韋宜慧,陳嘉琪,董玉紅,厚凌宇,焦如珍
(中國林業(yè)科學研究院林業(yè)研究所,林木遺傳育種國家重點實驗室,北京 100091)
磷是植物生長和發(fā)育的重要營養(yǎng)元素之一,參與植物的重要代謝途徑,如光合作用,養(yǎng)分吸收及細胞分裂[1-2]。然而土壤中的磷大部分是難以利用的難溶性磷酸鹽,可被植物直接吸收利用的水溶態(tài)磷含量低,土壤磷利用率通常只有10%~15%,少部分植物利用率達到25%[3-4]。因此,磷常常成為限制植物生產(chǎn)力的主要因素之一。杉木是我國南方特有的速生用材樹種,木材產(chǎn)量超過了全國商品用材的四分之一[5]。然而南方地區(qū)淋溶強烈,土壤富含鋁離子和鐵離子,磷極易被固定,土壤磷利用率極低,嚴重制約了杉木人工林可持續(xù)發(fā)展[6]。因此,越來越多的研究已經(jīng)轉向土壤磷可持續(xù)利用。眾多研究發(fā)現(xiàn),土壤中存在大量具有溶磷能力的微生物,這些微生物通過自身代謝作用,將土壤中的難溶性磷酸鹽轉化為植物可吸收利用的水溶性磷[7-9]。開發(fā)利用溶磷微生物,提高土壤磷利用率,已經(jīng)成為當前研究熱點。目前大多數(shù)報道的溶磷微生物菌分離自農(nóng)作物,Mukhtar[10]等從甘蔗根際分離出2株高效溶磷細菌,均屬芽孢桿菌屬(Bacillus),Zhao等[11]從玉米根際篩選到1株耐鹽的洋蔥伯克氏菌(Burkholderia cepacia)。
紅壤是我國杉木種植區(qū)主要土壤類型之一,具有“酸”、“粘”、“瘦”的特點,土壤磷素有效性低,嚴重制約著杉木生產(chǎn)力的提高[12]。本研究從紅壤地區(qū)杉木人工林土壤分離篩選溶磷細菌,通過生理生化和16SrDNA基因序列確定其分類地位,運用單因素試驗和正交試驗優(yōu)化培養(yǎng)條件,為杉木菌肥的開發(fā)利用提供高效溶磷菌株。
土壤樣品采自江西省大崗山山下林場(27°36′ N,114°24′ E)18年生杉木人工林,該區(qū)域屬于低山丘陵地貌,海拔220~300 m,土壤類型為紅壤。通過S形采樣法在樣地內(nèi)布設7個采樣點,用土鉆鉆取0~20 cm土壤,將7個采樣點土壤混合裝入滅菌袋后立即帶回實驗室,4℃保存。稱取10 g新鮮土樣,置于裝有90 mL無菌水的三角瓶中,振蕩30 min。將土壤懸浮液連續(xù)稀釋10倍至10-4,取0.05 mL稀釋度為10-3、10-4土壤懸浮液涂布于Pikovskaya(PVK)[13]瓊脂平板上,28℃培養(yǎng)5~7 d,檢查平板是否存在產(chǎn)生透明暈圈的菌落。挑取溶磷圈明顯的菌落,用連續(xù)劃線法進一步純化。
采用鉬銻抗比色法[14]對菌株溶磷能力進行測定:在250 mL三角瓶中加入100 mL PVK液體培養(yǎng)基(磷酸鈣滅菌后加入),接入1 mL培養(yǎng)過夜的菌液,置于恒溫搖床中28℃,180 r·min-1培養(yǎng)7 d后測定菌株溶磷能力。
根據(jù)伯杰細菌鑒定手冊,研究菌株的生理生化特性。采用試劑盒法提取細菌基因組DNA,PCR擴增后進行16SrDNA測序。擴增引物為:27F:5′AG AGTTTGATCCTGGCTCAG3′;1492R:5′TACGG CTACCTTGTTACGACTT3′,擴增體系參考劉彩霞的方法[15]。測序結果在GenBank中進行比對,運用MEGA7構建系統(tǒng)發(fā)育樹確定菌株分類地位。
1.3.1 單因素試驗 根據(jù)溶磷能力測定的結果,選擇溶磷能力強的菌株進行溶磷培養(yǎng)條件優(yōu)化。為了驗證菌株的溶磷能力,所有培養(yǎng)過程均采用PVK培養(yǎng)基。影響菌株溶磷能力的因素主要有培養(yǎng)時間、培養(yǎng)初始pH、培養(yǎng)溫度、接種量、碳源、氮源、磷源。通過單因素試驗,培養(yǎng)時間設置為24、48、72、96、120、144、168 h;培養(yǎng)基pH設置為4、5、6、7、8、9、10;培養(yǎng)溫度設置為10、15、20、25、30、35、40℃;接種量設置為0.5、1、1.5、2、2.5、3、3.5、4%。分別以1%(w/v)、0.05%(w/v)、0.5%(w/v)的濃度提供不同碳源(葡萄糖、蔗糖、乳糖、麥芽糖、甘露醇、可溶性淀粉)、氮源(硫酸銨、硝酸鉀、氯化銨、尿素、蛋白胨、酵母浸粉)、磷源(磷酸鈣、磷酸鐵、磷酸鋁)。接種后置于恒溫搖床中28℃,180 r·min-1培養(yǎng)7 d,測定培養(yǎng)基中菌株生長量、有效磷含量,以未接種PVK液體培養(yǎng)基為對照。菌株生長量通過測定培養(yǎng)液在波長600 nm時的光密度值表示(OD600)。有效磷含量采用鉬銻抗比色法測定。
1.3.2 正交試驗 根據(jù)單因素試驗的結果,設計了蔗糖(2.0%,2.5%,3.0%),氯化銨(0.1%,0.15%,0.2%),pH(5,5.5,6),溫度(25℃,30℃,35℃)四因素三水平的正交試驗對溶磷條件進行優(yōu)化。選用L9(34)正交表,因素水平見表1。
表1 L9(34)正交試驗因素水平Table 1 Factors and levels employed in orthogonal test
數(shù)據(jù)分析采用SPSS20.0軟件進行方差分析(ANOVA)。
利用PVK平板分離杉木人工林土壤中的溶磷細菌,經(jīng)過多次純化得到13株具有明顯溶磷圈的細菌。各菌株溶磷能力如表2所示,培養(yǎng)液中有效磷含量在21.61~195.61 mg·L-1之間,有效磷含量最高的是P5(195.61 mg·L-1)。因此,選擇P5作為后續(xù)研究供試菌株。
革蘭氏染色試驗表明菌株P5為革蘭氏陰性菌,在PVK瓊脂平板上28℃培養(yǎng)3 d后的菌落形態(tài)為圓形,邊緣整齊,白色不透明且表面光滑濕潤,具有明顯溶磷圈。以下生理生化試驗為陽性:硝酸鹽還原試驗,葡萄糖試驗,阿拉伯糖試驗,甘露醇試驗以及檸檬酸鹽試驗。以下生理生化試驗為陰性:甲基紅試驗,氧化酶/VP試驗,硫化氫試驗,明膠水解試驗及丙二酸鹽試驗。
將菌株P5 16SrDNA序列與Genbank中的模式菌株序列進行比較,P5菌株與Burkholderia ubonensis序列相似度為99.09%,一致性為98.8%。選擇數(shù)據(jù)庫中相似度最高的7株標準菌株及1株外群菌株構建系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖1所示。P5菌株與Burkholderia ubonensis同源,相似度和一致性均大于98%,置信度為78,結合生理生化判斷P5為Burkholderia ubonensis。
表2 菌株溶磷能力Table 2 Phosphorus solubilizing ability of bacterial strains
圖1 P5菌株系統(tǒng)發(fā)育樹狀圖Fig. 1 Phylogenetic tree of P5
2.3.1 菌株在不同碳源、氮源、磷源培養(yǎng)基中生長情況 由圖2可看出菌株生長量與有效磷含量對不同培養(yǎng)時間、pH、溫度及接種量的響應有顯著差異,但兩者之間無明顯相關性。培養(yǎng)時間對菌株溶磷量的影響如圖2a所示,培養(yǎng)基中菌株生長量隨著時間的增加先升高后降低,在72 h達到最大值,有效磷含量則在96 h達到最高后趨于平穩(wěn)。從圖2b可以看出pH在4~10范圍內(nèi),有效磷含量和菌株生長量均呈現(xiàn)先上升后逐漸下降的規(guī)律,P5生長適應范圍為5~6,最適pH為5。菌株生長量和有效磷含量在酸性條件下顯著高于堿性條件,表明P5耐低pH。溫度在10~40℃范圍內(nèi),P5培養(yǎng)液中有效磷含量也呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(圖2c)。溫度在25~30℃之間,菌株生長量和有效磷含量均達到最大值。在40℃時菌株光密度值OD600大于1,顯著高于10~15℃,說明菌株較耐高溫。菌株生長量和有效磷含量都隨著接種量的增加先升高后降低(圖2d)。菌株生長量在接種量為3%時達到了最高點,而有效磷含量在接種量為2%時達到最大值。單因素試驗結果表明,菌株P5最適培養(yǎng)時間為72~96 h,最適pH為5~6,最適溫度在25 ~30℃之間,最適接種量為1.5%。
6種不同碳源(葡萄糖、蔗糖、乳糖、麥芽糖、甘露醇、淀粉)對菌株溶磷能力的影響差異顯著(圖3a),葡萄糖、蔗糖作為唯一碳源時,有效磷含量和菌株生長量顯著高于其余4種碳源。其中蔗糖是菌株P5的最佳碳源,其次為葡萄糖>麥芽糖>乳糖>甘露醇>淀粉。為了確定蔗糖濃度對菌株解磷能力的影響,在0.5%~4%(w/v)范圍內(nèi)設置8個濃度蔗糖(梯度為0.5%)。圖3b表明隨著蔗糖濃度的增加,有效磷含量逐漸增加,蔗糖濃度為3%時有效磷含量最高,濃度繼續(xù)增加時有效磷含量無明顯變化。菌株生長量隨蔗糖濃度的增加先上升后下降,在濃度為1%~2%間達到最大值。不同蔗糖濃度下P5菌株生長量及溶磷量無明顯相關性。
將不同氮源(硫酸銨、硝酸鉀、氯化銨、尿素、蛋白胨、酵母浸粉)以0.05%(w/v)的濃度加入培養(yǎng)基中,測定不同氮源對有效磷含量的影響。如圖4a所示,在以硫酸銨和氯化銨為氮源時,菌株P5有效磷含量顯著高于其余4種氮源,其中氯化銨培養(yǎng)基中菌株生長量最高,是菌株P5溶解磷的最佳氮源。將氯化銨按0.05%~0.4%(w/v)范圍內(nèi)分8個濃度(梯度為0.05%)添加到培養(yǎng)基中,結果如圖4b,濃度為0.15%時培養(yǎng)基中有效磷含量最高,高于或低于該濃度的培養(yǎng)基有效磷含量均減少。氯化銨濃度對菌株生長的影響與有效磷含量變化一致,氯化銨濃度為0.2%、0.15%時菌株生長量和有效磷含量分別達到最高值。
由圖5a可知,3種不同磷源條件下,有效磷含量及菌株生長量大小排序為磷酸鈣>磷酸鋁>磷酸鐵。在0.5%~4%(w/v)范圍內(nèi)分8個濃度(梯度為0.5%)將磷酸鈣添加到培養(yǎng)基中,結果如圖5b所示,菌株P5在0.5%~4%(w/v)范圍內(nèi)有效磷含量呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢,在1.5%濃度時有效磷含量達到最高。菌株生長量在濃度范圍為0.5%~1.5%之間無明顯變化,濃度增加至2%時菌株生長量顯著減少。
圖2 培養(yǎng)條件對P5溶磷能力的影響Fig. 2 Effect of culture conditions on the ability of P5 to dissolve phosphorus
圖3 不同碳源及不同蔗糖濃度對P5溶磷能力的影響Fig. 3 Phosphorus dissolving ability of P5 under different different carbon sources and sucrose concentrations
2.3.2 正交設計優(yōu)化 在單因素試驗的基礎上,選擇蔗糖、氯化銨、pH、溫度進行四因素三水平正交試驗。從表3和表4可知,因素B、C對菌株解磷能力影響顯著(P<0.05),因素D極顯著(P<0.01),因素A不顯著,影響P5溶磷能力的因素主次順序為D>B>C>A,即溫度>氯化銨>pH>蔗糖。由表3可知,因素A、B、C、D優(yōu)水平為A2、B3、C2、D2,優(yōu)組合為A2B3C2D2。由于因素A的水平改變對試驗結果幾乎無影響,從經(jīng)濟角度考慮,選A1,因此培養(yǎng)條件優(yōu)組合為A1B3C2D2,即蔗糖濃度為2.0%,氯化銨濃度為0.2%,pH為5.5,溫度為30℃。為了驗證該條件下P5溶磷能力,進行了補充試驗,試驗結果表明該條件下P5培養(yǎng)液中有效磷含量高達268.69 mg·L-1,顯著高于優(yōu)化前培養(yǎng)條件(PVK液體培養(yǎng)基),后者有效磷含量為195.61 mg·L-1。證明通過正交試驗,調(diào)整后的培養(yǎng)條件更有利于提高菌株P5的溶磷能力。
圖4 不同氮源及不同氯化銨濃度對P5溶磷能力的影響Fig. 4 Phosphorus dissolving ability of P5 under different different nitrogen sources and ammonium chloride concentrations
圖5 不同磷源及不同磷酸鈣濃度對P5解磷能力的影響Fig. 5 Phosphorus dissolving ability of P5 under different different phosphorus sources and calcium phosphate concentrations
從杉木人工林土壤中篩選到一株高效溶磷菌株P5,通過生理生化試驗和16SrDNA基因序列分析鑒定為Burkholderia ubonensis。研究表明,隨著培養(yǎng)時間的增加,菌株生長量先上升后下降,而有效磷含量上升到最高后保持平穩(wěn),可能是因為菌株生長達到了穩(wěn)定期,菌體繁殖速度開始下降,但菌株分泌的代謝產(chǎn)物在這段時間內(nèi)大量積累,促進了難溶性磷的溶解[16-17]。菌株P5生長最適pH范圍為5~6,最適溫度范圍為25~30℃。楊艷紅等[18]研究得出,芽孢桿菌的最適生長溫度和pH分別為37℃、7.0;劉曉璐等[19]從煙草根際分離的功能菌最適生長溫度為30℃,pH為7.5。研究表明,pH和溫度通過影響微生物體內(nèi)酶驅動過程而改變代謝速率,低溫條件下菌株生長繁殖緩慢,活力下降,高溫則容易導致菌體自溶[20]。接種量逐漸增加,菌株對空間和營養(yǎng)物質(zhì)的爭奪越強烈,導致細菌代謝速度逐漸減慢,代謝產(chǎn)物的累積速率減緩,從而導致有效磷含量減少,也可能是因為菌株生長過程產(chǎn)生了有毒代謝物質(zhì)或細胞的自溶作用減緩了細菌代謝速率[21-22]。土壤pH值對林木生長有重要影響,極酸、極堿立地不利于林木生長,改良需要花費大量人力物力,且微生物肥料使用受限,土壤質(zhì)量難以提高[23]。本研究篩選的P5菌株在4~10時均可生長,可在不同pH值土壤中應用。
表3 L9(34)正交試驗結果Table 3 Results of the orthogonal test
表4 正交試驗方差分析Table 4 Variance analysis of the orthogonal test
本研究篩選的P5菌株的最佳碳源和氮源分別是蔗糖和氯化銨,而喬志偉等[24]分離的具有溶磷能力的伯克氏菌W4的適宜碳源、氮源分別為葡萄糖和硝酸鉀。Park等[25]發(fā)現(xiàn)伯克氏菌Burkholderia vietnamiensi的最佳碳源和氮源分別是葡萄糖和尿素。其原因可能與微生物代謝機制的多樣性以及不同碳、氮源的物理化學性質(zhì)有關,不同碳源和氮源通過改變微生物代謝路徑,導致其分泌的有機酸的種類和數(shù)量發(fā)生變化,從而改變了溶磷微生物的溶磷能力[26-29]。不同濃度碳源、氮源對不同菌株生長和溶磷效果影響不同,劉玉鳳[28]等分離的假單胞菌的最適葡萄糖濃度為1%;Park等[25]研究發(fā)現(xiàn)葡萄糖濃度為3.5%時Burkholderia vietnamiensi的生長量最大,有效磷含量最高。本研究中蔗糖濃度為3%時,菌株生長量和有效磷達到最大值,此時菌株分泌大量有機酸,抑制了微生物的生長代謝,導致菌株生長量開始下降,培養(yǎng)液有效磷含量增加受限;氮源濃度高則引起微生物對磷的吸收增加,從而降低有效磷含量[30]。不同磷源對溶磷微生物的溶磷能力與難溶性磷酸鹽的結構有關,本研究中菌株P5對磷酸鈣的溶解效果最佳。菌株溶磷機制包括以下幾種:分泌有機酸,呼吸酸化,NH4+同化,胞外酶水解[31-33]。Ca-P較易溶解可能與溶磷微生物分泌的有機酸種類有關,也可能是Ca-P的溶解是微生物分泌質(zhì)子和有機酸螯合陽離子雙重作用的結果,而Al-P和Fe-P只能通過螯合作用來釋放磷酸鹽[34-35]。磷源濃度也是影響溶磷微生物溶磷量的因素之一,磷濃度高,使微生物釋放的磷再次被陽離子固定,形成難溶性磷酸鹽,而低磷供應減少微生物蛋白質(zhì)合成,降低微生物活性[36]。培養(yǎng)條件優(yōu)化結果顯示pH值對菌株溶磷量的影響極顯著,溫度、氮源對菌株溶磷量影響顯著,這主要是因為菌株在不同培養(yǎng)條件下,基因調(diào)控及蛋白合成均會發(fā)生變化,從而引起菌株細胞膜通透性及對營養(yǎng)物質(zhì)的吸收、菌株代謝產(chǎn)物及胞外酶活的變化[37-38]。然而,需要進一步研究以了解P5的溶磷機制,并在溫室或田間條件下探索其促生能力及促生機制。
從杉木人工林土壤分離到1株耐酸,耐高溫的高效溶磷細菌Burkholderia ubonensisP5。單因素試驗表明P5最適培養(yǎng)時間為72~96 h,最適pH為5.0~7.0,最適溫度在25℃~30℃之間,最適接種量為1.5%,最適碳源為蔗糖,氮源為氯化銨,磷源為碳酸鈣。正交試驗表明P5在蔗糖濃度為2.0%,氯化銨濃度為0.2%,pH為5.5,溫度為30℃條件下溶磷能力顯著提高。對菌株溶磷條件進行優(yōu)化是有效發(fā)揮細菌溶磷能力的必要前提,為菌株P5的溶磷機制及其對植物生長的作用等后續(xù)研究奠定了基礎。