《柳葉刀》新型冠狀病毒肺炎案例分析兩則

PART1.感染病例分析

1.患者特征逐漸明朗

本次的研究為回顧性分析，患者均為在今年1月1日至1月20日。在武漢金銀潭醫(yī)院接受治療的確診患者。分析表明，有49名患者曾有華南海鮮市場的暴露史，占比為49%。其中，有47名患者具有長期暴露史（大部分為市場銷售人員或市場管理人員），2名患者只有短期暴露史（顧客）。

從患者的性別和年齡特征上看，本次分析的病例中，男性占了多數(shù)，共67名（68%）。這一比例與之前的數(shù)據(jù)（73%）相當(dāng)。而從年齡分布上看，最新數(shù)據(jù)的年齡中位數(shù)為55.5歲，較先前的49.0歲有所上升。

世界衛(wèi)生組織在上周的新聞發(fā)布會中多次提到，這次的感染病例中，有不少具有基礎(chǔ)疾病。本次的分析結(jié)果與這一觀點(diǎn)具有一致眭。分析表明。在這99名患者中。有50名患者同時具有心血管疾病、內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病、消化系統(tǒng)疾病等慢性疾病，占比約為51%。這些基礎(chǔ)疾病可能削弱了他們的免疫系統(tǒng)。

這些分析結(jié)果表明，新型冠狀病毒更有可能感染那些具有慢性疾?。庖吖δ茌^弱）的年長男性。

2.癥狀與治療

論文中作者們也介紹了這些患者的常見癥狀和常用的治療方案。數(shù)據(jù)表明，有83%的患者出現(xiàn)了發(fā)熱，82%的患者有咳嗽。這兩者是最為常見的臨床特征。相比之下，其他的一些疾病特征則相對比較少見——有31%的患者出現(xiàn)了氣短，11%的患者出現(xiàn)了肌肉疼痛，這些都沒有超過半數(shù)。而剩余的一些癥狀，則占比不超過10%。

在治療方面，大約四分之三的患者（76%）接受了抗病毒療法?！读~刀》論文介紹說，患者使用的藥物包括奧司他韋

（oseltamivir）、更昔洛韋（ganciclovir），以及最近引起廣泛關(guān)注的抗HIV感染療法洛匹那韋/利托那韋（lopinavir/ritonavir）。

與此同時，有70%的患者接受了抗生素治療，有15%的患者接受了抗真菌治療。這些是為了應(yīng)對患者出現(xiàn)的其他感染。

3.其他討論

作者們根據(jù)數(shù)據(jù)，做了一些相關(guān)的討論。首先，他們討論了一些“未知”。我們知道，無論是SARS病毒，還是MERS病毒，都從蝙蝠身上起源，且經(jīng)過中間宿主傳染到人類。然而目前我們還不清楚，本次新型冠狀病毒的來源究竟是何方。另外，病毒的具體傳播率也依然不得而知。

其次，他們討論了感染的死亡率。從本篇論文的數(shù)據(jù)來看，99名患者中，有11名在論文發(fā)表時已經(jīng)死亡，死亡率為11%。這一死亡率與SARS感染相當(dāng)（10%），但不如MERS感染那么嚴(yán)重（35%）。作者也指出，隨著時間的推移，正在住院的患者中，可能還會有新增的死亡病例。

而從衛(wèi)生應(yīng)急辦公室發(fā)布的最新公告來看，31個?。▍^(qū)、市）的累計(jì)死亡率為2.2%，現(xiàn)有的重癥病例率為20.7%。

作者們還根據(jù)實(shí)驗(yàn)室檢測的結(jié)果，指出大部分患者的淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)有所降低。這可能是因?yàn)樵诟腥局?，體內(nèi)的細(xì)胞因子風(fēng)暴引發(fā)了一系列免疫反應(yīng)，導(dǎo)致淋巴細(xì)胞的數(shù)量發(fā)生變化。這些結(jié)果表明本次新型冠狀病毒可能會影響到淋巴細(xì)胞，與SARS類似。而較低的淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)，或許也可以成為臨床診斷的參數(shù)之一。

4.小結(jié)

本篇論文的樣本數(shù)雖有增加，但和總確診病例相比，依然較少。此外，疑似病例的情況也尚未考慮在內(nèi)。這些信息只能讓我們窺見新型冠狀病毒感染的早期特征。我們也期待隨著更多分析結(jié)果的出爐，科研人員和醫(yī)務(wù)人員們能更好地了解這種疾病，更好地對其進(jìn)行診治和防控！

PART2.基因組分析

1.與舟山蝙蝠病毒最接近

在這項(xiàng)研究中，科學(xué)家們從9名患者的支氣管肺泡灌洗液與培養(yǎng)物中分離出了樣本，進(jìn)行基因測序工作。從這些樣本中，科學(xué)家們一共拼接出了8個完整的病毒基因組，以及2個部分完整的病毒基因組。

在獲得了這些基因組信息后，研究人員們首先比對了它們之間的基因序列。比對結(jié)果表明，這8個完整的病毒基因組高達(dá)99.98%，幾乎完全一致！考慮到病毒本身較容易突變，這個比對結(jié)果告訴我們，從病毒感染人體到醫(yī)務(wù)人員對病毒進(jìn)行系統(tǒng)性的檢測，這中間相隔的時間極短。

那么。這些病毒從何而來呢？作者們將其他已知的冠狀病毒基因組也納入了比對的范疇，這也包括了知名的SARS病毒和MERS病毒。比對結(jié)果表明，與新型冠狀病毒完整基因組序列最為接近的，是2018年在浙江省舟山市的蝙蝠體內(nèi)分離出的兩株病毒，相似性達(dá)87.99%。相比之下，新型冠狀病毒與SARS和MERS病毒的序列就沒那么相像，相似性分別為79%和50%。

2.基因序列說明了什么？

在進(jìn)一步的分析中，這些病毒的基因組序列向我們透露了更多細(xì)節(jié)。先前對于冠狀病毒的研究表明，其表面的S蛋白在病毒的感染和傳播上有著非常重要的作用。S蛋白可以分為兩部分：一塊叫做S1亞基，負(fù)責(zé)和細(xì)胞表面的受體結(jié)合;另一塊叫做S2亞基，負(fù)責(zé)“鉆”入細(xì)胞。

前面我們提到，與舟山蝙蝠體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的兩株冠狀病毒相比，此次新型冠狀病毒的基因組序列相似性很高。而在S蛋白上，科學(xué)家們則看到了一個很有意思的現(xiàn)象——負(fù)責(zé)“鉆”入細(xì)胞的S2亞基，與蝙蝠病毒的相似性達(dá)到了93%;而負(fù)責(zé)識別細(xì)胞受體并與之結(jié)合的S1亞基，相似性則只有68%。這也表明在感染人類上，新型冠狀病毒可能有著其特殊性。

那么，這種病毒究竟結(jié)合的是什么受體呢？研究人員們發(fā)現(xiàn)，盡管與SARS病毒總體而言相似性不是那么高，但在S1亞基上，兩者卻有著不少保守的氨基酸?；谶@些結(jié)果，輔以計(jì)算機(jī)模型，研究人員們猜測新型冠狀病毒可能和SARS病毒一樣，結(jié)合的是人體的ACE2受體。但他們也指出，一些SARS病毒用于和ACE2結(jié)合的氨基酸位點(diǎn)，卻在新型冠狀病毒中發(fā)生了變異。因此它也有可能結(jié)合我們目前未知的某種受體。

3.其他討論

在分離用于測序的樣本時，科研人員們也對患者的來源進(jìn)行過匯總。這9名患者中，有8名在華南海鮮市場有著暴露史，表明他們有可能是在市場內(nèi)接觸到了感染源。然而，第9名患者卻從未去過華南海鮮市場，如何感染病毒尚不明確。

作者們做了兩種可能性的分析。首先，由于這名患者曾住在華南海鮮市場附近的賓館，可能通過飛沫傳播，感染上了這種病毒;又或者，這名患者體內(nèi)的病毒來自某個目前還不明確的來源?，F(xiàn)在，我們無法區(qū)分這兩種可能性。

《柳葉刀》表示，新型冠狀病毒和蝙蝠中分離出的病毒序列最為相似，但不大可能直接由蝙蝠傳染給人類，理由如下：首先，去年12月，我們才聽到有感染病例的消息，而武漢的蝙蝠在當(dāng)時大部分已進(jìn)入冬眠;其次，華南海鮮市場中并沒有發(fā)現(xiàn)販?zhǔn)垓鸬默F(xiàn)象，相反，很多“非海鮮”的動物卻見在其中販?zhǔn)郏赡茏鳛橹虚g宿主的哺乳動物;再次，盡管新型冠狀病毒的序列和蝙蝠中分離出的序列最為相似，但兩者的相似程度依舊不到90%，表明舟山的蝙蝠體內(nèi)找到的病毒，不大可能是本次疫情的直接病毒來源，相反，現(xiàn)有的病毒應(yīng)來自其他的來源;最后，我們已知的兩種嚴(yán)重的冠狀病毒SARS和MERS，雖然最初的病毒儲存庫都是蝙蝠，但均通過中間宿主傳給人類。

綜合來看，研究人員們認(rèn)為，本次新型冠狀病毒可能最初也同樣來自某種蝙蝠，然后通過某種在華南海鮮市場販?zhǔn)郏壳斑€未知的野生動物，傳染給了人類。作者們也在文章的最后指出，本次疫情的暴發(fā)，再次強(qiáng)調(diào)了野生動物體內(nèi)未知病毒對人類的潛在威脅。