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      2型糖尿病患者瘦素受體基因多態(tài)性與環(huán)境交互作用研究

      2020-09-23 09:33:22王志迪龐慧崔萌陳樂趙靈燕
      實用醫(yī)學雜志 2020年17期
      關鍵詞:瘦素單體多態(tài)性

      王志迪 龐慧 崔萌 陳樂 趙靈燕,2

      內(nèi)蒙古醫(yī)科大學1公共衛(wèi)生學院預防醫(yī)學實驗中心,2慢性病分子流行病學重點實驗室(呼和浩特010110)

      近幾十年來,全球糖尿病和糖耐量受損的發(fā)生率一直呈現(xiàn)逐年上升的趨勢[1]。研究表明,2 型糖尿?。╰ype 2 diabetes mellitus,T2DM)是受基因和環(huán)境共同作用影響的一種疾病[2]。瘦素受體(leptin receptor,LEPR)位于1p31 染色體上,通過激活信號轉(zhuǎn)導子和轉(zhuǎn)錄激活因子在瘦素信號轉(zhuǎn)導和葡萄糖代謝調(diào)節(jié)中發(fā)揮關鍵作用[3],LEPR 基因已被認為是與T2DM 相關的候選基因之一[4]。一些可能對代謝調(diào)節(jié)有生物學影響的LEPR基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)已經(jīng)被國內(nèi)外學者進行了研究[5-6]。其中,有學者[7-8]發(fā)現(xiàn)瘦素受體rs1805096、rs1892534 和rs2211651 位點變異與T2DM發(fā)生具有相關性,但rs1805096單核苷酸多態(tài)性在法國人群中與增加胰島素抵抗風險無明顯相關性[9]。在過去幾年中,許多研究者利用廣義多因子降維法(generalized multifactor dimensionality reduction,GMDR)[10-11]來探索潛在的基因-基因或基因-環(huán)境交互作用,以發(fā)現(xiàn)復雜疾病可能的生物學途徑。因此,本研究基于GMDR 模型探討瘦素受體基因單核苷酸多態(tài)性與T2DM人群危險性的關系,通過納入與T2DM發(fā)生相關的環(huán)境危險因素,進行基因-環(huán)境交互作用分析,旨在人群流行病學資料基礎上探討呼和浩特地區(qū)漢族人群T2DM的病因線索,為制定相關干預措施及政策提供科學依據(jù)。

      1 資料與方法

      1.1 一般資料2017年10月至2018年8月在內(nèi)蒙古醫(yī)科大學附屬醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)院、國際蒙醫(yī)醫(yī)院收集T2DM 患者203 例(病例組),均符合1999年世界衛(wèi)生組織制定的糖尿病診斷標準,年齡30 ~70 歲,無心、肺、肝、腎、腦等并發(fā)癥或其他嚴重原發(fā)性疾病。選取同期在內(nèi)蒙古醫(yī)科大學附屬醫(yī)院體檢中心健康體檢的對照人群203 例,年齡30 ~70 歲,且經(jīng)詢問病史均無肝腎、高血壓、內(nèi)分泌及其他心血管疾病。全部受試對象均為漢族且無親緣關系,并簽署知情同意書。

      1.2 研究方法

      1.2.1 一般情況調(diào)查調(diào)查人員采用自行設計調(diào)查問卷進行面對面調(diào)查,調(diào)查內(nèi)容包括年齡、性別、個人史以及既往疾病史等。按照標準方法進行體格檢查,測量身高、體重、腰圍、臀圍等指標。

      1.2.2 生化指標檢測所有研究對象均清晨空腹8 h 以上,分別采外周靜脈血5 mL 于EDTA 抗凝管和惰性分離膠促凝管內(nèi),離心后收集血漿、血清和全血細胞,測量空腹血糖及血脂四項,血清瘦素水平檢測委托上海優(yōu)選生物科技有限公司采用酶聯(lián)免疫吸附試驗進行。

      1.2.3 DNA 提取及瘦素受體基因SNP 測定調(diào)查者血液樣本采用試劑盒(天根生化科技有限公司)提取全血基因組DNA。應用紫外分光儀器檢測OD260/OD280比值,超純水為陰性對照,比值在1.8 左右,證明DNA 提取純度合格。上海天昊生物科技有限公司設計本次實驗PCR 擴增引物及多重單堿基延伸反應延伸引物(表1),并委托該公司采用多重高溫連接酶檢測反應技術(shù)進行LEPR 基因分型實驗。反應體系(20 μL)包含1x HotStarTaq buffer,

      3.0 mM Mg2+,0.3 mM dNTP,1 U HotStarTaq polymerase(Qiagen Inc),1 μL 樣本DNA 和1 μL 多重PCR 引物。PCR 循環(huán)程序:95 ℃2 min;94 ℃20 s、65 ℃和-0.5 ℃/cycle 40 s、72 ℃1.5 min,共11 個循環(huán);94 ℃20 s、59 ℃30 s、72 ℃1.5 min,24 個循環(huán);72 ℃2 min、4 ℃forever;在10 μL PCR 產(chǎn)物中加入5U SAP 酶和2U Exonuclease I 酶,37 ℃溫浴1 h,然后75 ℃滅活15 min;10x連接緩沖液1 μL、高溫連接酶0.25 μL、5′連接引物混合液(1 μmol/L)0.4 μL,3′連接引物混合液(2 μmol/L)0.4 μL、純化后多重PCR 產(chǎn)物2 μL、ddH2O 6 μL 混勻,連接程序:94 ℃1 min、56 ℃4 min,38個循環(huán);4 ℃forever;取0.5 μL稀釋后的連接產(chǎn)物,與0.5 μL Liz500 SIZE STANDARD,9 μL Hi-Di 混勻,95 ℃變性5 min 后上ABI3730XL測序儀。收集的原始數(shù)據(jù)用GeneMapper 4.1(AppliedBiosystems,USA)來分析并輸出結(jié)果。

      表1 擴增的SNPs 的引物序列Tab.1 Primer sequence of amplified SNPs

      1.3 統(tǒng)計學方法調(diào)查研究數(shù)據(jù)用Epidata 3.1 軟件錄入,通過SPSS 25.0(IBM,NewYork,USA)軟件進行分析。正態(tài)分布計量資料用均數(shù)±標準差表示,滿足參數(shù)檢驗條件資料時,組間比較采用t檢驗;不滿足參數(shù)檢驗條件資料時用中位數(shù)(四分位間距)表示,組間比較采用秩和檢驗;計數(shù)資料比較用χ2檢驗。雙側(cè)檢驗水準α = 0.05。采用二分類logistic 回歸分析法分析LEPR 基因型頻率及LEPR 基因位點在顯性模型和隱性模型下與T2DM的關聯(lián)性。應用SHEsis 在線平臺進行連鎖不平衡分析,Plink 1.07 軟件分析單體型、最小等位基因頻率(Minimum allele frequency,MAF)及Hardy-Weinberg 遺傳平衡檢驗?;蛐团c環(huán)境危險因素交互作用應用GMDR 進行模型構(gòu)建和分析。

      2 結(jié)果

      2.1 基本情況病例組空腹血糖值高于正常值6.1 mmol/L,與對照組比較差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),兩組在年齡、體質(zhì)指數(shù)(BMI)、腰臀比(WHR)、血脂指標、高血壓疾病史、高脂飲食、吸煙狀況、飲酒上分布差異均無統(tǒng)計學意義(P<0.05)。病例組血清瘦素水平稍高于對照組,但差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見表2。

      2.2 瘦素受體SNP 位點基因型頻率分布LEPR基因rs1805096、rs1892534、rs2211651 位點均符合Hardy-Weinber 遺傳平衡定律。校正年齡等協(xié)變量后,基因型頻率分布在兩組間差異有統(tǒng)計學差異(P<0.05),見表3。

      2.3 瘦素受體SNP 位點單體型分析LEPR 基因rs1805096、rs1892534、rs2211651 各位點間r2值均大于0.8,存在連鎖不平衡性,需進一步分析單體型,排除分布頻率小于0.03 的單體型,表4結(jié)果顯示LEPR 基因三個位點形成2 種單體型,校正年齡等協(xié)變量因素后,GCG 單體型在兩組間分布差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。

      2.4 瘦素受體基因多態(tài)性與2 型糖尿病關聯(lián)性分析二分類logistic 分析結(jié)果顯示,校正年齡等協(xié)變量,rs1805096 攜帶(GG + GA)基因型個體與攜帶AA 型個體相比、rs1892534 攜帶(CC + CT)基因型個體與攜帶TT 基因型個體相比、rs2211651 攜帶(TG + GG)基因型個體與攜帶TT 基因型個體相比,T2DM 發(fā)病風險增加(OR>1),差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見表5。

      2.5 基因-環(huán)境交互作用分析一階交互最優(yōu)模型是rs1805096 與高脂飲食的交互作用,交叉一致性為10/10,測試集精準度為0.7432,模型差異有統(tǒng)計學意義(P= 0.001 0)。校正協(xié)變量因素后,三因素交互顯示二階模型中rs1805096、rs1892534 及高血壓疾病史模型(P= 0.010 7)和rs1805096、rs2211651 及高脂飲食模型(P= 0.0010),差異均有統(tǒng)計學意義,見表6。

      表2 病例組與對照組一般情況Tab.2 General situation of case group and control group±s

      表2 病例組與對照組一般情況Tab.2 General situation of case group and control group±s

      注:*為P <0.05

      參數(shù)性別(男性)年齡(歲)BMI(kg/m2)WHR空腹血糖(mmol/L)甘油三酯(mmol/L)總膽固醇(mmol/L)高密度脂蛋白(mmol/L)低密度脂蛋白(mmol/L)血清瘦素(ng/L)糖尿病家族史[例(%)]是否高血壓疾病史[例(%)]是否吸煙[例(%)]是否飲酒[例(%)]是否高脂飲食[例(%)]是否體育鍛煉[例(%)]是否病例組118 57.05±10.29 25.92±5.30 0.92±0.83 8.67±3.76 2.13±1.53 4.95±1.31 1.29±0.37 2.84±0.96 12.25±3.08 35(17.24)168(82.76)80(39.41)123(60.59)76(37.40)127(62.60)79(38.90)124(61.10)150(73.90)53(26.10)117(57.60)86(42.40)對照組110 49.68±10.65 23.43±3.60 0.84±0.78 5.21±1.96 1.53±1.14 4.57±1.05 1.23±0.42 2.65±0.73 12.13±2.86 31(15.27)172(84.73)7(3.40)196(96.60)46(22.70)157(77.30)47(23.20)156(76.80)35(17.20)168(82.80)113(55.70)90(44.30)t/χ2值0.64-7.02-5.52-10.31-11.51-4.12-3.15-1.53-2.24-0.34 0.29 77.96 10.54 11.78 131.32 0.16 P值0.424<0.001*<0.001*<0.001*<0.001*<0.001*0.002*0.128 0.028*0.736 0.592<0.001*0.001*0.001*<0.001*0.689

      表3 瘦素受體SNP 位點基因型頻率分布Tab.3 Genotype frequency distribution of leptin receptor SNP loci

      3 討論

      基因與環(huán)境因素是T2DM 發(fā)病的重要因素[2],雖然既往研究[12-13]表明了LEPR 基因與糖尿病密切相關,但該基因rs1805096、rs1892534、rs2211651與T2DM 發(fā)生的關系,特別在呼和浩特地區(qū)漢族人群中并未明確。因此,本研究納入406 例研究對象進行病例對照研究,發(fā)現(xiàn)內(nèi)蒙古呼和浩特地區(qū)漢族人群LEPR 基因rs1805096、rs1892534、rs2211651 位點單核苷酸多態(tài)性與T2DM 易感性相關。

      表6 瘦素受體各基因位點與環(huán)境交互作用GMDR 分析結(jié)果Tab.6 GMDR analysis result of interaction between leptin receptor gene loci and environment

      在動物模型中,小鼠LEPR 基因純合常染色體突變可導致肥胖和胰島素抵抗,通過引入神經(jīng)元特異性LEPR-B 轉(zhuǎn)基因可逆轉(zhuǎn)這一現(xiàn)象,這證實了LEPR 基因在糖尿病發(fā)病中的關鍵作用[14]。有研究發(fā)現(xiàn),血清瘦素水平升高可導致β 細胞受損甚至凋亡,從而引發(fā)胰島素抵抗[15],本研究中病例組的瘦素水平高于對照組,但差異無統(tǒng)計學意義,可能與樣本量較小有關。

      校正年齡等協(xié)變量后,LEPR 基因rs1805096、rs1892534、rs2211651 基因型頻率分布在兩組間差異有統(tǒng)計學意義。本研究結(jié)果顯示,rs1892534 位點(CC + CT)基因型與TT 基因型比較,T2DM 患病率增加2.905 倍,rs2211651 位點(TG + GG)基因型是TT 基因型患病率的2.604 倍,相關研究表明[16],rs1892534 位點與C 反應蛋白的表達水平相關,現(xiàn)有證據(jù)證實,C 反應蛋白水平的變化可能是導致T2DM 發(fā)生的危險因素之一[17]。且LIAO 等[8]在中國臺灣人群中發(fā)現(xiàn)rs1892534 和rs2211651 位點變異與早發(fā)型T2DM 患者的遺傳易感性有關聯(lián),與本研究結(jié)果一致。在本研究中,rs1805096 位點(GG+GA)基因型是AA 基因型患病率的2.905 倍,一項Meta 分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)[7],中國人群rs1805096 位點在顯性遺傳模型下與T2DM 及肥胖具有相關性,但PHILLIPS 等[9]研究發(fā)現(xiàn),在法國人群中,rs1805096單核苷酸多態(tài)性與增加成人胰島素抵抗和代謝綜合征的風險無關聯(lián),除此之外,DIAS 等[18]在巴西人群隊列研究的結(jié)果顯示,rs1805096 突變與代謝異常無關,這種差異可能是由于種族和背景的不同所導致。

      研究表明,位于染色體上某一區(qū)域的一組相關聯(lián)的SNP 等位位點被稱作單體型,T2DM 是多基因復雜性疾病,單體型分析比單個SNP 分析更具有優(yōu)勢。本研究單體型分析表明,rs1805096-rs1892534-rs2211651 單 體 型GCG 與T2DM 風 險增加相關(OR= 2.588,95%CI:1.307 ~5.125),既往有研究發(fā)現(xiàn)LEPR 基因Arg109Lys、Asn656Lys、Pro1019Pro 位點AGC 單體型可能是中國華北地區(qū)T2DM 的危險因素,但目前關于rs1805096-rs1892534-rs2211651 構(gòu)成的單體型與T2DM 的關聯(lián)分析研究未見報道。

      GMDR 是一種新穎而強大的檢測和建模上位性的統(tǒng)計工具,基本原理包括交叉驗證和計分統(tǒng)計量,利用降維的方法來檢測基因-基因、基因-環(huán)境之間相互作用,避免了Logistic 回歸模型等方法處理交互作用存在“維度災難”等局限性,從而導致研究結(jié)果假陽性率增加[19]?;?基因、基因-環(huán)境交互作用分析已經(jīng)廣泛應用于T2DM 的研究,ZHOU 等[20]發(fā)現(xiàn)GCKR 和G6PC2 基因交互作用可能增加中國漢族人群T2DM 發(fā)病風險;LI 等[21]發(fā)現(xiàn)TCF7L2 基因與BMI 和腰圍之間的交互作用可能在T2DM 發(fā)生風險中起重要作用。GMDR 分析交互作用時,當交互階數(shù)越高,需要樣本量越多才能獲得更穩(wěn)定的結(jié)果,本研究受樣本量限制,將LEPR 基因的三個基因位點分別與環(huán)境因素(糖尿病家族史、高血壓疾病史、吸煙、飲酒、高脂飲食、體育鍛煉)引入模型,校正年齡等協(xié)變量,分析基因-環(huán)境交互作用,結(jié)果顯示一階交互最優(yōu)模型是rs1805096 與高脂飲食的交互作用,交叉一致性為10/10;二階模型rs1805096、rs1892534 及高血壓疾病史模型和rs1805096、rs2211651 及高脂飲食模型均存在交互作用。

      綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)內(nèi)蒙古呼和浩特地區(qū)漢族人群LEPR 基因rs1805096、rs1892534、rs2211651 位點單核苷酸多態(tài)性與T2DM 易感性相關,GCG 單體型與T2DM 風險增加相關,且LEPR基因rs1805096、rs1892534 及高血壓疾病史模型和rs1805096、rs2211651 及高脂飲食模型之間的交互作用可能與T2DM 的發(fā)生有關聯(lián)。本研究存在一定的局限性,僅探討了呼和浩特地區(qū)漢族人群,且樣本量有限,今后我們將繼續(xù)加大樣本量,進行多地區(qū)不同民族、不同環(huán)境因素的研究,進一步驗證LEPR 基因rs1805096、rs1892534、rs2211651 與2 型糖尿病之間的關系。

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