張皞宇 周正松
摘? ?要:由于此前人們對病毒的傳染性關注度不夠,使得新型冠狀病毒在初期傳染時,可采取的有效干預措施較少,導致傳染人數(shù)激增。本研究從湖北省衛(wèi)生健康委員會的通報中得到從1月11日到2月7日的感染數(shù)據(jù),基于改進的SERI模型模擬出新型冠狀病毒在湖北省有效干預措施較少時的發(fā)展情況,為后續(xù)的預測模型做一個參考。
關鍵詞:無干預自由發(fā)展;基本再生數(shù);新型冠狀病毒。
隨著新型冠狀病毒在武漢開始傳播,感染人數(shù)與死亡人數(shù)也開始逐步上升。由于此前人們對病毒的傳染性了解不夠充分,使得在病毒發(fā)現(xiàn)初期可采取的措施較少,其未得到及時干預,新型冠狀病毒肺炎在湖北傳染得較快。為研究此次病毒的傳播情況,通過數(shù)學建模得出病毒在湖北省前期處于無干預自由發(fā)展狀態(tài)的模型。
1? ? 湖北新型冠狀病毒肺炎的基本情況
本研究中的數(shù)據(jù)來源于湖北省衛(wèi)生健康委員會的通報。
1.1? 湖北感染情況
根據(jù)省衛(wèi)生健康委員會的通報,統(tǒng)計得到從1月11日到2月7日的感染情況,如表1所示。
1.2? 感染趨勢
湖北省的感染趨勢如圖1所示。
由于感染人數(shù)與死亡和出院人數(shù)相差太大,故附上一張無病的趨勢圖,如圖2所示。
2? ? 模型的設計
2.1? 模型選擇
由于此次病毒為大型傳染病,故選擇最經典的傳染病模型,即易感者-潛伏者-移除者-感染者(Susceptible-Exposed-Infected-Recovered,SEIR)模型進行模型的建立,從而進行情況的分析[1]。該模型適用于通過病毒傳播的疾病,所以符合此次的實際情況。
在SEIR模型中,將人群分為4類:S(易感者),E(潛伏者),R(移除者),I(感染者)。
其中,S定義為易感者,在此處記為S(t),來表示t時段的易感者。
E定義為潛伏者,在此處記為E(t),來表示t時段的潛伏者。
R定義為感染后在后續(xù)疾病被移除且不會再次感染者,此處記為R(t),來表示t時段的移除者。
I定義為感染疾病者且同時具有傳播能力者,此處記為I(t),來表示t時刻的感染者。
2.2? 模型設計
由于本次的病毒有較長的潛伏期,且會導致患者死亡,根據(jù)情況建立SERI模型進行改進,增加新一類人員D(死亡者)。新型冠狀病毒的傳播流程如圖3所示。
其中E代表潛伏期人數(shù),R0代表基本再生數(shù)。在此處引入基本再生數(shù)這個概念,指在一個全是易感染態(tài)個體構成的群體中,一個感染態(tài)的個體在恢復之前平均能感染的人數(shù)。故可以推測出潛伏期的人數(shù),即E=S×R0。
J代表轉陽率,其含義為潛伏者向發(fā)病者的發(fā)展的概率,即取潛伏期的倒數(shù)。
r代表治愈率,即病人每天獲得治愈的概率。
k代表日死亡率,即病人的日死亡率。所以k=死亡率×治愈率。
2.3? 方程建立
在此處引入此次病毒的基本再生數(shù),即一個感染態(tài)的個體在恢復之前平均感染的人數(shù),由此可以更好地計算出受感染的潛伏者,即E=R0I-JE。
此時則需要對此次的疾病前期的基本再生數(shù)進行估計,根據(jù)基本再生數(shù)的計算公式R0=1+λTg+ρ(1-ρ)(λTg)2,其中TE,TI分別為感染期與傳染期,則患者生成時間為Tg=TE+TI。記ρ=TE/Tg為潛伏期占患病所需時間(潛伏期+感染期)的比[2]。
通過計算出的R0,根據(jù)模型的設計來建立出相關的微分方程組:
3? ? 參數(shù)確定與實際擬合
根據(jù)《新型冠狀病毒感染的肺炎治療方案》(試行第5版),由于本次病毒的潛伏期為3~7天,則取平均數(shù)5天。在進行體外分離培養(yǎng)時,在96 h左右,即4天,可在人呼吸道上皮細胞中發(fā)現(xiàn)病毒[3]。所以TE,TI的和Tg=9。再根據(jù)公式可得到ρ=5/9。
雖然本次病毒感染的第一為12月8日,由于初期不清楚傳染性,對其重視不足,使得病毒的爆發(fā)期發(fā)生在2019年12月中下旬,為方便計算,取12月16日開始。因為在2020年1月22日,湖北省人民政府發(fā)布《湖北省人民政府關于加強新型冠狀病毒感染的肺炎防控工作的通告》,同時啟動了突發(fā)公共衛(wèi)生事件二級應急響應,所以截至22日,新型冠狀病毒在此之前為無干預自由發(fā)展。根據(jù)湖北省前期感染的數(shù)據(jù),計算出病毒在呈指數(shù)增長的增長率,即,根據(jù)12月21日的數(shù)據(jù),得出結果為λ=0.165。
再通過基本再生數(shù)的計算,帶入數(shù)據(jù)得出基本再生數(shù)為R0=3.020。
通過統(tǒng)計得出湖北省在1月11日到2月7日時的平均死亡率和平均治愈率,即r=0.074,k=0.024。轉陽率取潛伏期的倒數(shù)。雖然Tg=9,但因為在對病毒傳染性了解不足的前期,即使出現(xiàn)了癥狀也無法得到充分的重視和有效處理措施,所以此處取最長潛伏期來進行計算,即J為14的倒數(shù)。
將如上參數(shù)帶入微分方程中,進行求解。
得到I(t)的相關方程,再進行擬合,結果如圖4所示。
由于數(shù)據(jù)取于1月11日,在圖4中坐標11處為1月21日。在坐標x=12處即為21日,此時國家處于2020年1月22日凌晨2:40,湖北省人民政府發(fā)布《湖北省人民政府關于加強新型冠狀病毒感染的肺炎防控工作的通告》,同時啟動了突發(fā)公共衛(wèi)生事件二級應急響應。此時的病毒不再處于無約束狀態(tài)發(fā)展,可以明顯看出不再呈指數(shù)趨勢發(fā)展。
所以此處的病毒傳播分為兩個時間段,即無干預自由發(fā)展時間段和有干預發(fā)展時間段??梢悦黠@看出,政府的介入與民眾的努力使得病毒的傳播速率明顯下降,通過少出門和不聚會、戴口罩和勤洗手,可明顯對病毒的傳播進行干預,使得R0下降,在R0≤1時,本次病毒得到控制。由于當前缺乏數(shù)據(jù),無法建立出對未來感染人數(shù)的預測模型。在后續(xù)有了流行病學的數(shù)據(jù)后,可以為I增加一個約束項,使其不再呈指數(shù)趨勢上漲,更貼合實際,從而能夠建立出預測模型。
4? ? 結語
文章在改進SIRE模型的同時引入了基本再生數(shù),簡化了對于潛伏期患者的計算難度,可以更好地擬合出病毒在無干預狀態(tài)下的發(fā)展與趨勢,具有一定的參考價值。
由于在后期湖北省啟動了突發(fā)公共衛(wèi)生事件二級應急響應,使得病毒不再呈模型中的趨勢發(fā)展。如果有足夠的數(shù)據(jù),可以在該模型的基礎上增加對I的約束項,從而更加符合疾病傳播動力學,可以實現(xiàn)對未來患病人數(shù)的預測。
[參考文獻]
[1]王拉娣.傳染病動力學模型及控制策略研究[D].上海:上海大學,2005.
[2]周濤,劉權輝,楊紫陌,等.新型冠狀病毒感染肺炎基本再生數(shù)的初步預測[J].中國循證醫(yī)學雜志,2020(2):1-6.
[3]國家衛(wèi)生健康委辦公廳,國家中醫(yī)藥管理局辦公室.新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第五版)[J].中國中西醫(yī)結合雜志,2020(2):1-3.