Arlequin進(jìn)行單倍型數(shù)目(Number of haplotype,H)、單倍型多樣性(Haplotype diversity,Hd)和核苷酸多樣性(Nucleotidae diversity,π)等參數(shù)估計(jì), 并采用最大似然 (ML)法對(duì)單倍型序列進(jìn)行聚類分析。

2 結(jié)果

2.1 基于微衛(wèi)星位點(diǎn)的羅氏沼蝦育種群體遺傳多樣性

經(jīng)檢驗(yàn), 7個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)都極顯著偏離哈迪溫伯格平衡(P<0.01)。所有群體所有微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)(Na)為14—24個(gè), 平均每個(gè)位點(diǎn)為19.43個(gè)等位基因, 平均觀測(cè)雜合度(Ho)、期望雜合度(He)和多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.615、0.898和0.887。在7個(gè)位點(diǎn)中, 座位29AG62的He和PIC都最高, 分別為0.919和0.910; 座位27AG62的He和PIC值均最低, 分別為0.878和0.864。4個(gè)群體中, SF群體平均每個(gè)座位的He和PIC都最高, 分別為0.874和0.854; ZD2S的其次,He和PIC分別為0.863和0.834;而ZDS群體的平均He和PIC都最低, 分別為0.798和0.761 (表 2)。

表2 各微衛(wèi)星位點(diǎn)在4個(gè)羅氏沼蝦育種群體中的遺傳多樣性參數(shù)Tab. 2 Genetic diversity parameters of each microsatellite locus in the four breeding populations of Macrobrachium rosenbergii

各育種群體間及群體內(nèi)分子變異分析(AMOVA)結(jié)果表明, 羅氏沼蝦各育種群體的變異主要來(lái)自群體內(nèi)的變異, 占總變異的93.59%, 而來(lái)自群體間的變異較小, 僅占總變異的6.31% (表格未列出)。各群體間的遺傳分化指數(shù)(FST)見(jiàn)表 3, 群體間的遺傳分化均達(dá)極顯著水平。其中, ZD和ZDS群體間的遺傳分化最大,FST值為0.10438, 而SF和ZD2S間的分化最小,FST值為0.04166。ZD和ZD2S間及ZD和SF群體間的FST值分別為0.06539和0.07281。

表3 基于微衛(wèi)星位點(diǎn)的羅氏沼蝦各育種群體間遺傳分化指數(shù)Tab. 3 Genetic differentiation index (FST) of the breeding populations of Macrobrachium rosenbergii based on SSR

2.2 基于線粒體基因的羅氏沼蝦育種群體遺傳多樣性

共獲得4個(gè)群體117個(gè)個(gè)體的線粒體COⅠ基因及137個(gè)個(gè)體的12S rRNA基因序列。COⅠ基因比對(duì)長(zhǎng)度為1247 bp, 12S rRNA基因比對(duì)長(zhǎng)度為798 bp。COⅠ基因共檢測(cè)到21個(gè)變異位點(diǎn), 其中14個(gè)為簡(jiǎn)約信息位點(diǎn); 117個(gè)個(gè)體共享9個(gè)單倍型, 單倍型多樣性(Hd)為0.425, 核苷酸多樣性(π)為0.00371(表 4)。在798 bp的12S rRNA基因中, 共檢測(cè)到10個(gè)變異位點(diǎn), 其中9個(gè)為簡(jiǎn)約信息位點(diǎn); 137個(gè)個(gè)體共識(shí)別12個(gè)單倍型,Hd為0.660,π為0.0023(表 4)。

將兩個(gè)基因進(jìn)行組合分析, 獲得149個(gè)個(gè)體2045 bp的組合序列, 含31個(gè)變異位點(diǎn), 其中27個(gè)為簡(jiǎn)約信息位點(diǎn); 共識(shí)別27個(gè)單倍型,Hd值和π值分別為0.846和0.00313; 在4個(gè)群體中, ZD2S的Hd值最高(0.876), 其次為SF群體(0.835), ZDS的Hd值最低(0.594); 對(duì)于π值, SF群體的最高(0.00422), 其次為ZD2S(0.00349), ZD群體的最低(0.00044, 表 4)。

表4 羅氏沼蝦育種群體線粒體COⅠ、12S rRNA基因及兩個(gè)基因組合序列的遺傳多樣性參數(shù)Tab. 4 Genetic diversity parameters of mitochondrial COⅠ, 12S rRNA and their concatenated gene sequences in each breeding populationof Macrobrachium rosenbergii

在兩個(gè)基因組合序列獲得的27個(gè)單倍型中,Hap6包含的個(gè)體數(shù)最多, 有46個(gè), 出現(xiàn)頻率為30.87%, 分布于ZD2S、SF和ZD三個(gè)群體中; 其次為單倍型Hap2, 包含29個(gè)個(gè)體, 出現(xiàn)頻率為19.46%,涵蓋了所有4個(gè)群體。Hap1和Hap9分別包含15和13個(gè)個(gè)體, 其他23個(gè)單倍型包含的個(gè)體數(shù)在1—9個(gè),有17個(gè)單倍型只包含1個(gè)個(gè)體, 為特有單倍型。在各群體中單倍型數(shù)量不一, 其中ZDS群體29個(gè)個(gè)體定義了5個(gè)單倍型, ZD2S群體30個(gè)個(gè)體定義了11個(gè)單倍型, SF群體60個(gè)個(gè)體定義了19個(gè)單倍型, ZD群體30個(gè)個(gè)體定義了7個(gè)單倍型。各群體單倍型分布情況見(jiàn)表 5。

基于最大似然法構(gòu)建的27個(gè)單倍型聚類關(guān)系見(jiàn)圖 1。所有單倍型聚為兩個(gè)分支, Clade A和Clade B。Clade A包含16個(gè)單倍型, 主要是來(lái)自SF群體的個(gè)體, 同時(shí)有部分ZD2S的個(gè)體及個(gè)別ZD和ZDS的個(gè)體; ZD群體的單倍型主要聚類在Clade B, 該分支也包含較多的SF和ZD2S群體及部分ZDS群體的單倍型。所有單倍型間的遺傳距離介于0.001—0.014,兩個(gè)分支Clade A和Clade B間的平均遺傳距離為0.009。從整體上看, 單倍型間的遺傳差異較小。

基于COⅠ和12S rRNA基因組合序列的各群體兩兩間遺傳分化指數(shù)(FST)結(jié)果表明, 群體間遺傳分化較小,FST值為-0.02226—0.07310。ZD2S群體和ZDS群體間遺傳分化最大,FST值為0.07310, 且分化顯著; ZDS和ZD群體間及ZDS和SF群體間的FST值分別為0.03899和0.01419, 遺傳分化較小, 且分化不顯著; ZD和ZDS群體間、ZD和SF群體間及ZD2S和SF群體間的FST值為負(fù)值(表 6), 暗示群體間幾乎不存在分化。

3 討論

3.1 基于微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性及群體遺傳分化

在本研究中哈迪溫伯格平衡(HWE)檢驗(yàn)結(jié)果顯示, 7個(gè)微衛(wèi)星座位都顯著偏離哈迪溫伯格平衡(P<0.05), 這與羅氏沼蝦的其他微衛(wèi)星研究結(jié)果類似[3]。這可能是因?yàn)檠芯繉?duì)象為人工選育群體, 群體間存在非隨機(jī)交配等導(dǎo)致偏離哈迪溫伯格平衡[19]。另一方面, 這也可能與無(wú)效等位基因相關(guān)[20]。

表5 羅氏沼蝦各育種群體COⅠ和12S rRNA基因組合序列單倍型在各群體中的分布Tab. 5 Distribution of combined COⅠ and 12S rRNA sequence haplotypes in each breeding population of Macrobrachium rosenbergii

多態(tài)信息含量(PIC) 能反映群體的遺傳變異程度和位點(diǎn)多樣性等[21]。根據(jù)Botstein等[22]的劃分標(biāo)準(zhǔn),PIC≥0.5為高度多態(tài)性; 0.25≤PIC<0.5為中度多態(tài)性;PIC< 0.25為低度多態(tài)性。在本研究結(jié)果中, 7個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的PIC值除ZDS群體27AG62位點(diǎn)為0.499外, 其余各群體每個(gè)位點(diǎn)的PIC值均大于0.5, 為高度多態(tài)性。在4個(gè)群體中, SF群體平均每個(gè)座位的PIC最高(0.854), ZD2S的其次(0.834)。

雜合度是衡量群體遺傳多樣性的重要參數(shù)。本研究中的4個(gè)羅氏沼蝦群體均表現(xiàn)出較高的雜合度, 其中SF群體平均每個(gè)位點(diǎn)的期望雜合度(He)最高, 為0.874, ZD2S群體的其次, 為0.863。從整體上,所有群體所有位點(diǎn)的平均觀測(cè)雜合度(Ho0.615)小于平均期望雜合度(0.898), 表明這4個(gè)群體可能因選育丟失了部分雜合子。雜合子缺失將導(dǎo)致純合子增加, 提高有害等位基因純合的幾率, 近交衰退幾率升高, 從而降低物種對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)性[23]。因此, 在缺乏外來(lái)優(yōu)勢(shì)野生型群體作為育種親本時(shí),選擇雜合子較多的群體進(jìn)行育種可以降低近交衰退幾率。

遺傳分化指數(shù)(FST)是反映各群體間遺傳分化的重要指標(biāo)[24]。本研究基于7個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)分析的結(jié)果表明, 除SF與ZD2S群體的FST值稍低于0.05外,其余兩兩群體間,FST值都在0.05—0.15, 為中度分化[24], 且分化均達(dá)極顯著水平, 這與孫成飛等[8]的研究結(jié)果類似。選擇遺傳分化指數(shù)大的群體間進(jìn)行雜交, 可發(fā)揮雜種優(yōu)勢(shì), 減緩育種群體之間近親繁殖帶來(lái)的影響。

3.2 基于線粒體基因的遺傳多樣性及群體遺傳分化

在本研究中, 線粒體COⅠ、12S rRNA及兩個(gè)基因的組合序列分析結(jié)果一致表明, 羅氏沼蝦SF群體的核苷酸多樣性(π)和ZD2S群體單倍型多樣性最高(Hd), 與微衛(wèi)星位點(diǎn)分析的結(jié)果較為一致。4個(gè)育種群體COⅠ基因的單倍型多樣性(Hd)為0.080—0.603, 核苷酸多樣(π)為0.00006—0.00512, 12S rRNA基因的Hd為0.500—0.637,π為0.00078—0.00293,兩個(gè)基因組合序列的Hd為0.594—0.876,π為0.00044—0.00422, 均高于Thanh等[15]中羅氏沼蝦越南2個(gè)野生種群及中國(guó)10個(gè)養(yǎng)殖群體16S rRNA基因的Hd(0—0.303)和π(0—0.0008), 但類似于其COⅠ基因的Hd(0.129—0.694)和π(0.0003—0.0073)。在本研究中, SF群體是通過(guò)收集國(guó)內(nèi)包括羅氏沼蝦“南太湖2號(hào)”在內(nèi)的不同種質(zhì)資源進(jìn)行選育3代的群體, 親本來(lái)源較為豐富。引進(jìn)的ZD群體與SF群體雜交后也獲得較高的遺傳多樣性, 這在本研究的微衛(wèi)星和線粒體基因分析結(jié)果中得到進(jìn)一步證明。另一方面, Thanh等[15]的研究采用的16S rRNA及COⅠ基因片段較短(分別僅395和498 bp), 提供的信息量有限。

圖1 羅氏沼蝦COⅠ和12S rRNA基因組合序列單倍型間的聚類分析Fig. 1 Phylogenetic tree for the combined COⅠ and 12S rRNA sequence haplotypes of Macrobrachium rosenbergii

表6 基于COⅠ和12S rRNA基因組合序列的羅氏沼蝦育種群體間遺傳分化指數(shù)Tab. 6 Genetic differentiation index (FST) of the breeding populations of Macrobrachium rosenbergii based on the combined COⅠand 12S rRNA sequences

從兩個(gè)基因組合序列的單倍型分布來(lái)看, 27個(gè)單倍型中具有優(yōu)勢(shì)單倍型Hap6, 包含46個(gè)個(gè)體, 出現(xiàn)頻率為30.87%, 分布于除ZDS群體以外的3個(gè)群體; 其次占優(yōu)勢(shì)的單倍型為Hap2, 包含29個(gè)個(gè)體, 出現(xiàn)頻率為19.46%, 4個(gè)群體中均有出現(xiàn); 其他各單倍型包含的個(gè)體數(shù)1—15不等。由此說(shuō)明, 單倍型在各群體中分布不均, 優(yōu)勢(shì)單倍型與其他單倍型包含的個(gè)體數(shù)量相差極大。從各群體的單倍型多樣性來(lái)看, SF群體包含的單倍型數(shù)目最多, 共有19個(gè)單倍型, ZD2S群體次之, 共11個(gè)。通常來(lái)說(shuō), 優(yōu)勢(shì)單倍型的個(gè)體適應(yīng)能力強(qiáng), 擁有更大的繁殖群體, 而低頻率的單倍型則因環(huán)境適應(yīng)能力差, 擁有的繁殖群體較小, 更容易對(duì)整個(gè)種群的遺傳多樣性造成不利影響[25]。另一方面, 優(yōu)勢(shì)單倍型體現(xiàn)了前期人工選擇過(guò)程中的育種方向, 定向選育過(guò)程中保留了成活率高、生長(zhǎng)性狀優(yōu)良的個(gè)體, 從而使優(yōu)勢(shì)單倍型包含的群體數(shù)量逐漸擴(kuò)大。另外, 單倍型的聚類分析結(jié)果顯示, SF和ZD2S群體擁有的單倍型, 在兩個(gè)分支中均有較多的分布, 也體現(xiàn)出這兩個(gè)群體具有豐富的多樣性。

3.3 微衛(wèi)星和線粒體基因的群體遺傳多樣性及遺傳分化比較

本研究基于微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)目(Na)、期望雜合度(He)和多態(tài)信息含量(PIC)等遺傳多樣性參數(shù)估計(jì)結(jié)果表明, 在4個(gè)育種群體中, SF群體的遺傳多樣性最高, 其次為ZD2S群體。該結(jié)果與基于線粒體COⅠ和12S rRNA基因組合序列的單倍型多樣性(Hd)、核苷酸多樣性(π)及單倍型聚類分析等結(jié)果較為一致, 均表明SF和ZD2S群體的遺傳多樣性較為豐富, 具有進(jìn)一步選育的潛力。

從群體間的遺傳分化來(lái)看, 微衛(wèi)星位點(diǎn)分析結(jié)果顯示各群體兩兩間均存在極顯著的遺傳分化, 且?guī)缀蹙鶠橹械瘸潭确只? 而兩個(gè)線粒體基因組合序列分析則顯示群體間的遺傳分化較小, 除ZD2S群體和ZDS群體的FST值(0.07310)大于0.05屬于中度分化外, 其余均較小或?yàn)樨?fù)值, 幾乎不存在分化。這表明微衛(wèi)星標(biāo)記用于檢測(cè)近緣種群間的遺傳分化時(shí)比線粒體基因具有更高的靈敏度。

綜合微衛(wèi)星和線粒體基因分析結(jié)果, 在羅氏沼蝦4個(gè)育種群體中, SF和ZD2S兩個(gè)群體具有較高的遺傳多樣性, 可作為良好的選育材料。但已有的這4個(gè)群體間遺傳分化不大, 若能引進(jìn)遺傳多樣性更為豐富的、與這4個(gè)群體具有高度分化的種質(zhì)資源,將更有利于優(yōu)良品種的選育。